BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg494576

Length=5173
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT5G44180.1 | Symbols:  | Homeodomain-like transcriptional regu...  7899    0.0  


> AT5G44180.1 | Symbols:  | Homeodomain-like transcriptional regulator 
| chr5:17783172-17790011 FORWARD LENGTH=5224
Length=5224

 Score = 7899 bits (4277),  Expect = 0.0
 Identities = 4920/5223 (94%), Gaps = 74/5223 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGGAAGGTGGGTCTGAGAAAACAACACCTGAA------GGTGGTGAGAGTAAGTCTAAA  54
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||||||||||
Sbjct  1     ATGGAAGGTGGGTCTGAAAAAACAACACCTGAAGGTTGTGGTGGTGAGAGTAAGTCTAAA  60

Query  55    CGGAAAATGAAAACTGCTGCTCAACTTGAAGTTCTTGAAAACACTTATGCAGCTGAGCCT  114
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  61    CGGAAAATGAAAACTGCTGCTCAACTTGAAGTTCTTGAAAACACTTATTCAGCTGAGCCT  120

Query  115   TATCCTTCGGAAGCTATAAGAGCGGATCTTTCAGTGAAACTGAATCTTTCCGACAGGCAG  174
             ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct  121   TATCCTTCGGAAGCTATAAGAGCGGATCTCTCAGTGAAACTGAATCTTTCCGATAGACAG  180

Query  175   TTACAGATGTGGTTTTGTCACCGGCGGCTTAAAGACCGGAAATCTACTACGCCGAGTAAA  234
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct  181   TTACAGATGTGGTTTTGTCACCGGCGGCTTAAAGAACGGAAATCTACTACGCCGAGCAAA  240

Query  235   CGTCAGCGTAAGGAGTTGGTAACACCTACGGC-AGTTGAATCCTCGAAACCAGCCGTCAA  293
             ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||||||| | ||||| |||||||
Sbjct  241   CGTCAGCGTAAGGAGTTAGTAACTCCAACGGCTA-TGGAATCCTGGGAACCACCCGTCAA  299

Query  294   TGCTGGTGATTTGGTGGCGGGAAATGAGCTTGATTCTAGAAGAGCTGCTCGAGGAGGCgg  353
             ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  
Sbjct  300   TGCCGGTGATTTAGTGGCGGGAAATGAGCTTGATTCTAGAAGAGCTGCTC---GAGGC--  354

Query  354   tggtagtggtggtggtggtgtgACTGTTGTTAGGCGGTTTAATGAACCGTCTTCTGCTGA  413
                 ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355   ----AGTGGCGGTAGTGGTGTGACGGTTGTGAGGCGGTTTAATGAACCGTCTTCTGCTGA  410

Query  414   GGTTAGAGCTATTGGTTATGTGGAAGCTCAATTGGGAGAGCGTTTGAGAGATAACGGACC  473
             ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  411   GGTTAGAGCTATTGGTTATGTTGAAGCTCAATTGGGAGAGCGGTTGAGAGATAACGGACC  470

Query  474   GATTCTTGGAATGGAGTTTGATCCTTTACCTCCTGGTGCATTTGGGATGCCTATTGAGAT  533
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  471   GGTTCTTGGAATGGAGTTTGATCCTTTACCTCCTGGTGCATTTGGCATGCCTATTGAGAT  530

Query  534   GCCAAGCCATCGAAAGGCGACTAGGCAAGCGTTT-GAGACCAACATATATGTTCGATCCG  592
             |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  531   GCCAAGCCATCGCAAGGCGACTAGGCAAGC-TTTCGAGACCAACATATATGTCCGATCCG  589

Query  593   ATGTAAAGCCTATCAAAGATCATGTGAGGCCCATTCGTGAATATCAGTTCATTCCTGAGC  652
             |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590   ATGTCAAGCCTATCAAAGATCATGTGAGGCCTATTCGTGAATATCAGTTCATTCCTGAGC  649

