BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494037
Length=4468
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G39500.1 | Symbols: GNL1, ERMO1 | GNOM-like 1 | chr5:1581527... 7153 0.0
> AT5G39500.1 | Symbols: GNL1, ERMO1 | GNOM-like 1 | chr5:15815274-15820045
FORWARD LENGTH=4467
Length=4467
Score = 7153 bits (3873), Expect = 0.0
Identities = 4282/4479 (96%), Gaps = 30/4479 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGGTATCAGAATCATTCTTCGGGAAGTAACTCGTTCCATGGAGAGTTCAAGAGTTGT 60
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGGGTATCAGAATCATCCTTCGGGAAGTAACTCGTTCCATGGAGAGTTCAAGAGATGT 60
Query 61 CACTCCAAACCGTCTAAGGGTGCGGTGGCATCCATGATTAATTCTGAAATTGGTGCAGTT 120
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 61 CACTCCAAACCGTCTAAAGGTGCGGTGGCGTCCATGATTAATTCTGAAATTGGTGCAGTT 120
Query 121 TTGGCTGTGATGAGGAGAAATGTACGGTGGGGTGTTCGTTATATTGCAGATGATGATCAG 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 121 TTGGCTGTGATGAGGAGAAATGTACGGTGGGGTGTTCGATATATAGCAGATGATGATCAG 180
Query 181 TTAGAGCATTCTCTTATCCATTCTTTAAAAGAATTGCGTAAGCAGATATTTTCATGGCAA 240
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 TTAGAGCATTCTCTTATCCATTCTTTGAAAGAATTGCGTAAGCAGATATTTTCATGGCAA 240
Query 241 AGCAATTGGCAATATGTTGACCCGAGATTGTACATACAGCCCTTTTTGGATGTTATATTG 300
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AGCAATTGGCAATATGTTGACCCTAGATTGTACATACAGCCCTTTTTGGATGTTATATTG 300
Query 301 TCTGATGAAACTGGTGCTCCAATTACTGGCGTTGCGTTGTCATCTGTCTACAAGATCTTA 360
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 TCTGATGAAACTGGTGCTCCGATTACTGGCGTTGCTTTGTCATCTGTTTACAAGATCTTA 360
Query 361 ACCCTTG-AGATTTTTACCCTTGAAACCGTGAATGTGGGAGAGGCAATGCATATCATAGT 419
||||| | || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 361 ACCCTCGAAG-TTTTTACTCTTGAAACTGTGAATGTGGGAGAGGCAATGCATATAATAGT 419
Query 420 TGATGCTGTAAAAAGCTGTCGTTTCGAGGTTACTGATCCAGCCTCAGAGGAAGTGGTTCT 479
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 420 TGATGCTGTAAAAAGCTGTCGTTTCGAGGTAACGGATCCTGCCTCAGAGGAAGTGGTTTT 479
Query 480 GATGAAGATACTTCAAGTTCTGCTGGCTTGCGTAAAGAGTAAGGCCTCTAATGGATTGAG 539
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 480 GATGAAGATACTTCAAGTTCTACTGGCTTGTGTAAAGAGTAAGGCGTCTAATGGATTGAG 539
Query 540 TAATCAAGACATTTGCACCATCGTCAACACTTGTTTGCGCGTTGTTCATCAATCAAGCTC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TAATCAAGACATTTGCACCATCGTCAACACTTGTTTGCGTGTTGTTCATCAATCAAGCTC 599
Query 600 CAAAAGTGAATTGTTGCAGCGTATAGCTCGCCACACAATGCATGAGTTGATTAGATGTAT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 CAAAAGTGAATTGTTGCAGCGTATAGCTCGCCACACAATGCATGAGTTGATTAGATGTAT 659
