BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495622
Length=4070
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G55390.1 | Symbols: EDM2 | ENHANCED DOWNY MILDEW 2 | chr5:22... 6479 0.0
> AT5G55390.1 | Symbols: EDM2 | ENHANCED DOWNY MILDEW 2 | chr5:22447966-22454802
REVERSE LENGTH=4258
Length=4258
Score = 6479 bits (3508), Expect = 0.0
Identities = 3901/4090 (95%), Gaps = 30/4090 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGTTCGTTGACGATGATGAAGAGGAAGACTTCTCTGTTCCTCAATCAGCTTCGAAT 60
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 179 ATGACGTTCGTTGACGATGATGAAGAGGAAGACTTCTCTGTTCCTCAATCAGCTTCCAAT 238
Query 61 TATTATTTCGAAGATGACGATAAAGAGCCTGTTTCGTTTGCTCGTCTCCCAATTCAATGG 120
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 TATTATTTCGAAGATGATGATAAAGAGCCTGTTTCGTTTGCTCGTCTCCCAATTCAATGG 298
Query 121 AGCG-GCAAGGACAAAGTTGATGGAAGTGGTTTAGGTTTTTACTTGCGAGGAAGATCTGA 179
|||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 299 AGCGTG-GAGGAGAAAGTTGATGGTAGTGGTTTAGGTTTTTACTTGCGAGGAAGATCTGA 357
Query 180 TAATGGGCTTTTGCCTCTGCATAAGCTTGTTAAGGCTTGGAGATTCGATCTTTCGAACTT 239
||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 358 TAACGGCCTTTTGCCTCTGCATAAGCTTGTTAAGGCTTGGAGATACGATCTTTCGAACTT 417
Query 240 -TAGACCAGAGGTTTCTGTTCTTACAAAGGATAATATCTGGATTAAGCTTGAGGAACCGA 298
|| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 CCAG-CCTGAGATTTCTGTTCTTACGAAGGATAATATATGGATTAAGCTTGAGGAACCGA 476
Query 299 GGAAAAGCTATGGGGAATTGATAAGAACTGTTTTTGTAACGTTGCACTCCATTCAGTTTC 358
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||
Sbjct 477 GGAAAAGCTATGGGGAATTGATTAGAACTGTTTTGGTCACGTTGCATTCCATTCAGTTTC 536
Query 359 TTAGGAGGAATCCCCAAGCCTCGGAGAAATCTCTCTGGGAGAAATTAACTAAAAGTTTGA 418
||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 537 TTAGGAGGAATCCCCAAGCGTCCGAGAAAGCTCTCTGGGAGAAATTAACTAGAAGTTTGA 596
Query 419 GGTCATATGATGTGAAGCCATCGCAGAATGATTTGGTGGATCACATTGATTTAATTTCTG 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||
Sbjct 597 GGTCATATGATGTGAAGCCATCGCAGAATGATTTGGTGGATCATATTGGTTTAATCGCTG 656
Query 479 AAGCTGCAG-AAAGAGAT-GTAAATTTGGGGAAATCAAAGTTTATACTTGCATTTCTCAC 536
||||||| | |||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 AAGCTGC-GAAAAGAGATAG-AAATTTGGCGAATTCGAAGTTTATACTTGCATTTCTCAC 714
Query 537 AAAAAAGCCTACCAAAAGGAGATTACCTGACGAGGACAATGCAAAGGATGATTTCATAGT 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 715 AAAAAAGCCTACCAAAAGGAGATTACCTGACGAGGACAATGCAAAAGATGATTTCATAGT 774
Query 597 TGGAGATGAGGACACTTATGTAGCTTCCGATGAAGATGAATTGGATGATGAAGACGATGA 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 TGGAGATGAGGACACTTATGTAGCTTCCGATGAAGATGAATTGGATGATGAAGACGATGA 834
Query 657 tttttttGAGTCTGTTTGTGCAATATGTGACAATGGTGGCGAGCTTTTGTGTTGTGAAGG 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 835 TTTTTTTGAGTCTGTTTGTGCAATATGTGACAATGGTGGCGAGATTTTGTGTTGTGAAGG 894
