BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495857
Length=3368
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G57610.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein wi... 5291 0.0
> AT5G57610.1 | Symbols: | Protein kinase superfamily protein
with octicosapeptide/Phox/Bem1p domain | chr5:23324791-23329347
FORWARD LENGTH=3846
Length=3846
Score = 5291 bits (2865), Expect = 0.0
Identities = 3244/3419 (95%), Gaps = 58/3419 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGATTCAGGTTCTGTGAACTCATCTTCTGTCACTAGTCCAGTCTCGAGTTTGAACGAT 60
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 434 ATGGATTCAGGTTCTGTGAACTCA---TCTGTCACTAGTCTAGTGTCGAGTTTGAACGAT 490
Query 61 GAGCCGCATCGTGTTAAATTCCTGTGTAGCTTCTTAGGCAGTATATTGCCTCGTCCTCAG 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 491 GAGCCGCATCGTGTTAAATTCCTGTGTAGCTTCTTAGGGAGTATATTGCCTCGTCCTCAG 550
Query 121 GATGGGAAATTGAGGTATGTTGGTGGAGAGACGAGGATTGTGAGTGTGAATAGAGATATT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 GATGGGAAATTGAGGTATGTTGGTGGAGAGACGAGGATTGTGAGTGTGAATAGAGATATT 610
Query 181 AGGTATGAGGAGTTGATGGGCAAGATGAGAGAGCTTTATGACGGTGCAGCGGTGTTGAAG 240
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct 611 AGGTATGAGGAGTTGATGAGTAAGATGAGAGAGCTTTATGATGGTGCAGCAGTGTTGAAG 670
Query 241 TATCAGCAGCCTGATGAGGATCTTGATGCTTTGGTCTCGGTTGTGAATGATGATGATGTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671 TATCAGCAGCCTGATGAGGATCTTGATGCTTTGGTCTCGGTTGTGAATGATGATGATGTG 730
Query 301 ACGAATATGATGGAGGAATATGATAAGTTAGGTTCAGGGGATGGGTTTACTAGGCTTAGG 360
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 731 ACGAATATGATGGAGGAGTATGATAAGTTAGGTTCAGGAGATGGGTTTACTAGGCTTAGG 790
Query 361 ATCTTTCTGTTTTCGT-CTCCTGAGCAGGATGGTTCTTTGCATTATGTGGAACGCGATGA 419
|||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 791 ATCTTTCTGTTTTC-TACTCCTGAGCAGGATGGTTCTTTGCATTATGTGGAGCGTGATGA 849
Query 420 TCAGAGGGAATCTGAGAGGAGATATGTTGATGCTCTTAATAATTTGATCGAAGGGACAGA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 850 TCAGAGGGAATCTGAGAGGAGATATGTTGATGCTCTTAATAATTTGATCGAAGGGACAGA 909
Query 480 CTTTAGGAAGCTT-CAGCAGTATCCTGATTCACCTCGTTTCAATCTCGTTGATGATTTTT 538
|||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 910 CTTTAGAAAG-TTGCAGCAGTATCCTGATTCACCTCGTTTCAATCTCGTTGATGATTTTT 968
Query 539 CGATGGTGGAACCGATGCTGAATCAGCTGAGCATTGAGACTGGTGGTGGCAGCCAGAGGG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 969 CGATGGTGGAACCGATGCTGAATCAGCTGAGCATTGAGACTGGTGGTGGTAGCCAGAGGG 1028
Query 599 GCACCGAGATACCTACTGCGCAGTATAGTAATCTTCACCAGCTCAGGATTCCTCGTGTGG 658
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 GCAACGAGATACCTACTGCGCAGTATAGTAATCTTCACCAGCTCAGGATTCCTCGTGTGG 1088
Query 659 GTTCGGGGCAGATGCTTGCACAGAGGTATGGTGAAGTAGAGGGTACATGGAGTCCTTACT 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 1089 GTTCGGGGCAGATGCTTGCACAGAGGTATGGTGAAGTAGAAGGTACATGGAGTCCTTTCT 1148
Query 719 ATTCTCCTCGGCACCATGGACATCATGATCCCAGAACTTTTCAGGAATTTCCATCTTCGC 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 ATTCTCCTCGGCACCATGGACATCATGATCCCAGAACTTTTCAGGAATTTCCATCTTCGC 1208
