BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494201
Length=5265
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G47690.3 | Symbols: | binding | chr5:19317716-19327334 FORW... 8551 0.0
> AT5G47690.3 | Symbols: | binding | chr5:19317716-19327334 FORWARD
LENGTH=5327
Length=5327
Score = 8551 bits (4630), Expect = 0.0
Identities = 5085/5300 (96%), Gaps = 50/5300 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 AGAGAGAGCTCAGATCAGATGTGGCTTTCTTCTTC-T-T-C--C-TCTTCCGTAGAGTGA 54
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||| | |||||
Sbjct 18 AGAGAGAGCTCAGATCAGATGTGGCTTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCTTCCGCATAGTGA 77
Query 55 CTCTGAGAA-C-----A-TCAA-ATTCCACCTTTTTTGTTTCCTTGTTCGTTTATTAG-G 105
||||||||| | | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 78 CTCTGAGAACCAGATTATTCAAGAAAATACCCTTTTTGTTTCCTTGTTCGTTTATT-GTG 136
Query 106 GCTCGTCTCTAACACCGTCGGTTTAAGAGTTGTCTGTTTCACTCGCCATGGCTCAGAAGC 165
|||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 137 GCTCGTCTCTAACAGCTTCGGTTTAAGAGTTCTCTGTTTCACTCCCCATGGCTCAGAAGC 196
Query 166 CGGAGGAACAGTTGAAAGAGCTGGGATCGAAGCTTGACCTAACTCCTGTTTCCAAAGATT 225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 197 CGGAGGAACAGTTGAAAGAGCTGGGATCGAAGCTTGACCTAGCTCCTGTTTCTAAAGATT 256
Query 226 CGTTGCTCAAACTCTTAAAGGAAGCTGCTGTTTGTCTTTCTGAGTTGGAGCAGTCTCCAC 285
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 CATTGCTCAAACTCTTAAAGGAAGCTGCTGTTTGTCTTTCTGAGTTGGAGCAGTCTCCAC 316
Query 286 CACCTGCAGTGCTCAAGTCCATTCAGCCTTTTCTTGATGCAGTTATTAAACCTGAAATTC 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 317 CACCTGCAGTGCTCAAGTCCATTCAGCCTTTTCTTGATGCAGTTATTAAACCTGAAATTC 376
Query 346 TCAACCATCAAGACAAGGATGTCAAGCTTCTTGTTGCAAGCTGCGTTTCTGAGATAACTC 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 377 TCAACCATCAAGACAAGGATGTCAAGCTTCTTGTTGCAAGCTGCGTTTCTGAGATAACTC 436
Query 406 GTATTACAGCACCTGAAGCGCCTTACAGTGATAATATTATGAAGGATATTTTTCAACTGA 465
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 437 GTATTACAGCACCTGAAGCGCCTTACAGTGATAATATTATGAAGGATATTTTTCAACTAA 496
Query 466 TTGTGAGCGCTTTTGCTGGGTTGAATGATGTCAGTGGTCCATCATTTGGAAGGAGGGTTG 525
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 TTGTGAGCGCTTTTGCTGGGTTGAATGATGTCAGTGGTCCATCATTTGGAAGGAGGGTTC 556
Query 526 TCATTTTAGAAACGGTTGCCAAGTACAGGTCATGTGTAGTGATGTTGGATCTTGAATGTG 585
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 557 TCATTTTAGAAACGGTTGCAAAGTACAGGTCATGTGTAGTGATGTTGGATCTTGAATGTG 616
Query 586 ATGATCTGGTGAAAGAAGTATTTACTACATTTCTGGATGTTGCTAGAGATGACCATCCGG 645
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 ATGATCTGGTGAAAGAAGTGTTTACTACATTTCTTGATGTTGCTAGAGATGACCATCCGG 676