Query 717 AAGCTGCCTGAGATCATTTCATGCTACCAAAAAAGATGGTGAAGATTCACTTTGTGATTC 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 895 AAGCTGCCTGAGATCATTTCATGCTACCAAAAAAGATGGTGAAGATTCACTTTGTGATTC 954
Query 777 TCTTGGCTTAAACAAGATGCAAGTGGAAGCAATTCAGAAATACTTTTGCCCAAACTGTGA 836
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TCTTGGCTTTAACAAGATGCAAGTGGAAGCAATTCAGAAATACTTTTGCCCAAACTGTGA 1014
Query 837 GCATAAGATACATCAATGCTTCATTTGCAAGAACCTTGGCTCTTCTGATAACTCCACTGG 896
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1015 GCATAAGATACATCAATGCTTCATTTGCAAGAACCTTGGCTCTTCTGATAACTCTTCTGG 1074
Query 897 GGCAGCAGAGGTTTTCCAATGCGTGTCAGCCACCTGCGGCTACTTTTACCATCCTCGTTG 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1075 AGCAGCAGAGGTTTTCCAATGCGTGTCAGCCACCTGTGGCTACTTTTACCATCCTCACTG 1134
Query 957 TGTCACAAGACGGCTACGTTTAGGAAATAAAGATGACTCTGAAGCACTAGAGAGACAAAT 1016
||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1135 TGTCACAAGACGGCTACGTTTAGGAAATAAAGAAGAGTCTGAAGCACTAGAAAGACAAAT 1194
Query 1017 CATTGCTGGAGAGTATACATGCCCACTGCACAAATGCAGTGTCTGTGAAAACGGAGAGGT 1076
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CATTGCTGGAGAGTATACATGCCCATTGCACAAATGCAGTGTCTGTGAAAACGGAGAGGT 1254
Query 1077 TAAGACAGACTCTAATTTGCAATTTGCTGTTTGCCGGCGTTGTCCAAAGTCCTACCATAG 1136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TAAGACAGACTCTAATTTGCAATTTGCTGTTTGCCGGCGTTGTCCAAAGTCCTACCATAG 1314
Query 1137 AAAATGCCTGCCGCGGGAAATTTCTTTTGAAGATATTGCGGACGAGGATATATTTACTAG 1196
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
Sbjct 1315 AAAATGCCTACCGCGGGAAATTTCTTTTGAAGATATTGAGGACGAGGATATATTAACTAG 1374
Query 1197 GGCATGGGACGGACTCTTGCACAACCGTGTTCTCATATATTGCCAAGAACATGAGATAGA 1256
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375 GGCATGGGACGGACTCTTGCACAACCGTGTACTCATATATTGCCAAGAACATGAGATAGA 1434
Query 1257 TGAAGAACTCCTGACACCACTTAGAGACCATGTTAAGTTCCCTTTCACCGAAGAGAAGAA 1316
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||
Sbjct 1435 TGAAGAACTTCTGACACCAGTTAGAGACCATGTTAAGTTTCCTTTCACGGAAGAGCAGAA 1494
Query 1317 GGTCTTCATAAAAGAGCAAAGAAGGATACTGGAATCACATGTGGGACGAGATAAAGCAAG 1376
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1495 GGTCTTCGTGAAAGAGCAAAGAAGGATACTGGAATCACATGTGGGACGAGATAAAGCAAG 1554
Query 1377 ACCTAAGGTTAAGGATCCTGCCTTACAAGATACTTGTGGAAAAGCTTCTGATAAATCCTT 1436
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||
Sbjct 1555 ACTTAAGGTTAAGGATCCTGCCTTACAAGATACTTGTGGAAAAGCTTCTAAGAATTCCTT 1614
Query 1437 TAGAAGTTCGTTTCCTTCTTCAAAAGATGGTTTCTCCACAAAGAAGCATGGATTAGTTTC 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1615 TAGAAGTTCGTTTCCTTCTTCAAAAGATGGTTTCTCCACAAAGAAGCATGGATTAGTTTC 1674
Query 1497 ATCCGTACCAGACCATTCGAGGAAACGAAAGGATATTGATCCATCCATAAAGCATAAAAT 1556
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 ATCCGTACCAGATCATTCGAGGAAACGTAAGGATATTGATCCATCCATAAAGCATAAAAT 1734
Query 1557 GGTTCCACAAAAATCCCACAAGATGATGGAAAACTCCCGTGAAGCTGGCAAAAACAGGCT 1616
