BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495640
Length=4294
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G55540.1 | Symbols: TRN1, LOP1 | tornado 1 | chr5:22496196-2... 6931 0.0
> AT5G55540.1 | Symbols: TRN1, LOP1 | tornado 1 | chr5:22496196-22500543
REVERSE LENGTH=4269
Length=4269
Score = 6931 bits (3753), Expect = 0.0
Identities = 4122/4298 (96%), Gaps = 33/4298 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGAATCAGAGCCAGACCAAAGCTTCAAAGACCTCTCATGGTTTCTTCAAGCAATCAAA 60
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCAGAGCCAGACCAAAGCTTCAAAGACCTCTCATGGTTTCTTCAAGCAATCAAA 60
Query 61 GACCCACAACAAACTTGCTTCAATCTTCAAACCCTATCTTTCTCCTCGTACGGAAAAACC 120
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||
Sbjct 61 GACCCACAACAAACTTTCTTCAATCTTCAAACCCTATCTTTCTCCTCTTCCGGAAACACC 120
Query 121 ACGCATTGTCAGTTAATAACAGAGAGCTCCATGAACATCAACGTCACTAGAGACAACCTC 180
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 ACGCATTGTCAGCTAATAACAGAGAGCTCCATGAACATCAACGTCACTAGAGACAACCTC 180
Query 181 ACTTCACTTTCCCAGATCTTCATCGAGCTAGCAACATCCTTAGAGACGCAGACATCTCTC 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 ACTTCACTTTCCCAGATCTTCATCGAGCTAGCAACATCCTTAGAGACGCAGACGTCTCTC 240
Query 241 AGGAACCTGGAATTCGAAGGAATCTCTTGGGAAATCGAGCTGTTGCAGAGCCTGGGTTTG 300
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 241 AGGAACTTGGAATTCGAAGGAATCTTTTGGGAAATCGAGCTGTTGCAGAGCTTGGGTTTG 300
Query 301 TTGTTAGACAACACCTCGAAGATAAAGCAGCTTGCTTTCAGAAAGAACAGGTTTAGTGAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 301 TTGTTAGACAACACCTCGAAGATAAAGCAGCTTGCTTTCAGAAAGAACAGGTTCAGTGAA 360
Query 361 CAATGTCTCAACGAGCTCTCAGAGATTTTGAAAAGAAACAGTTTTTTGAAAGAGGTTATG 420
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 361 CAATGTCTCAACGAGCTCTCAGAGATTCTGAAAAGAAACAGGTTTTTGAAAGAGGTTATG 420
Query 421 TTCTCAGAGTCGAGAATTGGATACAGAGGAGCTACGCTTCTTGGATCGGCTCTCCAAGTT 480
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 421 TTCTTAGAGTCGAGTATTGGATACAGAGGAGCTACGCTTCTCGGGTCGGCTCTCCAAGTT 480
Query 481 AACGATTCGTTAGAGGAATTGCAGATTTGGGAAGACTCAATTGGGTCAAAAGGAGCTGAA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 481 AACGATTCGTTAGAGGAATTGCAGATTTGGGAAGATTCGATTGGGTCAAAAGGAGCTGAA 540
Query 541 GAACTCTCCAAGATGATTGAAGTGAACTCAAGTTTGAAACTTTTCTCCATTTTCGACTCG 600
|| || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 GAGCTTTCGAGGATGATTGAAATGAACTCAAGTTTGAAACTTTTCTCCATTTTCGACTCG 600
Query 601 AGTCCTTTCACTGCCACGCCATTGATATCTGCTGTTTTGGGTATGAACAGAGAAATGGAG 660
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 AGCCCTTTCACTGCTACGCCATTGATATCTGCTGTTTTGGGTATGAACAGAGAAATGGAG 660
Query 661 GTTCATGTTTGGAGTGGAGATCACAAACGAGATAGAAGCAC-AAAGCTTGTTGAGTTCTT 719
|||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 661 GTTCATATGTGGAGTGGAGATCACAAACGAGACAGAAGC-CTAAAGCTTGTTGAGTTCTT 719
Query 720 GCCTGAGAGCAACACTCTGAGGATTTACCAGATTGACATTTCTGGTTCTTGCAGAGTCGC 779
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 GCCTGAGAGCAAAACTCTGAGGATTTACCAGATTGACATTTCTGGTTCTTGCAGAGTCGC 779
