BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493706
Length=1521
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G37340.2 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr... 2368 0.0
AT5G22480.1 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr... 2078 0.0
> AT5G37340.2 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr5:14787264-14792771
REVERSE LENGTH=1807
Length=1807
Score = 2368 bits (1282), Expect = 0.0
Identities = 1451/1531 (95%), Gaps = 17/1531 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 7 GGATTGTTTGGAGAAACTTTTGGAGGTGATGGACAATGGGAATGATCAACAAATCGATGT 66
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 GGATTGTTTGGAGAAATTTTTGGAGGTGATGGACAACGGGAATGATCAACAAATCGATGT 118
Query 67 TGGATCGGTGGTTGAAGCTGTTTCTGCTGATCATTCCTTTGGTGCTCCTCTCTATGTAGT 126
||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 TGGCTCGGTAGTTGAAGCAGTTTCGGCTGATCATTCCTTTGGTGCTCCTCTCTATGTAGT 178
Query 127 TGAGAGCATGTGTATGCGCTGCGGTGAAAATGGAACAACTAGATTTCTATTGACCTTAAT 186
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 TGAGAGTATGTGTATGCGCTGCGGTGAAAATGGAACAACTAGATTTCTATTGACCTTAAT 238
Query 187 TCCTCACTTCAGAAAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCAGCACTGCGGAGAAAGGAA 246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 239 ACCTCACTTCAGAAAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCCGCATTGCGGAGAAAGGAA 298
Query 247 TAATGAAGTTCAGTTTGCTGGTGAGATTCAACCCCGAGGATGCTCTTACCATCTAGAGGT 306
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 TAATGAAGTTCAGTTTGCTGGCGAGATTCAACCCCGAGGATGCTCTTACCATCTAGAGGT 358
Query 307 TTCAGCTGGCGATGTGAAGATATTTGACCGGCAAGTTGTAAAATCTGAATCTGCCACTAT 366
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 359 TTCAGCTGGTGATGTGAAGACATTTGACCGGCAAGTTGTAAAATCTGAATCAGCCACTAT 418
Query 367 TAAGATTCCTGAACTGGATTTTGAAATTCCACCAGAGGCCCAACGGGGTAGTTTATCTAC 426
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 419 TAAGATTCCTGAACTGGATTTTGAGATTCCACCAGAGGCCCAAAGTGGTAGTTTATCTAC 478
Query 427 GGTGGAAGGGATACTATCCCGGGCTGCTGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAGAACGCAG 486
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 GGTGGAAGGGATACTATCCAGGGCTGCTGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAGAACGCAG 538
Query 487 GAAAGTAGATCCTAAAACTGCGGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCTAAACTCAGAGCTTG 546
|||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 539 GAAAGTGGATCCTAAAACAGCTGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCTAAACTGAGAGCTTG 598
Query 547 TGCTAAAGCAGAGACATCATTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACAGTTTCAT 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TGCTAAAGCAGAGACATCATTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACAGTTTCAT 658
Query 607 TGAGAACCCACATGCTCCATCACTAGATCCCTCACTAACAATCAAGTTCTATGAGCGAAC 666
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 659 TGAGAACCCACATGCTCCATCATTAGATCCCTCACTAACGATCAAGTTCTATGAGCGTAC 718
