BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494966
Length=3740
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G49030.1 | Symbols: OVA2 | tRNA synthetase class I (I, L, M ... 5445 0.0
> AT5G49030.1 | Symbols: OVA2 | tRNA synthetase class I (I, L,
M and V) family protein | chr5:19874944-19882462 REVERSE LENGTH=3600
Length=3600
Score = 5445 bits (2948), Expect = 0.0
Identities = 3287/3448 (95%), Gaps = 33/3448 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3 AGTTCTGAGGTTTGGTTCTAGTTTCAAC-TTTCAGTTATCCACACACACATATTACATAT 61
||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||
Sbjct 5 AGTTCTGAGGTTTGGTTTTAGTTTCAACTTTTCAGTTAT-C-CACACACATA-CACACAT 61
Query 62 ACACAAAGCCTTCCCTGAGTTTGGCGACGTTAGTCTTCTTCCTTCTTTCCTTCCTTCTCA 121
|| | ||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||
Sbjct 62 --AC---G-CTTCCCTGAATTTGGTGACGTTAG------T-CTTC-TTCCTTCCTTCTCA 107
Query 122 ATCTTTGTTTCGCCGATAGCGTGGAAATGAGCTCTGAGAGATAGAAGCGTTAGAGAGAAA 181
||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 108 CTCTTTGTTTCG-C-----CGTGAAAATGAGCTCTGATAGATAGAAGCGACAGAGAGAAA 161
Query 182 ATTGAAGAAGATGTCTTCTTTCTTCAAATCCTTTGCGGGTAATCCCAGGGAAGCTGCTGC 241
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CTTGAAGCAGATGTCGTCTTTCTTCAAATCCTTCGCGGGAAATCCCAGGGAAGCTGCTGC 221
Query 242 AATGGCGATGGTTCAATCCTCATCTTACAGAGTATTGTCAGGTAGAAGTTGTTCAAATTT 301
|||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 222 AATGGCGATGGTTCAATCTTCATCTTACAGAGTTTTGTCAGGTAAAAGTTGTTCAAATTT 281
Query 302 AAGGAGGAATACGCCGTTGGATTCATTTCTTGCCAAGGGAAGGTC-TCCTGTCAAGGCTT 360
|||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 282 AAGGAGAAACACGCCGTTGGATTCTTTTCTTGCCAAGGGAAGGTCTTCC-GTCAAGGCTT 340
Query 361 TTTCATTCTTATATGTCTCAGGGTATTCAACTGAGCCAAACAATGAGTTTGGTCATTCAT 420
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 TTTCATTCTTATATGTCTCACGGTTTTCAACTGAACCAAACAATGAGTTTGGTCATTCAT 400
Query 421 CAAAGCGAAGGTCTCGTGGGCCTGTTATGGCGGCAAAGAAAGCATCCGAAGGGGAAAAGC 480
|||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 401 CAAAACGAAGGTCTCGTGGGCCTGTTATGGCAGCCAAGAAAGCATCTGAAGGGGAAAAGC 460
Query 481 AAGAAGATGGGAAGTACAAGCAAACGGTTGATTTGCCAAAGACAGGTTTTGGTATGAGAG 540
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 461 AAGAAGATGGAAAGTACAAGCAAACGGTTGATTTGCCAAAGACTGGTTTTGGTATGAGAG 520
Query 541 CGAATTCTTTGACAAGGGAACCTGAACTCCAGAAGTTGTGGGACGAGAACCAGGTCTTCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 521 CGAATTCTTTGACAAGGGAACCTGAACTCCAGAAGTTGTGGGAAGAGAACCAGGTCTTCA 580
Query 601 AGAGAGTTTCTGATAATAACAATGGAGGGAGTTTCATTCTTCATGATGGTCCTCCTTATG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 AGAGAGTTTCTGATAATAACAATGGAGGGAGTTTCATTCTTCATGATGGTCCTCCTTATG 640
