BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg493939
Length=5845
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G40480.1 | Symbols: EMB3012 | embryo defective 3012 | chr5:1... 9149 0.0
> AT5G40480.1 | Symbols: EMB3012 | embryo defective 3012 | chr5:16213222-16224058
FORWARD LENGTH=5987
Length=5987
Score = 9149 bits (4954), Expect = 0.0
Identities = 5561/5851 (95%), Gaps = 54/5851 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 27 CTACTTCTTCAATTCACTCTCCTTCGTCTGCGTTGATGTAGCAAAACAAAGAGAACaaaa 86
|||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | ||| |
Sbjct 83 CTACTTCTTCAATTTACTCTCATTCGTTTGCGTTGATGTAGCAAAAC-AA-A-AAC--CA 137
Query 87 aaaTGG-TCCGTGTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCCTGCTATCGGCTGGAGAA 145
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||
Sbjct 138 AAATGGTTCC-CGTCTCGTTCTGCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTTGCTCTCTGCTGGAGAG 196
Query 146 ATTTCATCGCAATTAGGTTCTGGTCCACACATTACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCG 205
| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197 AGTTCATCGCAATTAGTTTCTGGTCCACACATCACCGATGTTAACATACTCTTACCTCCC 256
Query 206 AAGATGAAGAACCCAGTTGAGTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCG 265
||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 AAGATGAAGAATCCGGTTGAGTATCGCCTTCAAGGAAGTGATGGCTGCTTCAAATGGTCA 316
Query 266 TGGGATCATCATGACATTCTCTCAGTTACACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCATTGCTCG 325
|||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 317 TGGGATCATCATGATATTCTATCAGTCACACCTGAGTTTAATTCGAGCAGTCATTGTTCG 376
Query 326 ACCAGCGCGCGTCTCAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAAGAGACTGCAGTTTAT 385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 377 ACCAGCGCGCGTCTCAGATCGATTTCTCCGTATAGTGGTAGAAAGGAGACTGCAGTTTAT 436
Query 386 GCCACTGATATACAGACCGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTGTTTATTGACAACTTCTCA 445
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 437 GCCACTGATATACAGACTGGGATGGTGATTCGCTGCAAGGTCTTTATTGACAACTTCTCA 496
Query 446 CGGATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGACTTTGAATGCTTAGA 505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 497 CGGATTCAGATTTTTCATAATTCTATCAAGCTTGATCTTGATGGTCTTTCCATGCTTAGA 556
Query 506 GTCCGCGCTTTTGATAATGAAGAGAACGAGTTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATG 565
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 GTCCGCGCTTTTGATAATGAAGATAACGAGTTCTCCTCACTGGTGGGTCTACAATTCATT 616
Query 566 TGGAAGCTGATGCCTGAAAGTGGTGGATCAACGCATCACCTTGCTCATGTGCCTTTGAAG 625
|||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 617 TGGAAGCTAATGCCTGAGAGTGGTGGATCAACACATCATCTTGCTCATGTGCCTTTGAAG 676
Query 626 GAATCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTGGATATCCAGAAAAAGCTT 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 677 GAATCTCCGTTGACTGACTGTGGAGGACTGTGTGGCTACTTAGATATCCAGAAAAAGCTT 736
Query 686 GAAGATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTCGTGAAGGGAACCAAAATTGGACATGAG 745
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 737 GAAGATAGTGGTGTATTTGCAGATTTGTTTGTTGTGAAGGGAACTAAAATTGGACATGAG 796
Query 746 AAGGTTTCAGTGCATCTGCTTGAGGCTCCTCTGACCCATATAGCCGATGAAATAGTACTA 805
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
Sbjct 797 AAGGTTTCAGTTCATCTGCTTGAGGCTCCTCTGACCCATATAGCTGATGAAATTGTATTA 856
Query 806 ACTGTGGCAGAGGCCATGTCTCTTGAACCTCGTTCACCAGTCTATGTCCTGATGGGAGCT 865
|| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 857 ACGGTTGCAGAAGCCATGTCTCTTGAACCTCGCTCACCTGTCTATGTCCTGATGGGAGCT 916
