BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495190
Length=5602
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G51200.1 | Symbols: | Protein of unknown function (DUF3414)... 7535 0.0
> AT5G51200.1 | Symbols: | Protein of unknown function (DUF3414)
| chr5:20804926-20819592 FORWARD LENGTH=5701
Length=5701
Score = 7535 bits (4080), Expect = 0.0
Identities = 4350/4483 (97%), Gaps = 8/4483 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1124 AGGTGAAGGAATCAAAGGACATGGCTATGAGTGTTCTAAATTCTTACCGAACTTGTGATT 1183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1214 AGGTGAAGGAATCAAAGGACATGGCTATGAGTGTTCTAAATTCTTACCGAACTTCTGATC 1273
Query 1184 CGCTTGATGGAAGTATGCAGACTGAAGAGGCTGACAGGCCACTGCCCTTCATTTCTCTTA 1243
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 CGCTTGATGGAAGTATGCAGACTGAAGAGTCTGACAGGCCACTGCCCTTCATTTCTCTTA 1333
Query 1244 TGGAGTTTAAGGAACCTGAGCTACTCTCCGGGAATGATGTCTTGTGGACATTTGTGAATT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1334 TGGAGTTTAAGGAACCTGAGCTACTCTCCGGGAATGATGTCTTGTGGACTTTTGTGAATT 1393
Query 1304 TTGCTGGAGAGGACCACACAAATTTTAAAACTCTTGTGGCTTTCTTGGAAATGCTGTGTA 1363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394 TTGCTGGAGAGGACCACACAAATTTTAAAACTCTTGTGGCTTTCTTGGAAATGCTGTGTA 1453
Query 1364 CCTTGGCTTCCACTCAGGAAGGTGCTTCTAAAGTTTATGAGTTGCTCCGGGGTACATCAT 1423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454 CCTTGGCTTCCACTCAGGAAGGTGCTTCTAAAGTTTATGAGTTGCTCCGGGGTACATCAT 1513
Query 1424 TCCGCAGTATAGGATGGGCCACTTTGTTTGATTGTATAAGAATTTACGATGAGAAGTTCA 1483
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1514 TTCGCAGTATAGGATGGCCCACTTTGTTTGATTGTATAAGAATTTACGATGAGAAGTTCA 1573
Query 1484 AGCAGTCTCTTCAAACTGCTGGAGCCATGATGCCAGAGTTCCTGGAGGGCGATGCAAAAG 1543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 AGCAGTCTCTTCAAACTGCTGGAGCCATGATGCCAGAGTTCCTGGAGGGCGATGCAAAAG 1633
Query 1544 CACTTGTCGCATATCTGAATGTACTTCAGAAGGTTGTTGAGAATGGTAATCCCACTGAGA 1603
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1634 CACTTGTCGCTTATCTGAATGTACTTCAGAAGGTTGTTGAAAATGGTAATCCCACTGAGA 1693
Query 1604 GGAAAAACTGGTTTCCTGATATCGAACCATTTTTTAAGCTTCTTGGTTATGAAAACATCC 1663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 1694 GGAAAAACTGGTTTCCTGATATCGAACCATTTTTTAAGCTTCTGGGTTACGAAAACATCC 1753
Query 1664 CTCCATACCTGAAGGGTGCTCTTAGAAAGACCATTGCTGCCTTTGTTTATGTCTTTCCAG 1723
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1754 CTCCATATCTGAAGGGTGCTCTTAGAAAGACCATTGCTGCCTTTGTTAATGTCTTTCCAG 1813
Query 1724 AAATGAGGGACTCTATCTGGGCTTTTCTTGAGCAGTATGATCTGCCTGTTGTTGTGGGAT 1783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1814 AAATGAGGGACTCTATCTGGGCTTTTCTTGAGCAGTATGATCTGCCTGTTGTTGTGGGAT 1873
Query 1784 CACCAGTTGGAAAGAGTGACCAATCTTCTCAGGTCTATGATATGCAATTTGAGTTAAATG 1843
