BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495420
Length=3768
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G53480.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr5... 6076 0.0
> AT5G53480.1 | Symbols: | ARM repeat superfamily protein | chr5:21713366-21717782
FORWARD LENGTH=3811
Length=3811
Score = 6076 bits (3290), Expect = 0.0
Identities = 3645/3808 (96%), Gaps = 58/3808 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2 tctctctctctctgtctctTCCTTCTGGGCTTCTAGGGTTTGTCCTCTCCCAGTCCCCGA 61
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 21 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTTCTGGGCTTCTAGGGTTTGTCCTCT-CCAGTCCCCGA 79
Query 62 TTTCCGCTTTATCCGATCGGCCGCCGCCGAGATTCTAGATATACCTATGGCAATGGAGGT 121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 80 TTTCCGCTTTATCCGATCGGCCGCCGCCGAGATTCTAGATAAACCTATGGCAATGGAGGT 139
Query 122 TACCCAGTTGCTCATTAATGCTCAGTCGATTGATGGAACTGTACGTAAGCACGCTGAAGA 181
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 140 TACGCAGTTGCTCATTAATGCTCAGTCGATTGATGGAACTGTACGTAAGCACGCGGAAGA 199
Query 182 GAGTCTTAAGCAGTTTCAGGAGCAAAACCTTGCAGGTTTCTTGTTGTCGCTTGCTGGAGA 241
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200 AAGTCTTAAGCAGTTTCAGGAGCAAAACCTTGCGGGTTTCTTGTTGTCGCTTGCTGGAGA 259
Query 242 GCTTGCGAACGATGAGAAGCCAGTAGATAGCAGGAAATTAGCCGGTTTAGTCCTTAAAAA 301
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 260 GCTTGCGAATGATGAGAAGCCAGTAGATAGCAGGAAATTAGCTGGTTTAGTCCTTAAAAA 319
Query 302 TGCTCTTGATGCTAAGGAACAACACAGGAAGTATGAGCTTGTTCAGAGATGGCTGGCTCT 361
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 320 TGCTCTTGATGCTAAGGAACAACACAGGAAGTATGAGCTTGTTCAGAGATGGTTGGCTCT 379
Query 362 AGACATGTCAACAAAGTCGCAGATCAGAGCATTCTTGTTGAAGACACTATCGGCACCTGT 421
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 380 AGACATGTCAACAAAGTCGCAGATCAGAGCTTTCTTGTTGAAGACACTGTCGGCACCTGT 439
Query 422 GCCCGATGTTCGTTCGACAGCATCCCAGGTTATTGCCAAGGTTGCAGGTATTGAGTTACC 481
||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 GCCTGATGTTCGTTCGACTGCATCTCAGGTCATTGCTAAGGTTGCAGGTATTGAGTTACC 499
Query 482 ACAGAAGCAGTGGCCTGAGCTCATAGTGTCTCTTCTCTCAAATATTCACCAGTTACCAGC 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 500 ACAGAAGCAGTGGCCTGAGCTCATAGTGTCTCTTCTCTCAAATATTCACCAGTTACCTGC 559
Query 542 TCATGTCAAGCAAGCCACTTTGGAGACTCTTGGATACCTATGTGAAGAAGTGTCACCTGA 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 TCATGTCAAGCAAGCCACTTTGGAGACTCTTGGATACCTATGTGAAGAAGTGTCACCTGA 619
Query 602 TGTTGTTGAACAGGAGCATGTAAATAAGATTCTCACAGCTGTTGTTCAGGGTATGAATGC 661
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 TGTTGTTGAACAGGAGCATGTAAATAAGATACTCACAGCTGTTGTTCAGGGTATGAATGC 679
Query 662 TGCTGAAGGTAATAATGATGTTAGACTTGCTGCAACCCGTGCTTTATACATGGCTCTTGG 721
