BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg497034
Length=4068
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G65930.3 | Symbols: ZWI | kinesin-like calmodulin-binding pr... 6682 0.0
> AT5G65930.3 | Symbols: ZWI | kinesin-like calmodulin-binding
protein (ZWICHEL) | chr5:26369857-26376447 REVERSE LENGTH=4109
Length=4109
Score = 6682 bits (3618), Expect = 0.0
Identities = 3894/4025 (97%), Gaps = 27/4025 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 66 TCT-GGGCAAATTTGTGCTTTCAGA--T-CTACAATCTCTCTTTTTTCTTCGGACATGGA 121
||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1 TCTGGGGCAAATTTGTTC-ATCAGATCTACTACAATCTCTC-TTTTTCTTCGGGTATGGA 58
Query 122 GGGCCAACGAGGCAGTAATTCTTCGTTGAGCTCCGGCAATGGCACCGAAGTCGCCACCGA 181
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 GGGCCAACGAGGCAGTAATTCTTCGTTGAGCTCTGGCAATGGCACCGAAGTCGCCACCGA 118
Query 182 CGTTTCTTCTTGCTTTTATGTTCCCAACCCCACTGGGACCGATTTCGATGCCGAGTCG-- 239
||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 119 CGTTTCTTCTTGCTTCTATGTTCCCAATCCCTCTGGAACCGATTTCGATGCCGAGTCGTC 178
Query 240 ---TC-T--T-CTCTTC-CTC-CTC--T-----CTCCCCAGCTCCTCAAGTGGCGTTGTC 283
|| | | |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 179 TTCTCTTCCTCCTCTTCTCTCGCTCTGTCACAGCTCCCCAGCTCCTCAAGTGGCATTGTC 238
Query 284 AATTCCTGCCGAGCTTGCTGCCGCCATTCCCCTCATCGATCGCTTCCAGGTTGAAGCTTT 343
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239 AATTCCTGCGGAGCTTGCCGCCGCCATTCCCCTCATCGATCGCTTCCAGGTTGAAGCTTT 298
Query 344 TCTTCGGCTTATGCAGAAGCAAATCCAGTCTGCTGGCAAGCGTGGCTTCTTCTATTCTAA 403
||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 299 TCTGCGGCTAATGCAGAAACAAATCCAGTCTGCTGGGAAGCGTGGCTTCTTCTATTCCAA 358
Query 404 AAAGTCCTCTGGCTCCAATGTCCGCGAGCGCTTCACATTTGAGGATATGCTTTGCTTTCA 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AAAGTCCTCTGGCTCCAATGTCCGCGAGCGCTTCACATTTGAGGATATGCTTTGCTTTCA 418
Query 464 GAAGGATCCCATCCCCACATCTCTCCTCAAGATTAACAGCGATCTCGTCAGCCGTGCTAC 523
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 AAAGGATCCAATCCCCACATCTCTCCTCAAGATTAACAGCGATCTCGTCAGCCGTGCTAC 478
Query 524 CAAGTTGTTTCACCTCATCTTAAAATATATGGGTGTTGATTCATCTGACCGATCAACGCC 583
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 479 CAAGTTGTTTCATCTCATCTTAAAATATATGGGTGTTGATTCATCTGATCGATCTACGCC 538
Query 584 ACCCAGTTTAGATGAACGCATTGACCTCGTTGGAAAGCTCTTCaaaaaaaCTTTGAAGCG 643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 539 TCCCAGTTTAGATGAACGCATTGACCTCGTTGGAAAGCTCTTCAAAAAAACTTTGAAGCG 598
Query 644 TGTTGAACTCAGGGACGAACTTTTTGCCCAAATCTCCAAACAGACTAGACATAATCCTGA 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 599 TGTTGAACTCAGGGACGAACTTTTTGCCCAAATCTCCAAACAGACTAGACATAATCCTGA 658
Query 704 CAGGCAATACTTGATAAAAGCTTGGGAGTTGATGTACTTATGTGCGTCCTCAATGCCTCC 763
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 659 CAGGCAATACTTGATCAAAGCTTGGGAATTGATGTACTTATGTGCCTCCTCTATGCCTCC 718
