BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493647
Length=3667
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G35980.1 | Symbols: YAK1 | yeast YAK1-related gene 1 | chr5:... 5646 0.0
> AT5G35980.1 | Symbols: YAK1 | yeast YAK1-related gene 1 | chr5:14127984-14136324
FORWARD LENGTH=3778
Length=3778
Score = 5646 bits (3057), Expect = 0.0
Identities = 3528/3740 (94%), Gaps = 93/3740 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGGAAGCAGAAGAAGAAAGAACAAAAATCAGGAGTTGGCATTTTGAAGACGAAACTCATC 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 GGGAAGCAGAAGAAGAAAGAACAAAAATCAGGAGTTGGCATTTTGAAGACGAAACTCATC 61
Query 61 ATCTTCTTCTTCCTCAGACAACAACAACaaaaaaaGC--TTCACTTTCTCTCGACCCTtc 118
||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 62 ATCATCTTCTTCCTCAG------ACAACAAAAAAAGCTTTTCACTTTCTCTCCACCCTTC 115
Query 119 tctctct-ctctctcaaagtctctctctTTGCCGTCGTT-GCCTCGCAATCCTCTACACT 176
||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | | |||||||
Sbjct 116 TCTCTCTCCT-TCTGAAAGTCTCTCTCTTTGCCGTCGTTAGCCT--C--TTC-CTACACT 169
Query 177 TGGGGCTGCGATTCTTCCAATCCTCCGATTTCAA-TT--T--T-GAAATCATAGTTTGAA 230
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||
Sbjct 170 TGGGGCTGCGATTCTTCCAATCCTCCGATTTCAATTTCATCCTCTCAATCATAGTTTGAA 229
Query 231 ATCATCGAGC-TTTACGCTGCTGTTGGTGTTTGACGCCATAAAAATCGA--------T-T 280
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |
Sbjct 230 ATCATCGAGCTTTTACGGTGCTGTTGGTGTTTGACGCCGTAAAATTCGATCCTTTTTTAT 289
Query 281 -C---t--t-tt--ttttATCGATTGTTCTGTGAGATCGA--TTTTAGGGTTTCGAG-TT 328
| | | || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 290 ACATTTGATGTTGATTTTATCGATAGTTTTGTGAGATCGATTTTTTAGGGTTTCGAGTTT 349
Query 329 GGCGCTGACTTGA-GGTTTGATTGGATGAGAA-AAGAGGGGTATGGGACTTGAGTCAATT 386
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 350 GGCGCTGACTTGAGGGTTTGATTGGATGAGAATAAG-GGGTTATGGGACTTGAGTCAATT 408
Query 387 GGGTTTGTCTCCCTAATCATCGCAAATTCCTGATTTCTGAGCTCTTTCGAAGGAATTAGG 446
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 409 GGGTTTGTCTCCCTAATCATCGCAAATTCCTGATTTCTCAGCTCTTTGGAAGGAATTAGG 468
Query 447 ATTCGTTGATTTCGAGTTT-GTGTTG-GTTG----ATGAGAGAGTTGGGTTTGGTCAATT 500
||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 469 ATTCGTTGATTTCGAGTTTTGTGTTGTGTTGGTTGATGAGAGAGTTGGGTTTGGTCAATT 528
Query 501 GAGG--TTC---TGATC----A-TG----GAT---GA-CAT---TGA--TT----CAAGC 533
|||| || || | | || ||| || ||| ||| || |||||
Sbjct 529 GAGGGGTTTAGGTGTTGTTTTACTGTTTTGATTCTGATCATGGATGACATTGATTCAAGC 588
Query 534 GATGGCGCTGCGGCACCACGAGCTGGTGAGATTGGCTCTATTGGGGTATCAACACCGTGG 593
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 589 GATGGTGCTGCGGCTGCACGAGCTGGTGAGATTGGCTCTATTGGGGTATCCACACCGTGG 648
