BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg496639
Length=2447
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G64341.1 | Symbols: CPuORF40 | conserved peptide upstream op... 3681 0.0
AT5G64343.1 | Symbols: CPuORF38 | conserved peptide upstream op... 3681 0.0
AT5G64342.1 | Symbols: CPuORF39 | conserved peptide upstream op... 3681 0.0
AT5G64340.1 | Symbols: SAC51 | sequence-specific DNA binding tr... 3681 0.0
> AT5G64341.1 | Symbols: CPuORF40 | conserved peptide upstream
open reading frame 40 | chr5:25730335-25733313 REVERSE LENGTH=2471
Length=2471
Score = 3681 bits (1993), Expect = 0.0
Identities = 2334/2487 (94%), Gaps = 70/2487 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTTTAGAAATATTTCGTaaaaaaaaaaTTCTGCGTTTACACATTATTGCTCGTTGGTCA 60
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 1 TCTTTAGAAATATTTCGT-AAAAAAAAATTCTCCGTTTAGACATTATTGTTCGTTGGTCA 59
Query 61 C-TTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTC---ATAAACCAAAAAAG 116
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 60 CTTTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTCAAAAAAAAACAAAAAAG 119
Query 117 TCTCATCGTTCTCTCTGGATCTGAGCGAAAGATCGTTCCTTTGTAAGCTACTAAAGTA-G 175
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |
Sbjct 120 TCTCATCGTTTTCTCTGGATCTGACCGAAAGATCATTCCTTTCTAAGATACTAAAGTAGG 179
Query 176 ATTGA-TGATCAGAATCAATTAGAGTGTGTATATAAGAAGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 234
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTTGAGTGATCAGAATCAATTAGAGTGTG--TATAAGAGGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 237
Query 235 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGCGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATTCTGT 294
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 238 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGAGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATACTGT 297
Query 295 AAATTGTTTCACCTTTGAACCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCTCTTCTTTGTTCTTATT 354
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||
Sbjct 298 AGATTGTTTCACCTTTGAAGCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCT-TT-TCT-TTCTTATT 354
Query 355 CATCTTCCCTTCGTTTTCGATATATTTTAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTT 414
|||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 CATCTTCCCTTCTTTTTCGGTATATTATAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTC 414
Query 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACT-AAAGCTTACTGTCCTTCCAC-AA 472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||
Sbjct 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACTAAAAGCTCACTCTCCTTCCACAAA 474
Query 473 CAAAAGTTTCCTCC------TTTT-G-----G---------TT---T-AAGATTCCCTCA 507
||||| |||||||| |||| | | || | |||||| |||||
Sbjct 475 CAAAACTTTCCTCCTTTTGGTTTTGGTATCTGTCTACTTTCTTCAATCAAGATTTCCTCA 534
Query 508 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGCATTGAAGTACGAGACAG 567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 535 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGGATTGAAGTACGAGACCG 594
Query 568 GAAACGCTAACAAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 627
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GAAACGCTAACGAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 654
Query 628 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGATA 687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 655 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGACA 714
Query 688 TTTCGCTGCATTTTTCGATCTGGGAtt-tttttCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 746
|||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TTTCGCTGCATTTTTCAATCTGTGATTGTTTTTCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 774
Query 747 AAAAAGGGCACAAGAAGTATTGCATTCACTCAATAGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 806
|||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GAAAAGGACACAAGAAGTATTGCATTCACTCAGTTGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 834
Query 807 TTTTTAAAGCTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTAGATACGAGGCAACGGG 866
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 835 TTTTTGAAGTTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTGGATAAGAGGCAACGGG 894
Query 867 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAACTTGCTTCGAGGATATAGCAGGTCGGTCTGTCC 926
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 895 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAGCTTGCTTCAAGGATATAGTAGGTCGGTCTGTCC 954
Query 927 ATCCTGGAATCCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATTTGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 986
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TTCCTAGAATTCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATATGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 1014
Query 987 GTTTGCAGCCACCACCATTCCTTTCTTTGCTGTGCAGCCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1046