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1874 CACAAGTTGGAAAGAGTGACCAATCTTCTCAGGTCTATGATATGCAATTTGAGTTAAATG 1933
Query 1844 AAGTGGAAGCAAGGAGAGAACAATATCCTTCAACAATATCGTTCCTTAATCTTATAAACG 1903
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1934 AAGTGGAAGCAAGGAGAGAACAGTATCCTTCAACAATATCGTTCCTTAATCTTATAAATG 1993
Query 1904 CTCTGATTGCTGGGGAGAAAGATGTGAATGATCGTGGGCGTAGGGCATATTCTGATCCTT 1963
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1994 CTCTGATTGCTGGAGAGAAAGATGTGAATGATCGTGGGCGTAGGGCATATTCAGATCCCT 2053
Query 1964 GTGAGAAGTGGCAATTGGTTGTGGCATGCCTTCAGCATTTTCATATGGTCTTAAGCATGT 2023
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 2054 GTGAGAAGTGGCAATTGGTTGTGGCATGCCTTCAACATTTTCACATGATCTTAAGCATGT 2113
Query 2024 ATGATATTCAGGAGGAGGATCTAGATGGATTTACTGAGCATCCACATTTTCTGGTGTCAG 2083
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2114 ATGATATTCAGGAGGAGGATCTTGATGGATTTACTGAGCATCCACATTTTCTGGTGTCAC 2173
Query 2084 TTGAAACATCTTCACTGCAAACGCAGCTACCAATTATAGAATTACTAAAAGATTTCATGA 2143
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2174 TTGAAACATCTTCACTGCAAACGCAGCTGCCAATTATAGAATTACTAAAAGATTTCATGA 2233
Query 2144 GTGGGAAAGCTCTTTATAGGAACCTCATGGGTATCCTTCAGGTTGGGGTCAATTCCATCA 2203
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2234 GTGGGAAAGCTCTCTATAGGAACCTCATGGGTATCCTTCAGGTTGGGGTCAATTCCATCA 2293
Query 2204 TCAGCGAGCGATTGAGTAAAACTTATGGGAAGATCTTGGAAAAGGCTGTACAACTTTCTT 2263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 TCAGCGAGCGATTGAGTAAAACTTATGGGAAGATCTTAGAAAAGGCTGTACAACTTTCTT 2353
Query 2264 TGGAAATCTTACTGCTCATCTTTGAGAAGGATTTGCTTGTTTCCGATGTTTGGCGTCCAC 2323
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2354 TGGAAATCTTACTACTCGTCTTTGAGAAGGATTTGCTTGTTTCCGATGTTTGGCGTCCGC 2413
Query 2324 TGTACCAGCCTTTGGATATAATTCTCTCACAAGATCATAATCAAATTATTGCCTTGTTGG 2383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2414 TGTACCAGCCTTTGGATATAATTCTCTCACAAGATCATAATCAAATTATAGCCTTGTTGG 2473
Query 2384 AGTATGTCAGATATGATTCTCTTCCTCAGATTCAGCGATCTTCAATCAAAATCATGAACA 2443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2474 AGTATGTCAGATATGATTCTCTTCCTCAGATTCAGCGATCTTCAATCAAAATCATGAACA 2533
Query 2444 TTTTAAGGTGTTCTCGCTTGGTTGGACTTGTTCCAATGCTGATCAAAATTGATGCTGCGA 2503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 TTTTAAGGTGTTCTCGCTTGGTTGGACTTGTTCCAATGCTGATCAAAATTGATGCTGCGA 2593
Query 2504 ATTCCTTGATCGAGGATTATGCGGCCTGCCTTGAGGTACGACTTGAAGAGGGTGAAGTTG 2563
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2594 ATTCCTTGATTGAGGATTATGCCGCCTGCCTTGAGGGACGACTTGAAGAGGGTGAAGTTG 2653
Query 2564 TAGAGAACAGTTGTGATGATCTAGGGGTCCTTATTATGCAGCTTCTGGTTGATAATATCA 2623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2654 TAGAGAACAGTTGTGATGATCTAGGGGTCCTTATTATGCAGCTTCTGGTTGATAATATCA 2713
Query 2624 ACCGGCCTGCACCAAGCATCACACATTTGCTTCTGAAGTTTGACCTTGATGCCCCCGTGG 2683
