BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495812
Length=3818
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G57160.1 | Symbols: ATLIG4, LIG4 | DNA ligase IV | chr5:2315... 5956 0.0
> AT5G57160.1 | Symbols: ATLIG4, LIG4 | DNA ligase IV | chr5:23154965-23161746
REVERSE LENGTH=3903
Length=3903
Score = 5956 bits (3225), Expect = 0.0
Identities = 3523/3670 (96%), Gaps = 8/3670 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACGGAAGAGATCAAATTCAGCGTTCTGGTATCTCTCTTCAACTGGATTCAAAAAAGC 60
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 59 ATGACGGAGGAGATCAAATTCAGCGTACTGGTATCTCTCTTTAACTGGATTCAAAAAAGC 118
Query 61 AAAACCTCATCTCAAAAACGCTCCAAATTCCGCAAGTTTCTCGACACTTACTGCAAACCC 120
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 AAAACCTCATCTCAGAAACGATCCAAATTCCGCAAGTTTCTCGACACTTACTGCAAACCC 178
Query 121 TCCGACTACTTCGTCGCCGTCCGTTTAATCATTCCGTCGCTTGATCGAGAACGAGGTAGC 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 TCCGACTACTTCGTCGCCGTCCGTTTAATCATTCCGTCGCTTGATCGAGAACGAGGTAGC 238
Query 181 TACGGCCTCAAAGAGTCAGTGCTCGCCACGTGTCTGATCGACGCACTTGGCATCTCTCGT 240
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 239 TACGGCCTTAAAGAGTCAGTGCTCGCCACGTGTCTGATCGACGCACTTGGTATCTCGCGT 298
Query 241 GACGCTCCTGACGCTGTACGTCTTCTCAATTGGCGTAAAGGAGGAACCGCTAAAGCTGGA 300
|| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 299 GATGCTCCTGATGCTGTTCGTCTTCTCAATTGGCGTAAAGGAGGAACTGCTAAAGCTGGA 358
Query 301 GCCAATGCTGGAAACTTTTCCTTGATTGCTGCTGAGGTATTGCAACGTAGACAAGGAATG 360
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 GCCAATGCTGGAAACTTCTCCTTAATTGCTGCTGAGGTATTGCAACGTAGACAAGGAATG 418
Query 361 GCTTCTGGTGGTTTGACTGTTAAGGAATTGAATGATTTGCTTGATCGTTTGGCTTCAAGT 420
|||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 GCTTCTGGCGGTTTGACTATTAAGGAATTGAATGATTTGCTTGATCGTTTGGCTTCAAGT 478
Query 421 GAGAACAGGTGCAGAGCCGAAAAAACTTTGGTTCTTTCTACTTTGATTCAGAAGACAAAT 480
||| | | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 479 GAG-A-A----CAGAGCGGAGAAAACTTTGGTTCTTTCTACATTGATTCAGAAGACAAAT 532
Query 481 GCTCAGGAGATGAAGTGGGTCATTAGGATTATTCTTAAAGATTTGAAACTGGGAATGAGT 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 GCTCAGGAGATGAAGTGGGTCATTAGGATTATTCTAAAAGATTTGAAACTGGGAATGAGT 592
Query 541 GAGAAGAGCATTTTTCAGGAGTTCCATCCAGATGCTGAGGACTTGTTTAATGTTACCTGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 593 GAGAAGAGCATTTTTCAGGAGTTCCATCCAGATGCTGAGGACTTGTTTAATGTCACATGT 652
Query 601 GACTTGAAACTAGTCTGTGAAAAGTTGAGGGATCGACACCAACGGCACAAGCGCCAGGAT 660
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653 GATTTGAAACTAGTCTGTGAAAAGTTGAGGGATCGACACCAACGGCACAAGCGCCAGGAT 712