Query 646 AGATTGTTTTCTCATCAATGCAAAATATAATGATTGTTCTTTTAGAAGAAAGTGAAGATG 705
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 677 AGATTGTTTTCTCATCAATGCAAAATATAATGATTGTTCTTTTAGAAGAAAGCGAAGATG 736
Query 706 TGCAGGAGCATCTTTTACTAATTTTACTCTCTAAATTGGGCCGCAATAGAAGTGACGTTA 765
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 TGCAAGAGCACCTTTTACTAATTTTACTCTCTAAATTGGGCCGCAATAGAAGTGACGTTA 796
Query 766 GAGATGCTGCAAGAAGACTTGCTATGAAAGTCATAGAGCAGTGTGCGCCCAAAGTTGAAT 825
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 797 GAGATGCTGCAAGAAGACTTGCTATGAAAGTCATAGAGCATTGTGCGCCCAAAGTTGAAT 856
Query 826 CTGAAATAAAGCAGTTCCTTATCTCTTCAATGTCTGGAGATAGCCGATTTTCCAGCAGTC 885
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 CTGACATAAAGCAGTTCCTTATCTCTTCAATGTCTGGAGATAGCCGATTTTCCAGCAGTC 916
Query 886 AAATTGACTACCATGAGGTTATCTATGATTTGTACCGCTGTGCTCCTCAGGCCCTATCTG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 917 AAATTGACTACCATGAGGTTATCTATGATTTGTACCGCTGTGCTCCTCAGGCCCTATCTG 976
Query 946 GAGTTGCACCATATCTCACTGGAGAGCTTTTGGCGGATAAACTGGAAACTCGTTTGAAAG 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 977 GAGTTGCACCATATCTCACTGGAGAGCTTTTGGCGGATAAACTGGAAACTCGTTTGAAAG 1036
Query 1006 TGGTTGGATTGGTTGGAGAGTTGTTTTCCTTGCCTGGACGTGTCATCTCTGAAGAGTTCG 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGTTGGATTGGTTGGAGAGTTGTTTTCCTTGCCTGGACGTGTCATCTCTGAAGAGTTCG 1096
Query 1066 GTTCAAtttttttGGAGTTTCTGAAAAGGCTGACCGATAGGGTAGTTGAAGTTAGGATGG 1125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 ATTCAATTTTTTTGGAGTTTCTGAAAAGGCTGACCGATAGGGTAGTTGAAGTTAGGATGG 1156
Query 1126 CCATCCTTGACCATATTAAGAACTGTTTGCTTTCGGATCCTTTGAGAGCTGAGGCTCCTC 1185
|||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1157 CCATCCTTGACCATATTAAGGACTGTTTGCTCTCAGATCCTTTGAGAGCTGAGGCTTCTC 1216
Query 1186 AAATTATATCTGCTCTCTGTGACCGGCTCTTGGATTATGATGAGAATATCCGCAAACAAG 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 AAATTATATCTGCTCTCTGTGACCGGCTCTTGGATTATGATGAGAATATCCGCAAACAAG 1276
Query 1246 TTGTTGCTGTTATTTGTGATGTGGCTGTGAGTGCATTGACGTCGATTCCAGTTGACACTA 1305
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 TTGTTGCTGTTATTTGTGATGTGTCTGTGAGTGCATTGACGTCGATTCCAGTTGACACTA 1336
Query 1306 TGAAGTTAGTTGCTGAACGGCTTCGTGACAAAGCTATACTCGTAAAAACATACACAATGG 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TGAAGTTAGTTGCTGAACGGCTTCGTGACAAAGCTATACTCGTAAAAACATACACAATGG 1396
Query 1366 AAAGGTTGACTGAGTTGTTCCGGGTATATTGCTTACGGTGTGCTGATGGGAAGGTAGACA 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 AAAGGTTGACTGAGTTGTTCCGGGTATATTGCTTACGGTGTGCTGATGGGAAGGTAGACA 1456
Query 1426 CTGGCGATTTTGATTGGATTCCTGGAAAAATCTTGAGATGTCTTTATGACAAAGATTTCA 1485