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 2714 ACCGGCCTGCCCCAAGTATCACACATTTGCTTCTGAAGTTTGATCTTGATGCCCCTGTGG 2773
Query 2684 AAGGGACAGTTTTGCAGCCTAAGTTCCACTACAGTTGTCTGAAGGTCATTCTTGAAATGC 2743
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2774 AAGGGACAGTTTTGCAGCCGAAGTTTCACTACAGTTGTCTGAAGGTCATTCTTGAAATGC 2833
Query 2744 TGGAGAAGCTTCCAAACCCCGATATAAACTTCTTACTCTTTGAGTTTGGTTTTCAGCTTT 2803
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2834 TGGAGAAGCTTCCAAACCCTGATATAAACTTCTTACTCTTTGAGTTTGGCTTCCAGCTTT 2893
Query 2804 TGTGTGAGTTGAATTTGGATCCATTAACTAGTGGTCCAACCATGGATCTCTTGAGCAGCA 2863
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2894 TGTGTGAGTTGAATTTGGATCCACTAACTAGTGGTCCAACCATGGATCTATTGAGCAGCA 2953
Query 2864 AGAAATATCAGTTTTTTCTCCAGCACCTCGATACCATTGGTGTTGCCACTCTTCCAAAAA 2923
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954 AAAAATATCAGTTTTTTCTCCAGCACCTCGATACCATCGGTGTTGCCACTCTTCCAAAAA 3013
Query 2924 GAAGTGGCAGCCAGGCACTCCGTATTAGTTCCCTTCATCAGAGGGCGTGGCTATTAAAGC 2983
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3014 GAAGTGGCAGCCAAGCACTCCGTATTAGTTCCCTTCATCAGAGGGCGTGGCTATTAAAGC 3073
Query 2984 TCTTAGCTATTGCATTGCATACTGGTTCTGGAAGCAGTTCAGCTCACCTAGAGGCATGTC 3043
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3074 TCCTAGCTATTGCACTGCATACTGGTTCTGGAAGCAGTTCAGCTCACCTAGAGGCATGTC 3133
Query 3044 AGAGCATACTTTCTCATCTTTTTGGGCGGGAGGTAACTGAAGCAGCGAATGAACTTTTTT 3103
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3134 AGAGCATACTTTCTCATCTTTTTGGGCGGGAGGTAACTGAAGCAGCGAATGAACCTTTTT 3193
Query 3104 CTTCCAGTACATATCCTCAGGATGGTCTTGATTATGCTGGTACTAGTTCAATCAGTAAAA 3163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3194 CTTCCAGTACATATCCTCAGGATGGTCTTGATTATGCTGGAACTAGTTCAATCAGTAAAA 3253
Query 3164 GTAAGGCATTGGCTTTGCTTGAAATTCTTCAGTTTAGATCTCCTGATGCTTCGATGCAGC 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3254 GTAAGGCATTGGCTTTGCTTGAAATTCTTCAGTTTAGATCTCCTGATGCTTCGATGCAGC 3313
Query 3224 TTCCTCAAATTGTGTCAAGCCGAAAGTATGACTCACTGGTGGAGGACATACTTGGGAACC 3283
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3314 TTCCTCAAATTGTGTCAAGCCTAAAGTATGACTCATTGGTGGAGGACATACTTGGGAACC 3373
Query 3284 GTGATACCTCTGTTAGCGGCAGTATCTACTATTATTCTGAGCGTGGGGATCGGCTAATTG 3343
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3374 GTGATACCTCTGTTAGCGGCAGTATTTACTATTATTCTGAGCGTGGTGATCGGCTAATTG 3433
Query 3344 ATCTATCTTCCTTCAGCAACAAACTCTGGCAGAAACTTCATTCTGGATTTCCCCTAGTGG 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 3434 ATCTATCTTCCTTCAGCAACAAACTCTGGCAGAAACTACATTCTGGATTTCCCCTAGTAG 3493
Query 3404 ATAGTTTTCCAAATGTTGCTGAGCTTAGTGAAGCTAGAGAGACAATCCAACAGCTGTTGA 3463
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3494 ATAGTTTTCCAAATGTTGCTGAGCTGAGTGAAGTTAGAGAGACAATTCAACAGCTGTTGA 3553
