BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495923
Length=3667
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G58160.1 | Symbols: | actin binding | chr5:23533701-2353946... 3509 0.0
> AT5G58160.1 | Symbols: | actin binding | chr5:23533701-23539465
FORWARD LENGTH=3998
Length=3998
Score = 3509 bits (1900), Expect = 0.0
Identities = 2142/2257 (95%), Gaps = 23/2257 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 53 GTGTTCGATTGCTGCTTCTCTACCGATTCATGGGAAGAAGAAAACTACAAAGTTTATATG 112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 96 GTGTTCGATTGCTGCTTCTCTACCGATTCATGGGAAGAAGAAAACTACAAAGTTTATATG 155
Query 113 GCGGGAGTAGTCAATCAACTACAGGAGCACTTCCCTGAAGCATCTTCTCTTGTGTTTAAT 172
|| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156 GCAGGAGTAGTCAATCAACTACAAGAGCATTTCCCTGAAGCATCTTCTCTTGTGTTTAAT 215
Query 173 TTCCGTGAAGTGGGTACTCGGAGTGTGATGGCTGATGTCTTGTCAGAACATGGTTTGACC 232
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 216 TTCCGTGAAGTGGGTACTCGAAGTGTGATGGCTGATGTCTTATCTGAACATGGCTTGACT 275
Query 233 ATAATGGATTATCCTCGGCACTACGAAGGCTGCTCATTGTTACCTGTGGAAGTTATGCAC 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 276 ATAATGGATTATCCTCGGCACTACGAAGGCTGCTCATTGTTACCTGTGGAAGTGATGCAT 335
Query 293 CATTTTCTCCGGTCAAGTGAAAGCTGGCTCTCACTCGGCCCAAATAACTTGTTACTAATG 352
||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||
Sbjct 336 CATTTTCTCCGGTCAAGTGAAAGTTGGCTCTCGCTTGGGCCAAATAACTTGTTACTAATG 395
Query 353 CATTGTGAAAGCGGGGCTTGGCCAGTTTTAGCTTTTATGCTAGCTGCCCTCCTTATATAC 412
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 CATTGTGAAAGTGGGGCTTGGCCTGTTTTAGCTTTTATGCTAGCTGCCCTCCTTATATAC 455
Query 413 CGGAAGCAGTATAGTGGTGAGTAC-AAGACTTTGGACATGATCTACAAGCAGGCTCCGCG 471
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 AGGAAGCAGTATAGTGGTGAGT-CTAAGACTTTGGACATGATCTACAAGCAGGCTCCGCG 514
Query 472 TGAGCTTCTGCGTTTGTTCTCACCGTTGAACCCAATTCCCTCTCAGCTTCGCTATCTACA 531
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 515 TGAGCTTCTGCGTTTGTTCTCGCCCTTGAACCCAATTCCTTCTCAGCTTCGTTATCTACA 574
Query 532 GTACGTTTCGAGAAGGAATTTGGTCTCTGAATGGCCTCCACTGGATAGGGCTCTCACCAT 591
|||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 575 GTACGTGTCAAGAAGGAATTTGGTCTCTGAATGGCCTCCATTGGATAGGGCTCTCACCAT 634
Query 592 GGATTGTGTTATTTTGAGATTTATTCCTGATGTTAGTGGACAAGGAGGCTTTCGCCCAAT 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 635 GGATTGTGTTATTTTGAGATTTATTCCTGATGTTAGTGGACAAGGAGGCTTTCGCCCTAT 694
Query 652 GTTCCGAATATATGGTCAGGATCCCTTTTTTGTAGATGATAAAAAGCCCAAGCTTTTGTA 711
||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 695 GTTTCGAATATATGGTCAGGATCCCTTTTTTGTTGATGATAAAAAGCCTAAGCTTTTGTA 754
Query 712 CTCTACTCCCAAGAAAGGGAAACACCTGAGGCTCTACAAGCAGGCAGAATGTGAACTAGT 771
| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 755 CACTACTCCCAAGAAAGGGAAACACCTGAGGGTCTACAAGCAGGCAGAATGTGAACTAGT 814
Query 772 CAAGATTGACATTAATTGTCATGTGCAAGGTGATATCGTGATCGAGTGCCTCAGTTTGAA 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 815 CAAGATTGACATTAATTGTCATGTGCAAGGTGATATCGTGATCGAGTGCCTTAGTTTGAA 874
Query 832 CGATGACATGGAAAGAGAGGTCATGATGTTTCGAGTGGTTTTCAATACTGCTTTTATTAG 891
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 875 CGATGACATGGAAAGAGAGGTCATGATGTTTCGAGTGGTTTTTAACACTGCTTTTATTAG 934
Query 892 ATCAAACATTTTGATGCTTAACCGTGATGAAGTCGACACATTATGGCATATAAAAGAATT 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 ATCAAACATTTTGATGCTTAACCGTGATGAAGTCGACACATTATGGCATATAAAAGAATT 994
Query 952 CCCAAAGGGATTCAGAGTTGAGCTTCTCTTCTCAGATATGGATGCTGCATCTTCTGTTGA 1011
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 995 CCCAAAGGGGTTCAGAGTTGAGCTTCTCTTCTCAGATATGGATGCTGCCTCTTCTGTTGA 1054
Query 1012 CTTGATGAATTTTTCGTTC-TTGGAAGAGAAAGATGGTCTTCCCATAGAAGTTTTTTCCA 1070
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1055 CTTGATGAATTTTTC-TTCCTTGGAAGAGAAAGATGGTCTTCCAATAGAAGTTTTTTCCA 1113
Query 1071 AAGTTCATGAGTTCTTCAATCAAGTTGACTGGGTTGATCAGACGGATGCCACACGCAATA 1130
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1114 AAGTTCATGAGTTCTTCAATCAAGTTGATTGGGTTGATCAGACAGATGCCACACGCAATA 1173
Query 1131 TGCTTCAGCAGTTAGCCATTGCAAATGCTGTTCAGGAAGGACCAGATGGGAATTCAAGCC 1190
|| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||
Sbjct 1174 TGTTTCAGCAGTTAGCCATTGCAAATGCTGTCCAAGAAGGACTAGATGGTAATTCAAGCC 1233
Query 1191 CAAGACTACAAGGGTTAAGCCCTAGAAGTATCCATGATATTATGAAACATGCAGCAATTG 1250
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1234 CAAGACTACAAGGGTTAAGCCCTAAAAGTATCCATGATATTATGAAGCATGCAGCAATTG 1293
Query 1251 AAAATAGTGCAAAGTTCAAATTGTCTTCAATGTCCGAGGTTGAAACAATCAACACACCAG 1310
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1294 AAAATAGTGCAAAGTTCAAATTGTCTTCAATGTCCGAGGTTGAAACAATCGACACACCAG 1353
Query 1311 AAAAGCCTCCTACTGATTCAGTCAAGACGTTTATAGCAGAAGATTTACATTCTGTCCTTC 1370
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1354 AAAAGCCTCCTACTGATTCAGTCAAGAAGTTTATAGCAGAAGATGTACATTCTGTCCTTC 1413
Query 1371 AGATAAGTAATCAGGAA-AAAACCGCCAGCCAGGAGGCAACCAAGTTGTTACATGAAGAG 1429
|||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 1414 AGATAAATAATCAGGAACAAAAC-GCCAGCGAGGATGCAACAAAGTTGTTACATCAAGAG 1472
Query 1430 TCCCCTTCTCTCAAGCTTGTGCATCATTCTGCTACAGTTAAACCTCTTGTGGACGGTTCT 1489
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1473 TCCCCTTCTCTCAAGCTTGTGCATCATTCTGCAACAGTTAAACCTCTTGTGGACGATTCT 1532
Query 1490 AAATCTTCAGAATATGTTGAGGAGAATTTTCTGAAAAGTCCTTCAGCAAAC-AGTGGGAA 1548