Query 866 TCTTTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGGAAATGTTCCTCAAGCCGTGCATCTACCA 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 917 TCTTTTGGTTACACGTTAAAGGTCATGCGTGGAAATGTTCCTCAAGCCGTGGATCTACCA 976
Query 926 TCACCACATCATAGATGGTCTGTGTTGAACACTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATA 985
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 TCACCACATCATAGATGGTCTGTGTTAAACTCTTCTGTTGCTCAAGTGGATTCTTTGATA 1036
Query 986 GGTCTGACTAAAGCGTTAAGCTTAGGGGTAACAACAGTTGTTGTTGAGGACACCCGGGTC 1045
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1037 GGTCTGACTAAAGCGTTAAGCTTGGGGGTAACAACAGTTGTTGTTGAGGATACCCGGGTC 1096
Query 1046 GCTGGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTATTATCTTGTAC 1105
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1097 GCTGGCCACATTCAAGGATCATCTATTAATGTTGTCACTCCAGATACTCTTATCTTGTAC 1156
Query 1106 ATATCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCGAAACCTTTTCCATCATCG 1165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1157 ATATCACCTTGGTCAATGTCAGGGGATCTTATTACAGAATCCAAACCTTTTCCATCATCT 1216
Query 1166 ATGCATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGA 1225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 ATGCATTGGTATGTGGTGTCTGGTCGTCAATATCTAATTCAAATGAAGATTTTCTCTGGA 1276
Query 1226 AGACCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAA 1285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 AGACCTGATGCACATGAAATCTATATAACTGAGACGGATGACATAAAACTGTATGGAAAA 1336
Query 1286 GATTCAGAGTATTGGAAAATCTTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAG 1345
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 GATTCAGATTATTGGAAAATCGTCTCACTGCCAGATGAACTTTCCTCTGAATATGGTCAG 1396
Query 1346 CAAAATTCTAGAATTTTGAACGCAATGTCACCAGGATTAGGAGAGCT-A-ATGGCTACAT 1403
| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||
Sbjct 1397 CGAAATTCTAGAATTTTGAACGCAATCTCACCAGGATTAGGAGAGCTGACAT--CTACAT 1454
Query 1404 TGACTTACTTCAGTGGGCATCAGGAATCAAAAGAGGTTCTCAAAGTTGTCCAAGAAATTA 1463
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1455 TGACTTACTTCAGTGGGCATCAAGAGTCAAAAGAGGTTCTCAAGGTTGTCCAAGAAATTA 1514
Query 1464 TGGTTTGTGAGAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTAAAGATGACACACCTAAGATTCTAC 1523
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1515 GGGTTTGTGAAAAAGTGCAGTTCACATTGAACAGTGAAGATGACACACCTAAGGTTCTAC 1574
Query 1524 TCCCTTGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAACTGTGACAGGAGGTTGTGCAA 1583
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1575 TCCCATGGACCCCTGCTGTTTATCAGGAGATGGAGCTAATTGTGACAGGAGGTTGTGCAA 1634
Query 1584 AAGCATCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATGAGCATTTTGTCGGTGTCAGCTT 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635 AAGCATCGAGTGACTACAAGTGGTTTACTTCAGATATAAGCATTTTGTCGGTGTCAGCTT 1694
Query 1644 ATGGAATTGTCCAGGCAAAGAGGCCTGGAATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCTACTTTCG 1703
|||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1695 ATGGAATTATCCAGGCAAAGAGGCCCGGTATAGCCACTGTGAAGGTGGTGTCGACTTTCG 1754
Query 1704 ATTCACAAAATTTTGATGAGGTTATCGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGT 1763
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 ATTCACAAAATTTTGATGAGGTTATTGTTGAAGTTTCCATTCCATCCTCTATGGTTATGT 1814
Query 1764 TGCAAAACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGA 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1815 TGCAAAACTTCCCAGTAGAGACAGTTGTTGGATCACACCTGAAAGCTGCTGTCACAATGA 1874
Query 1824 AGGCTTTAAATGGTGCCTTGTTCTCTAGATGTGATGCATTTAATTCATTGATAAAGTGGA 1883
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1875 AGGCTTTAAATGGTGCAACGTTCTCTAGATGTGATGCTTTTAATTCATTGATAAAGTGGA 1934
