BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg888834
Length=6444
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G32700.2 | Symbols: | helicases;ATP-dependent helicases;nuc... 1.070e+04 0.0
> AT4G32700.2 | Symbols: | helicases;ATP-dependent helicases;nucleic
acid binding;ATP binding;DNA-directed DNA polymerases;DNA
binding | chr4:15767317-15779697 FORWARD LENGTH=7100
Length=7100
Score = 1.070e+04 bits (5794), Expect = 0.0
Identities = 6251/6471 (97%), Gaps = 33/6471 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGACTCAGATTCCTCGAAATCGCGGATTGATCAGTTTTATGTATCAAAGAAGAGGAAA 60
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 124 ATGGACTCAGATTCTTCTAAATCGCGGATTGATCAGTTTTATGTATCGAAGAAGAGGAAA 183
Query 61 CACCAGTCACCAAATTTGAAA-TCTGGGAGAAATGAGAAAAATGTGAAGGTGACAGGAGA 119
||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 184 CACCAGTCACCAAATTT-AAAGTCTGGGAGGAATGAGAAAAATGTGAAGGTGACAGGGGA 242
Query 120 AAGATCTCCTGGAGACAAAGGCACTTTGGACAATTACTTGAAAGCCTCTCTGGATGACAA 179
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 243 AAGATCTCCTGGAGACAAAGGCACTTTGGACAGTTACTTGAAAGCCTCTCTGGATGACAA 302
Query 180 GAGCACTACCAATAGTGGGTTGCAGGCAAGGCAGGAGGCGTTTACAAGAAAATTGGATTT 239
||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 303 GAGTACTACCAATAGTGGGTTGCAGGCAAGGCAGGAAGCGTTTACAAGAAAATTGGATTT 362
Query 240 GGAGGTTTCTGCTTCGTCTGTTGGTGAAAATATAAACCCCTGCCTGCCTAAACCTGTAAC 299
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 363 GGAGGTTTCTGCTTCGTCTGTTGGTCAAAATATACACCCTTGCCTGCCTAAACCTGTAAG 422
Query 300 TATTGCAACTTTTAAAGAGTGTTTGGACCAGAACGGATCTCGAGATTTGCATAAAGAAGG 359
| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 423 TTTTGCAACTTTTAAGGAGTGTTTGGGCCAGAACGGATCTCAAGATTTGCATAAAGAAGG 482
Query 360 TGTTGCAGCTGAAGCTCATGCAACAGATGGTTTGCACTGTGCTAACCAGAAAGATAATTC 419
||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 TGTTGCAGCTGAAACTCATGCTACAGATGGTTTACTCTGTGCTAACCAGAAAGATAATTC 542
Query 420 AGAACTAAGAGACTTTGCCACTAGTTTCTTGTCCTTGTATTGTAGTGGTTTGCAGTCTGT 479
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 543 AGAACTACGAGACTTTGCCACTAGTTTCTTGTCCTTGTATTGTAGTGGAGTGCAGTCTGT 602
Query 480 TGTTGGCTCACCTCCACATCAGAAGGCAAATGAACTGAAGCGTCGAAGCAGTTCATCATC 539
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603 TGTTGGCTCACCTCCACATCAGAAGGAAAATGAATTGAAGCGTCGAAGCAGTTCATCATC 662
Query 540 ACTTGCCCAAGATATACAAAGTTCTCACAAGAGGCGTTGTGAGTCCGAAAATATACCATC 599
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 ACTTGCCCAAGATATACAAATTTCTCACAAGAGGCGTTGTGAGTCCGAAAATATACCATC 722
Query 600 ACTAGATGATCTTGCAAATCCTCTCGGGAGTAAGCCTGAATCACTCGCTAGGAATGGTGA 659
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 723 ACTAGATGATCTTACAAATCCTCTCGGGAGTAAGCCTGAATCACTCGCTAGGAATGGTAA 782
Query 660 TAATAGAGATAAATCTGTTTCAGACCATACAAAGAAGATGCCGAGCAATGAATATGTTGA 719