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457 CTGGCGATTTTAATTGGATTCCTGGAAAAATCTTGAGATGTCTTTATGACAAAGATTTCA 1516
Query 1486 GGTCAGATACAATTGAGTATATTCTATGCAGTTCACTGTTTCCTAGTGATTTCTCTGTAA 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1517 GGTCAGATACAATTGAGTATATTCTATGCAGTTCACTGTTTCCTAGTGATTTCTCAGTAA 1576
Query 1546 GAGATAAAGTTAAGCATTGGATACAAATCTTTTCCGGGTTTGACAAAGTGGAGACCAAAG 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 GAGATAAAGTTAAGCATTGGATACAAATCTTTTCCGGGTTTGACAAAGTGGAGACCAAAG 1636
Query 1606 CTTTTGAGAAGATACTGGAGCAAAGACAAAGGATACAACAAGAAATGCAAAGATATTTGT 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 CTTTTGAGAAGATACTGGAGCAAAGACAAAGGATACAACAAGAAATGCAAAGATATTTGT 1696
Query 1666 CAATCAAGCAGACGCAACAGAGTGCTGATGCTCCTGAGATTCAGAAAAAGATCCTATTTG 1725
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 CAATCAAGCAGACACAACAGACTGCTGATGCTCCTGAGATTCAGAAAAAGATCCTATTTG 1756
Query 1726 GATTCAGAGTTATGTCACGTGCATTTTCCGACCCCCCAAAGACTGAGCAAAACTTTTTAA 1785
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 GATTCAGAGTTATGTCACGTGCATTTTCTGACCCCCCAAAGACTGAGCAAAACTTTTTAA 1816
Query 1786 TTCTTGATCAACTGAAAGATGCTAATATCTGGAAGATTTTGACTAATCTGCTTGATCCCA 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817 TTCTTGATCAACTGAAAGATGCTAATATCTGGAAGATTTTGACTAATCTGCTTGATCCCA 1876
Query 1846 ACACTAGCATAATGCAAGCGTCCAGGATTCGGGATGATATGCTCAAAATACTCTCTGAGA 1905
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1877 ACACTAGCATAACGCAAGCATCCAGGATTCGGGATGATATGCTTAAAATACTCTCTGAGA 1936
Query 1906 AGCATTCTCTCTATGAATTTCTCAGCACTCTCTCCATAAAGTGTTCTTATCTGCTATTCA 1965
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1937 AGCATTCTCTCTATGATTTTCTCAGCACTCTCTCCATAAAGTGTTCTTATCTGCTATTCA 1996
Query 1966 GCAAGGAATATGTGAAAGAGATATTAGCGGAAGTATCTGCTAGAAAGTCGTCTAACAATA 2025
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1997 GTAAGGAGTATGTGAAAGAGATATTAGCGGAAGTATCTGTTAGAAAGTCTTCTAAAAATA 2056
Query 2026 TATTGGGGATCCAACCTTGCATGGACTTCTTAGCGCTCCTGGCATGTTTCTGTCCATCAT 2085
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057 CATTGGGGATCCAACCTTGCATGGACTTCTTAGGGCTCCTGGCATGTTTCTGTCCATCAT 2116
Query 2086 TGTTTGATGGTGCTGAAGAAGAACTGATAAGTTTCCTTAAAGAAGATGATGAAATGATAA 2145
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 2117 TGTTTGATGGCGCTGAAGAAGAACTGATAAGTTTCCTTAAAGATGACGATGAAATGATGA 2176
Query 2146 AGGAGGGTACTCTAAAAATTCTGGCAAAAGCAGGTGGTACCATTCGGGAGAATCTCATTG 2205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||
Sbjct 2177 AGGAGGGTACTCTAAAAATTCTGGCAAAAGCAGGTGGAACTATTCGGGAGAATCTCATTG 2236
Query 2206 CTTTAGCGAGTTCTGTGGACCTTTTACTGGAGAGGATTTGTGTTGAAGGAAACCGCAAGC 2265