Query 594 AAGCCAATTCAGCTGGTTTTTAAGCGTTATTTGCCACAGAAA-GGTTCCGATAGCAAAGT 652
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||
Sbjct 649 AAGCCAATTCAGCTGGTTTTTAAGCGTTATTTGCCACA-AAATGGGTCTGCTAGCAAAGT 707
Query 653 TCGTGTTGCGGTGAAGAAGCCGGTGGTGGTGAGACTAACTAGGGACTTGGTTGAGACGTA 712
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 708 TCATGTTGCCGTGAAGAAGCCGGTGGTGGTGAGACTAACTAGGGACTTGGTTGAGACGTA 767
Query 713 CAAAATATGTGACCCACAGTTCAAATATAGAGGAGAGTTGAATCCCAAGCGATACTTAAC 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 768 CAAAATATGTGACCCACAGTTCAAATATAGAGGAGAGTTGAATCCCAAGCGGTACTTGAC 827
Query 773 TACTCCATCAGTTGGTGTGCACAATGACGGCTTTGATAATGTCAACTTCGATCTAATTCT 832
||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 828 TACTCCATCAGTTGGTGTGAACAATGATGGCTTTGATAATGTCAACTACGATCTAATTCT 887
Query 833 GGCTGTAAATGATGATTTTTGCAGTTCAGATTCACGGCAGAGATACATTGTCAAAGATCT 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GGCTGTAAATGATGATTTTTGCAGTTCAGATTCACGGCAGAGATACATTGTCAAAGATCT 947
Query 893 TCTTGGCCATGGGACTTTTGGTCAGGTTGCTAAATGCTGGGTTCCTGAGACAAACAGCTT 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TCTTGGCCATGGGACTTTTGGTCAGGTTGCTAAATGCTGGGTTCCTGAGACAAACAGCTT 1007
Query 953 TGTTGCTGTAAAAGTAATTAAAAACCAGCTTGCATACTATCAGCAGGCACTGGTTGAAGT 1012
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1008 TGTTGCTGTAAAAGTAATAAAAAACCAGCTTGCATACTATCAGCAGGCATTGGTTGAAGT 1067
Query 1013 ATCTATTTTGACAACGCTAAACAAGAAGTATGATCCTGAGGATAAGAACCATATCGTTCG 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 ATCTATTTTGACAACGCTAAACAAGAAGTATGATCCTGAGGATAAGAACCATATCGTTCG 1127
Query 1073 CATATACGACTACTTCTTATATCATGGTCATTTGTGCATATGCTTTGAACTTCTCGACAT 1132
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1128 CATATACGACTACTTCTTACATCAAAGTCATTTGTGCATATGCTTTGAACTTCTAGACAT 1187
Query 1133 GAATCTGTATGAGCTCATAAAGATAAATCAATTTAGAGGCCTATCATTAAGCATAGTCAA 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 GAATCTGTATGAGCTCATAAAGATAAATCAATTCAGAGGCCTATCATTAAGCATAGTCAA 1247
Query 1193 GCTCTTCTCTAAGCAGATCTTACTTGGTTTGGCTCTTTTGAAAGATGCTGGTATAATTCA 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 1248 GCTCTTCTCTAAGCAGATCTTACTTGGTTTGGCTCTTTTGAAAGATGCTGGCATAATCCA 1307
Query 1253 TTGTGATCTGAAGCCTGAGAATATTCTTCTGTGTGCCAGTGCGAAGCCAACTGAAATTAA 1312
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1308 TTGTGATCTGAAGCCAGAGAATATTCTTCTGTGCGCCAGTGTGAAGCCAACTGAAATTAA 1367
Query 1313 GATAATTGACTTTGGATCAGCGTGTACAGAAGATAAAACTGTTTATTCATATATTCAGAG 1372
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1368 GATAATTGACTTTGGATCAGCGTGCATGGAAGATAAAACTGTTTATTCATATATTCAGAG 1427