||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 783 TAATAGAGATAAACCTGTTTCAGACCCTACAAAGAAGATGCCGAGCAATGAATCTGTTGA 842
Query 720 AATTCCAATGGGCTTGAGGAAGTGTAGTAAGGCGCCAGAATCATCTGCTCATCTAACTGA 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 843 AATTCCAATGGGCTTGAGGAAGTGTAGTAAGGCGCCAGAATCATCTGCTCATCTAACTGA 902
Query 780 ATTCCACACGCCTGGATCAGCCATTAAATCATGTCCTGTTGGAACCCCTAAGTCAGGAAG 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 903 ATTCCACACGCCTGGATCAGCCATTAAATCATGTCCTGTTGGAACCCCTAAGTCAGGATG 962
Query 840 TGGTAGCTCAATGTTCTCACCTGGTGATTCTTTCTGGAATGAAGCAATTCAAGTTGCTGA 899
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGTAGCTCAATGTTCTCACCTGGTGAGGCTTTCTGGAATGAAGCAATTCAAGTTGCTGA 1022
Query 900 TGGTTTGACAATTCCAATTGAGAACTCTGGTTCCGTAAAAGTTAAAGATGGAGATCAACA 959
||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||
Sbjct 1023 TGGTTTGACAATTCCAATTGAAAATTTTGGTTCTGTAGAAGCTAAAGTTAGAGATCAACA 1082
Query 960 TGGAACTATTCTTTCATGCAGCAACAAAACAGATAAATGCAATGAAATGTTAAAGAGGAG 1019
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||
Sbjct 1083 TGTAACTATTCTTTCATGCAGCAAGAAAACAGATAAATGCACTGAAAAGTTAGAGAGGAG 1142
Query 1020 TTTAGATTTAGATGAAAGCAGAGTAAACGATAAAGATGCCATTGGTTTTTCAAAGGTCTT 1079
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1143 TTTAGATTTAGATGAAATCAGAGTAAAGGATAAAGATGCCATTGGTTTTTCAAAGGTAGT 1202
Query 1080 GGAGAAGCATGGGAGAGACTTTAATAAAGAAGTATCTCCGCTTCCTGTCAAGAATCTTGA 1139
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 1203 GGAGAAGCATGGGAGAGATTTTAATAAAGAAGTATATCAGCTTCCTGTCAAGAATCTTGA 1262
Query 1140 ACTTTTGTTTCAAGATAAGAACATTAATGGAGGTCTTCGAGAGCAATGTGCTTCATTTGA 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||
Sbjct 1263 ACTTTTGTTTCAAGATAAGAACATTAATGGAGGTATTCAAGAGCGATGTGCTTCATTTGA 1322
Query 1200 TCAAAATAACATTACTCTAGGAAGCAGTAGGATCTCTGAATCTGCTTTCGTCGATAATAA 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1323 TCAAAATAACATTACTCTAGGAAGCAGTAGGATCTCTGAATCTGCTTTCGTCGGTAATAA 1382
Query 1260 AGGATGTGAAACTCTTGATATTGTAAAT--T-CTCAGGCAGATAAAGGTTTGATAGGCAA 1316
||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1383 AGGATGTGAAAATCTTGATATTGCAAATAATGCTCAGGCAGATAAAGGTTTGATAGGCAA 1442
Query 1317 GATGTATCCAGAACCCGAAGGAAAGAAAGTTTTACTGTGCGAGGAAAATCGTGGTGTAAG 1376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1443 GATGTATCCAGAACCCGAAGGAAAGAAAGTTTTACTGTGTGAGGAAAATCGTGGTGTAAG 1502
Query 1377 ATCTGTTTCTATGGTAAGCAACATGAGGAAACCAGTTGATTCTAGTGAATCTGAAGAAAG 1436
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 1503 ATCTGTTTCTATGATAAGCAACATGAGGAAACCAGTTGGTTCTAGTGAATCCGAAGAAAG 1562
Query 1437 TCATACTCCTTCAAGCTCTCACCGTAATTACGATGGTTTGATTCTCAGCACTTGGCTTCC 1496
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1563 TCATACTCCTTCAAGCTCTCATCGTAATTACGATGGCTTGAGTCTCAGCACTTGGCTTCC 1622
Query 1497 CTCAGAAGTTTGTAGTGTATACAATAAGAAAGGAATATCCAAACTCTATCCTTGGCAGGT 1556