Query 1884 AGACAGGGAGTGACTCTTTTGTTATTGTTAATGCAACATCTGAGATAATGATGTTGGACG 1943
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1935 AGACGGGGAGTGAGTCTTTTGTTATTGTTAATGCAACATCTGAGATGATGATGTTGGACG 1994
Query 1944 AACTAAGAACCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCACGGGCTTCTATAT-TGACTTCATCT 2002
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||
Sbjct 1995 AACTAAGAAGCATGGACTCCAGCCCTCCTTGTTCACGGGCTTCTATATAT-ACTGCATCT 2053
Query 2003 CCTGGCCGAACAGTACTACAAGCAACTCTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCT 2062
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054 ACTGGCCGCACAGTATTACAAGCAACTCTGGCAAAAGAGTTCCATTATTTTGATAAGTCT 2113
Query 2063 TTGAGTGAATCAATTGATTTGAAAGCAACTTTAAGTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCT 2122
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 TTGAGTGAATCAATAGATTTGAAAGCAACTTTAACTATCGGGGCCTATCTGCCACTTTCT 2173
Query 2123 GTCAGACAAGATAGTGACGGGAATCATCATGGTGGATATTGGTTTGATAAGGCACAGGAA 2182
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2174 GTCAGACAAGATAGTGACGGGAATCATCATGGTGGATATTGGTTTGATAAGGCACAAGAG 2233
Query 2183 GAAACTGATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGGACATATGTTGACGTTATG 2242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2234 GAAACTGATTTTGGTGTTAGTAAGCTATATCTTGTACCTGGTACATATGTTGACGTTATG 2293
Query 2243 CTTCTGGGGGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACA 2302
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 CTTCTGGGTGGACCTGAAAGGTGGGATGACAATGTTGAGTTCACCGAGACTGTGAAGACA 2353
Query 2303 TTGA-ATGAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTGCATCATGAGTTTGACCG 2361
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 2354 TT-ATATGAAGATGAGGAGGATCTTACAAGCAGAGTTAACGTCCATCATGAGGTTGACCG 2412
Query 2362 CCATGCTAACATGTATAGAATTTCGTGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTT 2421
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413 CCGTGCTAACATGTATAGAATTTCATGCCAGAAGCTTGGCTCCTATAAACTGGTCTTCTT 2472
Query 2422 GCGTGGGAATTTGGTGGGTATGGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTC 2481
|||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473 GCGTGGGAATCTGCTGGGTATAGACCATCCTGTACCTGCAGTTGCAGAAGCTTTATTGTC 2532
Query 2482 TGTTCATTGCAGCTTCCCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCT 2541
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533 TGTTCATTGCAGCTTACCATCCTCTGTTGTGCTCATTGTTGATGAACCTGTTAACAAGCT 2592
Query 2542 TGATGTGATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCC 2601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2593 TGATGTGATTAGAGCTGCTAGTCAAGCTGACAGGGCACCAGGACGACTTCGTGTAACTCC 2652
Query 2602 TGTGACTGTGGCAAATGGGCAGATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGG 2661
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 TGTGACTGTGGCAAATGGGCAAATAATTCGTGTGGCTGCTGTTGGTATTAGCGAGTTTGG 2712
Query 2662 AGAAGCTTTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAACTGACCAGTTGCAACAA 2721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2713 AGAAGCTTTTTCAAACTCCTCAACTCTTTCTCTCAGGTGGGAATTGACCAGTTGCAACAA 2772
Query 2722 TTTGGCATACTGGGACGATAATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTAGCTGGGAGAGATT 2781
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2773 TTTGGCATACTGGGACGATGATTATAACTCAAAAATGACAAAGTCTGGCTGGGAGAGATT 2832
Query 2782 TCTGGCTCTTCGCAACGAATCAGGATTGTGCACTGTCCGAGCTACCGTTTCTGGTATTGA 2841
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2833 TCTGGCTCTACGCAATGAATCAGGATTGTGCACTGTTCGAGCCACCGTTTCTGGTATTGA 2892
Query 2842 TTATTC----A--------TACTCAACTCCGCTTCCACAAGGTTCTCAAAGTACTCTCAC 2889