|||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||
Sbjct 1533 AAATCTCCAGAAAATGCCGAGGAGAATTTTCCGAAGAGTCCTTCAGCACATGA-TGGGAA 1591
Query 1549 AGCAATTTCGTTTTCGCCACCCACACCGTCACCACCTCATCCTGCAAGACCGCAGTTGGC 1608
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1592 AGCAATCTCGTTTTCGCCACCCACACCGTCACCACCTCATCCTGTAAGACCGCAGTTGGC 1651
Query 1609 TCTAGCGGGAGCACCTCCCCCACCTCCTCCACTTCCAGCTGCTGCTTCTAAGCCTTCAGA 1668
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1652 TCAAGCGGGAGCACCTCCCCCACCTCCTCCACTTCCAGCTGCTGCTTCTAAACCTTCAGA 1711
Query 1669 GCAATTGCAGCATTCTGTTGTTCAACCAACAGAGCCTCTGTCACAAGGAAATTCCTGGAT 1728
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 GCAATTGCAGCATTCTGTTGTTCAAGCAACAGAGCCTCTGTCACAAGGAAATTCCTGGAT 1771
Query 1729 GTCATTAGCAGGCTCTACGTTTTATCAAACAGTTCCAAACGaaaaaaaTCCCATTACACT 1788
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1772 GTCATTAGCAGGCTCTACGTTT---CAAACAGTTCCAAACGAAAAAAATCTCATTACACT 1828
Query 1789 GCCTCCAACACCTCCCCTTACTTCTACATCACATTCCTGTCCTGAGCCATCATCTAAAAC 1848
||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1829 GCCTCCAACACCTCCCCTTGCTTCTACATCCCATGCCTCTCCTGAGCCATCTTCTAAAAC 1888
Query 1849 AACAACTTCATTGTTACAGTCACCTCAAGCATCATCAGCTACTCCCGCCAACCCATTAAA 1908
||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 1889 AACAAATTCATTGTTACTGTCACCTCAAGCATCACCAGCTACTCCCACCAACCCATCAAA 1948
Query 1909 AACTGTTTCAGTAGATTCTTTTGGTCCTGCTACTTCACCTCATTTAGGAGCGTCCGATAA 1968
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1949 AACTGTTTCAGTAGATTTTTTTGGTGCTGCTACTTCACCTCATTTAGGAGCTTCCGATAA 2008
Query 1969 TGTGGCTTCAAATCTTGGACAACCGGCGAGGTCACCTCCTCCAGTATCTAATTCAGACAA 2028
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2009 TGTGGCTTCAAATCTTGGACAACCGGCGAGGTCACCTCCTCCAATATCTAATTCAGACAA 2068
Query 2029 AAAGCCTGCTTTGCCTCGACCGcctcctcctcctcctccccctccAATGCAGCATTCCAC 2088
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 AAAGCCTGCTTTGCCTCGACCGCCTCCTCCCCCTCCTCCCCCTCCAATGCAGCATTCCAC 2128
Query 2089 AGTCACTAAAGTCCCCCCTccaccaccaccaccaccaccagcacccccagcaccaTTTGT 2148
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 2129 AGTAACTAAAGTCCCCCCTCCACCACCACCAGCACCACCAGCACCCCCAACACCAATTGT 2188
Query 2149 TCATGCCTCTTctccccctcc-cc-c-tcctcc---------gcccgctcctcctACACC 2196
|||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 2189 TCATACCTCTTCTCCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCCCGCTCCTCCAACACC 2248
Query 2197 ACATTCTAATGGAATCTCTGCTATGAAAAGTTcacctcctgcaccccctgcacctccccg 2256
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2249 ACAATCTAATGGAATCTCTGCTATGAAAAGTTCACCTCCTGCACCACCTGCACCTCCCCG 2308
Query 2257 gcttcccacccattctgcctctcctccccctccaacc 2293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2309 GCTTCCCACCCATTCTGCCTCTCCTCCCCCTCCAACC 2345