Query 667 ACCCGAACAACAAGCAACTCTTGGATATCTTACTAACCCATCTCAGACTGGACAGTTAGA 726
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 719 ACCCGAACAACAAGCAACTCTTGGATATCTTACTAACCCATCTCAGACTGGACAGTCAGA 778
Query 727 AAGAAGTCTTGAAACATCTTCTACCCAAACAACTGCTCTACCTCATGGAACTATCGGAGC 786
|||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 779 AAGAAGCCTGGGAACACCTTCTACTCAAACAACTGCTCTACCTCATGGAACTATCGGAGC 838
Query 787 AACAGCTGGTCATCGAGCAATTGCACAGAGTAATAGTACTGATATTTCAGATAACTTGTT 846
||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 AACAGCTGGTCATCGGGCTATTGCGCAGAGTAATAGCACTGATATTTCAGATAACTTGTT 898
Query 847 TAGATACACTGCGCCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCATGTGCAAA 906
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 899 TAGATACTCTGCGCCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCATGTACAAA 958
Query 907 GCTGTGTGAAACACGGATGTTCGT-----G-A--CT---AAAA-TCCCGTA-CT-TTCA- 951
||||||||| |||||||||||||| | | || |||| || ||| | |||
Sbjct 959 GCTGTGTGAGACACGGATGTTCGTTACTAGTATTCTTTCAAAACTCT-GTAGCCGTTCCT 1017
Query 952 -GGAGGTTATTGTCATGGCATCTACATGTGATGATTGTGGCTATCGTAATTCTGAGTTGA 1010
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1018 TGGAGGTTATCGTCATGGCATCTACATGTGATGATTGTGGCTATCGGAATTCTGAGTTGA 1077
Query 1011 AGCCTGGTGGTGCAATTCCTGAAAAGGGAAAGAAAATTACTCTCTCTGTGAAAAACATCA 1070
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
Sbjct 1078 AGCCTGGTGGTGCAATTCCTGAAAAGGGAAAGAAAATTACGCTCTCTGTGAAGAACATAA 1137
Query 1071 CTGACCTTAGCCGGGATGTGATCAAGTCAGACACCGCTGGAGTGAAAATCCCAGAACTTG 1130
||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 CTGACCTTAGCCGCGATGTTATCAAGTCAGACACTGCAGGAGTGAAAATCCCAGAACTTG 1197
Query 1131 ATCTGGAGCTAGCTGGTGGTACACTTGGTGGAATGGTAACAACAGTGGAAGGGTTGGTCA 1190
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 ATTTGGAGCTAGCTGGTGGTACACTTGGTGGAATGGTAACAACAGTGGAAGGGTTGGTCA 1257
Query 1191 CACAAATCAGAGAAAGCTTAGCGAGAGTCCACGGATTCACTTTTGGTGACAGTTTGGAGC 1250
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CACAGATCAGAGAAAGCTTAGCGAGAGTCCATGGATTCACTTTTGGTGACAGTTTGGAGC 1317
Query 1251 AGAGTAAGATTAACAAGTGGAAAGAATTTGGAGCCAGACTAACAAAGCTTCTAAGCTTAG 1310
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1318 AGAGTAAGATTAACAAGTGGAAAGAATTTGGATCCAGACTAACTAAGCTTCTAAGCTTAG 1377
Query 1311 AACAGCCGTGGACATTGATTCTTGATGACGAATTAGCAAATTCCTTTATTTCACCAGTAA 1370
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1378 AACAGGAATGGACATTGATTCTTGATGACGAATTAGCGAATTCTTTTATTTCACCAGTAA 1437
Query 1371 CAGATGATATCAAAGATGATCATCAGCTCACATTTGAAGAGTACGAGAGATCATGGGAGC 1430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 CAGATGATATCAAAGATGATCATCAGCTCACATTTGAAGAGTACGAGAGATCATGGGAGC 1497
Query 1431 AAAACGAGGAGTTGGGTCTCAACGACATAGATACTTCTTCAGCTGATGCTGCTTATGAAT 1490
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1498 AAAACGAGGAGTTGGGTCTCAACGACATTGATACTTCTTCAGCTGATGCTGCTTATGAGT 1557
Query 1491 CCGCAGAGCCAACTAAATTACCTTAAACCTG 1521
|| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 CCACAGAGCCAACTAAATTACCTTAAACCTG 1588
> AT5G22480.1 | Symbols: | ZPR1 zinc-finger domain protein | chr5:7451505-7456685
REVERSE LENGTH=1795
Length=1795
Score = 2078 bits (1125), Expect = 0.0
Identities = 1390/1520 (91%), Gaps = 9/1520 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTCTTGGGATTGTTTGGAGAAACTTTTGGAGGTGATGGACAATGGGAATGATCAACAAAT 60
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||
Sbjct 143 TTCTTGGGATTGTTTGGAGAAAC-TTTGGAGGTGATGGACAACAAAAATGATCAGGATAT 201
Query 61 CGATGTTGGATCGGTGGTTGAAGCTGTTTCTGCTGATCATTCCTTTGGTGCTCCTCTCTA 120
|||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 202 TGATGTTAGATCAGTGGTTGAAGCTGTTTCCGCCGATCTTTCCTTTGGTGCTCCCCTCTA 261
Query 121 TGTAGTTGAGAGCATGTGTATGCGCTGCGGTGAAAATGGAACAACTAGATTTCTATTGAC 180
||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 262 TGTGGTTGAGAGCATGTGCATGCGCTGCCAAGAAAATGGAACAACCAGATTTCTATTGAC 321
Query 181 CTTAATTCCTCACTTCAGAAAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCAGCACTGCGGAGA 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||
Sbjct 322 CTTAATTCCTCACTTCAGAAAGGTCTTAATATCTGCATTTGAATGTCCGCATTGCGGGGA 381
Query 241 AAGGAATAATGAAGTTCAGTTTGCTGGTGAGATTCAACCCCGAGGATGCTCTTACCATCT 300
||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||
Sbjct 382 AAGGAATAATGAAGTTCAGTTCGCAGGCGAGATTCAACCCCGTGGATGCTGTTACAATCT 441
Query 301 AGAGGTTTC-AGCTGGCGATGTGAAGATATTTGACCGGCAAGTTGTAAAATCTGAATCTG 359
||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 442 AGAGG-TTCTAGCTGGTGATGTGAAGATATTTGACCGGCAAGTTGTGAAATCTGAATCAG 500
Query 360 CCACTATTAAGATTCCTGAACTGGATTTTGAAATTCCACCAGAGGCCCAACGGGGTAGTT 419
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||
Sbjct 501 CCACTATTAAGATTCCTGAACTGGATTTTGAGATTCCACCAGAGGCCCAACGTGGAAGTT 560
Query 420 TATCTACGGTGGAAGGGATACTATCCCGGGCTGCTGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAG 479
| ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 561 TGTCTACTGTGGAAGGGATATTAGCACGGGCTGCTGATGAACTGAGTGCCCTTCAAGAAG 620
Query 480 AACGCAGGAAAGTAGATCCTAAAACTGCGGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCTAAACTCA 539
|||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 621 AACGCAAGAAAGTTGATCCTAAAACTGCTGAAGCAATAGACCAATTCTTGTCCAAACTGA 680
Query 540 GAGCTTGTGCTAAAGCAGAGACATCATTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACA 599
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 681 GAGCTTGTGCTAAAGCAGAGACATCCTTCACCTTCATTTTGGATGATCCTGCTGGAAACA 740
Query 600 GTTTCATTGAGAACCCACATGCTCCATCACTAGATCCCTCACTAACAATCAAGTTCTATG 659
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||
Sbjct 741 GTTTCATTGAGAACCCACATGCTCCATCACCAGATCCCTCTCTAACCATCAAATTCTATG 800
Query 660 AGCGAACACCCGAACAACAAGCAACTCTTGGATATCTTACTAACCCATCTCAGACTGGAC 719
|||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||
Sbjct 801 AGCGAACACCAGAGCAACAAGCAACACTTGGATATGTTGCTAACCCATCTCAGGCTGGAC 860