Query  653   TGCCATCTTCAAGGACTGATCATTCCGAAAGAGTTTCTCCGTCTCATCATTTTGGAGTTC  712
             |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  650   TGCCATCTTCGAGGACTGATCATTCGGAACGAGTTTCTCCGTCACATCATTTTGGAGTTC  709

Query  713   CACTTGATGGTTCGGTTATGAGGGCTTCAGCTGTGTCTGCTGGACATCGGGATGACTATA  772
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710   CACTTGATGGTTCGGTTATGAGGGTTTCAGCTGTGTCTGCTGGACATCGGGATGACTATA  769

Query  773   AAATTTCACCTCAGATACCAAATTTGAATCTTGCAACTCATCAAGGGAAGCCGGGGCATG  832
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770   AAATTTCACCTCAGATACCAAATTTGAATCTTGCAACTCATCAAGGGAAGCCGGGGCATG  829

Query  833   TCTACTCGCCTAACTTGGCCGAATATGACTCATCGTATCAGAAAAGCTACGTGGATACTG  892
             |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  830   TCTATTCGCCTAACTTGGTCGAATATGACTCACCGTATCAGAAAAGCTACATGGATACTG  889

Query  893   CTGCACATGTTCATGAGGATCCTTTTGTGAAACCTGAGAGAGACTTTGGTAATGAGGATG  952
             ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||
Sbjct  890   CTGCACAAGTTCATGATGATCCTTTTGTGAAATCAGAGAGAGAAGTTGGTAATGAGGATG  949

Query  953   AGGATGATGATGCCCTGCAATTAGAGAGACAACGCAAGAATGAAGAAGCAAGAATAGCTC  1012
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950   AGGATGATGATGCCCTGCAATTAGAGAGACACCGCAAGAATGAAGAAGCAAGAATAGCTC  1009

Query  1013  GGGAAGTTGAGGCTCACGAGAAGAGGATCCGAAGAGAACTAGAGAAACAAGATATGCTGA  1072
             ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1010  GGGAAGTCGAGGCTCATGAGAAGAGGATCCGAAGGGAACTAGAGAAACAAGATATGCTGA  1069

Query  1073  GGCGAAAGAGAGAGGAGCAAATAAGGAAAGAAATGGAGAGGCAAGATCGTGAAAGACGGA  1132
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1070  GGCGAAAGAGAGAAGAGCAAATAAGGAAAGAAATGGAGAGGCAAGATCGTGAAAGACGGA  1129

Query  1133  AAGAGGAAGAACGTCTTTTACGTGAAaagcagagagaggaagagaggtacctgaaagagc  1192
             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  1130  AAGAGGAAGAACGTCTTTTACGTGAAAAACAGAGAGAGGAAGAGAGGTACCTTAAAGAGC  1189

Query  1193  agatgcgagagttgcagcgaagagagaagTTCTTgaagaaagaaacaatcagggctgaga  1252
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1190  AGATGCGAGAGTTGCAGCGAAGAGAGAAGTTCTTGAAGAAAGAAACAATCAGGGCTGAGA  1249

Query  1253  aaatgcgtcaaaaagaagagatgcgtaaagaaaaagaGGTTGCAAGGCTTAAAGCTGCTA  1312
             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  1250  AAATGCGACAAAAAGAAGAGATGCGTAAAGAAAAAGAGGTTGCCAGGCTTAAAGCTGCTA  1309

Query  1313  ACGAGAGGGCCATTGCTCGTAAGATCGCAAAGGAATCTATGGAACTTATTGAAGATGAAC  1372
             | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1310  ATGAGAGGGCCATTGCTCGTAAGATCGCAAAGGAATCTATGGAACTTATTGAAGATGAAC  1369

Query  1373  GCTTAGAACTCATGGAGGTTGCTGCGTTAACCAAAGGATTGCCTTCAATGCTCGCTCTTG  1432
             ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1370  GCTTAGAGCTCATGGAGGTTGCTGCGTTAACAAAAGGCTTGCCTTCAATGCTCGCCCTTG  1429

Query  1433  ACTTTGAAACTCTTCAGAACCTCGATGAATATAGAGACAAGCAGGTGTTATTTCCCCCAA  1492
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||
Sbjct  1430  ACTTTGAAACTCTACAGAACCTCGATGAATATAGAGACAAGCAGGCAATATTTCCCCCAA  1489