Query 661 ATAGAGGTTGGGAAAGCCGTACGACCCCAATTAGCTATGCGTATCAGTGATGTAAATGCT 720
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 713 ATAGAGGTTGGAAAAGCCGTACGACCCCAGTTAGCTATGCGTATTGGTGACGTAAATGCT 772
Query 721 TCTTGGAAGAAACTGCATGGGAAAGATGTAGTTGCTGAATGCAAATTTGATGGGGATCGC 780
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 GCTTGGAAGAAGCTGCATGGGAAAGATGTAGTTGCTGAATGCAAATTTGATGGGGATCGC 832
Query 781 ATACAAATACACAAAAATGGGACTGACATACATTACTTCTCTAGGAACTTCCTTGACCAT 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 833 ATACAAATACACAAAAATGGGACTGACATACATTACTTCTCTAGGAACTTCCTTGACCAT 892
Query 841 TCTGAATACGCACATGCCATGTCGGATCTTATTGTACAAAATATATTAGTGGACAAGTGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 893 TCTGAATACGCACATGCCATGTCGGATCTTATTGTACAAAATATATTGGTGGACAAGTGT 952
Query 901 ATCCTCGATGGTGAAATGTTGGTCTGGGATACATCCCTGAATCGGTTTGCTGAGTTTGGT 960
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 ATCCTTGATGGTGAAATGTTGGTCTGGGATACATCTCTGAATCGGTTTGCTGAGTTTGGT 1012
Query 961 TCGAATCAGGAAATAGCCAAGGCAGCAAGGGAGGGTCTTGACAGCCATAAACAGTTGTGT 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 TCGAATCAGGAAATAGCCAAGGCAGCAAGGGAGGGTCTTGACAGCCATAAACAGTTGTGT 1072
Query 1021 TATGTTGCCTTTGATGTTCTTTATGTTGGCGATACTAGCGTCATCCACCAGAGTTTGAAG 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 TATGTTGCCTTTGATGTTCTTTATGTTGGCGATACTAGCGTCATCCACCAGAGTTTGAAG 1132
Query 1081 GAACGGCATGAACTGCTGAGGAAAGTGGTCAAACCTTTAAAAGGTCGGCTCGAAGCTTTA 1140
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1133 GAACGGCATGAACTGCTGAAGAAAGTGGTCAAACCTTTAAAAGGTCGGCTCGAAGTTTTA 1192
Query 1141 GTACCTGAAGGTGGTCTCAATGTTCACCGCCCTTCAGGGGAACCTAGTTGGTCTATTGTT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 GTACCTGAAGGTGGTCTCAATGTTCACCGCCCTTCAGGGGAACCTAGTTGGTCTATTGTT 1252
Query 1201 GTTCATGCTGCTGCTGATGTTGAGCGATTTTTCAAAGAAACAGTTGAAAACAGAGATGAA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GTTCATGCTGCTGCTGATGTTGAGCGATTTTTCAAAGAAACAGTTGAAAACAGAGATGAA 1312
Query 1261 GGAGTTGTGCTTAAAGACCTGGGATCGAAATGGGAACCTGGAGATCGTAGTGGCAAGTGG 1320
||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GGAATTGTGCTTAAAGACCTGGAATCAAAATGGGAACCTGGAGATCGTAGTGGCAAGTGG 1372
Query 1321 TTGAAATTGAAGCCTGAATATATCCGGGCTGGTGCTGACCTGGATGTTCTTATAATAGGA 1380
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 ATGAAATTGAAGCCTGAATATATCCGGGCTGGTGCTGACCTGGATGTTCTTATAATAGGA 1432
Query 1381 GGATACTATGGCTCCGGACGTCGTGGAGGAGAGGTAGCACAGTTTCTTGTCGCCTTGGCT 1440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1433 GGATACTATGGCTCCGGACGTCGTGGAGGAGAGGTAGCACAGTTTCTTGTAGCCTTGGCT 1492
