BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg495958
Length=5625
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G58410.1 | Symbols: | HEAT/U-box domain-containing protein ... 9027 0.0
> AT5G58410.1 | Symbols: | HEAT/U-box domain-containing protein
| chr5:23609663-23617386 FORWARD LENGTH=5665
Length=5665
Score = 9027 bits (4888), Expect = 0.0
Identities = 5394/5640 (96%), Gaps = 28/5640 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGCAAACCCAAAGGAGATGCTGCAAGAAGCAAAGCTCGTCCATCCAGCAGCAGCTTG 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGCAAACCCAAAGGAGATGCTGCAAGAAGCAAAGCACGTCCATCTAGCAGCAGCTTG 60
Query 61 GCAGCTTCTTTGTTGCCGTCTGGCTCTGCAGCCGCCGTAGGTTTTGGCGGG-TATGTCGG 119
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 61 GCAGCTTCTCTGTTGCCGTCTGGCTCTGCAGCCGCCGTAGGTTTTGG-GGGCTATGTCGG 119
Query 120 TAGCTCTAGATTCGAAACGTCTCTGTCAAACGAAGACTCTGCTTCCCTT-TTGGATTTGG 178
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||
Sbjct 120 TAGCTCTAGATTCCAAACTTCTCTGTCAAACGAAGACTCTGCTT-CCTTCTTGGATTTGG 178
Query 179 ATAGTGAGGTTGCCCAGCACTTGCAAAGGCTTTCAAGGAAGGATCCTACAACAAAGATTA 238
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 ATAGTGAGGTTGCCCAACACTTGCAAAGGCTTTCAAGGAAGGATCCTACAACAAAGATTA 238
Query 239 AAGCTCTTGCTTCCCTGTCAGAACTGGTTAAGCAGAAGAAAGGAAAGGAACTTTTCCCAA 298
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||
Sbjct 239 AAGCTCTTGCTTCCCTATCAGAACTGGTTAAGCAGAAGCAAGGGAAGGAACTTTTGCCAA 298
Query 299 TAATCCCACAATGGACATTTGAGTACAAGAAGCTGATACTGGACTACAATAGAGATGTTC 358
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||
Sbjct 299 TAATCCCACAATGGACATTTGAGTACAAGAAGCTGATACTGGACTACAGTCGAGATGTTC 358
Query 359 GGCGAGCTACGCATGATGTCATGACTAATGTTGTCACTGGTGCCGGGAGAGATTTAGCTC 418
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 359 GGCGAGCTACTCATGACGTCATGACTAATGTTGTCACTGGTGCCGGGAGAGATATAGCTC 418
Query 419 CTCATCTAAAGTCTATAATGGGGCCCTGGTGGTTTTCACAATTTGATTTGGCATCTGAAG 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 CTCATCTAAAGTCTATAATGGGGCCCTGGTGGTTTTCGCAATTTGATTTGGCATCTGAAG 478
Query 479 TTTCTCAAGCAGCAAAGTCGTCTTTCCAGGTTGGCTCCTCGTTTCGTAATTCAGTTTTCT 538
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 479 TTTCTCAAGCAGCAAAGTCGTCTTTCCAGGTTGGCTCCTCGTTTGGTAATTCAGTTTTCT 538
Query 539 TGGTGGAGGCAGCATTCCCTACCCAGGAAAAGAGATTGCACGCCTTG-ATTCTATGTTCA 597
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 539 TGGTGGAGGCAGCATTCCCTGCCCAGGAAAAGAGATTGCACGCCTTGAATT-TATGTTCA 597
Query 598 GCTGAGATTTTTGCTTATCTGGAGGAAAATCTCAAACTTACACCTCAAAATTTATCTGAT 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598 GCTGAGATTTTTGCTTATCTGGAGGAAAATCTCAAACTTACACCTCAAAATTTATCTGAT 657
Query 658 AAAGCACTTGCATCAGATGAACTAGAAGAAATGTACCAGCAGATGATATCGTCATCTCTG 717
||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 658 AAATCACTTGCTTCAGATGAATTAGAAGAAATGTACCAGCAGATGATATCGTCATCTCTG 717