Query  1493  CATCTGTAAGATTGAAAAAGCCCTTTGCAGTCAAGCCATGGAATGGTTCTGATGAGAATG  1552
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  1490  CATCTGTAAAATTGAAAAAGCCCTTTGCAGTCAAGCCGTGGAATGGTTCTGATGAGAATG  1549

Query  1553  TTGCAAATCTTCTAATGGTGTGGAGATTCTTAATCACTTTTGCGGACGTTCTTGGTCTTT  1612
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct  1550  TTGCAAATCTTCTTATGGTGTGGAGATTCTTAATCACTTTCGCAGACGTTCTTGGTCTTT  1609

Query  1613  GGCCATTTACCCTAGACGAGTTTG-TGCAGGCATTCCATGACTATGACCCACGACTAATG  1671
             ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1610  GGCCATTTACCCTGGACGAGTTTGCT-CAGGCATTCCATGACTATGACCCACGGCTAATG  1668

Query  1672  GGAGAGATACACATTGTTCTTTTGAAGACTATAATCAAAGATATCGAGGGTGTTGCAAGA  1731
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct  1669  GGAGAGATACACATTGTTCTATTGAAGACTATAATCAAAGATATCGAGGGTGTGGTAAGA  1728

Query  1732  ACGCTATTGACCGGTGTTGGAGCAAACCAGAATACTGCTTCTAATCCCGGAGGGGGTCAT  1791
             ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  1729  ACGCTGTCGACCGGTGTTGGAGCAAACCAGAATGTTGCTGCTAATCCCGGAGGGGGTCAT  1788

Query  1792  CCTCATGTTGTGGAGGGTGCATATGCATGGGGTTTTGATATACGCAGCTGGAGACGAAAC  1851
             ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||
Sbjct  1789  CCTCACGTTGTGGAGGGTGCATACGCGTGGGGTTTTGATATACGCAGCTGGAGAAAAAAC  1848

Query  1852  TTGAATGTTTTTACATGGCCTGAAATCTTGAGGCAACTCGCTCTCTCTGCAGGATTGGGA  1911
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct  1849  TTGAATGTTTTTACATGGCCTGAAATCTTGAGGCAACTCGCTCTCTCTGCCGGGTTGGGA  1908

Query  1912  CCGCAACTGAAGAAAATGAACATTAAGACTGTGTCTGTTCATGATGACAATGAGGCCAAT  1971
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  1909  CCGCAACTGAAGAAAATGAACATTAGGACTGTGTCTGTTCATGATGACAATGAGGCCAAC  1968

Query  1972  AACTCTGAGAATGTGATTGTCAACCTAAGGAAAGGAGTAGCAGCTGAGAATGCTTTTGCC  2031
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1969  AACTCTGAGAATGTGATTTTCAACCTAAGGAAAGGAGTAGCAGCTGAGAATGCTTTTGCC  2028

Query  2032  AAGATGCAAGAAAGGGGACTTTCTAATCCGCGACGTTCACGGCATCGTTTGACTCCAGGC  2091
             ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2029  AAGATGCAAGAGAGGGGACTTTCTAATCCACGACGTTCACGGCATCGTTTGACTCCAGGC  2088

Query  2092  ACTGTTAAGTTTGCTGCATTTCATGTTCTATCTCTTGAGGGTGAAAAAGGTTTGACCATT  2151
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct  2089  ACTGTTAAGTTTGCTGCATTTCATGTTCTATCTCTTGAAGGTGAAAAAGGTTTGAACATT  2148

Query  2152  CTTGACGTTGCAGAGAAGATTCAGAAATCAGGATTGAGGGATCTAACGACGAGTAGGACA  2211
             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2149  CTTGAGGTTGCAGAGAAGATTCAGAAATCAGGATTGAGGGATCTAACGACGAGTAGGACA  2208