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2237 TTTTAGCAAGTTCTGTGGACCTTTTACTGGAGAGGATTTGTGTAGAAGGAAACCGCAAGC 2296
Query 2266 AGGCTAAGTATGCTGTGCACGCACTAGCATCAATAACAAAGGATGATGGCCTGAAGTCCC 2325
||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2297 AGGCTAAGTATGCTGTGCATGCGCTAGCATCAATAACAAAGGATGATGGCCTGAAGTCGC 2356
Query 2326 TCTCTGTTCTATACAAGAGACTCGTGGACATGCTGGAGGACAAGAGACATCAGCCAGCTG 2385
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2357 TCTCTGTTCTATACAAGAGACTTGTGGACATGCTGGAGGACAAGAGATATCAGCCGGCTG 2416
Query 2386 TTCTTCAGTGTCTTGGATGCATAGCGCAGATTGCGATGCCAGTCTATGAGACTAGAGAAA 2445
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 TTCTTCAGTGTCTTGGATGCATAGCACAGATTGCGATGCCAGTCTATGAGACTAGAGAAA 2476
Query 2446 GCGAAGTAGTTGAGTTTATTAGAAGCCAAATCCTCAAA-CTCAAAAGTGAAACTGTAGAT 2504
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2477 GCGAAGTAGTTGAGTTTATTAGAAGCAAAATCCT-AAAGCTCAAAAGTGAAACTGTGGAT 2535
Query 2505 GACAAAAAATTATCATGGGATGACAAAAGTGAAATTTGTCAACTGAAGATATATGGGATC 2564
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2536 GACAAAAAATTGTCATGGGATGACAAAAGTGAAATTTGTCAACTGAAGATATATGGGATC 2595
Query 2565 AAGACGTTGGTTAAGAGCTATTTGCCTTTTAAGGATGCTCAGCTTCGTGCGGGTGTTGAT 2624
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2596 AAGACGTTGGTTAAGAGCTATTTACCTTTTAAGGATGCTCAACTTCGTGCGGGTGTTGAT 2655
Query 2625 GATCTTCTTGGAATACTAAAAACCATTCTTTCCTTTGGCGAAGTATCTGAAGATCTAGAA 2684
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2656 GATCTTCTTGGAATACTAAAAAACATTCTTTCCTTTGGCGAAGTATCCGAAGATCTAGAA 2715
Query 2685 TCAAGTTCTGTTGACAAGGCCCATTTGAGACTTGCTGCTGCAAAGGCAGTCCTCCGCCTT 2744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2716 TCAAGTTCTGTTGACAAGGCCCATTTGAGACTTGCTGCTGCAAAGGCTGTCCTCCGCCTT 2775
Query 2745 TCTAGACATTGGGATGATAAGATACCTATTGAGATCTTTCATTTAACTTTAAAAACCCCT 2804
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2776 TCTAGACATTGGGATGATAAGATACCTATTGAGATCTTCCATTTAACTTTAAAAACCCCT 2835
Query 2805 GAGATACCATTTCCTACAGCTAAGAAAATATTCCTCGGGAAAGTTCACCAGTATGTAAAG 2864
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2836 GAGATACCATTTCCTACAGCTAAGAAAATATTCCTTGGGAAAGTTCACCAGTATGTAAAG 2895
Query 2865 GATCGGGTTTTGGAGACAAAGTATGCCTGTTCATTCCTATTTGATATCACTGGATCAAAT 2924
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2896 GATCGGGTTTTGGAGATGAAGTATGCCTGTTCATTCCTATTTGATATCACTGGATCAAAT 2955
Query 2925 GTTCTCGCATCAGAGGAGGAGAAACACAACCTAGCTGATATCATACAGCATTCTTATCAA 2984
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956 GTTCTCGAATCAGAGGAGGATAAACACAACCTAGCTGATATCATACAGCATTCTTATCAA 3015
Query 2985 ACGAAAGTGCGGAAAATTTCTGCTCAGACTGATGCAAATTCAGCGACTCTCTACGCTCAT 3044