Query 780 TGCAGCCTTGGGGATGAACACAACCGTGAGGGCTCTAGACATGACGGGTGCGAAGCTGAA 839
|||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 780 TGCAGCCTTGGGGATGAATACAACAGTCAGGTCTCTAGATATGACGGGTGCGAAGCTAAA 839
Query 840 TTCGCGGTGGGCGAAGGAGTTTAGATGGGTTTTGGAACAGAACAAGACTCTTAGAGAAGT 899
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 840 CTCTCGGTGGGCGAAGGAGTTTAGATGGGTTTTGGAACAGAACAAGACTCTGAGAGAAGT 899
Query 900 GAAACTTTCGAAAACCGGTCTTAAAGACAAAGCGGTTGTTTATGTTGCAGCTGGACTTTT 959
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 900 GAAACTTTCGAAAACAGGTCTTAAAGACAAAGCTGTTGTTTATATTGCAGCTGGACTATT 959
Query 960 CAAGAACAAGAGCTTGCAGAGTTTGTATGTTGATGGAAATCGGTTTGGAAGCGTTGGTGT 1019
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 960 CAAGAACAAGAGCTTGCAGAGTTTGTATGTTGATGGAAATCGGTTTGGGAGCGTTGGTGT 1019
Query 1020 CGAGGATTTGCTTTGTCCATTGAGTAGATTCTCTGCTCTGCAATTACAAGCTAACATCAC 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TGAGGATTTGCTTTGTCCATTGAGTAGATTCTCTGCTCTGCAATTACAAGCTAACATCAC 1079
Query 1080 ATTGCGGTCAATTGTGTTTGGAGGTTCCAAGACAAAGATTGGAAGAGATGGACTTACCGC 1139
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1080 ATTGCGGTCAATTGTGTTTGGAGGTTCCAATACAAAGATTGGAAGAGATGGACTTACAGC 1139
Query 1140 GGTTTTAAAGATGGTGACAACAAATGAGACTGTGGTTCATCTTGGGATTCACGACGATGC 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1140 AGTTTTAAAGATGGTGACAACAAATGAGACTGTGGTTCATCTTGGGATTCATGACGATGC 1199
Query 1200 GAGTCTGGGACCTGATGATTTCATACATATCTTCAAGACCTTGCAGAAGAACTCGTCTAT 1259
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
Sbjct 1200 GAGTTTGGGACCTGATGATTTCATACATATCTTCAAGAGCTTGCAGAAGAACGCGTCTTT 1259
Query 1260 AAGACGGTTTTCGTTACAAGGCTGCAAAGGGGTAAGAGGTGATAGAGTATTGGAGGCAAT 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 AAGACGGTTTTCGTTACAAGGCTGCAAAGGGGTAAGAGGTGATAGAGTATTGGAGGCAAT 1319
Query 1320 CACAGAGACATTGCAGATTAATCCATTGATTGAGGAAATTGATTTAGCGAGAACTCCGCT 1379
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320 CACTGAGACATTGCAGATTAATCCATTGATTGAAGAAATTGATTTAGCGAGAACTCCGCT 1379
Query 1380 TCAAGATTCAGGGAAGGCAGATGAGATTTATCAGAAGCTGGGACACAATGGTAGGAAGAT 1439
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 TCAAGATTCAGGGAAAGCAGATGAGATTTATCAGAAACTGGGACACAATGGTAGGAAGAT 1439
Query 1440 AGATGAAGCAGAGACGGATGATTCACTCAAGGATATGCCACTTACTGAGCCAAAGAGCAT 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1440 AGATGAAGCAGAGACGGATGATTCACTCAAGGATATGCCACTTACTGAGCCAAAGAGCGT 1499
Query 1500 TAGAGCTTTCCTCTGTGGACAAGACTATGCAGGAAAGACAACACTCTGCAACTCTATACT 1559
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 TAGAGCTTTCCTCTGTGGACAAAACTATGCAGGAAAGACAACACTCTGCAACTCTATACT 1559
Query 1560 GCAAAGTTCCTCTTCTTCGGGTTTTCCGTATGTGGAGAATGTGAGAACTTTGATGAATCC 1619
||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1560 GCAAAGTTCGTCTGCTTCCGGTTTTCCTTATGTGGAGAATGTGAGAAATTTGATGAATCC 1619
Query 1620 TATGGAGCAAGCGGTTAAAACAGTTGGTGGGATGAAAATAAAGACATTCAAGGACGAGGA 1679
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 TGTGGAGCAAGTGGTTAAAACAGTTGGTGGGATGAAAATAAAGACATTCAAGGACGAGGA 1679
