BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg496629
Length=4026
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G64270.1 | Symbols: | splicing factor, putative | chr5:2570... 6418 0.0
> AT5G64270.1 | Symbols: | splicing factor, putative | chr5:25706659-25710925
FORWARD LENGTH=4146
Length=4146
Score = 6418 bits (3475), Expect = 0.0
Identities = 3871/4059 (95%), Gaps = 39/4059 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TTTTTTGTTGGAGAAAGCTTCGTTGAGTATC-GATAATGGCGGATCTAGATCCAGAGATC 59
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 TTTTTTGCTGGAGAAAGCTTCGTTGAGTATCTGATAATGGCGGATCTAGATCCAGAGATC 153
Query 60 GCTAAAACTCAAGAGGAAAGACGGAAGATGGAAGCAGACCTTGCTTCTCTCACTTCTATC 119
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 154 GCTAAAACTCAGGAGGAAAGACGGAAGATGGAAGCAGACCTTGCTTCTCTCACTTCTCTG 213
Query 120 AATATGGATCGCGATCTATACGGAGGTAACGACCGTGATTCCTACGT-GACTTCTATTGC 178
| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||
Sbjct 214 ACTTTCGATCGCGATCTATACGGAGGTAACGACCGTGCTTCCTAC-TCGACTTCTATTGC 272
Query 179 TCCTAACGATGAGGAGGATACGAATCTGGACACCACTGGTTCTCTTGTTGCTCAGCGGCT 238
|||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct 273 ACCTAACGAGGAGGATGATGCGAATCTGGACACCACTGGTTCTCTTGTGGCTCAGCGCCT 332
Query 239 CGCGTCTTACACTGCTCCTAGGTCGCTTCTTAACGACGTGGCTCGTCCTCACAACGAAGA 298
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 333 CGCGTCTTATACTGCTCCTAGGTCAATTCTTAACGACGTGGCTCGTCCTCACAACGAAGA 392
Query 299 TGACGATGTGGGATTTAAACCTAGGCAGACTATTGCGGAACGGGAGGGTGAGTATAGGAA 358
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 393 TGACGATGTGGGATTTAAACCTAGGCAGAGTATTGCCGAACGTGAGGGTGAATATAGGAA 452
Query 359 TAGGAGACTCAATCGGGTTCTTTCTCCGGATAGAGTTGATGCCTTTGCTATGGGCGACAA 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 453 TAGGAGACTCAATCGGGTTCTTTCTCCGGATAGAGTTGATGCCTTTGCTATGGGCGACAA 512
Query 419 AACGCCGGATGCGAGTGTTCGGACTTACACGGACCATATGAGGGAGACGGCTTTGCAGAG 478
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 AACGCCGGATGCGAGTGTTCGTACTTACACGGACCATATGAGGGAGACGGCTTTGCAGAG 572
Query 479 GGAGAAAGAGGAAACTATGAGGCTCATTGCTaagaagaagaaagaggaagaagaa---gC 535
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 573 GGAGAAAGAGGAAACTATGAGACTCATTGCCAAGAAGAAGAAAGAGGAAGAAGAAGCTGC 632
Query 536 TGCAAAGCATCAGAAAGATTCTGCTCCTCCTCCTCCTG--T--TC--CTTC-T--TCTTC 586
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||
Sbjct 633 TGCGAAGCATCAGAAAGATTCTGCTCCTCCTCCTCCTGCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTC 692
Query 587 CAAGAGGAGACACAGGTGGGATCTCCCTGAAGAAGACGGTGGTGCTGCAAAGAAAGCTAA 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 693 CAAGAGGAGACACAGGTGGGATCTCCCTGAAGAAGACGGTGCTGCTGCAAAGAAGGCTAA 752
Query 647 AGCAGCAAGTTCAGATTGGGATTTACCTGATGCAGCTCCAGGGATTGGACGATGGGATGC 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 753 AGCAGCAAGTTCAGATTGGGATTTACCTGATGCAGCTCCAGGGATTGGACGATGGGATGC 812