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GTTTGCAGCCACCACCATTCCAGTCTTTGCTGTGCAGTCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1074
Query 1047 AACGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGTGCGCTGCTGCTGctactactactacta 1106
|| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1075 AAAGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGT--GC-GCTGCTG---CTACTACTACTA 1128
Query 1107 ctactCCACATGGAGCACTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1166
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 CTACTCCACTTGGAGCATTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1188
Query 1167 GAAACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCGG 1226
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1189 GAGACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCTG 1248
Query 1227 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAGGAAGATGGTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1249 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAAGAAGATGGTG 1308
Query 1287 AAGAGTTTGACAAGAACCATTTAGATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1346
|||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 AAGAGTTTCACAAG----A-GT-GATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1362
Query 1347 AGATCAATGCATTGCTGTATTCAgatgatgattatgatgatgatgatgattgtgagagtg 1406
|||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1363 AGATCAATGCATTGCTATATTCAGATGATG---AT--T-ATGATGATGATTGCGAGAGTG 1416
Query 1407 atgatgaAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAACGAGTTTGCAACAAAA 1466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1417 ATGATGAAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAAGGAGTTTGCAACAAAA 1476
Query 1467 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCTTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1526
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1536
Query 1527 ACAGCAGCAACTCATCATCACTTGTGGGCACT-ACGAGTTCCACAAAACTCAATGGATCG 1585
||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1537 ACATCAGCGACTTATCATCACTTGTGGGCACTGA-GAGCTCCACACAACTCAATGGATCT 1595
Query 1586 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAAACATCTGGACCAAAGAAGACACT 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||
Sbjct 1596 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAACCATATCGACCAAAGAGGACACT 1655
Query 1646 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1715
Query 1706 CTCGAGAGCATAGTCCCCGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1765
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CTCGAGAGCGTAGTCCCTGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1775
Query 1766 ATTGATTACCTAAAGTTACTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1825
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 ATTGATTACCTAAAGTTGCTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1835
Query 1826 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGGTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1885
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGCTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1895
Query 1886 CTGCAGACAGATAAGGCATGAAAGATTCTCACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1945
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CTGCAGACAGATAAGGCGTGAAAGATTCTGACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1955
Query 1946 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTATATA 2005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1956 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTAT-TA 2014
Query 2006 TAATATGCTACTGC-AATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2064
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 T-ATATGCTACTGCAAATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2073
Query 2065 TCTGTGTGGAAAGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATCGACAATGATTATCTTTTT 2124
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2074 TCTGTGTGGAATGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATGGACAATGATTATCTTTTT 2133
Query 2125 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGC-AATATTCAAAGTCTCATCCTCAAGCTCG 2183
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2134 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGCAAATATTCAAAGTCTCAT-CTCAAGCTCG 2192
Query 2184 CGTGGTCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATGTCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2243
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 CGTGATCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATATCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2252
Query 2244 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2312
Query 2304 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTCCAACCCACA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2313 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTC-AACCCACA 2371