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 680 TGCTGAAGGTAATACTGATGTTAGACTTGCTGCAACCCGTGCTTTATACATGGCTCTCGG 739
Query 722 ATTCGCCCAAGCAAATTTCAACAACGACATGGAGCGTGATTATATCATGAGAGTCGTGTG 781
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 740 ATTCGCCCAAGCAAATTTCAACAACGACATGGAGCGTGATTATATCATGAGAGTTGTGTG 799
Query 782 TGAAGCAACCCTGTCCCCTGAGGTGAAAATTAGGCAGGCGGCTTTTGAGTGTTTGGTATC 841
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 800 TGAAGCAACCCTGTCCCCTGAGGTGAAAATTAGGCAGGCAGCTTTTGAGTGTTTGGTATC 859
Query 842 TATTGCTTCCACATACTATGAGAAGTTGGCGCATTATATGCAAGATATATTCAACATCAC 901
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 TATCGCTTCCACATACTATGAGAAGTTGGCGCATTACATGCAAGATATATTCAACATCAC 919
Query 902 AGCTAAGGCTGTAAGAGAAGATGACGAGTCTGTTGCTCTACAGGCAATTGAGTTCTGGAG 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 AGCTAAGGCTGTAAGAGAAGATGACGAGTCTGTTGCTCTACAGGCAATTGAGTTCTGGAG 979
Query 962 TTCTATTTGTGACGAAGAGATTGACATCTTAGAAGAATATGGTGGTGAGTTCGCTGGGGA 1021
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 TTCTATTTGTGACGAAGAGATTGACATCTTAGAAGAATATGGTGGTGAGTTCGCTGGGGA 1039
Query 1022 TTCTGATGTTCCATGCTTTTATTTTACTAAGCAGGCTCTTCCTGGGCTTGTGCCTCTGCT 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||
Sbjct 1040 TTCTGATGTTCCATGCTTTTATTTTACTAAGCAGGCTCTCCCTGGTCTTGTGCCTCTACT 1099
Query 1082 GCTGGAGACTCTTCTTAAGCAAGAAGAAGATCAAGATTTGGATGAAGGAGCTTGGAATAT 1141
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1100 GCTGGAGACTCTTCTGAAGCAAGAAGAAGATCAAGATTTGGATGAAGGGGCTTGGAATAT 1159
Query 1142 TGCAATGGCAGGTGGGACATGCCTCGGTTTGGTTGCTAGGGCAGTTGGAGATGACATTGT 1201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 TGCAATGGCAGGTGGGACATGCCTCGGTTTGGTTGCTAGGGCAGTTGGAGATGACATTGT 1219
Query 1202 ACCACATGTCATGCCGTTTATTGAAGAGAAAATATCAAAGCCTGATTGGAGAGAACGAGA 1261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1220 TCCACATGTCATGCCGTTTATTGAAGAGAAAATATCAAAGCCTGATTGGAGAGAGCGAGA 1279
Query 1262 AGCTGCAACTTATGCTTTTGGTTCCATTTTGGAAGGCCCTTCTGCAGATAAGTTGATGGC 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1280 AGCTGCAACTTATGCTTTTGGTTCCATTTTGGAAGGCCCTTCTGCCGATAAGTTGATGGC 1339
Query 1322 AATCGTTAACGCAGCGTTAACATTTATGCTCAATGCTCTAACAAATGACCCAAGCAACCA 1381
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1340 AATTGTTAACGCAGCGTTAACATTTATGCTCAATGCTCTAACAAATGACCCAAGCAACCA 1399
Query 1382 TGTGAAAGACACAACCGCATGGACCCTTGGTCGGATATTTGAGTTCCTTCATGGTTCAAC 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 TGTGAAAGACACAACCGCATGGACCCTTGGTCGGATATTTGAGTTCCTTCATGGTTCAAC 1459
Query 1442 AATCGAGACACCAATTATTACTCAGGCAAACTGCCAGCAGATTATCACAGTACTGATCCA 1501
|||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1460 AATCGAGACACCTATTATTAATCAGGCAAACTGCCAGCAGATAATCACAGTACTCATCCA 1519