Query 1373 TCGTTACTACAGATCGCCGGAAGTCTTACTTGGTTACCAATACACTACAGCTATTGACAT 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428 TCGTTACTACAGATCGCCGGAAGTCTTACTTGGTTACCAATACACTACAGCTATTGACAT 1487
Query 1433 GTGGTCTTTTGGCTGCATTGTTGCCGAGCTGTTTCTTGGATTGCCACTATTTCCAGGAGG 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1488 GTGGTCTTTTGGCTGCATTGTTGCCGAGCTGTTTCTTGGATTGCCACTATTTCCAGGAGG 1547
Query 1493 TTCAGAATTTGATATCTTGAGGCGTATGATTGAAATACTAGGCAAACAACCACCTGATTA 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TTCAGAATTTGATATCTTGAGGCGTATGATTGAAATACTAGGCAAACAACCACCTGATTA 1607
Query 1553 TGTGCTCAAGGAAGCAAAAAATACGAATAAGTTCTTTAAATGTGTTGGGAGTGTCCACAA 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608 TGTGCTCAAGGAAGCAAAAAATACGAATAAGTTCTTTAAATGTGTTGGGAGTGTCCACAA 1667
Query 1613 TTTAGGGAATGGTGGAACTTATGGTGGCTTCAAAAGTGCTTATATGGCACTGACTGAAGA 1672
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 1668 TTTAGGGAATGGTGGAACTTATGGTGGCCTCAAAAGTGCTTATATGGCTTTGACTGGAGA 1727
Query 1673 AGAGTTTGAAGCCAGAGAAAAGAAAAAACCAGAAATTGGGAAAGAGTACTTCAACCATAA 1732
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1728 AGAGTTTGAAGCTAGAGAAAAGAAAAAGCCAGAAATTGGGAAAGAGTACTTCAACCATAA 1787
Query 1733 GAACCTTGAAGAAATTGTTAAAGGCTATCCTTACAAGATAAATTTGCCTGAGGACGATGT 1792
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1788 GAACCTTGAAGAAATTGTTAAAAGCTATCCGTACAAGATAAATCTACCTGAGGACGATGT 1847
Query 1793 AGTCAAAGAAACTCAAATCCGGTTAGCTCTTATTGATTTTCTGAGAGGACTTGTTGAATT 1852
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||
Sbjct 1848 AGTCAAAGAAACTCAAATCCGGTTAGCTCTTATTGATTTTCTGAAAGGACTTATGGAATT 1907
Query 1853 TGATCCAGCAAAACGTTGGTCACCTTTTCAGGCAGCCAAGCACCCTTTCATTACTGGGGA 1912
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1908 TGATCCAGCAAAACGTTGGTCACCTTTTCAGGCAGCAAAGCACCCTTTCATTACTGGAGA 1967
Query 1913 ACCTTTTACCTGCCCATACAACCCTGCGCCAGAAACTCCTCGTGTGCATGTTACCCAAAA 1972
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968 ACCTTTTACGTGCCCATACAACCCTCCGCCAGAAACACCTCGTGTGCATGTTACCCAAAA 2027
Query 1973 CATCAAAGTGGACCATCATCCAGGTGGAGGGCACTGGTTTGCTGCTGGTCTCTCTCCTAA 2032
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2028 CATCAAAGTTGACCATCATCCAGGTGAAGGGCACTGGTTTGCCGCTGGTCTCTCTCCTCA 2087
Query 2033 TGTATCAGGGAGAACCAGAATCCCGATGCACAATAGTCCCCATTTTCAGATGATACCTTA 2092
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2088 TGTATCAGGGAGAACCAGAATCCCGATGCACAATAGTCCCCATTTTCAGATGATGCCTTA 2147
Query 2093 CTCACATGCAAATAGTTATGGGAGCATTGGAAGCTATGGTAGCTACAATGATGGTAATAT 2152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2148 TTCACATGCAAATAGTTATGGGAGCATTGGAAGCTATGGTAGCTACAATGATGGTACTAT 2207
