BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494576
Length=5173
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G44180.1 | Symbols: | Homeodomain-like transcriptional regu... 7899 0.0
> AT5G44180.1 | Symbols: | Homeodomain-like transcriptional regulator
| chr5:17783172-17790011 FORWARD LENGTH=5224
Length=5224
Score = 7899 bits (4277), Expect = 0.0
Identities = 4920/5223 (94%), Gaps = 74/5223 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAAGGTGGGTCTGAGAAAACAACACCTGAA------GGTGGTGAGAGTAAGTCTAAA 54
||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAGGTGGGTCTGAAAAAACAACACCTGAAGGTTGTGGTGGTGAGAGTAAGTCTAAA 60
Query 55 CGGAAAATGAAAACTGCTGCTCAACTTGAAGTTCTTGAAAACACTTATGCAGCTGAGCCT 114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 61 CGGAAAATGAAAACTGCTGCTCAACTTGAAGTTCTTGAAAACACTTATTCAGCTGAGCCT 120
Query 115 TATCCTTCGGAAGCTATAAGAGCGGATCTTTCAGTGAAACTGAATCTTTCCGACAGGCAG 174
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 121 TATCCTTCGGAAGCTATAAGAGCGGATCTCTCAGTGAAACTGAATCTTTCCGATAGACAG 180
Query 175 TTACAGATGTGGTTTTGTCACCGGCGGCTTAAAGACCGGAAATCTACTACGCCGAGTAAA 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 181 TTACAGATGTGGTTTTGTCACCGGCGGCTTAAAGAACGGAAATCTACTACGCCGAGCAAA 240
Query 235 CGTCAGCGTAAGGAGTTGGTAACACCTACGGC-AGTTGAATCCTCGAAACCAGCCGTCAA 293
||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||||||| | ||||| |||||||
Sbjct 241 CGTCAGCGTAAGGAGTTAGTAACTCCAACGGCTA-TGGAATCCTGGGAACCACCCGTCAA 299
Query 294 TGCTGGTGATTTGGTGGCGGGAAATGAGCTTGATTCTAGAAGAGCTGCTCGAGGAGGCgg 353
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 300 TGCCGGTGATTTAGTGGCGGGAAATGAGCTTGATTCTAGAAGAGCTGCTC---GAGGC-- 354
Query 354 tggtagtggtggtggtggtgtgACTGTTGTTAGGCGGTTTAATGAACCGTCTTCTGCTGA 413
||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 ----AGTGGCGGTAGTGGTGTGACGGTTGTGAGGCGGTTTAATGAACCGTCTTCTGCTGA 410
Query 414 GGTTAGAGCTATTGGTTATGTGGAAGCTCAATTGGGAGAGCGTTTGAGAGATAACGGACC 473
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 411 GGTTAGAGCTATTGGTTATGTTGAAGCTCAATTGGGAGAGCGGTTGAGAGATAACGGACC 470
Query 474 GATTCTTGGAATGGAGTTTGATCCTTTACCTCCTGGTGCATTTGGGATGCCTATTGAGAT 533
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 471 GGTTCTTGGAATGGAGTTTGATCCTTTACCTCCTGGTGCATTTGGCATGCCTATTGAGAT 530
Query 534 GCCAAGCCATCGAAAGGCGACTAGGCAAGCGTTT-GAGACCAACATATATGTTCGATCCG 592
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 531 GCCAAGCCATCGCAAGGCGACTAGGCAAGC-TTTCGAGACCAACATATATGTCCGATCCG 589
Query 593 ATGTAAAGCCTATCAAAGATCATGTGAGGCCCATTCGTGAATATCAGTTCATTCCTGAGC 652
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 ATGTCAAGCCTATCAAAGATCATGTGAGGCCTATTCGTGAATATCAGTTCATTCCTGAGC 649