Query 1502 GAGCATGAACGATGCGCCTAATGTTGCCGAGAAGGCTTGTGGGGCTCTATACTTCCTTGC 1561
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1520 GAGCATGAATGATGCGCCTAATGTTGCCGAGAAGGCTTGTGGGGCTCTGTACTTCCTTGC 1579
Query 1562 TCAAGGCTATGAGGATATCGGTCCCAATTCTCCGTTAACACCCTTCTTCCAGGAAATTAT 1621
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1580 TCAAGGCTATGAGGATATCGGTCCCAGTTCTCCGTTAACACCCTTCTTCCAGGAAATTAT 1639
Query 1622 TCAGTCACTTTTAGCTGTTGCACACAGAGAGGATGCAACTGAATCACGCTTGCGGACTGC 1681
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1640 TAAGTCACTTTTAGCTGTTGCACACAGAGAGGATGCAACTGAATCACGCTTGCGGACTGC 1699
Query 1682 AGCATATGAGGCATTGAATGAAGTTGTCAGGTGTTCGACTGATGAAACGTCGACCATGGT 1741
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1700 AGCATATGAGGCATTGAATGAAGTTGTCAGGTGTTCAACTGATGAAACGTCTACCATGGT 1759
Query 1742 TTTGCAATTAGTACCAGTGATAATGTTGGAGCTTCACAATACTTTGGAAGGGGAAAAGCT 1801
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760 TCTGCAATTAGTACCAGTGATAATGATGGAGCTTCACAATACTTTGGAAGGGGAAAAGCT 1819
Query 1802 ATCATTGGATGAGAGGGAGAAACAAAACGAGTTGCAGGGACTTCTATGTGGATGCTTGCA 1861
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820 TTCATTGGATGAGAGGGAGAAACAAAACGAGTTGCAGGGACTTCTATGTGGATGCTTGCA 1879
Query 1862 GGTCATCATACAGAAATTAGGATCTGAACCAACCAAGTCTGCTTTCATGCAGTATGCAGA 1921
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 1880 GGTCATCATACAGAAATTAGGATCTGAACCAACCAAGTCTAAGTTCATGGAGTATGCAGA 1939
Query 1922 CCAAATGATGGGACTTTTCCTGAGGGTGTTTGGTTGTAGAAGTGCAACTGCACATGAGGA 1981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940 CCAAATGATGGGACTTTTCCTGAGGGTGTTTGGTTGTAGAAGTGCAACTGCACATGAGGA 1999
Query 1982 AGCCATGCTTGCCATTGGTGCTCTTGCTTATGCAGCAGGTCCCAATTTTGCCAAATACAT 2041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000 AGCCATGCTTGCCATTGGTGCTCTTGCTTATGCAGCAGGTCCCAATTTTGCCAAATACAT 2059
Query 2042 GCCTGAGTTTTACAAGTACTTGGAAATGGGTCTTCAAAACTTTGAAGAATACCAAGTGTG 2101
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2060 GCCTGAGTTTTATAAGTACTTGGAGATGGGTCTTCAAAACTTTGAAGAATACCAAGTGTG 2119
Query 2102 TGCTGTTACTGTGGGTGTTGTTGGGGATATCTGCAGAGCATTGGAGGACAAGATTTTACC 2161
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120 TGCTGTTACTGTTGGTGTTGTTGGGGATGTCTGCAGAGCATTGGAGGACAAGATTTTACC 2179
Query 2162 TTATTGCGATGGGATTATGACGCAGCTTCTGAAAGATTTGTCGAGCAACCAGTTGCACCG 2221
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2180 TTATTGCGATGGGATTATGACACAGCTTCTGAAAGATTTGTCGAGCAACCAATTGCACCG 2239
Query 2222 ATCAGTGAAGCCACCGATATTCTCCTGTTTTGGTGACATAGCACTTGCCATTGGTGAGGA 2281
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2240 ATCAGTGAAGCCACCGATATTCTCCTGTTTTGGTGACATAGCACTTGCTATCGGTGAGGA 2299