Query 3464 AATGGGGCTGGAAGTATAACCGAAACCTTGAGGAGCAAGCTGCCCAACTTCATATGTTAG 3523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3554 AATGGGGCTGGAAGTATAACCGAAACCTTGAGGAGCAAGCTGCCCAACTTCATATGTTAG 3613
Query 3524 CTGGCTGGTCTCAGATTGTTGAGGTGTCTGCTTGCAGAAGAATATCTTCTCTTGATAATC 3583
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3614 CTGGCTGGTCTCAGATTGTTGAGGTGTCTGCTTGCAGAAGAATATCTTCTCTTGATAACC 3673
Query 3584 GGTCTGAAATTTTGTACCGGTTACTTGATGCCTCTCTTAGTGCCTCCGCGTCTCCAGATT 3643
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3674 GGTCTGAAATTTTGTACCGGATACTTGATGCCTCTCTTAGCGCCTCCGCGTCTCCAGATT 3733
Query 3644 GTTCATTAAAAATGGCGTTTGTACTTACTCAGGTTGCCCTTACCTGCATTGCCAAGCTTC 3703
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3734 GTTCATTAAAAATGGCGTTTGTACTCACTCAGGTTGCCCTTACCTGCATTGCCAAACTTC 3793
Query 3704 GTGATGATAGATTTTCATTTCAAGGGGCCTTGAGTTCTGACACCGTGACATGTCTAGATG 3763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3794 GTGATGATAGATTTTCATTTCAAGGGGCCTTGAGTTCTGATACCGTGACATGTCTAGATG 3853
Query 3764 TTATGATGGTCAAACATTTATCCACTGGTGCTTGCAACTCGGTTCTATTTAAACTTGTTA 3823
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3854 TTATGATGGTCAAACATTTATCCACTGGTGCTTGCCACTCAGTTCTATTTAAACTTGTTA 3913
Query 3824 TGGCAATTCTAAGGCATGAGTCATCAGAATCCTTGAGAAGGCGCCAATATGCATTGCTCT 3883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3914 TGGCAATTCTAAGGCATGAGTCATCAGAATCCTTGAGAAGGCGCCAATATGCATTGCTCT 3973
Query 3884 TGAGCTATTTCCAGTACTGCCAGCATATGATTGCTCTGGATGTGCCAACATCAGTTGTGC 3943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3974 TGAGCTATTTCCAGTACTGCCAGCATATGATTGCTCTTGATGTGCCAACATCAGTTGTGC 4033
Query 3944 AGTTCTTGTTACTTAATGAGCAAGACGGTGAAGATTTGGATATCCAGAAGATTGACAAGG 4003
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4034 AGTTCTTGTTACTTAATGAGCAAGATGGTGAAGATTTGGATATCCAGAAGATTGACAAGG 4093
Query 4004 AGCAGGCTGACCTTGCTCGTGCCAACTTTTTTGTAATAAAGAAAGAAGCTCAGGGCATCT 4063
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4094 AGCAGGCTGACCTTGCTCGTGCCAACTTTTTTATTATAAAGAAAGAAGCTCAGGGCATCT 4153
Query 4064 TGGATCTGGTAATCAAAGATGCAAGTCAAGGCAGTGAGTTTGGAAAAACAATATCACTTT 4123
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4154 TGGATCTGGTAATCAAGGATGCAAGTCAAGGCAGTGAGTTTGGGAAAACAATATCACTTT 4213
Query 4124 ATGTGCTGGAAGCTCTTGTTTGTATTGATCACGAGAGATATATTCTTAGTCAGCTCCAGA 4183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4214 ATGTGCTGGAAGCTCTTGTTTGTATTGATCACGAGAGATATTTTCTTAGTCAGCTCCAGA 4273
Query 4184 GCAGAGGTTTCATACGGTCTTGCCTTGGAAGCATTAGTAATATCTCCTACCAGGATGGAA 4243
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4274 GCAGAGGTTTCATACGATCTTGTCTTGGAAGCATTAGTAATATCTCCTACCAGGATGGAA 4333
Query 4244 CACATTTGCTGGAGTCACAACAGCGAGCATGTACCTTAGAAGCAGAACTTGCATTGCTAC 4303
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4334 CACATTTGCTGGAGTCACAACAGCGAGCTTGTACGTTAGAAGCAGAACTTGCATTGCTAC 4393