Score = 1958 bits (1060), Expect = 0.0
Identities = 1196/1258 (95%), Gaps = 23/1258 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 2432 CTTGAAAGTCTGTTCTCCGCATCTGCTCCAGAGCAGGCAGGAAAATCGAGACTAGATAGC 2491
||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 CTTGAAAGTCTTTTCTCCGCATCAGCTCCAGAACAAGCAGGAAAATCGAGACTAGATAGC 2801
Query 2492 TCTCGTGGACCTAAACCCGAGAAAGTCCAACTGATTGAACACCGGCGAGCGTACAATTGT 2551
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2802 TCTCGTGGACCTAAACCCGAGAAAGTCCAACTGATTGAACACCGGCGAGCCTACAATTGT 2861
Query 2552 GAAATTATGCTTTCAAAAGTGAAAGTACCTTTGCAGGATTTGACGAACTCAGTGCTTAAC 2611
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 GAAATCATGCTTTCAAAAGTGAAAGTACCTTTACAGGATTTGACGAACTCAGTGCTTAAC 2921
Query 2612 CTGGAGGAGTCGGCTCTTGATGCTGATCAGGTTGAGAACCTAATTAAATTTTGCCCAACA 2671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2922 CTGGAGGAGTCGGCTCTTGATGCTGATCAGGTTGAGAACCTAATTAAGTTTTGCCCAACA 2981
Query 2672 AGAGAAGAAATGGAATTACTAAAGGGTTACACTGGTGACAAGGACAAGCTTGGAAAATGC 2731
|||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2982 AGAGAAGAGATGGAGTTACTAAAGGGTTATACTGGTGACAAGGACAAGCTTGGAAAATGC 3041
Query 2732 GAACTGTTCTTCTTAGAGATGATGAAAGTCCCACGAGTAGAAACAAAGCTCAGGGTATTC 2791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3042 GAACTGTTCTTCTTAGAGATGATGAAAGTCCCACGAGTAGAAACAAAGCTCAGGGTATTC 3101
Query 2792 TCATTCAAAATGCAGTTTACCTCTCAGATTTCTGAACTAAGGAATAGTCTAGGTGTTGTG 2851
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 TCATTCAAAATGCAGTTTACCTCTCAGATTTCTGAACTCAGGAATAGTCTAGGTGTTGTG 3161
Query 2852 AACTCCGCATCAGAACAGG---------C----AAA-TC---AGACTCACTG--GACAAT 2892
||||||||| ||||||||| | ||| || ||| | | || ||| ||
Sbjct 3162 AACTCCGCAGCAGAACAGGTAAAAAATTCTGAAAAATTCAAAAGAAT-AATGCAGACGAT 3220
Query 2893 TTTATCCCTTGGGAACGCCCTAAACCAAGGGACGGCTAGGGGTGCTGCGGTTGGGTTTAA 2952
||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3221 TTTGTCACTTGGGAACGCCCTAAACCAAGGGACTGCTAGGGGTGCTGCGGTTGGGTTTAA 3280
Query 2953 ATTGGACAGTTTGCCGAAACTCAGTGAAACACGGGCGCGTAATAACCGAATGACTCTGAT 3012
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3281 ATTGGACAGTTTGCCGAAACTCAGTGAAACACGGGCACGTAATAACCGAATGACTCTGAT 3340
Query 3013 GCATTATCTATGCAAGGTAAGCTATTATAGTCTGCTCTTCTGTAGCTTTATGGATGTACT 3072
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3341 GCATTATCTATGCAAGGTAAGCTTTTATAGTCTGCGCTTCTGTAGCTTTGTGGATGTACT 3400
Query 3073 AGAGGAAGAAAGATATAGTCTGATGGATTCTTTACAGATTCTTGCTGAAAAAATCCCAGA 3132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3401 AGAGGAAGAAAGATATAGTCTGATGGATTCTTTACAGATTCTTGCTGAAAAAATCCCAGA 3460
Query 3133 AGTTTTAGATTTTACAAAAGAATTATCCTCGTTGGAGCCGGCAACAAAGATTCAACTGAA 3192
