BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493633
Length=3915
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G35750.1 | Symbols: AHK2, HK2 | histidine kinase 2 | chr5:13... 5823 0.0
> AT5G35750.1 | Symbols: AHK2, HK2 | histidine kinase 2 | chr5:13911371-13916337
REVERSE LENGTH=3903
Length=3903
Score = 5823 bits (3153), Expect = 0.0
Identities = 3684/3936 (94%), Gaps = 54/3936 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCTATAACTTGTGAACTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAGGC--A-AAGGAGTCGAGG 57
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||
Sbjct 1 ATGTCTATAACTTGTGAGCTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAAGCTAAGAAGTCGTCGAGC 60
Query 58 AGTGGCAAGAAGTGGCTAAAGAAGCCTCTCTTGTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 117
|||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 AGTGACAAGAAATGGCTAAAGAAGCCTCTCTTCTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 120
Query 118 ATTGTTCTT-GTTATGTTCTCATGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACATCTTCTTG 176
|||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 121 ATTGTT-TTGGTTATGTTCTTACGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACAGATTCTTG 179
Query 177 TAATGGAGAAGCTAAAGTGTTGTATAGACATCAAAACGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 236
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TAATGGAGAAGAGAAAGTGTTGTATAGACATCAAAATGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 239
Query 237 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTATTATCCTTTGAATGT-AGTAAGGAAT 295
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 240 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTAACATCCTTTGAATGTCA-TAAGGAAT 298
Query 296 CAAGACCTGGAATGTGGGA-AAATTATGGTATTACATGTTCCCTGAATATGCGGTCGGAG 354
|||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || ||
Sbjct 299 CAAGCCCTGGAATGT-GGACAAACTATGGTATTACATGTTCCCTGAGTGTGCGTTCTGAT 357
Query 355 AAACAGGAGACCAGATGGATTCCCTGGAATCTTAATCCATCAGGCTTAGCACATTCTATC 414
||||| ||||| ||| || |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||
Sbjct 358 AAACAAGAGACTAGAGGGCTTCCCTGGAATC----T---T--GGCTTAGGACATTCTATC 408
Query 415 TCATCAACTTCTTGTATATGTGATAATCTTGAAGCGAGTTTACAACAACCGGAAAA---- 470
|||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||
Sbjct 409 TCATCAACATCTTGTATGTGTGGTAATCTTGAACCGATTTTACAGCAACCTGAAAACCTT 468
Query 471 -A-TCAGAAAACCTTGAGGAAGAGCTGGAGCAGAGTTTGTCAACTTGTTTAAGAAATGCA 528
| |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||
Sbjct 469 GAGGAAGAAAACCATGAAGAAGGGCTGGAGCAGGGTTTGTCATCGTATTTAAGAAATGCA 528
Query 529 TGGTGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTATTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATTTCATTCT 588
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 529 ---TGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTGTTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATCTCATTCT 585
Query 589 AAAGCACCAGCTAAGAGGAAAGAAAAAGTACATCTACAAGAGCCTTTAGCTCAAAAGAAG 648
||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 586 AAAGCACGAGGTGAGAGGAAAGAGAAAGTACATCTGCAAGAGGCTTTAGCTCCAAAGAAG 645
Query 649 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAAAGGGGCTGGAAAATGGAGGAAGAACATCCTT 708
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 646 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAGAGGGGCTGGAAGATGGAGGAAGAATATCCTT 705
Query 709 CTCCTTGGAATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCCGTTTGGTGGTTTTGGAACACCAATGAG 768
|||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 706 CTCCTTGGTATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCTGTTTGGTGGTTTTGGGACACTAATGAG 765
Query 769 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTAGCTAACATGTGTGATGAACGAGCCCGCGTG 828
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 766 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTGGCAAACATGTGTGACGAACGAGCACGTGTT 825
Query 829 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 885
Query 889 ACATTTCATCATGGGAAAACCCCATCTGCCATTGATCAGAAAACATTTGAAGAATATACT 948
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 886 ACATTTCATCATGGTAAAATCCCATCTGCCATTGATCAGAGAACATTTGAAGAATATACT 945
Query 949 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACAAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTTCCA 1008
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 946 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACTAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTCCCA 1005
Query 1009 CACTCAGAAAGGGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGACAATAAAGAAAATGGAAACT 1068
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 CACTCAGAAAGAGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGGCAATAAAGAAAATGGAAACT 1065
Query 1069 GAGGACCAGACAGTCGTCCAAGATTGTGTTCCTGAAAATTTTGATCCAGCACCTATTCAA 1128
|||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1066 GAGGACCAGACAGTTGTACAAGATTGTGTTCCTGAAAACTTTGATCCCGCACCGATTCAA 1125
Query 1129 GCCGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACAGTTTCCCATATTGTATCGGTTGAC 1188
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1126 GACGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACTGTTTCCCATATTGTATCGGTCGAC 1185