Query 2364 TGCTACTGGTTTTGTTGTGTCTCG-TTGGTTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2422
|||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 TGCTACTGGTATTGTTGTGTCTCTATTG-TTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2430
Query 2423 ATGG-GTTTTT-GGTTTGTGATAAAAA 2447
|||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2431 ATGGCGTTTTTTGGTTTGTGATAAAAA 2457
> AT5G64343.1 | Symbols: CPuORF38 | conserved peptide upstream
open reading frame 38 | chr5:25730335-25733313 REVERSE LENGTH=2471
Length=2471
Score = 3681 bits (1993), Expect = 0.0
Identities = 2334/2487 (94%), Gaps = 70/2487 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTTTAGAAATATTTCGTaaaaaaaaaaTTCTGCGTTTACACATTATTGCTCGTTGGTCA 60
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 1 TCTTTAGAAATATTTCGT-AAAAAAAAATTCTCCGTTTAGACATTATTGTTCGTTGGTCA 59
Query 61 C-TTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTC---ATAAACCAAAAAAG 116
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 60 CTTTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTCAAAAAAAAACAAAAAAG 119
Query 117 TCTCATCGTTCTCTCTGGATCTGAGCGAAAGATCGTTCCTTTGTAAGCTACTAAAGTA-G 175
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |
Sbjct 120 TCTCATCGTTTTCTCTGGATCTGACCGAAAGATCATTCCTTTCTAAGATACTAAAGTAGG 179
Query 176 ATTGA-TGATCAGAATCAATTAGAGTGTGTATATAAGAAGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 234
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTTGAGTGATCAGAATCAATTAGAGTGTG--TATAAGAGGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 237
Query 235 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGCGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATTCTGT 294
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 238 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGAGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATACTGT 297
Query 295 AAATTGTTTCACCTTTGAACCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCTCTTCTTTGTTCTTATT 354
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||
Sbjct 298 AGATTGTTTCACCTTTGAAGCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCT-TT-TCT-TTCTTATT 354
Query 355 CATCTTCCCTTCGTTTTCGATATATTTTAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTT 414
|||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 CATCTTCCCTTCTTTTTCGGTATATTATAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTC 414
Query 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACT-AAAGCTTACTGTCCTTCCAC-AA 472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||
Sbjct 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACTAAAAGCTCACTCTCCTTCCACAAA 474
Query 473 CAAAAGTTTCCTCC------TTTT-G-----G---------TT---T-AAGATTCCCTCA 507
||||| |||||||| |||| | | || | |||||| |||||
Sbjct 475 CAAAACTTTCCTCCTTTTGGTTTTGGTATCTGTCTACTTTCTTCAATCAAGATTTCCTCA 534
Query 508 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGCATTGAAGTACGAGACAG 567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 535 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGGATTGAAGTACGAGACCG 594
Query 568 GAAACGCTAACAAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 627
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GAAACGCTAACGAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 654
Query 628 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGATA 687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 655 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGACA 714
Query 688 TTTCGCTGCATTTTTCGATCTGGGAtt-tttttCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 746
|||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TTTCGCTGCATTTTTCAATCTGTGATTGTTTTTCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 774
Query 747 AAAAAGGGCACAAGAAGTATTGCATTCACTCAATAGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 806
|||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GAAAAGGACACAAGAAGTATTGCATTCACTCAGTTGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 834
Query 807 TTTTTAAAGCTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTAGATACGAGGCAACGGG 866
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 835 TTTTTGAAGTTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTGGATAAGAGGCAACGGG 894
Query 867 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAACTTGCTTCGAGGATATAGCAGGTCGGTCTGTCC 926
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 895 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAGCTTGCTTCAAGGATATAGTAGGTCGGTCTGTCC 954
Query 927 ATCCTGGAATCCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATTTGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 986
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TTCCTAGAATTCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATATGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 1014
Query 987 GTTTGCAGCCACCACCATTCCTTTCTTTGCTGTGCAGCCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1046
