BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495046
Length=2339
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G49910.1 | Symbols: CPHSC70-2EAT SHOCK PROTEIN 70-2, HSC70-7... 3834 0.0
AT4G24280.1 | Symbols: cpHsc70-1 | chloroplast heat shock prote... 2218 0.0
> AT5G49910.1 | Symbols: CPHSC70-2EAT SHOCK PROTEIN 70-2, HSC70-7,
cpHsc70-2 | chloroplast heat shock protein 70-2 | chr5:20303414-20306469
FORWARD LENGTH=2387
Length=2387
Score = 3834 bits (2076), Expect = 0.0
Identities = 2268/2358 (96%), Gaps = 23/2358 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 GGTTTTTTCAATCTCTC-TTCTCCAGA-AATGGCTTCCTCCGCCGCCCAAATTCACATCC 58
|||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 GGTTTTATCAATCTCTCATT-TCCA-ACCATGGCTTCCTCCGCCGCCCAAATTCACATCC 87
Query 59 TCGGCGGAATCGGATTCCCTA-------------CT--TCCGGCAAAAACCTCGACAACA 103
||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||
Sbjct 88 TCGGCGGAATCGGATTCCCTACTTCGTCTTCTTCCTCCTCCACCAAAAACCTCGACAACA 147
Query 104 AAACCAATTCCATTCCACGAAGCGTCTTCTTCGGCAACAGAACAAGTCCTTTCTCTACTC 163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 148 AAACCAATTCCATTCCACGAAGCGTCTTCTTCGGCAACAGAACAAGTCCTTTCACTACTC 207
Query 164 CAACCTCCGCCTTCCTTCGTATGGGACGAAGAAACAACAACGCTTCCCGTTACACCGTTG 223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 208 CAACCTCCGCCTTCCTTCGTATGGGACGAAGAAACAACAACGCTTCCCGATACACCGTTG 267
Query 224 GTCCAGTCCGTGTTGTTAACGAGAAAGTCGTCGGAATCGATTTAGGTACGACGAACTCAG 283
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 268 GTCCAGTCCGTGTGGTTAACGAGAAAGTCGTCGGAATCGATTTAGGCACGACGAATTCAG 327
Query 284 CCGTAGCTGCTATGGAAGGAGGTAAACCAACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAAAGAA 343
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328 CTGTTGCTGCTATGGAAGGAGGTAAACCAACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAAAGAA 387
Query 344 CTACGCCTTCTGTTGTTGCTTATACTAAGAGTAAAGATAGACTTGTTGGTCAGATTGCGA 403
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 388 CTACACCTTCTGTTGTGGCTTATACTAAGAGTAAAGATAGACTTGTTGGTCAGATTGCTA 447
Query 404 AACGTCAAGCTGTTGTTAATCCGGAGAATACTTTCTTCTCTGTTAAGAGGTTTATTGGTA 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 AACGTCAAGCTGTTGTTAATCCGGAGAATACTTTCTTCTCTGTTAAGAGGTTTATTGGTA 507
Query 464 GGAGAATGAATGAAGTTGCTGAAGAGTCGAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTATTAAAGATG 523
| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508 GAAGAATGAATGAAGTTGCTGAAGAGTCTAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTATTAAAGATG 567
Query 524 AGAATGGTAATGTTAAGCTTGATTGTCCTGCTATTGGTAAACAATTTGCTGCTGAGGAGA 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 AGAATGGTAATGTTAAGCTTGATTGTCCTGCTATTGGTAAACAATTTGCTGCTGAGGAGA 627