Query 4304 TTAGAATTAGTCACAAGTACGGAAAGTCTGGAGGCCAGGTTCTGTTCTCCATGGGTGCAC 4363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4394 TTAGAATTAGTCACAAGTACGGAAAGTCTGGAGGCCAGGTTCTGTTCTCCATGGGTGCGC 4453
Query 4364 TGGAACATATCGCTTCATGTAGAGCTATCAGCTTTAAGGGAAATATGAGACGGGTGGATA 4423
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 4454 TGGAACATATTGCTTCATGTAGAGCTATCAGCTTTAAGGGAAATATGAGGCGTGTGGATA 4513
Query 4424 TGAAACTTCAGAGTGATGTAGGATATAGTGTGCAAAAGCAACGAACGATAATCACTGCTG 4483
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4514 TGAAACTTCAGAGTGATGTAGGATATAATGTGCAAAAGCAACGAACGATAATCACTGCTG 4573
Query 4484 TCCTAAGACTGGTGTTTGCTCTAACCTCATTGGTTGAGACCTCTGAATTTTTTGAGGGAA 4543
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4574 TCCTAAGACTGGTGTTTGCTCTAACCTCATTGGTTGAGACCTCTGAATTTTTTGAGGGGA 4633
Query 4544 GGAATAAAATTGTTCGTGAAGTCATTGAGTTTATCAAAGGACATCAATTTCTTTTTGACC 4603
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 4634 GGAATAAAATTGTTCGTGACGTCGTTGAGTTTATCAAAGGACATCAATCTCTGTTTGACC 4693
Query 4604 AACTTCTTCGTGAAGACTTTACTCAAGCAGATGATTTATTGATGGAGCAAATTATTCTTG 4663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4694 AACTTCTTCGTGAAGACTTTACTCAAGCAGATGATTTATTGATGGAGCAAATTATTCTTG 4753
Query 4664 CAGTGGGAATATTGAGCAAGGTCTGGCCTTTTGAAGAGAATGACGGATATGGATTTGTTC 4723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4754 CAGTGGGAATATTGAGCAAGGTCTGGCCTTTTGAAGAGAACGATGGATATGGATTTGTTC 4813
Query 4724 AAGGGCTTTTTGATATGATGAGCAACCTTTTCATCGTCTCCCCCATTAAATTGATATCAT 4783
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||
Sbjct 4814 AAGGGCTATTTGATATGATGAGCAAGCTTTTCATCGCCTCCCCGATTAAATCGATATTAT 4873
Query 4784 CGCAGGTATCAGAGCTCAAATTGTCTCAGTTGCGATTCAGCTTGACTTCTTACTTATATT 4843
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4874 CGCAGGGATCAGAGCTCAAATTGTCTCAGTTGCGATTCAGCTTGACTTCTTACTTATATT 4933
Query 4844 TTCTGGTGACCAAAAATTCTCTGAGGTTGCAGGTTTCAGATGATTCTCTTGATAGTTCCA 4903
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4934 TTCTGGTGACCAAAAATTCTCTGAGGTTACAGGTTTCAGATGATTCTCTTGATAGTTCCA 4993
Query 4904 CTAAACTACGCCAACCAACGTTACTGTTGCTTGCATCTCTTCTTTCGCATGTGACTGATT 4963
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4994 CTAAACTACGCCAACCAACATTGCTGTTGCTTGCATCTCTTCTTTCGCATGTGACTGATT 5053
Query 4964 CCCTCGAGAGAGCAGCTGAGAAAAAGTCATTACTTCTTCATAAGATTAGAGACATAAACG 5023
|||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5054 CCCTCGAGAGAGCAGCAGAGAAGAAGTCCTTACTTCTTCATAAGATTAGAGACATAAACG 5113
Query 5024 AGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCGATCATCAAGATATGTGATTGCCAAGAATATGTCA 5083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5114 AGCTCTCAAGACAAGATGTAGATGCGATCATCAAGATCTGTGATTCCCAAGAATATGTCA 5173
Query 5084 CACCGTCCGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTATGGTTGAAATGTGCCAAATCG 5143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5174 CACCGTCCGACAACATACATAAAAGGAGATACATAGCTATGGTTGAAATGTGCCAAATCG 5233