Query 1441 GACCGGGCAGAGGCAAATGTATATCCCAGGCGATTTATGTCCTTTTGTAGAGTTGGCACT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1493 GACCGGGCAGAGGCAAATGTATATCCCAGGCGATTTATGTCCTTTTGTAGAGTTGGCACT 1552
Query 1501 GGACTTTCTGATGATGAGCTCAACACTGTTGTAAGCAAACTGAAGCCTTATTTCAGAAAA 1560
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 GGGCTTTCTGATGATGAGCTTAACACTGTTGTAAGCAAACTGAAGCCTTATTTCAGAAAA 1612
Query 1561 AATGAACACCCAAAGAAGGCTCCACCAAGCTTCTATCAGGTCACTAATCACTCAAAAGAG 1620
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1613 AATGAGCACCCAAAGAAGGCTCCACCAAGCTTCTATCAGGTCACTAATCACTCCAAAGAG 1672
Query 1621 AGACCGGATGTTTGGATTGAAAGCCCGGAAAAATCAATAATACTTTCAATCACTAGTGAT 1680
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 AGACCGGATGTTTGGATTGACAGCCCGGAAAAATCAATAATACTTTCAATCACTAGTGAT 1732
Query 1681 ATCAGGACAATAAGGTCTGAGGTGTTTGTTGCACCTTACAGCCTGAGGTTTCCTCGTATT 1740
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1733 ATCAGGACGATAAGGTCTGAGGTGTTTGTTGCACCTTACAGTCTGAGGTTTCCTCGTATT 1792
Query 1741 GATAAAGTAAGATATGACAAGTCTTGGCATGAATGTCTCGATGTGCAGGCTTTTGTGGAA 1800
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1793 GATAAAGTAAGATATGACAAGCCTTGGCATGAATGTCTTGATGTGCAGGCTTTTGTGGAA 1852
Query 1801 TTGGTAAATTCGAGTAACGGCACCACACAGAAACAGAAGGAATCTGAAAGCACACAGGAC 1860
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1853 TTGGTGAATTCGAGTAACGGCACCACACAGAAACAGAAGGAGTCTGAAAGCACACAGGAC 1912
Query 1861 AATCCAAAAGTCAATAAATCTTCCAAGAAAGGAGAGAAAAAGAATGTCTCTCTTGTCCCC 1920
||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1913 AATCCGAAAGTCAATAAATCCTCCAAGAGAGGAGAGAAAAAGAATGTCTCTCTTGTTCCC 1972
Query 1921 TCTCAGTTTATTCAAACTGATGTATCGGATATCAAGGGCAAGACCTCAGTCTTCTCAAAT 1980
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1973 TCTCAGTTTATTCAAACTGATGTATCGGATATCAAGGGCAAGACCTCAATCTTCTCAAAT 2032
Query 1981 ATGATATTTTATTTTGTTAACGTGCCTCTGTCCCATTCTCTTGAGACTTTCCACAAAATG 2040
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2033 ATGATATTTTATTTTGTTAACGTGCCTCGGTCCCATTCTCTTGAGACATTCCACAAAATG 2092
Query 2041 GTGGTTGAGAATGGAGGGAAGTTTTCAATGAACTTAAACAACTCAGTGACTCATTGCATT 2100
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2093 GTGGTTGAAAACGGAGGGAAGTTTTCAATGAACTTAAACAACTCAGTGACTCATTGCATT 2152
Query 2101 GCAGCAGAAAGCAGTGGAATAAAATATCAGGCAGCAAAGCGTCAGAGAGATGTCATCCAC 2160
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2153 GCAGCAGAAAGCAGTGGAATAAAGTATCAGGCAGCAAAGCGTCAGCGAGATGTCATCCAC 2212
Query 2161 TTTTCATGGGTCTTAGATTGCTGTTCGCGAAATAAGATGCTTCCTTTGCAGCCAAAGTAT 2220
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2213 TTTTCATGGGTCTTAGATTGTTGTTCACGAAATAAGATGCTTCCTTTGCTGCCAAAGTAC 2272