Query 584 TTTCTGCTCAGGTTTTGAGGAAGCTTGTGGATGATGCTTCGAGATTCTTGAATGATAAAG 643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 628 TTTCTGCTCAGGTTTTGAGGAAGCTTGTGGATGATGCTTCGAGATTTTTGAATGATAAAG 687
Query 644 TAACCAAAGCTGTTATCACTGTGCCTGCTTACTTCAATGATTCACAGAGGACAGCTACTA 703
|||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 688 TAACGAAAGCTGTCATCACTGTGCCTGCTTACTTCAATGATTCACAAAGGACGGCTACTA 747
Query 704 AAGATGCTGGTCGTATTGCTGGATTGGAAGTTCTTAGGATTATTAATGAGCCTACTGCTG 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748 AAGATGCTGGTCGTATTGCTGGATTGGAAGTTCTTAGGATTATTAATGAGCCTACTGCTG 807
Query 764 CTTCTTTGGCTTATGGGTTTGAGAGGAAAAGCAATGAAACTATTCTTGTCTTTGATCTTG 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 808 CTTCTTTGGCTTATGGGTTTGAGAGGAAAAGCAATGAAACTATTCTTGTTTTTGATCTTG 867
Query 824 GTGGTGGTACCTTCGATGTCTCAGTCCTTGAGGTTGGTGATGGTGTTTTTGAAGTGCTTT 883
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 868 GTGGTGGTACTTTTGATGTCTCAGTCCTTGAGGTTGGTGACGGTGTTTTTGAAGTGCTTT 927
Query 884 CTACATCTGGTGATACACATTTGGGAGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGC 943
| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 928 CGACTTCTGGTGATACACATTTGGGAGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTCGTTGATTGGC 987
Query 944 TTGCTTCAACTTTCAAGAAAGATGAAGGTATAGATCTTCTCAAAGACAAGCAAGCGCTTC 1003
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 TTGCTTCAACCTTCAAGAAGGATGAAGGTATAGATCTTCTCAAAGACAAGCAAGCGCTTC 1047
Query 1004 AGAGGTTAACTGAGGCAGCTGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCACTGACTCAGACAA 1063
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1048 AGAGGTTGACGGAGGCAGCTGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCACTGACTCAGACAA 1107
Query 1064 ACATGAGTTTGCCTTTTATCACTGCAACGGCTGATGGGCCTAAGCACATTGAAACTACTC 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1108 ACATGAGTTTGCCTTTTATCACTGCAACGGCTGATGGGCCTAAGCACATTGAAACCACTC 1167
Query 1124 TCACCCGGGCCAAGTTTGAAGAATTGTGCTCTGACTTACTCGACAGGGTCAGGACACCTG 1183
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 TCACCAGGGGCAAGTTTGAAGAATTGTGCTCTGACTTACTCGACAGGGTCAGGACACCTG 1227
Query 1184 TGGAGAATTCCCTGAGGGATGCAAAACTCAGCTTCAAAGATATTGATGAGGTGATCCTTG 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 TGGAGAATTCCCTGAGGGATGCAAAACTCAGCTTCAAAGATATTGATGAGGTGATCCTTG 1287
Query 1244 TTGGTGGATCCACACGTATTCCTGCTGTTCAGGAACTTGTAAGGAAGCTGACAGGGAAAG 1303
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1288 TTGGTGGATCCACACGTATCCCTGCTGTTCAGGATCTTGTAAGGAAGCTGACAGGAAAAG 1347
Query 1304 AACCCAATGTCTCAGTCAATCCTGATGAAGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTTCAGGCTG 1363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1348 AACCCAATGTCTCAGTCAATCCTGATGAAGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTTCAGGCCG 1407
Query 1364 GTGTTCTATCTGGAGATGTGAGTGACATTGTTCTTCTTGATGTGACGCCGTTATCGCTTG 1423