Query 653 TGCCATCTTCAAGGACTGATCATTCCGAAAGAGTTTCTCCGTCTCATCATTTTGGAGTTC 712
|||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 650 TGCCATCTTCGAGGACTGATCATTCGGAACGAGTTTCTCCGTCACATCATTTTGGAGTTC 709
Query 713 CACTTGATGGTTCGGTTATGAGGGCTTCAGCTGTGTCTGCTGGACATCGGGATGACTATA 772
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 CACTTGATGGTTCGGTTATGAGGGTTTCAGCTGTGTCTGCTGGACATCGGGATGACTATA 769
Query 773 AAATTTCACCTCAGATACCAAATTTGAATCTTGCAACTCATCAAGGGAAGCCGGGGCATG 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 AAATTTCACCTCAGATACCAAATTTGAATCTTGCAACTCATCAAGGGAAGCCGGGGCATG 829
Query 833 TCTACTCGCCTAACTTGGCCGAATATGACTCATCGTATCAGAAAAGCTACGTGGATACTG 892
|||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 830 TCTATTCGCCTAACTTGGTCGAATATGACTCACCGTATCAGAAAAGCTACATGGATACTG 889
Query 893 CTGCACATGTTCATGAGGATCCTTTTGTGAAACCTGAGAGAGACTTTGGTAATGAGGATG 952
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 890 CTGCACAAGTTCATGATGATCCTTTTGTGAAATCAGAGAGAGAAGTTGGTAATGAGGATG 949
Query 953 AGGATGATGATGCCCTGCAATTAGAGAGACAACGCAAGAATGAAGAAGCAAGAATAGCTC 1012
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 950 AGGATGATGATGCCCTGCAATTAGAGAGACACCGCAAGAATGAAGAAGCAAGAATAGCTC 1009
Query 1013 GGGAAGTTGAGGCTCACGAGAAGAGGATCCGAAGAGAACTAGAGAAACAAGATATGCTGA 1072
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010 GGGAAGTCGAGGCTCATGAGAAGAGGATCCGAAGGGAACTAGAGAAACAAGATATGCTGA 1069
Query 1073 GGCGAAAGAGAGAGGAGCAAATAAGGAAAGAAATGGAGAGGCAAGATCGTGAAAGACGGA 1132
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1070 GGCGAAAGAGAGAAGAGCAAATAAGGAAAGAAATGGAGAGGCAAGATCGTGAAAGACGGA 1129
Query 1133 AAGAGGAAGAACGTCTTTTACGTGAAaagcagagagaggaagagaggtacctgaaagagc 1192
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1130 AAGAGGAAGAACGTCTTTTACGTGAAAAACAGAGAGAGGAAGAGAGGTACCTTAAAGAGC 1189
Query 1193 agatgcgagagttgcagcgaagagagaagTTCTTgaagaaagaaacaatcagggctgaga 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 AGATGCGAGAGTTGCAGCGAAGAGAGAAGTTCTTGAAGAAAGAAACAATCAGGGCTGAGA 1249
Query 1253 aaatgcgtcaaaaagaagagatgcgtaaagaaaaagaGGTTGCAAGGCTTAAAGCTGCTA 1312
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1250 AAATGCGACAAAAAGAAGAGATGCGTAAAGAAAAAGAGGTTGCCAGGCTTAAAGCTGCTA 1309
Query 1313 ACGAGAGGGCCATTGCTCGTAAGATCGCAAAGGAATCTATGGAACTTATTGAAGATGAAC 1372
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310 ATGAGAGGGCCATTGCTCGTAAGATCGCAAAGGAATCTATGGAACTTATTGAAGATGAAC 1369
Query 1373 GCTTAGAACTCATGGAGGTTGCTGCGTTAACCAAAGGATTGCCTTCAATGCTCGCTCTTG 1432
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1370 GCTTAGAGCTCATGGAGGTTGCTGCGTTAACAAAAGGCTTGCCTTCAATGCTCGCCCTTG 1429