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 CTCAGAAGTTTGCAGTGTATACAATAAGAAAGGAATATCTAAACTCTATCCTTGGCAGGT 1682
Query 1557 CGAGTGTCTTCAGGTAGATGGTGTTTTGCAGAAAAGGAATCTAGTATATTGTGCTTCTAC 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 CGAGTGTCTTCAGGTAGATGGTGTTTTGCAGAAAAGGAATCTAGTATATTGTGCTTCTAC 1742
Query 1617 TAGTGCTGGTAAAAGTTTTGTTGCAGAAGTCTTGATGCTGCGCCGGGTCATAACAACTGG 1676
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1743 AAGTGCTGGTAAAAGTTTTGTTGCAGAAGTCTTGATGCTGCGCCGGGTCATAAGAACTGG 1802
Query 1677 AAAAATGGCATTGCTTGTGCTACCTTATGTATCCATTTGTGCCGAGAAGGCGGAACACCT 1736
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 AAAAATGGCATTGCTTGTACTACCTTATGTATCCATTTGTGCCGAGAAGGCGGAACACCT 1862
Query 1737 TGAGGTCCTTCTTGAACCACTTGGTAAGCATGTTCGTAGTTACTATGGAAATCAGGGTGG 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1863 TGAGGTCCTTCTTGAACCACTTGGTAAGCATGTTCGTAGTTACTATGGAAATCAGGGTGG 1922
Query 1797 TGGAACACTTCCTAAAGGCACTTCTGTGGCTGTCTGCACGATTGAGAAGGCAAACTCTTT 1856
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923 TGGAACACTTCCTAAAGACACTTCTGTGGCTGTCTGCACGATTGAGAAGGCAAACTCTTT 1982
Query 1857 GATAAATCGCTTGCTCGAAGAGGGTCGTTTGTCAGAACTTGGGATAATAGTTATAGATGA 1916
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1983 GATAAATCGCTTGCTTGAAGAGGGTCGTTTGTCAGAACTTGGAATAATAGTTATAGATGA 2042
Query 1917 GCTACATATGGTGGGTGACCAGCATAGGGGTTATCTTTTGGAACTTATGTTGACGAAACT 1976
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043 GCTACATATGGTGGGTGACCAACATAGGGGTTATCTTCTGGAACTTATGTTGACGAAACT 2102
Query 1977 TCGTTATGCTGCTGGTGAAGGCAGTTCAGAATCAAGTAGTGGTGAGAGTTCAGGGAATAG 2036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2103 TCGTTATGCTGCTGGTGAAGGCAGTTCAGAATCAAGTAGTGGTGAGAGTTCAGGGACTAG 2162
Query 2037 CAGTGGCAAGGCTGATCCTGCTCATGGCCTACAAATTGTGGGTATGAGTGCTACAATGCC 2096
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163 CAGTGGCAAAGCTGATCCTGCTCATGGCCTACAAATTGTGGGTATGAGTGCTACAATGCC 2222
Query 2097 GAATGTTGGCGCAGTTGCTGACTGGCTTCAAGCAGCTTTATATCAAACAGAGTTTCGACC 2156
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2223 AAATGTTGGCGCAGTTGCTGACTGGCTTCAAGCAGCTTTATATCAGACAGAGTTTCGACC 2282
Query 2157 AGTTCCACTAGAGGAGTATATTAAAGTTGGTAGCACCATTTACAATAAAAAGATGGAAGT 2216
|||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 AGTTCCCCTGGAGGAGTATATTAAAGTAGGTAGCACCATTTACAATAAAAAGATGGAAGT 2342
Query 2217 TGTGAGGACTATACCAAAAGCTGCTGATATGGGAGGGAAAGACCCAGACCATATAGTTGA 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2343 TGTGAGGACTATACCAAAAGCTGCTGATATGGGAGGGAAAGACCCGGACCATATAGTTGA 2402
Query 2277 GCTTTGTAACGAGGTTGTTCAAGAGGGCAATTCAGTGCTGATATTTTGCTCGAGTCGAAA 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2403 GCTTTGTAACGAGGTTGTTCAAGAGGGCAATTCAGTGCTGATATTTTGCTCGAGTCGAAA 2462
Query 2337 AGGATGTGAATCAACTGCTAGGCATATTTCAAAGCTCATTAAAAAAGTTCCCGTAGACAT 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