Query 5144 TGGGTAACAGGGACCAGTTAATCACCTTGTTACTACAACTTGCCGAGCATGTACTAAATA 5203
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5234 TGGGTAACAGGGACCAGTTAATCACCTTGTTACTGCAACTTGCCGAGCATGTACTAAATA 5293
Query 5204 TTATCCTGATCCATCTCCAAGATAGATCCGTTAGTTCAAATGAAAGGGGATCATATGGTT 5263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5294 TTATCCTGATCCATCTCCAAGATAGATCCGTTAGTTCAAATGAAAGGGGATCATATGGTT 5353
Query 5264 CAAAATCCCATCTACAACAGGATGTTACAGATCTATGTGGCAAATTGTCACCTACCATAG 5323
||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5354 CAAAATCCCATATACAACAGGAAGTTACAGATCTCTGTGGCAAATTGTCACCTACCATAG 5413
Query 5324 AGAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACATAACCTGAAGGTGTTCCAGAGAC 5383
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5414 ATAGGCTTGCATTACTGAATGAGGGAAAAGTAGGACATAACCTGAAGGTGTTCCAGAGAC 5473
Query 5384 TGGCAACGACTGTAAAAGAAATGGCCATCCAAAAGTGTTTATGATAATAAGCTTCTCAAG 5443
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 5474 TGGCAACGACTGTAAAAGAAATGGCCATCCAAAAGTGTGTATGA-AATAAGCTTCTCAAG 5532
Query 5444 AAATGTATTTTTGTGTGTGAAATGTCCAAATCTGAAATT-GTAGTGCGGGTCTGTATAAC 5502
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||
Sbjct 5533 AAATGTATTTTTGTGTGTCAAATGTCCAAATCT-AAATTTGTAGTATGAGTCTGTATAAC 5591
Query 5503 AAAATAGTAAATCCATATGAATTCAGATAATACTTTCTCTGAGG-TGATTGGGAAAAA-C 5560
||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |
Sbjct 5592 AAAATAGTAAATCCACATGATTTCAAATGATACTTTCTCTGAGACTC-TTGAGAAAAAAC 5650
Query 5561 TTTAAAAGCTCCAACTTTATTTTAAAGTCT-TGAAAGCCAAAA 5602
||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 5651 TTTAAAAGCTCCAGCTTAATTTTAAAGT-TATGAAAGCCAAAA 5692
Score = 1912 bits (1035), Expect = 0.0
Identities = 1095/1125 (97%), Gaps = 0/1125 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTGTCGCCGAAAGAGTTAGTGGCCATAGTACACTCTTCGCTGCTCGGAACGTCACGG 60
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 1 ATGGTGTCGCCGAAAGATTTAGTGGCGATAGTACACTCTTCGCTGCTCGGAACATCCCGG 60
Query 61 CCAACTCCAACGCAGCGTATCGAACTCACTCATGCCATTCGCAACTCATTTTCCTCTATT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 61 CCAACTCCAACGCAGCGTATCGAACTCACTCATGCCATTCGCAACTCATTTCCCTCTCTT 120
Query 121 CAGAACCTCCTCTCTTTCCCGCCTCCGAAGCCGTCGGACAGAGCGCAAGTTCAGTCCAAA 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 CAGAACCTCCTCTCTTTCCCGCCTCCGAAGCCGTCGGACAGAGCGCAAGTTCAGTCCAAA 180
Query 181 GAAATTCGACTCCCGGATTCGCTGCCAATATCTTTGGATGACCAAGATGTCGCTATTAGC 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 181 GAAATTCGACTCCCGGATTCGCTGCCAATATCTTTGGATGACCAAGATATCGCTATTAGC 240
Query 241 TTGAAACTGAGTGATGAGCTTCACCTAAATGAGATAGATTCTGTTCGCCTGCTTGTATCT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 241 TTGAAACTGAGTGATGAGCTTCACCTAAATGAGATAGATTCTGTTCGTCTGCTTGTATCT 300