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 3016 ACAAAAGTGCGGAAAATTTCGGCTCAGACTGATGCAAATTCAGTTACTCTCTACCCTCAT 3075
Query 3045 CATATCCTTCCTTATCTGGTTCACGCACTTGCGCATCATTCTTGTCCTGACGTTGAGAAA 3104
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 3076 CATATCCTCCCTTATCTGGTTCATGCACTTGCGCATCATTCTTGTCCTGATGTCGAGAAA 3135
Query 3105 TGCAAAGACGTGAAGGAATATGAAATGATATATCGCCAATTATACTTGATCATTTCTATG 3164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3136 TGCAAAGACGTGAAGGAATATGAAATGATATATCGCCAATTATACTTGATCATTTCTATG 3195
Query 3165 TTGCTCCATAAAGAGGAAGACGGGAAGACTGAAGATATTGATAAGGAACAG-GAGTACGT 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 3196 TTGCTCCATAAAGAGGAAGACGGGAAGACTGAAGATATTGATAAGGAAC-GTGAGTACGT 3254
Query 3224 TCCCACCATTGTTCTTATCTTCCATAGTATAAAACAGTCAGAAGATGTCACTGATGCAAC 3283
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3255 TCCCACCATTATTCTTATCTTCCATAGTATAAAACAGTCAGAAGATGTCACTGATGCAAC 3314
Query 3284 AAAGTCAAAGAACTCACATGCGATCTGTGAGCTTGGGCTGTCAATAATCAATCGCTTAAC 3343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3315 AAAGTCAAAGAACTCACATGCGATCTGTGAGCTTGGGCTGTCAATAATCAATCACTTAAC 3374
Query 3344 TCAGAAAGAGCCTGATCTACAAGGGGAAATCACACCTGTATCGTTGCCTCCGACGCTTTA 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 3375 TCAGAAAGAGCCTGATCTACAAGGGGAAATCACACCTGTATCGCTGCCTCCGACGCTGTA 3434
Query 3404 CAAACCTTCTGAAAAAGTTGAAGGTGACAAGTCTCAGGTAGGTGAAGAGAAATTGTGGCT 3463
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3435 CAAACCTTCTGAAAAAGTTGAAGGAGACAAGTCTCAGGTAGGTGAAGAAAAATTGTGGCT 3494
Query 3464 AGCTGATGAGACTGTCCTGGCACACTTCAGGGCTCTCAAGTTGGAGAGTCATGCTGATGC 3523
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3495 AGCTGATGAGACTGTCCTGTTACACTTCAGGGCTCTCAAGTTGGAGAGTCATGCTGATGC 3554
Query 3524 ATCTGTGATCCCCCAAACTTCAGAATATGAGGTTATGATTGATGGGGAAAGTGATGGAAA 3583
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3555 ATCTGTGATCCCCCAAACTTCAGAAAATGAGGTTATGATTGATGGGGAAAGTGATGGAAA 3614
Query 3584 TGAAATTCCTCTGGGTAAAATTGTAGAGCGTTTGAGAGCTCAGGGAACCAAGACTAGAAA 3643
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3615 TGAAATTCCTCTGGGTAAAATAGTAGAGCGTTTGAGAGCTCAGGGAACCAAGACTAGAAA 3674
Query 3644 GGGCAAAAAGAATAAATCTGTACCAGCTGAAGATGAGAATGGTAAAAATGATGTCGATGT 3703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3675 GGGCAAAAAGAATAAATCTGTACCAGCTGAAGATGAGAATGGTAAAAATGATGTCGATGT 3734
Query 3704 TTTGAAGATGGTGAGGGAGATAAATCTAGATCACTTGCAAATGCTGGATAAATTCGAATC 3763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3735 TTTGAAGATGGTGAGGGAGATAAATCTAGATCACTTACAAATGCTGGATAAATTCGAATC 3794
Query 3764 CAGTAATGGACACAAACATTCCCCTGGTGAGGGAGCAGAGATATGTCAAAAAGATCAGAA 3823