Sbjct 2463 AGGATGTGAATCAACTGCTAGGCATATTTCAAAGCTCATTAAAAATGTTCCCGTAAACGT 2522
Query 2397 TGATGGTGAAAATAGTGAGTTTATGGATATCAGATCTGCTATTGATGCCCTGCGAAGGTC 2456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2523 TGATGGTGAAAATAGTGAGTTTATGGATATCAGATCTGCTATTGATGCCCTGCGAAGGTC 2582
Query 2457 TCCGTCTGGAGTAGATCCTGTACTAGAAGAAACTCTTCCCTCTGGAGTTGCCTATCACCA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2583 TCCGTCTGGAGTAGATCCTGTACTAGAAGAAACTCTTCCCTCTGGGGTTGCCTATCACCA 2642
Query 2517 TGCTGGTCTTACAGTAGAAGAAAGAGAGATAGTTGAGACCTGTTACCGTAAGGGTCTCGT 2576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2643 TGCTGGTCTTACAGTAGAAGAAAGAGAGATAGTTGAGACCTGTTACCGTAAGGGTCTTGT 2702
Query 2577 ACGTGTCTTAACAGCTACATCCACTTTGGCGGCTGGGGTTAACCTGCCTGCAAGGAGGGT 2636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2703 ACGTGTCTTAACAGCTACATCCACTTTGGCGGCTGGGGTTAACCTGCCTGCAAGGAGGGT 2762
Query 2637 TATTTTTCGACAACCAATGATTGGCCGTGATTTTATTGATGGAACAAGGTACAAGCAAAT 2696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2763 TATTTTTCGACAACCAATGATTGGCCGTGATTTTATTGATGGAACAAGGTACAAGCAAAT 2822
Query 2697 GTCTGGTCGAGCTGGGCGGACTGGGATTGATACAAAAGGAGAAAGTGTTTTGATTTGCAA 2756
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2823 GTCTGGTCGAGCTGGGCGAACTGGGATTGATACAAAAGGAGATAGTGTTTTGATTTGCAA 2882
Query 2757 ACCTGGAGAACTCAAGCGAATAATGGCACTTCTTAATGAAACCTGCCCACCATTGCAGTC 2816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883 ACCTGGAGAACTCAAGCGAATAATGGCACTTCTTAATGAAACCTGCCCACCATTGCAGTC 2942
Query 2817 TTGTTTATCTGAGGATAAAAATGGAATGACTCATGCGATACTAGAAGTTGTGGCAGGTGG 2876
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2943 TTGTTTATCTGAGGATAAAAATGGAATGACTCATGCAATACTAGAAGTTGTGGCAGGTGG 3002
Query 2877 AATTGTTCAGACTGCCAAAGATATTCATCGCTATGTTAGGTGTACACTTCTGAATTCTAC 2936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3003 AATTGTTCAGACTGCCAAAGATATTCATCGCTATGTTAGGTGTACACTTCTGAATTCTAC 3062
Query 2937 AAAACCCTTTCAAGATGTGGTCAAATCAGCTCAGGATTCTCTGCGGTGGCTGTGCCACAG 2996
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3063 AAAGCCCTTTCAAGATGTGGTCAAATCAGCTCAGGATTCTCTTCGGTGGCTGTGCCACAG 3122
Query 2997 GAAATTTCTTGAGTGGAATGAAGAGACAAAGTTATACACTACAACACCCCTTGGACGTGG 3056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3123 GAAATTTCTTGAGTGGAATGAAGAGACAAAGTTATACACTACAACACCCCTTGGACGTGG 3182
Query 3057 ATCTTTTGGAAGTTCACTCTGCCCAGAGGAGTCACTTATAGTGCTGGATGATCTTCTACG 3116
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ATCTTTTGGCAGTTCACTCTGCCCAGAGGAGTCACTTATAGTGCTGGATGATCTTCTACG 3242
Query 3117 AGCACGTGAAGGACTAGTAATGGCTTCTGATTTGCATTTGGTCTACTTAGTCACACCAAT 3176
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3243 AGCACGTGAAGGACTAGTTATGGCTTCTGATTTGCATCTGGTCTACTTAGTCACACCAAT 3302
Query 3177 CAATGTTGGTGTTGAACCAAACTGGGAATTGTATTATGAACGGTTCATGGAACTGTCTCC 3236
