BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg494576 Length=5173 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G44180.1 | Symbols: | Homeodomain-like transcriptional regu... 7899 0.0 > AT5G44180.1 | Symbols: | Homeodomain-like transcriptional regulator | chr5:17783172-17790011 FORWARD LENGTH=5224 Length=5224 Score = 7899 bits (4277), Expect = 0.0 Identities = 4920/5223 (94%), Gaps = 74/5223 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGAAGGTGGGTCTGAGAAAACAACACCTGAA------GGTGGTGAGAGTAAGTCTAAA 54 ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1 ATGGAAGGTGGGTCTGAAAAAACAACACCTGAAGGTTGTGGTGGTGAGAGTAAGTCTAAA 60 Query 55 CGGAAAATGAAAACTGCTGCTCAACTTGAAGTTCTTGAAAACACTTATGCAGCTGAGCCT 114 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 61 CGGAAAATGAAAACTGCTGCTCAACTTGAAGTTCTTGAAAACACTTATTCAGCTGAGCCT 120 Query 115 TATCCTTCGGAAGCTATAAGAGCGGATCTTTCAGTGAAACTGAATCTTTCCGACAGGCAG 174 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| Sbjct 121 TATCCTTCGGAAGCTATAAGAGCGGATCTCTCAGTGAAACTGAATCTTTCCGATAGACAG 180 Query 175 TTACAGATGTGGTTTTGTCACCGGCGGCTTAAAGACCGGAAATCTACTACGCCGAGTAAA 234 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 181 TTACAGATGTGGTTTTGTCACCGGCGGCTTAAAGAACGGAAATCTACTACGCCGAGCAAA 240 Query 235 CGTCAGCGTAAGGAGTTGGTAACACCTACGGC-AGTTGAATCCTCGAAACCAGCCGTCAA 293 ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||||||| | ||||| ||||||| Sbjct 241 CGTCAGCGTAAGGAGTTAGTAACTCCAACGGCTA-TGGAATCCTGGGAACCACCCGTCAA 299 Query 294 TGCTGGTGATTTGGTGGCGGGAAATGAGCTTGATTCTAGAAGAGCTGCTCGAGGAGGCgg 353 ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 300 TGCCGGTGATTTAGTGGCGGGAAATGAGCTTGATTCTAGAAGAGCTGCTC---GAGGC-- 354 Query 354 tggtagtggtggtggtggtgtgACTGTTGTTAGGCGGTTTAATGAACCGTCTTCTGCTGA 413 ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 355 ----AGTGGCGGTAGTGGTGTGACGGTTGTGAGGCGGTTTAATGAACCGTCTTCTGCTGA 410 Query 414 GGTTAGAGCTATTGGTTATGTGGAAGCTCAATTGGGAGAGCGTTTGAGAGATAACGGACC 473 ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 411 GGTTAGAGCTATTGGTTATGTTGAAGCTCAATTGGGAGAGCGGTTGAGAGATAACGGACC 470 Query 474 GATTCTTGGAATGGAGTTTGATCCTTTACCTCCTGGTGCATTTGGGATGCCTATTGAGAT 533 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 471 GGTTCTTGGAATGGAGTTTGATCCTTTACCTCCTGGTGCATTTGGCATGCCTATTGAGAT 530 Query 534 GCCAAGCCATCGAAAGGCGACTAGGCAAGCGTTT-GAGACCAACATATATGTTCGATCCG 592 |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 531 GCCAAGCCATCGCAAGGCGACTAGGCAAGC-TTTCGAGACCAACATATATGTCCGATCCG 589 Query 593 ATGTAAAGCCTATCAAAGATCATGTGAGGCCCATTCGTGAATATCAGTTCATTCCTGAGC 652 |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 590 