|||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2893 TTATTCTTTCAAAAGCCAATACTCAACTCTGCTTCCACAAGGTTCTGAAAGTACTCTCAC 2952
Query 2890 TGATGCTGTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGT 2949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2953 TGATGCTGTACGCTTACAGTTGGTTTCCACACTAAGAGTCACACCAGAGTTCAACCTGGT 3012
Query 2950 CTTTTTCAATCCGAATGCCAAGGTAAATTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGA 3009
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3013 CTTTTTCAATCCTAATGCCAAGGTAAACTTGTCAATGACTGGAGGGAGCTGTTTGTGGGA 3072
Query 3010 AGCAGTTGTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATG 3069
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3073 AGCAGTTGTGAATAATTCTCGTGTAGCAGAAGTTATTCGACCCCCATCTGGCCTGCAATG 3132
Query 3070 CTCGCAAATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACACTCGTGACAGTATACGACAT 3129
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3133 CTCGCAAATGATGCTATCTCCAAAAGGGTTGGGGACTACAATCGTGACAGTATACGACAT 3192
Query 3130 TGGGGTTTCTCCTCCACTTTCTGCTCTTGCGTTGATTAAAGTTGCAGATGTGGACTGGAT 3189
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3193 TGGAGTTTCTCCTCCACTTTCAGCTCTTGCGTTGATAAAAGTTGCAGATGTGGACTGGAT 3252
Query 3190 AAAGATTGCATCTGGGGATGAGATAAGTATAATGGAAGGAAGTACACACTCCATTGATCT 3249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3253 AAAGATTGCATCTGGGGATGAGATAAGTATAATGGAAGGAAGTACACACTCCATTGATCT 3312
Query 3250 CTTGACTGGCATTGACGATGGGATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACCCACTTATGGACAT 3309
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3313 CTTGACTGGCATTGACGATGGAATGACCTTTGATTCTTCCCAGTACTCACTTATGGACAT 3372
Query 3310 TATGGTGCATATTGAGGATGATCTCGTAGAGCATGTCACTGTTGATGATAATTCACTTTC 3369
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3373 TATGGTGCATATTGAGGATGATCTCGTGGAGCATGTCACTGTTGATGAGGATTCACTTTC 3432
Query 3370 TGTTGGTGAACACGTGGCAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCAC 3429
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3433 TGTTGGTGAACACGTGGCAACTTCCTCTTTTAAAATTGCTGCTAGACGACTGGGAATCAC 3492
Query 3430 AACCCTATATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGATAAAATACTTAGCCAAACTATTAA 3489
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||
Sbjct 3493 AACCCTATATGTCAGCGCAAGACAACAATCAGGAGGTAAAGTGCTAAGCCAAACTATTAA 3552
Query 3490 AGTCGAAGTTTATTCCCCTCCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCCGGTGC 3549
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3553 AGTCGAAGTTTATTCCCCACCAAGACTTCACCCACAAGGAATATTTCTTGTTCCTGGTGC 3612
Query 3550 TTCTTATGTGCTCACTATTGAAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCAC 3609
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3613 TTCCTATGTGCTCACTATTGAAGGAGGCCCGACCATGAATGTTTCTGTTGACTACACCAC 3672
Query 3610 TGTGGATAACGAAGTTGCAAAGATTGAAAAATCAGGACGCCTATACGCAACATCACCAGG 3669
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 3673 TGTGGATAACGAAGTTGCAAAGATCGAAAAATCAGGACGCCTATATGCAACATCTCCCGG 3732
Query 3670 CAACACGACAATCTATGCAACGATTTACGGGAGTGAAGGTACTGTAGTTTGTCAGGCAAT 3729
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3733 CAACACGACAATCTATGCAACAATTTACGGGAGTGAAGGTGCTGTAATTTGTCAGGCAAT 3792
Query 3730 TGGCAATGCTGAAGTAGGACTTCCTGCTGCTGCGATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTAT 3789
||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3793 TGGAAATGCCGAAGTAGGACTTCCTGCTACTGCAATGCTGGTAGCTCAAAGTGACACTGT 3852
Query 3790 GGCCGTTGGTCATGAAATGCCTATGTCCCCATCATTTCCTGAGGGAGACCTTTTGTCATT 3849
||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||
Sbjct 3853 GGCCGTTGGCCATGAAATGCCTGTATCCCCATCATTTCCTGAGGGTGACCTTTTATCTTT 3912
Query 3850 TTATGAGCTCTGCAGCGCATACAAGTGGACTATTGAAGATGAGAAGGTGTTAATTTTCCT 3909