Query 718 GTGGGGTTGGCTACACTTCTAGATATTTTGCTCCGCAAACCTGATAA-AGTTGGCTCTGC 776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||
Sbjct 718 GTGGGGTTGGCTACACTTCTAGATATTTTGCTCCGCGAACCCGATAATA-CTGGCTCTGC 776
Query 777 AAACATTAATTCTGAATCAAAACTTGCATCGAAGGCTAGGGCAGTAGCAACCTCCTCAGC 836
||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 AAACATTAATTCTGAATCAAAACTTGCCTCAAAGGCTAGGGCAGTAGCAACCTCCTCAGC 836
Query 837 TGAGAAGTTGTTCTCTTTCCATAAATGCTTTCTGAACTTTCTAAAATCTGAAAGCCCTAG 896
||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TGAGAAGATGTTCTCTTCCCATAAATGCTTTCTGAACTTTCTAAAATCTGAAAGCCCTAG 896
Query 897 TATTCGGTCAGCGACTTATTCTTTGTTAAGCAGCTTCATTAAAAATGTTCCTGAAGTCTT 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 897 TATTCGGTCAGCGACTTATTCTTTGTTAAGCAGCTTCATTAAAAATGTTCCTGAAGTCTT 956
Query 957 TGGCGAAGGAGACGTCCGATGTCTTGCACCAGCTCTGCTTGGCGTTTTTCGAGAAAATAA 1016
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 957 TGGCGAAGGCGACGTCCGAAGTCTTGCACCAGCTCTGCTTGGTGTTTTTCGAGAAAATAA 1016
Query 1017 TCCAACCTGCCACTCATCAATGTGGGAGGCTGTCTTGCTGTTCTCTAGAAAATTTCCTCA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1017 TCCAACCTGCCACTCATCAATGTGGGAGGCTGTCTTGCTGTTCTCTAAAAAATTTCCTCA 1076
Query 1077 GAGTTGGGTCTACTTAAATGTTCATAAATCTGTTCTAAGTCATTTATGGCAGTTTCTTAG 1136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 1077 GAGTTGGGTCTACTTAAATGTTCATAAATCTGTTCTAAATCATTTATGGCAGTTTCTGAG 1136
Query 1137 GAACGGGTGCTATGGATCCTCACGGGTTTCTTATCCTGCACTGATATTGTTCCTGGAAGT 1196
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1137 GAACGGGTGCTATGGATCCCCACAGGTTTCTTATCCTGCACTGATATTGTTCCTCGAAGT 1196
Query 1197 TATGCCAACACAATCTGTAG-AAGCTGATAAGTTCTTTGTGAATTTTTTCAAAAACTTAT 1255
||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197 TATGCCAGCACAATCTGTAGAAAG-TGATAAGTTCTTTGTGAATTTTTTCAAAAACTTAT 1255
Query 1256 TGGCTGGGAGGAGTATGTGTGAATCTTCAAGTACAGATCAATTATCACTTCTTCGGGCAA 1315
||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1256 TGGCTGGAAGGAGTATGTGTGAATCATCAAGTACGGATCAGTTATCACTTCTTCGGGCAA 1315
Query 1316 CCACTGAATGTTTCCTCTGGGGATTACATAATGCTTCAAGGTATTGCGATGATCCCAATT 1375
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1316 CCACTGAATGTTTCCTCTGGGGATTACGTAATGCTTCAAGGTATTGCGATGTTCCCAATT 1375
Query 1376 CTATTCATGATCTCCAGGTTGATCTAATTGATAAAGTCCTCGTGAAGATTCTATGGGCGG 1435
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1376 CTATTCATGATCTCCAGGTTGATCTAATTGATAAAGTCCTAGTGAAGATTCTATGGGCGG 1435
Query 1436 ACTTCTTTGAACTATCTAAGGGCAGCATTCCACCTATTCAGAGGAAGTCAACTGAAAATC 1495
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1436 ACTTCACTGAACTATCTAAGGGCAGCATTCCACCTAATCAGAGGAAGTCAGCTGAAAATC 1495
Query 1496 TTGGCATGGGTAATTCAGCTAGTTATCTGCAAGAGCTAGGAAGATGCATCTTAGAAATTC 1555
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 TTGGCATGGGTAATTCAGTTAGTTATCTGCAAGAGCTAGGAAGATGCATCTTAGAAATTC 1555