Query 707 TCCAACTCCAGGGAGAGTTTCTGATGCCACCCCTTCTGCTGGACGAAGAAACAGGTGGGA 766
||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 813 TCCTACTCCAGGGAGAGTTTCTGATGCCACACCATCTGCTGGACGAAGGAACAGGTGGGA 872
Query 767 CGAAACTCCTACACCTGGTCGTGTGACTGATTCTGATGCAACACC---TGGTGGTGTTAC 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 873 CGAAACTCCTACACCTGGTCGTGTGACTGATTCTGATGCAACACCTGGTGGTGGTGTTAC 932
Query 824 TCCCGGTGCAACTCCTTCAGGTGTTACTTGGGACGGGCTTGCCACCCCTACCCCAAAGCG 883
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 933 TCCCGGTGCTACTCCTTCAGGTGTTACTTGGGACGGGCTTGCCACGCCTACCCCAAAGCG 992
Query 884 TCAACGTTCAAGGTGGGACGAAACACCAGCCACTATGGGGAGTGCTACACCTATGGGTGG 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 993 TCAACGTTCAAGGTGGGACGAAACACCAGCCACTATGGGGAGTGCTACACCTATGGGTGG 1052
Query 944 AGTCACTCCTGGTGCAGCTTACACTCCTGGTGTTACCCCTATTGGTGGGATTGATATGGC 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1053 AGTCACTCCTGGTGCAGCTTACACTCCTGGTGTTACCCCAATTGGTGGGATTGATATGGC 1112
Query 1004 TACTCCGACTCCGGGTCAGCTTATTTTCCGTGGTGCTATGACCCCCGAGCAGCTCAATAT 1063
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113 TACTCCGACTCCGGGTCAGCTTATTTTCCGTGGTCCTATGACCCCCGAGCAGCTCAATAT 1172
Query 1064 GCAAAGGTGGGAGAAGGATATCGAGGAGAGAAACAGACCATTGAGTGATGAAGAGCTTGA 1123
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 GCAAAGGTGGGAGAAGGATATCGAGGAAAGAAACAGACCATTGAGTGATGAAGAGCTTGA 1232
Query 1124 TGCCATGTTTCCTAAAGATGGATACAAGGTTTTGGATCCGCCTGCTTCATATGTTCCCAT 1183
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
Sbjct 1233 TGCCATGTTTCCTAAAGATGGATACAAGGTTTTGGATCCGCCTGCTACGTATGTTCCCAT 1292
Query 1184 CAGAACCCCTGCGAGGAAACTTCAACAAACCCCGACACCCATGGCAACTCCTGGCTATGT 1243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293 CAGAACCCCTGCGAGGAAACTTCAACAAACCCCGACACCCATGGCAACTCCTGGCTATGT 1352
Query 1244 TATTCCCGAGGAAAACCGTGGGCAACAGTATGATGTGCCCCCAGAAGTTCCTGGTGGTTT 1303
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1353 TATTCCTGAGGAAAACCGTGGGCAACAGTATGATGTGCCCCCAGAAGTTCCTGGTGGTTT 1412
Query 1304 GCCGTTTATGAAACCAGAGGATTATCAGTATTTTGGAGCTCTGTTGAATGAAGAGAACGA 1363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1413 GCCGTTTATGAAACCAGAGGATTATCAGTATTTTGGTTCTCTGTTAAATGAAGAGAACGA 1472
Query 1364 AGAAGAGCTGTCTCCTGACGAGCAGAAAGAACGCAAGATCATGAAACTATTGTTAAAGGT 1423
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1473 AGAAGAGCTGTCTCCTGAAGAGCAGAAAGAACGCAAGATAATGAAACTGTTGTTAAAGGT 1532
Query 1424 TAAAAATGGAACTCCTGCCCAGAGGAAAACAGCCCTGAGGCAGCTTACTGATAAGGCTCG 1483
|||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533 TAAAAATGGAACTCCTCCCCAGAGGAAAACAGCGCTGAGGCAGCTTACTGATAAGGCTCG 1592
Query 1484 TGAGCTTGGTGCTGGTCCTTTGTTCAATAAAATTTTGCCATTGCTCATGCAACCCACTTT 1543
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1593 TGAACTTGGTGCTGGTCCTTTGTTCAATAAAATTTTGCCATTGCTCATGCAACCCACTTT 1652
Query 1544 GGAAGATCAAGAGAGGCATCTTTTGGTCAAAGTGATTGATAGGATTCTGTACAAACTTGA 1603
