BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg494999
Length=5037
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G49430.1 | Symbols: | WD40/YVTN repeat-like-containing doma... 8589 0.0
AT2G15030.1 | Symbols: | pseudogene, similar to LD40380p, bla... 185 3e-45
AT2G15029.1 | Symbols: | unknown protein; Has 30201 Blast hits... 106 2e-21
> AT5G49430.1 | Symbols: | WD40/YVTN repeat-like-containing domain;Bromodomain
| chr5:20037338-20045454 REVERSE LENGTH=5034
Length=5034
Score = 8589 bits (4651), Expect = 0.0
Identities = 4911/5039 (97%), Gaps = 7/5039 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTCTTAGGAAAAATACTCCAAAAAGCGATTCAGTTTCACTCCCTATGAAGCCATTG 60
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 1 ATGGCTCTTAGGAAAAATACTCCAAAAGGCGATTCAGTTTCACTACCTATGAAGCCTTTG 60
Query 61 AATTTCTCCAGAAAATTGCCAGGGAATGTGCAGATTCCAGACCCTGATATTGCTC-AAGT 119
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 61 AATTTCTCCAGAAAATTGCCAGGAAATGTGCAGATTCCAGACCCTGATATTGTTCAAAG- 119
Query 120 TGTTGCACCTAACATTGATTTAGACCTCCGTGAAGTTTACTTTTTGATGCTCCACTTACT 179
|||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 TGTTGCGCCTAACATTGATCTAGACCTCCGGGAAGTTTACTTTTTGATGCTCCACTTACT 179
Query 180 TTCATCTGGGCCATGCCAGAAAACTTATGCACTGTTGCGACATGAACTTCTTGAACATGA 239
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTCATCTGGGCCGTGCCAGAAAACTTATGCACTGTTGCGGCATGAACTTCTTGAACATGA 239
Query 240 GCTTCTTCCTAGAAGATATCATGCTTGGTACTCGAGGAGTGGATTGTCTAGTGGGGATGA 299
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 240 GCTTCTTCCTAGAAGATATCATGCTTGGTACTCGAGGAGTGGATTGCCTAGTGGGGATGA 299
Query 300 GAATGATGATGGCAATTCCTTTCCTTTGAACTATACTGAGTTGGCTAAAAGGTATTCTCA 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 300 GAATGATGATGGCAATTCCTTTCCTTTGAACTATACTGAGTTGGCTAAGAGGTATTCTCA 359
Query 360 TGTaaaaaaaGATCACCTGGTGGAGCTTCTAAAGCAATTGGTCTTTGTTTCGAATAGGCC 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 360 TGTAAAAAAAGATCACCTGGTGGAGCTTCTAAAGCAATTGGTCTTTGTTTCAAATAGGCC 419
Query 420 TAATCCCTCACGAGGGATCGGTGATGGAAATAAAATGATTGGAGCTGGTGTTCCAACACT 479
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 420 TAATCCCTCACGAGGGATCGGTGATGGAAATAAAATGATTGGAGCTGGGGTTCCAACACT 479
Query 480 TTTAGGCACTGGCTCGTTCTCCCTTTTGAGCTCTGACAAGGAAATAGTTGGAAGTGATCT 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 480 TTTAGGCACTGGCTCGTTCTCCCTTTTGAGCTCTGACAAGGAAATAGTTGGAAGTGATCT 539
Query 540 CAAATCACCACCTATTGGCATGCGTTGGCCTCATATGCATGCTGATCAGGTTCGTGGTAT 599
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 CAAACCACCACCTATTGGCATGCGTTGGCCTCATATGCATGCTGATCAGGTTCGTGGTAT 599
Query 600 TAGTTTGAGGGAAATTGGTGGTGGTTTTGGCAGACATCATCGGGCCCCATCAATTCGTGC 659
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 600 TAGTTTGAGGGAAATTGGTGGTGGTTTTGCCAGACATCATCGTGCCCCATCAATTCGAGC 659