Query 1433 ACTTTGAAACTCTTCAGAACCTCGATGAATATAGAGACAAGCAGGTGTTATTTCCCCCAA 1492
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1430 ACTTTGAAACTCTACAGAACCTCGATGAATATAGAGACAAGCAGGCAATATTTCCCCCAA 1489
Query 1493 CATCTGTAAGATTGAAAAAGCCCTTTGCAGTCAAGCCATGGAATGGTTCTGATGAGAATG 1552
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 CATCTGTAAAATTGAAAAAGCCCTTTGCAGTCAAGCCGTGGAATGGTTCTGATGAGAATG 1549
Query 1553 TTGCAAATCTTCTAATGGTGTGGAGATTCTTAATCACTTTTGCGGACGTTCTTGGTCTTT 1612
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 1550 TTGCAAATCTTCTTATGGTGTGGAGATTCTTAATCACTTTCGCAGACGTTCTTGGTCTTT 1609
Query 1613 GGCCATTTACCCTAGACGAGTTTG-TGCAGGCATTCCATGACTATGACCCACGACTAATG 1671
||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1610 GGCCATTTACCCTGGACGAGTTTGCT-CAGGCATTCCATGACTATGACCCACGGCTAATG 1668
Query 1672 GGAGAGATACACATTGTTCTTTTGAAGACTATAATCAAAGATATCGAGGGTGTTGCAAGA 1731
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 1669 GGAGAGATACACATTGTTCTATTGAAGACTATAATCAAAGATATCGAGGGTGTGGTAAGA 1728
Query 1732 ACGCTATTGACCGGTGTTGGAGCAAACCAGAATACTGCTTCTAATCCCGGAGGGGGTCAT 1791
||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 ACGCTGTCGACCGGTGTTGGAGCAAACCAGAATGTTGCTGCTAATCCCGGAGGGGGTCAT 1788
Query 1792 CCTCATGTTGTGGAGGGTGCATATGCATGGGGTTTTGATATACGCAGCTGGAGACGAAAC 1851
||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1789 CCTCACGTTGTGGAGGGTGCATACGCGTGGGGTTTTGATATACGCAGCTGGAGAAAAAAC 1848
Query 1852 TTGAATGTTTTTACATGGCCTGAAATCTTGAGGCAACTCGCTCTCTCTGCAGGATTGGGA 1911
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 1849 TTGAATGTTTTTACATGGCCTGAAATCTTGAGGCAACTCGCTCTCTCTGCCGGGTTGGGA 1908
Query 1912 CCGCAACTGAAGAAAATGAACATTAAGACTGTGTCTGTTCATGATGACAATGAGGCCAAT 1971
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 CCGCAACTGAAGAAAATGAACATTAGGACTGTGTCTGTTCATGATGACAATGAGGCCAAC 1968
Query 1972 AACTCTGAGAATGTGATTGTCAACCTAAGGAAAGGAGTAGCAGCTGAGAATGCTTTTGCC 2031
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 AACTCTGAGAATGTGATTTTCAACCTAAGGAAAGGAGTAGCAGCTGAGAATGCTTTTGCC 2028
Query 2032 AAGATGCAAGAAAGGGGACTTTCTAATCCGCGACGTTCACGGCATCGTTTGACTCCAGGC 2091
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029 AAGATGCAAGAGAGGGGACTTTCTAATCCACGACGTTCACGGCATCGTTTGACTCCAGGC 2088
Query 2092 ACTGTTAAGTTTGCTGCATTTCATGTTCTATCTCTTGAGGGTGAAAAAGGTTTGACCATT 2151
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||
Sbjct 2089 ACTGTTAAGTTTGCTGCATTTCATGTTCTATCTCTTGAAGGTGAAAAAGGTTTGAACATT 2148
Query 2152 CTTGACGTTGCAGAGAAGATTCAGAAATCAGGATTGAGGGATCTAACGACGAGTAGGACA 2211
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2149 CTTGAGGTTGCAGAGAAGATTCAGAAATCAGGATTGAGGGATCTAACGACGAGTAGGACA 2208