Query 661 CCAATGGTGATCTGCATATGGGTCATGCTCTTAACAAGATACTGAAGGATATCATTAATC 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CCAATGGTGATCTGCATATGGGTCATGCTCTTAACAAGATACTGAAGGATATCATTAATC 700
Query 721 GCTATAAGCTGCTCCAAAACTATAAAGTTCAGTACGTTCCTGGGTGGGATTGCCATGGCC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 GCTATAAGCTGCTCCAAAACTATAAAGTTCAGTACGTTCCTGGGTGGGATTGCCATGGCC 760
Query 781 TTCCAATTGAGTTGAAAGTTCTGCAGTCCCTGGATCAGGAAGTAAGAAAGGAACTTACAC 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 761 TTCCAATTGAGTTGAAAGTTCTGCAGTCCCTGGATCAGGAAGTAAGAAAGGAACTTACAC 820
Query 841 CATTAAAATTAAGGGCAAAGGCGGCGAAATTTGCAAAAGCAACAGTCAAAACACAAATGG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 CATTAAAATTAAGGGCAAAGGCGGCGAAATTTGCAAAAGCAACAGTCAAAACACAAATGG 880
Query 901 AATCATTTAAGCGGTTTGGTGTATGGGCAGACTGGAACAATCCTTATCTAACTCTTGATC 960
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 881 AATCATTTAAGCGATTTGGAGTATGGGCAGACTGGAACAATCCTTATCTAACTCTTGATC 940
Query 961 CGGAATATGAAGCAGCCCAGATTGAAGTATTTGGCCAGATGGCCTTGAAAGGGTACATCT 1020
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 941 CGGAATATGAAGCAGCTCAGATTGAAGTATTTGGCCAGATGGCCTTGAAAGGGTACATTT 1000
Query 1021 ATAGAGGTAGGAAACCAGTTCACTGGAGCCCTTCATCTCGGACTGCTCTTGCAGAAGCTG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001 ATAGAGGTAGGAAACCAGTTCACTGGAGCCCTTCATCTCGGACTGCTCTTGCAGAAGCTG 1060
Query 1081 AATTAGAGTATCCGGAGGGTCATATTTCCAAAAGCATATATGCTATTTTCAAAGTGGTTG 1140
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1061 AACTAGAGTATCCGGAGGGTCATATTTCCAAAAGCATATATGCTATTTTTAAATTGGTTG 1120
Query 1141 GCGGAGCGAAAACAAGCCTTTTAGATGAGTTTGTCCCTAATATATGCTTGGCAGTATGGA 1200
| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1121 GTGGAGCGAAAACAAGCCTTTTAGATGAGTTTATCCCTAATATATACTTGGCAGTATGGA 1180
Query 1201 CAACTACACCTTGGACTATGCCAGCCAATGCTGCTGTCGCGGTGAATGCAAAGCTTCAGT 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 CAACTACACCTTGGACTATGCCAGCCAATGCTGCTGTCGCGGTGAATGCAAAGCTTCAGT 1240
Query 1261 ACTCTGTTGTGGAAGTGCAGTCATTCTCAGAAGATGAATCTGCTGTGACAGGCAATAAAA 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||
Sbjct 1241 ACTCTGTTGTGGAAGTGCAGTCATTCTCAGAAGATGAATCAACAGTGACAAGCAATAAAA 1300
Query 1321 AGAAAATGCCTGGGAAGGTTCTAAAGAATCAACAAAAGCTTTTCGTGATTGTAGCGACCG 1380
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301 AGAAAATTCCCGGGAAGGTTCTAAAGAATCAACAAAAGCTTTTCGTGATTGTAGCGACCG 1360
Query 1381 ACCTTGTGCCAGCATTAGAAGCGAAATGGGGTGTCAAGCTTATCATAAGTAAAACATTCC 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1361 ACCTTGTGCCAGCATTAGAAGCGAAATGGGGTGTGAAGCTTAGCATAAGTAAAACATTCC 1420
Query 1441 TTGGTTCAGATCTTGAAAACTGCAGGTACACACATCCAATTGACAACAGGGACTGTCCAG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1421 TTGGTTCAGATCTTGAAAACTGCAGGTACACTCATCCCATTGACAACAGAGACTGTCCAG 1480