Query 1189 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATTTTGCGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1248
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATCTTACGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1245
Query 1249 GTATTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGCATCGTGTTGACCTTT 1308
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 1246 GTGTTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGTGTTGTGTTGACCTTT 1305
Query 1309 GCTGTGTATGACACGAGCCTACCGCCCAATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1368
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306 GCTGTCTATGACACGAGCCTACCGCCTGATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1365
Query 1369 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1366 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1425
Query 1429 CTTGCCAGTAAACAGACGATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACCTCAGGTCTA 1488
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1426 CTTGCCAGCAAACAGACAATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACTTCAGGTCTA 1485
Query 1489 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCACATAAGTAGCCTTGAT 1548
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1486 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCATATAAGTAGCCTTGAT 1545
Query 1549 TTTGGTGATCCATCAAGGAATCATGAGATGCACTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1608
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 TTTGGTGATCCATCAAGGAACCATGAGATGCATTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1605
Query 1609 CCTTGGACCGCGATAACAACGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1668
|| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1606 CCCTGGACAGCGATAACACCGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1665
Query 1669 ATTTTCA-ATGAAGCCATCAATCGAATTGCCACAGTTGAAGAGGACTGTCAGAAGATGAG 1727
||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1666 ATTTT-ATATGAAGCCATCAACCGAATTGCGACAGTTGAAGAGGATTGTCAGAAGATGAG 1724
Query 1728 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACGTTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1787
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACATTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1784
Query 1788 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1847
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1844
Query 1848 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCACAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1907
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCGCAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1904
Query 1908 TCTTACATCCCTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCAGGAAGGCTCGA 1967
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1905 TCTTACATCACTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCCGGAAGGCTCGA 1964
Query 1968 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGCTTTATTCTGGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2027
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGTTTTATTCTTGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2024
Query 2028 TGGCAAAGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2087
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 TGGCAAGGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2084
Query 2088 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATAATTACAAACCTTGTTGGAAACTC 2147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2085 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATCATTACAAACCTGGTTGGAAACTC 2144
Query 2148 AATCAAGTTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2207
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 AATCAAATTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2204
Query 2208 AAGGGAGCCTCTTAATATTGAAGATGCAGTGCTAAAACAGAGACTAGCTTTAGGATGCAG 2267
|| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2205 AAAGGAGCCTCTTACTATTGAAGACGCAGTGCTAAAACAGCGACTAGCTTTAGGATGCAG 2264
Query 2268 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCCGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2327
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCGGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2324
Query 2328 TTTCAAGACATGTTACAGCT-CTGAGAATCATAATTCTGATAAAATCAAATTGCTAGTTA 2386
|||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2325 TTTCAAGACATGTTACAG-TACTGAGAGTCAGAATTCTGATCAAATCAAATTGCTAGTTA 2383
Query 2387 CAGTGGAGGACACAGGAGTGGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATATTCACGCCTT 2446
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2384 CAGTGGAGGACACTGGAGTTGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATCTTCACACCTT 2443
Query 2447 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGGACTGGCATAGGTTTGAGCA 2506
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2444 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGAACTGGCATAGGTTTGAGTA 2503
Query 2507 TAAGCAAGCGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2566
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504 TAAGCAAACGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2563