Query 660 AGCATGTTACGTCATTGCAAAACCATCGTCAATGGTACAAAAGATGCAGAACATCAAGAG 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 AGCATGTTACGTCATTGCAAAACCATCGTCAATGGTACAAAAGATGCAGAACATCAAGAG 719
Query 720 GCTACGTGGACACAGAAATGCTGTGTACTGTGCTATATTAGATCGCTCAGGAAGGTACGT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 720 GCTACGTGGACACAGAAATGCTGTGTACTGTGCTATATTAGATCGCTCAGGAAGGTATGT 779
Query 780 AATCACTGGTTCAGATGACCGCCTTGTAAAAGTATGGTCAATGGATACTGCATACTGCCT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AATCACTGGTTCAGATGACCGCCTTGTAAAAGTATGGTCGATGGATACTGCATACTGCCT 839
Query 840 GGCCAGCTGTCGAGGGCATGAAGGTGACATAACTGATCTTGCTGTGAGTTCGAACAACAT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 GGCCAGCTGTCGAGGGCATGAAGGTGACATAACTGATCTTGCTGTGAGTTCGAACAACAT 899
Query 900 TTTCATAGCATCCGCATCGAATGATTGTGTGATCCGCGTTTGGCGATTGCCAGATGGCTT 959
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TTTCATAGCATCCGCATCAAATGATTGTGTGATCCGCGTTTGGCGATTGCCAGATGGCTT 959
Query 960 ACCAGTTTCTGTCCTCCGTGGACATACTGGAGCTGTTACTGCTATTGCATTTAGTCCCAG 1019
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 960 ACCAGTTTCTGTTCTCCGTGGACATACTGGAGCTGTTACTGCTATTGCCTTTAGTCCCAG 1019
Query 1020 ACCTGGATCCCCATACCAGCTTCTCTCATCGTCTGATGATGGTACATGTAGGATATGGGA 1079
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 ACCTGGATCCCCGTACCAGCTTCTCTCATCGTCTGATGATGGTACATGTAGGATATGGGA 1079
Query 1080 TGCTCGGGGAGCCCAATTTGCTCCCCGGATATATGTCCCTAGGCCTCCTAGTCCTGATGG 1139
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 TGCCCGGGGAGCCCAATTTGCTCCCCGGATATATGTCCCTAGGCCTCCTAGTCCTGATGG 1139
Query 1140 AAAGAACAGTGGCCCTTCTTCTAGTAATGCTCAGCAGAGTCACCAAATCTTTTGCTGTGC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AAAGAACAGTGGCCCTTCTTCTAGTAATGCTCAGCAGAGTCACCAAATCTTTTGCTGTGC 1199
Query 1200 ATTCAATGCTAATGGATCTGTCTTTGTCACTGGCAGTTCTGACACTCTTGCTAGAGTATA 1259
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 ATTCAATGCTAGTGGATCTGTCTTTGTCACTGGCAGTTCTGACACTCTTGCTAGAGTATA 1259
Query 1260 CTCGGTTTGGAGTGCTAATAAGACCAATACTGATGATCCAGAGCAGCCAAATCATGAGAT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 CTCGGTTTGGAGTGCTAATAAGACCAATACTGATGATCCAGAGCAGCCAAATCATGAGAT 1319
Query 1320 GGATGTTCTAGCTGGACATGAGAATGATGTTAATTATGTTCAGTTCAGTGGTTGTGCTGC 1379
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 GGATGTTCTGGCTGGACATGAGAATGATGTTAATTATGTTCAGTTCAGTGGTTGTGCTGC 1379
Query 1380 GGGATCTAAATTTTCTGTAACTGACTACTCAAAAGACGAGAATGTTCCAAAATTTAAGAA 1439
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 GGGGTCTAAATTTTCTGTAACTGACTACTCAAAAGACGAGAATGTTCCAAAATTTAAGAA 1439
Query 1440 TTCCTGGTTTTGTCATGATAACATAGTTACATGCTCTCGTGATGGTAGTGCAATCATTTG 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1440 TTCCTGGTTTTGTCATGATAACATAGTTACATGCTCTCGTGATGGTAGTGCAATCATTTG 1499
Query 1500 GATCCCAAGATTGCGGAGATCGCATGGAAAAAGCTGCCGATGGACACGAGCATATCATCT 1559
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 GATCCCAAGATTACGGAGATCTCATGGAAAAAGCTGCCGATGGACACGAGCATATCATCT 1559