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3461 AGTTTTGGATTTTACAAAAGAATTATCCTCGTTGGAGCCGGCAACAAAGATTCAACTGAA 3520
Query 3193 GTTTCTGGCCGAGGAGATGCAAGCTATAAACAAGGGACTGGAGAAAGTCGTACAGGAACT 3252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3521 GTTTCTGGCCGAGGAGATGCAAGCTATAAACAAGGGACTTGAGAAAGTCGTACAGGAACT 3580
Query 3253 TTCCTTGTCCGAAAATGATGGCCCGATTTCACATAACTTTAACAAGATATTGAAGGAGTT 3312
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3581 TTCCTTGTCCGAAAATGATGGCCCGATTTCCCATAACTTTAACAAGATATTGAAGGAGTT 3640
Query 3313 CCTTCATTATGCGGAAGCAGAAGTAAGGTCGTTGGCTTCACTCTATTCAGGAGTGGGAAG 3372
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3641 CCTTCATTATGCGGAAGCAGAAGTAAGGTCATTGGCTTCACTTTATTCGGGAGTGGGAAG 3700
Query 3373 AAACGTGGATGGCTTAATTCTCTACTTTGGTGAAGACCCTGCCAAGTGCCCTTTTGAACA 3432
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 AAACGTGGATGGTTTAATTCTCTATTTTGGTGAAGACCCTGCCAAGTGCCCTTTTGAACA 3760
Query 3433 AGTGGTGTCGACTCTTCTAAACTTTGTAAGACTGTTCAATCGTGCGCTTGAAGAAAACGG 3492
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
Sbjct 3761 AGTAGTGTCGACTCTTCTAAACTTTGTAAGACTGTTCAATCGTGCACATGAAGAAAACGG 3820
Query 3493 AAAACAACTCGAGGCAGAAGCTAAGAAGAATGCTGCTGAAAAGGAGAAACCAAAAACAGG 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3821 AAAACAACTCGAGGCAGAAGCTAAGAAGAATGCTGCTGAAAAGGAGAAACCAAAAACAGG 3880
Query 3553 TGGATTAGATAAAGAAATCAAGAAGCCCTTGGATGAAGAAGTTAAGGAG-A-AAA-CAAA 3609
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||
Sbjct 3881 TGGATTAGATACAGAAATCAAGAAGCCCTTAAATGAAGAAGTTAAGGAGGAGAAAACAAA 3940
Query 3610 AACAAGTGGATTAGGTAAAGAAATGAGTGAGCGAATAAAGGAAAGAACCGCTCCTTGA 3667
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3941 AACAAGTGGATTAGGTAAAGAAATGAGTGACCGACTAAAGGAAAGAACCGCTCCTTGA 3998
Score = 167 bits (90), Expect = 8e-40
Identities = 94/96 (98%), Gaps = 0/96 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2297 AAGCCATACCACTGGTTGAAACTGACAAGAGCTGTCAATGGGAGCTTATGGGCTGAAACA 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2541 AAGCCATACCACTGGTTGAAACTGACAAGAGCTGTCAATGGGAGCTTATGGGCTGAAACA 2600
Query 2357 CAAATGTCTAGGGAAGCTTCTAAGTATGCATTATTC 2392
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2601 CAAATGTCTAGTGAAGCTTCTAAGTATGCATTGTTC 2636
Score = 75.0 bits (40), Expect = 5e-12
Identities = 42/43 (98%), Gaps = 0/43 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 2389 ATTCTTGCATGATTTCCAATTCATTGATACTTTACCTCTTTGT 2431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2671 ATTCTTGCATGATTTCCAATTCATTGATACTTTACCTCCTTGT 2713
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 182607672520
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5