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1408 GTGTTCTATCAGGAGATGTGAGTGACATTGTTCTTCTTGATGTGACGCCGCTATCGCTTG 1467
Query 1424 GTTTGGAAACTCTTGGTGGTGTCATGACCAAGATTATACCAAGAAACACCACACTTCCAA 1483
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468 GTTTGGAAACTCTTGGTGGTGTCATGACCAAGATCATTCCAAGAAACACCACACTTCCAA 1527
Query 1484 CTTCTAAGTCAGAAGTCTTCTCAACCGCTGCAGATGGACAGACAAGCGTTGAGATTAATG 1543
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528 CTTCTAAGTCAGAAGTCTTCTCAACTGCTGCAGATGGACAGACAAGCGTTGAGATTAATG 1587
Query 1544 TGTTACAGGGTGAGAGAGAGTTCGTAAGAGATAACAAGTCTATTGGTAGCTTCCGTCTTG 1603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1588 TGTTACAGGGTGAGAGAGAGTTCGTAAGAGATAACAAGTCTATTGGTAGCTTCCGTCTTG 1647
Query 1604 ATGGTATTCCGCCTGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAGGTCAAATTCGACATTGATG 1663
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648 ATGGTATTCCACCTGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAGGTCAAATTCGACATTGATG 1707
Query 1664 CCAATGGAATTCTATCTGTCAGTGCTTCGGACAAAGGCACAGGAAAGAAGCAGGACATCA 1723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1708 CCAATGGAATTCTATCTGTCAGTGCTTCGGACAAAGGTACAGGAAAGAAGCAGGACATCA 1767
Query 1724 CCATTACTGGTGCTAGTACCTTGCCTAAGGATGAGGTAGACACAATGGTGCAAGAAGCAG 1783
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 CCATTACTGGTGCTAGTACCTTACCAAAGGATGAGGTAGACACAATGGTGCAAGAAGCAG 1827
Query 1784 AGAGGTTTGCAAAGGAAGACAAAGAAAAGAGAGATGTGATTGACACAAAGAACCAGGCTG 1843
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1828 AGAGGTTTGCAAAGGAAGACAAAGAAAAGAGAGATGCGATTGACACAAAGAACCAGGCTG 1887
Query 1844 ATTCCGTAGTTTACCAGACGGAGAAGCAGCTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTC 1903
| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1888 ACTCCGTCGTTTACCAGACAGAGAAGCAGCTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTC 1947
Query 1904 CAGTGAAAGAAAAGGTTGAGGCTAAGCTCCAAGAGCTGAAGGAAAAGATAGGAAGCGGAT 1963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||
Sbjct 1948 CAGTGAAAGAAAAGGTTGAGGCTAAGCTCCAAGAGCTGAAGGAGAAGATAGCAAGCGGAT 2007
Query 1964 CAACTCAAGAAATCAAAGACACCATGGCAGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGCC 2023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2008 CAACTCAAGAAATCAAAGACACCATGGCAGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGCC 2067
Query 2024 AGTCTCTGTACAACCAACCCCAACCAGGTGGTGCTGGTTCTCCTCCTGGAGGTGAAGCTT 2083
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 AGTCTCTGTACAACCAACCCCAACCAGGTGGTGCTGATTCTCCTCCTGGAGGTGAAGCTT 2127
Query 2084 CCTCGTCGTCTGACTCATCATCTTCAGCCAAAGGTGGAGACAACGGTGGTGATGTGATTG 2143
|||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2128 CCTCGTCGTCTGACACATCATCCTCAGCCAAAGGTGGAGACAACGGCGGTGATGTGATTG 2187
Query 2144 ACGCTGACTTCACAGACAGCAAATAATACAAATTGGATTCATACAAGGATTATTTCTGGG 2203