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1653 GGAAGATCAAGAGAGGCATCTTTTGGTCAAAGTGATTGATAGAATTCTGTACAAACTTGA 1712
Query 1604 TGAGCTGGTAAGGCCTTACGTCCACAAAATCCTTGTTGTTATTGAGCCTTTGTTGATTGA 1663
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1713 TGAGATGGTAAGGCCTTACGTCCACAAAATCCTTGTTGTTATTGAGCCTTTGCTGATTGA 1772
Query 1664 TGAGGATTATTATGCTCGTGTAGAAGGGAGAGAAATTATTTCTAACCTTAGCAAAGCAGC 1723
||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 TGAAGATTATTATGCTCGTGTAGAAGGGAGAGAGATTATTTCTAACCTTAGCAAAGCAGC 1832
Query 1724 TGGTTTGGCCACTATGATTGCAGCTATGCGTCCTGATATTGACAACATTGATGAATATGT 1783
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1833 TGGTTTGGCCTCTATGATTGCAGCTATGCGTCCTGATATTGACAACATCGATGAATATGT 1892
Query 1784 GAGGAACACAACAGCGAGAGCTTTCAGTGTGGTGGCTTCAGCTCTTGGAATCCCTGCACT 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893 GAGGAACACAACAGCGAGAGCTTTCAGTGTGGTGGCTTCAGCTCTTGGAATCCCTGCACT 1952
Query 1844 CTTGCCTTTCCTAAAAGCTGTGTGCCAGAGTAAAAAGTCATGGCAGGCACGGCACACTGG 1903
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1953 CTTGCCTTTCCTGAAAGCTGTGTGCCAGAGTAAAAGGTCATGGCAGGCACGGCATACTGG 2012
Query 1904 AATTAAGATTGTTCAGCAGATTGCGATACTAATTGGTTGTGCCGTCCTGCCTCACTTAAG 1963
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2013 AATCAAGATTGTTCAGCAGATTGCGATACTAATTGGTTGTGCTGTCCTGCCTCACTTAAG 2072
Query 1964 GTCTTTAGTAGAGATTATCGAACATGGTCTCAGTGATGAAAACCAGAAGGTTAGGACTAT 2023
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GTCTTTGGTAGAGATTATCGAACATGGTCTTAGTGATGAAAACCAGAAGGTTAGGACTAT 2132
Query 2024 TACCGCTTTGTCACTGGCTGCTCTTGCTGAAGCTGCTGCTCCATATGGTATTGAGAGCTT 2083
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2133 TACCGCATTGTCACTGGCTGCTCTTGCTGAAGCTGCTGCTCCATATGGTATTGAGAGCTT 2192
Query 2084 TGATTCTGTTCTGAAGCCTTTGTGGAAAGGTATTAGGTCGCACCGTGGTAAAGTTTTAGC 2143
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 TGATTCTGTTCTGAAGCCTTTGTGGAAAGGTATTAGGTCGCACCGTGGTAAAGTTTTAGC 2252
Query 2144 TGCTTTCTTGAAGGCGATCGGTTTTATCATCCCCTTGATGGATGCTATATATGCGAGCTA 2203
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TGCTTTCTTGAAGGCGATCGGTTTTATCATTCCCTTGATGGATGCTATATATGCGAGCTA 2312
Query 2204 CTATACAAAAGAAGTCATGGTTATCTTGATTCGTGAGTTCCAGTCGCCTGATGAAGAGAT 2263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2313 CTATACAAAAGAAGTCATGGTTATCTTGATTCGTGAGTTCCAGTCGCCTGATGAAGAGAT 2372
Query 2264 GAAGAAGATCGTCCTCAAGGTGGTGAAACAGTGTGTAAGTACAGAGGGTGTTGAACCGGA 2323
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2373 GAAGAAGATCGTCCTCAAGGTGGTGAAACAGTGTGTAAGTACAGAGGGTGTTGAACCGGA 2432
Query 2324 ATACATACGCAGTGATATTCTGCCTGAGTTTTTCAAGCATTTCTGGGTTAGGAAAATGGC 2383
|||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||
Sbjct 2433 ATACATTCGTAGTGATATTCTGCCCGAGTTTTTCAGGAATTTCTGGACAAGGAAAATGGC 2492
Query 2384 TCTGGAGAGGAGAAACTATAAGCAGCTTGTTGAAACTACTGTGGAGATTGCGAACAAGGT 2443