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1735 GGTTCCACAAAAATCCCAGAAGATGATGGAAGACTCCCGTGAAGCTGGCAAAAACAAGCT 1794
Query 1617 GGGAGTAAAAGA-GACACGTGAAT-CTGGTAAAAGCAAGGTTTCACTGGGTGAGAGGTTG 1674
|||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1795 GGGAGTAAAAGAAGCC-CGTGA-TGCTGGTAAAAGCAAGATTTCACTGGGTGAGAGGTTG 1852
Query 1675 TTTAATTATATCCAGGAACCTAA-CCTAGTAAAGCCTGGGCGCGTGATTCCTGTTGATAG 1733
|||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1853 TTTAGTTATACCCAGGAACCTAATCC-AGTAAAACCTGGGCGCGTGATTCCTGTTGATAG 1911
Query 1734 CAAGCACAATAAGACTGACTCAATTGCTTCCAAGGAGCCAGGAAGTGAAATTCCTACATT 1793
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1912 CAAGCACAATAAGACTGACTCAATTGCCTCCAAGGAGCCAGGAAGTGAAATTCCTACATT 1971
Query 1794 AGACAACGACTCTCAAAGGAGGCTCTTGGCGGTGATGAAAAAAGCTACGGAAGAAATAAC 1853
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972 AGACAACGACTCTCAAAGGAGGCTCTTGGCAGTGATGAAAAAAGCTACGGAAGAAATAAC 2031
Query 1854 TATGGGTACTATGTTAAAGAAATTTAAAGTTCAATCTACTATGAATACAAACTCCACAAG 1913
|||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 2032 TATGGGTACTATTTTAAAGAAATTCAAAATTCAATCTACTATGAGTACACACTCCACAAG 2091
Query 1914 GAATGTTGTGGACAAGACAATCACTATGGGGAAGGTAGAGGGCTCAGTTCAGGCTGTCAG 1973
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||
Sbjct 2092 GAATGTTGTGGACAAGACAATCACTATGGGGAAGGTAGAGGGATCAGTCCAGGCTATCAG 2151
Query 1974 AACAGCGCTAAAAAAGCTTGAGGAAGGAGGAAACATTGAGGATGCAAAAGCAGTTTGTGA 2033
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2152 AACAGCACTAAAAAAGCTTGAGGAAGGAGGAAACATTGAGGATGCAAAAGCAGTTTGTGA 2211
Query 2034 GCCAGAGGTTCTGAGCCAAATCCTCAAGTGGAAGGATAAGCTCAAAGTTTACCTTGCTCC 2093
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2212 GCCAGAGGTTCTGAGCCAAATCCTCAAGTGGAAGGATAAGCTCAAAGTTTATCTTGCTCC 2271
Query 2094 TTTTCTCCATGGTGCACGCTACACCTCCTTTGGTCGTCATTTTACTAATCCTGAAAAACT 2153
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2272 TTTTCTCCATGGTGCACGCTATACCTCATTTGGTCGTCATTTTACTAATCCTGAAAAACT 2331
Query 2154 TCAACAGATTGTTGATAGGCTGCATTGGTATGCAGAAGATGGTGATATGATTGTCGACTT 2213
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2332 TCAACAGATTGTTGATAGGCTGCATTGGTATGCAGATGATGGTGATATGATTGTCGACTT 2391
Query 2214 CTGTTGTGGTTCTAATGACTTTAGCTGTCTGATGAACACGAAGCTTGAAGAAACGGGGAA 2273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2392 CTGTTGTGGTTCTAATGACTTTAGCTGTCTGATGAACGCGAAGCTTGAAGAAACGGGGAA 2451
Query 2274 GAAGTGCTTATATAAAAATTACGATCTTTTTCAAGCAAAGAATAATTTCAATTTTGAGAG 2333
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2452 GAAGTGCTTATATAAAAATTACGATCTTTTTCCAGCGAAGAATAATTTCAATTTTGAGAG 2511
Query 2334 AAAGGATTGGATGACTGTAAGCAAAGATGAGTTGGAACCAGGTTCAAAGCTGATTATGGG 2393
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 AAAGGATTGGATGACTGTAAGTAAAGATGAGTTGGAACCAGGTTCAAAGCTGATTATGGG 2571
Query 2394 GCTAAATCCACCATTTGGAGTCAATGCTTCTCTTGCAAACAAGTTTATTACCAAGGCTCT 2453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572 GCTAAATCCACCATTTGGAGTCAATGCTTCTCTTGCAAACAAGTTTATTACCAAGGCTCT 2631
