BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg890991
Length=6411
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT4G13750.1 | Symbols: NOV | Histidine kinase-, DNA gyrase B-, ... 1.025e+04 0.0
AT1G08300.1 | Symbols: NVL | no vein-like | chr1:2614774-261882... 446 2e-123
> AT4G13750.1 | Symbols: NOV | Histidine kinase-, DNA gyrase B-,
and HSP90-like ATPase family protein | chr4:7975191-7987620
FORWARD LENGTH=8252
Length=8252
Score = 1.025e+04 bits (5551), Expect = 0.0
Identities = 6124/6406 (96%), Gaps = 17/6406 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 16 GTAACTTCATTAAAACGTGGAATGTGGGATAGCATATATGATAATTTGCAAATGACAAGC 75
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1792 GTAACTTCATTAAGACGTGGTATGTGGGATAGCATATATGATAATTTTCAAATGACAAGC 1851
Query 76 CTAAGTGATACGACTAATACAGGCTCAGGAAATCAAGTTGGTGAAATTAACCCAAGTGAA 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1852 CTAAGTGATACGACTAATACAGGCTCAGGAAATCAAGTTGGTGAAATTAACCCAATTGAA 1911
Query 136 AACAGTGAGTTAAGCAAAACTCAGCATGTTATGCCTCCTAAACA-TAGTAACACTGTTGA 194
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||
Sbjct 1912 AACAGTGAGTTAAGCAAGACTCAGCATGTTATGCCTCCTACACACT-GTAACACTGTCGA 1970
Query 195 AGAAATTATCAGAAGACTTTCCTTGTATTTTGAGCATGATCTTTCTGGAGAGAAGCACAT 254
||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1971 AGAAATTATTAGAAGGCTTTCCTTGTATTTTGAGCATGATCTTTCTGGAGCGAAGCACAT 2030
Query 255 TGGTATCTTCAGGAAGCTACAGACTTGCGAGGTTTTGTTGGCAGAGCAATTTCAAGTACA 314
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 TGGTATCTTTAGGAAGCTACAGACTTGCGAGAATTTGTTGGCAGAGCAATTTCAAGTACA 2090
Query 315 GGATTTTGAGTCTCTTGGTTGGGGTGGGTTTTTCACTTTCTTGGAAAAACATATGTTACT 374
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 GGATTTTGAGTCTCTTGGTTGGGGTGGGTTTTTTGCTTTCTTGGAAAAACATATGTTACT 2150
Query 375 ACTACCAACACAACTTCAAAGGTTTCTATCTAGAGAATTACTGGAAGAGTTTCCTCTGGA 434
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2151 GCTACCAACACAACTTCAAAGGTTTCTATCTAGAGAATTACAGGAAGAGTTTCCTCTGGA 2210
Query 435 GGTCCACGTGAATGAGAATCTGTTGACTCTTCTGCTTTCGCAAGCGTCTGAATTTTCAGG 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
Sbjct 2211 GGTCCACGTGAATGAGAATCTGTTGACTCTTCTGCTTTCGCAAGCTTCTGAATTTTCAAG 2270
Query 495 TGGTAATGTAATATCTAGACAAACAGTAAATCGACTGCTTGCAGAACAATTTCCGTCAAT 554
|| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 2271 TGATAAAGTACTATCTAGACAAACATTAGCTCGACTGGTTGCAGAACAATTTCCATCAAT 2330
Query 555 CAATTTTAAGGTTGTCGGAAGAAATTCAGAGGAAAATTTCACTGAAATCATTGGTAAGGA 614
|| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2331 CAGTTTCAAGGTTGTCGGAAGAGATTCAGAGGAAAATTTCTCTGAAATCATTGGTAAGAA 2390
Query 615 GAAGTCTTGTTCTAAATGTGTGCTCTTTTCTGCAACATTGTCGGGAGCTGAAAACTCTTT 674
