BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493296
Length=4093
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G15890.1 | Symbols: | binding | chr4:9017453-9022982 FORWAR... 6606 0.0
> AT4G15890.1 | Symbols: | binding | chr4:9017453-9022982 FORWARD
LENGTH=4182
Length=4182
Score = 6606 bits (3577), Expect = 0.0
Identities = 3933/4104 (96%), Gaps = 27/4104 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATGAAGAGCTTTTACTTACTAGAATCATTGCAGGAATCGAAGGAGGAGGAGGCGAT 60
||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 1 ATGGATGAAGAGCTTCTGCTCACTAGAATCCTTGCAGGAATCGAAGGAGGA-GA--CGAT 57
Query 61 GAAGCTTACTATCACGAACTCGTCACGGATCTCAAATCTCTACTCGATACAGACGACGAT 120
||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 58 GAATCTGACTATCATGAACTCGTCACGGATCTCAAATCTCTACTTGATACAGACGATGAT 117
Query 121 GAAATTCTCAATCGATTCTACGGTAGTCTCTCCTCAATGGCTTCGTCGTTTCTCCGCTGT 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 118 GAAATTCTCAATCGATTCTACGGTAGTCTCTCCTCAATGGCTTCTTCGTTTCTCCGCTGT 177
Query 181 GTCTCCGCCGCCATGGATTCGCCGGTTGAATCAGGCCGTCTTGCTATTTTAGCCTCCGAC 240
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 ATCTCCGCCGCCATGGATTCTCCGGTTGAATCAGGCCGTCTTGCTATTTTAGCCTCCGAC 237
Query 241 GCTTATCTCAGTCTGCTTCTTTCCACGAATTGCCCCGTTTTCACTTTCTTCTCGCCGATT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 238 GCTTATCTCAGTCTGCTTCTTTCCACGAATTGCCCCGTTTTCACTTTCTTCTCTCCGATT 297
Query 301 GCGTTTCTTTCTCTACTCGGCTCAATCCGCCGCTACCTCAAACGCCGGGACGATTCGGCC 360
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||
Sbjct 298 GCGTTTCTTTCTCTACTTGGCTCAATTCGCCGCTACCTCAAACGCCGTGATGATTCCGCC 357
Query 361 GGTCAAGGGAGTAATTCGCAGCGAGAGAAAGGGAATAAGAAGAAGAGAGGACGTGGTAAG 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GGTCAAGGGAGTAATTCGCAGCGAGAGAAAGGGAATAAGAAGAAGAGAGGACGTGGTAAG 417
Query 421 AGGAATTTAGGGTATGAAGATGGGGAAGAGACTGAAGAAGGTGGATTCGATGCGAAATTG 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 418 AGGAATTTAGGGTATGAAGATGGGGAAGAGACTGAAGAAGGTGGATTTGATGCGAAATTG 477
Query 481 CTGTTTATAGTGCTGGAGAAGCTGGGCTCGGTTCTGAACTTTGTTCACTTAGATAGATTT 540
||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 478 ATGTTTATAGTGTTAGAGAAGCTTGGCTCGGTTCTGAGTTTTGTTCATTTAGATAGATTT 537
Query 541 CCTGATAGCTTGAAATCTTTGGTACAGACTGTGAGTGAGATTCCTTTATTGGCGTTGGAG 600
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 CCTGATAGTTTGAAATCTTTGGTACAAACTGTGAGTGAGATTCCTTTATTGGCGTTGGAG 597
Query 601 TACTCTGG-GTTTTTGAATTATGATCGATTGATGGAAATGTGTGGGAAGATTTTGGGTGG 659
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||
Sbjct 598 CACTCTGGAG-TTTTGAATTATGATCGATTGATGGAAATGTGTGGGAAGATTCTGGGAGG 656
Query 660 AGTGTTGAATTCCGATCATGGAGATATGGCACTCACTGCTGCTGAGATTTCAAAGTCTTT 719
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 AGTGTTGAATTCTGACCATGGAGATATGGCACTCACTGCTGCTGAGATTTCAAAGTCTTT 716
Query 720 GACACCGTTGCTTCTTATGGGGAAACATCAAGGC-AGAAGTTTTGCGTTAGGTTTTGTGT 778
