BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494507
Length=3789
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G44750.2 | Symbols: REV1, ATREV1 | DNA-directed DNA polymera... 5788 0.0
> AT5G44750.2 | Symbols: REV1, ATREV1 | DNA-directed DNA polymerases
| chr5:18052608-18060169 FORWARD LENGTH=3841
Length=3841
Score = 5788 bits (3134), Expect = 0.0
Identities = 3576/3787 (94%), Gaps = 39/3787 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 24 CTTCTTCTTCTCCGTCTCGCTCTGAGATTCATCCCCAACAACTACAATGAAGCGTAGCTT 83
||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 18 CTTCTTCTTCTCCGTCTCG-T-TGAGATTCCTCCCCAACAACAACAATGAAGCGTAGCTT 75
Query 84 GGGTTCCAATTCTTCGAACAATAGTGGCAGTGGAAGTAACAAGAAGACTAAGAAGAAGAA 143
|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 76 GGGTTCAAATTCTTCAAACAATAGTGGCAGTGGAAGTAACAAGAAGTCTAAGAAGAATAA 135
Query 144 TAATCCGAGCAATCAGAAAACCCTAGGTGCCGCATGGGGCGCTGCTTCTTCTCGTTCTTC 203
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 TAATCCGAGCAATCAGAAAACCCTAGGCGCGGCATGGGGCGCTGCTTCTTCTCGTTCTTC 195
Query 204 TTTCCGGTCTTCTCCTTTCTCTGATTTCGGAAGTTACATGGAAGTGAAAAATCGGAAACT 263
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 196 TTTCCGGTCTTCTCCTTTCTCCGATTTCGGAAGTTACATGGAAGTGAAAAATAGGAAACT 255
Query 264 TCAGAACCAATTTGAGACTGAGGCTTCTGCTTCTTCTCGTGGTATTTCGGGTTCTGAGAA 323
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 256 TCAGAACCAATTTGAGACTGAGGCTTCTGCTGCTTCTCGTGGTGTTTCGGGTTCTGAGAA 315
Query 324 ACTTATTTTCCAAGGGGTTTCAATCTTTGTGGATGGTTTCACCATTCCTTCCCATCAGGA 383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 316 ACTTATTTTCCAAGGGGTTTCAATCTTTGTGGATGGGTTCACTATTCCTTCTCATCAGGA 375
Query 384 ATT-ACGAGCTTACATGATAAAGTATGGTGGAAGATTCGAGAACTACTTTTCTAGGCGTT 442
|| | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 376 GTTGA-AAGGATACATGATGAAGTATGGTGGAAGATTTGAGAACTACTTTTCTAGGCGTT 434
Query 443 CTGTAACACATATCATCTGCAGCAACCTTCCAGATAGTAAAGTCAAGAATCTAAGGGCAT 502
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||
Sbjct 435 CTGTTACACATATCATTTGCAGCAACCTTCCAGATAGTAAAGTCAAGAATCTTAGGACAT 494
Query 503 TCAGCAGAGGGTTACCTGTTGTGAAACCCACATGGATAGTGGACTCTATCTCTGCCAACA 562
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 TCAGCAGAGGATTACCTGTTGTGAAACCTACATGGATAGTGGACTCTATCTCTGCCAACA 554
Query 563 GACTTCTGGGCTGGGTTCCTTACCAGCTAGATCAACTGAATGATACCCAGCCGAAGTTGT 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||
Sbjct 555 GACTTCTGGGCTGGGTTCCTTACCAGCTAGATCAACTAAATGATACCCAGCCAAAGTTGT 614
Query 623 CTGCCTTTTTTGCACCCAGAAGCCATTTGACCCCTCGGATGGCTTCGCCGGTTACATCTT 682
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 CTGCCTTTTTTGCACCCAGAAGCCATTTGACCCCTCAGATGGCTTCGCCGGTTACATCTT 674