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GTTTGCAGCCACCACCATTCCAGTCTTTGCTGTGCAGTCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1074
Query 1047 AACGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGTGCGCTGCTGCTGctactactactacta 1106
|| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1075 AAAGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGT--GC-GCTGCTG---CTACTACTACTA 1128
Query 1107 ctactCCACATGGAGCACTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1166
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 CTACTCCACTTGGAGCATTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1188
Query 1167 GAAACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCGG 1226
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1189 GAGACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCTG 1248
Query 1227 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAGGAAGATGGTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1249 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAAGAAGATGGTG 1308
Query 1287 AAGAGTTTGACAAGAACCATTTAGATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1346
|||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 AAGAGTTTCACAAG----A-GT-GATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1362
Query 1347 AGATCAATGCATTGCTGTATTCAgatgatgattatgatgatgatgatgattgtgagagtg 1406
|||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1363 AGATCAATGCATTGCTATATTCAGATGATG---AT--T-ATGATGATGATTGCGAGAGTG 1416
Query 1407 atgatgaAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAACGAGTTTGCAACAAAA 1466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1417 ATGATGAAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAAGGAGTTTGCAACAAAA 1476
Query 1467 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCTTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1526
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1536
Query 1527 ACAGCAGCAACTCATCATCACTTGTGGGCACT-ACGAGTTCCACAAAACTCAATGGATCG 1585
||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1537 ACATCAGCGACTTATCATCACTTGTGGGCACTGA-GAGCTCCACACAACTCAATGGATCT 1595
Query 1586 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAAACATCTGGACCAAAGAAGACACT 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||
Sbjct 1596 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAACCATATCGACCAAAGAGGACACT 1655
Query 1646 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1715
Query 1706 CTCGAGAGCATAGTCCCCGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1765
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CTCGAGAGCGTAGTCCCTGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1775
Query 1766 ATTGATTACCTAAAGTTACTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1825
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 ATTGATTACCTAAAGTTGCTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1835
Query 1826 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGGTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1885
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGCTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1895
Query 1886 CTGCAGACAGATAAGGCATGAAAGATTCTCACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1945
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CTGCAGACAGATAAGGCGTGAAAGATTCTGACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1955
Query 1946 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTATATA 2005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1956 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTAT-TA 2014
Query 2006 TAATATGCTACTGC-AATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2064
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 T-ATATGCTACTGCAAATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2073
Query 2065 TCTGTGTGGAAAGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATCGACAATGATTATCTTTTT 2124
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2074 TCTGTGTGGAATGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATGGACAATGATTATCTTTTT 2133
Query 2125 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGC-AATATTCAAAGTCTCATCCTCAAGCTCG 2183
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2134 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGCAAATATTCAAAGTCTCAT-CTCAAGCTCG 2192
Query 2184 CGTGGTCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATGTCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2243
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 CGTGATCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATATCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2252
Query 2244 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2312
Query 2304 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTCCAACCCACA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2313 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTC-AACCCACA 2371