Query 764 TAGCAAAGATATTGGTGGATATCTCTCTGAATATATTCATAATGTGGCACACGATGCAAC 823
|||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 719 TAGCAAAGATATCGGTGGATATCTATCTGAGTATATTCATAATGTCGCACACGATGCAAC 778
Query 824 AATTGAACCGGATGCTCAGGTTCTTGCTGTCAACACTTTGAAGGCTTTAAAGCGCTCTAT 883
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 779 TATTGAACCGGATGCTCAGGTTCTTGCTGTTAACACTTTGAAAGCTTTAAAGCGCTCTAT 838
Query 884 CAAAGCTGGTCCTAGGCACACCACTCCTGGTCGTGAAGAAATTGAAGCCCTTTTGACCGG 943
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 CAAAGCTGGTCCTAGGCACACCACACCTGGTCGTGAAGAAATTGAAGCCCTTTTGACCGG 898
Query 944 TAGAAAGCTCACAACCATTGTCTTCTTTCTGGATGAAACTTTTGAAGAAATATCATATGA 1003
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 899 TAGAAAGCTCACAACCATTGTCTTCTTTCTCGATGAAACTTTTGAAGAAATTTCATATGA 958
Query 1004 CATGGCTACAACAGTGTCTGATGCTGTTGAGGAGCTAGCTGGAACAATTAAACTATCAGC 1063
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CATGGCTACCACAGTGTCTGATGCTGTTGAGGAGCTAGCTGGAACAATTAAACTATCAGC 1018
Query 1064 TTTCTCTAGCTTTAGTTTGTTTGAATGTCGTAAAGTTGTTTCAAGTTCAAAATCATCTGA 1123
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1019 TTTCTCTAGCTTTAGTTTGTTTGAATGTCGTAAAGTTGTTTCAAGTTCTAAATCATCTGA 1078
Query 1124 TCCCGGAAATGAGGAATATATAGGATTGGATGATAACAAGTATATTGGAGATCTCCTCGC 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TCCCGGAAATGAGGAATATATAGGATTGGATGATAACAAGTATATTGGAGATCTCCTCGC 1138
Query 1184 AGAATTTAAAGCTATAAAAGATCGAAATAAAGGAGAGATACTACACTGCAAACTGGTATT 1243
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139 AGAATTTAAAGCTATTAAAGATCGAAATAAAGGAGAGATACTACACTGCAAACTGGTATT 1198
Query 1244 TaaaaaaaaaTTATTCCGAGAGTCTGATGAAGCTGTAACAGATCTGATGTTTGTGCAACT 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 TAAAAAAAAATTATTCCGAGAGTCTGATGAAGCTGTAACAGATCTGATGTTTGTGCAACT 1258
Query 1304 TTCCTATGTTCAACTGCAACATGACTATTTGCTAGGAAACTATCCTGTCGGGAGGGACGA 1363
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1259 TTCGTATGTTCAACTGCAACATGACTATTTGCTAGGAAACTATCCTGTTGGGAGGGACGA 1318
Query 1364 TGCTGCACAACTTTGTGCCTTGCAAATTCTAGTTGGGATTGGGTTTGTCAATAGTCCAGA 1423
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TGCTGCACAGCTTTGTGCCTTGCAAATTCTTGTTGGGATTGGGTTTGTCAATAGTCCAGA 1378
Query 1424 GTCATGCATTGATTGGACATCACTTCTTGAGCGGTTTTTGCCGAGACAAATAGCAATAAC 1483
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1379 GTCATGCATTGATTGGACATCACTTCTTGAGCGGTTTTTGCCAAGACAAATAGCAATAAC 1438
Query 1484 CCGAGCAAAGCGTGAATGGGAATTGGATATCCTTGCTCGCTACCGTTCAATGGAGAACGT 1543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 CCGAGCAAAGCGTGAATGGGAATTGGATATCCTTGCTCGCTACCGTTCAATGGAGAACGT 1498
Query 1544 GACCAAAGATGATGCTAGACAACAATTTCTACGGATACTGAAGGCACTGCCATACGGGAA 1603
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GACCAAAGATGATGCAAGACAACAATTTCTACGGATACTGAAGGCACTGCCATACGGGAA 1558