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3303 TAATGTTGGTGTTGAGCCAAACTGGGAATTGTATTATGAACGGTTCATGGAACTGTCTCC 3362
Query 3237 TTTAGAGCAGTCTGTTGGCAATAGAGTTGGAGTGGTCGAACCTTTCCTGATGCGCATGGC 3296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3363 TTTAGAGCAGTCTGTTGGCAATAGAGTTGGAGTGGTCGAACCTTTCCTGATGCGCATGGC 3422
Query 3297 ACATGGTGCAACAGTTCGCACTATAAACAAACCACAGGATGTaaaaaaaaaTTTGCGTGG 3356
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3423 ACATGGTGCAACAGTTCGCACTCTAAACAGACCACAGGATGTAAAAAAAAATTTGCGTGG 3482
Query 3357 AGAATATGACAATCGGCATGGTTCAACAAGCATGAAGATGCTTTCAGATGAACAAATGCT 3416
||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3483 AGAATATGACAGTCGGCATGGTTCGACAAGCATGAAGATGCTTTCAGATGAACAAATGCT 3542
Query 3417 TCGAGTGTGCAAACGATTTTTTGTTGCTCTAATCTTGTCAAAATTAGTTCAGGAAGCTTC 3476
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3543 TCGAGTGTGCAAAAGATTTTTTGTTGCTCTCATCTTGTCAAAATTAGTTCAGGAAGCTTC 3602
Query 3477 TGTGACTGAGGTCTGTGAAGCCTTTAAAGTGGCTAGAGGTATGGTTCAAGCGCTACAGGA 3536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3603 TGTGACTGAGGTCTGTGAAGCCTTTAAAGTGGCTAGAGGTATGGTTCAAGCGCTACAGGA 3662
Query 3537 GAACGCTGGAAGGTTTTCTTCTATGGTTTCAGTGTTCTGTGAGAGGCTTGGATGGCATGA 3596
||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3663 GAACGCTGGAAGGTTTTCTTCCATGGTTTCGGTATTCTGTGAGAGGCTTGGATGGCATGA 3722
Query 3597 TTTGGAAGGCTTAGTTGCCAAGTTCCAGAACCGTGTTTCATTTGGTGTCAGGGCTGAGAT 3656
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3723 TTTGGAAGGATTAGTTGCCAAGTTCCAGAACCGTGTTTCATTTGGTGTCAGGGCTGAGAT 3782
Query 3657 TGTTGAACTTACTAGCATTCCATATATAAAGGGTTCAAGGGCTAGAGCGCTGTATAAAGC 3716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3783 TGTTGAACTTACTAGCATTCCATATATAAAGGGTTCAAGAGCTAGAGCGCTGTATAAAGC 3842
Query 3717 TGGCTTGCGTACATCTCAGGCGATAGCTGAAGCGTCCATCCCTGAAATTGTCAAAGCTCT 3776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3843 TGGCTTGCGTACATCTCAGGCGATAGCTGAAGCGTCCATCCCTGAAATTGTCAAAGCTCT 3902
Query 3777 CTTTGAATCTTCAGCATGGGCTGCAGAAGGTACTGGACAAAGAAGGATACACTTGGGATT 3836
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3903 TTTTGAATCTTCAGCGTGGGCTGCAGAAGGTACTGGACAAAGAAGGATACACTTGGGATT 3962
Query 3837 AGCCAAGAAAATCAAGAATGGGGCTCGCAAAATTGTTCTTGAGAAAGCAGAAGAGGCGAG 3896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3963 AGCCAAGAAAATCAAGAATGGGGCTCGCAAAATTGTTCTTGAGAAAGCAGAAGAGGCGAG 4022
Query 3897 GGCTGCTGCATTTTCTGCTTTTAAGTCACTTGGTTTGGATGTTCATGAGCTTTCAAAGCC 3956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4023 GGCTGCTGCATTTTCTGCTTTTAAGTCACTTGGTTTGGATGTTAATGAGCTTTCAAAGCC 4082
Query 3957 CTTGCCTTTGGCTCCTGCTAGTAGTCCCAATGGACAAGAAACTACTGAAAGAGAGATTTC 4016
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4083 CTTGCCGTTGGCTCCTGCTAGTAGTCTCAATGGACAAGAAACTACTGAAAGAGACATTTC 4142
Query 4017 CAGAATCTCTGTTGGTCCCGATGGATTACAACAAAGCATAAAGGTGCACATGGAATGTGA 4076
