BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg496177
Length=1599
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2682 0.0
AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2061 0.0
AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2061 0.0
AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu fami... 2050 0.0
AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domai... 436 2e-121
AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832 RE... 228 2e-58
> AT5G60390.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr5:24288658-24291020 FORWARD LENGTH=1764
Length=1764
Score = 2682 bits (1452), Expect = 0.0
Identities = 1553/1602 (97%), Gaps = 6/1602 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACACTTTCGTAGCCGCAAGCCTCCTCTCAGATTCTTA 60
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1 TAGGGTGCGCTCTCATATTTCTCACATTTTCGTAGCCGCAAGACTCCTTTCAGATTCTTA 60
Query 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGAC 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 61 CTTGCAGCTATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGTCATGTTGAT 120
Query 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCTGGAAAATCGACCACAACTGGTCACTTGATCTATAAGCTTGGTGGTATTGACAAGCGT 180
Query 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCA 240
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 181 GTCATCGAGAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCA 240
Query 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 241 TGGGTGTTGGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATTACCATCGATATTGCTCTA 300
Query 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGAT 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 301 TGGAAGTTCGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTCATTGATGCCCCAGGACATCGTGAT 360
Query 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGAC 420
Query 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TCCACCACTGGAGGTTTTGAGGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCT 480
Query 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCC 540
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 481 CTTCTTGCTTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATTTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCC 540
Query 541 ACTACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 541 ACCACCCCCAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCATAC 600
Query 601 CTGAAGAAGGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAG 660
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||
Sbjct 601 CTGAAGAAGGTCGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTGCCAATCTCTGGATTCGAG 660
Query 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTT 720
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 661 GGAGACAACATGATTGAGAGGTCAACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTTCTT 720
Query 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCA 780
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 721 GAGGCTCTTGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTTCCA 780
Query 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACC 840
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 CTTCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACT 840
Query 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 841 GGTATGATCAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTT 900
Query 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 901 AAGTCTGTTGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGA 960
Query 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 961 TTCAATGTCAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGATACGTTGCCTCTAACTCC 1020
Query 1021 AAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCAC 1080
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1021 AAGGATGATCCAGCTAAGGGTGCCGCCAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCAC 1080
Query 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 CCTGGTCAGATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCA 1140
Query 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAG 1200
Query 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCC 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1201 GAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACCCCAACCAAGCCC 1260
Query 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCATTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATG 1320
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1261 ATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCTTTGGGACGTTTCGCTGTTAGGGACATG 1320
Query 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 AGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTATTAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCC 1380
Query 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGATGAGACTTTCGTTATGATGGA 1440
|||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1381 AAGGTCACCAAGGCTGCAGTGAAGAAGGGTGCCAAATGATGAGACTTTCGTTATGATCGA 1440
Query 1441 CTCTCTTATGGTTTTCTTTGGTTCTTAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCttttt-tttt- 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1441 CTCTCTTATGGTTTTCTTTGGTTCTTAAAACTTTGATGGCGTTTGAGCCTTTTTCTTTTT 1500
Query 1499 -ctctttatttctatgactttcttctctcttcctcctttttggatatctctgagactttt 1557
|||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1501 TCTCTTTATTTCTGTGACTTTCT-CTCTC--CCTCCTTTTTGGATATCTCTGAGACTTTT 1557
Query 1558 tATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558 TATTATGGTTTTCAATTATGCAGTTTCCGGATAATTTTGCTT 1599
> AT1G07940.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2462953-2465504 REVERSE LENGTH=1864
Length=1864
Score = 2061 bits (1116), Expect = 0.0
Identities = 1274/1352 (94%), Gaps = 4/1352 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 118 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 177
Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
|||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 178 TCGACCACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 236
Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 237 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 296
Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 356
Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 357 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 416
Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 417 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 476
Query 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 477 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 536