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 3913 TTATGAGCTCTGCAGCGCTTACAAATGGACTATTGAAGATGAAAAGGTGTTAATTTTCAT 3972
Query 3910 TGCATCATCCA-CTAATGTGGAAGAGAATGCTGGCTTTGTCAATGTCGTCCAAGGAAGAT 3968
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3973 TGCATCATCCATC-AATGTGGAAGAGAATGCTGGCTTTGTTAATGTCGTCCAAGGAAGAT 4031
Query 3969 CAGCTGGCAAAACCAGAGTCACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGT 4028
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4032 CAGCTGGCAAAACCAGAGTTACAATTGCCTTCTCATGTGATTTCGTGTCTCCTGGCTTGT 4091
Query 4029 ACTCTGAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTC 4088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4092 ACTCTGAATCTAGAACATATGAAGCGTCAATGATTTTATCTGTTGTGCCTGATCTCCCTC 4151
Query 4089 TTTCGCTTGGCGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTAT 4148
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4152 TTTCGCTTGGGGCTCCTATGACTTGGGTTCTTCCGCCTTTTTATACATCATCTGGTCTAT 4211
Query 4149 TACCTTCATCT-CTAGAGCCACAGAAGCATAGGGATGGCCAAAGTCACAGAGGCAATATA 4207
||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 4212 TACCTTCATCTTC-AGAGCCACAGAAGCATAGAGATGGACAAAGTCACAGAGGCAATATA 4270
Query 4208 GTCTATTCCATATTGAAAGACTGTAGCTCTCGGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCA 4267
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4271 GTCTACTCCATATTGAAAGACTGCAGCTCTCGGGCTGATTTTGAACGAGATACCATATCA 4330
Query 4268 ATAAATGGCGGAAGTGTCAAAACAACAGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAA 4327
|| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4331 ATTAATGGCGGGAGTGTCAAAACAACTGATAGCAACAATGTTGCATGTATTCAAGCCAAA 4390
Query 4328 GACCGCACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGTGTGAGGGTTGCAGAGGTTGCTCAA 4387
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4391 GACCGCACAAGTGGAAGGATTGAGATTGCTGCTTGCGTGAGAGTTGCAGAGGTTGCTCAA 4450
Query 4388 ATAAGAATGAAGAGTGAGGGGATCCCTTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTTGGCGGTGAA 4447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4451 ATAAGAATGAAGAGTGAGGGGATCCCTTTCCACGTGATAGATCTTGCTGTTGGCGGTGAA 4510
Query 4448 CTTGAACTTCCAATCAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGT 4507
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4511 CTTGAACTTCCAATAAATTACTATGACACTTTAGGAATCCCTTTTCTCGAAGCACATGGT 4570
Query 4508 GTTATTACATATAATGTCGAAACCAATCATCGTGATGTTGTATCTATTAAGACTGTCAAT 4567
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4571 GTTACTACATACAATGTCGAAACCAATCATCGTGATGTTGTATTTATTAAGACTGTCAAT 4630
Query 4568 GACCAACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCC 4627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4631 GACCAACCAAGTGCCTACATTAAGGGAATAAAACATGGCAAAGCTCTCATTCGGGTTTCC 4690
Query 4628 ATTGGCGGCAATCTCAGGAAATCAGACTATGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCGCATATCTTT 4687
||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4691 ATTGGTGATAATCTCAGGAAATCAGATTACGTTCTGGTTTCAGTTGGGGCGCATATCTTT 4750
Query 4688 CCTCAAAACCCGGTCATTCACACTGGAAATGTGTTAAATTTCAGCATAGCAGGGTCTGAT 4747
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 4751 CCTCAAAACCCGGTCATTCACACTGGAAATTTGTTAAATTTCAGCATAACAGGGGCTGAT 4810
Query 4748 CATGAAGTCTCTGGGCAATGGGTTACATCAAACAGAAGTGTCCTATCCGTAAATGTGGCA 4807
|||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct 4811 AATGAAGTCACTGGTCAATGGTTTACATCAAACAGAAGTGTCATATCCGTCAATGTGGCA 4870
Query 4808 TCTGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCAC---A--------G-TCATGGT 4855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||
Sbjct 4871 TCTGGCCAAGCTAAAGCGATCAGCCAAGGCTCAACTCACGTTACATTTAAAGGTCATGGT 4930