Query 779 CTTCTTCTGCTCGTTATCGAATGCCATATGGGGAAATTCCTGATAAGGGGTTTGATAGAA 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1209 CTTCTTCTGCTCGTTATCGAATGCCATATGGGGAAATTCCTGATAAGGGATTGGATAGAA 1268
Query 839 TGCCTGAGGAGTATGTGAGGCCGCAAGCAAGTCATCATCCTTTATATGAGCACCAGGCAC 898
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||
Sbjct 1269 TGCCTGAGGAGTATGTTAGGCCGCAAGCAAGTCACCATCCTTTTTACGAGCACCAGGCAC 1328
Query 899 ACATTCCTGACAGTGTTGTGTGGGTCCCAGCTGGAGCAATGCCACCTGAGAGTAAAGGTG 958
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1329 ACATTCCTGACAGTGTGGTGTGGGTCCCAGCTGGAGCAATGCCACCTGAGAGTAAAGGAG 1388
Query 959 GTTTTCCTGGGAATGTTCTTCACAGTGGTCCAGGTGGCTATGAAGGTGGTAATGTATGCG 1018
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1389 GGTTTCCTGGGAATGTTCTTCACGGTGGTCCAGGTGGCTATGAAGGTGGTAATGGATGCG 1448
Query 1019 AGAACTGTCGTGTACCGTATCATAGGAACCATCAGCTTTTGGAGCAGCCTAATATAGGCA 1078
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1449 AGAACTGTCGTGTACCGTATCATAGGAACCATCAGCTTTTAGAGCAATCTAATATAGGCA 1508
Query 1079 ACAATGGATTTCCACCGGTTCATTGTGCACATTGTCCACCAAACAGGGAAAGTTTCCTGC 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509 ACAATGGATTTCCACCGGTTCATTGTGCACATTGTCCACCAAACAGGGAAAGTTTCCTGC 1568
Query 1139 TTAACACAGACCCGAAA-CCTACTCATCACGGAGCTTATCCAAATGAGACTTTCGGACAT 1197
||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1569 TTAACACAGACCC-AAAGCCTACTCATCATGGAGCTTATCCAAATGAGACTTTTGGACCT 1627
Query 1198 GAAAGAGGACGGATGGTTCAACAACAGGTGAATTCTAATCCTCCAAGGATTGAGGAAGGA 1257
|| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GATAGAGGATGGATGGTTCAACAACAGGTGAATCCTAACCCTCCAAGGATTGAGGAAGGA 1687
Query 1258 AGGTCACATATTTCTAATGTTGGAAGACCAAACGATCATTACACTCCCGATTATCCGGTG 1317
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1688 AGGTCACATATTTCTAATGTTGGAAGACCGAACGATCATTACACTCCCGATTATCCTGTG 1747
Query 1318 TCGAACTATCCTCTTGCTCAACGAGCTGGACATGAAATTTCGAATGAAGGGTTCCATGAT 1377
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1748 TCGAACTATCCTCTTGGTCAACGAGCTGGACATGAAATTTCCAATGAAGGGTTTCATGAT 1807
Query 1378 AAACCACTTGGTGGCATTCCCCTGAATTCGGCCAACCGTTCTGCTGAGGAACGTGTGTTT 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1808 AAACCACTTGGTGGCATTCCCCTGAATTCGGCCAACCGTTCTGCTGAGGAACGTGGGTTT 1867
Query 1438 CATTACGGGAATAATCTCTATCCTCCAGGACCTGAAAGTATCCAATCAGCAGGTCATAGC 1497
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1868 CATTATGGGAATAATCTCTATCCTCCAGGACCTGATAGTATCCACTCAGCAGGTCATAGC 1927
Query 1498 CATATGCACC-C--TCAACAAAATATTTGGCAGAACGTTTCAAATCCTGTAGCTGGTCCT 1554
|||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 1928 CATATGCACCACCCTCAACCAAATATTTGGCAGAACGTTTCAAATCCTATAGCTGGCCCT 1987
Query 1555 CCAGGCTTGTCCATGCAAATCAATGGCACAGTCAATCAGACCATAATCAGGAATCCGATA 1614
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||
Sbjct 1988 CCAGGCTTGCCCATGCAAATTAATGGCACAGTCAATCAGACCGTTATCAGGAATCCGATA 2047
Query 1615 GAAACTGCTCCTAGGTATTCTATTGGAGTAGAGAATCAAGGTGTTTTGGTTGGTTCTCCG 1674
|||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2048 GAAACTGCTCCTAGGTATTCTACTGGAATGGAGAATCAAGGTGTTTTGGTTGGTTCTCCG 2107