Query 2153 ACAGGA-AAGTAGTTATGGAAGCTATGGAGGGACTGGCAATATGTTTGCATACTACTCTC 2211
|||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2208 ACAGGACAA-TAGCTATGGGAGCTATGGAGGGACTGGCAATATGTTTGCATACTATTCTC 2266
Query 2212 CTGTGAATCATCCGGGCCTATACATGCAAAACAACAG-TGGGGTCTCAATGCTTGGAACT 2270
||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267 CTGTGAATCATCCAGGCCTATACATGCAAAACCA-AGGTGGGGTCTCAATGCTTGGAACT 2325
Query 2271 AGCCCTGATGCCAGACGTCGGGTTATGCAGTACCAACATGGATATGGGCCAAATGGCCTT 2330
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2326 AGTCCTGATGCCAGACGTCGGGTTATGCAGTACCCACATGGAAATGGGCCAAATGGCCTT 2385
Query 2331 GGTACAAGTCCATCTGCTGGAAATTTTGCACCACTACCCCTTGGCACTAGTCCGTCGCAA 2390
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2386 GGTACAAGTCCATCTGCTGGAAATTTTGCACCACTACCCCTTGGCACTAGTCCGTCACAA 2445
Query 2391 TTTACTCCGAATACAAACAATCAATTTTTAGCTGGGTCTCCTGGACACCATGGCCCGACA 2450
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2446 TTTACTCCAAATACAAACAATCAATTTTTAGCTGGGTCTCCTGGACACCATGGCCCGACA 2505
Query 2451 TCTCCGGTAAGAAACAGCAGTCATGGATCTCCTCTAGGAAAGATGGCTGCATTTAGTCAA 2510
||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2506 TCTCCAGTAAGAAACAGCTGCCATGGGTCTCCTTTGGGAAAGATGGCTGCATTTAGTCAA 2565
Query 2511 ATTAATAGAAGAATGAGCGCTGGATATTCTGGAGGTTCTCAGTCGCAAGATCCTTCCTTG 2570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2566 ATTAATAGAAGAATGAGCGCTGGATATTCTGGAGGTTCTCAGTCGCAAGATTCTTCCTTG 2625
Query 2571 TCACAAGCGCAAGGGCATGGGATGGATAATTTTTATCAAAATGAGGGATATTCTGGACAA 2630
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2626 TCACAAGCCCAAGGGCATGGGATGGATAACTTTTATCAAAATGAGGGGTATTCTGGACAA 2685
Query 2631 TTCTCTGGTTCACCTTCACGCCGGCAATTGGATTCTTGTGGCAAAAATCGTAAACAGACA 2690
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2686 TTCTCTGGTTCACCTTCACGCCGGCAACTGGATTCTGGTGTCAAAAATCGTAAACAGACA 2745
Query 2691 CAAGGAGGCACTACATTAAGTACTGGGTACTCTACTCATAACAATTCCAACTCATCACTT 2750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2746 CAAGGAGGCACTACATTAAGTACTGGGTACTCTACTCATAACAATGCCAACTCATCACTT 2805
Query 2751 CGGTCCAATATGTCTAACCCTTCCAGTACTGCACACCATCTTGAAAATCCGGATACTGCC 2810
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806 CGGTCCAATATGTATAACCCTTCCAGTACTGCACACCATCTTGAAAATCCGGATACTGCC 2865
Query 2811 TTATCAGTACCTGATCCAGGAGACTGGGACCCAAATTACAGTGATGACTTGCTTCTAGAA 2870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2866 TTATCAGTACCTGATCCAGGAGACTGGGACCCAAATTACAGTGATGACTTGCTTCTAGAA 2925
Query 2871 GAAGATAGTGCGGATGAGAGTTCTCTTGCTAATGCATTCAGCAGAGGTATGCAACTTGGT 2930
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2926 GAAGATAGTGCAGATGAGAGTTCTCTTGCTAATGCATTCAGCAGAGGTATGCAACTTGGT 2985