Query 660 CTTCTCTCAACTTCCTTTTATCAGCCCCTTGGCTAATGAAAGTGAATTACATGTCGACAA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 660 CTTCTCTCAACTTCCTTTTATCAGCCCCTTGGCTAATGAATGTGAATTACATGTCGACAA 719
Query 720 GAAGGTGGGAATAGTGGACTGGGATCAGAATTCTGGAGAAAAAAGGGTTGAAAATGGAAA 779
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 TAAGGTGGGAACAGTGGACTGGGATCCGAATTCTGGAGAAAAAAGGGTTGAAAATGGAAA 779
Query 780 TATTGCTAGTGTATCTGATACTCTCGGCACTGACAAAGATTCTCCAAGTTCTGAGATGGT 839
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 780 TATTGCTAGCATATCTGATACTCTCGGCACTGACAAAGATGATCCAAGTTCTGAAATGGT 839
Query 840 TATTCCAGAAACAGAACTTCGAAATGATGAAAAGAAAACTGAGGTCAGCGATGACTTGAA 899
||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TATTCCAGAGACAGATCTTAGAAATGATGAAAAGAAAACCGAGGTCAGCGATGACTTGAA 899
Query 900 TGCTGATGCAAATGGTGAAAATGCAATGATGGCGCCTTTTGGTATTCCATGCATGGTAGA 959
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||
Sbjct 900 TGCTGCTGCAAATGGTGAAAATGCAATGATGGCGCCTTATGGTATACCATGCATGGTAGA 959
Query 960 GATTTTTCATTTCTTGTGTACGCTGTTGAATGTTGGAGAAAACGGTGAAGTCAATTCCAG 1019
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GATTTTTCATTTCTTGTGTACCCTGTTGAATGTTGGAGAAAACGGTGAAGTCAATTCCAG 1019
Query 1020 ATCCAACCCAATAGCGTTTGATGAAGATGTTCCTCTTTTCGCTCTGGGTTTAATTAATTC 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ATCCAACCCAATAGCGTTTGATGAAGATGTTCCTCTTTTCGCTCTGGGTTTAATTAATTC 1079
Query 1080 TGCTATAGAACTTGGAGGGCCTTTTTTCCGTGAGCACCCAAAGCTGTTGACTTTGATTCA 1139
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TGCTATAGAACTTGGAGGGCCTTCTTTCCGTGAGCACCCAAAGCTGTTGACTTTGATTCA 1139
Query 1140 GGATGAGTTATTCTGTAACTTGATGCAGTTTGGTATGTCCATGAGCCCTCTGATTCTTTC 1199
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 GGATGATTTATTCTGTAACTTGATGCAGTTTGGTATGTCCATGAGCCCTCTGATTCTTTC 1199
Query 1200 TACAGTTTGCAGCATCGTTCTTAATCTCTACTTGAATCTCCGTACTGAGCTTAAGGTACA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 TACAGTTTGCAGCATCGTTCTTAATCTCTACCTGAATCTCCGTACTGAGCTTAAGGTACA 1259
Query 1260 GCTTGAAGCTTTCTTTTCATATGTACTTCTGAGGATTGCACAGAGCAAACATGGTTCTTC 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1260 GCTTGAAGCTTTCTTTTCATATGTACTTCTGAGGATTGCACAGAGCAAACATGGCTCTTC 1319
Query 1320 TTATCAGCAACAGGAGGTGGCTATGGAGGCTCTGGTTGATCTTTGCAGACAACATACTTT 1379
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 TTATCAGCAACAGGAGGTTGCTATGGAGGCTCTGGTTGATCTTTGCAGACAACATACTTT 1379
Query 1380 CATAGCTGAAATGTTTGCAAATTTCGATTGTGATATAACCTACAGTAATGTGTTTGAAGA 1439
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 1380 CATAGCTGAAGTGTTTGCAAATTTCGATTGTGATATAACTTGCAGTAATGTGTTTGAAGA 1439