Query 1501 TCGTTATAGGGGGTGATTACATAACTACGGAATCTGGAACAGGGTTGGTCCACACTGCCC 1560
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCGTTATAGGGGGTGATTACATAACTACAGAATCTGGAACAGGGTTGGTCCACACTGCCC 1540
Query 1561 CTGGTCATGGTCAGGAGGATTATGCAACCGGCCTGAAGTATGGGCTGCCTCTTATCTCTC 1620
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 1541 CTGGTCATGGTCAGGAGGATTATGCAACTGGCCTGAAGTACGGGCTGCCTCTTGTCTCTC 1600
Query 1621 CGGTGGATGATGAAGGAAAGTTCACTGAAGAAGCTGGA-AGGTTTAGAGGGCTCTCCGTC 1679
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||
Sbjct 1601 CGGTGGATGATGAAGGAAAGTTCACTGAAGAAGCTGGACAG-TTTAGAGGGCTCTCTGTC 1659
Query 1680 CTTGGAGAAGGGAATAGTGCTGTTGTCAGTTACCTGGATGAAAATATGTCTCTGGTCATG 1739
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 CTTGGAGAAGGGAATACCGCTGTTGTCAGTTACCTGGATGAAAATATGTCTCTGGTCATG 1719
Query 1740 GAAGAATCTTATGCTCATAAATACCCATATGATTGGCGAACTAAGAAACCTACGATATTT 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1720 GAAGAATCTTATGCTCATAAATACCCATATGATTGGCGAACTAAGAAACCGACGATATTT 1779
Query 1800 AGAGCGACTGAGCAGTGGTTTGCATCAGTTGAAGGGTTTCGCACGGCCACAATGGATGCA 1859
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1780 AGAGCGACTGAGCAGTGGTTTGCATCGGTTGAAGGGTTTCGCACAGCCACAATGGATGCA 1839
Query 1860 ATCAACAATGTAAAATGGGTACCAGATCAGGCGGTAAACAGAATATCTGCCATGACTTCC 1919
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840 ATCAACAATGTAAAATGGGTACCACATCAGGCAGTAAACAGAATATCTGCCATGACTTCC 1899
Query 1920 AGTCGATCTGATTGGTGCATCTCGAGACAAAGGACATGGGGGGTCCCTATTCCTGCCTTT 1979
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1900 AGTCGATCTGATTGGTGCATCTCAAGACAAAGGACATGGGGTGTCCCTATTCCTGCTTTT 1959
Query 1980 TATCATGTTAAGACAAAAGAACCCCTCATGAATGAAGAGACAATTAACCATGTTAAATCT 2039
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1960 TATCATGTTAAGACAAAAGAACCACTCATGAATGAAGAGACAATCAACCATGTTAAATCT 2019
Query 2040 GTAATTTCCCAAAAGGGTAGTGATGCGTGGTGGTATATGTCAGTGGAAGACCTACTTCCT 2099
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2020 ATAATTTCCCAAAAGGGTAGTGATGCGTGGTGGTATATGTCAGTGGAAGACCTACTTCCT 2079
Query 2100 GAGAAATATCGTGATAAAGCAGCTGATTATGAAAAAGGGACTGATACAATGGACGTCTGG 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2080 GAGAAATATCGTGATAAAGCAGCTGATTATGAAAAGGGGACTGATACGATGGACGTCTGG 2139
Query 2160 TTCGACTCAGGATCTTCTTGGGCTGGTGTATTGGGGAAACGTGAGGGTCTTAGTTTCCCT 2219
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2140 TTTGACTCAGGATCTTCTTGGGCTGGTGTATTAGGGAAACGCGAAGGTCTTAGTTTCCCT 2199
Query 2220 GCAGACGTGTATCTAGAGGGTACAGATCAGCATCGTGGATGGTTCCAGAGTTCTTTGTTA 2279
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2200 GCAGACGTGTATCTAGAAGGTACAGATCAGCATCGTGGATGGTTCCAAAGTTCTTTGTTA 2259