Query 2931 TCAACAGATGCCTCCAGTTATTCCAGAAGGTTCAACAGTAATGCCTCGACCTCATCCTCA 2990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2986 TCAACAGATGCCTCCAGTTATTCCAGAAGGTTCAACAGTAATGCCTCGACCTCATCCTCA 3045
Query 2991 AATCCGACTACCCAAAGGAGATATGCTCCCAATCAAGGCTATTCACAAGTAGAGACTGGC 3050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 3046 AATCCGACTACCCAAAGGAGATATGCTCCCAATCAAGCCTTTTCACAAGTAGAGACTGGC 3105
Query 3051 AGCCCTCCAAGTAATGATCCTCATGCCAGATTTGGCCAACATATACCAGGATCACAATTT 3110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3106 AGCCCTCCAAGTAATGATCCTCATGCCAGATTTGGCCAACATATACCAGGATCACAATAT 3165
Query 3111 ATTCCTCACGTCTCCCAGAACTCTCCAAGTCGCTTAGGGCAGCAACCTCCTCAACGGT-T 3169
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3166 ATTCCTCATGTCTCCCAGAACTCTCCAAGTCGCTTAGGGCAGCAACCTCCTCAACGGTAT 3225
Query 3170 CAATCATGGGAGACCAAATGCTGGAAGAACTATGGATCGGAATCACATCAACGCTCAGCT 3229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3226 -AATCATGGGAGACCAAATGCTGGAAGAACTATGGATCGGAATCACATGAACGCTCAGCT 3284
Query 3230 TCCCCCTTCCAACACGAATTCTGGGGGTCAACAACGCTCACCCAGAAGTAGCTCATATAC 3289
||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3285 TCCTCCTTCCAATACAAATTCTGGGGGTCAACAACGTTCACCCAGAAGTAGCTCATATAC 3344
Query 3290 CAATGGTGTCCCTTGGGGACGTAGGACTAACAATCATGTCCCGAATGTTCCATCGACGTC 3349
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 AAATGGTGTCCCTTGGGGTCGTAGGACTAACAATCATGTCCCGAATGTTCCATCGACGTC 3404
Query 3350 CCATGGAAAGGTAGACTACGGAAGTATTGCTTAATTCC-CAAGTTTTATCT-CTCATTTA 3407
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||
Sbjct 3405 CCATGGAAGGGTAGACTACGGAAGTATTGCTTAATTCTGCA-GTCTT-TCTTCTCATTTA 3462
Query 3408 TTTTGTTCTTTCCCTTGGTGTGCAATCTTCTTGTTGGAAGTGTGGGAACAAAGTTGTACT 3467
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3463 TTTTGTTCTTTCCCTTGGTGTGCAATCTTCTTGTTAGAAGTGTGGGAACAAAGTTGTACT 3522
Query 3468 GAGACAAAAAACAAACTTAGTTCATGGCTTGTGGGCTTCTGATCAGAACGTGCTTATTCA 3527
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3523 GAGACAAGAAACAAACTTAGTTCATGGCTTGTGGGCTTCTGATCAGAACGTGCTTATTCA 3582
Query 3528 TTGTGCTTTTTGCACAAATAAACCaaaaaaaaaaaGTATGTTATCATTGATATTGTTATC 3587
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3583 TTGTGCTTTTTGCACAAATAAAC-AAAAAAAAAAAGTATGTTATAATTGATATTGTTATC 3641
Query 3588 TTTCTGGCATCTATCTCTCGGAATTTCTTATTGGTATTCTCTGTTGAATGTATCTTTTGG 3647
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3642 TTTCTGGCATCTATCTCTCTGAATTTCTTTTTGGTATTCTCTGATGAATGTATCTTTTGG 3701
Query 3648 CAAAGTTGTTGAAGTGTTTA 3667
||||||||| |||||||||
Sbjct 3702 GAAAGTTGTTCAAGTGTTTA 3721
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182607672520
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5