Query 1440 TGTTTCAAACCTGCTATCAAAGAGTGCCTTCCCAGTTAATGGGCCTATATCTGCTATGCA 1499
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1440 TGTTTCAAACCTGCTATCAAAGAATGCCTTCCCAGTTAATGGGCCTTTATCTGCTATGCA 1499
Query 1500 TATACTTGCATTGGATGGGTTAATTTCTATGGTTCAGGGAATGGCTGAGAGAGTAGGTGA 1559
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1500 TATACTTGCATTGGATGGGTTAATTTCTATGGTTCAGGGAATGGCTGAGAGAGTGGGTGA 1559
Query 1560 AGAATTGCCGGCTTCAGATGTTCCTACACATGAAGAAGGATATGAAGAATTCTGGACAGT 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 AGAATTGCCGGCTTCAGATGTTCCTACACATGAAGAACGATATGAAGAATTCTGGACAGT 1619
Query 1620 GAGATGTGAGAATTACGGAGATCCTAATTTTTGGGTTCCCTTTGTCCGAAAGG-CAAAGC 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1620 GAGATGTGAGAATTACGGAGATCCTAATTTTTGGGTTCCCTTTGTCCGAAAGGTC-AAGC 1678
Query 1679 ACATAAAGAAAAAGCTGATGCTTGGGGCTGATCATTTTAACCGTGATCCTAAAAAAGGCT 1738
| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1679 ATATAAAGAAAAAGCTGATGCTTGGGGCTGATCGTTTTAACCGTGATCCTAATAAAGGCT 1738
Query 1739 TACAGTATCTTCAAGGGATGCACTTGTTGCCCGAGGAACTTGATCCAAAGAGTGTGGCAT 1798
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 TACAGTATCTTCAAGGGGTGCACTTGTTGCCCGAGAAACTTGATCCAAAGAGTGTGGCAT 1798
Query 1799 GTTTCTTCAGGTATACATGTGGGTTAGATAAGAATCTTATAGGAGATTTCCTCGGAAATC 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GTTTCTTCAGGTATACATGTGGGTTAGATAAGAATGTTATGGGAGATTTCCTCGGAAATC 1858
Query 1859 ATGACCAGTTCTGTATTCAGGTGCTTCATGAGTTTGCCAAGACGTTCGACTTCCAGAACA 1918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 ATGACCAGTTCTGTATTCAGGTGCTTCATGAGTTTGCCAAGACGTTCGACTTCCAGAACA 1918
Query 1919 TGAATCTTGCTACCGCCCTGCGTCTCTTTGTGGGTACATTTAGATTGCCTGGCGAGGCAC 1978
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1919 TGAATCTTGCTACAGCCCTGCGTCTTTTTGTGGGTACCTTTAAATTGTCTGGCGAGGCAC 1978
Query 1979 AGAAGATACAGAGGGTGCTGGAGGCGTTTTCTGAGAGATACTATGAGCAGTCACCACATA 2038
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1979 AGAAGATACACAGGGTACTGGAGGCGTTTTCTGAGAGATACTATGAGCAGTCACCACACA 2038
Query 2039 TACTGATTGATAAAGATGCTGCCTTTGTGTTAGCTTACTCGATTATCTTGCTGAACACAG 2098
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TACTGATTGATAAAGATGCTGCCTTCGTGTTAGCTTACTCGATTATCTTGCTGAACACAG 2098
Query 2099 ATCAGCACAACGCCCAGGTGAGGACAAGGATGACTGAAGAAGATTTCATCCGTAACAACA 2158
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 ATCAGCACAACGCCCAGGTGAAAACAAGGATGACTGAAGAAGATTTCATCCGTAACAACA 2158
Query 2159 GGACAATAAATGGAGGCGCAGACCTTCCTAGAGAGTACCTATCTGAGATTTATCATTCAA 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2159 GGACAATAAATGGAGGCGCAGACCTTCCTAGAGAGTACCTATCTGAGATTTATCACTCAA 2218
Query 2219 TCCGCCACAGTCAGATTGAGATTGAGATGAACTCAGATGAGGGAACCGGCTTCCAACTGA 2278