Query 2280 ACAAGCATCGCAACACAAGGAAAAGCTCCATATTCTGCTGTTATAACACATGGATTTGTA 2339
|||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2260 ACAAGCATCGCAACGCAAGGAAAAGCCCCCTATTCTGCTGTTATAACACATGGATTTGTA 2319
Query 2340 TTGGATGAGAAGGGTATGAAAATGAGCAAGTCTCTAGGTAATGTAGTGGACCCACGTTTG 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2320 TTGGATGAGAAGGGTATGAAAATGAGCAAGTCTCTAGGTAACGTAGTGGACCCACGTTTG 2379
Query 2400 GTCATTGAAGGAGGGAAAAATTCAAAGGACGCACCTGCTTATGGAGCTGATGTTATGCGT 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2380 GTCATTGAAGGAGGGAAAAATTCAAAGGACGCACCTGCTTACGGAGCTGATGTTATGCGT 2439
Query 2460 CTTTGGGTTTCTAGTGTAGATTACACAGGGGATGTACTGATAGGTCCTCAGATTCTTCGG 2519
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2440 CTTTGGGTTTCTAGTGTAGATTACACAGGGGATGTACTAATAGGTCCCCAGATTCTTCGT 2499
Query 2520 CAAATGTCTGATATATATAGGAAGTTGAGGGGAACGTTAAGATATCTCTTGGGCAATCTT 2579
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2500 CAAATGTCTGATATATATAGGAAGTTAAGGGGAACGTTAAGATACCTCTTGGGAAATCTT 2559
Query 2580 CATGATTGGAGAGTTGATAATGATGTTCCATACGAGGATTTACCTATCATTGATCAGCAT 2639
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2560 CATGATTGGAGAGTTGATAATGCTGTTCCATACCAGGATTTACCTATCATTGATCAGCAT 2619
Query 2640 GCTCTCTTTCAGCTTGAGAATGTTGTAAAGAACATACACGAATGTTACGAGAACTACCAG 2699
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2620 GCTCTCTTTCAGCTTGAGAATGTTGTAAAGAATATACAAGAATGTTACGAGAACTACCAG 2679
Query 2700 TTCTTTAAAATATTCCAGATCATACAACGATTCACAATTGTTGATCTGTCAAATTTCTAC 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2680 TTCTTTAAAATATTCCAGATCATACAACGATTCACAATTGTTGATCTGTCAAATTTCTAC 2739
Query 2760 TTCGATATTGCTAAAGATAGACTGTATACTGGGGGCACTTCAAGTTTTACCCGAAGAAGC 2819
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2740 TTCGATATAGCTAAAGATAGACTGTATACTGGGGGTACTTCAAGTTTTACCAGAAGAAGC 2799
Query 2820 TGTCAAACAGTTCTTTCAACACATCTTTTATCCATATTGAGAGTGATTGCTCCGATAGTA 2879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 2800 TGTCAAACAGTTCTTTCAACACATCTTTTATCCATATTGAGAGTGATTGCTCCAATCGTA 2859
Query 2880 CCTCACCTAGCAGAAGATGTCTGGCAGAATCTTCCATTTGAGTACAGAAATGAAGATGGC 2939
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2860 CCTCACCTAGCGGAAGATGTCTGGCAGAATCTTCCATTTGAGTACAGAAATGAAGATGGC 2919
Query 2940 TCTGCAGCAAAATTCGTCTTCGAACTTAAATGGCCTACAGTGAACGAACAATGGCTCTCA 2999
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||
Sbjct 2920 TCTGCAGCAGAATTTGTCTTCGAACTTAAATGGCCTACTTTGAATGAACAATGGCTTTCA 2979
Query 3000 TTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGCAAAGGCTTCTCC-G--G-GGACCGAGGGTGAA 3055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||
Sbjct 2980 TTTCCTGCTGAAGATGTTCTCTTCTGGCAAAGGCTTCTCGAGTTGAGGACTGAGG-TGAA 3038