Query 1560 CAAGGTTCCACCTCCGCCCATGCCTCCTCAACCTCCTAGAGGTGGGCCACGTCAAAGGAT 1619
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1560 CAAGGTTCCACCTCCGCCCATGCCCCCTCAACCTCCTAGAGGGGGGCCACGTCAAAGGAT 1619
Query 1620 CCTACCTACACCCCGTGGGGTTAACATGATTGCTTGGAGTCTGGATAATCGTTTTGTCCT 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CCTACCTACACCCCGTGGGGTTAACATGATTGCTTGGAGTCTGGATAATCGTTTTGTCCT 1679
Query 1680 TGCCGCTATCATGGATTGTAGAATATGCGTGTGGAATGCCTCTGATGGTAGCTTGGTACA 1739
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1680 TGCCGCTATTATGGATTGTAGAATATGCGTGTGGAATGCCTCTGATGGTAGCTTGGTACA 1739
Query 1740 TTCTTTGACTGGTCATACAGCATCTACATATGTTATGGACGTCCATCCTTTCAATCCTCG 1799
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1740 TTCTTTGACTGGTCATACAGCATCTACATATGTTATGGACGTCCATCCATTCAATCCTCG 1799
Query 1800 TATAGCTATGAGTGCTGGCTATGATGGAAAAACAATAGTGTGGGATATATGGGAAGGCAT 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1800 TATAGCTATGAGTGCTGGCTATGATGGAAAAACAATAGTGTGGGATATATGGGAAGGCAT 1859
Query 1860 ACCTATCCAAATATACGAGATTTCACACTACAAGTTGGTTGATGGGAAGTTTTCACCGGA 1919
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1860 ACCTATACAAATATACGACATTTCACACTACAAGTTGGTTGATGGGAAGTTTTCACCGGA 1919
Query 1920 TGGAACATCAATTATACTTTCAGATGATGTGGGCCAATTGTACATATTAAGTACAGGCCA 1979
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1920 TGGAACTTCAATTATACTTTCAGATGATGTGGGCCAATTGTACATATTAAGTACTGGCCA 1979
Query 1980 AGGGGATTCTCAAAAAGATGCTAAATATGATCAGTTCTTCCTGGGGGATTATCGGCCATT 2039
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1980 AGGGGATTCTCAAAAAGACGCTAAATATGATCAGTTCTTCCTGGGGGATTATCGTCCATT 2039
Query 2040 AATTCAGGACATATATGGTAATGTCCTTGACCAGGAATCTCAGCTTCAACCTTATCGTCG 2099
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2040 AATTCAGGACACATATGGTAATGTCCTTGACCAGGAATCTCAGCTTCAACCTTATCGCCG 2099
Query 2100 AAATATGGAGGATCCTCTTTGCGATTCAGGGATGATTCCATATGAAGAGCCATATCAGAC 2159
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2100 AAATATGGAGGATCCTCTTTGTGATTCAGGGATGATTCCATATGAAGAGCCATATCAGAC 2159
Query 2160 CACGTTTCAGAAACGACGACTCGGCGCCTTAGGCAAAGAATGGCGACCATCTTCTTTGAA 2219
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2160 CACGTTTCAGAAACGGCGACTCGGCGCCTTAGGCAAAGAATGGCGACCATCTTCTTTGAA 2219
Query 2220 GCTTGCTGTCGGGCCAGATATCACTTTAGATCAAGATTACCAAATGCCACCTCTGGCAGA 2279
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GCTTGCTGTCGGGCCAGATATCACTTTAGATCGAGATTACCAAATGCCACCTCTGGCAGA 2279
Query 2280 TCTAGACTTAGCCGAACCGTTGCCAGAATTTATAGATGTAATGGAGTGGGAACCAGAAGT 2339
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2280 TCTAGACTTAGCCGAACCGTTGCCAGAGTTTATAGATGTAATGGAGTGGGAACCAGAAGT 2339
Query 2340 TGATATCTTAAGTGATGAAAACGACTCTGAATACAATGTGCCAGAGGAGTATTCGTCTGG 2399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 TGATATCTTAAGTGATGAAAACGACTCTGAATACAATGTGCCAGAGGAGTATTCGTCTGG 2399
