BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg493633 Length=3915 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G35750.1 | Symbols: AHK2, HK2 | histidine kinase 2 | chr5:13... 5823 0.0 > AT5G35750.1 | Symbols: AHK2, HK2 | histidine kinase 2 | chr5:13911371-13916337 REVERSE LENGTH=3903 Length=3903 Score = 5823 bits (3153), Expect = 0.0 Identities = 3684/3936 (94%), Gaps = 54/3936 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGTCTATAACTTGTGAACTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAGGC--A-AAGGAGTCGAGG 57 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| Sbjct 1 ATGTCTATAACTTGTGAGCTCTTGAATCTTACTTCAAAGAAAGCTAAGAAGTCGTCGAGC 60 Query 58 AGTGGCAAGAAGTGGCTAAAGAAGCCTCTCTTGTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 117 |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 61 AGTGACAAGAAATGGCTAAAGAAGCCTCTCTTCTTCCTGATTTTGTGTGGCTCTTTGGTA 120 Query 118 ATTGTTCTT-GTTATGTTCTCATGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACATCTTCTTG 176 |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 121 ATTGTT-TTGGTTATGTTCTTACGGTTAGGTAGAAGTCAGAAGGAGGAGACAGATTCTTG 179 Query 177 TAATGGAGAAGCTAAAGTGTTGTATAGACATCAAAACGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 236 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 TAATGGAGAAGAGAAAGTGTTGTATAGACATCAAAATGTCACAAGAAGTGAGATTCATGA 239 Query 237 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTATTATCCTTTGAATGT-AGTAAGGAAT 295 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| Sbjct 240 TTTGGTCTCTTTGTTCTCTGATTCAGATCAGGTAACATCCTTTGAATGTCA-TAAGGAAT 298 Query 296 CAAGACCTGGAATGTGGGA-AAATTATGGTATTACATGTTCCCTGAATATGCGGTCGGAG 354 |||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| || || Sbjct 299 CAAGCCCTGGAATGT-GGACAAACTATGGTATTACATGTTCCCTGAGTGTGCGTTCTGAT 357 Query 355 AAACAGGAGACCAGATGGATTCCCTGGAATCTTAATCCATCAGGCTTAGCACATTCTATC 414 ||||| ||||| ||| || |||||||||||| | | ||||||| |||||||||| Sbjct 358 AAACAAGAGACTAGAGGGCTTCCCTGGAATC----T---T--GGCTTAGGACATTCTATC 408 Query 415 TCATCAACTTCTTGTATATGTGATAATCTTGAAGCGAGTTTACAACAACCGGAAAA---- 470 |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| Sbjct 409 TCATCAACATCTTGTATGTGTGGTAATCTTGAACCGATTTTACAGCAACCTGAAAACCTT 468 Query 471 -A-TCAGAAAACCTTGAGGAAGAGCTGGAGCAGAGTTTGTCAACTTGTTTAAGAAATGCA 528 | |||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| Sbjct 469 GAGGAAGAAAACCATGAAGAAGGGCTGGAGCAGGGTTTGTCATCGTATTTAAGAAATGCA 528 Query 529 TGGTGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTATTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATTTCATTCT 588 ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 529 ---TGGTGGTGTCTAATCCTTGGTGTGTTAGTGTGCCATAAGATTTATGTATCTCATTCT 585 Query 589 AAAGCACCAGCTAAGAGGAAAGAAAAAGTACATCTACAAGAGCCTTTAGCTCAAAAGAAG 648 ||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 586 AAAGCACGAGGTGAGAGGAAAGAGAAAGTACATCTGCAAGAGGCTTTAGCTCCAAAGAAG 645 Query 649 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAAAGGGGCTGGAAAATGGAGGAAGAACATCCTT 708 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct 646 CAGCAACAACGTGCTCAGACTTCTTCTAGAGGGGCTGGAAGATGGAGGAAGAATATCCTT 705 Query 709 CTCCTTGGAATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCCGTTTGGTGGTTTTGGAACACCAATGAG 768 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| Sbjct 706 CTCCTTGGTATTTTAGGAGGAGTTTCCTTCTCTGTTTGGTGGTTTTGGGACACTAATGAG 765 Query 769 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTAGCTAACATGTGTGATGAACGAGCCCGCGTG 828 ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || Sbjct 766 GAGATCATAATGAAAAGGAGGGAGACTTTGGCAAACATGTGTGACGAACGAGCACGTGTT 825 Query 829 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 888 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 826 TTACAAGATCAGTTCAATGTTAGCTTGAACCATGTTCATGCCTTGTCTATTCTTGTATCT 885 Query 889 