Query 2364 TGCTACTGGTTTTGTTGTGTCTCG-TTGGTTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2422
|||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 TGCTACTGGTATTGTTGTGTCTCTATTG-TTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2430
Query 2423 ATGG-GTTTTT-GGTTTGTGATAAAAA 2447
|||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2431 ATGGCGTTTTTTGGTTTGTGATAAAAA 2457
> AT5G64342.1 | Symbols: CPuORF39 | conserved peptide upstream
open reading frame 39 | chr5:25730335-25733313 REVERSE LENGTH=2471
Length=2471
Score = 3681 bits (1993), Expect = 0.0
Identities = 2334/2487 (94%), Gaps = 70/2487 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTTTAGAAATATTTCGTaaaaaaaaaaTTCTGCGTTTACACATTATTGCTCGTTGGTCA 60
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 1 TCTTTAGAAATATTTCGT-AAAAAAAAATTCTCCGTTTAGACATTATTGTTCGTTGGTCA 59
Query 61 C-TTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTC---ATAAACCAAAAAAG 116
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 60 CTTTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTCAAAAAAAAACAAAAAAG 119
Query 117 TCTCATCGTTCTCTCTGGATCTGAGCGAAAGATCGTTCCTTTGTAAGCTACTAAAGTA-G 175
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |
Sbjct 120 TCTCATCGTTTTCTCTGGATCTGACCGAAAGATCATTCCTTTCTAAGATACTAAAGTAGG 179
Query 176 ATTGA-TGATCAGAATCAATTAGAGTGTGTATATAAGAAGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 234
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTTGAGTGATCAGAATCAATTAGAGTGTG--TATAAGAGGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 237
Query 235 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGCGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATTCTGT 294
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 238 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGAGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATACTGT 297
Query 295 AAATTGTTTCACCTTTGAACCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCTCTTCTTTGTTCTTATT 354
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||
Sbjct 298 AGATTGTTTCACCTTTGAAGCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCT-TT-TCT-TTCTTATT 354
Query 355 CATCTTCCCTTCGTTTTCGATATATTTTAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTT 414
|||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 CATCTTCCCTTCTTTTTCGGTATATTATAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTC 414
Query 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACT-AAAGCTTACTGTCCTTCCAC-AA 472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||
Sbjct 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACTAAAAGCTCACTCTCCTTCCACAAA 474
Query 473 CAAAAGTTTCCTCC------TTTT-G-----G---------TT---T-AAGATTCCCTCA 507
||||| |||||||| |||| | | || | |||||| |||||
Sbjct 475 CAAAACTTTCCTCCTTTTGGTTTTGGTATCTGTCTACTTTCTTCAATCAAGATTTCCTCA 534
Query 508 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGCATTGAAGTACGAGACAG 567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 535 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGGATTGAAGTACGAGACCG 594
Query 568 GAAACGCTAACAAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 627
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GAAACGCTAACGAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 654
Query 628 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGATA 687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 655 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGACA 714
Query 688 TTTCGCTGCATTTTTCGATCTGGGAtt-tttttCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 746
|||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TTTCGCTGCATTTTTCAATCTGTGATTGTTTTTCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 774
Query 747 AAAAAGGGCACAAGAAGTATTGCATTCACTCAATAGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 806
|||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GAAAAGGACACAAGAAGTATTGCATTCACTCAGTTGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 834
Query 807 TTTTTAAAGCTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTAGATACGAGGCAACGGG 866
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 835 TTTTTGAAGTTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTGGATAAGAGGCAACGGG 894
Query 867 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAACTTGCTTCGAGGATATAGCAGGTCGGTCTGTCC 926
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 895 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAGCTTGCTTCAAGGATATAGTAGGTCGGTCTGTCC 954
Query 927 ATCCTGGAATCCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATTTGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 986
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TTCCTAGAATTCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATATGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 1014
Query 987 GTTTGCAGCCACCACCATTCCTTTCTTTGCTGTGCAGCCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1046