||||||||||| ||||| ||| || || | | |||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 2219 TCCGCCACAGTGAGATTCAGA-TG-GACG-A---AGATAAAGGAACCGGCTTCCAACTGA 2272
Query 2279 TGACAGCCAGTCGTTGGATTAGTGTGATTTACAAATCCAAAGAAACCAGTCCCTATATCC 2338
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2273 TGACAGCCAGTCGTTGGATTAGTGTGATTTACAAATCCAAAGAAACGAGTCCCTATATCC 2332
Query 2339 AATGTGACACTGCATCCCATCTGGACCGTGACATGTTTTATATCGTGTCTGGTCCCACTA 2398
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 AATGTGACGCAGCATCCCATCTGGACCGTGACATGTTTTATATCGTGTCTGGTCCCACTA 2392
Query 2399 TTGCTGCTACATCAGTGGTTTTTGAGCAAGCAGAGCAAGAAGATGTTTTGCAGAGATGTA 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2393 TTGCTGCTACATCAGTGGTTTTTGAGCAAGCAGAGCAAGAAGATGTTTTGCGGAGATGTA 2452
Query 2459 TTGATGGGTTATTGGCCATTGCAAAACTTTCAGCATATTATCATTTGAATAGTGTTTTGG 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 TTGATGGGTTATTGGCCATTGCAAAACTTTCAGCATATTATCATTTGAATAGTGTTTTGG 2512
Query 2519 ATGATCTGGTTGTGTCTCTCTGCAAATTCACACCCTTCTTCGCCCCATTATCTGCTGATG 2578
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513 ATGATCTGGTCGTGTCTCTCTGCAAATTCACACCCTTCTTCGCCCCATTATCTGCTGATG 2572
Query 2579 AAGCTGTTCTTGCTCTAGGAGAAGATGCCAGAGCCAGAATGGCTACTGAAGCTGTTTTCT 2638
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2573 AAGCTGTTCTTGTTCTAGGAGAAGATGCCAGAGCCAGAATGGCTACTGAAGCTGTTTTCT 2632
Query 2639 TGATTGCAAGTAAATATGGTGACTATATTAGTTCGGGCTGGAAAAACATATTGGAATGTG 2698
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2633 TGATTGCAAATAAATATGGTGACTATATTAGTGCGGGCTGGAAAAACATACTGGAATGTG 2692
Query 2699 TCTTGAGCCTCAATAAACTCCACATTTTACCAGATCATATAGCTAGTGATGCAGCGGATG 2758
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2693 TCTTGAGCCTCAACAAACTCCACATTTTACCAGATCATATAGCTAGTGATGCAGCGGATG 2752
Query 2759 ACCCAGAGCTGTCAACTAGTAGCTTGGAGCAAGAAAAACCTTCGGCAAATCCCCTGCCAG 2818
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2753 ACCCAGAGCTGTCAACTAGTAACTTGGAGCAAGAAAAACCTTCGGCAAATCCCGTGCCAG 2812
Query 2819 TCGTATCACAGTCACAACCCTCAGCGACGCCTCGAAAATCATCTAGTTTTATTGGTCGGT 2878
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TCGTATCACAGTCACAACCCTCAGCGATGCCTCGAAAATCATCTAGTTTTATTGGTCGGT 2872
Query 2879 TTC-TCATGTCTTTTGATTCTGAGGAGACAAAGCCATTACCAACCGAGGAAGAACTGGCA 2937
||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2873 TTCTTC-TGTCTTTTGATTCTGAGGAAACAAAGCCATTACCAAGCGAGGAAGAATTGGCA 2931
Query 2938 GCTTATAAACATGCTCGTGGGATAGTGAAAGATTGTCATATTGATAGCATATTCTCAGAC 2997
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 GCTTATAAACACGCTCGTGGGATAGTGAAAGATTGTCATATTGATAGCATATTCTCAGAC 2991