Query 1604 TTCAGTGTTTTTTAGCGTACGCAAGATAGATGATCCGATCGGTCTTTTACCTGGGCGAAT 1663
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 TTCAGTTTTTTTTAGCGTACGCAAGATAGATGATCCGATCGGTCTTTTACCTGGGCGAAT 1618
Query 1664 CATTTTGGGTATCAACAAACGTGGGGTTCACTTTTTTCGGCCGGTTCCGAAAGAATATCT 1723
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 1619 CATTTTGGGTATCAACAAACGTGGGGTTCACTTTTTTCGACCGGTTCCTAAAGAATATCT 1678
Query 1724 GCACTCTGCTGAACTACGTGACATAATGCAATTTGGCAGCAGTAACACTGCTGTCTTTTT 1783
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 GCACTCTGCTGAACTACGTGACATCATGCAATTTGGCAGCAGTAACACTGCTGTCTTTTT 1738
Query 1784 CAAAATGAGAGTCGCTGGTGTTCTTCACATATTTCAGTTCGAGACAAAACAGGGAGAAGA 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 CAAAATGAGAGTCGCTGGTGTTCTTCACATATTTCAGTTCGAGACAAAACAGGGAGAAGA 1798
Query 1844 AATATGTGTTGCTTTGCAAACACATATAAATGATGTCATGTTGCGTCGTTACTCCAAAGC 1903
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 AATTTGTGTTGCTTTGCAAACACATATAAATGATGTCATGTTGCGTCGTTACTCCAAAGC 1858
Query 1904 TCGATCTGCTGCCAATAGCTTGGTTAATGGAGATATATCTTGTAGTTCTAAGCCGCAGAA 1963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1859 TCGATCTGCTGCCAATAGCTTGGTTAATGGAGATATATCTTGTAGTTCTAAGCCGCAAAA 1918
Query 1964 TTTTGAAGTGTATGAAAAACGTTTGCAAGATTTGTCTAAGGCTTATGAAGAGTCCCAAAA 2023
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 TTTTGAAGTGTATGAAAAACGTTTGCAAGATTTGTCTAAGGCTTATGAAGAGTCCCAAAA 1978
Query 2024 GAAGATTGACAAGTTGATGGATGAACAACAAGAGAAAAATCAGCAAGAAGTTACTCTGCG 2083
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1979 GAAGATTGAGAAGTTGATGGATGAACAACAAGAGAAAAATCAGCAAGAAGTTACTCTGCG 2038
Query 2084 TGAAGAATTAGAAGCTATACACAATGGTTTGGAGCTTGAAAGGAAAAAATTGTTGGAGGT 2143
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2039 TGAAGAGTTAGAAGCTATACACAATGGTTTGGAGCTTGAAAGGAGAAAATTGTTGGAGGT 2098
Query 2144 TACCTTAGACCGAGATAAACTTAGGTCATTGTGTGACGAGAAGGGAACAACTATTCAAAC 2203
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2099 TACTTTAGACCGAGATAAACTTAGGTCATTGTGTGACGAGAAGGGAACAACTATTCAATC 2158
Query 2204 CTTGATGTCTGAACTGCGAGGAATGGAAGCCAGGTTGGCAAAGTCGGGCAACACAAAATC 2263
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2159 CTTGATGTCTGAACTGCGAGGAATGGAAGCAAGGTTGGCAAAGTCGGGCAACACAAAATC 2218
Query 2264 AAGTAAAGAGACAAAATCAGAATTAGCTGAAATGAATAATCAGATATTATACAAGATCCA 2323
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 AAGTAAAGAGACAAAATCAGAATTAGCCGAAATGAATAATCAGATATTATACAAGATCCA 2278
Query 2324 AAAGGAGTTAGAAGTTCGAAATAAGGAATTGCATGTTGCAGTTGATAATTCAAAGAGGTT 2383
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 AAAGGAGTTAGAAGTTCGAAATAAGGAATTGCATGTCGCAGTTGATAATTCAAAGAGGTT 2338
Query 2384 GTTGAGTGAAAACAAGATATTGGAGCAAAGTATTTTCAATATCgaaaagaagaaaaaaga 2443
||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2339 GTTGAGTGAAAACAAGATATTGGAGCAAA--A-TCTCAATATTGAAAAGAAGAAAAAAGA 2395