Query 1556 TTTCAGGGATTAATTTGCTCGAACAGAACCTGCTGTCTTTTTTCTGTAAATCTGTTCAAG 1615
| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1556 TATCAGGGATTAATTTACTTGAACAGAACCTGCTGTCTTTTTTCTGTAAAGCTGTTCAAG 1615
Query 1616 AGAGCTTCTTGAACATGCTTCAGCAGGGAAATTTAGAGATAGTTACGGGAAGCATGAGAA 1675
||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1616 AGAGCTTCTTGAATATGCTTCAGCAGGGAGATTTAGAGATAGTTGCGGGAAGCATGAGAA 1675
Query 1676 AAATGATTGATTTTCTCTTATTATTGGAGAGATGTTCAGTTTTGGAAGGTGAGAGTTGGC 1735
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1676 AAATGATTGATTTTCTCTTGTTATTGGAGAGATATTCAGTTTTGGAAGGTGAGAGCTGGC 1735
Query 1736 CCTTGGATCAATTTATGGGGCCACTTTTGTCCAAGGCTTTCCCGTGGATAAGATCATCTG 1795
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 CCTTGCATCAATTTATGGGGCCACTGCTGTCCAAGGCTTTCCCGTGGATAAGATCATCTG 1795
Query 1796 AATTGATCGAAGGTGTGAAACTTTTGTCAGTTTCAGTATCAGTGTTTGGACCAAGAAAGA 1855
||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1796 AATTGTTAGATGGTGTGAAGCTTTTGTCAGTTTCAGTATCGGTGTTTGGACCAAGAAAGG 1855
Query 1856 TAGTTCCAGTACTAATTGATGATATAGAGACTTCTACCCTTCTCTCTGTTGAAAAAGGGA 1915
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1856 TAGTTCCAGTGCTAATTGATGATATAGAGACTTCTACCCTTCTCTCTGTTGAAAAAGAGA 1915
Query 1916 AGAATATGAGCCCAGAGAAGCTTATTAAAGTTTTTCAAGAAATTTTTATTCCTTGGTGTA 1975
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 AGAATATGAGCCCGGAGAAGCTTATTAAAGTTTTTCAAGAAATTTTTATTCCTTGGTGTA 1975
Query 1976 TGGATGGATATGACTCTTCGACTGCAGCTAGACAAGATCTCCTATTTTCATTGCTCGATG 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1976 TGGATGGATATGACTCTTCGACTGCAGCTAGACAAGATCTCCTATTTTCATTGCTTGATG 2035
Query 2036 ATGAATGTTTCACTCAGCAGTGGAGTGATGTCATTTCTTATGTATTTAATCAACAACATC 2095
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 ATGAATGTTTCACTCAGCAGTGGAGTGATGTCATTTCTTATGTATTTAATCAACAACATC 2095
Query 2096 AGGGCTTCAATAACCTGGCTGCTATGAAAATGCTTTTAGAGAAGGCAAGGGATGAAATTA 2155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2096 AGGGCTTCAATAACCTGGCTGCTATGAAAATGCTTTTAGAGAAGGCAAGGGATGAAATTA 2155
Query 2156 CAAAAAGAAGTTCTGGGCAGGAGTTGCATCAAAGAATAGGTTCTCGGCCAGACCATTGGC 2215
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2156 CAAAAAGAAGTTCTGGACAGGAGTTGAATCAAAGAATAGGTTCTCGGCCAGAACATTGGC 2215
Query 2216 ACCATACACTCATAGAATCAACTGCTATAAGTCTGGTCCATTCCTCCTCAGCGACTACAA 2275
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 ACCATACACTCATAGAATCAACTGCTATAAGTCTTGTCCATTCCTCCTCAGCGACTACAA 2275
Query 2276 CCTCTGCTGCTCAGTTCTTGTGTTCAGTTCTGGGTGGTTCAACCCAAGACAGCAGTATTT 2335
| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276 CTTCTGCTGTTCAGTTCCTGTGTTCAGTTCTGGGTGGTTCAACCCAAGACAGCAGTATTT 2335
Query 2336 CTTTTGTGTCAAGAAGCTCGTTGGTCTTGATATATAGGGGGATCCTCGAAAAACTGCTAT 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2336 CTTTTGTGTCAAGAAGCTCGTTGGTCTTGATATATAGAGGGATCCTCGAAAAACTGCTAT 2395
