BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg494980 Length=2511 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G49190.1 | Symbols: SUS2, SSA, ATSUS2 | sucrose synthase 2 |... 4205 0.0 > AT5G49190.1 | Symbols: SUS2, SSA, ATSUS2 | sucrose synthase 2 | chr5:19943282-19947189 REVERSE LENGTH=2511 Length=2511 Score = 4205 bits (2277), Expect = 0.0 Identities = 2436/2514 (97%), Gaps = 6/2514 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCCGACTGGTAGGTTCGAGACTATGCGTGAATGGGTTCATGACGCCATCTCTGCTCAA 60 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| Sbjct 1 ATGCCGACTGGTAGGTTCGAGACTATGCGTGAATGGGTTTATGACGCTATCTCTGCTCAA 60 Query 61 CGCAATGAGCTCCTCTCTCTCTTCTCCAGATATGTAGCTCAGGGAAAGGGGATATTGCAG 120 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 61 CGCAATGAGCTCCTCTCTCTTTTCTCCAGATATGTAGCCCAGGGAAAGGGGATATTGCAG 120 Query 121 TCCCACCAGCTGATTGATGAGTTCCTTAAGACTGTGAAAGTTGATGGAACAACT-GAAGA 179 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| Sbjct 121 TCCCACCAGCTGATTGATGAGTTCCTTAAGACTGTGAAAGTTGATGGAAC-ATTAGAAGA 179 Query 180 TCTTAACAAAAGTCCATTCATGAAAGTTTTGCAGTCTGCAGAGGAAGCCATAGTTTTGCC 239 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 180 TCTTAACAAAAGTCCATTCATGAAAGTTCTGCAGTCTGCAGAGGAAGCCATAGTTTTGCC 239 Query 240 TCCATTTGTTGCTTTGGCTATTCGTCCCAGGCCTGGTGTTAGGGAATATGTCCGTGTGAA 299 ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 240 TCCATTTGTTGCTTTGGCTATACGTCCCAGACCTGGTGTTAGGGAATATGTCCGTGTGAA 299 Query 300 TGTGTACGAGCTGAGCGTAGATCATTTAACTGTTTCTGAATATCTTCGGTTTAAGGAAGA 359 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 300 TGTGTATGAGCTGAGCGTAGATCATTTAACTGTTTCTGAATATCTTCGGTTTAAGGAAGA 359 Query 360 GCTCGTTAATGGCCATGCCAATGGAGATTATCTTCTTGAGCTTGATTTTGAACCCTTCAA 419 ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| Sbjct 360 GCTCGTTAATGGCCATGCCAATGGAGATTATCTCCTTGAACTTGATTTTGAACCTTTCAA 419 Query 420 TGCAACATTGCCTCGCCCAACTCGTTCATCATCCATTGGGAATGGGGTTCAGTTCCTCAA 479 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 420 TGCAACATTGCCTCGCCCAACTCGTTCATCATCCATTGGGAATGGGGTTCAGTTCCTCAA 479 Query 480 TCGTCACCTCTCTTCAATTATGTTCCGTAACAAAGAAAGCATGGAGCCTTTGCTTGAGTT 539 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 TCGTCACCTCTCTTCAATTATGTTCCGTAACAAAGAAAGCATGGAGCCTTTGCTTGAGTT 539 Query 540 TCTCCGCACTCACAAACATGATGGCCGTTCTATGATGCTGAATGATCGAATACAGAATAT 599 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 540 TCTCCGCACTCACAAACATGATGGCCGTCCTATGATGCTGAATGATCGAATACAGAATAT 599 Query 600 CCCCATACTTCAGGGAGCTTTGGCAAGGGCAGAGGAGTTCCTTTCTAAACTTCCTCTGGC 659 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 600 CCCCATACTTCAGGGAGCTTTGGCAAGAGCAGAGGAGTTCCTTTCTAAACTTCCTCTGGC 659 Query 660 TACACCATACTCTGAATTCGAGTTTGAACTGCAAGGAATGGGATTTGAAAGGGGATGGGG 719 |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 660 AACACCATACTCTGAATTCGAATTTGAACTACAAGGGATGGGATTTGAAAGGGGATGGGG 719 Query 720 TGACACAGCACAGAAGGTTTCAGAAATGGTGCATCTCCTTCTGGACATACTCCAGGCACC 779 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 720 TGACACAGCACAGAAGGTTTCAGAAATGGTGCATCTTCTTCTGGACATACTCCAGGCACC 