ATGTCAAGCCTATCAAAGATCATGTGAGGCCTATTCGTGAATATCAGTTCATTCCTGAGC 649 Query 653 TGCCATCTTCAAGGACTGATCATTCCGAAAGAGTTTCTCCGTCTCATCATTTTGGAGTTC 712 |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 650 TGCCATCTTCGAGGACTGATCATTCGGAACGAGTTTCTCCGTCACATCATTTTGGAGTTC 709 Query 713 CACTTGATGGTTCGGTTATGAGGGCTTCAGCTGTGTCTGCTGGACATCGGGATGACTATA 772 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 710 CACTTGATGGTTCGGTTATGAGGGTTTCAGCTGTGTCTGCTGGACATCGGGATGACTATA 769 Query 773 AAATTTCACCTCAGATACCAAATTTGAATCTTGCAACTCATCAAGGGAAGCCGGGGCATG 832 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 770 AAATTTCACCTCAGATACCAAATTTGAATCTTGCAACTCATCAAGGGAAGCCGGGGCATG 829 Query 833 TCTACTCGCCTAACTTGGCCGAATATGACTCATCGTATCAGAAAAGCTACGTGGATACTG 892 |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 830 TCTATTCGCCTAACTTGGTCGAATATGACTCACCGTATCAGAAAAGCTACATGGATACTG 889 Query 893 CTGCACATGTTCATGAGGATCCTTTTGTGAAACCTGAGAGAGACTTTGGTAATGAGGATG 952 ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| Sbjct 890 CTGCACAAGTTCATGATGATCCTTTTGTGAAATCAGAGAGAGAAGTTGGTAATGAGGATG 949 Query 953 AGGATGATGATGCCCTGCAATTAGAGAGACAACGCAAGAATGAAGAAGCAAGAATAGCTC 1012 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 950 AGGATGATGATGCCCTGCAATTAGAGAGACACCGCAAGAATGAAGAAGCAAGAATAGCTC 1009 Query 1013 GGGAAGTTGAGGCTCACGAGAAGAGGATCCGAAGAGAACTAGAGAAACAAGATATGCTGA 1072 ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1010 GGGAAGTCGAGGCTCATGAGAAGAGGATCCGAAGGGAACTAGAGAAACAAGATATGCTGA 1069 Query 1073 GGCGAAAGAGAGAGGAGCAAATAAGGAAAGAAATGGAGAGGCAAGATCGTGAAAGACGGA 1132 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1070 GGCGAAAGAGAGAAGAGCAAATAAGGAAAGAAATGGAGAGGCAAGATCGTGAAAGACGGA 1129 Query 1133 AAGAGGAAGAACGTCTTTTACGTGAAaagcagagagaggaagagaggtacctgaaagagc 1192 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 1130 AAGAGGAAGAACGTCTTTTACGTGAAAAACAGAGAGAGGAAGAGAGGTACCTTAAAGAGC 1189 Query 1193 agatgcgagagttgcagcgaagagagaagTTCTTgaagaaagaaacaatcagggctgaga 1252 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1190 AGATGCGAGAGTTGCAGCGAAGAGAGAAGTTCTTGAAGAAAGAAACAATCAGGGCTGAGA 1249 Query 1253 aaatgcgtcaaaaagaagagatgcgtaaagaaaaagaGGTTGCAAGGCTTAAAGCTGCTA 1312 ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 1250 AAATGCGACAAAAAGAAGAGATGCGTAAAGAAAAAGAGGTTGCCAGGCTTAAAGCTGCTA 1309 Query 1313 ACGAGAGGGCCATTGCTCGTAAGATCGCAAAGGAATCTATGGAACTTATTGAAGATGAAC 1372 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1310 ATGAGAGGGCCATTGCTCGTAAGATCGCAAAGGAATCTATGGAACTTATTGAAGATGAAC 1369 Query 1373 GCTTAGAACTCATGGAGGTTGCTGCGTTAACCAAAGGATTGCCTTCAATGCTCGCTCTTG 1432 ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| Sbjct 1370 GCTTAGAGCTCATGGAGGTTGCTGCGTTAACAAAAGGCTTGCCTTCAATGCTCGCCCTTG 