Query 2282 TTTTGATAAGTACTGGAGGTATTCAATGCCGATGCTTCAGAGCGCCGCAGAGTTATCTGC 2341
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2300 TTTTGATAAGTACTGGAGGTATTCAATGCCGATGCTTCAGAGTGCCGCAGAGTTATCTGC 2359
Query 2342 TCACTCGTCTGGAGCCGATGATGAAATGACGGAGTACACAAACTCATTGAGAAACGGAAT 2401
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360 TCACTCGGCTGGAGCTGATGATGAAATGACGGAGTACACAAACTCATTGAGAAACGGAAT 2419
Query 2402 CCTTGAGGCTTATTCAGGCATCTTTCAAGGTTTCAAGAACTCCCCCAAAACCCAGCTCCT 2461
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2420 CCTTGAGGCTTATTCAGGCATATTTCAAGGTTTCAAGAACTCCGCCAAAACCCAGCTCCT 2479
Query 2462 GATTCCTTTCGCACCCCATATCCTCCAGTTTTTGGACAGTATATACATGGAGAAGGACAT 2521
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2480 GATTCCTTTCGCACCCCATATCCTCCAGTTTTTGGACAGTATATACATGGAGAAAGACAT 2539
Query 2522 GGACGAGGTGGTGATGAAGACAGCGATTGGGGTCTTAGGAGATTTAGCAGATACACTAGG 2581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2540 GGACGAGGTGGTGATGAAGACAGCGATTGGGGTCTTAGGAGATTTAGCAGATACACTAGG 2599
Query 2582 GAGTCATGTGGGTGGTTTGATACAACAGTCAGTGTCAAGTAAAGAGTTCTTAAACGAATG 2641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2600 GAGTCATGTGGGTGGTTTGATACAACAGTCAGTGTCAAGTAAAGAGTTCTTAAACGAATG 2659
Query 2642 TTTGTCTTCTGAAGACCACACAATTAAAGAAGCAGCCGAATGGGCGAAGCATGCCATTAC 2701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2660 TTTGTCTTCTGAAGACCACACAATTAAAGAAGCAGCCGAATGGGCGAAGCATGCCATAAC 2719
Query 2702 CCGTGCCATATCTGTTTGAAGGCTCTTCTTT-GCCTAAAAGAAAGAAAAATTCGTTTTGC 2760
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 2720 CCGTGCCATATCTGTTTGAAGGCTCTTCTTTTGCCTATAAGAAAGAAAA-TTCCTTTTGC 2778
Query 2761 TTTTTAGTAAAGTCTGCATGCATCTCTGGGTGGGTTGAGTCGGTCGGGGG-AGGGGTAGA 2819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2779 TTTTTAGTAAAGTCTGCATGCATCTCTGGGTGGGTTGAGTCGGTCGGGGGGAGGGGTAGA 2838
Query 2820 GCTGCAACAGCCGAGTCACATCAGCATCATC-GTCATCAGTTTCATTTGCATCATCAGCA 2878
||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839 GCTGCAACATCCGAGTCACATCAGCATCATCAG-CATCAGTTTCATTTGCATCATCAGCA 2897
Query 2879 TTACTGGGGTCAGTCAGGGAATCATTGAGTCGTGGATG-GGGGAATGATGAGTTTTGGG- 2936
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 TAACTGGGGTCAGTCAGGGAATCGTTGAGTCGTGGATGTGGGGAATGATGAGTTTTGGGG 2957
Query 2937 TAAATAATGAAACTGGAGGAGTCGCGGGTGAAACTTTCCCGGGTGAGGTTAAAACCCCGG 2996
||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 2958 TAAATAATGAAACTGGAAGAGTCACGGGTGAAAGTTTCCCGGGTAAGGTTAAATCCCCGG 3017
Query 2997 GAGTAGGAAGAGGAGGAAG--AGTTGTGGTCGTTTTCTGGTGG-TTTTGGGGATAAAGTT 3053
|||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||
Sbjct 3018 GAGTAGAAAGAGGAGGAAGTGAGTCATGGTCGTTTTCTGGTGGGTTTTGGG-ACAAAGTT 3076
Query 3054 ATACCaaaaaaaaaaaaaaaGGTTTCATCGAACATCTCATAATACATTCTTGTTTTT-CT 3112