Query  2212  CCTGAAGCCTCTGTTGCTGCTGCGTTGTCTCGGGATACAAAACTCTTTGAGAGGGTAGCT  2271
             ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2209  CCTGAAGCCTCGGTTGCTGCTGCGTTGTCTCGAGATACAAAACTCTTTGAGAGGGTAGCT  2268

Query  2272  CCTTCTACGTACTGTGTGCGTGCTTCCTATAGAAAAGATGCAGGTGATGCTGAGACTATA  2331
             ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2269  CCTTCTACGTATTGTGTACGTGCTTCCTATAGAAAAGATGCAGGTGATGCTGAGACTATA  2328

Query  2332  TTTGCTGAAGCAAGAGAGAGAATACGGGCATTCAAGAGTGGGGTCACTGATGTAGAAGAT  2391
             ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||
Sbjct  2329  TTTGCTGAAGCGAGAGAGAGAATACGTGCATTCAAGAGCGGCATCACTGATGTAGAAGAT  2388

Query  2392  GTTGATGACGTTGAGAGAGATGAAGACTCCGAAAGCGATGTCGGAGATGACCCAGAAGTT  2451
             |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct  2389  GTTGATGACGCTGAGAGAGATGAAGACTCTGAAAGCGATGTCGGAGAAGACCCAGAGGTT  2448

Query  2452  GATTTGAACCTTAAAAAGGAAGATCCCAATGCTCTGAAGATAGAAAACCTAATCGGAGTC  2511
             ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||
Sbjct  2449  GATGTGAACCTTAAAAAGGAAGATCCCAATCCTCTGAAGGTAGAAAACTTAATTGGAGTC  2508

Query  2512  GAACCAGTGTTGGAAAATGGGAAACTGGATACCGTGCCCATGAAAACTGAACTGGGACTG  2571
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2509  GAACCATTGTTGGAAAATGGGAAACTGGATACCGTGCCCATGAAAACTGAACTGGGACTG  2568

Query  2572  CCTCTTACTCCCTCTCTCCCCGAGGATATGAAAGATGAGAAAAGAGATGACATTTTAGTG  2631
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct  2569  CCTCTTACTCCCTCTCTCCCCGAGGAAATGAAAGATGAGAAAAGAGATGACACTTTAGCG  2628

Query  2632  GAACAATCTCTAGAAGATGCAGTAGCAAACGGTGAGGATAGTGCTTGTTTTGACGAGAGC  2691
             || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2629  GACCAATCTCTAGAGGATGCGGTAGCAAACGGTGAAGATAGTGCTTGTTTTGACGAGAGC  2688

Query  2692  AAACTTGGGGAACAGTGGGTTCAAGGACTTGTGGAAGGAGATTACTCGAATCTCAGCAGC  2751
             |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  2689  AAACTTGGGGAACAGTGGGTTCAAGGACTTGTAGAAGGAGATTACTCGAATCTTAGCAGC  2748

Query  2752  GAGGAACGTTTAAACGCACTTGTTGCTCTGATTGGTATTGCCATCGAAGGAAACACAATC  2811
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  2749  GAGGAACGTTTAAACGCACTTGTTGCTCTGATTGGTATTGCCACCGAAGGAAACACAATC  2808

Query  2812  CGAATCGCCCTTGAGGAACGGTTGGAAGTTGCAAGTGCCTTAAAGAAACAGATGTGGGGT  2871
             |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  2809  CGAATCGCCCTTGAGGAACGGTTGGAGGTAGCAAGTGCATTAAAGAAACAGATGTGGGGT  2868

Query  2872  GAAGTGCAACTCGACAAACGCTGGAAAGAAGAGTCTTTGATTCGAGCAAATTACCTTTCA  2931
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  2869  GAAGTGCAACTCGACAAACGCTGGAAAGAAGAGTCTTTGATTCGAGCAAATTACCTCTCA  2928

Query  2932  TACCCAACAGCAAAGCCGGGGCTTAATATCGCAACTCCTGCATCTGGAAATCAAGAAAGT  2991
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2929  TACCCAACAGCAAAGCCGGGGCTTAATATCGCAACCCCTGCATCTGGAAATCAAGAAAGT  2988