Query 1675 CAAAGGATTTCAGGCTTTGATGGAATGTCCTCCCCTGGCCAGCCTTACTACCCTAATCCC 1734
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2108 CAAAGGATTTCAGGCTTTGATGGAATGTCCTCCCTTGGCCAGCCTTCCTACCCTAATCCC 2167
Query 1735 CATTTGCAAGATAGAGCCTTCCCTTTAGACCCAAATTGGGTCCCATCTGAAAACCCGACA 1794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 2168 CATTTGCAAGATAGAGCCTTCCCTTTAGACCCAAATTGGGTGCCATCTGAAAACCCAACT 2227
Query 1795 GTACATAATGAACATCTACAGGTGCGTGAGCTTTTGTCTGGGCCATTATTACAGACAAAC 1854
||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2228 GTACATAATGAACATCTACAGGTGCGTGAGCCTCTGCCTGGGCCATTATTACAGACAAAC 2287
Query 1855 CTCAATGCTGCACCAATTATGCAGACACCAGTTATCCAGACACCAGAG-A--GCAAG-TT 1910
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | | | ||||| ||
Sbjct 2288 CTCACTGCTGCACCAATCATGCAGACACCAGTTATGCAGACATCTGTGGAAAGCAAGCTT 2347
Query 1911 AGCTCAGGGAGGTGAAAAATTTAACTATGTTGATACTGGTGTTTCAAACGGTGTTCCTTA 1970
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2348 -GCTCAGGGAGGTGAACAATTTAACTATGTTAATACTGGTATTTCAAACGGTGTTCCTTA 2406
Query 1971 CCTAGATAAGCCTCAACCCTTAGCTGAAGGAAAGAAAGATATGG------T---AGAAGT 2021
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 2407 CCAAGATAAGCCTCAACCCTTAGCTGGAGGAAAGAAAGATATGGGGAACCTGGTAGAAGT 2466
Query 2022 TA--------G-T-C--CT---GAAGGGGCAGAGCTATCAGTTGAGCGTTTGAGTTTCTT 2066
|| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2467 TAATCCTTCTGCTGCTACTCTTGAAGGGGCAGAGCTATCAGTTGAGCGTTTGAGTTTCTT 2526
Query 2067 GCCGGAGTTAATGGAATCTGTGAAGAGGGCGGCACTTGAAGGAGCTGCTGAAGTTAAAGC 2126
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2527 GCCTGAGTTAATGGAATCTGTGAAGAGGGCGGCACTTGAAGGAGCTGCTGAGGTTAAAGC 2586
Query 2127 TCATCCAGAAGAATCCAAAGATCAAGTGAGGCCGGAGTTGGTGGAAAATGAATCAGAGCA 2186
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587 TCATCCAGAAGAGGCCAAAGATCAAGTGAGGCCGGAGTTGGTGGAAAATGAATCAGAGCA 2646
Query 2187 TATGAATGCTCAAGACGAATCTGAGATAGATTCTGATAGCGATAACCCAAACAATTTCAA 2246
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2647 TATGAATGCTCAAGACGAACCTGAGATAGATTCTGATAGTGATAACCCAAACAATTTCAA 2706
Query 2247 GATTGAACAAACAAAGGCTGAGGCTGAAGCTCGATCCAGGGGACTACAGAGTATAAGAAA 2306
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2707 GATTGAACAAACAAAGGCTGAGGCTGAAGCTAAATCCAGGGGACTACAGTCTATAAGAAA 2766
Query 2307 CGATGATCTGGAGGAGATCCGAGAGTTAGGCCATGGAACCTATGGATCTGTTTACCATGG 2366
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2767 CGATGATTTGGAGGAAATCCGAGAGTTAGGCCATGGAACATATGGATCTGTTTACCATGG 2826
Query 2367 AAAATGGAAAGGCTCAGATGTTGCAATAAAGAGAATAAAAGCCAGCTGCTTTGCAGGCAA 2426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2827 AAAATGGAAAGGCTCAGATGTTGCAATAAAGAGAATAAAAGCCAGCTGCTTTGCAGGCAA 2886
Query 2427 ACCTTCTGAAAGGGAACGTTTGATAGAAGATTTTTGGAAAGAAGCCCTGTTATTGAGCTC 2486
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ACCTTCGGAAAGGGAACGTTTGATAGAAGATTTTTGGAAAGAAGCCCTGTTATTGAGCTC 2946
Query 2487 ATTGCATCACCCAAACGTTGTGTCGTTCTATGGGATAGTTCGTGATGGTCCTGATGGTTC 2546
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2947 ATTGCATCATCCAAATGTTGTGTCGTTCTATGGGATAGTTCGTGATGGTCCTGATGGTTC 3006