Query 2567 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGTAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCAATTA 2626
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2564 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGGAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCGATTA 2623
Query 2627 CTAAGTTGGAACGATTCGATCTAGCTCTTCAGGAGTTTAAAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2686
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2624 CTAAGCTGGAACGATTCGATCTAGCTATTCAGGAGTTTACAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2683
Query 2687 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTGACCAGCTACCATCTTCAGAGACTGGGAATAT 2746
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||||
Sbjct 2684 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTCACCAGGTACGAACTTCGGAGACTGGGAATAT 2743
Query 2747 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTTAGAATGGCATGCACCTCT-GT--CAGCAAATTAGAAA 2803
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||
Sbjct 2744 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTGAGAATGGCATGCACTTGTTGTATCAGCAAATTAGAAA 2803
Query 2804 ATTTGGCTATGGTTCTAATCGACAAAGACGCCTGGAACAAGAAAGACTTTTCAGTACTTG 2863
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2804 ATTTGGCTATGATTCTAATAGACAAAGACGCCTGGAACAAGGAAGAATTTTCAGTACTTG 2863
Query 2864 ACGAGTTGTTTACCCGTAGCAAAGTAACCTTTGCAAGAGTCCCAAAGATTATTCTTTTGG 2923
|||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2864 ACGAGTTGTTTACCCGAAGCAAAGTAACCTTTACAAGAGTCCCAAAGATTTTTCTTTTGG 2923
Query 2924 CAACCTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTTCTGGCCTCATCGATGAGG 2983
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 2924 CAACTTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTACTGGTCTCATCGATGAGG 2983
Query 2984 TAGTAATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2984 TGGTGATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043
Query 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGGATAGAAAGCGAAGAAATCTTGGACACTTACTCAGAGAAA 3103
|||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGAACAGACAGCGAAGAAATCTTGGACACTTGCTAAGAGAAA 3103
Query 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGACGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCCGAAGGTGCACTTA 3163
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGATGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCAGAAGGTGCACTTA 3163
Query 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGGAAGGCTGCATTGGAAATGCTTA 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||
Sbjct 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGCAAAGCTGCATTGGCAATGCTTA 3223
Query 3224 AGCCGCCTCACAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3224 AGCCGCCTCATAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283
Query 3284 TTGAAGCAACGAGGAGAGTCCGTGATCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343
||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3284 TTGAAGCGACAAGGAGAGTCCGTGAGCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343
Query 3344 GAGAAGTTTCTGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCATGTCCCGATATTAGCAA 3403
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3344 GAGAAGTTTCAGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCACGTCCCGATATTAGCAA 3403
Query 3404 TGACAGCTGATGTTATTCAGGCTACTCACGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3404 TGACAGCAGATGTTATTCAGGCTACTCATGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463
Query 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTTTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTCTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523
Query 3524 CCTGTTAACAGAAAGCCTAAAAACGCCACTGCCCTTGTAGCATTATAGATATCAACCCGA 3583
| |||||| | | | ||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||
Sbjct 3524 CTTGTTAA-A-A--G---AAAAA-GCCATTTCCCTTGTAGGATTATA--TATCAACCCGA 3573
Query 3584 GAGCTTTTTGATGTCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3643
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3574 GAGCTTTTTGACATCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3633
Query 3644 TCAAGGAAAGAACCAGTCCATTATCCATTGTTCTTCACAGGTCTCGTTC-GCTTTAAGAC 3702
|||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||
Sbjct 3634 TCAAGGCAAGAACCAGTTCATTGTCAATTTTTCTTCACAGGTCTCTTTCAGCTT-AAGAC 3692
Query 3703 CTTGTCTGGTTGAGTGAGAAAAAAGACTGCGAAAACCGCAATCTTTCTCTTTGTATAGAC 3762
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 3693 CTCGTCTGGTTGAGTGAGAAAAA---CTGCGAAAACCG-A-TCTTTCTCTTTGTATAGAC 3747
Query 3763 AGTTTGTCGTCTTTGATCTCTGCATGTGTGTATAGTAGATTTCTAGTGTATAGCTCCATT 3822
| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 3748 ACTTTGTCTTCATTGATCTCTGCCTGTGTGTATAGTAGATTCCTAGGGTATAGCTCCATT 3807
Query 3823 ATATTCATTC-ATATATATA-AA-CCCAAATTCTCTCCTCTGAACTGTAAAACAGCTTGT 3879
||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||
Sbjct 3808 ATATTCATTTTATATATATATAAACCCAAACTCTGTCCTCTTAACTATGAAACAGCTTGT 3867
Query 3880 ATGTTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3915
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3868 ATATTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3903
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 195049074384
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5