Query  2992  TAC-TCAGCAGATGTGACTCCAATCTCCTCACAGGACCCGTTGAGTCTTCCACAGATCGA  3050
             | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  2989  T-CATCAGCGGATGTGACTCCAATCTCCTCACAGGACCCGGTGAGTCTTCCACAGATCGA  3047

Query  3051  TGTAAATAACGTGATCGCAGGACCAAGCTTGCAATTGCAAGAAAATGTACCTGGAATGGA  3110
             ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  3048  TGTGAATAACGTGATTGCTGGACCAAGCTTGCAATTGCAAGAAAATGTACCTGGAGTGGA  3107

Query  3111  GAATTTGCAGTATCAGCAGCAACAGGGCTACACAGCGGACCGGGAAAGGCTGCGTGCACA  3170
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3108  GAATTTGCAGTATCAGCAGCAACAGGGGTACACAGCGGACCGGGAAAGGCTGCGTGCACA  3167

Query  3171  GTTAAAAGCGTATATTGGGTATAAAGCTGAAGAGCTATATGTATATAGGTCGCTTCCGCT  3230
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3168  GTTAAAAGCGTATGTTGGGTATAAAGCTGAAGAGCTATATGTATATAGGTCGCTTCCGCT  3227

Query  3231  TGGTCAAGATCGAAGACGCAATCGCTATTGGCGGTTTTCAGCATCCGCCTCTCGAAATGA  3290
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3228  AGGTCAAGATCGAAGACGCAATCGCTATTGGCGGTTTTCAGCATCCGCCTCTCGAAATGA  3287

Query  3291  TCCTGGTTGTGGTAGAATATTCGTGGAACTTCAGGACGGACGATGGAGGCTCATTGATTC  3350
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  3288  TCCTGGTTGTGGTAGAATATTCGTGGAACTTCAGGACGGACGCTGGAGGCTCATTGATTC  3347

Query  3351  CGAAGAGGGTTTTGATTATTTGGTGAAGTCACTAGATGTTCGCGGTGTAAGAGAATCACA  3410
             |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3348  CGAAGAGGCTTTTGACTATTTGGTGAAGTCACTAGATGTTCGCGGTGTAAGAGAATCACA  3407

Query  3411  TTTACACTTTATGTTACTGAAGATTGAAGCATCTTTCAAGGAAGCAGTGAGGAGGAGTGT  3470
             ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||
Sbjct  3408  TTTACACTTTATGTTGCTGAAGATCGAAGCATCCTTCAAGGAAGCATTAAGGAGGAATGT  3467

Query  3471  GGAAGCAAATCCCGGGTTGTGTTCCATATCTTCTAGCATGGATTCTGATACTGGCG-AGA  3529
             || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |
Sbjct  3468  GGCAGCAAATCCCGGGGTGTGTTCCATATCTTCTAGCTTGGATTCCGATACTG-CGGAAA  3526

Query  3530  TCTCCACGACGTTTAAGATCGAGCTAGGGGATAGTAACGCCATTGAGAGATGCAGCGTAT  3589
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  3527  TCTCCACGACGTTTAAGATCGAGCTAGGGGATAGTAACGCCGTTGAGAGATGCAGCGTAT  3586

Query  3590  TGCAACGGTTCCATAGTTTTGAGAAATGGATGTGGGATAATATGCTGCATCCGGGTGCGT  3649
             ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |
Sbjct  3587  TGCAACGCTTCCATAGTTTCGAGAAGTGGATGTGGGATAATATGCTGCATCCTAGTGCTT  3646

Query  3650  TATCCGCATATAAGTATGGTGCTAAGCAAAGCAGTCCGCTTTTTCGCATATGCAGAATCT  3709
             |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3647  TATCTGCATTTAAGTATGGTGCTAAGCAAAGCAGTCCGCTTTTTCGCATATGCAGAATCT  3706

Query  3710  GTGCGGGACTACACTTTGTCGGAGATATTTGCTGTCCTAGTTGCGGTCAGATGCATGCTG  3769
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3707  GTGCGGAACTACACTTTGTCGGAGATATTTGCTGTCCTAGTTGCGGTCAGATGCATGCTG  3766