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GTTTGCAGCCACCACCATTCCAGTCTTTGCTGTGCAGTCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1074
Query 1047 AACGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGTGCGCTGCTGCTGctactactactacta 1106
|| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1075 AAAGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGT--GC-GCTGCTG---CTACTACTACTA 1128
Query 1107 ctactCCACATGGAGCACTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1166
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 CTACTCCACTTGGAGCATTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1188
Query 1167 GAAACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCGG 1226
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1189 GAGACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCTG 1248
Query 1227 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAGGAAGATGGTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1249 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAAGAAGATGGTG 1308
Query 1287 AAGAGTTTGACAAGAACCATTTAGATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1346
|||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 AAGAGTTTCACAAG----A-GT-GATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1362
Query 1347 AGATCAATGCATTGCTGTATTCAgatgatgattatgatgatgatgatgattgtgagagtg 1406
|||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1363 AGATCAATGCATTGCTATATTCAGATGATG---AT--T-ATGATGATGATTGCGAGAGTG 1416
Query 1407 atgatgaAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAACGAGTTTGCAACAAAA 1466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1417 ATGATGAAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAAGGAGTTTGCAACAAAA 1476
Query 1467 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCTTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1526
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1536
Query 1527 ACAGCAGCAACTCATCATCACTTGTGGGCACT-ACGAGTTCCACAAAACTCAATGGATCG 1585
||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1537 ACATCAGCGACTTATCATCACTTGTGGGCACTGA-GAGCTCCACACAACTCAATGGATCT 1595
Query 1586 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAAACATCTGGACCAAAGAAGACACT 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||
Sbjct 1596 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAACCATATCGACCAAAGAGGACACT 1655
Query 1646 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1715
Query 1706 CTCGAGAGCATAGTCCCCGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1765
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CTCGAGAGCGTAGTCCCTGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1775
Query 1766 ATTGATTACCTAAAGTTACTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1825
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 ATTGATTACCTAAAGTTGCTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1835
Query 1826 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGGTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1885
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGCTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1895
Query 1886 CTGCAGACAGATAAGGCATGAAAGATTCTCACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1945
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CTGCAGACAGATAAGGCGTGAAAGATTCTGACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1955
Query 1946 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTATATA 2005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1956 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTAT-TA 2014
Query 2006 TAATATGCTACTGC-AATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2064
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 T-ATATGCTACTGCAAATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2073
Query 2065 TCTGTGTGGAAAGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATCGACAATGATTATCTTTTT 2124
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2074 TCTGTGTGGAATGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATGGACAATGATTATCTTTTT 2133
Query 2125 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGC-AATATTCAAAGTCTCATCCTCAAGCTCG 2183
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2134 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGCAAATATTCAAAGTCTCAT-CTCAAGCTCG 2192
Query 2184 CGTGGTCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATGTCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2243
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 CGTGATCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATATCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2252
Query 2244 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2312
Query 2304 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTCCAACCCACA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2313 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTC-AACCCACA 2371
Query 2364 TGCTACTGGTTTTGTTGTGTCTCG-TTGGTTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2422