Query 2400 AAAAGAGCAAGAATGTTTAAATTCTTCAACCTCTGGTGAGTCAGGTTCCAGTTCCGGTGA 2459
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2400 AAAAGAGCAAGAATGTTTAAATTCTTCAACCTCTGGTGAGTCAGGTTCCAGTTCTGGTGA 2459
Query 2460 AAGCGATGAGGATGATGATCATCAGAATAGCCTTAGAAGATCCAAAAGGAAAAAAGATAA 2519
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2460 AAGCTATGAGGATGATGATCATCAGAATAGCCTTAGAAGATCCAAAAGGAAAAAACATAA 2519
Query 2520 GAAAGAAGCTGGGATCATGACTTCTTCGGGTAGGCGCGTCAAAAAGAGGAACTTTGATGA 2579
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2520 GAAAGAAGCTGGGATCATGACTTCTTCGGGTAGGCGTGTCAAAAAGAGGAACTTTGATGA 2579
Query 2580 GATTGAGGGAGCTCCAAGCAACAAAAAACGTACCAGGAAATCTAGGAGTGGTCGTAAAGA 2639
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2580 GCTTGAGGGAGCTCCAAGCAACAAAAAACGTACCAGAAAATCTAGGAGTGGTCGTAAAGA 2639
Query 2640 ATCGAAAAGGAAATCTTCAAAATCTAAATCGTCCAGACCTAGGCGAGCAGCTGCACGAAA 2699
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640 ATCGAAGAGGAAATCTTCAAAATCTAAATCGTCTAGACCTAGGCGAGCAGCTGCACGAAA 2699
Query 2700 TGCTCTCTCTTGGTTTTCTAAGATTACAGGTACATCTAAAGATGCAGAAGAGGAAGAGGT 2759
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 2700 TGCTCTCTCTTGGTTTTCTAAGATTACAGGTACATCTAAAGATGCAGAAGAGGAGGAAGT 2759
Query 2760 CTCTGAATTGAGTGATTCATCAGAAAGTGAATCGACAACACAAGACTCAGGCACTGGGGA 2819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2760 CTCTGAATTGAGTGATTCATCAGAAAGTGAATCGACAACACAAGACTCAGGTACTGGGGA 2819
Query 2820 TAGTGAACTTGAAGTAGCTTTGTTAAATGGGCATGGGAAGCAATCGAAGGGGAAAAATAT 2879
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2820 TAGTGAACTTGAAGTAGCTTTGTTAAATGGGCATGGGAAGCAATCGAAGGGGAAAACTAT 2879
Query 2880 CCTCGTATGTGATTCAGATGATGGGGCTCAACAATGTGATATCAGAGAAACTCATCCTAC 2939
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 2880 CCTCGTATGTGATTCTGATGATGGGGCTCAACAATGTGATATCAGAGAAACTCATACTGC 2939
Query 2940 TGAAAGGAGGAGATTGGTTCTTAGATTTCCTGTTAGGAATTCAGATAAGCTTACTTTACT 2999
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2940 TGAAAGGAGGAGATTGGTTCTTAGATTTCCTGTTAGGAATTCAGATAAGCTTACCTTACT 2999
Query 3000 GGAGAACCTACCTGGATCATCTTCTGATGTTCCAACTCCAACTTTAGGGAACGGCTGTGC 3059
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3000 GGAGAACCTACCTGGATCATCTTGTGATGTTCCAAGTCCAACTTTAGGGAACGGCTGTAC 3059
Query 3060 TGAAGACTCGAGGATTCCTGGGAACCAATTTGAAGGGCTAGATGTAAGTAAAGTCAAATG 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 TGAAGACTCGAGGATTCCTGGGAACCAATTTGAAGGGCTAGATGTAAGTAAAGTCAAATG 3119
Query 3120 GGGAATGGTTAAGGCTCGTACAACGAAGCGAATAAGAGGTGAAGCAATATCATCGCATGA 3179
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 GGGAATGGTTAAGGCTCGTACAACAAAGCGAATAAGAGGTGAAGCAATATCATCGCATGA 3179
Query 3180 ACTTATGGGCTCTGACCCGGAGGGAAAGGAAAATAATCTTAAGGAAGA-TGCAAATCACC 3238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||
Sbjct 3180 ACTTATGGGCTCTGACCCGGAGGGAAAGGAAAATAATGTTAAGGAAGACT-CAAATCACC 3238