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2493 TCTGGAGAGGAGAAACTATAAGCAGCTTGTTGAAACTACTGTGGAGGTTGCGAACAAGGT 2552
Query 2444 TGGTGTTGCAGATATTGTGGGAAGAGTTGTTGAAGATCTCAAGGATGAGAGTGAACCGTA 2503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct 2553 TGGTGTTGCAGATATTGTGGGAAGAGTTGTTGAAGATCTCAAGGACGAGAGTGAACAGTA 2612
Query 2504 TCGACGTATGGTTATGGAAACCATTGATAAGGTTGTCACAAACTTGGGAGCATCTGATAT 2563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2613 TCGACGTATGGTTATGGAAACCATTGATAAGGTTGTCACAAACTTAGGAGCATCTGATAT 2672
Query 2564 TGATGCGAGATTGGAGGAACTGCTCATAGATGGCATTCTTTATGCTTTTCAAGAACAGAC 2623
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2673 TGATGCGAGGTTGGAGGAACTGCTCATAGATGGCATTCTTTATGCTTTTCAAGAACAGAC 2732
Query 2624 TAGTGACGATGCTAATGTAATGCTTAATGGATTCGGTGCTGTAGTGAATGCTCTTGGTCA 2683
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2733 TAGTGACGATGCTAATGTGATGCTTAATGGATTCGGTGCTGTAGTAAATGCTCTTGGTCA 2792
Query 2684 GAGAGTAAAGCCTTATCTTCCCCAGATCTGTGGTACCATCAAGTGGCGTTTGAACAACAA 2743
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2793 GCGAGTAAAGCCTTATCTTCCCCAGATCTGTGGTACCATCAAGTGGCGATTGAACAACAA 2852
Query 2744 GAGTGCTAAGGTAAGACAACAAGCTGCTGATCTGATTTCTAGAATTGCGGTTGTTATGAA 2803
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 2853 GAGTGCAAAGGTAAGACAGCAAGCTGCTGATCTGATTTCTCGAATTGCAGTTGTTATGAA 2912
Query 2804 GCAATGCGGAGAGGAACAGTTGATGGGACATCTTGGTGTTGTTTTGTATGAATATCTTGG 2863
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2913 GCAATGCGGAGAGGAACAGTTGATGGGACATCTAGGTGTTGTTTTGTATGAATATCTTGG 2972
Query 2864 AGAAGAGTACCCAGAAGTCTTGGGATCAATTCTTGGAGCTTTAAAAGCTATAGTCAATGT 2923
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2973 AGAAGAGTACCCAGAAGTCTTGGGATCGATTCTTGGGGCTTTAAAAGCTATAGTCAATGT 3032
Query 2924 GATTGGTATGACGAAGATGACTCCTCCTATTAAGGATCTGCTTCCAAGGCTGACCCCGAT 2983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 3033 GATTGGTATGACGAAGATGACTCCTCCTATTAAGGATCTTCTACCAAGGCTGACCCCGAT 3092
Query 2984 TTTGAAGAACAGGCACGAGAAAGTGCAAGAGAATTGCATTGATCTTGTCGGTAGGATTGC 3043
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct 3093 TTTGAAGAATAGGCATGAGAAAGTGCAAGAGAATTGTATCGATCTTGTTGGTAGGATTGC 3152
Query 3044 TGATCGTGGTGCCGAGTTTGTTCCAGCAAGAGAATGGATGAGAATCTGTTTTGAGCTTCT 3103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3153 TGATCGTGGTGCCGAGTTTGTTCCAGCAAGAGAATGGATGAGAATCTGTTTCGAGCTTCT 3212
Query 3104 TGAAATGCTTAAGGCTCATAAGAAAGGTATTCGTCGTGCTACAGTCAATACTTTCGGGTA 3163
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||
Sbjct 3213 TGAAATGCTTAAAGCTCATAAGAAAGGTATTCGTCGTGCTACTGTCAACACTTTTGGGTA 3272
Query 3164 CATCGCCAAAGCCATTGGACCACAGGATGTTCTTGCCACGTTGCTGAACAATCTCAAAGT 3223
||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3273 CATTGCCAAAGCCATTGGGCCACAAGACGTTCTAGCCACGTTGCTTAACAATCTCAAAGT 3332
Query 3224 CCAAGAACGTCAGAACCGTGTTTGCACCACAGTCGCAATCGCTATTGTCGCTGAAACATG 3283