1429 Query 1433 ACTTTGAAACTCTTCAGAACCTCGATGAATATAGAGACAAGCAGGTGTTATTTCCCCCAA 1492 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1430 ACTTTGAAACTCTACAGAACCTCGATGAATATAGAGACAAGCAGGCAATATTTCCCCCAA 1489 Query 1493 CATCTGTAAGATTGAAAAAGCCCTTTGCAGTCAAGCCATGGAATGGTTCTGATGAGAATG 1552 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 1490 CATCTGTAAAATTGAAAAAGCCCTTTGCAGTCAAGCCGTGGAATGGTTCTGATGAGAATG 1549 Query 1553 TTGCAAATCTTCTAATGGTGTGGAGATTCTTAATCACTTTTGCGGACGTTCTTGGTCTTT 1612 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| Sbjct 1550 TTGCAAATCTTCTTATGGTGTGGAGATTCTTAATCACTTTCGCAGACGTTCTTGGTCTTT 1609 Query 1613 GGCCATTTACCCTAGACGAGTTTG-TGCAGGCATTCCATGACTATGACCCACGACTAATG 1671 ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1610 GGCCATTTACCCTGGACGAGTTTGCT-CAGGCATTCCATGACTATGACCCACGGCTAATG 1668 Query 1672 GGAGAGATACACATTGTTCTTTTGAAGACTATAATCAAAGATATCGAGGGTGTTGCAAGA 1731 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| Sbjct 1669 GGAGAGATACACATTGTTCTATTGAAGACTATAATCAAAGATATCGAGGGTGTGGTAAGA 1728 Query 1732 ACGCTATTGACCGGTGTTGGAGCAAACCAGAATACTGCTTCTAATCCCGGAGGGGGTCAT 1791 ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1729 ACGCTGTCGACCGGTGTTGGAGCAAACCAGAATGTTGCTGCTAATCCCGGAGGGGGTCAT 1788 Query 1792 CCTCATGTTGTGGAGGGTGCATATGCATGGGGTTTTGATATACGCAGCTGGAGACGAAAC 1851 ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1789 CCTCACGTTGTGGAGGGTGCATACGCGTGGGGTTTTGATATACGCAGCTGGAGAAAAAAC 1848 Query 1852 TTGAATGTTTTTACATGGCCTGAAATCTTGAGGCAACTCGCTCTCTCTGCAGGATTGGGA 1911 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 1849 TTGAATGTTTTTACATGGCCTGAAATCTTGAGGCAACTCGCTCTCTCTGCCGGGTTGGGA 1908 Query 1912 CCGCAACTGAAGAAAATGAACATTAAGACTGTGTCTGTTCATGATGACAATGAGGCCAAT 1971 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1909 CCGCAACTGAAGAAAATGAACATTAGGACTGTGTCTGTTCATGATGACAATGAGGCCAAC 1968 Query 1972 AACTCTGAGAATGTGATTGTCAACCTAAGGAAAGGAGTAGCAGCTGAGAATGCTTTTGCC 2031 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1969 AACTCTGAGAATGTGATTTTCAACCTAAGGAAAGGAGTAGCAGCTGAGAATGCTTTTGCC 2028 Query 2032 AAGATGCAAGAAAGGGGACTTTCTAATCCGCGACGTTCACGGCATCGTTTGACTCCAGGC 2091 ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2029 AAGATGCAAGAGAGGGGACTTTCTAATCCACGACGTTCACGGCATCGTTTGACTCCAGGC 2088 Query 2092 ACTGTTAAGTTTGCTGCATTTCATGTTCTATCTCTTGAGGGTGAAAAAGGTTTGACCATT 2151 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| Sbjct 2089 ACTGTTAAGTTTGCTGCATTTCATGTTCTATCTCTTGAAGGTGAAAAAGGTTTGAACATT 2148 Query 2152 CTTGACGTTGCAGAGAAGATTCAGAAATCAGGATTGAGGGATCTAACGACGAGTAGGACA 2211 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2149 