Query 2444 ggaggttgaaattcatcaaaagagatatgaacaagaaagaaagGTGTTAAAGCTTCGAGT 2503
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2396 GGAGGTTGAAATTCATCAAAAGAGATATGAACAAGAAAAAAAGGTGTTAAAGCTTCGAGT 2455
Query 2504 TTCTGAACTTGAAAATAAGCTTGAAGTCCTTGCTCAAGACTTGGATAGTGCTGAGTCTAC 2563
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2456 TTCTGAACTTGAAAATAAGCTTGAAGTACTTGCTCAAGACTTGGATAGTGCTGAGTCTAC 2515
Query 2564 GATTGAAAGTAAGAATTCTGACATGCTGCTGTTGCAAAATAACTTGAAAGAACTTGAGGA 2623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 GATTGAAAGTAAGAATTCTGACATGCTGCTGTTGCAAAATAACTTGAAAGAACTTGAGGA 2575
Query 2624 GTTAAGAGAAATGAAAGAGGACATTGACCGAAAGAATGAGCAAACAGCTGCCATTTTGAA 2683
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2576 GTTAAGAGAAATGAAAGAGGACATTGACAGAAAAAATGAGCAAACAGCTGCCATTTTGAA 2635
Query 2684 GATGCAGGGAGCCCAACTTGCTGAGCTAGAAATACTTTATAAGGAAGAACAAGTTTTAAG 2743
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 AATGCAAGGAGCCCAACTTGCTGAGCTAGAAATACTTTATAAGGAAGAACAAGTTTTAAG 2695
Query 2744 GAAAAGATACTATAATACCATAGAAGATATGAAAGGGAAGATTAGAGTTTATTGTCGAAT 2803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696 GAAAAGATACTATAATACCATAGAAGATATGAAAGGGAAGATTAGAGTTTATTGTCGAAT 2755
Query 2804 AAGACCTCTAAATGAAAAAGAGAGTTCAGAGAGAGAAAAACAAATGCTGACAACTGTGGA 2863
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2756 AAGACCTCTAAATGAAAAAGAGAGTTCAGAGAGGGAAAAACAAATGCTGACAACTGTGGA 2815
Query 2864 TGAGTTTACAGTTGAACATCCATGGAAAGACGACAAAAGAAAGCAACATATATATGATCG 2923
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2816 TGAGTTTACTGTTGAACATCCATGGAAAGACGACAAAAGAAAGCAACACATATATGATCG 2875
Query 2924 CGTATTTGATATGCGTGCTAGTCAAGATGATATCTTTGAAGACACAAAGTATTTGGTGCA 2983
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2876 CGTATTTGACATGCGTGCTAGTCAAGATGATATCTTTGAAGACACAAAGTATTTGGTACA 2935
Query 2984 GTCGGCTGTAGATGGGTATAACGTTTGCATCTTCGCATATGGTCAAACTGGTTCTGGAAA 3043
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2936 GTCGGCTGTAGATGGGTATAACGTTTGCATCTTTGCATATGGTCAAACTGGTTCTGGAAA 2995
Query 3044 AACTTTCACTATATATGGGCATGAGAGCAATCCTGGACTCACACCTCGAGCTACAAAGGA 3103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996 AACTTTCACTATATATGGGCATGAGAGCAATCCTGGACTCACACCTCGAGCTACAAAGGA 3055
Query 3104 ACTGTTCAACATATTAAAGAGAGATAGCAAGAGATTTTCATTTTCTCTAAAGGCATATAT 3163
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3056 ACTGTTCAACATATTAAAGCGAGATAGCAAGAGATTTTCATTTTCTCTAAAGGCATATAT 3115
Query 3164 GGTGGAACTTTATCAAGACACACTTGTAGACCTTTTGTTACCAAAGAGTGCAAGACGCCT 3223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 3116 GGTGGAACTTTATCAAGACACACTTGTAGACCTTTTGTTACCAAAAAGTGCAAGACGCTT 3175
Query 3224 GAAGCTAGAGATTAAAAAAGATTCAAAGGGAATGGTCTTTGTAGAGAATGTGACAACTAT 3283
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 GAAACTAGAGATTAAAAAAGATTCAAAGGGAATGGTCTTTGTAGAGAATGTGACAACTAT 3235