Query 3239 ATGGAAATGGTGTTACAGCACCTAGTTGTTTGGAATTGAAAACAGATATAGATGGCATGG 3298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3239 GTGGAAATGGTGTTACAGCACCTAGTTGTTTGGAATTGAAAACAGATATAGATGACATGG 3298
Query 3299 CAGTTGACACTGACACGGTGATCTCCAGTGGTTTGCCAAATGGTGGTAAGCGATATCCAG 3358
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3299 CAGTTGACACTGACACGGTGATCTCTAATGGTTTGCCAAATGGTGGGAAGCGATATCCAG 3358
Query 3359 AACTGGATGGGTCACCAAGTCGACTGGCTGATGACAGGGCCTCTAACGGTTCTCAAGATG 3418
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||
Sbjct 3359 AACTGGATGGGTCACCAAGTCGAGTGGCTGATGACAAGGCCTCTAATAGTTCTCAAAATG 3418
Query 3419 TAACCGGTCACCGGCACAATCTAATTGATAGCCTTCCACCAATCTCAACGACATTGAGGA 3478
||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3419 TAACC---CACCGGCACGATCTAATAGATAGCCTTCCACCAATCTCAACGACATTGAAGA 3475
Query 3479 TACGCTCCAAGAGAGTTTCAAGGGCTCCGGATACATCTTTGAGGCAAGAAGGAAAACCCT 3538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3476 TACGCTCCAAGAGAGTTTCAAGGGCTCCGGATACATCTTTGAGGCAAGAAGGAAAATCCT 3535
Query 3539 TATCAATAGATCAAGAGACTGGTGGCTCTGATGCAATAAATGATGGTTTTGAAGACGCTA 3598
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3536 TATCAATAGATCAAGAGACTGGTGGCTCTGATGCATTAAATGATGGTTTTGAAGATGCTA 3595
Query 3599 AATGTGATTTGGCATTGGACTGTCAAAAGGATGGTGTGGTTGGGACAGAGATATCTCTGC 3658
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 AATGTGATTTGACATTGGACTGTCAAAAGGATGGTGTGGTTGGGACAGAGATATCTCTGC 3655
Query 3659 GAAATGACTGTGTTCTGGAATTAAATCCTCAGATCAGTGATGCGCTCTCAATTGCTAATG 3718
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3656 GAAATGATTGTGTTCTGGAATTAAATCCTCAGATCTGTGATGCGCTCTCAATTGCTAATG 3715
Query 3719 ATGTTCCTGTGTCACACTCACATCCTAAACGGATGTTTGATTTTGTCTATAGACGAAAGT 3778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 ATGTTCCTGTGTCACACTCACATCCTAAACGGATGTTTGATTTTGTCTATAGACGAAAGT 3775
Query 3779 CACGGAAGCATAAGAACAACTTAGACAGGGATGCTGCTATTACTAAAGAAATCAGTCCAG 3838
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 3776 CACGGAAGCATAAGAACAACTTAGACAGGGATGCTGCTCTTACTAAAGAAGTCAGTCCAG 3835
Query 3839 GTTCTTGTAGTCAGGATCAGGGTAGTGGCTCTAAGTCCCATGAAGGTGCCTCTAATGGGT 3898
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3836 GTTCTTGTAGTCAGGATCATGGTAGTGGCTCTAAGTCCCATGAAGGTGCCTCTAATGGGT 3895
Query 3899 TCCATGGGACTCAGTTGAATGGATTAGAGAAGTCGGAAGGCAGTTTGACACACATCCAAG 3958
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3896 TCCATGGGACTGAGTTGAATGGATTAGAGAAGTCGGAAGGCAGTTTGACCCACATCCAAG 3955
Query 3959 ATAAAATAAGTGATTCACGTGGAAACCAAAACTCTCAGGAAGAATTGAGATCTGCTTCTG 4018
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3956 ATAAAATAAGTGATTCACGTGGAAACCAAAACTCTCAGGAAGAATTGAGATCCGCTTCTG 4015
Query 4019 GGGCAACACTTCGTTTGAGATCCACAAGAAATAGAAAGTCCACTTATCCTTTTAGTGAAA 4078
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 4016 GAGCAACACTTCGGTTGAGATCCACAAGAAATAGAAAGTCTACTTATCCCTTTAGTGAAA 4075
Query 4079 CTAAACCTATTGAAACAAAGAAGCCGCAACAGTTAATAGAAAATGTATCCTGGTTGACAT 4138