ACATTTCATCATGGGAAAACCCCATCTGCCATTGATCAGAAAACATTTGAAGAATATACT 948 |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 886 ACATTTCATCATGGTAAAATCCCATCTGCCATTGATCAGAGAACATTTGAAGAATATACT 945 Query 949 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACAAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTTCCA 1008 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 946 GAGAGAACAAACTTTGAGAGGCCACTTACTAGTGGTGTAGCGTATGCTTTGAAAGTCCCA 1005 Query 1009 CACTCAGAAAGGGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGACAATAAAGAAAATGGAAACT 1068 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1006 CACTCAGAAAGAGAGAAATTTGAAAAGGAGCATGGATGGGCAATAAAGAAAATGGAAACT 1065 Query 1069 GAGGACCAGACAGTCGTCCAAGATTGTGTTCCTGAAAATTTTGATCCAGCACCTATTCAA 1128 |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| Sbjct 1066 GAGGACCAGACAGTTGTACAAGATTGTGTTCCTGAAAACTTTGATCCCGCACCGATTCAA 1125 Query 1129 GCCGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACAGTTTCCCATATTGTATCGGTTGAC 1188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 1126 GACGAATACGCGCCAGTTATATTTGCTCAAGAAACTGTTTCCCATATTGTATCGGTCGAC 1185 Query 1189 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATTTTGCGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1248 |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1186 ATGATGTCTGGAGAAGAAGACCGTGAAAACATCTTACGGGCAAGGGCATCAGGAAAAGGA 1245 Query 1249 GTATTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGCATCGTGTTGACCTTT 1308 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| Sbjct 1246 GTGTTAACATCTCCATTTAAGCTTCTTAAGTCAAATCATCTTGGTGTTGTGTTGACCTTT 1305 Query 1309 GCTGTGTATGACACGAGCCTACCGCCCAATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1368 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1306 GCTGTCTATGACACGAGCCTACCGCCTGATGCTACAGAAGAACAGCGTGTTGAAGCAACT 1365 Query 1369 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1428 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1366 ATTGGGTACCTTGGTGCATCATATGATATGCCATCGCTGGTGGAGAAACTTCTTCACCAA 1425 Query 1429 CTTGCCAGTAAACAGACGATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACCTCAGGTCTA 1488 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 1426 CTTGCCAGCAAACAGACAATTGCTGTGGATGTTTACGACACAACTAACACTTCAGGTCTA 1485 Query 1489 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCACATAAGTAGCCTTGAT 1548 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1486 ATAAAAATGTATGGCTCAGAAATTGGGGATATAAGTGAGCAGCATATAAGTAGCCTTGAT 1545 Query 1549 TTTGGTGATCCATCAAGGAATCATGAGATGCACTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1608 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1546 TTTGGTGATCCATCAAGGAACCATGAGATGCATTGCAGGTTTAAGCATAAACTTCCCATT 1605 Query 1609 CCTTGGACCGCGATAACAACGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1668 || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1606 CCCTGGACAGCGATAACACCGTCGATCTTAGTTCTGGTTATTACTTTTCTTGTTGGTTAT 1665 Query 1669 ATTTTCA-ATGAAGCCATCAATCGAATTGCCACAGTTGAAGAGGACTGTCAGAAGATGAG 1727 ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 1666 ATTTT-ATATGAAGCCATCAACCGAATTGCGACAGTTGAAGAGGATTGTCAGAAGATGAG 1724 Query 1728 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACGTTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1787 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1725 GGAACTCAAAGCTCGTGCTGAGGCCGCTGACATTGCAAAGTCACAGTTCCTAGCAACTGT 1784 Query 1788 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1847 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1785 TTCTCATGAGATACGGACTCCGATGAATGGAGTTTTAGGAATGCTGAAAATGCTGATGGA 1844 Query 1848 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCACAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1907 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1845 CACCGATCTTGATGCGAAGCAGATGGACTATGCGCAAACTGCTCATGGCAGTGGGAAGGA 