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 4143 CAGAGGCTCTGTTGGTCCCGATGGATTACAACAAAGCATAGAGGGGCACATGGAATGTGA 4202
Query 4077 AAACTTTGATATGGATAATCACAGAGAAAAGCCAAGTGAAGTATTAGGTG---CTACCTT 4133
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4203 AAACTTTGATATGGATAATCACAGAGAAAAGCCAAGTGAAGTATTAGGTGATGCTACCTT 4262
Query 4134 AGGGGTTTCATCAGAAGTTAACATGACCAGTCGTCTTCCTAATTTTGGACCTATAGGAAC 4193
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4263 AGGGGTTTCATCAGAAATTAACTTGACCAGTCGTCTTCCTAATTTTAGACCTATAGGAAC 4322
Query 4194 TACAGTCGGCACTAATGGGCCTAGTGTTGTTAGTATTCTTTCCAGTGATACTTTGCCTAT 4253
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4323 TGCAGTCGGCACTAATGGGCCTAGTGCTGTTAGTATTCTTTCCAGTGATACTTTCCCTAT 4382
Query 4254 CCCTGTTTACGATAACAGAGAGATAAAAACTGAGGACAATGTTGAGCAGCATTTGACTAG 4313
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4383 CCCTGTTTACGATAACAGAGAGATAAAACCTAAGGACAATGTTGAGCAGCATTTGACTAG 4442
Query 4314 GAATG-CCA-AT-------A--AG------G-ATGGTACAGGTGAAAAGGGTCCAATAAC 4355
||||| ||| || | || | ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4443 GAATGACCATATTCCTCTGAGTAGTAATAAGGATGGTACAGGTGAAAAGGGTCCAGTAAC 4502
Query 4356 TGCAGGAAATATTAGTGGTGGATTTGATTCTTTTCT-GGAACTTTGGGAATCTGCTGGGG 4414
|||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |
Sbjct 4503 TGCAGGAAATATTAGTGGCGGATTTGATTCTTT-CTTGGAACTTTGGGGATCTGCTGGCG 4561
Query 4415 AATTTTTCTTTGATCTTCACTATAATAAACTACAAGATTTGAATTCCCGCATCTCTTATG 4474
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4562 AATTTTTCTTCGATCTTCACTATAATAAACTACAAGATTTGAATTCACGCATCTCTTATG 4621
Query 4475 AGATACATGGAATTGCTATATGCTGGAATAGCTCCCCTGTATACTATGTCAATCTTAATA 4534
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4622 AGATACATGGAATTGCTATCTGCTGGAATTGCTCCCCTGTATACTATGTCAATCTTAATA 4681
Query 4535 AGGATCTTCCCAACCTGGAATGTGTAGAAAAACAAAAGCTCATCGAAGATGCAGTTGTTG 4594
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||
Sbjct 4682 AGGATCTTCCCAACCTGGAATGTGTAGAAAAACAAAAGCTTATCGAGGATGCAGTTATTG 4741
Query 4595 GCAAGAATGAGGTTTTGGCTACCCACAACATGTTTGATGTTATAAAATCTAGGTGGAACA 4654
|||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4742 GCAAGAGTGAGGTTCTGGCTTCTCACAACATGTTGGATGTTATAAAGTCTAGGTGGAACA 4801
Query 4655 AAATCAGTAAAATAATGGGGAATGTAAATACGAGAAAGTTCACGTGGAATTTGAAAGTCC 4714
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4802 AAATCAGTAAAATTATGGGGAATGTAAATACGAGAAAGTTCACGTGGAATTTGAAAGTCC 4861
Query 4715 AGATTCAGGTGCTTAAGAGTCCCGCCATTTCAATCCAAAGATGCAATCGCTTGAATCTTG 4774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4862 AGATTCAGGTGCTTAAGAGTCCCGCCATTTCAATCCAAAGATGCACTCGCTTGAATCTTC 4921
Query 4775 CAGAAGGGATCAGGGATCTTGAGTTGGTTGATGGATCTTGGTTAATGATGCCTCCTCTTC 4834
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4922 CAGAAGGGATCAGGGAT---GAGTTGGTCGATGGATCTTGGTTAATGATGCCTCCTCTTC 4978