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 3333 CCAAGAACGTCAGAACCGTGTTTGCACCACAGTTGCAATCGCCATAGTCGCTGAAACATG 3392
Query 3284 CTCTCCCTTCACCGTATTACCTGCTTTGATGAATGAGTACCGTGTTCCAGAGCTAAACGT 3343
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3393 CTCTCCCTTCACCGTCTTACCTGCTTTGATGAATGAGTACCGTGTTCCAGAGCTAAACGT 3452
Query 3344 CCAAAACGGTGTTTTGAAATCTCTTTCCTTCCTCTTTGAGTATATTGGAGAAATGGGCAA 3403
|||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||
Sbjct 3453 CCAAAATGGTGTTCTGAAATCTCTCTCCTTCCTCTTCGAGTACATTGGAGAGATGGGCAA 3512
Query 3404 AGATTACATATACGCAGTCACACCGTTGCTTGAAGACGCGCTCATGGACAGAGATTTGGT 3463
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 3513 AGATTACATATACGCAGTTACACCGTTGCTTGAAGACGCTCTCATGGACAGGGATTTGGT 3572
Query 3464 TCACAGACAAACCGCAGCTTCAGCCGTGAAACATATGGCTCTAGGTGTAGCTGGGTTGGG 3523
||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3573 TCATAGACAAACGGCTGCTTCAGCTGTGAAACATATGGCTCTAGGTGTAGCTGGGTTGGG 3632
Query 3524 ATGCGAAGACGCTTTGGTTCACTTGCTTAACTTCATTTGGCCCAACATTTTCGAGACATC 3583
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3633 ATGCGAAGACGCCTTGGTTCACTTGCTTAACTTCATTTGGCCCAACATTTTTGAGACATC 3692
Query 3584 TCCTCACGTCATTAACGCGGTGATGGAAGCCATTGAAGGAATGCGAGTCGCATTAGGTGC 3643
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3693 TCCTCACGTCATTAACGCAGTGATGGAAGCCATTGAAGGAATGCGAGTCGCATTAGGAGC 3752
Query 3644 AGCTGTAATTCTGAACTATTGTTTGCAGGGTTTGTTTCATCCGGCGCGCAAGGTCCGCGA 3703
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3753 AGCTGTAATTCTGAACTATTGCTTGCAGGGTTTGTTTCATCCGGCGCGCAAGGTCCGCGA 3812
Query 3704 AGTGTACTGGAAGATATACAATTCTCTATACATTGGTGCTCAGGACACGCTTGTTGCTGC 3763
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3813 AGTGTACTGGAAGATATACAATTCTTTATACATTGGTGCTCAGGACACCCTTGTTGCTGC 3872
Query 3764 TTACCCGGTTCTTGAAGATGAGCAGAACAATGTGTATAGCCGACCAGAGTTGACGATGTT 3823
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3873 TTACCCGGTTCTTGAAGACGAGCAGAACAATGTGTATAGCCGACCGGAGTTGACGATGTT 3932
Query 3824 TGTGTGAAAGAAAGATT--GGATTCGATGTGACTCTATTACTCTCTAGTCTCCTGTAGTT 3881
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3933 TGTGTGAAAGAAAGATTCTGGATTCGATGTGATTCTATTACTCTCTAGTCACCTGTAGTT 3992
Query 3882 TTTGGTATT--GGCTTTATTGCAAAGGTTTGCTTTGTATAAAACTCTCGAACACAGAAGC 3939
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | |
Sbjct 3993 GTTGGTATTTTGGCTTTATTGCAAAGGTTTGCTTTGTATAAAACACA-GAA-AC-GTTTC 4049
Query 3940 GGTTCTTTT-CTTTTT-CT-G------TGTG--CACTTTTTGGT-ATTTCTTATTGACTT 3987
||||||| || | || | | || ||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4050 TTTTCTTTTTCTGATAACTAGAAAACCTATGTTCACTTTT-GGTTATTTCTTATTGACTT 4108
Query 3988 TAGTTTCATGTTATTTGCCATGCATTACAGCTGCAGGTT 4026
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 4109 AAGTTTCATGTTATTTGT-ATGCATTACAGTTGCAGGTT 4146
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 200617605057
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5