Query 2212 CCTGAAGCCTCTGTTGCTGCTGCGTTGTCTCGGGATACAAAACTCTTTGAGAGGGTAGCT 2271
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 CCTGAAGCCTCGGTTGCTGCTGCGTTGTCTCGAGATACAAAACTCTTTGAGAGGGTAGCT 2268
Query 2272 CCTTCTACGTACTGTGTGCGTGCTTCCTATAGAAAAGATGCAGGTGATGCTGAGACTATA 2331
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 CCTTCTACGTATTGTGTACGTGCTTCCTATAGAAAAGATGCAGGTGATGCTGAGACTATA 2328
Query 2332 TTTGCTGAAGCAAGAGAGAGAATACGGGCATTCAAGAGTGGGGTCACTGATGTAGAAGAT 2391
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2329 TTTGCTGAAGCGAGAGAGAGAATACGTGCATTCAAGAGCGGCATCACTGATGTAGAAGAT 2388
Query 2392 GTTGATGACGTTGAGAGAGATGAAGACTCCGAAAGCGATGTCGGAGATGACCCAGAAGTT 2451
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2389 GTTGATGACGCTGAGAGAGATGAAGACTCTGAAAGCGATGTCGGAGAAGACCCAGAGGTT 2448
Query 2452 GATTTGAACCTTAAAAAGGAAGATCCCAATGCTCTGAAGATAGAAAACCTAATCGGAGTC 2511
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||
Sbjct 2449 GATGTGAACCTTAAAAAGGAAGATCCCAATCCTCTGAAGGTAGAAAACTTAATTGGAGTC 2508
Query 2512 GAACCAGTGTTGGAAAATGGGAAACTGGATACCGTGCCCATGAAAACTGAACTGGGACTG 2571
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2509 GAACCATTGTTGGAAAATGGGAAACTGGATACCGTGCCCATGAAAACTGAACTGGGACTG 2568
Query 2572 CCTCTTACTCCCTCTCTCCCCGAGGATATGAAAGATGAGAAAAGAGATGACATTTTAGTG 2631
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 2569 CCTCTTACTCCCTCTCTCCCCGAGGAAATGAAAGATGAGAAAAGAGATGACACTTTAGCG 2628
Query 2632 GAACAATCTCTAGAAGATGCAGTAGCAAACGGTGAGGATAGTGCTTGTTTTGACGAGAGC 2691
|| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2629 GACCAATCTCTAGAGGATGCGGTAGCAAACGGTGAAGATAGTGCTTGTTTTGACGAGAGC 2688
Query 2692 AAACTTGGGGAACAGTGGGTTCAAGGACTTGTGGAAGGAGATTACTCGAATCTCAGCAGC 2751
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2689 AAACTTGGGGAACAGTGGGTTCAAGGACTTGTAGAAGGAGATTACTCGAATCTTAGCAGC 2748
Query 2752 GAGGAACGTTTAAACGCACTTGTTGCTCTGATTGGTATTGCCATCGAAGGAAACACAATC 2811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2749 GAGGAACGTTTAAACGCACTTGTTGCTCTGATTGGTATTGCCACCGAAGGAAACACAATC 2808
Query 2812 CGAATCGCCCTTGAGGAACGGTTGGAAGTTGCAAGTGCCTTAAAGAAACAGATGTGGGGT 2871
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2809 CGAATCGCCCTTGAGGAACGGTTGGAGGTAGCAAGTGCATTAAAGAAACAGATGTGGGGT 2868
Query 2872 GAAGTGCAACTCGACAAACGCTGGAAAGAAGAGTCTTTGATTCGAGCAAATTACCTTTCA 2931
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2869 GAAGTGCAACTCGACAAACGCTGGAAAGAAGAGTCTTTGATTCGAGCAAATTACCTCTCA 2928
Query 2932 TACCCAACAGCAAAGCCGGGGCTTAATATCGCAACTCCTGCATCTGGAAATCAAGAAAGT 2991