Query 2396 CTTTTATCAAACAGTCACCATTATGTTCAGTCAATGATACATGTTCGTCTCTTATTGTCG 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 CTTTTATCAAACAGTCACCATTATGTTCAGTCAATGATACATGTTCGTCTCTTATTGTCG 2455
Query 2456 AGGCTATAGAGTTTGATTTGAGCAGTTCTGTAGATGTGATCGTGGTTGCTAAGTTTGCAG 2515
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 AGGCTATAGCGTTTGATTCGAGCAGTTCTGTAGATGTGATCGTGGTTGCTAAGTTTGCAG 2515
Query 2516 CTGAAGTTATTGATGGTAGTTTCTTCAGTTTGAAGTCTCTGAATCAGGACGCCACTCTAC 2575
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||
Sbjct 2516 CTGAAGTTATTGATGGTAGTTTCTTCAGTTTGAAGTCTCTGAGTCAGGACGCAACCCTAC 2575
Query 2576 TTTCAACTATTTTGTCTTCTATTTTTATCATTGACTTGGAGAGTAGAATGACATCACTAG 2635
|| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 2576 TTACAACTGTATTGTCTTCTATTTTTATCATTGACTTAGAGAATAGAATGACATCACTAG 2635
Query 2636 TGGACAGTACGCTATCTGAGTCCAAAGAGAAGAGAAAGGATCGGAATCTTGTGTGTGATT 2695
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2636 TGGACAATACGCTATCTGAGTCCAAAGAGAAGAGAAAGGATCGGAATTTTGTGTGTGATT 2695
Query 2696 ATATTCATGCTGTTTGCTCTAAGATGGATAATCAGTTCTGGAAATCTATAAACTATGATG 2755
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 ATGTTCATGCCGTTTGCTCTAAGATGGATAATCAATTCTGGAAATCTATAAACTATGATG 2755
Query 2756 TCCGGAAGAGTTCAGCAAGCATTTTGGTTCAGTTCCTTAGGTCAGTTGTCCTACTTGAGG 2815
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2756 TCCGGAAGAGTTCAGCAAGCACTTTGGCTCAGTTCCTGAGGTCAGTTGTCCTACTTGAGG 2815
Query 2816 ATGATCTGCAACCTTTTGAACTTACATTATTGTGTGCTTCAAGGATGACCGAGGTATTGG 2875
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
Sbjct 2816 ATGATCTGCAACCTTTTGAACTTACATTATTGTGTGCTTCAAGGATGACCGAAGTGTTAG 2875
Query 2876 AATATCTCTCATTGGATCAAAGCGATGAAGAAAATATCCATGGCCTGCTCCTGCTTGAGA 2935
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2876 AATATCTCTCATTGGATCAAAGCGATGAAGAGAATATCTGTGGCCTGCTCCTGCTTGAGA 2935
Query 2936 GAGATGTATGGCCTATTTGGGTCAGCCCCAGCTCGTCAGCTAGCATAAATACCCATGGTA 2995
| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2936 GTGATGCGTGGCCTATTTGGGTCAGCCCCAGCTCGTCAGCTAGCATAGATACCCATGGTA 2995
Query 2996 TGCCTGTTCATTTGTGCGAATTGAGGAAATCCAAGAGTCAAAGATATGTTTCTTTCATTA 3055
|||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 TGCCTGTTCAGTTGTGCGAATTGAGGAAATCGAAAAGTCAAAGATATGTTTCTTTCATTG 3055
Query 3056 ACAGCCTGATCATGAAATTGGGAATTCACCGATTTCTTGTTGGCCACAAAGATAATGGGT 3115
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3056 ACAGCCTGATCATGAAATTGGGAATTCACCGATTTATTGTTGGCCACAAAGATCATGGGT 3115
Query 3116 TTGCCTCTCAAGCTTGGCTTTCCGTAGAAATACTCTGCACGTGGGAGTGGCCAGGGGGTA 3175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116 TTGCCTCTCAAGCTTGGCTTTCCGTAGAAATACTCTGCACGTGGGAGTGGCCAGGGGGTA 3175
Query 3176 ATGTTCACACTTCTTTCCTGCCAACTCTTGTATCATTTTGTAAGGGTGAACCATCGAGTG 3235
| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3176 AAGTTCAGACTTCTTTCCTGCCAAATCTTGTATCATTTTGTAAGGATGAACCATCGAGTG 3235
Query 3236 GAGGTTTACTAAATTCCATTTTTGACATTCTACTCAACGGTGCTCTTGTGCATGTAAAGG 3295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3236 GAGGTTTACTAAATTCCATTTTTGACATTCTACTCAACGGTGCTCTTGTGCATGTAAAGG 3295
Query 3296 ATGAGGAAGAGGGCTTAGGGAACATGTGGGTTGACTTTAATAATAACATAGTGGACGTCG 3355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3296 ATGAGGAAGAGGGCTTAGGGAACATGTGGGTTGACTTTAATAATAACATAGTGGACGTCG 3355
Query 3356 TAGAACCATTTTTGAGGGCTCTTTTGTCATTCCTTCACATTTTGTTCAAGGAAGACCTTT 3415
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3356 TTGAACCATTTTTGAGGGCTCTAGTGTCATTCCTTCACATTTTGTTCAAGGAGGACCTTT 3415
Query 3416 GGGGAGAAGAAGAAGCCATGTCTGCTTTCAAAATGATCACAGATAAACTCTTCATAGGAG 3475
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3416 GGGGAGAAGAAGAAGCCATGGCTGCTTTCAAAATGATCACAGATAAACTCTTCATAGGGG 3475
Query 3476 AAGAGACAAGCAAAAACTGTTTGAGAATTATTCCTTGCATTATGAGCATAATAATTTCAC 3535
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3476 AAGAGACAAGCAAAAACTGTTTGAGAATTATTCCTTACATTATGAGCATAATAATCTCAC 3535
Query 3536 CATTACGTACAAAAATAAAATCTGGTGGTTCTGGTAAAGATACTCTGCTGCCACTGGAAG 3595
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3536 CATTACGTACAAAAGTAAAATCTGGTGGTTCTGGTAAAGATACTCTGCTACCACTGGAAG 3595
Query 3596 TTTTGCTTAGAAGTTGGCTGGAGAGGTCTTTGTCGTTTCCTCCTCTGGTGCTCTGGCAAA 3655
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 TTTTGCTTAGAAATTGGCTGGAGAGGTCTTTGTCGTTTCCTCCTCTGGTGCTCTGGCAAA 3655
Query 3656 GTGGGGAAGATATACAGGATTGGTTTCAGCTTGTTATCTCTTGTTATCCCTTAAGTGA-A 3714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 3656 GTGGGGAAGATATACAGGATTGGTTTCAGCTTGTTATCTCTTGTTATCCCGTAAGTGATA 3715
Query 3715 AAGGCTGAAGAAGCAAAGGAAATACAGAGGCATGTGAGTAATGAAGAGAAAACACTCCTG 3774
||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||
Sbjct 3716 AAG-CTGAAGAAGCAAAGGAACTACAGAGGCATCTGAGCACTGAAGAGAGAACGCTCCTG 3774
Query 3775 CTTGACTTGTTCCGCAAGCAAAATCAAGATCCTGGTGCATCAAGTGTAGTTACCCAACTT 3834
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3775 CTTGACTTGTTCCGCAAACAAAAGCAAGATCCTGGTGCATCAACTGTAGTTACCCAACTT 3834
Query 3835 CCAGCTGTCCAAATTCTGCTCGCAAGACTAATTGTGATTGCAGTTAGTTACTGTGGAAAC 3894
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3835 CCAGCTGTGCAAATTCTGCTCGCAAGACTAATTATGATTGCAGTTAGTTACTGTGGAAAC 3894
Query 3895 AATTTTAACGAGGATGATTGGGATTTTGTCTTTTCTAATTTGAAGCGACAGATTCAGTCT 3954
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||
Sbjct 3895 GATTTTAACGAGGATGATTGGGATTTTGTCTTTTCTAATCTGAAGCGTCTGATTCAATCT 3954
Query 3955 GCAGTAGTTGTGATGGAGGAAACTGCTGAGAACGTCAATGATTTCATTAGTGGCGTTTCT 4014
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||
Sbjct 3955 GCAGTAGTTGTGATGGAGGAAACTTCCGAGAACGTCAACGACTTCATTAGTGGTGTTTCT 4014