Query 3284 TCCTATATCAACTTTGGAGGAATTGCGAATGATTATTGAACGAGGATCAGAACGACGACA 3343
|||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||
Sbjct 3236 TCCTATATCAACTTTGGAGGAACTGCGAATGATTCTTGAACGGGGATCGGAACGACGACA 3295
Query 3344 TGTTTCTGGAACAAATATGAATGAAGAAAGCTCAAGATCTCACCTCATACTATCGGTTGT 3403
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 3296 TGTTTCTGGAACAAATATGAATGAAGAAAGCTCAAGATCTCACCTCATATTATCAGTTGT 3355
Query 3404 TATTGAAAGTATTGATCTTCAAACACAGTCTGCTGCGAGGGGCAAGTTGAGTTTTGTGGA 3463
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3356 TATTGAAAGTATTGATCTTCAAACCCAGTCTGCTGCGAGGGGCAAGCTGAGTTTTGTGGA 3415
Query 3464 TCTTGCTGGTTCTGAGAGAGTAAAAAAGTCGGGCTCTGCTGGTTGTCAACTCAAAGAAGC 3523
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 TCTTGCTGGTTCTGAGAGAGTTAAAAAGTCGGGCTCAGCTGGTTGTCAACTCAAAGAAGC 3475
Query 3524 TCAAAGTATCAACAAATCACTTTCTGCATTAGGTGATGTTATTGGTGCTTTATCTTCAGG 3583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3476 TCAAAGTATCAACAAATCACTTTCTGCATTAGGTGATGTTATTGGTGCTTTATCTTCTGG 3535
Query 3584 CAACCAACATATTCCTTATAGGAATCACAAGCTAACAATGTTGATGAGCGATTCATTGGG 3643
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3536 CAACCAGCATATTCCTTATAGGAATCACAAGCTAACGATGTTGATGAGCGATTCATTGGG 3595
Query 3644 CGGCAATGCCAAGACGTTAATGTTTGTTAATGTGTCTCCAGCCGAATCAAATTTGGACGA 3703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3596 CGGCAATGCCAAGACGTTAATGTTTGTTAATGTGTCTCCAGCCGAATCAAATTTGGACGA 3655
Query 3704 GACGTACAATTCTCTTATATATGCATCGAGAGTGAGAACGATCGTGAATGATCCCAGCAA 3763
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3656 GACGTACAATTCTCTTCTATATGCATCGAGAGTGAGAACGATCGTGAATGATCCCAGCAA 3715
Query 3764 ACATATATCATCCAAAGAGATGGTGCGATTGAAGAAGTTGGTAGCATACTGGAAAGAGCA 3823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3716 ACATATATCATCCAAAGAGATGGTGCGATTGAAGAAGTTGGTAGCATACTGGAAAGAGCA 3775
Query 3824 AGCCGGTAAAAAAGGTGAAGAAGAAGACTTGGTGGATATTGAGGAAGATCGTACACGAAA 3883
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3776 AGCCGGTAAAAAAGGTGAGGAAGAAGACTTGGTGGATATTGAGGAAGATCGTACACGAAA 3835
Query 3884 AGATGAGGCAGATAGTTGAAGAAAGCTGACATGGAATTCGTGTAGGTGAAATTGAGACTA 3943
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3836 AGATGAGGCAGATAGTTGAAGAAAGCTGACATGAAATTCGTCTAGGTGAAATTGAGACTA 3895
Query 3944 TAGAAGCACTGATTTTCACCATTCTTTTTGTAGGAAGTTCCTACTCTATAGTAGACTTTC 4003
||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||
Sbjct 3896 TAGTATCACTGGTTTTCACCATTCTTTTTGTAGGAAGTTCCTGCTTTATAGTAGAGTTTC 3955
Query 4004 TATCGAAGAGTAATGCTATATGTCTCAAACTTTATCTCTTTTGATGAGATCTTCATTACA 4063
|||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3956 TATCGAAGAGTAGTCCTATATGTCTCAAACTTTCTCTCTTTTGATGAGATCTTCATTACA 4015
Query 4064 AGAAA 4068
|||||
Sbjct 4016 AGAAA 4020
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 202724616663
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5