BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg890570
Length=2190
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G16570.1 | Symbols: ATPRMT7, PRMT7 | protein arginine methyl... 3470 0.0
> AT4G16570.1 | Symbols: ATPRMT7, PRMT7 | protein arginine methyltransferase
7 | chr4:9336703-9340869 FORWARD LENGTH=2464
Length=2464
Score = 3470 bits (1879), Expect = 0.0
Identities = 2096/2197 (95%), Gaps = 29/2197 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGTCGTCTCTGTTTTCTCTTCTTCTTCCCAAAACCTTTA--T-CTCCTTCCGGTGCCAC 57
|||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||| | |||||||| ||||||
Sbjct 113 ATGTCGCCTCTGTCTTCTCTTC--C-TCCCAAAACATTTATCTCCTCCTTCCATTGCCAC 169
Query 58 TCAGTGACTCGCCTAAGAAGCTCCGTCGCTGCTCGAACCATGAGCTCTCAGTCTAGTCAA 117
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 170 TCAGTGACTCGCCTAAGAAGGTCCGTCACTGCTCGAACCATGAGCTCTCAGTCTAGTCAA 229
Query 118 CGCGTCTTCCAGCTCAGACAAGACCCTCTCACCGGCAATTCCGAGTGGATTGTCATCGAA 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||
Sbjct 230 CGCGTCTTCCAGCTCAGACAAGACCCTCTCACCGGAAATTCCGAATGGATTGTCATTGAG 289
Query 178 GACAATGACCAACCCGGAACTTCCACTGACGGCCTCCTCGCCACGACGTCGTATCTCGAC 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 290 GACAATGACCAACCCGGAACTTCCACTGACGGCCTACTCGCGACGACGTCGTATCTCGAC 349
Query 238 ATGCTTAATGATTCTCGCCGCAACAGAGCTTATCGTCTCGCTATCGAGAAAACCATCACT 297
||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 350 ATGCTCAATGATTCTCGCCGTAACATAGCTTATCGTCTCGCTATCGAGAAAACCATCACT 409
Query 298 GAACCTTGCCACGTCCTTGACATTGGTGCTGGAACTGGGTTGCTATCGATGATGGCTGTG 357
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 410 GAACCTTGCCACGTCCTGGACATTGGTGCTGGAACTGGGTTGCTATCAATGATGGCTGTG 469
Query 358 AGAGCAATGAGAGGAAGAGAAGAAGAGTCTGGTGATTCAAAAGGAATGGTGACGGCGTGT 417
|||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 AGAGCAAT-------------G-AGA----GGTGATTCAAAAGGAATGGTGACGGCGTGT 511
Query 418 GAGTCCTACTTACCGATGGTTAAGCTTATGAGGAAGGTTTTGCATAAGAATGGGATGACT 477
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 512 GAGTCTTACTTACCGATGGTTAAGCTTATGAGGAAGGTTATGCATAAGAATGGAATGACT 571
Query 478 AAGAACATTAACCTTATCAACAAACGATCCGATGAACTCAAAGTTGGATC---AGACATT 534
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 572 AAGAACATTAACCTTATCAACAAACGATCCGATGAACTCAAAGTTGGATCAGAAGACATT 631
Query 535 GCTTCACGAGCTGATGTTCTTGTTAGTGAAATATTGGACTCTGAGTTACTTGGTGAAGGT 594
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632 GCTTCACGAGCTGACGTTCTTGTTAGTGAAATATTGGACTCTGAGTTACTTGGTGAAGGT 691
Query 595 CTAATCCCAAGTTTACAACACGCTCATGACATGTTGCTGGTTGATAATCCAAAAACAGTG 654
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 692 CTAATCCCAAGTTTACAACACGCTCATGACATGTTGCTGGTTGATAATCCCAAAACAGTG 751