Query 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548
||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 596
Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 597 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 656
Query 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 657 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 716
Query 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 776
Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 836
Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 837 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 896
Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 897 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 956
Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 957 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1016
Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||
Sbjct 1017 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1076
Query 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1136
Query 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1196
Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1197 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCTAA 1256
Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
|| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 ATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1316
Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1317 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGA 1375
Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1376 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTTA 1435
Query 1388 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGA 1419
||||||||||||||||||| || || || |||
Sbjct 1436 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAGGGTGCCAAGTGA 1467
> AT1G07920.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2454846-2457321 FORWARD LENGTH=1783
Length=1783
Score = 2061 bits (1116), Expect = 0.0
Identities = 1274/1352 (94%), Gaps = 4/1352 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 114 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 173
Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
|||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 174 TCGACCACCACTGGGCACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTCATTGA 232
Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 233 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTTTT 292
Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 293 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 352
Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 353 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGCCATCGTGATTTCATCAA 412
Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 413 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 472
Query 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 473 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTACTTGC 532
Query 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548
||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 592
Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 593 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 652
Query 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 653 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 712
Query 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 772
Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 832
Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 833 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 892
Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 893 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 952
Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 953 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1012
Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||
Sbjct 1013 TAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCATCCAACTCCAAGGATGA 1072
Query 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1073 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1132
Query 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1148
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1133 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAGTCCTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTT 1192
Query 1149 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193 CTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAA 1252
Query 1209 GTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1268
||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 GTTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGT 1312
Query 1269 TGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGA 1327
||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1313 GGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTGAGGGACATGAGGCAGA 1371
Query 1328 CCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTCA 1387
| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1372 CTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTTA 1431
Query 1388 CCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAATGA 1419
|||||||||| |||||||| || || || |||
Sbjct 1432 CCAAGGCTGCCGTCAAGAAGGGTGCGAAGTGA 1463
> AT1G07930.1 | Symbols: | GTP binding Elongation factor Tu family
protein | chr1:2458244-2460790 FORWARD LENGTH=1807
Length=1807
Score = 2050 bits (1110), Expect = 0.0
Identities = 1274/1354 (94%), Gaps = 8/1354 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 70 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATTAACATTGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCTGGAAAA 129
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 126 ATGGGTAAAGAGAAGTTTCACATCAACATTGTGGTCATTGGCCACGTCGATTCTGGAAAG 185
Query 130 TCGACCACAACTGGTCACTTGATCTACAAGCTT-GGTGGTATTGACAAGCGTGTCATCGA 188
||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 186 TCGACAACCACTGGACACTTGATCTACAAG-TTGGGTGGTATTGACAAGCGTGTGATCGA 244
Query 189 GAGGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCATTCAAGTACGCATGGGTGTT 248
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 245 GAGGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGATGAACAAGAGGTCCTTCAAGTACGCATGGGTGTT 304
Query 249 GGACAAACTTAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTT 308
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 305 GGACAAACTTAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGACATTGCTCTCTGGAAGTT 364
Query 309 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACAGTTATTGATGCCCCTGGACATCGTGATTTCATCAA 368