|||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3077 ATACCAAAAAAAAAAA----GGTTTCATGGAACATCTCATAATACATTCTTGTTTTTTCT 3132
Query 3113 TTTCTCTCATATGTTCTTCAACCCCTTGAGGAGGGA-AGGTCTCAGGTTTTTATCAAGTG 3171
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3133 TTTCTCTCATATGTTCTTCAACCCCTTGAGGAGGGAGAGGTCTCAGGTTTTTATCAAGTG 3192
Query 3172 GGGGCATTATTAGAGGACAATCCCTTGAtttttttttttcttcttttttcttttattatt 3231
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||
Sbjct 3193 GGGGCATTATTAGAGGACAATCCCTTGATTTTTTCTTTTGTT-TT----CTTTTATTATT 3247
Query 3232 tggttagttgcagtctttgcatcatcattttgtcttttgGGGGG-TTTGTATGTTTGATT 3290
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3248 TGGTTAGTTGCAGTCTTTGCATCATCATTTTGTCTTTTGGGGGGGTTTGTATGTTTGATT 3307
Query 3291 AAAAGCATTATTCACATTTTTATTTTTATATAAAGAAGTTTCACATGTCTGTCTATCTTC 3350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3308 AAAAGCATTATTCACATTTTTATTTTTATATAAAGAAGTTTCACATGTCTGTCTATCTTC 3367
Query 3351 TCTTTGCTATG---CAGTTTTGGGGTTTTTGCATATATACTTGTGTTTTGTTT--A-T-- 3402
||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |
Sbjct 3368 TCTTTGCTATGATGCAGTTTAGGGGGTTTTGCATATATACTTGTGTTTTGTTTGCAATCA 3427
Query 3403 -GT--CA-----CA--TACAGGAACATTT--AT-AT--GGTGTCATGTCTTAGGGTCTTG 3447
|| || || ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 3428 AGTTTCAAATGTCACATACAGGAACATTTTTATTATATGGTGTCATGTCTTAGGGTCTT- 3486
Query 3448 AAA-AGGTCCACGTCTATTTATTTTAGAATGAAACTGTTTTTAATCTTTTAGATTCCATT 3506
||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||||
Sbjct 3487 AAAGAGGTCCACATCTATTCATTTTACTATGGAACTGTTTACAATCGTTTAGAATCCATT 3546
Query 3507 ATTTGATTTGGCTCGAATTATATGGGAAAGGTCACATGTTAATAGGAGAAAACGCCCTGC 3566
||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3547 ATTTGATTTGGCTCGAACTATATGGGAAAGGGCACATGTTAATAGGAGAAAACGTCCTGC 3606
Query 3567 CGTGCTCTGCTTCCAAAGAGTCAAGTTAAGAGAA-GAAGAACATTTCACAT-CAC-CTCG 3623
| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |
Sbjct 3607 CTTACTCTGCTTCCAAAGAGTCAAGTTAAGAGATCGAAGAACATTTCACATTCACGCT-G 3665
Query 3624 TTTATG-AATTACCTCAATTTTGATTGTTTGTGTTGCttttttt-GGTTTTCCAAATGCC 3681
|||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 3666 TTTATGGAA--ACCTCAATTTTGATTGTATGTGTTGCTTTTTTTTGGTTTTCCAAACGCC 3723
Query 3682 AAATGTAACCGATACAGAACCTATATTTTGAAAA-TGTTTTCATGTGTTTTTGAAACATT 3740
||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3724 AAATGCAACTGATACCGAACCTATATTTTGAAAAATGTTTTCATGTGTATTTGAAACATT 3783
Query 3741 CTAGACCATTCAAGTTATGGTTTAAATT 3768
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3784 CTAGACCATTCAAGTTATGGTTTAAATT 3811
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 187674533763
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5