Query 655 CCATATCGAGCTACTACTTATTGCCAGCTTGTTGAAAGCAGATTCTTATGTAACATGCAC 714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||
Sbjct 752 CCATATCGAGCTACTACTTATTGCCAGCTTGTTGAAAGCACATTCTTATGTAACTTGCAA 811
Query 715 GATCTACGAAATAACGAGGCTAAAACATCCGATGGTGTTCGGCTGGTTCCTCCTGGATTA 774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 812 GATCTACGAAATAACGAGGCTAAAACATCCGATGGTGTTCGTCTAGTTCCTCCTGGATTA 871
Query 775 GAGAGTCTATTTGGTATCAAGTCACAACAGTATAGCATGCATGTTGATGCTATTGAGAAA 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 GAGAGTCTATTTGGTATCAAGTCACAACAGTATAGCATGCATGTTGATGCTATTGAGAAA 931
Query 835 GATATCAAACTGTTGTCAGAGCCCGTCAAAATATTTGAATTTGACTTTTGGAAACGGCCA 894
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 GAGATCAAACTGTTGTCAGAGCCCGTCAAAATATTTGAATTTGACTTTTGGAAACGGCCA 991
Query 895 GAAAGTAATGGAGAGCTTGATGTGCACATAGAAGCAATAACCGCGGGTAGTGTTCATGCT 954
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 992 GAAAGTAATGGAGAGCTTGATGTGCACATAGAAGCAAAAACCACGGGTAGTGTTCATGCT 1051
Query 955 ATTATTTCATGGTGGGTGCTGCAGCTTGATAGTGAAGGAACAATCTTCTATTCTACTGCT 1014
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1052 ATTATATCATGGTGGGTGCTGCAGCTTGATAGTGAAGGAACAATCTTCTATTCTACCGCT 1111
Query 1015 CCCCGGTGGATAGATTCAAATTCTGAGATAGGTGTTAGAGACTGGTGTGACCATTGGAAA 1074
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 CCCAGGTGGATAGATTCAAATTCTGAGATAGGTGTTAGAGACTGGTGTGACCATTGGAAA 1171
Query 1075 CAGTGTGTTTGGTTTACTCCAGGGGCAGGTGTGTCCATATCCAAAGGAGAAAAAGTTCAT 1134
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172 CAGTGTGTTTGGTTTACTCCAGGAACAGGCGTGTCCATATCCAAAGGAGAAAAAGTTCAT 1231
Query 1135 TTGCATGCTGCTCATACTTGTACTAACATCTTGTACAATCTGAAGAAGACTCAAAGCTTG 1194
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232 TTGCATGCTTCTCATACTTGTACTAACATCTTGTACAATCTGAAGAAGACTCAAAGCTTG 1291
Query 1195 ACACATGAAATGACACACTCTCCTTTGAGTACTGGAGATCTACACCTCACATTATCACCC 1254
|||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1292 ACACATGAGAGGACACACTTTCCTTTAAGTACTGGAGATCTACACCTCACATTACCACCC 1351
Query 1255 GAAAGAGTCGCAATATATGGTGACAGTATATATAGGCAATCCTTGTTTGAGGCCACAAGA 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 GAAAGAGTCGCAATATATGGTGACAGTATATATAGACAATCCTTGTTTGAGGCCACAAGA 1411
Query 1315 AAAGCTTTACAGGGGAAATCGTATCCACAATGTCTCGTCATTGATGATAGTCTTCTCTTA 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1412 AAAGCTTTACAGGGGAAATCGTATCCACAATGTCTCGTCATTGATGACAGTCTTCTCTTA 1471
Query 1375 CCACTTATGGCTCTACATATATCCAACAGATCACGGGTTATATCATTGTCACCTGGGTTG 1434
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 CCACTTATGGCTCTACATATATCGAACAGATCACGGGTTTTATCATTGTCACCTGGGTTG 1531