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||
Sbjct 717 GACACCGTTGCTTCTTATGGGGAAACATCAA-GCGAGAAGTTTTGCGTTGGGATTTGTGT 775
Query 779 CTAGGAAATTGATGGGTTTGGCTAAAGATAACTGTGAATTGAAAAAAGTTGTTTCTAATT 838
| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 776 CAAGGAAATTGATGAGTTTGGCTAAAGATAACCCTGAATTGAAAAAAGTTGTGTCTAATT 835
Query 839 TGCCTAAGTTTCTGGTTCATAAGGCACCTGAGAAGGCCGAGCCACGTGGATTTGCAGTGG 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 836 TGCCTAAGTTTCTGGTTCATAAGGCACCTGAGAAGGCCGAGCCGCGTGGATTTGCAGTGG 895
Query 899 AGGCGGTACTGGATATTGTAAAGGCAATGGAGGTTGAGGACCAATCAGACTTTGTTGATT 958
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 896 AGGCGGTACTGGAGATTGTAAAGGCAATGGAGGTTGAGGGCCAATCAGAGTTTGTTGATT 955
Query 959 TTGTGATGAAGATGTGTCAAGGGAAGTCTAATTTTAGGA-TATTAGCTGTTGATCTTATA 1017
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||
Sbjct 956 TTGTAATGAAGATGTGTCAAGGGAAGTCTAATTTTA-GAGTATTAGCTGTTGATATTATA 1014
Query 1018 CCTCTGTTGATAAGCTTATTAGGAAACCCTTTAGGAGATATTAGTTCAGAGAATGGGTTG 1077
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CCTCTGTTGATAAGCTCATTAGGAAACCCTCTAGGAGATATTAGTTCAGAGAATGGGTTG 1074
Query 1078 AAAGAATCGTGGGGCGTGGGTTGTCTTGATGCGTTACTTCAGCGGTGCTCAGACACGAGC 1137
||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1075 AAAGATTCGTGGGGCTTGGGTTGTATTGATGCTTTAGTTCAGCGGTGTTCAGACACGAGC 1134
Query 1138 GCTTTGATTAGAGCTCGTGCTTTGTCCAACTTGGCTCAAGTTGTGGGGTTCTTGTCTGGT 1197
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1135 GCTTTGATTAGAGCTCGAGCTTTGTCCAACTTGGCTCAAGTTGTGGAGTTCTTGTCTGGT 1194
Query 1198 GATGAAAGGAGTAGGTCGATCCTGAAACAAGCCCTTAGGTTTAACGGTGAGACTTCAGAG 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 GATGAAAGGAGTAGGTCGATCCTGAAACAAGCCCTTGGGTTTAACGGTGAGACTTCAGAG 1254
Query 1258 GGAAACGGTTCAGTAACTGACCTTTTGAAGAAAAGATGTGTGGATGAGAAGGCGGCTGTA 1317
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GGAAAAGGTGCAGTAACTGACCTTTTGAAGAAAAGATGTGTGGATGAGAAGGCGGCTGTA 1314
Query 1318 AGGAGAGCAGCTCTTCTTCTGGTGACTAAATTGACATCCCTTATGGGTGGTTGCTTTGAT 1377
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1315 AGGAGAGCAGCTCTTCTTCTGGTGACAAAATTGACATCGCTTATGGGTGGTTGCTTTGAT 1374
Query 1378 AGTAGTATCCTAAAGACAATGGGAACATCTTGTTCTGATCCGCTCATAAGTATAAGAAAG 1437
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1375 GGTAGTATCCTAAAGACAATGGGTACATCTTGTTCTGATCCGCTAATAAGTATAAGAAAG 1434
Query 1438 GCTGCAATTTCAGCTCTTTCCGAGGCCTTCAGAATATGTACAGATGAAATTGTGACCACT 1497
|||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435 GCTGCAGTTTCAGCTATTTCCGAGGCATTCAGAATATGTACAGATGAAATTGTGACCACT 1494
Query 1498 GAATGGTTACATTCTGTTCCTCGGATGATCATGGACAATGAAACTAGCATCCAAGAAGAA 1557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GAATGGTTACATTCTGTTCCTCGGATGATCATGGACAATGAAACTAGCATCCAAGAAGAA 1554
Query 1558 TGCGAGAATGTCTTTCATGAACTAGTTCTGGAGAGAATATTACGAGCTGGAAATGTGCTT 1617