1904 Query 1908 TCTTACATCCCTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCAGGAAGGCTCGA 1967 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 1905 TCTTACATCACTAATAAATGAGGTTCTTGATCAGGCAAAGATTGAATCCGGAAGGCTCGA 1964 Query 1968 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGCTTTATTCTGGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2027 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1965 GCTTGAAAATGTGCCTTTTGATATGCGTTTTATTCTTGATAATGTTTCATCTCTCCTCTC 2024 Query 2028 TGGCAAAGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2087 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2025 TGGCAAGGCAAATGAAAAAGGAATTGAGTTGGCCGTTTATGTTTCTAGTCAAGTTCCTGA 2084 Query 2088 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATAATTACAAACCTTGTTGGAAACTC 2147 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| Sbjct 2085 TGTTGTAGTCGGTGATCCGAGTCGGTTCCGGCAGATCATTACAAACCTGGTTGGAAACTC 2144 Query 2148 AATCAAGTTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2207 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2145 AATCAAATTCACACAGGAAAGGGGACACATATTTATCTCAGTGCACCTTGCAGATGAGGT 2204 Query 2208 AAGGGAGCCTCTTAATATTGAAGATGCAGTGCTAAAACAGAGACTAGCTTTAGGATGCAG 2267 || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2205 AAAGGAGCCTCTTACTATTGAAGACGCAGTGCTAAAACAGCGACTAGCTTTAGGATGCAG 2264 Query 2268 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCCGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2327 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2265 CGAGTCCGGTGAGACAGTTAGCGGGTTTCCTGCGGTAAATGCATGGGGAAGCTGGAAGAA 2324 Query 2328 TTTCAAGACATGTTACAGCT-CTGAGAATCATAATTCTGATAAAATCAAATTGCTAGTTA 2386 |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2325 TTTCAAGACATGTTACAG-TACTGAGAGTCAGAATTCTGATCAAATCAAATTGCTAGTTA 2383 Query 2387 CAGTGGAGGACACAGGAGTGGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATATTCACGCCTT 2446 ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| Sbjct 2384 CAGTGGAGGACACTGGAGTTGGCATACCTGTGGATGCACAAGGCCGAATCTTCACACCTT 2443 Query 2447 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGGACTGGCATAGGTTTGAGCA 2506 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | Sbjct 2444 TTATGCAAGCCGACAGTTCCACATCGCGGACTTATGGTGGAACTGGCATAGGTTTGAGTA 2503 Query 2507 TAAGCAAGCGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2566 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2504 TAAGCAAACGTTTGGTTGAACTCATGCAAGGAGAGATGGGGTTTGTGAGTGAGCCCGGGA 2563 Query 2567 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGTAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCAATTA 2626 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 2564 TAGGCAGTACTTTTTCATTTACTGGAGTTTTCGGGAAAGCAGAAACAAATACGTCGATTA 2623 Query 2627 CTAAGTTGGAACGATTCGATCTAGCTCTTCAGGAGTTTAAAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2686 ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2624 CTAAGCTGGAACGATTCGATCTAGCTATTCAGGAGTTTACAGGATTGAGAGCATTAGTTA 2683 Query 2687 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTGACCAGCTACCATCTTCAGAGACTGGGAATAT 2746 |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| Sbjct 2684 TTGATAACAGAAACATTAGAGCAGAGGTCACCAGGTACGAACTTCGGAGACTGGGAATAT 2743 Query 2747 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTTAGAATGGCATGCACCTCT-GT--CAGCAAATTAGAAA 2803 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||| Sbjct 2744 CTGCAGACATTGTTTCAAGTCTGAGAATGGCATGCACTTGTTGTATCAGCAAATTAGAAA 2803 Query 2804 ATTTGGCTATGGTTCTAATCGACAAAGACGCCTGGAACAAGAAAGACTTTTCAGTACTTG 2863 ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 2804 ATTTGGCTATGATTCTAATAGACAAAGACGCCTGGAACAAGGAAGAATTTTCAGTACTTG 2863 Query 2864 ACGAGTTGTTTACCCGTAGCAAAGTAACCTTTGCAAGAGTCCCAAAGATTATTCTTTTGG 2923 |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 2864 