Query  3770  GTCCGGATATTGGTGAGTTGTGTTTTGCTGAGCAAGTGGCTCAACTTGGGGATATTTTGA  3829
             |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct  3767  GTCCAGATGTTGGTGAGTTGTGTTTTGCTGAGCAAGTGGCTCAACTCGGGGATAATTTGA  3826

Query  3830  GAGGAGGAGATATTGGCTTTATCTTGCGTAGCTCAATCTCGTCTCCTCTTAGAATAAGAC  3889
             || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3827  GAAGAGGAGATACTGGCTTTATCTTGCGTAGCTCAATCTTGTCTCCTCTTAGAATAAGAC  3886

Query  3890  TACTCAAGGTTCAATTAGCGCTTGTCGAAGCTTCTCTTCCACCTGAAGGACTTGAAGCTT  3949
             ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3887  TACTCAAGGTTCAGTTAGCACTTGTCGAAGCTTCTCTTCCACCTGAAGGACTTGAAGCTT  3946

Query  3950  TTTGGACAGAGAATCTTAGGAAATCTTGGGGTATGAAGCTGATGTCATCAAGTTCCCCCG  4009
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |
Sbjct  3947  TTTGGACAGAGAATCTTAGGAAATCTTGGGGTATGAAGCTGTTGTCATCAAGTTCCCATG  4006

Query  4010  AAGAACTTAATCAGGTTCTCACAACGTTAGAGGCTGCACTAAAGAGAGATTTCTTGTCTT  4069
             |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct  4007  AAGATCTTTATCAGGTTCTCACAACGTTAGAGGCAGCACTAAAGAGGGATTTCTTGTCTT  4066

Query  4070  CAAACTTTGAAACAACTTCTGAACTCTTGGGTTTACAAGTAGAAGCTCTCGCCAACGAT-  4128
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| 
Sbjct  4067  CAAACTTTGAAACAACTTCTGAACTCTTGGGTTTACAAGAAGGAGCTCTCGCCAGCGATC  4126

Query  4129  TTCACTTGTGGAGTTAATGTACTACCGTGGATACCGAAGACAACAGGAGGTGTAGCTTTG  4188
             || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct  4127  TT-ACTTGTGGGGTTAATGTACTACCGTGGATACCAAAGACAGCAGGAGGTGTAGCTTTG  4185

Query  4189  AGGCTCTTTGAATTCGACAGCTCGATTGTTTACACAACCGATCAAAACAAAGATCCTCTA  4248
             || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct  4186  AGACTCTTTGATTTCGACAGCTCGATTGTTTACACACCCGATCAAAACAACGATCCTCTA  4245

Query  4249  AAAGACAAAGAATCTGAAGATTTCGTCGGTTTGGAGACAAATTTTGTGAGAAACGTT-CA  4307
             |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||
Sbjct  4246  AAAGACAAAGAATCTGAAGATTTCGTGGGTTTGGAGACAAATATTCTGAGAAAC-TTACA  4304

Query  4308  AGAAAAGGACGTAATGGAGACTCTGGTGCAAGTTGCT--T-ACACGCAAGAAGAGAACTG  4364
              || |||||||||||||| |||| |||||||||||||  | | | |||||||||||||||
Sbjct  4305  TGAGAAGGACGTAATGGAAACTCCGGTGCAAGTTGCTGCTTATAAGCAAGAAGAGAACTG  4364

Query  4365  GACGGATCCTGGTTTAGGTGGTGTGTCTAGCTCTGGGCGAGGAGGTCGACCACCACGAGG  4424
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  4365  GACGGATCCTGGTTTAGGTGGTGTGTCTAGCTCTGGGAGAGGAGGTCGACCACCACGAGG  4424

Query  4425  ACGTGGCCGACCTCGTTCCCGTGGCAACGGCAAGAAACCGGCAGTTTCTGGTAGACCACC  4484
             ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct  4425  ACGTGGCCGGCCTCGTGCCCGTGGCAATGGCAAGAAACCGGCAGTTTCTGTTAAACCACC  4484