Query 720 AGTTAGAAAGAAGTCTTGAAACATCTTCTACCCAAACAACTGCTCTACCTCATGGAACTA 779
| | |||| |||| |||| || ||||||| ||||| || | ||||| ||||||| |
Sbjct 861 AATCAGAAGGAAGCCTTGGCGCACCTTCTACTAAAACAGCTTATGTACCTAATGGAACAA 920
Query 780 TCGGAGCAACAGCTGGTCATCGAGCAATTGCACAGAGTAATAGTACTGATATTTCAGATA 839
|||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 921 TCGGAGCAACTGCTGGTCATCGCGCGATTGCTCAGAGTAATAGCACTGATATTTCCGACA 980
Query 840 ACTTGTTTAGATACACTGCGCCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCAT 899
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 981 ACTTGTTCAGATACTCTGCGCCTGAAGAGGTGATGACTTTCCCTTCAACTTGCGGAGCAT 1040
Query 900 GTGCAAAGCTGTGTGAAACACGGATGTTCGTGACTAAAATCCCGTACTTTCAGGAGGTTA 959
|| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1041 GTACGGAGCCGTGTGAGACACGGATGTTCGTGACTAAAATCCCGTACTTTCAGGAAGTTA 1100
Query 960 TTGTCATGGCATCTACATGTGAT-GATTGTGGCTATCGTAATTCTGAGTTGAAGCCTGGT 1018
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 TTGTCATGGCATCTACATGTGACAG-TTGTGGCTATCGTAATTCTGAGTTGAAGCCTGGT 1159
Query 1019 GGTGCAATTCCTGAAAAGGGAAAGAAAATTACTCTCTCTGTGAAAAACATCACTGACCTT 1078
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||
Sbjct 1160 GGTGCAATTCCTGAAAAGGGAAAGAAGATTACTCTCTCTGTGAGGAACATTACAGACCTT 1219
Query 1079 AGCCGGGATGTGATCAAGTCAGACACCGCTGGAGTGAAAATCCCAGAACTTGATCTGGAG 1138
||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220 AGCCGAGATGTTATCAAGTCGGACACTGCAGGAGTGATAATCCCAGAACTTGATCTGGAG 1279
Query 1139 CTAGCTGGTGGTACACTTGGTGGAATGGTAACAACAGTGGAAGGGTTGGTCACACAAATC 1198
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||
Sbjct 1280 CTAGCTGGTGGTACACTTGGTGGAATGGTAACAACAGTTGAAGGGTTGGTTACACAGATC 1339
Query 1199 AGAGAAAGCTTAGCGAGAGTCCACGGATTCACTTTTGGTGACAGTTTGGA-GCAGAGTAA 1257
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||
Sbjct 1340 AGAGAAAGCCTAGCGAGAGTTCACGGATTCACTTTTGGTGATAGTATGGAAG-AGAGTAA 1398
Query 1258 GATT-AACAAGTGGAAAGAATTTGGAGCCAGACTAACAAAGCTTCTAAGCTTAGAACAGC 1316
| || ||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1399 G-TTGAACAAATGGAGAGAATTTGGAGCCAGGCTCACTAAGCTCCTAAGCTTTGAACAGC 1457
Query 1317 CGTGGACATTGATTCTTGATGACGAATTAGCAAATTCCTTTATTTCACCAGTAACAGATG 1376
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1458 CGTGGACATTGATTCTTGATGATGAATTAGCAAATTCCTTTATTGCACCAGTAACAGATG 1517
Query 1377 ATATCAAAGATGATCATCAGCTCACATTTGAAGAGTACGAGAGATCATGGGAGCAAAACG 1436
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1518 ATATCAAAGATGACCATCAGCTCACATTTGAAGAGTACGAGAGGTCATGGGATCAAAACG 1577
Query 1437 AGGAGTTGGGTCTCAACGACATAGATACTTCTTCAGCTGATGCTGCTTATGAATCCGCAG 1496
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1578 AGGAGTTGGGTCTCAACGACATAGATACTTCTTCAGCTGATGCTGCTTATGAATCCACAG 1637
Query 1497 AGCCAACTAAATTACCTTAA 1516
|| | |||||||||||||||
Sbjct 1638 AGACGACTAAATTACCTTAA 1657
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 75049814775
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5