Query 683 GTCCGCCTGATACTGGATACAGTGAAGCTGAAGAAGGAAGTTCAATTAGGGCAGA-GCAT 741
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||
Sbjct 675 TTCAGCCTGATACTGGATACAGTGAAGCTGAAGAAGGAAGTTCAATTAGAGCAGATG-AT 733
Query 742 TTTGAGGAAGCAAGAGACCATGTTGATGATGAATTTGACGGCGTTTATATCGGGAACACT 801
| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 734 TCAGAGGAAGCAAGGGACCACATCGATGATGAAATTGATGGCGTTTATATCGAGAACACT 793
Query 802 ACTCCAGAACTGACAGAAGAAACAGGAACTGGTGATCTGAAATCTTCTGAAATGAATGCA 861
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 794 ACTCCAGAACTGACAGAACAAACAGGAACTGGTGATCTGAAATCTTCTGAAATGAATGCA 853
Query 862 GAAAGACTTGCTAATTATGACATAGAAGAAAAAGAAGTGAGTAGTGAACTTCAATCAACT 921
||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 854 GAAGGACTTGGTAATTATGACATAGAAGAAAAAGAAGTTAGTAGTGAACTTCAATCCACT 913
Query 922 ACCAAACTTCATTCCGCTTCAGACAACAAGTCCGTTCATGCAAATGGGAAGAATGATGGC 981
|| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 914 ACTAATCTTCATTCCACTTCAGACAACAAGTCCGTTCATGCAAATGGGAAGAATGGTGGC 973
Query 982 AAATCGATTGCAACTGCTGCTGGATCTTCTGCAAGGCGTCATTCAACTCTCGAGGATCCC 1041
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 974 AAATCAATTGCAACTGCTGCTGGATCTTCTACAAGGCGTCATTCAACTCTCGAGGA-CCC 1032
Query 1042 -AATTTCGTGGAAAACTACTTTAAGAATTCAAGGCTGCATTTTATTGGAACATGGAGAAA 1100
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1033 TAATTTTGTAGAAAACTACTTTAAGAATTCAAGGCTGCATTTTATTGGAACATGGAGGAA 1092
Query 1101 CAGGTACCGTAAAAGATTTCATGGCCCTTCCAATGGACTTAAATGGGCAGATTCAGGCCA 1160
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 CAGGTACCGTAAAAGATTTCATGGCTCTTCCAATGGACTTAAATGGGCAGATTCAGGCCA 1152
Query 1161 GAATACAGCTGAAATGGACAAGAAGTCAACCATTATCCACATTGATTTGGATTGCTTCTT 1220
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153 GAATACAGCTGAAATGGCCAAGAAGTCAACCATTATCCACATTGATTTGGATTGCTTCTT 1212
Query 1221 TGTGTCAGTGGTAATCAAGAACCGTCTTGAATTACACGACAAGCCGGTAGCTGTATGTCA 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213 TGTGTCAGTGGTAATCAAGAACCGTCTTGAATTACACGACAAGCCGGTAGCTGTATGTCA 1272
Query 1281 CTCAGATAACCCGAAAGGAACGGCTGAAATTTCATCTGCAAATTATCCAGCTCGGGCTTA 1340
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 1273 CTCAGATAACCCAAAAGGAACGGCTGAAATTTCATCTGCAAACTATCCAGCGCGGGCTTA 1332
Query 1341 TGGAGTGAAGGCAGGTATGTTTGTAAGACATGCAAAAGAGCTTTGTCCTCAGCTTGTTAT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1333 TGGAGTGAAGGCAGGTATGTTTGTAAGACATGCAAAAGACCTTTGCCCTCAGCTTGTTAT 1392
Query 1401 TGTTCCTTACAACTTTGAAGCCTACGAAGAGGTAGCTGATCAGTTTTATGACATCTTGCA 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393 TGTTCCTTACAACTTTGAAGCCTACGAAGAGGTAGCTGATCAGTTTTATGACATCTTGCA 1452
Query 1461 TAGGCATTGCAGAAAAGTCCAGGCACTAAGCTGCGATGAAGCGTTTTTAGATGTCTCAGA 1520