CTTGAGGTTGCAGAGAAGATTCAGAAATCAGGATTGAGGGATCTAACGACGAGTAGGACA 2208 Query 2212 CCTGAAGCCTCTGTTGCTGCTGCGTTGTCTCGGGATACAAAACTCTTTGAGAGGGTAGCT 2271 ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2209 CCTGAAGCCTCGGTTGCTGCTGCGTTGTCTCGAGATACAAAACTCTTTGAGAGGGTAGCT 2268 Query 2272 CCTTCTACGTACTGTGTGCGTGCTTCCTATAGAAAAGATGCAGGTGATGCTGAGACTATA 2331 ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2269 CCTTCTACGTATTGTGTACGTGCTTCCTATAGAAAAGATGCAGGTGATGCTGAGACTATA 2328 Query 2332 TTTGCTGAAGCAAGAGAGAGAATACGGGCATTCAAGAGTGGGGTCACTGATGTAGAAGAT 2391 ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| Sbjct 2329 TTTGCTGAAGCGAGAGAGAGAATACGTGCATTCAAGAGCGGCATCACTGATGTAGAAGAT 2388 Query 2392 GTTGATGACGTTGAGAGAGATGAAGACTCCGAAAGCGATGTCGGAGATGACCCAGAAGTT 2451 |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| Sbjct 2389 GTTGATGACGCTGAGAGAGATGAAGACTCTGAAAGCGATGTCGGAGAAGACCCAGAGGTT 2448 Query 2452 GATTTGAACCTTAAAAAGGAAGATCCCAATGCTCTGAAGATAGAAAACCTAATCGGAGTC 2511 ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| Sbjct 2449 GATGTGAACCTTAAAAAGGAAGATCCCAATCCTCTGAAGGTAGAAAACTTAATTGGAGTC 2508 Query 2512 GAACCAGTGTTGGAAAATGGGAAACTGGATACCGTGCCCATGAAAACTGAACTGGGACTG 2571 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2509 GAACCATTGTTGGAAAATGGGAAACTGGATACCGTGCCCATGAAAACTGAACTGGGACTG 2568 Query 2572 CCTCTTACTCCCTCTCTCCCCGAGGATATGAAAGATGAGAAAAGAGATGACATTTTAGTG 2631 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | Sbjct 2569 CCTCTTACTCCCTCTCTCCCCGAGGAAATGAAAGATGAGAAAAGAGATGACACTTTAGCG 2628 Query 2632 GAACAATCTCTAGAAGATGCAGTAGCAAACGGTGAGGATAGTGCTTGTTTTGACGAGAGC 2691 || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2629 GACCAATCTCTAGAGGATGCGGTAGCAAACGGTGAAGATAGTGCTTGTTTTGACGAGAGC 2688 Query 2692 AAACTTGGGGAACAGTGGGTTCAAGGACTTGTGGAAGGAGATTACTCGAATCTCAGCAGC 2751 |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 2689 AAACTTGGGGAACAGTGGGTTCAAGGACTTGTAGAAGGAGATTACTCGAATCTTAGCAGC 2748 Query 2752 GAGGAACGTTTAAACGCACTTGTTGCTCTGATTGGTATTGCCATCGAAGGAAACACAATC 2811 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 2749 GAGGAACGTTTAAACGCACTTGTTGCTCTGATTGGTATTGCCACCGAAGGAAACACAATC 2808 Query 2812 CGAATCGCCCTTGAGGAACGGTTGGAAGTTGCAAGTGCCTTAAAGAAACAGATGTGGGGT 2871 |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 2809 CGAATCGCCCTTGAGGAACGGTTGGAGGTAGCAAGTGCATTAAAGAAACAGATGTGGGGT 2868 Query 2872 GAAGTGCAACTCGACAAACGCTGGAAAGAAGAGTCTTTGATTCGAGCAAATTACCTTTCA 2931 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 2869 GAAGTGCAACTCGACAAACGCTGGAAAGAAGAGTCTTTGATTCGAGCAAATTACCTCTCA 2928 Query 2932 TACCCAACAGCAAAGCCGGGGCTTAATATCGCAACTCCTGCATCTGGAAATCAAGAAAGT 2991 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2929 