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGCGAGAATGTCTTTCATGAATTAGTTCTGGAGAGAATATTACGAGCTGGAAATGTGCTT 1614
Query 1618 TCTCCAG--A---C-TCTCTCCCTAACAACCGGAACAATACTTCAAAAGATCTAGACAGA 1671
||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 TCTCCAGACAGTGCTTCTCTCCCTAACAACCGGAACACTACTTCAAAAGATCTAGACAGA 1674
Query 1672 GACATTGAAGCCTTGTTTCCAGAAGGAGTTTTGGTTCTGTTAAGGGAGCTTTGCAACAGC 1731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 GACATTGAAGCCTTGTTTCCAGAAGGAGTTTTGGTTCTCTTAAGGGAGCTTTGCAACAGT 1734
Query 1732 GAGGTTTCTCCTTGGGTTACGAAAATATGTGGAAGTTTGGGAAAGAAGAAGCGACTAAAA 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1735 GAGGTTTCTCCTTGGGTTACGAAAATATGTGGAAGTTTGGGAAAGAAGAAGCGACTAAAA 1794
Query 1792 CCAAGAGTTGCCCTTGCGCTTCAGTGTATCATAAAGGAATCTGAATCACTGTGGTTGAGC 1851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 CCAAGAGTTGCCCTTGCGCTTCAGTGTATCATAAAGGAATCTGAATCACTGTGGTTGAGT 1854
Query 1852 CGTTCAATGCCAATAAATAAATGGACAGCTCCTGCTGGTGCTTGGTTTCTTCTATCAGAG 1911
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1855 CGTTCAATGCCAATAAATAGATGGACAGCTCCTGCTGGTGCTTGGTTCCTTCTATCAGAG 1914
Query 1912 GTTTCAGTTTATCTTCCAAAGTCTGTCGAATGGGAATTTCTTCACCATCATTGGCAGTTG 1971
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 GTTTCAGTTTATCTTTCAAAGTCTGTCGAATGGGAATTTCTTCACCATCATTGGCAGTTG 1974
Query 1972 CTTGACAAGAATGACGTGCAAGGGCTAGATGAACAAGGTGATGAACAGGGTGTCGAGTGT 2031
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1975 CTTGACAAGAATGACGTACAAGGGCTAGATGAACAAGGTGATGAACAGGGGGTCGAGTGT 2034
Query 2032 AATTCTTCTACATGGGCTGGCGATCGAGTTTGTCTTTTGCAAACAATCTCCAATGTTTCT 2091
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035 AATTCTTCTACATGGGCTGGCGATCGAGTTTGTCTTTTGCAAACAATCTCCAATGTTTCC 2094
Query 2092 CTTCAGCTGCCAGCAGAGCCTGCTGCAGATCTCGCTGACAATTTGCTGAAGAAAATCGAA 2151
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2095 CTTCAGCTGCCAGCAGAGCCTGCTGCAGATCTGGCTGACAATTTGCTGAAGAAAATCGAA 2154
Query 2152 AAGTTTAACCTGCATTCTGCTGAGGTCGATGCACATGTTAAAGCATTAAAAACTTTGTGC 2211
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2155 AATTTTAACCTGCATTCTGCTGAGGTCGATGCACATGTCAAAGCATTAAAAACTTTGTGC 2214
Query 2212 AAAAAGAAGGCACGCACCTCTGAGGAGTCTGATATGCTTGTCAAGAAGTGGGTAGACCAA 2271
|||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2215 AAAAAGAAGGCAAGCACCTCTGAGGAGGCCGATATGCTTGTCAAGAAGTGGGTAGAACAA 2274
Query 2272 GTTTTAGCCAAGGCATCTAAGGTCACTGAGAAGTACATCGAGGGGGTCTCCAGTAATAAT 2331
|||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2275 GTTTCATTGAAAGCATCTAAGGTCACTGAGAAGTACATCGAGGGGGTTTCCAGTCATAAT 2334
Query 2332 CATTCTTTTGTTACACCAGCAACACTTGGAAGTAGAAGAAGCAAGAGACTGGATTCTGTG 2391
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2335 CATTCTTTTGTTACACCAGCAACACTCGGAAGTAGAAGAAGCAAGAGACTGGATACTGTG 2394
Query 2392 TCCAAGAAATTATCAAAAGCAGTCACAGCTGTATACACCATTGGATCTTGTGTCATTATA 2451
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395 TCCAAGAAATTATCAAAAGCAGTCACAGCAGTATACACCATTGGATCTTGTGTCATTATA 2454