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 TAGGCATTGCAGAAAAGTCCAGGCGCTAAGCTGCGATGAAGCGTTTTTAGATGTCTCAGA 1512
Query 1521 TTTGAGGGATGTAGAACCCGGATTTTTAGCCTCGACAATAAGGAATGAGATCCTTGAGAC 1580
|||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1513 TTTGAGTGATGTAGAAACCGAAGTTTTAGCCTCGACAATAAGGAATGAGATCCTTGAGAC 1572
Query 1581 TACTGGATGCAGCGCAAGTGCTGGGATAGGCGGTACTATGCTAATGGCCCGTCTTGCTAC 1640
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1573 TACTGGATGCAGTGCAAGTGCTGGAATAGGCGGTACTATGCTAATGGCTCGTCTTGCTAC 1632
Query 1641 CAGAGTTGCTAAACCAGCCGGCCAGCTTTATATCTCTGCTGAGAAGGTTGAGGAGTTCTT 1700
||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1633 CAGAGTTGCTAAACCAGCCGGTCAACTTTATATTTCTGCTGAGAAGGTAGAGGAGTTCTT 1692
Query 1701 GGATGGGCTTCCAGTCGGGACACTACCTGGTGTAGGTTCTGTGTTGATGGAGAAGCTGGT 1760
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1693 GGATCAGCTTCCAGTCGGGACACTACCTGGTGTAGGTTCTGTGTTGAAGGAGAAGCTGGT 1752
Query 1761 GAAGCAAAATATTCAAACCTGTGGGCAGTTACGTTTGATTTCCAAGGATTCTCTTCAAAA 1820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 GAAGCAAAATATTCAAACCTGTGGGCAGTTACGTTTGATTTCCAAGGATTCTCTTCAAAA 1812
Query 1821 GGATTTTGGGGTGAAAACCGGCGAGATGCTCTGGAGTTATAGCAGAGGACTAGACCTACG 1880
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813 GGATTTTGGGGTAAAAACCGGCGAGATGCTTTGGAGTTATAGCAGAGGACTAGACCTACG 1872
Query 1881 GTCAGTTACAGCAGTGCAGGAGAGTAAGTCCATAGGGGCTGAAGTGAATTGGGGTGTGCG 1940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1873 GTCAGTTACAGCAGTGCAGGAGAGTAAGTCCATAGGGGCTGAAGTGAATTGGGGTGTGCG 1932
Query 1941 GTTCAGAGATCAGCAAGATGTCTGTATTCTCGTTCAACACTTCCTCCAATGCCTATGCAA 2000
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933 GTTCAGAGATCAGCAAGACGTCTTTATTCTCGTTCAACACTTCCTCCAATGCCTATGCAA 1992
Query 2001 AGAAGTTTCTTTGCGTCTGCAAGGATGTGAAATGATAGGACGCAATTTTACTCTTAAGAT 2060
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1993 AGAAGTTTCTTTGCGTCTGCAAGGATGTGAAATGATAGGACGCACTTTTACTCTTAAGAT 2052
Query 2061 aaaaaagagaaaaaaCGATGCTGAAGAACCTACAAAGTATATGGGTTGTGGAGACTGTGA 2120
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2053 AAAAAAGAGAAAAAAAGATGCTGAAGAACCTACAAAGTATATGGGTTGTGGAGACTGTGA 2112
Query 2121 CAATCTGAGTCGTTCCATCACTGTGCCTACTGCTACAGATGACGTAGAAGTTCTGCAGAG 2180
|||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2113 CAATCTGAGTCGCTCCATCACGGTGCCTGCTGCTACAGATGACATAGAAGTTCTGCAGAG 2172
Query 2181 GATTTCAAAGAAGTTGTTTGGGTCATTTTGCTTGGATGTTAAGGAAGTTCGTGGGGTTGG 2240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2173 GATTTCAAAGAAGTTGTTTGGGTCATTTTGCTTGGATGTAAAGGAAGTTCGTGGGGTTGG 2232
Query 2241 GCTTCAGGTCTCTAAGCTTGACAGTGCAGATCCTTCTAATAAAGGTTCAAGGACTCTGAA 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2233 GCTTCAGGTCTCTAAGCTTGACAGTGCAGATCCTTCTAATAAAGGTTCAAGGACTCTGAA 2292