779 Query 780 TGATCCTTCTGTATTGGAGACGTTCCTAGGAAGGATTCCTATGGTGTTCAATGTTGTGAT 839 |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 780 TGATCCTTCTGTCTTGGAGACGTTTCTAGGAAGGATTCCTATGGTGTTCAATGTTGTGAT 839 Query 840 TTTGTCTCCGCATGGTTACTTTGGCCAAGCCAATGTCTTGGGTCTGCCTGACACTGGTGG 899 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 840 TTTGTCTCCGCATGGTTACTTTGGCCAAGCCAATGTCTTGGGTCTGCCTGATACTGGTGG 899 Query 900 CCAGGTTGTGTACATTCTTGATCAAGTTCGTGCATTGGAAAATGAGATGCTCCTTAGGAT 959 |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 900 ACAGGTTGTCTACATTCTTGATCAAGTACGTGCATTGGAAAATGAGATGCTCCTTAGGAT 959 Query 960 ACAGAAGCAAGGACTGGAAGTTATTCCAAAGATTCTCATTGTAACAAGACTGATACCCGA 1019 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 960 ACAGAAGCAAGGACTGGAAGTTATTCCAAAGATTCTCATTGTAACAAGACTGCTACCCGA 1019 Query 1020 AGCAAAGGGAACAACGTGCAACCAGAGGTTAGAAAAAGTAAGTGGTACAGAACACGCACA 1079 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1020 AGCAAAGGGAACAACGTGCAACCAGAGGTTAGAAAGAGTTAGTGGTACAGAACACGCACA 1079 Query 1080 TATTCTGCGAATACCATTTAGGACTGAGAAGGGAATTCTTCGCAAGTGGATCTCGCGGTT 1139 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1080 CATTCTGCGAATACCATTTAGGACTGAAAAGGGAATTCTTCGCAAGTGGATCTCAAGGTT 1139 Query 1140 TGATGTCTGGCCATACCTGGAGACTTTTGCAGAGGATGCATCAAATGAAATTTCTGCAGA 1199 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1140 TGATGTCTGGCCATACCTGGAGACTTTTGCAGAGGATGCATCAAATGAAATTTCTGCGGA 1199 Query 1200 GTTGCAGGGTGTACCAAATCTCATCATTGGCAACTACAGTGATGGAAATCTCGTTGCTTC 1259 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1200 GTTGCAGGGTGTACCAAATCTCATCATTGGCAACTACAGTGATGGAAATCTCGTTGCTTC 1259 Query 1260 TTTGTTAGCTAGTAAGCTAGGCGTGATGCAGTGTAATATTGCTCATGCTTTAGAGAAAAC 1319 ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1260 TTTGTTAGCTAGTAAGCTAGGTGTGATACAGTGTAATATTGCTCATGCTTTAGAGAAAAC 1319 Query 1320 GAAGTACCCCGAGTCTGACATTTACTGGAGAAACCATGAAGATAAGTATCATTTTTCAAG 1379 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 1320 CAAGTACCCCGAGTCTGACATTTACTGGAGAAACCATGAAGATAAGTATCACTTTTCAAG 1379 Query 1380 TCAGTTCACTGCAGATTTAATTGCCATGAATAATGCTGATTTCATCATCACCAGCACATA 1439 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 1380 TCAGTTCACTGCAGATCTAATTGCCATGAATAATGCCGATTTCATCATCACCAGCACATA 1439 Query 1440 CCAAGAGATCGCGGGAAGCAAGAACAATGTTGGGCAATACGAGAGCCACACAGCTTTCAC 1499 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1440 CCAAGAGATTGCGGGAAGCAAGAACAATGTTGGGCAATACGAGAGCCACACAGCTTTCAC 1499 Query 1500 TATGCCTGGTCTTTACCGAGTTGTTCATGGGATCGATGTCTTTGATCCTAAGTTTAATAT 1559 |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1500 TATGCCTGGTCTTTACCGAGTTGTTCATGGAATTGATGTCTTTGATCCTAAGTTTAATAT 1559 Query 1560 AGTCTCTCCAGGAGCTGATATGACCATATACTTTCCATATTCTGACAAGGAAAGAAGACT 1619 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1560 AGTCTCTCCAGGAGCTGATATGACCATATACTTTCCATATTCTGACAAGGAAAGAAGACT 1619 Query 1620 CACTGCCCTTCATGAGTCAATTGAAGAACTCCTCTTTAGCGCCGAACAGAATGATGAGCA 1679 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 1620 CACTGCCCTTCATGAGTCAATTGAAGAACTCCTCTTTAGTGCCGAACAGAATGATGAGCA 