Query 2454 TGAGTTTCGCCCAAAGATTCTCATCCTCATTGTTCCTCCCGAGACTGAAAGGTTGGATAA 2513
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2632 TGAGTTCCGCCCAAAGATTCTCATTCTCATTGTTCCTCCCGAGACTGAAAGGTTAGATAA 2691
Query 2514 AAAGAAGTCATCATATGTGCTTATATGGGAGGATAAGACGTTCCTATCTGGAAATTCATT 2573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2692 AAAGAAGTCATCATATGTGCTTATATGGGAGGATAAGACGTTCCTATCTGGAAATTCATT 2751
Query 2574 TTACCTGCCTGGTTCTGTCAATGAAGAAGATAAGCAATTGGAAGACTGGAACATTGTTCC 2633
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2752 TTACCTGCCTGGTTCTGTCAATGAAGAAGACAAGCAATTGGAAGACTGGAACCTTGTTCC 2811
Query 2634 TCCGCCACTTTCTCTCTGGAGTCGGTCCGACTTTGCAGCCAAGCACAAGAAAATAGCGGA 2693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 TCCGCCACTTTCTCTCTGGAGTCGGTCCGACTTTGCAGCCAAGCACAAGAAAATAGCGGA 2871
Query 2694 AAAGCATTGCCATTTGTCTAGGGATGTGGGGAGCTCAAAGTTAAAGATAGTTGAAGAAGA 2753
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2872 GAAGCATTGCCATTTGTCTAGGGATGTGGGGAGCTCAAAGTTAAAGATAGTGGAAGAAGA 2931
Query 2754 AGCAAAAGCATCTTTGCATCCTCTTGGACCTTCTGATGGCATGTGTGATGATATTCCTGT 2813
|||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2932 AGCAAACGCATCTTTGCATCCACTTGGAGCTTCTGATGGCATGTGTGATGATATTCCTAT 2991
Query 2814 GGAAAAGGATGAACTTGAGGTAGCTGAATGTGTTCATAAAATTTTACTCTCTGAGAAAAT 2873
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 2992 GGAAAAGGATGAACTTGAGGTAGCTGAATGCGTTAATAAAATCTTAGTCTCTGAGAAAAT 3051
Query 2874 CGAAACACCGGAAGCTGTAGCACGTGTACATCAGTCAGATCACTTGTTACAGAGAAGTCA 2933
||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 3052 CGACACAGTAGAAACTGTAGCACGTGTACATCAGTCAGATCACTTGTCACGGAGAAGTCA 3111
Query 2934 GCTGAAAA-GGAAGGAAAAGACCAAAGACTACTCCGGTAGGAAGCGTGGGAAGTCTGTGG 2992
|||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||
Sbjct 3112 GCTGAAAAAGGAGGGAAA-GACCAAAGACTACTCTGGTAGGAAGCTTGGGAAATCTATGG 3170
Query 2993 ATTCTAATAATGTGGATTGGAAGAGCAATGACATGGAAGAGGATCGAGGAGAGTTGACTA 3052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 3171 ATTCTAATAATGTGGATTGGAAGAGCAATGACATGGAAGAGGATCAAGGAGAGTTGAGTA 3230
Query 3053 GAGCACCGGAGAGCATCAAAGTAAAAGTTCCCGAAATGACATCTGATTGGCAGAGTCCTG 3112
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 GAGCACCAGAGAGCATCAAAGTAAAAATTCCCGAAATGACATCTGATTGGCAGAGTCCTG 3290
Query 3113 TTAGGTCTTCCCCAGATGATATATATGCTGTCTGCACATCAATTTCCAATACAACACCTC 3172
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3291 TTAGGTCTTCCCCAGATGATATATATGCTGTCTGCACATCAATTTCCACTACAACACCTC 3350
Query 3173 AAAGATCTCACGAGTCTGTAGAAGCATCTCTGCCTGCAATAACAAGGACAAAAAGTAACT 3232
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3351 AAAGATCTCACGAGGCTGTAGAAGCATCTCTGCCTGCAATAACAAGGACAAAAAGTAACT 3410
Query 3233 TGGGAAAGGATATTAGAGAACCTGATTGTAAAGTGCAGGGCAGTGGAAAACCTGAAGTGA 3292
|||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3411 TGGGAAAGAATATTAGAGAACATGGTTGTAAAGTGCAGGGCACTGGAAAACCTGAAGTGA 3470