Query 4856 TTGAAACTGCAAACAAAAGTCACAGTGCTATTTGGAAACACCATTTACGTCGACTCTCCA 4915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4931 TTGAAACTGCAAACAAAAGTCACAGTGCTATTTGGAAACACCATATATGTCGACTCTCCA 4990
Query 4916 AGTGAAACACTGACAAATGTCCACGTCCCTGCAGAAGGATATAAATTTCCAGTGAAATTC 4975
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4991 GGAGAAACACTGACAAATGTCCACGTCCCTGCAGAAGGATATAAGTTTCCAGTGAAATTC 5050
Query 4976 AGGGAGAACAAGTTTGCAGTCTCTGAATATGGAAACAAGGCCACGTTTAACTGCCAAGTA 5035
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5051 AGGGAGAACAAGTTTGCAGTCACTGAACATGGAAACAAGGCCACGTTTAACTGCCAAGTA 5110
Query 5036 GACCCTCCGTTTATAGGATACGCAAAGCCATGGATGGATCTCGTTACGGGCAACATTTAT 5095
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 5111 GACCCTCCGTTTATAGGATACACAAAGCCATGGATGGATCTCGATACGGGCAACACTTAT 5170
Query 5096 TGTCTTTTCTTCCCATACTCACCAGAGCATCTGGTTCGCTCCATGTCTATAACAAAAGAC 5155
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5171 TGTCTTTTCTTCCCATACTCACCAGAGCATCTTGTTCACTCCATGTCTATAACAAAAGAC 5230
Query 5156 ATGAAACCTCATGTGTCCTTCTCTGTTAATGCTTCACTTAAAGAAGCTCGTCATGTTTCG 5215
||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||
Sbjct 5231 ATGAAACCTCATGTGTCATTCTCCGTTGATGCTTCACTTAAAGAAGCTCGACGTGTTTCG 5290
Query 5216 GGATCTGCATCTGCACTTCTTATTGGAGGGTTTTCTGTAACAGGGCCAAATAAGCTGAAT 5275
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 5291 GGATCTGCATCTGCACTTCTTATAGGAGGGTTTTCTGTAACAGGGCCAGATAAGCTGAAT 5350
Query 5276 ATAAACCCGGATTCAAACACGACCATTATTTCAATAGTGGGGAACACCGATGTTCAAATT 5335
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5351 ATAAACCCGGATTCAAACACGACCATCATTTCATTAGTGGGGAACACCGATGTTCAAATT 5410
Query 5336 CACTGCCGCAGCAAAGGTAGGTTATCGATCAACTTGATCAAAAGGGAAGATTTTGGTATC 5395
|||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||
Sbjct 5411 CACTGCCGCAACAAAGGTAGGTTATCAATCAGCTTGATTAAAAGAGACGATTTTGGTATC 5470
Query 5396 GCAGGACTTGCACTATACAAGGTGAATGTGTTAAGATCAGAGCAATTCACAGATATAATC 5455
||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5471 GCAGGGCATGCACAATACAAGGTAAATGTGTTAAGATCAGAGCAATTCACAGATAGAATC 5530
Query 5456 CGCATCACTCTCCCCT-CTACTGGCCAAAGTGTAGAAATTGATGTCTCCTATGACACGGG 5514
||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||
Sbjct 5531 ATCATCACTCTACC-TGCTACTGGCCAAATTGTAGAAATCGATGTCTGCTATGACACAGG 5589
Query 5515 CGAGTCCCTAGTAGCTTCGTCTAAAGATGGATACTCTGTTTTGTTCAAGATACTATGGTG 5574
||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 5590 AGAGTCACTAGTAGCTTCGTCTAAAGATGGTTACTCTGTTTTGTTGAAGATACTATGGGG 5649
Query 5575 CGTTTTGGTGTTGGCTATATCAGTGATCATCTTGATGAAAGTGATAGATAGACAAGGGCC 5634
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 5650 CGTTTTGGTGTTGGTTGTATCAGTGATCATCTTGATGAAAGTGATAGATCGACAAGTGCC 5709
Query 5635 AATTGGTCCAACAGGAGCTACTAGAACTGCAACAAACAATGGAACTGCAGCACCGGGAAC 5694
| | ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||
Sbjct 5710 -------C-A-CAGGAGCTACTGGAACGGCAACATACAGTGGAAATGCAGCACAGGGAAC 5760
Query 5695 ACCAGAAAGAAGAAGCGGTGCAGTTATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACC 5754
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5761 ACCAGAAAGAAGAAGCGGCACAGTTATATACCATGAGGAATCTCCAAGAACACCATCACC 5820
Query 5755 GTTTATGGAGTATGTGAAGAGAACAGTGGATGAAACTCCCTATTACAGAAGAGAAGGAAG 5814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5821 ATTTATGGAGTATGTGAAGAGAACAGTGGATGAAACTCCCTACTACAGAAGAGAAGGAAG 5880
Query 5815 AAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACAATGTAG 5845
|||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5881 AAGAAGGTTTAATCCTCAAAACACTATGTAG 5911
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 291625644597
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5