Query 4835 ACACAAGCCACACCATTGACATGAGCATTGTGACATGGATTCTTTGGCCAGATGAGGAAA 4894
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4979 ACACAAGCCACACCATTGACATGAGCATTGTGATATGGATTCTTTGGCCAGATGAGGAAA 5038
Query 4895 GACATTCAAATCCAAACATCGATAAGGAAGTAAAGAAAAGGCTATCCCCAGAGGCAGCTG 4954
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5039 GACACTCAAATCCAAACATCGATAAGGAAGTAAAGAAAAGGCTATCCCCAGAGGCAGCTG 5098
Query 4955 AAGCTGCTAATCGCAGTGGCAGGTGGAGGAATCAGATCCGAAGGGTTGCCCACAATGGTT 5014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5099 AAGCTGCTAATCGCAGTGGCAGGTGGAGGAATCAGATCCGAAGGGTTGCCCACAATGGTT 5158
Query 5015 GCTGCAGACGGGTTGCTCAAACGAGAGCCCTTTGTTCAGCTCTTTGGAAGATCCTTGTTT 5074
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 5159 GCTGCAGAAGGGTTGCTCAAACGAGAGCCCTTTGTTCAGCACTTTGGAAGATCCTTGTTT 5218
Query 5075 CCGAAGAACTTCTTGAAGCACTGACAACCACTGAAATGCCGCTGGTTAATGTCCTTGCAG 5134
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5219 CCGAAGAACTTCTTCAAGCACTGACAACCATTGAAATGCCGCTGGTTAATGTCCTTGCAG 5278
Query 5135 ACATGGAGCTCTGGGGTATAGGTGTCGATATAGAAGGATGCCTTAGGGCACGGAATATAC 5194
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5279 ACATGGAGCTTTGGGGTATAGGTATCGATATAGAAGGATGCCTTAGGGCACGGAATATAT 5338
Query 5195 TGCGGGATAAACTGCGGTCCCTTGAGAAGAAAGCATTTGAATTGGCTGGCATGACATTTT 5254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5339 TGCGGGATAAACTGCGGTCCCTTGAGAAGAAAGCATTTGAATTGGCTGGCATGACATTTT 5398
Query 5255 CATTGCACAACCCAGCTGATATTGCAAATGTGTTGTTTGGACAGTTGAAGTTGCCCATAC 5314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5399 CATTGCACAACCCAGCTGATATTGCAAATGTGTTGTTTGGACAGTTGAAGTTGCCCATAC 5458
Query 5315 CTGAAAACCAATCCAAAGGGAAACTTCATCCAAGTACAGATAAGCATTGCTTGGATCTTT 5374
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5459 CTGAAAACCAATCTAAAGGGAAACTTCATCCAAGTACTGATAAGCATTGCTTGGATCTTT 5518
Query 5375 TAAGGAATGAGCATCCTGTTGTCCCAATCATCAAAGAACACCGCACTTTGGCAAAGCTCT 5434
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5519 TAAGGAATGAGCATCCTGTTGTCCCAATTATCAAAGAACACCGCACTTTGGCAAAGCTCT 5578
Query 5435 TAAATTGTACACTTGGATCAATTTGTTCGCTTGCTAAACTACGCTTGAGCACGCAAAGGT 5494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5579 TAAATTGTACACTTGGATCAATTTGTTCGCTTGCTAAACTACGCTTGAGCACGCAAAGGT 5638
Query 5495 ACACTTTGCATGGCCGCTGGCTTCAAACATCAACAGCAACTGGGCGGCTTTCCATAGAGG 5554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5639 ACACTTTGCATGGCCGCTGGCTTCAAACATCAACAGCAACTGGGCGGCTTTCCATAGAAG 5698
Query 5555 AGCCTAATCTCCAATCTGTTGAGCATGAAGTAGAGTTCATATTGGATAAAAATGGAAAGG 5614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 5699 AGCCTAATCTCCAATCTGTTGAGCATGAAGTAGAGTTCAAATTGGATAAAAATGGAAGGG 5758
Query 5615 ACGTAAATTCAGATGCTGATAGTTACAAAATAAATGCACGTGATTTCTTTGTTCCTACTC 5674
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5759 ACGTAAGTTCAGATGCTGATCGTTACAAAATAAATGCACGTGATTTCTTTGTTCCTACTC 5818