Query 2452 TTTCCTTCAGCTGACACGACCAAAATTGTTCCGTTCTTACATACTGTCATCACTTCAGGA 2511
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2455 TATCCTTCAGCTGACACGACCAAAATTGTTCCGTTCTTACATACTGTCATCACTTCAGGA 2514
Query 2512 AATTCAGACTCAAAGCTGAAAAACAAAATGCCCCAAGCTAATGTTTGCTTGAAACAAAAG 2571
||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2515 AATTCAGACTCAAAGCTGAAAAACAAACTGCCGCAAGCTAATGTTTGCTTGAAGCAAAAA 2574
Query 2572 GCTCCTCTTCTCTATTGTCAGTCTTGGTTGACCATGGCGAAGATGTGTTTGGCTGACGGG 2631
||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2575 GCTCCTCTTCTCTATAGTCAGTCTTGGTTAACCATGGCGAAGATGTGTTTGGCTGACGGG 2634
Query 2632 AAACTTGCTAAAAGATATATTCCTCTCTTTGCACAGGAGCTTGAAAAGAGTGATTGTGCA 2691
|| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 AAGCTTGCTAAAAGATATCTCCCTCTCTTTGCACAGGAACTTGAAAAGAGTGATTGTGCA 2694
Query 2692 GCCTTGCGTAACAATCTTGTAGTGGCAATGACAGACTTTTGTGTTCACTATACAGCCATG 2751
||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695 GCCTTGCGTAACAATCTTGTAGTAGCGATGACAGACTTTTGTGTTCACTATACAGCCATG 2754
Query 2752 ATCGAGTGTTACATACCGAAGATTACTAACCGTCTACGGGATCCTTGTGAAGTTGTTAGA 2811
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755 ATTGAGTGTTACATACCGAAGATTACTAAACGTCTTCGGGATCCTTGTGAAGTTGTTAGA 2814
Query 2812 AGGCAGACCTTCATACTTCTCTCAAGGTTACTACAGAGAGACTACGTGAAGTGGAGAGGA 2871
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2815 AGGCAAACCTTCATACTTCTCTCAAGGTTACTACAGAGAGACTACGTGAAATGGAGAGGA 2874
Query 2872 GTTCTCTTCCTTCGATTCCTTTTATCGCTAGTGGATGAATCTGAAAAGATACGCCAACTT 2931
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 2875 GTTCTCTTCCTTCGATTCCTTCTATCGCTAGTGGATGAATCTGAAAAGATACGTCGACTT 2934
Query 2932 GCAGACTTCTTATTTGGAAGCATCCTTAAAGTAAAGGCGCCACTTCTAGCTTACAACAGT 2991
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 GCAGACTTTTTATTTGGAAGCATCCTTAAAGTAAAGGCGCCACTTCTAGCTTACAACAGT 2994
Query 2992 TTCGTGGAAGCTATTTATGTCTTAAACGACTGCCATGCCCACACTGGCCATAGTAATCCA 3051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2995 TTCGTGGAAGCTATTTATGTCTTAAACGACTGCCATGCCCACACTGGCCATAGTAATCCA 3054
Query 3052 GATTCTAAACAATCAAGAACAAAGGAGCAAGCTTTTTCTATCAGAGGGAATGATGAAAGG 3111
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3055 GATTCTAAACAATCAAGAACAAAGGATCAAGTTTTTTCTATCAGAGGGAATGATGAAAGG 3114
Query 3112 GCTAGGTCTAAAAGAATGCAGATCTACATTACTCTGCTTAAACAAATGGCTCCAGAACAC 3171
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3115 GCTAGGTCTAAAAGAATGCAGATCTACGTTACTTTGCTTAAACAAATGGCCCCAGAACAC 3174
Query 3172 CTTTTGGCCACATTCGCCAAGTTATGTGCTGAGATCCTGGCAGCTGCTTCTGATGGAATG 3231
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3175 CTTTTGGCCACATTCGCCAAGTTATGTGCAGAGATCCTCGCAGCTGCTTCTGATGGAATG 3234
Query 3232 CTCAACATAGAAGATGTCACTGGTCAATCAGTTCTACAGGATGCGTTTCAGATCTTGGCG 3291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3235 CTCAACATAGAAGATGTCACTGGTCAATCAGTTCTACAGGATGCGTTTCAGATCTTGGCG 3294