Query 2301 ATCATGGCTCAGCTCTGCATCTGCC-TCTGTCCAAATAGAACAAGATGATAATGTTTTTG 2359
||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293 ATCATGGCTCAGCTCTGCACCTGCCGT-TGTCCAAATAGAACAAGATGATAATGTTTTTG 2351
Query 2360 CTGCAAAAGTTAGGGAAAACTCAGATTGTAATAGGCATGTTACTGGTGGAGTTTCTAGAC 2419
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2352 CTGCAAAGGTTAGGGAAAACTCAGATTGTAACAGGCCTGTTACTGGTGGAGTTTCTAGAC 2411
Query 2420 TCCGAGAATCTAATTCAGCAGAATCTTCAATTCAGTCAGGTGATACAAATTCATCCTTAC 2479
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2412 TCCGAGAATCTAATTCAGAAGAATCTTCAATTCAGTCAGGTGATACAAATTCATCCTTAC 2471
Query 2480 CGCCTATGTGTCATCTCGACATGGAAGTTCTAGAGAACCTTCCTCCAGAGCTCCTTTCTG 2539
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2472 CGCCCATGTGTTATCTCGACATGGAAGTTCTAGAGAACCTTCCTCCAGAGCTCCTTTCAG 2531
Query 2540 AATTAGATGGAACCTACGGTGGGAAGTTGTTTGAGTTGATTGAGAAAAAACGAGGCAAAG 2599
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2532 AATTAGATGGAACCTACGGTGGGAAGCTGTTTGAGTTGATTGAGAAAAAACGAGGCAAAA 2591
Query 2600 GAAAAATCAA-TAGCAATTCTCCACATGTCTCCTTGGATGGCACTGCTGGTGGCATTAAA 2658
||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 2592 GAAGAATCAACT-GCAACTCTCCACATGTCTCCTTGGATGGCACTGCTGCTAGCATTAAA 2650
Query 2659 GAATTAAAATCTCTCTCAGTTAAGATACATGGCTTGAGCACCTCTAGAGAAAAGGAATAT 2718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2651 GAATTAAAATCTCTCTCAGTTAAGATACATGGCTTGAGCACCTCTGGAGAAAAGGAATAT 2710
Query 2719 AAAGAACCGTATGTGCCGCATCCTTCCATTGCCAGAACTTCTAATCATCGTACAATAGAA 2778
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||
Sbjct 2711 AAAGAACCATATGTGCCGCATCCTTCCATTGCCAGAACGTCTAATCAGCATACAATAGAA 2770
Query 2779 ATGACTGATTTGATACCTTCATTCCTTAGTCAAGTCGACGTCTCTGTGTTACAAGAATTA 2838
||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2771 ATGACGGATTTGTTGCCTTCATCCCTTAGTCAAGTCGACGTCTCTGTGTTACAAGAATTA 2830
Query 2839 CCTGAAGAATTGAGGGTTGACGTATTGGGAGCATTTCCTGC-CAACAGGAGACAACAGTC 2897
|||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||
Sbjct 2831 CCTGAAGAGTTGAGAGCTGACGTATTGGGAGCATTTCCTTCACA-CAGGAGACAACAGTC 2889
Query 2898 ATCATCAAATGTTCCCATGGAGACTTGTAAGAAACAAGATGAGGAGCCGATAGATATAAA 2957
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||
Sbjct 2890 ATCATCAGATGTTCCCAAGGAGACTTGTAAGAAACAAGATGAGGAACCAATAGATTTAAA 2949
Query 2958 GGGCACTGAGAATAAGATTGGATTCTCATGTAGCTCTCGTTGGTTTGGGAATCCTCCTCT 3017
||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2950 GGGCACTGAGAATGAGATTGGATTATCATTTAGCTCTCTTTGGTTTGGGAATCCTCCTCT 3009
Query 3018 TTGGACAGAGAAGTTCAAAGTTAGTGGCAATTGTACTTTGGAAAAACTTTCAGGGATATA 3077
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3010 TTGGACAGAGAAGTTCAAAGTTAGTGGCAATTGTACTATGGAAAAACTTTCAGCGATATA 3069