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3795 CAGTAATGGACACAAACATTCCCCTAGTGAGAGAGCAGAGATATGTCAAAGAGATCAGAA 3854
Query 3824 GGGTAACAAAAGGAATGTTGGTGATGCAACATCAGTAGTTTCAGTCCCTAAGCGCCGGAG 3883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3855 GGGTAACAAAAGGAATGTTGGTGATGCAACATCAGTAGTTTCAGTCCCTAAGCGCCGGAG 3914
Query 3884 ATCATCTTCTGGCCATAGTCCTTACAAGTTCTCAAACAGTGGTCCTAAAGTTCCTCTGAA 3943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3915 ATCATCTTCTGGCCATAGTCCTTACAAGTTCTCAAACAGTGGTCCTAAAGTTCAACTGAA 3974
Query 3944 AGGTTCTGAAGATGAGTTGCATCAAGAGAGAGACATGGACAAAAATGTCTCTTCGGACTC 4003
|| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3975 AGCTTCTGAAGATGAGTTGCATCTAGAGAGTGACATGGACAAAAATGTCTCTTTGGACTC 4034
Query 4004 ACACGATGAAAATTCAGACCAAGGGAAAA-GATTAGCAAGCATTTCTCCCCGAAAGAGAA 4062
|||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||
Sbjct 4035 GCACGATGAAAATTCTGACCAAGAGAAAATG-TTAGAAAGCATCTCTCCCCGGAAGAGAA 4093
Query 4063 AGAAAAGCTTATCATCAAAATTAAAGATTACAGAATCTGATTGGGCTCTCACTGATCTGG 4122
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 4094 AGAAAAGCTTATCATCAAAATTAAAGATTACAGAATCTGATTGGGCTCTCACCGATGTGG 4153
Query 4123 ATAGG-AG--TAGGTCAGCAGGAAGTGGTGATAGCAAATTAAAGTCTGCCTCTGGATCAA 4179
| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4154 AGAGGCAGAGTAGGTCAGCAGGAGGTGGTGATAGCAAATTAAAGTCTGCCTCTGGATCAA 4213
Query 4180 TGAAAAAGCGAAAAAACATGTCAGGACTGGCGAAGTGCTCTACAAACGAAAATAAATTGG 4239
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4214 TGAAAAAGCGAAAAAACGTGTCAGGACTGGCGAAGTGCTCTACAAAGGAAAATAAATTGG 4273
Query 4240 TAAATGATGAACTGATCGGTTGCAGAATAGAAGTTTGGTGGCCTATGGATAAACGGTTTT 4299
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4274 TAAATGATGAACTGATCGGTTGCCGAATAGAAGTTTGGTGGCCTATGGATAAACGGTTTT 4333
Query 4300 ATGAAGGGACAGTGAAATCTTATGATTCCACAAAACAGAGACATGTGATACTTTACGAGG 4359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4334 ATGAAGGGACAGTGAAATCTTATGATTCCACAAAACAGAGACATGTGATACTTTATGAGG 4393
Query 4360 ATGGAGATGTTGAAGTACTTAACCTAGAGAAAGAACGGTGGGAGCTCATAGACACCGGTG 4419
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4394 ATGGAGATGTTGAAGTACTTAACCTAAAGAAAGAACAGTGGGAGCTCATAGACACTGGTG 4453
Query 4420 GAAAGCCCACAAAGAAGTCCCGAACATCAAAGGGAAGTTCTAATAAGAAAAGATCTTCTG 4479
||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4454 GAAAGACCGCAAAGAAGTCCAGAACATCAAAGGGAAATTCGAAGAAGAAAAGATCTTCTG 4513
Query 4480 AAAGTAAGCCTAAGAATTCGGTTGGCCCACAGAGGGGTGAAGACCCAGTTACTACTACGc 4539
|||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4514 GAAGTAAGCCTAAGAATCCGGATGGCGTACAGAGGGATGAAGACCCAGTTACTACTACGC 4573
Query 4540 caaaagggaaaagaactccaaagaaaaacttaaaaca-tacacacccaaaaggcacacca 4598