Query 4015 TCCATGGAGAAGGA-AA--A---TGATACTCTTGAGGGACTTGGGCATATTGTTTTTATT 4068
|||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4015 TCCATGGAGAAGGAGAAGGAGAATGATACCCTTGAAGGACTTGGGCATATAGTTTTTATC 4074
Query 4069 TCTGATCCTTCTATAAACAATGCTCAGAATGCTCTCT-ACGCATTTTCGTTGCTTAATGC 4127
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 4075 TCTGATCCTTCTATAAACAGTGCTCAGAATGCTCTCTCA-GCATTTTCGTTGCTTAATGC 4133
Query 4128 GTTAGTAAAGCATAAATCGGTTGAATATGAAGACAATCTGAAATCCTTGGCAGATGAAAT 4187
||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4134 GTTAGTAAACCATAAATCTGTTGAAGGTGAAGACAATCTGAAATCCTTGGCAGATGAAAC 4193
Query 4188 ATGGGATCCGGTTAAGGATCGGATACTTGAAGGTGTTCTGCGTCTTTTCTTCTGCACTGG 4247
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4194 ATGGGATCCTGTTAAAGATCGAATACTTGAAGGTGTTCTGCGTCTTTTCTTCTGCACGGG 4253
Query 4248 TCTTGCTGAGGCTATTGCTGCTTCATATTCCCCAGAGGCAGCATCTATTGTTGCTTCATT 4307
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4254 TCTTACTGAGGCTATTGCTGCTTCATATTCCCCAGAGGCAGCATCTATTGTTGCTTCATT 4313
Query 4308 TCGAGTTGATCATTTGCAGTTCTGGGAGTTGGTGGCTCAACTTGTGGTTGACTCTTCTCC 4367
||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||
Sbjct 4314 TCGAGTTGATCATCTGCAGTTCTGGGAGCTGGTAGCTCACCTTGTAGTAGACTCTTCTCC 4373
Query 4368 ACGTGCAAGAGATAGAGCTGTCAGAGCAGTGGAATTTTGGGGTCTAAGCA-AGGGAGCCA 4426
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | |
Sbjct 4374 ACGCGCAAGAGATAGAGCTGTCAGAGCAGTGGAATTCTGGGGACTAAGCAGAGG-ATCTA 4432
Query 4427 TAAGCTCTTTGTATGCAATAATGTACTCTTCCAATCCAATCCCGTCATTGCAACTTGCTG 4486
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4433 TAAGCTCTTTGTATGCAATAATGTTCTCTTCCAATCCAATCCCGTCATTGCAACTTGCTG 4492
Query 4487 CATACACTGTTTTGTCTACCGAACCTATTTCCAGGCTGGCCATAGTTGCTGATGGGAATG 4546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4493 CATACACTGTTTTGTCTACCGAACCTATTTCCAGGCTGGCCATAGTTGCTGATTTGAATG 4552
Query 4547 CCCCACTGAATGATGAGTTTCTCAATGATCAGGACTCAAGCAATGCTGGTTTGCCATCTG 4606
| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4553 CACCACTGAATGATGAGTCTCTCAATGATCAGGACTCAAGCAATGCTGGTTTACCATCTG 4612
Query 4607 AAGAGAAGCTACTGCTAAGAGATGAAGTATCTTGTATGGTTGAGAAGTTAAATCATGATC 4666
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 4613 AAGACAAGCTACTGCTAAGAGATGAAGTATCTTGTATGGTTGAGAAGTTAGATCATGAAC 4672
Query 4667 TTCTTGATACAGACTTAACTGCGCCAGAAAGGGTGCAAACGTTCCTGGCATGGTCTTTGT 4726
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4673 TTCTTGATACGGACTTGACTGCGCCAGAAAGGGTGCAAACGTTCCTGGCGTGGTCTTTGT 4732
Query 4727 TGCTCTCGCA-TGTTAATTCTTTACCTTCACTAACACAAGGACGAGAGAGACTGGTGCAA 4785
| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4733 TACTCTC-CAATGTTAACTCTTTACCTTCACTAACCCAAGGACGAGAGAGACTGGTGCAA 4791
Query 4786 TATATAGAGAAAACTGCAAATCGGTTGATATTAGATAGTCTTTTTCAGCACATTCCTCTA 4845
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4792 TATATAGAAAAAACTGCAAATCCGTTGATATTAGATAGTCTTTTTCAGCACATTCCTCTA 4851