|||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 TGCTACTGGTATTGTTGTGTCTCTATTG-TTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2430
Query 2423 ATGG-GTTTTT-GGTTTGTGATAAAAA 2447
|||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2431 ATGGCGTTTTTTGGTTTGTGATAAAAA 2457
> AT5G64340.1 | Symbols: SAC51 | sequence-specific DNA binding
transcription factors;transcription regulators | chr5:25730335-25733313
REVERSE LENGTH=2471
Length=2471
Score = 3681 bits (1993), Expect = 0.0
Identities = 2334/2487 (94%), Gaps = 70/2487 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TCTTTAGAAATATTTCGTaaaaaaaaaaTTCTGCGTTTACACATTATTGCTCGTTGGTCA 60
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||
Sbjct 1 TCTTTAGAAATATTTCGT-AAAAAAAAATTCTCCGTTTAGACATTATTGTTCGTTGGTCA 59
Query 61 C-TTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTC---ATAAACCAAAAAAG 116
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||
Sbjct 60 CTTTCATCTCTCTTATCCCTTTGCTTTTCCATTGATTCAGCTCAAAAAAAAACAAAAAAG 119
Query 117 TCTCATCGTTCTCTCTGGATCTGAGCGAAAGATCGTTCCTTTGTAAGCTACTAAAGTA-G 175
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |
Sbjct 120 TCTCATCGTTTTCTCTGGATCTGACCGAAAGATCATTCCTTTCTAAGATACTAAAGTAGG 179
Query 176 ATTGA-TGATCAGAATCAATTAGAGTGTGTATATAAGAAGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 234
|||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 180 TTTGAGTGATCAGAATCAATTAGAGTGTG--TATAAGAGGAAGAGAAAGAGAAAACAGCA 237
Query 235 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGCGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATTCTGT 294
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 238 TGTGTATTGCCGTATACCGTAAAGTTTTGAGCTTGAATCTGTATTGCCGTGTGATACTGT 297
Query 295 AAATTGTTTCACCTTTGAACCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCTCTTCTTTGTTCTTATT 354
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||
Sbjct 298 AGATTGTTTCACCTTTGAAGCAACACCTTCAAGAGTCAAATCCT-TT-TCT-TTCTTATT 354
Query 355 CATCTTCCCTTCGTTTTCGATATATTTTAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTT 414
|||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 CATCTTCCCTTCTTTTTCGGTATATTATAAACACTTTTGAAAATGGGATCACAACATTTC 414
Query 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACT-AAAGCTTACTGTCCTTCCAC-AA 472
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||
Sbjct 415 TATGTGTACCATTGTGAACAAAGAATCAGCTAGACTAAAAGCTCACTCTCCTTCCACAAA 474
Query 473 CAAAAGTTTCCTCC------TTTT-G-----G---------TT---T-AAGATTCCCTCA 507
||||| |||||||| |||| | | || | |||||| |||||
Sbjct 475 CAAAACTTTCCTCCTTTTGGTTTTGGTATCTGTCTACTTTCTTCAATCAAGATTTCCTCA 534
Query 508 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGCATTGAAGTACGAGACAG 567
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 535 AAGTTATGGTGTGCCAATCACCTGGTAAGACAAGATTTCGAGGATTGAAGTACGAGACCG 594
Query 568 GAAACGCTAACAAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 627
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 595 GAAACGCTAACGAATCAACAATTGTAGTGAGAGTTATTGAATGCTATCAACCGATGGATA 654
Query 628 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGATA 687
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 655 ATTGCCAGGCTGAGTACTTCAGACTTCTACTCAAACCAGTCACGTAGTTGGTTGGTGACA 714
Query 688 TTTCGCTGCATTTTTCGATCTGGGAtt-tttttCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 746
|||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 TTTCGCTGCATTTTTCAATCTGTGATTGTTTTTCGTTCGTCTTTCTTTTACTATTTTCTC 774
Query 747 AAAAAGGGCACAAGAAGTATTGCATTCACTCAATAGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 806
|||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 GAAAAGGACACAAGAAGTATTGCATTCACTCAGTTGAGCAACTTAACAATCGTGTTGTAC 834
Query 807 TTTTTAAAGCTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTAGATACGAGGCAACGGG 866
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 835 TTTTTGAAGTTCCCTTGAGCTAAACTGCTAAGAGCATGCCTCTGGATAAGAGGCAACGGG 894
Query 867 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAACTTGCTTCGAGGATATAGCAGGTCGGTCTGTCC 926
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 895 ATTTGCCTCTGGGCTTAAGTCCTCAAGCTTGCTTCAAGGATATAGTAGGTCGGTCTGTCC 954
Query 927 ATCCTGGAATCCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATTTGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 986
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 TTCCTAGAATTCCTCTCCCTGAGCTTGGGAAACTATATGCAGCTAAGCTTCAGGCTCGCT 1014
Query 987 GTTTGCAGCCACCACCATTCCTTTCTTTGCTGTGCAGCCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1046
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GTTTGCAGCCACCACCATTCCAGTCTTTGCTGTGCAGTCATGATAAGGAGTCTTATGGAA 1074
Query 1047 AACGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGTGCGCTGCTGCTGctactactactacta 1106
|| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1075 AAAGATTCTCACGGTCTGACATGCGGTCTTGGT--GC-GCTGCTG---CTACTACTACTA 1128
Query 1107 ctactCCACATGGAGCACTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1166