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929 TACCCAACAGCAAAGCCGGGGCTTAATATCGCAACCCCTGCATCTGGAAATCAAGAAAGT 2988
Query 2992 TAC-TCAGCAGATGTGACTCCAATCTCCTCACAGGACCCGTTGAGTCTTCCACAGATCGA 3050
| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2989 T-CATCAGCGGATGTGACTCCAATCTCCTCACAGGACCCGGTGAGTCTTCCACAGATCGA 3047
Query 3051 TGTAAATAACGTGATCGCAGGACCAAGCTTGCAATTGCAAGAAAATGTACCTGGAATGGA 3110
||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3048 TGTGAATAACGTGATTGCTGGACCAAGCTTGCAATTGCAAGAAAATGTACCTGGAGTGGA 3107
Query 3111 GAATTTGCAGTATCAGCAGCAACAGGGCTACACAGCGGACCGGGAAAGGCTGCGTGCACA 3170
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 GAATTTGCAGTATCAGCAGCAACAGGGGTACACAGCGGACCGGGAAAGGCTGCGTGCACA 3167
Query 3171 GTTAAAAGCGTATATTGGGTATAAAGCTGAAGAGCTATATGTATATAGGTCGCTTCCGCT 3230
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3168 GTTAAAAGCGTATGTTGGGTATAAAGCTGAAGAGCTATATGTATATAGGTCGCTTCCGCT 3227
Query 3231 TGGTCAAGATCGAAGACGCAATCGCTATTGGCGGTTTTCAGCATCCGCCTCTCGAAATGA 3290
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 AGGTCAAGATCGAAGACGCAATCGCTATTGGCGGTTTTCAGCATCCGCCTCTCGAAATGA 3287
Query 3291 TCCTGGTTGTGGTAGAATATTCGTGGAACTTCAGGACGGACGATGGAGGCTCATTGATTC 3350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3288 TCCTGGTTGTGGTAGAATATTCGTGGAACTTCAGGACGGACGCTGGAGGCTCATTGATTC 3347
Query 3351 CGAAGAGGGTTTTGATTATTTGGTGAAGTCACTAGATGTTCGCGGTGTAAGAGAATCACA 3410
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3348 CGAAGAGGCTTTTGACTATTTGGTGAAGTCACTAGATGTTCGCGGTGTAAGAGAATCACA 3407
Query 3411 TTTACACTTTATGTTACTGAAGATTGAAGCATCTTTCAAGGAAGCAGTGAGGAGGAGTGT 3470
||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||
Sbjct 3408 TTTACACTTTATGTTGCTGAAGATCGAAGCATCCTTCAAGGAAGCATTAAGGAGGAATGT 3467
Query 3471 GGAAGCAAATCCCGGGTTGTGTTCCATATCTTCTAGCATGGATTCTGATACTGGCG-AGA 3529
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |
Sbjct 3468 GGCAGCAAATCCCGGGGTGTGTTCCATATCTTCTAGCTTGGATTCCGATACTG-CGGAAA 3526
Query 3530 TCTCCACGACGTTTAAGATCGAGCTAGGGGATAGTAACGCCATTGAGAGATGCAGCGTAT 3589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3527 TCTCCACGACGTTTAAGATCGAGCTAGGGGATAGTAACGCCGTTGAGAGATGCAGCGTAT 3586
Query 3590 TGCAACGGTTCCATAGTTTTGAGAAATGGATGTGGGATAATATGCTGCATCCGGGTGCGT 3649
||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3587 TGCAACGCTTCCATAGTTTCGAGAAGTGGATGTGGGATAATATGCTGCATCCTAGTGCTT 3646
Query 3650 TATCCGCATATAAGTATGGTGCTAAGCAAAGCAGTCCGCTTTTTCGCATATGCAGAATCT 3709
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3647 TATCTGCATTTAAGTATGGTGCTAAGCAAAGCAGTCCGCTTTTTCGCATATGCAGAATCT 3706
Query 3710 GTGCGGGACTACACTTTGTCGGAGATATTTGCTGTCCTAGTTGCGGTCAGATGCATGCTG 3769