|||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 365 CGAGACCACCAAGTACTACTGCACTGTCATTGATGCTCCTGGTCATCGTGATTTCATCAA 424
Query 369 GAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTTCTTATCATTGACTCCACCAC 428
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 425 GAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTGTCCTTATCATTGACTCCACCAC 484
Query 429 TGGAGGTTTTGAAGCTGGTATCTCTAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGC 488
||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 485 TGGTGGTTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAGCACGCTCTCCTTGC 544
Query 489 TTTCACCCTTGGTGTTAAGCAGATGATTTGCTGCTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 548
||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 545 TTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGATGATCTGCTGTTGTAACAAGATGGATGCCACTACCCC 604
Query 549 CAAATACTCCAAGGCTAGGTACGATGAAATTATCAAGGAGGTGTCTTCATACCTGAAGAA 608
||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 605 CAAGTACTCCAAGGCCAGGTACGATGAAATCATCAAGGAGGTGTCTTCCTACTTGAAGAA 664
Query 609 GGTTGGATACAACCCTGACAAAATCCCATTTGTTCCCATCTCTGGATTTGAGGGAGACAA 668
|||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 665 GGTTGGTTACAACCCCGACAAAATCCCATTTGTGCCCATCTCTGGATTTGAGGGTGACAA 724
Query 669 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CATGATTGAGAGGTCCACCAACCTTGACTGGTACAAGGGACCAACTCTCCTTGAGGCTCT 784
Query 729 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCATCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 788
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 TGACCAGATCAACGAGCCCAAGAGGCCGTCAGACAAGCCCCTTCGTCTCCCACTTCAGGA 844
Query 789 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACCGGTATGAT 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 845 TGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGAACGGTGCCAGTGGGACGTGTTGAGACTGGTATGAT 904
Query 849 CAAGCCTGGTATGGTTGTTACCTTTGCTCCCACAGGGTTGACCACTGAGGTTAAGTCTGT 908
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 905 CAAGCCTGGTATGGTTGTGACCTTTGCTCCCACAGGATTGACCACTGAGGTCAAGTCTGT 964
Query 909 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCCGGTGACAATGTTGGATTCAATGT 968
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 965 TGAGATGCACCACGAGTCTCTTCTTGAGGCACTTCCAGGTGACAACGTTGGGTTCAATGT 1024
Query 969 CAAGAATGTTGCTGTCAAGGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGA 1028
||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1025 TAAGAATGTTGCCGTGAAGGATCTTAAGAGAGGGTACGTCGCCTCCAACTCCAAGGATGA 1084
Query 1029 CCCAGCTAAGGGTGCTGCCAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1088
||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 CCCTGCCAAGGGTGCTGCTAACTTCACCTCCCAGGTCATCATCATGAACCACCCTGGTCA 1144
Query 1089 GATTGGTAACGGTTATGCCCCAGTTC-TCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1147
||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1145 GATTGGTAACGGTTACGCCCCAG-TCTTGGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGT 1203
Query 1148 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 TCTCTGAGATCTTGACCAAGATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCA 1263
Query 1208 AGTTTTTGAAGAATGGTGACGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1267
| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 AATTCTTGAAGAATGGTGATGCTGGTATGGTGAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTG 1323
Query 1268 TTGAGACTTTCTCCGAGTACCCACCA-TTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAG 1326
| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1324 TGGAGACCTTCTCTGAGTACCCACCACTTGG-ACGTTTCGCTGTTAGGGACATGAGGCAG 1382
Query 1327 ACCGTTGCTGTTGGTGTTATCAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAAGGTC 1386
|| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1383 ACTGTTGCAGTCGGTGTTATCAAGAGTGTTGACAAGAAGGACCCAACCGGAGCCAAGGTT 1442
Query 1387 ACCAAGGCTGCAGTCAAGAAAGGAGCTAAA-TGA 1419
|||||||||||||| ||||| || || ||| |||
Sbjct 1443 ACCAAGGCTGCAGTTAAGAAGGGTGC-AAAGTGA 1475
> AT1G35550.1 | Symbols: | elongation factor Tu C-terminal domain-containing
protein | chr1:13112506-13113136 FORWARD LENGTH=631
Length=631
Score = 436 bits (236), Expect = 2e-121
Identities = 343/396 (87%), Gaps = 1/396 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 987 GGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGC 1046
||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||
Sbjct 133 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 191
Query 1047 CAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGC 1106
| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |
Sbjct 192 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 251
Query 1107 CCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1166
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 311
Query 1167 GATTGACAGGCGTTCTGGTAAGGAGATTGAGAAGGAGCCCAAGTTTTTGAAGAATGGTGA 1226
||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||
Sbjct 312 GATTGACTGGCGTACTGGTCATGAGATTGAGAAGGAGCCAAAGTTTTTAAAGAACAGTGA 371
Query 1227 CGCTGGTATGGTTAAGATGACTCCAACCAAGCCCATGGTTGTTGAGACTTTCTCCGAGTA 1286
|| | ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||| | |||
Sbjct 372 GGCCGCTATTATTAATATGACTCCCACCAAGCCTATGGTGGTTGAGGCTTACTCTGCGTA 431
Query 1287 CCCACCATTGGGACGTTTTGCTGTTAGGGACATGAGGCAGACCGTTGCTGTTGGTGTTAT 1346
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||
Sbjct 432 CCCACCCCTGGGACGTTTTGCTATTAGGGACATGAGGCAAACCGTTGGTGTTGGAGTTAT 491
Query 1347 CAAGAGCGTGGACAAGAAGGACCCAACTGGAGCCAA 1382
|||||| || | |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 492 CAAGAGTGTTGTCAAGAAGGACCCAAGTGGAGCCAA 527
> AT1G35545.1 | Symbols: | other RNA | chr1:13110517-13112832
REVERSE LENGTH=814
Length=814
Score = 228 bits (123), Expect = 2e-58
Identities = 170/193 (88%), Gaps = 1/193 (1%)
Strand=Plus/Minus
Query 987 GGATCTTAAGAGAGGGTATGTTGCCTCTAACTCCAAGGATGACCCAGCTAAGGGTGCTGC 1046
||| |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||
Sbjct 195 GGA-CTTAAGCGTGGGTACGTCGCCTCAAACTCCAAGGATGATCCTGCAAAGGTTGCTGC 137
Query 1047 CAACTTCACCTCCCAGGTTATCATCATGAACCACCCTGGTCAGATTGGTAACGGTTATGC 1106
| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |
Sbjct 136 TAGCTTCACCTCCCAGGTCGTCATCATGAACCACCTTGGTCAGATTAAAAATGGTTACAC 77
Query 1107 CCCAGTTCTCGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 1166
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 CCCAGTTCTTGATTGCCACACCTCTCACATTGCAGTCAAGTTCTCTGAGATCTTGACCAA 17
Query 1167 GATTGACAGGCGT 1179
||||||| |||||
Sbjct 16 GATTGACTGGCGT 4
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 78965457285
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5