Query 2221 TTCCTCCACCTCACTGATGCTTCAAGGACAAAATTACAGGATGACATTGATGAATTTTCT 2280
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2273 TTCCTCCACCTCACTGATGCTTCAAGGACAAAATTACAGGATGATATTGATGAATTTTCT 2332
Query 2281 GATTCTTATTACTGGGATTTAGACCTTGAAGGTCTCAAACAGGTCTTAAGCAATGCCAAG 2340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2333 GATTCTTATTACTGGGATTTAGACCTTGAAGGTCTCAAACAGGTCTTAAGCAATGCCAAG 2392
Query 2341 CAATCTGAAGATTCAAAATCCATTGACTACTACAAGAAAAAGTTATGTCCAGAGAAAAGA 2400
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2393 CAATCTGAAGATTCAAAATCTATTGACTACTACAAGAAAAAGTTATGTCCTGAAAAAAGA 2452
Query 2401 TGGTCCTGCCTCTTTAGCTGCTGTGTTTACTTCTACCCGTATAGTCAAACATTGAGCACT 2460
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2453 TGGTCCTGCCTCTTAAGCTGCTGTGTTTACTTTTACCCGTATAGTCAAACATTGAGCACT 2512
Query 2461 GAAGAGGAAGCCCTGTTGGGAATTATGGCTAAGAGATTAGCGCTTGAAGTGTTAATGGGT 2520
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
Sbjct 2513 GAAGAGGAAGCCCTATTGGGAATTATGGCTAAGAGATTAATGCTTGAAGTCTTAATGGCT 2572
Query 2521 GGTGGTAAAGTTAGCAATAATCTTGCTCATGCGTCGCACCTTGTAGTCCTTGCTGTGGCA 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 2573 GGTGGTAAAGTTAGCAATAATCTTGCTCATGCGTCGCACCTTGTAGTTCTTGCTATGGCA 2632
Query 2581 GAAAAATCTTTGGATTTTGCTTCAGTTTCGAAAAGTTTCAGTGAGATGGAGAAACGTCTT 2640
||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 2633 GAAGAACCTTTGGATTTTACTTTAGTTTCGAAAAGTTTCAGCGAAATGGAGAAACGTCTT 2692
Query 2641 TTGCTGAAGAAAAGGCTTCATGTTGTTAGCTCGCACTGGTTAGAGGACAGCTTGCGAAGA 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
Sbjct 2693 TTGCTGAAGAAAAGGCTTCATGTTGTTAGCTCGCACTGGTTAGAGGAAAGCTTGCAAAGA 2752
Query 2701 GAGGAAAAACTGTGCGAGGATGTCTACAATCTGAGGCCTAAGTATATGGAAGAGTCTGAT 2760
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 GAGGAAAAACTGTGCGAGGATGTCTACACTCTGAGGCCTAAGTATATGGAAGAGTCTGAT 2812
Query 2761 ACTGAAGAATCAGATAAATCCGAACATGATACAACGGAAGTAGCTTCCGAAGGTAGTGCT 2820
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2813 ACTGAAGAATCAGATAAATCCGAACATGATACAACGGAAGTAGCTTCCCAAGGTAGTGCT 2872
Query 2821 CAAACCGAAGAGCCAGCTTCCTCAAAAATGGCAATTACGAGTTCAAGAGGACGGTCAAAT 2880
|||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2873 CAAACCAAAGAGCCAGCTTCCTCTAAAATTGCAATTACGAGTTCAAGAGGACGGTCAAAT 2932
Query 2881 ACTAGAGCTGTTAAAAGGGGAAGGTCTTCTACAAACTCACTGCGACGAGTACAGAGACGG 2940
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2933 ACTCGAGCTGTTAAAAGGGGAAGGTCTTCTACAAACTCACTGCAACGAGTACAGAGACGC 2992
Query 2941 AGAGGCAAGCAGCCTTCTAAGATAACCGGAGATGAAACAGAGGAGAGTGATGCTTCTGAA 3000