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3707 GTGCGGAACTACACTTTGTCGGAGATATTTGCTGTCCTAGTTGCGGTCAGATGCATGCTG 3766
Query 3770 GTCCGGATATTGGTGAGTTGTGTTTTGCTGAGCAAGTGGCTCAACTTGGGGATATTTTGA 3829
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 3767 GTCCAGATGTTGGTGAGTTGTGTTTTGCTGAGCAAGTGGCTCAACTCGGGGATAATTTGA 3826
Query 3830 GAGGAGGAGATATTGGCTTTATCTTGCGTAGCTCAATCTCGTCTCCTCTTAGAATAAGAC 3889
|| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3827 GAAGAGGAGATACTGGCTTTATCTTGCGTAGCTCAATCTTGTCTCCTCTTAGAATAAGAC 3886
Query 3890 TACTCAAGGTTCAATTAGCGCTTGTCGAAGCTTCTCTTCCACCTGAAGGACTTGAAGCTT 3949
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3887 TACTCAAGGTTCAGTTAGCACTTGTCGAAGCTTCTCTTCCACCTGAAGGACTTGAAGCTT 3946
Query 3950 TTTGGACAGAGAATCTTAGGAAATCTTGGGGTATGAAGCTGATGTCATCAAGTTCCCCCG 4009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 3947 TTTGGACAGAGAATCTTAGGAAATCTTGGGGTATGAAGCTGTTGTCATCAAGTTCCCATG 4006
Query 4010 AAGAACTTAATCAGGTTCTCACAACGTTAGAGGCTGCACTAAAGAGAGATTTCTTGTCTT 4069
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4007 AAGATCTTTATCAGGTTCTCACAACGTTAGAGGCAGCACTAAAGAGGGATTTCTTGTCTT 4066
Query 4070 CAAACTTTGAAACAACTTCTGAACTCTTGGGTTTACAAGTAGAAGCTCTCGCCAACGAT- 4128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||
Sbjct 4067 CAAACTTTGAAACAACTTCTGAACTCTTGGGTTTACAAGAAGGAGCTCTCGCCAGCGATC 4126
Query 4129 TTCACTTGTGGAGTTAATGTACTACCGTGGATACCGAAGACAACAGGAGGTGTAGCTTTG 4188
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4127 TT-ACTTGTGGGGTTAATGTACTACCGTGGATACCAAAGACAGCAGGAGGTGTAGCTTTG 4185
Query 4189 AGGCTCTTTGAATTCGACAGCTCGATTGTTTACACAACCGATCAAAACAAAGATCCTCTA 4248
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 4186 AGACTCTTTGATTTCGACAGCTCGATTGTTTACACACCCGATCAAAACAACGATCCTCTA 4245
Query 4249 AAAGACAAAGAATCTGAAGATTTCGTCGGTTTGGAGACAAATTTTGTGAGAAACGTT-CA 4307
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||
Sbjct 4246 AAAGACAAAGAATCTGAAGATTTCGTGGGTTTGGAGACAAATATTCTGAGAAAC-TTACA 4304
Query 4308 AGAAAAGGACGTAATGGAGACTCTGGTGCAAGTTGCT--T-ACACGCAAGAAGAGAACTG 4364
|| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||
Sbjct 4305 TGAGAAGGACGTAATGGAAACTCCGGTGCAAGTTGCTGCTTATAAGCAAGAAGAGAACTG 4364
Query 4365 GACGGATCCTGGTTTAGGTGGTGTGTCTAGCTCTGGGCGAGGAGGTCGACCACCACGAGG 4424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4365 GACGGATCCTGGTTTAGGTGGTGTGTCTAGCTCTGGGAGAGGAGGTCGACCACCACGAGG 4424
Query 4425 ACGTGGCCGACCTCGTTCCCGTGGCAACGGCAAGAAACCGGCAGTTTCTGGTAGACCACC 4484
||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 4425 ACGTGGCCGGCCTCGTGCCCGTGGCAATGGCAAGAAACCGGCAGTTTCTGTTAAACCACC 4484
Query 4485 ACGAGGTGCAGCAAACTCAAATGGCGAAACCATGTTGAGACCAAGAGCACAACCACGTGG 4544