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2188 ACGCTGACTTCACAGACAGCAATTAATACGAATTGGATTCATACAAGGATTATTTATGGG 2247
Query 2204 GTTTGTCCATGATTTTGTAGGAAGGATAATGTGATTTGTGGGCAACAAATGAATGGTAAG 2263
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 2248 GTTTGTCCATGATTTTGTAGGAATGATAATGTGATTTGTTGGCAGCAAATGAATGGTAAG 2307
Query 2264 AGTCAAATTTTGTCTTTTTAAACACAT-ACGTGAAGCAATATTCTGGAGAACATATTGTC 2322
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2308 AGTCAAATTTTGTCTTTTTAAACACATGAT-TGAAGCAATATTCTGGAGCACATATTGTC 2366
Query 2323 CATAGAA-GCAGTGTTGT 2339
||| || ||||||||||
Sbjct 2367 GATA-AATGCAGTGTTGT 2383
> AT4G24280.1 | Symbols: cpHsc70-1 | chloroplast heat shock protein
70-1 | chr4:12589988-12593630 FORWARD LENGTH=2456
Length=2456
Score = 2218 bits (1201), Expect = 0.0
Identities = 1789/2071 (86%), Gaps = 47/2071 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 122 GAAGCGTCTTCTTCGGCAAC-AGAACAAGTCCTTTCTCTACTCCAACCTCCGCCTTCCTT 180
|||| | ||||||||| || ||||| |||||||||| || || || || || || | |
Sbjct 213 GAAGTGCCTTCTTCGG-TACAAGAACCGGTCCTTTCTCCACACCCACTTCTGCTTTTC-T 270
Query 181 C-GTATGGG-ACGAAGAAA---CAACAACGCTTCCCGTTACACCGTTGGTCCAGTCCGTG 235
| | ||||| || ||||| | | |||||| | ||| | |||||||| || ||||
Sbjct 271 CAGAATGGGCAC-CAGAAATGGCGGCGGCGCTTCTAGATACGCGGTTGGTCCGGTTCGTG 329
Query 236 TTGTTAACGAGAAAGTCGTCGGAATCGATTTAGGTACGACGAACTCAGCCGTAGCTGCTA 295
| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 330 TGGTTAACGAGAAGGTTGTTGGAATTGATTTGGGTACGACTAACTCTGCAGTAGCTGCTA 389
Query 296 TGGAAGGAGGTAAACCAACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAAAGAACTACGCCTTCTG 355
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||
Sbjct 390 TGGAAGGAGGTAAGCCTACGATTGTGACTAACGCTGAAGGTCAGAGGACAACGCCTTCTG 449
Query 356 TTGTTGCTTATACTAAGAGTAAAGATAGACTTGTTGGTCAGATTGCGAA-ACGTCAAGCT 414
|||| ||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||
Sbjct 450 TTGTGGCTTACACGAAGAGTGGTGATAGGCTTGTTGGGCAGATTGCGAAGA-GGCAAGCT 508
Query 415 GTTGTTAATCCGGAGAATACTTTCTTCTCTGTTAAGAGGTTTATTGGTAGG-AGAATGAA 473
||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 509 GTTGTTAATCCCGAGAATACTTTCTTCTCAGTGAAGAGGTTTATTGGTAGGAAG-ATGAA 567
Query 474 TGAAGTTGCTGAAGAGTCGAAGCAGGTTTCTTATAGAGTTATTAAAGATGAGAATGGTAA 533
|| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||
Sbjct 568 CGAGGTTGATGAAGAGTCTAAGCAGGTTTCTTACAGAGTTGTTAGAGATGAGAACAATAA 627
Query 534 TGTTAAGCTTGATTGTCCTGCTATTGGTAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCTGCTCA 593
|||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 628 TGTTAAGCTTGAGTGTCCTGCCATTAACAAACAATTTGCTGCTGAGGAGATTTCAGCTCA 687
Query 594 GGTTTTGAGGAAGCTTGTGGATGATGCTTCGAGATTCTTGAATGATAAAGTAACCAAAGC 653
|||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||
Sbjct 688 GGTTCTAAGGAAACTTGTGGATGATGCATCAAGATTCTTGAACGACAAAGTAACCAAGGC 747