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129 CTACTCCACTTGGAGCATTAGAGTCTTCTCAGAAAAGACTTTTGATATTCGATCAGTCAG 1188
Query 1167 GAAACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCGG 1226
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1189 GAGACCAGACTCGTCTATTACAATGTCCATTTCCTCTACGGTTTCCATCTCATGCGGCTG 1248
Query 1227 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAGGAAGATGGTG 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1249 CAGAACCAGTGAAACTCTCTGAGTTACAAGGTATAGAGAAAGCTTTCAAAGAAGATGGTG 1308
Query 1287 AAGAGTTTGACAAGAACCATTTAGATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1346
|||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 AAGAGTTTCACAAG----A-GT-GATGGAACAGAGTCAGAAATGCATGAAGACACTGAGG 1362
Query 1347 AGATCAATGCATTGCTGTATTCAgatgatgattatgatgatgatgatgattgtgagagtg 1406
|||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||
Sbjct 1363 AGATCAATGCATTGCTATATTCAGATGATG---AT--T-ATGATGATGATTGCGAGAGTG 1416
Query 1407 atgatgaAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAACGAGTTTGCAACAAAA 1466
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1417 ATGATGAAGTAATGAGCACTGGTCACTCTCCTTATCCAAATGAAGGAGTTTGCAACAAAA 1476
Query 1467 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCTTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1526
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GGGAATTAGAAGAAATCGATGGTCCTTGTAAAAGGCAGAAACTACTGGATAAGGTCAACA 1536
Query 1527 ACAGCAGCAACTCATCATCACTTGTGGGCACT-ACGAGTTCCACAAAACTCAATGGATCG 1585
||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 1537 ACATCAGCGACTTATCATCACTTGTGGGCACTGA-GAGCTCCACACAACTCAATGGATCT 1595
Query 1586 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAAACATCTGGACCAAAGAAGACACT 1645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||
Sbjct 1596 TCCTTTCTTAAGGACAAAAAGCTCCCTGAATCAAAAACCATATCGACCAAAGAGGACACT 1655
Query 1646 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 GGTTCTGGTCTGAGCAACGAGCAGTCGAAGAAAGACAAGATCCGCACAGCTCTGAAAATA 1715
Query 1706 CTCGAGAGCATAGTCCCCGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1765
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1716 CTCGAGAGCGTAGTCCCTGGTGCAAAAGGAAACGAAGCGCTCTTACTTCTGGACGAAGCA 1775
Query 1766 ATTGATTACCTAAAGTTACTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1825
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 ATTGATTACCTAAAGTTGCTGAAACGAGACTTAATCTCCACAGAGGTTAAGAACCAAAGC 1835
Query 1826 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGGTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1885
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1836 TCCACCACTCACAAGTCACCAATCTTGTTGCTTAAAGAGACAACATGGGGAACAAGAAAT 1895
Query 1886 CTGCAGACAGATAAGGCATGAAAGATTCTCACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1945
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CTGCAGACAGATAAGGCGTGAAAGATTCTGACGAGTTAAAACGTGTGAAGTGGGTTTTTG 1955
Query 1946 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTATATA 2005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1956 GGTACGTATCCTCTGCACCAGCTTTTTAGCTGTATATAGTGGACTACTTTTAAGTAT-TA 2014
Query 2006 TAATATGCTACTGC-AATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2064
| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015 T-ATATGCTACTGCAAATTTCAAAAAGTTAAAGAAGAAAAGAGGTCACTTTCTTCTTCTC 2073
Query 2065 TCTGTGTGGAAAGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATCGACAATGATTATCTTTTT 2124
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2074 TCTGTGTGGAATGAAAAGCCAAAGTCGTCATGGTCATTGATGGACAATGATTATCTTTTT 2133
Query 2125 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGC-AATATTCAAAGTCTCATCCTCAAGCTCG 2183
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2134 TGGCTGAGTGTGGATGGTGAAATCAAAAGGCAAATATTCAAAGTCTCAT-CTCAAGCTCG 2192
Query 2184 CGTGGTCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATGTCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2243
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193 CGTGATCTATGAATCTCCCCTAAGGTAATAAAATATCTCTGACCCACACACACTCTTTTG 2252
Query 2244 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 TCCATATGATGACTAGATGGGTCCATGATTTTTATGAAATATTGATGTCATGTTCATGTA 2312
Query 2304 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTCCAACCCACA 2363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2313 ATTAATTTGAGTGTCTGTAATAATGCAAACTATTCCTTTGTCTTTTGCTTC-AACCCACA 2371
Query 2364 TGCTACTGGTTTTGTTGTGTCTCG-TTGGTTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2422
|||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2372 TGCTACTGGTATTGTTGTGTCTCTATTG-TTGTATTGTTAAATGGTTTTGTAATAAACAA 2430
Query 2423 ATGG-GTTTTT-GGTTTGTGATAAAAA 2447
|||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 2431 ATGGCGTTTTTTGGTTTGTGATAAAAA 2457
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 121535519445
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5