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4076 CTAAACCTATTGAAACAAAGAAGCCTCAGCAGTTAATAGAAAATGTATCCTGGTTGACAT 4135
Query 4139 TATCGATACATGAAGAGGGTTCTCGTTATATTCCACAAATGGGGGATGAAGTTGCGTATT 4198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4136 TATCGATACATGAAGAGGGTTCTCGTTATATTCCACAAATGGGGGATGAAGTTGCGTATT 4195
Query 4199 TGCGACAGGGGCATCAAGAATACTTAAACTTTAGCTCCCTGAGGGAGGTGGCTCCTTGGA 4258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4196 TGCGACAGGGGCATCAAGAATACTTAAACTTTAGCTCCCTGAGGGAAGTGGCTCCTTGGA 4255
Query 4259 CTTCAATAAAAGGAGGAATTATAAAGGCTGTGGAAATTTGTAAAGTGGAAAGTCTTGAAT 4318
| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4256 CATCAATAAAAGGAGGAAATATAAAGGCTGTAGAAATTTGTAAAGTGGAAAGTCTTGAAT 4315
Query 4319 ATGCAACTCTTCCTGGTTCTGGGGATAGCTGCTGCAAAATGATACTTAAGGTCATCGATC 4378
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4316 ATGCAACTCTGCCTGGTTCTGGGGATAGCTGCTGCAAAATGATACTTAAGGTCATCGATC 4375
Query 4379 CAAACTCCGAAGTGTTCAACAAAGCTTTCAAACTTACGTTGCCTGAGGTGGTGACCTTTC 4438
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 4376 CAAACTCCGAAGTGTTCAACAAAGCTTTCAAACTTACGTTGCCTGAAGTGGTGACGTTTC 4435
Query 4439 CAGATTTTCTTGTGGAAAGAAGTCGGTATGAAGCAGCAATACAGAGGAACTGGACTTGCA 4498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4436 CAGATTTTCTTGTGGAAAGAAGTCGGTATGAAGCAGCAATACAGAGGAACTGGACTTGCA 4495
Query 4499 GGGATAAGTGTAAGGTTTGGTGGAGAGACGAAGGCGAAGAAGATGGTAGTTGGTGGGAAG 4558
|||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4496 GGGACAAGTGTAAAGTTTGGTGGAGAGACGAAGGCGAAGAAGATGGTAGTTGGTGGGAAG 4555
Query 4559 GACGGATTCTAGCTGTGAAACCCAAATCACCTGATTTTCCTGATAGTCCGTGGGAGAGGT 4618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4556 GACGGATTCTAGCTGTGAAACCCAAATCACCTGATTTTCCTGATAGTCCGTGGGAGAGGT 4615
Query 4619 ACACTGTTAAGTACAAGAGTGACCCTGCCGAGACACATCTTCACAGTCCCTGGGAGCTTT 4678
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4616 ACACAGTTAAGTACAAGAGTGACCCTGCCGAGACACATCTTCACAGTCCCTGGGAGCTTT 4675
Query 4679 TTGATGCTGATACCAAGTGGGAGCCGCCTCACATTGATGATGAGCAACGAAACCGTTTGC 4738
||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4676 TTGATGCAGATACCAAGTGGGAGCAGCCTCACATTGATGATGAGCAACGAAACCGTTTGC 4735
Query 4739 TCTCGGCCTTAACAAAGTTAGAGACTTCAGACAAAAGAACCCAGGATTCTTATGGCCTCC 4798
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4736 TCTCGGCCTTAACAAAGTTAGAGACTTCAGACAAGAGAACCCAGGATTCTTTTGGCCTCC 4795
Query 4799 GAAAACTGAACCAGACCGTGGGAAACTCCAGCTACACCAACAGGTTCCCAGTTCCTTTGT 4858
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4796 GAAAACTGAACCAGACCGTGGGAAATTCCAGCTACTCCAACAGGTTCCCAGTTCCTTTGT 4855
Query 4859 CTCTTGAAGTAATCAGATCAAGGCTTGAGAACAACTATTACCGAAGTGTGGAAGCATTAA 4918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4856 CTCTTGAAGTAATCAGATCAAGGCTTGAGAACAACTATTACCGAAGTGTGGAAGCATTAC 4915
Query 4919 GACACGACGTAGCAGTTATGTTGTCGAATGCAGAAACTTTCTTTGGTCGAAATAAAAGCG 4978