Query 1435 CAAGAGAATGCTGCCAGATACTTTGAAGCCATTGCTGATTCAAATGACTTTTCAAAAGAT 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1532 CAAGAGAATGCTGCCAGATACTTTGAAGCCATTGCTGATTCAAATGGCTTTTCAAAAGAT 1591
Query 1495 CGTTTCGAATATTTCAGAGAAGGGAAGGCAAATTTGGCCAAAGCGTATCCAAGCAAGATT 1554
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1592 CGTTTCGAATATTTCAGAGATGGGAAGACAAATTTGGCCAAAGCGTATCCAGGCAAGATT 1651
Query 1555 GATCTGCTGATTGGAGAGCCATATTACAGCGGACTTGAAAGTGGGCTTCCGTGGCAGAAT 1614
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 1652 GATCTGCTGATTGGAGAGCCATATTATAGCGGACTTGAAAATGGGCTTCCGTGGCAAAAT 1711
Query 1615 CTCAGATTCTGGAAGGACAGAACTCTACTTGATTCTGTCCTGTCAGAAGATGCAGTGGTA 1674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 CTCAGATTCTGGAAGGACAGAACTCTACTTGATTCTGTCCTGTCAGAAGATGCAGTGGTA 1771
Query 1675 ATGCCATATAAAGGGGTTTTGAGAGGTTGTGCGATGTATCTTCCAGATCTCTGGAAGAGC 1734
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1772 ATGCCGTATAAAGGGGTTTTGAGAGGTTGTGCGATGTATCTTCCTGATCTCTGGAAGAGC 1831
Query 1735 CGTTGTTGCCTTGGGAA-TGTAGAAGGGTTTGACCATGCTCTGGTGAATACAACCTTAGG 1793
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832 CGTTGTTGCC-TGGGAAGTGTAGAAGGGTTTGACCATACTCTGGTGAATACAACCTTAGG 1890
Query 1794 GGGATGTGGTGATCTACCTTCTGGTAAAGACAGTCCTTGTTTGCCCTTCTTTATCTGGCA 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1891 GGGATGTGGTGATCTACCTTCTGGTAAAGACAGTCCTTGTTTGCCCTTCTTCATCTGGCA 1950
Query 1854 ATGTGGAGAGACAAAGAAACTTAGCAAGGAATTTACAGTCATGGAGTTTGACTTCTCCAA 1913
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 ATGTGGAGAGACAAAGATACTTAGCAAGGAATTCACAGTCATGGAGTTTGACTTCTCCAA 2010
Query 1914 GCCCATCAGAGGTCCATGTTCTGGGGAAGTTCAGATTGAGTTTATAAAACCCGGCGTATG 1973
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2011 GCCCATCACAGGTCCATGTTCTGGGGAAGTTCAGATTGAGTTTATAAAACCCGGCGTATG 2070
Query 1974 CCATGGAATTGCATTGTGGATGGATTGGGTGATGGATGAAGAAAACTCAACCGTGATCTC 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 CCATGGAATTGCATTGTGGATGGATTGGGTGATGGATGAAGAAAACTCAACCGTGATCTC 2130
Query 2034 AACAGGACCAGATGAAAAGTATTGGAAGCAAGGAGTGAAGCTATTAGGGAAGCCAGTCAC 2093
||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2131 AACAGGACCAGATGATAAGTATTGGAAACAAGGAGTGAAGCTCTTAGGGAAGCCAGTCAC 2190
Query 2094 AGTGAGAGTGAAAGGTCCCTCCTCATCCATAGGAATCCAAGCTTCCTTAGATTTATCTTC 2153
||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191 AGTAAGAATGGAAGGTCCTTCCTCATCCATAGGAATACAAGCTTCCTTAGATTTATCTTC 2250
Query 2154 AAACAGCGACCTCATCATCACTCATACTATTTCGTGA 2190
||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct 2251 AAACAGCGAGCTCATCGTCACTCATACTATTTCTTGA 2287
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 108633979380
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5