Query 2998 AGCAAGTTTCTCCAAGCTGAGTCTCTGCAGCAGCTTGTTAACTCTCTTATAAAAGCATCC 3057
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2992 AGCAAGTTTCTCCAAGCTGAGTCTCTGCAGCAGCTTGTTAACTCTCTTATAAGAGCATCC 3051
Query 3058 GGGAAAGATGAAGCTAGTTCAGTCTTTTGCCTGGAGCTTCTAATTGCAGTAACTCTGAAC 3117
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 3052 GGGAAAGATGAAGCTAGTTCGGTCTTTTGCCTGGAGCTTCTGATTGCGGTAACGCTGAAC 3111
Query 3118 AACCGAGACAGAATCCTTCTGATTTGGCAAACTGTTTATGAGCATATCTTGGGTATAGTA 3177
||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3112 AACCGAGACAGAATCCTACTGATTTGGCCAACAGTTTATGAGCATATCTTGGGTATAGTT 3171
Query 3178 CAACCAACATTAACACCATGCACGCTTGTTGAAAAGGCTGTTTTTGGTGTACTGAAGATT 3237
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3172 CAATTAACATTAACACCATGCACGCTTGTTGAAAAGGCTGTTTTTGGTGTACTGAAGATT 3231
Query 3238 TGCCAGAGATTATTACCATACAAGGAAAACCTAACAGATGAACTTCTGAAATCACTCCAA 3297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3232 TGCCAGAGATTATTACCATACAAGGAAAACCTAACAGATGAACTTCTGAAATCACTCCAA 3291
Query 3298 CTGGTTCTCAAGCTTAAACCAAGAGTGGCTGATGCATACTGCGAACGCATTACACAAGAA 3357
|||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||
Sbjct 3292 CTGGTTCTCAAGCTGAAAGCAAAAGTGGCTGATGCATACTGTGAACGCATTGCACAAGAA 3351
Query 3358 GTTGTCCATCTTGTAAAAGCAAACGCATCTCACATTAGATCCCATACTGGTTGGCGAACG 3417
||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3352 GTTGTTCGTCTTGTAAAAGCAAACGCATCTCACGTTAGATCCCGTACTGGTTGGCGAACG 3411
Query 3418 ATCATATCTCTGCTATCAATCACAGCTCGGCATCCAGAAGCTTCTGATGCGGGATTCGAA 3477
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 3412 ATTATATCTCTGCTATCAATCACAGCTCGGCATCCAGAAGCTTCTGAAGCTGGATTCGAA 3471
Query 3478 GCCCTCCGGTTTATAATGTCAGAAGGAGCTCACTTGTTACCATCAAACTACGAGCTCTGT 3537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 GCCCTCCGGTTTATAATGTCAGAAGGAGCTCACTTGTTACCATCAAACTACGAGCTCTGT 3531
Query 3538 TTGGATGCAGCTAAGA-ACTTTGCT-ATATCCCGAGTTGGTGAAATCGATCGGTCCATCT 3595
||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 3532 TTGGATGCAGCCA-GTCACTTTGCTGA-ATCCCGAGTTGGTGAAGTCGATCGGTCTATCT 3589
Query 3596 CAGCAATTGACTTAATGTCAAACTCTGTGTTTTGTCTTGCAAGATGGTCTCAAGAGGCGA 3655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3590 CAGCAATTGACTTAATGTCAAACTCTGTGTTTTGTCTTGCAAGATGGTCTCAAGAGGCGA 3649
Query 3656 AAAACTCGATTGGTGAAACTGATGCCATGATGAAACTAAGTGAAGATATTGGAGAAATGT 3715
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3650 AAAACTCGATTGGTGAAACTGATGCTATGATGAAACTAAGTGAAGATATTGGAAAAATGT 3709
Query 3716 GGCTCGCACTTGTGAACAAGCTCCAAATAGTATGT-TATGATCAACGCGACCAAGTGAGA 3774
||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3710 GGCTCAAACTTGTGAAGAACCTCAAAAAAGTATGTCT-TGATCAACGCGACGAAGTGAGA 3768