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||
Sbjct 4574 CAAAAGGAAAAAGAACTCCAAAGAAAAACTTAAAACAGTT-ACACCCAAAAGATACACCA 4632
Query 4599 aaaTA-TCTTTCTTTAGAACATGAGAAACTAGAGAGCAGAAACAAGAAAAGACGATCTTC 4657
||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4633 AAA-AGTCTTTCTTTAGAACATGAGAAAGTAGAGAGCAGAAACAAGAAAAGACGATCTTC 4691
Query 4658 TGCCATACCAA--G-GACAGAATATAGTGGGGAGGCTGGCGAAGAGAAATCAGAGTCTGA 4714
||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4692 TGCTTTGCCAATAGAGACAGAATATAGTGGGGAGGCTGGCGAAGAAAAATCAGAGTCTGA 4751
Query 4715 AGGAAAGTTGTGGAAAGAAGGCGAGGATGATGAGGAAGTTGTAAACAAGGAAGAAGATTT 4774
|||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4752 AGGAAAGTCGTTGAAAGAAGGTGAGGATGATGAGGAAGTTGTAAACAAGGAAGAAGATTT 4811
Query 4775 ACAGGAGGCAAAAACAGAGTCGAGTGGGGACGCTGAGGGGAAAGAAGCTGAACATGACAA 4834
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4812 ACAGGAGGCAAAAACAGAGTCGAGTGGGGACGCTGAGGGGAAAGAAGCTGAACATGACGA 4871
Query 4835 CTCAGATACTGAAGGGAAACAAGAAAACAATGAGATGGAGACAGAAGCTGAAGACGATGC 4894
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||
Sbjct 4872 CTCAGATACTGAAGGGAAACAAGAAAACAATGAAATGGAGAGAGAAGCTGAAGA-GA--- 4927
Query 4895 CGAGGATGCTGAGACTTCTGACAATGAGACTCTTGGAGCGTGGAAAAGTAAAGTGGGTAA 4954
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 4928 --A---TGCTGAGACTTCTGACAATGAGACTCTTGGAGCTTGGAAGAGTAAAGTGGGTAA 4982
Query 4955 GTCAATCTCGAGGAAAACAATATAGGTTTGTCGTATGCCATAATGTAGAAGAAATTGCGG 5014
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4983 GTCAATCTCGAGGACAGCAATATAGGTTTGCCGTATGCCGTAATGTAGAAGAAATTGCGG 5042
Query 5015 TGATTGTCCCCAATTATTGGTGGTCTCTGGATTGATGTGGTGTATATGTGGTACAAATGT 5074
||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5043 TGATTGTCCTCAAAAATTGGTGGTCTCTGGATTGCTGTGGTGTATATGTGGTAAAAATGT 5102
Query 5075 GAGATTTGTAGGGTTAGTGATACATACTTGTTCTAACCACCATGTTGGAAAGAATAATAG 5134
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5103 GAGACTTGTAGGGTTAGTGATACATACTTGTTCTAACCACCATGTTGGAAAGAATAATAG 5162
Query 5135 GCAGAA-GAAGCTCCTCCAGAAGCTTATGTGGTCATGTATTGTAGCCTCTGTGTGTGTTT 5193
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5163 GCAGAAAGAAGCTCCTCCAGAAGCTTTTGTGGTCATGTATTGTAGCCTCTGTGTGTGTTT 5222
Query 5194 ATTTGTAGGTTTGTTTTATGTTTT--CT------GTAATATTTACAACTTATATTCCTTA 5245
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5223 ATTTGTAGGTTTGTTTTACGTTTTTTCTTTTTCTGTAATATTTACAACTTATATTCCTTT 5282
Query 5246 ACCCAAAGTGCTATTCTCTT 5265
||||||||| ||||||||||
Sbjct 5283 ACCCAAAGTACTATTCTCTT 5302
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 262774447434
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5