Query 3056 CAAAGTGCTGGAGCTCGCACGTAATGATAAAATGATTGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGT 3115
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3039 CAAAGTGCTGGAGCTAGCACGTAATGAGAAAATGATTGGTTCCAGTTTAGAAGCAAAGGT 3098
Query 3116 GTATCTGTACACTGCAGATGCAGGAATGGCTACAAAATTACTAGAGATGAGTGAAGCAAA 3175
|||| || | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 GTATTTGCATACTGCAGATGCAGGCATGGCTGCAAAATTACTAGAGATGAGTGAAGCAAA 3158
Query 3176 GAACGAGGCTGACACTCTGCAACGCATATTCATAACATCACAAGTTGAAGTATTGCCTTC 3235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3159 GAACGAGGCTGACACTCTGCAACGCATATTCATAACATCACAAGTTGAAGTATTGTCTTC 3218
Query 3236 AATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTGCAACACACAGGAGAGTATGTAGAGGGAGATAA 3295
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 3219 AATGGAGAAGGAGATGATAAGCAGTGTGCAACACACAGGAGAGTATGTGGAGGGAGAGAA 3278
Query 3296 GAAAGTGTGGATTGGTGTGTCACGAGCTGAGGGGTCCAAGTGTGAGAGGTGCTGGAATTA 3355
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3279 CAAAGTGTGGATTGGGGTGTCACGAGCCGAGGGGTCTAAGTGTGAGAGGTGCTGGAATTA 3338
Query 3356 CTCGGGCCAGGTCGGGTCATTTTCCAACCATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAATGT 3415
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3339 CTCGGGCCAGGTCGGATCATTTTCTGACCATCCTACTCTCTGTGGACGCTGCTTCAGTGT 3398
Query 3416 CATTGTTGCTAATCCGCCTGAGCCAGCA 3443
||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3399 CATTGTTGCTAATCCACCTGAGCCTGCA 3426
Score = 375 bits (203), Expect = 1e-102
Identities = 244/264 (92%), Gaps = 2/264 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3478 AAGTTGAAGTATTGCCTTCAATGGAGAAGGAGATGGTAAGCAGTGTGCAACACACAGGAG 3537
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3200 AAGTTGAAGTATTGTCTTCAATGGAGAAGGAGATGATAAGCAGTGTGCAACACACAGGAG 3259
Query 3538 AGTATGTAGAGGGAGATAAGAAAGTGTGGATTGGTGTGTCACGAGCTGAGGGGTCCAAGT 3597
||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 3260 AGTATGTGGAGGGAGAGAACAAAGTGTGGATTGGGGTGTCACGAGCCGAGGGGTCTAAGT 3319
Query 3598 GTGAGAGGTGCTGGAATTACTCGGGCCAGGTCGGGTCATTTTCCAACCATCCTACTCTCT 3657
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3320 GTGAGAGGTGCTGGAATTACTCGGGCCAGGTCGGATCATTTTCTGACCATCCTACTCTCT 3379
Query 3658 GTGGACGCTGCTTCAATGTCATTGTAGCTAATCCGCCTGAGCCAGCAGTTGCAGCCT-TG 3716
||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||
Sbjct 3380 GTGGACGCTGCTTCAGTGTCATTGTTGCTAATCCACCTGAGCCTGCAGTTGCAGC-TGTG 3438
Query 3717 ATCAGCTCAGCCTGAAATTTGCTC 3740
| ||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 3439 AACAGCTTAGCCTAAAATTTGCTC 3462
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 186269859359
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5