Query  4485  ACGAGGTGCAGCAAACTCAAATGGCGAAACCATGTTGAGACCAAGAGCACAACCACGTGG  4544
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct  4485  ACGAGGTGCAGCAAACTCAAATGGTGAAACCATGTTGAGACCGAGAGCACAACCACGTGG  4544

Query  4545  GGGTAGAAAGAACGGGCGGCGTA-TCGGCACCAAAGGCCGGAAGAGACCAACGAAAGGAA  4603
             |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct  4545  GGGTAGAAAGAATGGGCGGCGTAGT-GGCACCAAAGGCCGAAAGAGACCAACGCAAGGAA  4603

Query  4604  CACTAGGTATATCTAATGAAGTAGGAGGA--A-GTCGGGCAAAGGAAGTTGCTGTAACCG  4660
             |||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||
Sbjct  4604  CACTCGGTATATGTAATGAAGTAGGAGGAGGACGTCGGGTTAAGGAAGTTGCTGTAACCG  4663

Query  4661  CCAAAACTAGTCTTCCTGATAACGACGACGATTGGATCGATACCCCTGAACTGCAAGACG  4720
             ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  4664  CCAAAACCAGTCTTCCTGATAACGATGACGATTGGATCGAAACCCCTGAACTGCAAGACG  4723

Query  4721  ATGACGGAGAAGCTAGCAGCTCAGGGAGATCGTTTCAGTATGAAGACTATGATGATGATG  4780
             |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4724  ATGACGGAGAAGCTAGCAGCTCGGGGAGATCGTTTCAGTATGAGGACTATGATGATGATG  4783

Query  4781  -T--CATGGCTCCGATTGATGATTTTGATGGCGGCGGTGAATCAAGTAAATTAGTAGGTA  4837
              |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct  4784  ATGTCATGGCTCCGATTGATGATTTTGATGGCGGCGGCGAATCAAGTAAATTAGTAGGTA  4843

Query  4838  GGGGTGAATTTAGCTTACATAGTGATGATGAATACgaagaagaaga--a-gaagaagaag  4894
             |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||
Sbjct  4844  GGGGGGAATTTAGCTTACATAGTGATGATGAATACGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAG  4903

Query  4895  acatgaacatgaaaatgaatgtgaatgttgttgatgatgaagatgaagatTACATAAACG  4954
             ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  4904  ACATGAACATGAAAATGGATGTGAATGTTGTTGATGATGAGGATGAAGATTACATAAACG  4963

Query  4955  ATGACTCATATGGTAGAGAGCAGCC-GG--T--G-ATTAGCA-C--T-C-G-GA-----A  4997
             | ||||| ||||||||| ||||||  ||  |  | ||||||| |  | | | ||     |
Sbjct  4964  AAGACTCGTATGGTAGAAAGCAGCATGGGATTAGCATTAGCAACGATGCAGCGACTCGGA  5023

Query  4998  AA-GGTTTAA---GTTTGAAGATCCTGATCTAACATCTTCATCGTCTTCTGATTTTCAGT  5053
             || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct  5024  AAAGGTTTAATAAGTTTGAAGATCCTGATCTAACATCTTCATCGTCTTCTGATTTTCAAT  5083

Query  5054  GATTGATTTTAGACA-GAAACTACGAAGCtttttttttgtattcttcaaaatgaatgaat  5112
             || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   |
Sbjct  5084  GACTGATTTTAGACAAGAACCTACGAAGCTTGTTTTT-GTATTCTTCAAAATGAAT---T  5139

Query  5113  ttttttagtttaact---ttttt-tAAGTTAACGTCAATGTAATCCTTTTGTCTCTTATG  5168
              |||| ||| ||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5140  CTTTT-AGTGTAACAACCTTTTTGTAAGGTAACGTCAATGTAATCCTTTTGTCTCTTATG  5198

Query  5169  AGC  5171
             |||
Sbjct  5199  AGC  5201



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 258159088678


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5