Query 4846 GAATTATACATGGGACAGAGCTTGAAGAAAAAAGATGGGGATATTCCGTCTGAGTTATCT 4905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4852 GAATTATACATGGGACAGAGCTTGAAGAAAAAAGATGGGGATATTCCGTCTGAGTTATCT 4911
Query 4906 GTGGTAGCTTCTGCAGCCACTCGTGCGATTGTGATGGGTTCGTCCCTGTCAACAGTTGAA 4965
||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4912 GTGGTAGCTTCAGCAGCCACTCGTGCGATTATTACGGGTTCGTCCCTGTCAACGGTTGAA 4971
Query 4966 TCACTTTGGCCTATTGAAACTGGAAAGATGGCTTCGCTTGCTGGGGCGATATATGGTCTG 5025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4972 TCACTTTGGCCTATTGAAACTGGAAAGATGGCTTCGCTTGCTGGGGCGATATATGGTCTG 5031
Query 5026 ATGCTACGTGTACTTCCAGCTTATGTTAGAGAATGGTTTAGCGAAATGCGTGACCGTTCT 5085
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5032 ATGTTACGTGTCCTTCCAGCTTATGTTAGAGAATGGTTTAGCGAAATGCGTGACCGTTCT 5091
Query 5086 GCATCATCT-TTGATTGAAGCATTTACAAGATCGTGGTGCAGCCCTTCTTTAATCGAA-A 5143
||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |
Sbjct 5092 GCATCATCTCTT-ATTGAAGCATTTACAAGAACGTGGTGCAGCCCATCTCTAATC-AAGA 5149
Query 5144 ACGAACTGTCTCAGATAAAGAAGGCAGACTTTAATGATGAGAGCTTTTCAGTCAGCATAA 5203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5150 ACGAACTGTCTCAGATAAAGAAGGCAGACTTTAATGATGAGAGCTTTTCAGTCAGCATAA 5209
Query 5204 GTAAAGCGGCGAATGAAGTAGTTGCTACATATACGAAGGATGAAACGGGGATGGATCTCG 5263
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5210 GTAAAGCGGCAAATGAGGTAGTTGCTACATATACGAAGGATGAAACGGGGATGGATCTCG 5269
Query 5264 TGATCCGGCTTCCAGTTTCTTACCCACTCAGGCCTGTTGACGTTAATTGCACAAAAAGTA 5323
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5270 TGATCCGGCTTCCAGTTTCTTACCCACTCAAGCCTGTTGACGTTAATTGCGCAAAAAGTA 5329
Query 5324 TTGGAATAAGCGATGCGAAGCAGAGGAAGTGGTTGATGTCTATGCAAATGTTTGTTCGTA 5383
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5330 TTGGAATAAGCGAAGCGAAGCAGAGGAAGTGGTTGATGTCTATGCAAATGTTTGTTCGTC 5389
Query 5384 ATCAGAACGGGGCTCTGGCGGAGGCGATAAGGATATGGAAGCGAAACTCGGACAAGGAAT 5443
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5390 ATCAGAATGGGGCTCTGGCGGAGGCGATAAGGATATGGAAGCGAAATTCGGACAAGGAAT 5449
Query 5444 TTGAAGGAGTAGAAGACTGCCCGATATGTTACAGTGTGATACACACAGGGAATCACAGCC 5503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5450 TTGAAGGAGTAGAAGACTGCCCGATATGTTACAGTGTGATACACATAGGGAATCACAGCC 5509
Query 5504 TTCCAAGGCGAGCTTGCGTGACGTGCAAGTACAAGTTTCACAAAGCATGTTTAGACAAGT 5563
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5510 TTCCAAGGCGAGCTTGCGTGACTTGCAAGTACAAGTTTCACAAAGCATGTTTAGACAAGT 5569
Query 5564 GGTTCTACACGTCTCATAAGAAACTCTGCCCCTTGTGCCAATCTCCTTGCTGATTCAATA 5623
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 5570 GGTTCTACACGTCTAATAAGAAACTCTGCCCCTTGTGCCAATCTCCTTGCTAATACAATA 5629
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 280834546914
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5