||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4916 GACACGACGTATCAGTTATGTTGTCCAATGCAGAGACTTTCTTTGGTCGAAATAAAAGTG 4975
Query 4979 TAGCAGCCAAAATCTCAAATCTCTCTAACTGGTTCGACCGCATGCTACCTTCTTCGTAG 5037
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 4976 TAGCAGCCAAAATCTCAAATCTCTCTAACTGGTTCGACCGGACGCTACCTTCTTCGTAG 5034
> AT2G15030.1 | Symbols: | pseudogene, similar to LD40380p, blastp
match of 31% identity and 2.1e-06 P-value to GP|20151643|gb|AAM11181.1||AY094828
LD40380p {Drosophila melanogaster}
| chr2:6504367-6506172 FORWARD LENGTH=1806
Length=1806
Score = 185 bits (100), Expect = 3e-45
Identities = 172/206 (83%), Gaps = 8/206 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4838 ACAGGTTCCCAGTTCCTTTGTCTCTTGAAGTAATCAGATCAAGGCTTGAGAACAACTATT 4897
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1602 ACAGGTTCCCAGTTCCTTTGTCTCTTGAGGTAATAAGATCAAGGATTGAGAACAACTATT 1661
Query 4898 ACCGAAGTGTGGAAGCATTAAGACACGACGTAGCAGTTATGTTGTCGAATGCAGAAACTT 4957
|||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| | || |||||||| ||||
Sbjct 1662 ACCGGAGTATGGAAGCGTTAAGGCACGATGTATCAGTTATGCTATCCAATGCAGAGACTT 1721
Query 4958 TCTTTGGTCGAAATAAA-----AGC-GTAGCAGCCAAAATCTCAAATCTCTCT-AACTGG 5010
|||||| || ||| ||| || ||||||| |||||| ||| |||| ||| || |||
Sbjct 1722 TCTTTGATCTAAACAAATGTGTAGGTGTAGCAGTCAAAATTTCAGATCTTTCTCAA-TGG 1780
Query 5011 TTCGACCGCATGCTACCTTCTTCGTA 5036
|||||||||| | | |||||| |||
Sbjct 1781 TTCGACCGCACGTTGTCTTCTTTGTA 1806
Score = 143 bits (77), Expect = 2e-32
Identities = 108/123 (88%), Gaps = 2/123 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 4084 CCTATTGAAACAAAGAAGCCGCAACAGTTAATAGAAAATG-TATCCTGGTTGACATTATC 4142
||| |||||| | |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||
Sbjct 562 CCTTTTGAAATATTGAAGCCTCAACAGTTAAAAGAAAA-GTTATCTTGGTTGACATTATC 620
Query 4143 GATACATGAAGAGGGTTCTCGTTATATTCCACAAATGGGGGATGAAGTTGCGTATTTGCG 4202
|||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||
Sbjct 621 GATACATGAAGAGGATTGTCGTTATATTCTACAAAAGGAGGATGAAGTTGCGAATTTGCG 680
Query 4203 ACA 4205
|||
Sbjct 681 ACA 683
> AT2G15029.1 | Symbols: | unknown protein; Has 30201 Blast hits
to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria -
1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses
- 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | chr2:6504070-6504171
REVERSE LENGTH=102
Length=102
Score = 106 bits (57), Expect = 2e-21
Identities = 65/69 (94%), Gaps = 0/69 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1454 ATGATAACATAGTTACATGCTCTCGTGATGGTAGTGCAATCATTTGGATCCCAAGATTGC 1513
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 100 ATGATAACATAGTTACATGCTCTAGTGATGGTAGTGCAATCATTTGGATCCCAAGATCAC 41
Query 1514 GGAGATCGC 1522
|||| ||||
Sbjct 40 GGAGTTCGC 32
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 251336384430
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5