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2391 GAAGTCTTCTTCTAAATGTGTCCTCTTTTCTGCAACATTGTTGGGAGCTGAAAACTCTTT 2450
Query 675 GACCAGTAAATATCTAGAAGAATCCTTGACAGTGGGGAATGATACTGAAGCAAGAGGCAG 734
||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||
Sbjct 2451 GACAAGTAAATATCTGGAAGAATCCCTGACAGTGGGAAATGATACTGAAGCAAGAAGCAC 2510
Query 735 CACTCTTAATGCTGTTGCATCCAAAGAGGTTTTAGATGTTTTGCTTAGGGTTCCGTTGTT 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 CACTCTTAATGCTGTTGCATCCAAAGAGGTTTTAGATGTTTTGCTTAGGGTTCCGTTGTT 2570
Query 795 GTCAGACTTGAATTCATGGTGTCACTGGGATCTTAGGTATGCTCCACAGTTTGGTCCTCT 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2571 GTCAGACTTGAATTCATGGTGTCACTGGGATCTTAGGTATGCTCCACAGTTTGGTCCTCT 2630
Query 855 TTTGGGCTGTTTAAATGAGATTAATTCAAAAGATCTGCTGTGTCTAGTGACAAGGGATGG 914
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2631 TATGGGCTGTTTAAATGAGATTAATTCAACAGATCTGTTGTGTCTAGTGACAAGGGATGG 2690
Query 915 TAAGATTATCAGAACAGATCCTTCTGCAACAGCAGATTCATTCTTGGAGGCTGCTCTTCA 974
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2691 TAAGATTATCAGAGCAGATCCTTCTGCAACAGCAGATTCATTCTTAGAGGCTGCTCTTCA 2750
Query 975 AGGATCTGCTTACTGTACTGCTGCACAGTTGTTGTCGTTGATATCATTGAATGGACGAAC 1034
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2751 AGGATCTGCTTACCGTACTGCTGCACAGTTGTTGTCATTGATATCATTGAATGGAAGAAC 2810
Query 1035 ACATCTACCGTTTTCCCTTCTAAAATGCTATGCAAAACGTGCATTTGAAGttttttttGA 1094
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2811 ACATCTACCATTTTCCCTTCTAAAATGCTATGCAAAACGTGCATTTGAAGTTTTTTTTTA 2870
Query 1095 TAACCATTCCGAGGAGATGGAGCTTAATAATAGGAATTCTCTTGTGCAAATGCATCGGCC 1154
|||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2871 TAACTATTCCGAGGAGATGGAGCTAAATGATAGGAATTCTCTTGTGCAAATGCATGGGCC 2930
Query 1155 AGAACAGCTTAGTACTTCTTTGGACAAAATGATAGTTGTAGGAGAGAAAACTAAAGCGGC 1214
|||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2931 AGAAAAGCTCAGCACTTCTTTTGACAAAGTGATAGTTGTAGGAGAGAAAGCTAAAGTGGC 2990
Query 1215 TAAAAGTGACTATGCTGCCTCTAAGTTTCTTCTTGATTGTCTGGGCTATTTACCTGGGGA 1274
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2991 TAAACGTGACTATGCTGCCTCTAAGTTTCTTCTTGATTGTCTGGGCTATCTACCTGGGGA 3050
Query 1275 GTTTCGCAGTTTAGTTGTTGATATCTTGCTACCAGGTCTACGTTCTGTTGTTAAAGATGC 1334
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 GTTTCGCAGTTTAGTTGTTGATATCTTGCTACCAGGACTACGTTCTGTTGTTAAAGATGC 3110
Query 1335 TCCTACAAGAGTTTTGTCTGCATGCAAGCAAACAGAGCAACGCATCATGCTGCATGATGC 1394
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3111 TCCTACAAGAGTTTTGTCTGCATGCGAGCAAACAGAGCAACGCATCATGCTGCATGATGC 3170
Query 1395 CGGATTGCTGCTTGGCATTGTTGAGTGGATTAGTGATTACCATATGTTTTGCTCATCATG 1454
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3171 CGGATTGCTGCTAGGCATTGTTGAGTGGATTAGTGATTACCATAAGTTTTGCTCATCATG 3230