TACCCAACAGCAAAGCCGGGGCTTAATATCGCAACCCCTGCATCTGGAAATCAAGAAAGT 2988 Query 2992 TAC-TCAGCAGATGTGACTCCAATCTCCTCACAGGACCCGTTGAGTCTTCCACAGATCGA 3050 | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 2989 T-CATCAGCGGATGTGACTCCAATCTCCTCACAGGACCCGGTGAGTCTTCCACAGATCGA 3047 Query 3051 TGTAAATAACGTGATCGCAGGACCAAGCTTGCAATTGCAAGAAAATGTACCTGGAATGGA 3110 ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 3048 TGTGAATAACGTGATTGCTGGACCAAGCTTGCAATTGCAAGAAAATGTACCTGGAGTGGA 3107 Query 3111 GAATTTGCAGTATCAGCAGCAACAGGGCTACACAGCGGACCGGGAAAGGCTGCGTGCACA 3170 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3108 GAATTTGCAGTATCAGCAGCAACAGGGGTACACAGCGGACCGGGAAAGGCTGCGTGCACA 3167 Query 3171 GTTAAAAGCGTATATTGGGTATAAAGCTGAAGAGCTATATGTATATAGGTCGCTTCCGCT 3230 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3168 GTTAAAAGCGTATGTTGGGTATAAAGCTGAAGAGCTATATGTATATAGGTCGCTTCCGCT 3227 Query 3231 TGGTCAAGATCGAAGACGCAATCGCTATTGGCGGTTTTCAGCATCCGCCTCTCGAAATGA 3290 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3228 AGGTCAAGATCGAAGACGCAATCGCTATTGGCGGTTTTCAGCATCCGCCTCTCGAAATGA 3287 Query 3291 TCCTGGTTGTGGTAGAATATTCGTGGAACTTCAGGACGGACGATGGAGGCTCATTGATTC 3350 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 3288 TCCTGGTTGTGGTAGAATATTCGTGGAACTTCAGGACGGACGCTGGAGGCTCATTGATTC 3347 Query 3351 CGAAGAGGGTTTTGATTATTTGGTGAAGTCACTAGATGTTCGCGGTGTAAGAGAATCACA 3410 |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3348 CGAAGAGGCTTTTGACTATTTGGTGAAGTCACTAGATGTTCGCGGTGTAAGAGAATCACA 3407 Query 3411 TTTACACTTTATGTTACTGAAGATTGAAGCATCTTTCAAGGAAGCAGTGAGGAGGAGTGT 3470 ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| Sbjct 3408 TTTACACTTTATGTTGCTGAAGATCGAAGCATCCTTCAAGGAAGCATTAAGGAGGAATGT 3467 Query 3471 GGAAGCAAATCCCGGGTTGTGTTCCATATCTTCTAGCATGGATTCTGATACTGGCG-AGA 3529 || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | | Sbjct 3468 GGCAGCAAATCCCGGGGTGTGTTCCATATCTTCTAGCTTGGATTCCGATACTG-CGGAAA 3526 Query 3530 TCTCCACGACGTTTAAGATCGAGCTAGGGGATAGTAACGCCATTGAGAGATGCAGCGTAT 3589 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 3527 TCTCCACGACGTTTAAGATCGAGCTAGGGGATAGTAACGCCGTTGAGAGATGCAGCGTAT 3586 Query 3590 TGCAACGGTTCCATAGTTTTGAGAAATGGATGTGGGATAATATGCTGCATCCGGGTGCGT 3649 ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | Sbjct 3587 TGCAACGCTTCCATAGTTTCGAGAAGTGGATGTGGGATAATATGCTGCATCCTAGTGCTT 3646 Query 3650 TATCCGCATATAAGTATGGTGCTAAGCAAAGCAGTCCGCTTTTTCGCATATGCAGAATCT 3709 |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3647 TATCTGCATTTAAGTATGGTGCTAAGCAAAGCAGTCCGCTTTTTCGCATATGCAGAATCT 3706 Query 3710 GTGCGGGACTACACTTTGTCGGAGATATTTGCTGTCCTAGTTGCGGTCAGATGCATGCTG 3769 