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2993 AGAGGCAAGCAGCCGTCTAAGATAAGCGGAGATGAAACAGAGGAAAGTGATGCTTCTGAA 3052
Query 3001 GAAAAGGTTTCAACAAGACTCAGTGATATAGCAGAAGAGACTGATTCGTTTGGTGAGGCT 3060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3053 GAAAAGGTTTCAACAAGACTCAGTGATATAGCAGAAGAGACGGATTCGTTTGGTGAGGCT 3112
Query 3061 CAAAGAAACTCTAGCAGAGGAAGATCTGCGAAGAGAGGAAAGTCTCGTGTGGGACAAACC 3120
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3113 CAAAGAAACTCTAGCAGAGGAAAATGTGCGAAGAGAGGAAAGTCTCGTGTGGGACAAACC 3172
Query 3121 CAAAGAGTACAGAGATCACGAAGAGGCAAGAA-GCCTTCAAAGATAGGAGGAGATGAGTC 3179
|||||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 CAAAGAGTACAGAGATCACGCAGAGGCAAGAAAGC-TGCGAAGATAGGAGGAGATGAGTC 3231
Query 3180 TGAGGAAAATGATGAATTTGGTGACAAAAACAATGTGTCATCAGATGCGGAAGAGAGTAA 3239
||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 3232 TGATGAAAATGATGAATTAGATGGCAATAACAATGTGTCAGCAGATGCGGAAGAGGGTAA 3291
Query 3240 TGCAGCTGGTAGATCTGTGGAAAACGAAGAAACCCGAGAACCTGACATAGCGAAGTACAC 3299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3292 TGCAGCTGGTAGATCTGTGGAAAACGAAGAAACCCGAGAGCCTGACATAGCGAAGTACAC 3351
Query 3300 AGAATCACTGCAAAGAGACACCACAGCAGCAGTTGAAGACGCCTCACAAGATTCTAGAAA 3359
|||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct 3352 AGAATCACAGCAAAGAGACAACACAGTAGCAGTTGAAGAGGCCTTACAAGATTCTAGAAA 3411
Query 3360 TGCAAAGACCGAGATGGATATGAAAGAGAAGTTACAAATCCATGAGGATCCACTACAAGC 3419
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3412 TGCAAAGACGGAGATGGATATGAAAGAGAAGTTACAAATCCATGAGGATCCACTACAAGC 3471
Query 3420 TATGCTAATGAACATGTTCCCGAGTCTCAGTCaaaaaaaCACAGAGACATCAAACCGAAT 3479
|||| ||||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3472 TATGTTAATGAAAATGTTCCCTATTCCCAGTCAAAAAACCACAGAGACATCAAACCGAAC 3531
Query 3480 CACCGGGGAAAATAGAAAGGCTAATGTTTCTGGTGAATGCGAGTCTTCAGAGAAAAGAAA 3539
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3532 CACTGGGGAATATAGAAAGGCTAATGTTTCTGGTGAATGTGAGTCTTCAGAGAAAAGAAA 3591
Query 3540 ACTCGACACCGAGACTGATAATACTTGTGTGAACACAGGCACAGACTCAGAAGCAGTTCC 3599
||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||
Sbjct 3592 ACTCGACGCTGAGACTGATAATACATCTGTGAACGCAGGCGCAGAATCAGACGTAGTTCC 3651
Query 3600 TCCTCTTGCGAAGAAAAAGAAAGTCAGCTACCGGGATGTTGCCGGAGAACTGCTCAAAGA 3659
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3652 TCCTCTAGTGAAGAAAAAGAAAGTCAGCTACCGGGATGTTGCCGGAGAACTGCTCAAAGA 3711
Query 3660 CTGGTGATAC 3669
||||||||||
Sbjct 3712 CTGGTGATAC 3721
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 190182880913
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5