Query 2547 TCTAGCAACTGTCGCTGAGTTCATGGTTAACGGATCTTTGAAACAGTTCTTGCAGAAGAA 2606
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3007 TCTAGCAACTGTCGCGGAGTTCATGGTTAACGGATCTTTGAAACAGTTCTTGCAGAAGAA 3066
Query 2607 GGATAGAACTATTGATCGGCGCAAAAGACTCATCATAGCCATGGATACTGCATTTGGGAT 2666
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3067 GGATAGAACTATTGATCGTCGCAAAAGACTCATCATAGCCATGGATACTGCATTTGGGAT 3126
Query 2667 GGAGTATTTGCACGGAAAGAACATAGTTCATTTCGATTTGAAGTGTGAGAATCTTCTTGT 2726
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3127 GGAGTATTTGCACGGAAAGAACATTGTTCATTTCGATTTGAAGTGTGAGAATCTTCTTGT 3186
Query 2727 GAACATGAGAGATCCTCAGCGTCCTATATGCAAGATTGGTGATTTGGGGTTATCGAAGGT 2786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3187 GAACATGAGAGATCCTCAGCGTCCTATATGCAAGATTGGTGATTTGGGGTTATCGAAGGT 3246
Query 2787 GAAACAGAAGACTCTAGTATCAGGAGGTGTTCGTGGGACTTTGCCATGGATGGCACCTGA 2846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3247 GAAACAGAAGACTCTAGTATCAGGAGGTGTTCGTGGGACTTTGCCATGGATGGCACCTGA 3306
Query 2847 GCTCTTGAGTGGGAAAAGCAACATGGTCTCTGAAAAGATCGATGTTTACTCGTTTGGGAT 2906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3307 GCTCTTGAGTGGGAAAAGCAACATGGTCTCTGAAAAGATCGATGTTTACTCGTTTGGGAT 3366
Query 2907 TGTAATGTGGGAACTACTCACTGGTGAAGAACCTTACGCAGACATGCACTGTGCTTCCAT 2966
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3367 TGTAATGTGGGAACTACTCACTGGTGAAGAACCATACGCAGACATGCATTGTGCTTCCAT 3426
Query 2967 AATTGGAGGTATAGTGAATAACGCATTGCGTCCGAAAATCCCACAGTGGTGTGATCCAGA 3026
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3427 AATTGGAGGTATAGTGAACAACGCATTGCGTCCAAAAATCCCACAGTGGTGTGATCCAGA 3486
Query 3027 GTGGAAGGGATTGATGGAAAGTTGCTGGGCCTCTGAGCCAACAGAGAGACCATCCTTTAC 3086
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3487 GTGGAAGGGATTGATGGAAAGTTGCTGGACGTCTGAGCCAACAGAGAGACCATCCTTTAC 3546
Query 3087 TGAAATATCACAGAAGCTCAGGACTATGGCTGCTGCTATGAATTtgaaataagtaaatac 3146
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||
Sbjct 3547 TGAAATATCACAGAAGCTCAGGACAATGGCTGCTGCTATGAATTTGAAATAACTTAATAA 3606
Query 3147 ataaact-aaaaaatgaagaataaagatgaagatgatgatgaagaagatggtgatggt-t 3204
||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
Sbjct 3607 ATAGACTCAAAAAAGGAAGAATAAAGATGATGATGAAGAAAAAGAAGATGGTGATGGTGT 3666
Query 3205 ---cttgaagatTTAAGGCTTCTATTTACTTTGAGTTTTT-ATAAAAA-GTAT-AGTTAG 3258
|||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||
Sbjct 3667 TTACTTGGAGATTAAAGGCTTCTATTTACTTTGTTTTTTTTATAAAAAAGTATTAGTTAG 3726
Query 3259 CCTATTTTTGGTTACCACTTGGTTTGCGGTTGGAACGCGAAAACTAGCGTTTTGTGGGAG 3318
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3727 CCTATTTTTGGTTACCACTTGGTTTGCGTTTGGAACGCGAAAACTAGCGTTATGTGGGAG 3786
Query 3319 AAAGAAAAACGGTGTTTT---------ATTGGTATATAGTTTTATGTTTAATTTAGAGG 3368
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3787 AAAGAAAAATGGTGTTTTCCTTTTTTTATTGGTATATAGTTTTATGTTTAATTTAGAGG 3845
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 167607756563
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5