Query 5675 AGGAAAATTGGTTACTCTTGACGGCAGATTATTCACAGATAGAGTTGCGACTTATGGCAC 5734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5819 AGGAAAATTGGTTACTCTTGACGGCAGATTATTCACAGATAGAGTTGCGACTTATGGCAC 5878
Query 5735 ACTTTTCTAGAGATTCCTCGTTGATTTCACAGCTTAGACAGCCAGAGGGTGATGTCTTTA 5794
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||
Sbjct 5879 ACTTTTCTAGAGATTCCTCGTTGATTTCAAAGCTTAGTCAGCCAGAAGGCGATGTCTTTA 5938
Query 5795 CGATGATAGCTGCAAAATGGACTGGAAAAGCCGAGGATTCTGTTAGTCCACATGATAGAG 5854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5939 CGATGATAGCTGCAAAATGGACTGGAAAAGCCGAGGATTCTGTTAGTCCACATGATAGAG 5998
Query 5855 ATCAGACCAAAAGATTGATCTACGGAATTCTTTATGGAATGGGTGCAAACAGGCTCGCAG 5914
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5999 ATCAGACCAAAAGATTGATCTACGGAATTCTTTATGGAATGGGTGCAAACAGACTCGCAG 6058
Query 5915 AACAGCTTGAGTGCAGCTCAGATGAAGCCAAGGAGAAAATTAGAAGCTTTAAAAGTTCTT 5974
||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 6059 AACAGCTTGAGTGCACCTCAGATGAAGCTAAGGAGAAAATTCGAAGCTTTAAAAGTTCTT 6118
Query 5975 TCCCTGCAGTCACCTCTTGGCTAAACGAAACGATTTCATTTTGCCAGGAAAAAGGATACA 6034
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6119 TCCCTGCAGTCACCTCTTGGCTAAACGAAACGATTTCATTCTGCCAGGAAAAAGGATACA 6178
Query 6035 TTCAGACTCTCAAGGGAAGAAGGCGGTTCTTGTCGAAAATAAAATTTGGGAATGCCAAAG 6094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6179 TTCAGACTCTCAAGGGAAGAAGGCGGTTCTTGTCGAAAATAAAATTTGGGAATGCCAAAG 6238
Query 6095 AGAAATCTAAGGCTCAAAGGCAAGCTGTAAATTCCATGTGCCAGGGATCTGCTGCTGATA 6154
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6239 AGAAATCGAAGGCTCAAAGGCAAGCTGTAAATTCCATGTGCCAGGGATCTGCTGCTGATA 6298
Query 6155 TTATCAAGATTGCGATGATAAACATATATTCTGCAGTTGCTGAAGATGTTGATACCACAG 6214
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6299 TTATCAAGATTGCGATGATAAACATATATTCTGCAATTGCTGAAGATGTTGATACCGCAG 6358
Query 6215 CATCTAGTTCTTCAAGTGAAACTGGGTTTCACATGTTAAAGGGACGATGCCGAATTCTTC 6274
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 6359 CATCTAGTTCTTCAAGTGAAACTAGATTTCACATGTTGAAGGGACGATGCCGAATTCTTC 6418
Query 6275 TACAAGTACATGATGAACTTGTGCTAGAAGTTGATCCTTCTTACGTAAAAGTAGCTGCAA 6334
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 6419 TACAAGTACATGATGAACTTGTGCTGGAAGTTGATCCTTCTTACGTAAAACTAGCTGCAA 6478
Query 6335 TGTTGCTACAAACCAGCATGGAAAATGCGGTGTCACTTCTCGTCCCT-TTACATGTGAAA 6393
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||
Sbjct 6479 TGTTGCTACAAACCAGCATGGAAAATGCGGTGTCACTTCTTGTCCCTCTT-CATGTGAAA 6537
Query 6394 CTGAAAGTTGGAAAAACATGGGGTTCTTTAGAGCCGTTTCAGGCTGATTAA 6444
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6538 CTGAAAGTTGGGAAAACATGGGGTTCTTTAGAGCCGTTTCAGACTGATTAA 6588
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 321655515856
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5