Query 1680 GACAAAGATTTTGATGTGGAATCTTGCGGGGCAGCACGAGTTCTTTGCCCTTCATGATCT 1739
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1680 GACAAAGATCTCGATGTGGAATCTTGCGGGGCAGCACGAGTTCTTTGCTCTTCATGATCT 1739
Query 1740 TATGTTTCCAAGCCCAT-CTCTCTTCTTGATCGTATTGAGCTTGTTTAGGAAACCGAGCA 1798
|||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 TATGTTCCCAAGCCCGTGCT-TCTTCTTGATCGTATTGAGCTTGTTTAGGAAACCGAGCA 1798
Query 1799 ATAAAGAACCCAAAACACCAGCAGAAGTAGAAGAAGAGCTTCAATACTGGCTTAGATTCA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1799 ATAAAGAACCCAAAACACCAGCAGAAGTAGAGGAAGAGCTTGAATACTGGCTTAGATTCA 1858
Query 1859 TCGTTTCCAACTCGAGAAAAGCGGTCCAACAATGCATGAAACCGAATGTCACAATTGTTC 1918
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1859 TCGTTTCCAACTCGAGAAAAGCGATCCAACAATGCATGAAACCAAATGTCACAATTGTTC 1918
Query 1919 TCACGCATTCCGACAAAATCAATCTGCAATCTGAAAGCTTTCAGGCAACTGTGGGTTGCA 1978
|||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TCACACATTCCGAAAAAATCAATCTACAATCTGAAAGCTTTCAGGCAACTGTGGGTTGCA 1978
Query 1979 TTCAGAGACTGAGAGATAAGTTTCAAGCTTTAGTGGAATTTTATCCGACTGTATTCACAG 2038
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 TTCAGAGACTGAGAGATAAGTTTCAGGCTTTAGTGGAATTTTATCCGACTGTATTCACAG 2038
Query 2039 TTGATGCAAGATCATCTCCTTCGGTTAGTAAACTCACACATCATATTCGGATGACTAGCA 2098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 TTGATGCAAGATCATCTCCTTCGGTTAGTAAACTCACACATCATATTCGGATGACTAGCA 2098
Query 2099 AAGCCATCCTTCAAAGAGTTCCTCGGGTTTATCAGCTCTGCAATGATATGGTACAGCTCT 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2099 AAGCCATCCTTCAAAGAGTTCCTCGGGTTTATCAGCTCTGCAATGATATAGTACAGCTCT 2158
Query 2159 TATCAGACTGGAGATCAGAGAATTCAAACAAACCTATTATGAGATGGAAAGCCTTTGCAG 2218
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 TATCAGACTGGAGATCAGAGAATTCGAACAAACCTATTATGAGATGGAAAGCCTTTGCAG 2218
Query 2219 ATCTCTGCCAGTTTAAGGTTCCTTCCCTGAGAATAAAGTCCCGCAACGAGAACATTGAGA 2278
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 2219 ACCTCTGCCAGTTTAAGGTTCCTTCCCTGAGAATAAAGTCTCGCAACGAGAACATTCAGA 2278
Query 2279 TTGTGGAGACAAGACGGCAAGCTATAGCCACATGCCTCCACCAAATAGGAGAGGTGATTT 2338
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2279 TTGTGGAGACAAGACGGCATGCTATAGCCACATGCCTCCACCAAATGGGAGAGGTGATTT 2338
Query 2339 ACTTTGATGACTTGGGCTTTTTGATACTAGACTACGAATGGTTTTGTGGGGAGGTTCTTA 2398
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 ACTTTGATGACTTGGGCTTTTTGATACTAGACTATGAATGGTTTTGTGGGGAGGTTCTTA 2398
Query 2399 CTCAGTTGATAAAGCTTGATGTAAGAAAGCAAAGCACCGGGGAAAGAAATGGGTTTGTGA 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399 CTCAGTTGATAAAGCTTGATGTAAGAAAGCAAAGCACTGGGGAAAGAAATGGGTTTGTGA 2458
Query 2459 GCAGGAAAGAGCTAGAGAAGACTTTGAGAAGTAGTTTACAGAGTCCAATTCCAGGGATGA 2518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 GCAGGAAAGAGCTAGAGAAGACTTTGAGAAGTAGTTTACAGAGTCCAATTCCAGGGATGA 2518
Query 2519 CCTCAAAGGTACTTGAGCACTTTGATGTGTGTGACCTTGTGAAGATGATGAAGAAAGTAG 2578
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 CCTCAAAGGTACTTGAGCACTTTGATGCGTGTGACCTTGTGAAGATGATGAAGAAAGTAG 2578