Query 1455 TTCTCCGAACTCTTCAATAGTGGAGAGTGCTTCGTCCAACTTAGATTCTGTCGCAGGTTC 1514
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3231 TTCTCCAAACTCTTCAATAGTGGAGAATGCTTCGTCCAACTTAGATTCTGGCGCAGGTTT 3290
Query 1515 TGTGCAAAAAGAATTGGAGGACCCAATTCAGACCGAACAAAGATGCATGATCGTATCAGA 1574
||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TGTGCAAAACGAATTGGAGGACCCAGTTCAGACCAAACAAAGATGCATGATCGTATCAGA 3350
Query 1575 GAAGGCTTGCCAGGACAAAAAAGAACCTCATGAATCTTGTCACACTTTTGGTGGTTCTGG 1634
|||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3351 GAAGTCGTGCGAATACAAAGAAGAACCTCATGAATCTTGTCACACTTTTGGTGGTTCAGG 3410
Query 1635 GACTTTATGTGATTCTGTTGGGGAGGCTTTCACCCAGACTGCGCTTGAGTTTCATGATAA 1694
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||
Sbjct 3411 GATTTTATGTGATTCTGTTGGGGAGGCTTTCACCCAGACTGCACCTGAATTTTATGATAA 3470
Query 1695 TCCAGCCTCTGTTATTGATTCAATCAGACGGGATGAGTTTGGGTTAGATTTAACTTCTTC 1754
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3471 TCGAGCCTCTGTTATTGATTCAATCAGACGGGATGAGTTTGGGTTGGATTTAACTTCTTC 3530
Query 1755 TGGCTCTGAGATGAGTATGCTGCAGAAACAACATGCTCGGTTAGGAAGAGCACTTCAGTG 1814
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3531 TGGTTCTGAGATGAGTATGCTGCAGAAACAACATGCTCGGTTAGGAAGAGCACTTCAGTG 3590
Query 1815 TTTGTCCCAGGAATTGTATTCACAAGATTCACACTTCATTCTTGAACTTGTTCAAAATGC 1874
||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3591 TTTGTCCCAAGAACTGTATTCTCAAGATTCACACTTCATTCTTGAACTTGTTCAAAATGC 3650
Query 1875 TGATGACAATAAGTACCCTGCACACGTGGAACCCACACTCACATTCATTCTTCAAAAGAC 1934
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3651 TGATGACAATAAATACCCTGAACACGTGGAACCCACACTCACATTCATTCTTCAAAAGAC 3710
Query 1935 CGGGATTGTTGTTTTAAACAACGAGTGTGGCTTCATGCCTGAGAACATTCGGGCCCTGTG 1994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3711 CGGGATTGTTGTTTTAAACAACGAGTGTGGCTTCATGCCTGAGAACATTCGGGCCCTGTG 3770
Query 1995 TGATGTTGGTCAATCCACAAAGAAAGGATCTGGTGGATACATAGGGAAGAAAGGAATTGG 2054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3771 TGATGTTGGTCAATCCACAAAGAAAGGATCTGGTGGATACATAGGGAAGAAAGGAATTGG 3830
Query 2055 CTTCAAGTCAGTGTTTCGGGTTTCTGATGCTCCTGAGATCCACTCAAATGGTTTCCATTT 2114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3831 CTTCAAGTCAGTGTTTCGGGTTTCTGATGCTCCTGAGATCCACTCAAATGGTTTCCATTT 3890
Query 2115 CAAGTTTGATATTAGTGAGGGTCAGATTGGATATATTTTGCCGACTGTTGTGCCTCCTCA 2174
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3891 CAAGTTTGATATAAGTGAGGGTCAGATTGGATATATTTTACCGACTGTTGTGCCTCCTCA 3950
Query 2175 AGATATTGAATCGCTTAGCAGCATGTTATCTGGCCGTGCTTTACACCTAAAGGATGCAGG 2234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3951 TGATATTGAATCGCTTAGCAGCATGTTATCTGGCCGTGCTTTACACCTGAAGGATGCAGG 4010
Query 2235 ATGGAACACTTGCATTACACTTCCTTTCAGAAGC-ATTGATTCCGAAAGAACAACAGTGA 2293