Query 3293 CG-CGGAATAGGTCTAGCTCTGTAAGAACTTCTAGAGAGGACATCTACACTGTTCGTCCA 3351
| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3471 -GTCGGGATAGGCCTAGCTCTGTGAGAACTTCTAGAGAGGACATCTACACTGTTCGTCCA 3529
Query 3352 TCGCCAGAAAATACGGCTCAGAAACCGTTTGAAGCTTTTGAACCATCTTATGGTGCAGGT 3411
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3530 TCGCCAGAAAATACGGGTCAGAAACCGTTTGAAGCTTTTGAACCATCTTATGGTGCAAGT 3589
Query 3412 TTGTCCCATTTCGACGATGGTCTTGCTGCTAGGTATGGT--TTT-GGTGGAGGCTACAGA 3468
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||
Sbjct 3590 TTGTCCCATTTCGACGATGGTCTTGCTGCTAAGTATGGTGGTTTCGGTGGAGGCTATAGA 3649
Query 3469 ATGCCAGATCCTCCTTTCCTACCGGATCAGTTTCCATTGAGAAATGGTCCTAACGAGATG 3528
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3650 ATGCCGGATCCTCCTTTCCTACCGGATCAGTTTCCATTGAGAAATGGTCCTAACGAGATG 3709
Query 3529 TTTGATTTCCGAGGATATTCAGACCTCGATAGAGGGGTTGGTCAAAGAGAGTATCCACAG 3588
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3710 TTTGATTTCCGAGGATATTCAGACCTTGATAGAGGGATTGGTCAAAGAGAATATCCACAG 3769
Query 3589 CAGTACGGTGGGCACTTGGACCCCATGTTAGCTCCTCCTCC------AAATCTGATGGAC 3642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3770 CAGTACGGTGGGCACTTGGACCCCATGTTAGCTCCTCCTCCTCCTCCAAATCTGATGGAC 3829
Query 3643 AATGCATTCCCATTGCAACAACGTTATGCGTCTCATTTCGATCAAATGAATTACCAGAGG 3702
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3830 AATGCATTCCCATTGCAACAACGTTATGCGCCTCATTTCGATCAAATGAATTACCAGAGG 3889
Query 3703 ATGAGCTCTTTCCCACCTCCGCCTCCAATGCAACCTAGCGGACACAATCTCCTAAATCCT 3762
||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||
Sbjct 3890 ATGAGCTCTTTCCCACCTCAGCCTCCATTGCAACCTAGCGGACATAATCTCTTAAATCCT 3949
Query 3763 CATGGTTTTTCACTGCAACCGCCACCACCTAGTGACTTCGAAATGAGTCCGCTGGGTTTT 3822
|||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3950 CATGACTTTCCACTGCCACCGCCACCACCTAGTGACTTCGAAATGAGTCCAAGGGGTTTT 4009
Query 3823 GCCCCTGGGCCGAACCCGAACTACCCTTATATGAGTCGATCTGGCGGTTGGATTAATGAC 3882
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4010 GCCCCTGGCCCGAACCCGAACTACCCTTATATGAGTCGATCTGGCGGTTGGATTAATGAC 4069
Query 3883 TAGACCAGCAGTCATTATCCTTGTAGTTGCAACATTAGTAGTTCGATTGATCTTTTGTGT 3942
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4070 TAGATCAGCACTCATTATCCTTGTAGTTGCAACATTAGTAGTTTGATTGATCTTTTGTGT 4129
Query 3943 CTGACTCTACGAAATTGTAGGAAGAATAGAAGAAATCTAGAACTTTTCTCTGCCACTCA- 4001
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4130 CTCACTCTACGAAAGTGTAGGAAGAATAGAAGAAATCTATAACTTTTCTCTGCCACTCAC 4189
Query 4002 -TGCCTAGCTAGTGGGCCTTTTGGCTGTTTAATTAATATAAAAGAAAAAGAAGCCAGCAT 4060
|| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4190 ATGTGTAGCTAGTGGGCCTTTTAGCTGTTTAAT-AATATAAAAGAAAAAGAAGCCAGCTT 4248
Query 4061 CTTTTCTCTT 4070
|| || ||||
Sbjct 4249 CTATTGTCTT 4258
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 202824950549
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5