1679 Query 1680 TGTTGGTTTACTGAGCGACCAATCAAAGCCGATCATCTTCTCCATGGCAAGACTTGACAG 1739 |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 1680 TGTTGGTTTACTGAGCGACCAATCGAAGCCAATCATCTTCTCTATGGCAAGACTTGACAG 1739 Query 1740 GGTGAAAAACTTGACTGGGCTAGTTGAATGCTATGCCAAGAATAGCAAGCTTAGAGAGCT 1799 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1740 GGTGAAAAACTTGACTGGGCTAGTTGAATGCTATGCCAAGAATAGCAAGCTTAGAGAGCT 1799 Query 1800 CGCAAATCTTGTTATAGTCGGTGGCTACATCGATGTGAATCAGTCCAGGGATAGAGAGGA 1859 |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 1800 TGCAAATCTTGTTATAGTCGGTGGCTACATCGATGAGAATCAGTCCAGGGATAGAGAGGA 1859 Query 1860 AATGGCTGAGATACAAAAGATGCACAGCCTGATTGAGCAGTATGATTTACATGGTCAGTT 1919 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| Sbjct 1860 AATGGCTGAGATACAAAAGATGCACAGCCTGATTGAGCAGTATGATTTACACGGTGAGTT 1919 Query 1920 TAGGTGGATAGCTGCTCAAATGAACCGTGCTCGAAATGGTGAGCTTTACCGTTATATCGC 1979 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1920 TAGGTGGATAGCTGCTCAAATGAACCGTGCTCGAAATGGTGAGCTTTACCGTTATATCGC 1979 Query 1980 AGACACAAAAGGTGTTTTTGTTCAGCCTGCTTTCTATGAAGCATTTGGGCTTACAGTTGT 2039 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 1980 AGACACAAAAGGTGTTTTTGTTCAGCCTGCTTTCTATGAAGCATTTGGGCTTACGGTTGT 2039 Query 2040 GGAATCAATGACTTGTGGGCTCCCAACGTTTGCTACCTGTCATGGTGGACCCGCAGAGAT 2099 ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2040 GGAATCAATGACTTGTGCACTCCCAACGTTTGCTACCTGTCATGGTGGACCCGCAGAGAT 2099 Query 2100 TATCGAGAATGGAGTTTCGGGGTTCCACATTGACCCATATCATCCAGACCAGGTTGCAGC 2159 |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2100 TATCGAAAACGGAGTTTCTGGGTTCCACATTGACCCATATCATCCAGACCAGGTTGCAGC 2159 Query 2160 TACCCTGGTCAGCTTCTTTGAGACCTGCAACACCAATCCAAATCATTGGGT-AAAAGTCT 2218 |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| Sbjct 2160 TACCTTGGTCAGCTTCTTTGAGACCTGTAACACCAATCCAAATCATTGGGTTAAAA-TCT 2218 Query 2219 CTGAAGGAGGTCTCAAGCGAATCTATGAAAGGTACACATGGAAGAAGTACTCAGAGAGGT 2278 |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2219 CTGAAGGAGGGCTCAAGCGAATCTATGAAAGGTACACATGGAAGAAGTACTCAGAGAGAC 2278 Query 2279 TGCTTACGCTGGCTGGAGTCTATGCATTCTGGAAACATGTGTCTAAGCTCGAAAGGAGAG 2338 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2279 TGCTTACCCTGGCTGGAGTCTATGCATTCTGGAAACATGTGTCTAAGCTCGAAAGGAGAG 2338 Query 2339 AAACACGACGTTACCTAGAGATGTTCTACTC-TCTGAAGTTTCGTGACTTGGCCAATTCA 2397 ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||||||||||| Sbjct 2339 AAACACGACGTTACCTAGAGATGTTTTACTCAT-TGAAATTTCGTGATTTGGCCAATTCA 2397 Query 2398 ATCCCGCTGGCAACAGATGAGAACTGAGCATGACAGGGTTGGATTCTATTTGCTGCACTT 2457 ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| Sbjct 2398 ATCCCGCTGGCAACAGATGAGAACTGATCATGACAGGGTAGGATTTTATTTCCTGCACTT 2457 Query 2458 TCTTTAGAGCTTTTGTTTGTATTATCTTGAATAAAAGTTGTTGGGTTTTGTTTC 2511 |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| Sbjct 2458 TCTTTAGATCTTTTGTTTGTGTTATCTTGAATAAAAATTGTTGGGTTTTGTTTC 2511 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 124614686412 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5