Query 301 GCAAATCAGGAGTGGGGCTTAATGGGACGGGACCCTCTTGAGATTCAACGGCTTGCAACT 360
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 TCGAATCAGGAGTGGGGCTTAATGGGACGAGACCCTCTTGAGATTCAACGGCTTGCAACT 360
Query 361 GGACTATGGTATACAGGGAGAAGAGATCTTACATCAACGCTATACACACTCCTGAGGGCA 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GGACTATGGTATACAGGGAGAAGAGATCTTACATCAACGCTATACACACTCCTGAGGGCA 420
Query 421 GTTGTTCTGGACCAGGGGCTTGAACCTGATCTTATAGCTGACATTCAGGGACTCTTAGAA 480
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GTTGTTCTGGACGAGGGGCTTGAACCTGATCTTATAGCTGACATTCAGGGACTCTTAGAA 480
Query 481 GAACTTATTAAAGCTGGGCTCAGACAACGGTTGATTACTCTTATAAAGGAACTCAATCGG 540
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAACTGATTGAAGCTGGGCTCAGACAACGGTTGATTACTCTTATAAAGGAACTCAATCGG 540
Query 541 CAGGATCCTACTGGATTGGGTGGGCCCTTATGCGAGCGATACCTTATTGACTCAAGAGGT 600
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GAGGATCCTACTGGACTGGGTGGGCCCTTATGCGAGCGATACCTTATTGACTCAAGAGGT 600
Query 601 GCTCTTGTTGAACGAAGAGCTGTTGTTCAGAGGGAAAGACTGATACTGGGACATTGCCTT 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 601 GCTCTTGTTGAACGAAGAGCTGTTGTTCAGAGGGAAAGATTGATACTGGGACATTGCCTT 660
Query 661 GTTCTTTCAATTTTGGTTGATAGACCTGGTTCGAAAGATGTGAAGGATATATACTACGTT 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 661 GTTCTTTCAATTTTGGTTGATAGACCTGGTTCGAAAGATGTGAAGGATATATACTATATT 720
Query 721 TTAAAAGATAATGCAGCTCAATTAACTGAAGGAAATGACACCATAAGTTCTCAGATTACT 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 TTAAAAGATAATGCAGCTCAATTAACTGAAGGAAATGACACCATAAGTTCTCAGATTACT 780
Query 781 TTTAGTCTTTTGTTTTCTCTCATCATCACCTTCGTATCAGATGCAATCAGTGGACTATCT 840
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 781 TTTAGTCTTCTGTTTTCTCTCATCATCACCTTCGTATCAGATGCAATCAGCAGACTATCT 840
Query 841 GATAAGTCATCTATGATATCTCAAGATGCTTCGTTTAGGACAGACTTTCAGGATATTGTT 900
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GATAAGTCATCTATGATATCTCAAGATGCTTCATTTAGGACAGACTTTCAGGATATTGTC 900
Query 901 ATGGCTTCTGGCAGTGACCCCACTGCTGATGGCTTCATTGGTGGCATAAGGCTTGCCTGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 ATGGCTTCTGGCAGTGACCCCACTGCTGATGGCTTCATTGGTGGCATAAGGCTTGCCTGG 960
Query 961 GCTGTACATTTAATGCTCATACATGATGGAATATCTGGAATGGATACGATTTCCACTGCT 1020
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 961 GCTGTACATTTAATGCTGATACATGATGGAATATCGGGAATGGATACAATTTCCACTGCT 1020
Query 1021 TCAACAAAAGATATGGGGCACATATGCTCCTGCCTGGAGTCCATCTTCTCAAAAAATGTG 1080
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1021 TCAACAACAGATATGGGGCATATATGCTCCTGCCTGGAGTCCATCTTCTCAAAAAACGTG 1080
Query 1081 TTTCAATTTTTGCTGGATAATGTTCTTCGAACTGCAGCCTACCAG 1125
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 TTTCAATTTTTGCTGGATAATGTTCTTCGAACTGCAGCCTACCAG 1125
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 279680707225
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5