Query 2579 AACTTTGCTATGAACAAGACCCTTCCTGTCCAGACTCTTCATTGTTAGTCCCATCGATTC 2638
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 AACTTTGCTATGAGCAAGACCCTTCCAGTCCAGACTCTTCATTGTTAGTCCCATCGATTC 2638
Query 2639 TCGAAGAAGGCAGAGGAAAGACACAGAAATGGCAGGTAAACACACACGACTGTGTTTATT 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2639 TCGAAGAAGGCAGAGGAAAGACACAGAAATGGCAGATAAACACACATGACTGTGTTTATT 2698
Query 2699 CAGGCCGGCATCTCCAGTGCGATGATTCAAGTCACATGTTTCTCACAGCTGGTTTCTTCC 2758
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2699 CAGGCCGTCATCTTCAGTGCGATGATTCAAGTCACATGTTTCTCACAGCTGGATTCTTCC 2758
Query 2759 CTCGTTTACAGGCAAGGGATCAAAAGCATTTTTCTGTACATCTTCACAACAGAATCATGG 2818
|||||||||||| | |||| || | || | | | |||||||||||
Sbjct 2759 CTCGTTTACAGG-------T-----GCAT----CT-T-CA-C---A-A-CAGAATCATGG 2794
Query 2819 AACTGAAGAACCAACACGGGGCGACTTATAATCTTGAGAAGTACCTCATCT-CTATAACG 2877
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 2795 AACTGAAGAACCAACACGGGGCGACTTATAGTCTTGAGAAGTACCTCAT-TGCTATAACG 2853
Query 2878 ATCCATGGCATTAACATTAGAGTGGAGCTTGGAGGACAGTTGGGAAATTACATTGATATT 2937
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2854 ATCCATGGTATTAACATTAGAGTGGAACTTGGAGGACAGTTGGGAAATTACATTGATGTT 2913
Query 2938 CTTGCTTGCTCGA-CAAAGAGCTTGACAGAAACTCTGAGGCTCATTCACCAGCTAATCAT 2996
|| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2914 CTGGCTTGTTC-ATCAAAGAGCTTGACAGAAACTCTGAGGCTCATTCACCAGCTAATCAT 2972
Query 2997 TCCGGCTATCCAGAGCAGCTGCCAAGGTGTAATCCTCCTTGAGCACATCATAAGACCACA 3056
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2973 TCCGGCTATCCAGAGCAGCTGCCGAGGTGTAATCCTCCTTGAGCACATCATAAGACCACA 3032
Query 3057 ATGCGTCCAGGACTTGACTCCACCGCGATTCCGACAAAGTCAGTTTGTTTCCCTCCACAG 3116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3033 ATGCGTCCAGGACTTGACTCCACCGCGATTCCGACAAAGCCAGTTTGTTTCCCTCCACAG 3092
Query 3117 ACTAAAAGAAGCATTGTCATCAGTTCCTGCAGAAACTATGTATGACTATCAACACACATG 3176
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3093 ACTAAAAGAAGCATTATCATCAGTTCCTGCAGAGACTATGTATGACTATCAACACACATG 3152
Query 3177 GGACTCTGTCCTAGATTCAGGTAAGACTGTTCTAAGAGCCGGATTTGATTTAGCCCGCAA 3236
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3153 GGACTCTGTTCTAGATTCAGGTAAGACTGTTCTAAGAGCCGGATTTGATTTAGCCCGCAA 3212
Query 3237 CCTCCTCTCTGATGATGATTTCAGAGAAGTATTGCAAAGAAGGTACCATGATCTGCACAA 3296
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3213 CCTCCTCTCTGATGATGATTTCAGAGAAGTCCTGCAAAGAAGGTACCATGATCTGCACAA 3272
Query 3297 CTTAGCTCAAGAACTACAAGTTCCCACCGACGAAAACCCCGAAGCAGATAATCATGTTCC 3356
|||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3273 CTTAGCACAAGAACTACAAGTTCCAACAGACGAAAACCCCGAAGCAGATAATCATGTACC 3332
Query 3357 GGTGACCAATGAGCTGGAAAAAGTTGATCCTAGCTTCGGTGGAATCGCTAAGGGAGTAGA 3416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 3333 GGTGACCAATGAGCTGGAAAAAGTTGATCCTAGCTTCGGTGGAATTGCTAAAGGAGTAGA 3392
Query 3417 AGCAGTACTTCAGAGACTGAAGATTATCGAGCAAGAGATACGAGACCTGAAACAAGAAAT 3476