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4485 ACGAGGTGCAGCAAACTCAAATGGTGAAACCATGTTGAGACCGAGAGCACAACCACGTGG 4544
Query 4545 GGGTAGAAAGAACGGGCGGCGTA-TCGGCACCAAAGGCCGGAAGAGACCAACGAAAGGAA 4603
|||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 4545 GGGTAGAAAGAATGGGCGGCGTAGT-GGCACCAAAGGCCGAAAGAGACCAACGCAAGGAA 4603
Query 4604 CACTAGGTATATCTAATGAAGTAGGAGGA--A-GTCGGGCAAAGGAAGTTGCTGTAACCG 4660
|||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4604 CACTCGGTATATGTAATGAAGTAGGAGGAGGACGTCGGGTTAAGGAAGTTGCTGTAACCG 4663
Query 4661 CCAAAACTAGTCTTCCTGATAACGACGACGATTGGATCGATACCCCTGAACTGCAAGACG 4720
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4664 CCAAAACCAGTCTTCCTGATAACGATGACGATTGGATCGAAACCCCTGAACTGCAAGACG 4723
Query 4721 ATGACGGAGAAGCTAGCAGCTCAGGGAGATCGTTTCAGTATGAAGACTATGATGATGATG 4780
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4724 ATGACGGAGAAGCTAGCAGCTCGGGGAGATCGTTTCAGTATGAGGACTATGATGATGATG 4783
Query 4781 -T--CATGGCTCCGATTGATGATTTTGATGGCGGCGGTGAATCAAGTAAATTAGTAGGTA 4837
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4784 ATGTCATGGCTCCGATTGATGATTTTGATGGCGGCGGCGAATCAAGTAAATTAGTAGGTA 4843
Query 4838 GGGGTGAATTTAGCTTACATAGTGATGATGAATACgaagaagaaga--a-gaagaagaag 4894
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct 4844 GGGGGGAATTTAGCTTACATAGTGATGATGAATACGAAGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAG 4903
Query 4895 acatgaacatgaaaatgaatgtgaatgttgttgatgatgaagatgaagatTACATAAACG 4954
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4904 ACATGAACATGAAAATGGATGTGAATGTTGTTGATGATGAGGATGAAGATTACATAAACG 4963
Query 4955 ATGACTCATATGGTAGAGAGCAGCC-GG--T--G-ATTAGCA-C--T-C-G-GA-----A 4997
| ||||| ||||||||| |||||| || | | ||||||| | | | | || |
Sbjct 4964 AAGACTCGTATGGTAGAAAGCAGCATGGGATTAGCATTAGCAACGATGCAGCGACTCGGA 5023
Query 4998 AA-GGTTTAA---GTTTGAAGATCCTGATCTAACATCTTCATCGTCTTCTGATTTTCAGT 5053
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5024 AAAGGTTTAATAAGTTTGAAGATCCTGATCTAACATCTTCATCGTCTTCTGATTTTCAAT 5083
Query 5054 GATTGATTTTAGACA-GAAACTACGAAGCtttttttttgtattcttcaaaatgaatgaat 5112
|| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 5084 GACTGATTTTAGACAAGAACCTACGAAGCTTGTTTTT-GTATTCTTCAAAATGAAT---T 5139
Query 5113 ttttttagtttaact---ttttt-tAAGTTAACGTCAATGTAATCCTTTTGTCTCTTATG 5168
|||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5140 CTTTT-AGTGTAACAACCTTTTTGTAAGGTAACGTCAATGTAATCCTTTTGTCTCTTATG 5198
Query 5169 AGC 5171
|||
Sbjct 5199 AGC 5201
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 258159088678
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5