Query 3775 AACCATGCAATTTTGATGCTGCAACGAGCTATAGCTGGTGCAGACGGGATCATGTTACCA 3834
||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3769 AACCATGCAATCTCAATGCTGCAACGAGCTATAGCCGGTGCAGACGGGATCATGTTACCA 3828
Query 3835 CAACCTATATGGTTCCAATGCTTTGATTCCGCAGTCTTCCCATTGCTAGACAAA-TCGCT 3893
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||
Sbjct 3829 CAACCTCTATGGTTCCAATGCTTTGATTCCGCAGTCTTCATATTGCTAGACGATGT-GCT 3887
Query 3894 CGCTTTTGCAATCGAGAATTCAAGGAAGAATTTCAAGAAAACAGTTGAAGAAACGCTTGT 3953
| ||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3888 CACTTTTTCGATCGAGAATTCAAGGAAGACTCTCAAGAAAACAGTGGAAGAAACGCTTGT 3947
Query 3954 TCTCGCGACAAAGCTCATGTCAAAAGCTTTTCTTCAATCTCTTCAAGACATCTCACAGCA 4013
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3948 TCTCGCCACAAAGCTCATGTCAAAAGCTTTTCTGCAATCTCTTCAAGACATCTCACAGCA 4007
Query 4014 ACCATCATTCTGCAGACTTTGGGTTGGTGTCTTGAACCGTTTGGAAACTTACATGTCAAC 4073
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4008 ACCATCATTCTGCAGACTTTGGGTTGGTGTCTTAAACCGTTTGGAAACGTACATGTCAAC 4067
Query 4074 CGAATTCAGAGGAAAACGCAGCGAGAAAGTCCATGAACTCATCCCTGAACTGCTCAAGAA 4133
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4068 TGAATTCAGAGGAAAACGCAGCGAGAAAGTCAATGAACTCATCCCGGAACTGCTCAAGAA 4127
Query 4134 CACATTGCTGGTAATGAAGGCGACGGGAGTTTTATTACCAGGTGTTGATATCGGAAGTGA 4193
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4128 CACATTACTGGTAATGAAGGCGACGGGAGTTTTATTACCAGGTGATGATATCGGAAGTGA 4187
Query 4194 CAGTTTCTGGCAACTAACGTGGCTTCACGTTAAGAAGATCTCTCCTTCTCTGCAATCTGA 4253
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4188 CAGTTTCTGGCAACTAACGTGGCTTCACGTTAATAAGATCTCTCCTTCTCTTCAATCTGA 4247
Query 4254 AGTTTTCCCACAAGAGGAGCTCGATCAGTTTCAGAGACGAAACGCAAAGCCTGAGGATTC 4313
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 4248 AGTTTTCCCTCAAGAGGAGCTTGATCAGTTTCAGAGACGAAACGCGAAGCCTGAGGATCC 4307
Query 4314 TCCGGTACCGGAAAACGAGGCCTGAGAGACGGT---GGTGGAATAGAGAAAAATTGTTCT 4370
||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4308 TCCGGTACCGGGAAATGAGGTCTGAGA--CGGTTTTGGTGGAATAGAGAAAATTTGTTCT 4365
Query 4371 ATACAGATGAAAAAGCATATTCAAGAATATCGAAAtttttttt-gcagtatagctttttt 4429
|||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4366 ATACAGATGAAAAAGCTTAATCAAGGATATC-AATTTTTTTTTTGCAGTATAGCTTTTTT 4424
Query 4430 gtttttAATATAGGGG-ATTATATAATACTTTGGAGTCT 4467
|||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||
Sbjct 4425 GTTTTTAATATAGGGGGATTATA-A-TACTTTGGAGTCT 4461
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 222791393863
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5