Query 654 TGTTATCACTGTGCCTGCTTACTTCAATGATTCACAGAGGACAGCTACTAAAGATGCTGG 713
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 748 TGTCATCACTGTGCCTGCTTACTTCAACGATTCACAGAGGACAGCTACAAAAGATGCTGG 807
Query 714 TCGTATTGCTGGATTGGAAGTTCTTAGGATTATTAATGAGCCTACTGCTGCTTCTTTGGC 773
||| |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 808 TCGAATTGCTGGGTTGGAAGTTCTTCGTATTATCAATGAGCCCACAGCTGCTTCATTGGC 867
Query 774 TTATGGGTTTGAGAGGAAAAG-CAATGAAACTATTCTTGTCTTTGATCTTGGTGGTGGTA 832
|||||||||||| | |||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 868 TTATGGGTTTGACA-GAAAAGCCAATGAAACAATCCTAGTCTTCGATCTTGGTGGTGGTA 926
Query 833 CCTTCGATGTCTCAGTCCTTGAGGTTGGTGATGGTGTTTTTGAAGTGCTTTCTACATCTG 892
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 927 CCTTTGATGTCTCAGTGCTTGAGGTTGGTGATGGTGTGTTTGAAGTGCTTTCCACTTCTG 986
Query 893 GTGATACACATTTGGGAGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTTCA- 951
| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 987 GCGACACACACTTGGGTGGTGATGACTTTGACAAGAGAGTTGTTGATTGGCTTGCTGCAG 1046
Query 952 ACTTTCAAGAAAGATGAAGGTATAGATCTTCTCAAAGACAAGCAAGCGCTTCAGAGGTTA 1011
| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1047 AATT-CAAGAAAGACGAAGGGATAGATCTTCTGAAAGACAAGCAAGCTCTTCAGAGGTTA 1105
Query 1012 ACTGAGGCAGCTGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCCTCACTGACTCAGACAAACATGAGT 1071
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1106 ACAGAGGCAGCAGAAAAAGCTAAAATTGAGCTTTCTTCACTGACTCAGACAAATATGAGC 1165
Query 1072 TTGCCTTTTATCACTGCAACGGCTGATGGGCCTAAGCACATTGAAACTACTCTCACCCGG 1131
|| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||
Sbjct 1166 TTACCTTTTATCACGGCCACAGCTGATGGACCTAAACACATAGAAACCACCCTCACACGT 1225
Query 1132 GCCAAGTTTGAAGAATTGTGCTCTGACTTACTCGACAGGGTCAGGACACCTGTGGAGAAT 1191
|||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1226 GCCAAGTTCGAAGAATTGTGTTCAGATTTACTTGACAGGGTCAGGACTCCTGTCGAGAAT 1285
Query 1192 TCCCTGAGGGATGCAAAACTCAGCTTCAAAGATATTGATGAGGTGATCCTTGTTGGTGGA 1251
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 1286 TCCCTGCGGGATGCAAAGCTCAGCTTCAAAGATATTGATGAAGTCATCCTTGTCGGTGGA 1345
Query 1252 TCCACACGTATTCCTGCTGTTCAGGAACTTGTAAGGAAGCTGACAGGGAAAGAACCCAAT 1311
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||
Sbjct 1346 TCCACACGTATTCCTGCTGTTCAGGAACTCGTGAGGAAGGTGACTGGGAAAGAACCTAAT 1405
Query 1312 GTCT-CAGTCAATCCTGATGAAGTTGTAGCTTTAGGTGCTGCAGTTCAGGCTGGTGTTCT 1370
|| | |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1406 GT-TACAGTAAATCCTGACGAGGTTGTAGCGTTAGGTGCTGCAGTCCAGGCTGGTGTTCT 1464
Query 1371 AT-CTGGAGATGTGAGTGACATTGTTCTTCTTGATGTGACGCCG-TTATCGCTTGGTTTG 1428
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||
Sbjct 1465 -TGCTGGAGATGTGAGTGACATTGTGCTTCTTGATGTGACACCGCTT-TCGATTGGTTTG 1522
Query 1429 GAAACTCTTGGTGGTGTCATGACCAAGATTATACCAAGAAACACCACACTTCCAACTTCT 1488
|| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||
Sbjct 1523 GAGACCCTAGGTGGTGTTATGACTAAGATTATTCCAAGGAACACCACACTGCCTACTTCT 1582
Query 1489 AAGTCAGAAGTCTTCTCAACCGCTGCAGATGGACAGACAAGCGTTGAGATTAATGTGTTA 1548
|| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1583 AAATCAGAAGTCTTTTCAACTGCTGCTGATGGACAGACAAGTGTTGAGATTAATGTGTTG 1642
Query 1549 CAGGGTGAGAGAGAGTTCGTAAGAGATAACAAGTCTATTGGTAGCTTCCGTCTTGATGGT 1608
||||||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1643 CAGGGTGAGAGGGAGTTTGTTAGGGATAACAAGTCTCTTGGTAGCTTCCGTCTAGATGGT 1702
Query 1609 ATTCCGCCTGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAGGTCAAATTCGACATTGATGCCAAT 1668
|| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1703 ATCCCCCCTGCACCACGTGGAGTTCCACAAATCGAAGTCAAATTTGACATTGATGCCAAT 1762
Query 1669 GGAATTCTATCTGTCAGTGCT-TCGGACAAAGGCACAGGAAAGAAGCAGGACATCACCAT 1727
||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1763 GGAATTCTATCTGTCAGTGCTGTTG-ACAAGGGCACAGGAAAGAAGCAAGACATCACCAT 1821
Query 1728 TACTGGTGCTAGTACCTTGCCTAAGGATGAGGTAGACACAA-TGGTGCAAGAAGCAGAGA 1786
|||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| || || ||||| |
Sbjct 1822 TACTGGCGCAAGTACATTGCCCAAGGATGAGGTAGAC-CAAATGGTCCAGGAGGCAGAAA 1880
Query 1787 GGTTTGCAAAGGAAGACAAAGAAAAGAGAGATGTGATTGACAC-AAAGAACCAGGCTGAT 1845
| |||||||| || |||||||| |||||||| | || ||||| ||| ||||| || |||
Sbjct 1881 GATTTGCAAAAGATGACAAAGAGAAGAGAGACGCAATCGACACGAAA-AACCAAGCAGAT 1939
Query 1846 TCCGTAGTTTACCAGACGGAGAAGCAGCTTAAAGAACTTGGAGAGAAAATTCCAGGTCCA 1905
|| || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1940 TCAGTGGTGTACCAGACAGAGAAGCAACTGAAAGAACTAGGAGAGAAAATTCCAGGTGAA 1999
Query 1906 GTGAAAGAAAAGGTTGAGGCTAAGCTCCAAGAGCTGAAGGAAAAGATAGGAAGCGGATCA 1965
|||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct 2000 GTGAAAGAGAAGGTGGAGGCTAAGCTACAAGAGCTGAAAGACAAGATAGGAAGTGGATCA 2059
Query 1966 ACTCAAGAAATCAAAGACACCATGGCAGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGCCAG 2025
|| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2060 ACCCAAGAAATCAAAGACGCCATGGCTGCTCTTAACCAAGAAGTGATGCAGATTGGTCAG 2119
Query 2026 TCTCTGTACAACCAACCCCAACC---AGGT---GGTGCTGGTTCT-CCTCCTGGAGGTGA 2078
||||| |||||||| || | | |||| ||||| ||| || || || ||||| ||
Sbjct 2120 TCTCTATACAACCAGCCTGGAGCTGGAGGTCCAGGTGCAGGTCCTTCC-CCGGGAGGCGA 2178
Query 2079 AGCTTCCTCGTC-GTCTGACTCATCATCTTCA-GCCAAAGGTGGAGACAACGGTGGTGAT 2136
|| | | || || | || | ||||||||| | ||||| ||||| |||| ||||
Sbjct 2179 AGGTGCTTCATCAGGA-GA-T--TCATCTTCAAGT-AAAGGAGGAGAT---GGTGATGAT 2230
Query 2137 GTGATTGACGCTGACTTCACAGACAGCAAAT 2167
||||| || |||||||||||||||||| |||
Sbjct 2231 GTGATCGATGCTGACTTCACAGACAGCCAAT 2261
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 116113860585
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5