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 3393 AGCAGTACTTCAGAGACTGAAGATTATTGAGCAAGAGATACGCGACCTGAAACAAGAGAT 3452
Query 3477 CCAAGGACTGAGATACTATGAGCACAGACTTCTGATCCAGCTTCATCACAAAGTGAATTA 3536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3453 CCAAGGACTGAGATACTATGAGCACAGACTTCTGATCCAGCTTCATCACAAAGTGAATTA 3512
Query 3537 CCTTGTCAACTATAATGTCCAGATGGATGAAAGACAAGTTCCAAACATGTTTTACTTCAT 3596
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3513 CCTTGTCAACTATAATGTCCAGATGGATGAAAGAAAAGTTCCAAACATGTTTTACTTCAT 3572
Query 3597 CAGAGCAGAGAACTACGGGAGACGACTGATCACATCTATGGTTCCTGGCATGGTTGCTCT 3656
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3573 CAGAGCAGAGAACTACGGGAGACGACTGATCACATCTATGGTTCCTGGCATGGTCGCTCT 3632
Query 3657 AAGGATACACATGTTATGCGAATTTAGACGGGAAATGCACGTCGTAGAAGATCAGCTTGG 3716
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3633 AAGGATACACATGTTATGCGAATTTAGGCGGGAAATGCACGTCGTAGAGGATCAGCTTGG 3692
Query 3717 GTGTGACGTGATGCAGATAGACAACCAAGCTGTGAAGTGCTTGGCTCCATACATGACAAA 3776
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3693 TTGTGACGTAATGCAGATAGACAACCAAGCTGTGAAGTGCTTGGCTCCATACATGACAAA 3752
Query 3777 CTTCATGAAACTGGTGACTTTTGCATTGAGGATAGGAGCAAACTGGGCAGCTGGGATGGG 3836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3753 CTTCATGAAACTGGTGACTTTTGCATTGAGGATAGGAGCAAACTGGGCAGCTGGGATGGG 3812
Query 3837 ACACATGATACCTGACTTGGGCCACGCTATCGCTCACCTAGCCAACCCAGCTGTCATGAC 3896
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3813 ACACATGATACCTGACTTGAGCCATACTATCGCTCACCTAGCCAACCCAGCTGTCATGAC 3872
Query 3897 TGGAGCGGCCGGAGCTGCAGGAGCCATGGGGGTCGCTGTTGCATTGGGTAGGAACCGAGG 3956
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3873 TGGAGCGGCCGGAGCTGCAGGAGCCATAGGGGTCGCTGCTGCATTGGGTAGGAACCGAGG 3932
Query 3957 CAGAGATAGAGATATTCAGGAACAAGACCAAAGAGCAGCTCAACAGTGGCTCATTGATTA 4016
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3933 CAGAGATAGAGATATTCAGGAACAAGAACAAAGAGCAGCTCAACAGTGGCTCATCGATTA 3992
Query 4017 CTTGAGGGAACAGAATTGCTCAACAGGAAGGGATATTGCAGAAAAATTTGGCCTGTGGCG 4076
|||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3993 CTTGAGGGAACAGACTTGCTCAACCGGGAGGGATATTGCAGAAAAATTTGGCCTCTGGCG 4052
Query 4077 AGTTAGATACAGAGACGATGGGTCCATCGCCTGGATCTGCAAACGGCATATGATCACCAG 4136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4053 AGTTAGATACAGAGACGATGGGTCCATCGCCTGGATTTGCAAACGGCATATGATCACCAG 4112
Query 4137 AGCCAATGAAGTGATCCAAGTTCCTCTCTAATGGTTGCTAGCTAGCTACAAATGAACAGT 4196
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4113 AGCCCATGAAGTGATCCAAGTTCCTCTCTAATGGTTGCTAGCTAGCTACAAATAAACAGT 4172
Query 4197 AAGAGAAAGTAGTTTAATTAGGCAAAACCATTTTCATTAAATTCTGTTGCCTTATGATAA 4256
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||
Sbjct 4173 AAGAGAAAGTAGTTTAAT-AGGCAAAACCATTTTCATTAAATTATGTTGCATTACGATAA 4231
Query 4257 TGCTTTGAATCTTTTACTTATTTACTGTTGAATCCCTT 4294
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4232 TGTTTTGAATCTTTTACTTACTTACTGTTGAATCCCTT 4269
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 214062345781
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5