Query 3292 TGCAAAGAGATCCGTTTGTCAGTTTCCAGAGGAGCATCGTCGGAGACAGCAGAGATAGAG 3351
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3295 TGCAAAGAGATCCGTTTATCAGTTTCCAGAGGAGCATCGTCGGAGACAGCAGATATAGAG 3354
Query 3352 GACGAAGGTGGAGATTCCAATGCAGCGGCTGCGAAAGGAAGGGCCATAACGCTA-GCTGT 3410
|| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 3355 GAAGAAGGTGGAG------ATGCAGCAACTGCAAAAGGAAGGGCCATAACGC-ACGCTGT 3407
Query 3411 TAGAAAAGGTTTGATTCAGAACACGATTCCAATCTTCATTGAGCTCAAGAGGCTATTGGA 3470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3408 TAGAAAAGGTTTGATTCAGAACACGATTCCAATCTTCATTGAGCTCAAGAGGCTATTGGA 3467
Query 3471 GAGCAAGAACAGTCCTCTCACAGGTTCGCTCATGGACTGCCTCCGTGTCCTCCTCAAAGA 3530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3468 GAGCAAGAACAGTCCTCTCACAGGTTCGCTCATGGACTGCCTCCGTGTCCTCCTCAAAGA 3527
Query 3531 TTACAAGAACGAGATCGAAGAAATGCTTGTCGCTGACAAACAGCTTCAGAAAGAGCTCGT 3590
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3528 CTACAAGAACGAGATCGAAGAAATGCTTGTCGCTGACAAACAGCTTCAGAAAGAGCTTGT 3587
Query 3591 TTACGATATGCAGAAGCACGAGGCTGCAAAGGCAAGGTCCATGGCTAACCAAGGGGGTGC 3650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3588 TTACGATATGCAGAAGCACGAGGCTGCAAAGGCAAGGTCCATGGCTAACCAAGGGGTTGC 3647
Query 3651 CTGCGGGACAAGTCATAGAAACGGTGAACCTGAAGCACCAGCAGCAAGCGAGGAGAATGT 3710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3648 CTGCGGGACAAGTCATAGAAACGGTGAACCTGAAGCATCAGCAGCAAGCGAGGAGAATGT 3707
Query 3711 TAGAGATTCGGGATTGGAATCAAGAGTGGTTTCTGCGGCTGCTGATGTGGTGGCGGCTAA 3770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3708 TAGAGATTCGGGATTGGAATCAAGAGTGGTTTCTGCGGCTGCTGATGTGGTGGCGGCTAA 3767
Query 3771 GGCAGCTAGGTCGGTGTTGAGAGAAGTGAACGGTGGAGCTGCAACGCCGCCTCTGAGCGC 3830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3768 GGCAGCTAGGTCGGTGTTGAGAGAAGTGAACGGTGGAGCTGCAACGCCGCCTCTGAGCGC 3827
Query 3831 AATGAGTGTTCCAAAGCTAAGGTCGAGCCGTGGAGTTAGCCAGAGTGGTCGACCATCAGC 3890
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3828 AATGAGTGTTCCGAAGCTAAGGTCGAGCCGTGGAGTTAGCCAGAGTGGTCGACCATCAGC 3887
Query 3891 TGATGTGTTGGAGTCTCTGAGAAGAAGACCAACTTTCATGTCTGATGATGAGAGTTAGAA 3950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3888 TGATGTGTTGGAGTCTCTGAGAAGAAGACCAACTTTCATGTCTGATGATGAGAGTTAGAA 3947
Query 3951 CTTAAAATTGAGAGACTCTAGAAA-TAGCTTTTGTTGTATATGCATAACTTCGATTTTTC 4009
||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 3948 CTTAAAAATGAGA--CTGTAGAAAATAGCTTTTGCTGTAAATGCATGACTTCGATTTTTC 4005
Query 4010 TTTTTGTTGAGATTAGATCGAGACTCTACTAAAGTCTAAATCGTATTTATGAACCGCATA 4069
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4006 TTTTTGG-GAGATTAGATCGAGACTCTATTAAAGTCTAAATCGTATTTATAAACCGCATA 4064
Query 4070 AGACACTAAAACCAGGTGTGTGTG 4093
||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4065 AGACACTAAAACCTGGTGTGTGTG 4088
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 203978790238
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5