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3707 GTGCGGAACTACACTTTGTCGGAGATATTTGCTGTCCTAGTTGCGGTCAGATGCATGCTG 3766 Query 3770 GTCCGGATATTGGTGAGTTGTGTTTTGCTGAGCAAGTGGCTCAACTTGGGGATATTTTGA 3829 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| Sbjct 3767 GTCCAGATGTTGGTGAGTTGTGTTTTGCTGAGCAAGTGGCTCAACTCGGGGATAATTTGA 3826 Query 3830 GAGGAGGAGATATTGGCTTTATCTTGCGTAGCTCAATCTCGTCTCCTCTTAGAATAAGAC 3889 || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3827 GAAGAGGAGATACTGGCTTTATCTTGCGTAGCTCAATCTTGTCTCCTCTTAGAATAAGAC 3886 Query 3890 TACTCAAGGTTCAATTAGCGCTTGTCGAAGCTTCTCTTCCACCTGAAGGACTTGAAGCTT 3949 ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3887 TACTCAAGGTTCAGTTAGCACTTGTCGAAGCTTCTCTTCCACCTGAAGGACTTGAAGCTT 3946 Query 3950 TTTGGACAGAGAATCTTAGGAAATCTTGGGGTATGAAGCTGATGTCATCAAGTTCCCCCG 4009 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | Sbjct 3947 TTTGGACAGAGAATCTTAGGAAATCTTGGGGTATGAAGCTGTTGTCATCAAGTTCCCATG 4006 Query 4010 AAGAACTTAATCAGGTTCTCACAACGTTAGAGGCTGCACTAAAGAGAGATTTCTTGTCTT 4069 |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 4007 AAGATCTTTATCAGGTTCTCACAACGTTAGAGGCAGCACTAAAGAGGGATTTCTTGTCTT 4066 Query 4070 CAAACTTTGAAACAACTTCTGAACTCTTGGGTTTACAAGTAGAAGCTCTCGCCAACGAT- 4128 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| Sbjct 4067 CAAACTTTGAAACAACTTCTGAACTCTTGGGTTTACAAGAAGGAGCTCTCGCCAGCGATC 4126 Query 4129 TTCACTTGTGGAGTTAATGTACTACCGTGGATACCGAAGACAACAGGAGGTGTAGCTTTG 4188 || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4127 TT-ACTTGTGGGGTTAATGTACTACCGTGGATACCAAAGACAGCAGGAGGTGTAGCTTTG 4185 Query 4189 AGGCTCTTTGAATTCGACAGCTCGATTGTTTACACAACCGATCAAAACAAAGATCCTCTA 4248 || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4186 AGACTCTTTGATTTCGACAGCTCGATTGTTTACACACCCGATCAAAACAACGATCCTCTA 4245 Query 4249 AAAGACAAAGAATCTGAAGATTTCGTCGGTTTGGAGACAAATTTTGTGAGAAACGTT-CA 4307 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || || Sbjct 4246 AAAGACAAAGAATCTGAAGATTTCGTGGGTTTGGAGACAAATATTCTGAGAAAC-TTACA 4304 Query 4308 AGAAAAGGACGTAATGGAGACTCTGGTGCAAGTTGCT--T-ACACGCAAGAAGAGAACTG 4364 || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||| Sbjct 4305 TGAGAAGGACGTAATGGAAACTCCGGTGCAAGTTGCTGCTTATAAGCAAGAAGAGAACTG 4364 Query 4365 GACGGATCCTGGTTTAGGTGGTGTGTCTAGCTCTGGGCGAGGAGGTCGACCACCACGAGG 4424 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4365 GACGGATCCTGGTTTAGGTGGTGTGTCTAGCTCTGGGAGAGGAGGTCGACCACCACGAGG 4424 Query 4425 ACGTGGCCGACCTCGTTCCCGTGGCAACGGCAAGAAACCGGCAGTTTCTGGTAGACCACC 4484 ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| Sbjct 4425 ACGTGGCCGGCCTCGTGCCCGTGGCAATGGCAAGAAACCGGCAGTTTCTGTTAAACCACC 4484 Query 4485 