ACGAGTTGTTTACCCGAAGCAAAGTAACCTTTACAAGAGTCCCAAAGATTTTTCTTTTGG 2923 Query 2924 CAACCTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTTCTGGCCTCATCGATGAGG 2983 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 2924 CAACTTCTGCAACTCTTACTGAGCGCAGTGAGATGAAGTCTACTGGTCTCATCGATGAGG 2983 Query 2984 TAGTAATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043 | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2984 TGGTGATAAAGCCTCTTCGGATGAGTGTCTTAATATGTTGCTTGCAAGAAACCCTTGTCA 3043 Query 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGGATAGAAAGCGAAGAAATCTTGGACACTTACTCAGAGAAA 3103 |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| Sbjct 3044 ATGGCAAGAAGAGGCAACCGAACAGACAGCGAAGAAATCTTGGACACTTGCTAAGAGAAA 3103 Query 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGACGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCCGAAGGTGCACTTA 3163 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 3104 AACAGATTCTGGTTGTGGATGATAATCTTGTGAACAGACGAGTTGCAGAAGGTGCACTTA 3163 Query 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGGAAGGCTGCATTGGAAATGCTTA 3223 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| Sbjct 3164 AGAAATATGGAGCTATTGTTACATGCGTTGAGAGTGGCAAAGCTGCATTGGCAATGCTTA 3223 Query 3224 AGCCGCCTCACAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3224 AGCCGCCTCATAACTTCGATGCTTGCTTCATGGATCTCCAGATGCCTGAAATGGATGGAT 3283 Query 3284 TTGAAGCAACGAGGAGAGTCCGTGATCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343 ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3284 TTGAAGCGACAAGGAGAGTCCGTGAGCTGGAGAGGGAAATCAATAAGAAAATAGCTTCTG 3343 Query 3344 GAGAAGTTTCTGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCATGTCCCGATATTAGCAA 3403 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 3344 GAGAAGTTTCAGCTGAAATGTTCTGTAAATTTAGTAGTTGGCACGTCCCGATATTAGCAA 3403 Query 3404 TGACAGCTGATGTTATTCAGGCTACTCACGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463 ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3404 TGACAGCAGATGTTATTCAGGCTACTCATGAAGAATGCATGAAATGTGGAATGGATGGTT 3463 Query 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTTTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3464 ATGTATCAAAACCGTTTGAAGAGGAAGTGCTCTACACAGCGGTAGCAAGATTCTTTGAAC 3523 Query 3524 CCTGTTAACAGAAAGCCTAAAAACGCCACTGCCCTTGTAGCATTATAGATATCAACCCGA 3583 | |||||| | | | ||||| |||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| Sbjct 3524 CTTGTTAA-A-A--G---AAAAA-GCCATTTCCCTTGTAGGATTATA--TATCAACCCGA 3573 Query 3584 GAGCTTTTTGATGTCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3643 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3574 GAGCTTTTTGACATCGGGTAGTATATCTTGAACATCCATGACCTGCAATTCAACTTGAGA 3633 Query 3644 TCAAGGAAAGAACCAGTCCATTATCCATTGTTCTTCACAGGTCTCGTTC-GCTTTAAGAC 3702 |||||| |||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| Sbjct 3634 TCAAGGCAAGAACCAGTTCATTGTCAATTTTTCTTCACAGGTCTCTTTCAGCTT-AAGAC 3692 Query 3703 CTTGTCTGGTTGAGTGAGAAAAAAGACTGCGAAAACCGCAATCTTTCTCTTTGTATAGAC 3762 || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 3693 CTCGTCTGGTTGAGTGAGAAAAA---CTGCGAAAACCG-A-TCTTTCTCTTTGTATAGAC 3747 Query 3763 AGTTTGTCGTCTTTGATCTCTGCATGTGTGTATAGTAGATTTCTAGTGTATAGCTCCATT 3822 | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| Sbjct 3748 ACTTTGTCTTCATTGATCTCTGCCTGTGTGTATAGTAGATTCCTAGGGTATAGCTCCATT 3807 Query 3823 ATATTCATTC-ATATATATA-AA-CCCAAATTCTCTCCTCTGAACTGTAAAACAGCTTGT 3879 ||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| Sbjct 3808 ATATTCATTTTATATATATATAAACCCAAACTCTGTCCTCTTAACTATGAAACAGCTTGT 3867 Query 3880 ATGTTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3915 || ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3868 ATATTGTGTAGTAATAGTAATGGCTCTTGATTACAT 3903 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 195049074384 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5