Query 3078 CTTCAAGGTTGCTCAGTTAAGACCTATGTTATCCCGGGTCCTACAACACGCTATTTCAGA 3137
||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3070 CTTCAAGGTTGCTCAGTCAAGGCCCATGTTATCCCTAGTCCTGCAACACGCTATTTCAGA 3129
Query 3138 AATCAGTAGTTTTCATGATGCAGCAAGTGCCAATGATTTGGACAAAGCTATATACGATGT 3197
||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3130 AATGAGTAGTTTTCCTGATGCAGCAAGTGCCAGTGATTTGGACAAAGCTATTTACGATGT 3189
Query 3198 GTGTGAACTTCTTAAACAGTACATTAAGCTCAAGGTAGAAGGTGATATTGAAGAGATATA 3257
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 3190 GTGTGAACTTCTTAAACAGTACATTAACCTCAAGGTAGGAGGTGATATTGAGGAGATATA 3249
Query 3258 TCTCTGCTTCCGACTTCTGAAAAGATTAGCAGCAAGGAGCCAACTTTTCCTACAAGTCTA 3317
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3250 TCTCTGCTTCCGACTTCTGAAAAGATTAGCAGCAAGGAGCCAGCTTTTCCTACAAGTCTA 3309
Query 3318 TGAGATATTGTCTCCCTTTATTCAGGCCTCGATCAGTGAACACTATGGAGGAAGCTTGAG 3377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3310 TGAGATATTGTCTCCCTTTATTCAGGCCTCGATCAGTGAACACTATGGAGGAAGCTTGAG 3369
Query 3378 TATTCCTTGAAAGATCTTTACTGAGGTTGGGCTGAAGTCTGGCCGAATGCTATAAAAGAA 3437
||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 3370 TATACCATGAAAGGTCTTCACTGAGGTTGGACTGAAGTCTGGCTGGATGCTATAAAAGAA 3429
Query 3438 TGTATACTTGCAGGACAATGTGGATCCTGAAGGGCATCATGGTGAATGCACTCGGACAAT 3497
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||
Sbjct 3430 TGTATACTTGCAGGACAATGTGGATTCTGAAGGGCATCATGGTGAACGCACACGGACAAT 3489
Query 3498 ACACGAAGCAGCTTAAGAAAACGGCAA--TAG--AAGGCTA--G--C--TAGATA---TA 3544
||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| | | | |||| | ||
Sbjct 3490 ACACGAAGCAGCTTAAGCAAAC--CAAACTCGGGAAGATTTTTGGGCAATAGA-AGGCTA 3546
Query 3545 T-TGCTGCAAATTCGCGTGTCAAATGGAGTCTCGAAAACACCCATTGTGGCATTTGCACA 3603
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3547 GCTGCTGCAAATCCGCGTGTGAAATGGAGTCTCGAAAGCACTTATTGTTGCATTTGCACA 3606
Query 3604 ATGGGATATGGAAGTTATTCAAATCTCAAAGTGCAGAGCCATTAGGAGCAACTACTTTTC 3663
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 3607 ATGAGATATGGAAGTGATTCAAATCTCAAAGTGCAGAGCCATTAGGAGCCACTGCTTTTC 3666
Query 3664 TCTGTTCATAGGAATGTATCTGAACTTGATAATCATTTCGTCCCATGACACGAGCGCAGC 3723
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 3667 TCTGTTCATAGAAATGTAACTGAACTTGATAATCATTTCTTCCCATGACACGAGCT-A-- 3723
Query 3724 TGTATATATCACCTAGTTCCTTGTTCATGAATTTTCTTTATTTGTTAAAA-CGATAATTT 3782
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||
Sbjct 3724 ---ATATATCACCTAGTTCCTTGTTCATGAATTGTCTTTATTT-TTAAAAACGATAATTT 3779
Query 3783 ATTCTCT 3789
|||||||
Sbjct 3780 ATTCTCT 3786
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 188728039566
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5