ACGAGGTGCAGCAAACTCAAATGGCGAAACCATGTTGAGACCAAGAGCACAACCACGTGG 4544 |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 4485 ACGAGGTGCAGCAAACTCAAATGGTGAAACCATGTTGAGACCGAGAGCACAACCACGTGG 4544 Query 4545 GGGTAGAAAGAACGGGCGGCGTA-TCGGCACCAAAGGCCGGAAGAGACCAACGAAAGGAA 4603 |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| Sbjct 4545 GGGTAGAAAGAATGGGCGGCGTAGT-GGCACCAAAGGCCGAAAGAGACCAACGCAAGGAA 4603 Query 4604 CACTAGGTATATCTAATGAAGTAGGAGGA--A-GTCGGGCAAAGGAAGTTGCTGTAACCG 4660 |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4604 CACTCGGTATATGTAATGAAGTAGGAGGAGGACGTCGGGTTAAGGAAGTTGCTGTAACCG 4663 Query 4661 CCAAAACTAGTCTTCCTGATAACGACGACGATTGGATCGATACCCCTGAACTGCAAGACG 4720 ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4664 CCAAAACCAGTCTTCCTGATAACGATGACGATTGGATCGAAACCCCTGAACTGCAAGACG 4723 Query 4721 ATGACGGAGAAGCTAGCAGCTCAGGGAGATCGTTTCAGTATGAAGACTATGATGATGATG 4780 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4724 ATGACGGAGAAGCTAGCAGCTCGGGGAGATCGTTTCAGTATGAGGACTATGATGATGATG 4783 Query 4781 -T--CATGGCTCCGATTGATGATTTTGATGGCGGCGGTGAATCAAGTAAATTAGTAGGTA 4837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| Sbjct 4784 ATGTCATGGCTCCGATTGATGATTTTGATGGCGGCGGCGAATCAAGTAAATTAGTAGGTA 4843 Query 4838 GGGGTGAATTTAGCTTACATAGTGATGATGAATACgaagaagaaga--a-gaagaagaag 4894 |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| Sbjct 4844 GGGGGGAATTTAGCTTACATAGTGATGATGAATACGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAG 4903 Query 4895 acatgaacatgaaaatgaatgtgaatgttgttgatgatgaagatgaagatTACATAAACG 4954 ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 4904 ACATGAACATGAAAATGGATGTGAATGTTGTTGATGATGAGGATGAAGATTACATAAACG 4963 Query 4955 ATGACTCATATGGTAGAGAGCAGCC-GG--T--G-ATTAGCA-C--T-C-G-GA-----A 4997 | ||||| ||||||||| |||||| || | | ||||||| | | | | || | Sbjct 4964 AAGACTCGTATGGTAGAAAGCAGCATGGGATTAGCATTAGCAACGATGCAGCGACTCGGA 5023 Query 4998 AA-GGTTTAA---GTTTGAAGATCCTGATCTAACATCTTCATCGTCTTCTGATTTTCAGT 5053 || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 5024 AAAGGTTTAATAAGTTTGAAGATCCTGATCTAACATCTTCATCGTCTTCTGATTTTCAAT 5083 Query 5054 GATTGATTTTAGACA-GAAACTACGAAGCtttttttttgtattcttcaaaatgaatgaat 5112 || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | Sbjct 5084 GACTGATTTTAGACAAGAACCTACGAAGCTTGTTTTT-GTATTCTTCAAAATGAAT---T 5139 Query 5113 ttttttagtttaact---ttttt-tAAGTTAACGTCAATGTAATCCTTTTGTCTCTTATG 5168 |||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5140 CTTTT-AGTGTAACAACCTTTTTGTAAGGTAACGTCAATGTAATCCTTTTGTCTCTTATG 5198 Query 5169 AGC 5171 ||| Sbjct 5199 AGC 5201 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 258159088678 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5