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4011 ATGGAACACTTGCATTACACTTCCTTTCAGA-GCCATTGATTCCGAAAGAACAACAGTGA 4069
Query 2294 ATCACATTGAACCTATGTTTTCAGACCTTCATCCTTCTTTATTACTCTTCCTACATCGCC 2353
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4070 ATCACATTGAACCTATGTTTTCAGACCTTCACCCTTCTTTATTACTCTTCCTACATCGCC 4129
Query 2354 CCCAGTGCATAGTATACAGAAATGTGCTTGAAGATTCTCTCTTGGTCATGAGGAAAGAGG 2413
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4130 TCCAGTGCATAGTATACAGAAACGTGCTTGACGATTCTCTCTTGGTCATGAGGAAAGAGG 4189
Query 2414 TTGTGAGCAATAATATCGTAAAGGTTTCATGTGGGGAAAATAGCATGACATGGTTTGTGG 2473
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4190 TTGTGAGCAAGAATATCGTAAAGGTTTCATGTGGGGAAAATAGCATGACATGGTTTGTGG 4249
Query 2474 CATCAGAGAAATTAAAGGCTGCCAATCTTCGTGATGACGTTCAGACAACAGAGATTTCGA 2533
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 4250 CATCAGAGAAATTAAAGGCTACCAATCTTCGTGATGATGTTCAGACAACAGAAATTTCCA 4309
Query 2534 TAGGATTCACTCTTGACATGCTGGAAGATGGAACTTACAGATCATGTATGATTCAAGAAC 2593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4310 TAGGATTCACTCTTGACATGCTGGAAGATGGAACTTACAGATCATGTATGATTCAAGAAC 4369
Query 2594 CTGTTTTTGCTTTTCTTCCTCTAAGAACTTATGGTTTGAAATTTATTATACAAGGGGATT 2653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4370 CTGTTTTTGCTTTTCTTCCTCTAAGAACTTATGGTTTGAAATTTATTATACAAGGGGATT 4429
Query 2654 TCATTCTTACATCATCAAGGGAGGATGTTGATGAGGATAGTCCTTGGAACCAGTGGCTGT 2713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4430 TCATTCTTACATCATCAAGGGAGGATGTTGATGAGGATAGTCCTTGGAACCAGTGGCTGT 4489
Query 2714 TGTCAGAGTTTCCGGGTTTGTTTGTGGATGC-TCTAAGGTCCTTTTGCAGTCTTCCTTCT 2772
||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4490 TGTCAGAATTTCCGGGTTTGTTTGTGGATGCGT-TAAGGTCCTTTTGCAGTCTTCCTTCT 4548
Query 2773 TTCACCCAGAATCTGGGTAAAGCTGTGTCCTCATATATGCAGCTTGTACCTCTCG-CTGG 2831
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 4549 TTCACCCAGAATCTGGGTAAAGGTGTCTCCTCATACATGCAGCTTGTACCTCTCGTC-GG 4607
Query 2832 GGAAGTGCATGGGTTCTTTTCTTCTCTCCCTCGTTCTATTATATCTAGATTGAGAACAAC 2891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4608 GGAAGTGCATGGGTTCTTTTCTTCTCTCCCTCGTTCTATTATATCTAGATTGAGAACAAC 4667
Query 2892 AAATTGCTTGCTGCTTGAGGGAGACGGTGAAGAATGGGTTCCTCCTTGCAAGGTTTTAAG 2951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4668 CAATTGCTTGCTGCTTGAGGGAGACGGTGAAGAATGGGTTCCTCCTTGCAAGGTTTTAAG 4727
Query 2952 AAACTGGAATGAAAAGATAAGGGTTCTTCTTAAGGATGGATTGCTTCAGGAGCATCTTGC 3011
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4728 AAACTGGAATGAAAAGATTAGGGTTCTTCTTAAGGATGGATTGCTTCAGGAGCATCTTGC 4787
Query 3012 TTTGGGCTTTTTGGACAAAGATATAGTTTTGTCAGATTCCCTGTCAAGGGCACT-GAGCA 3070
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 4788 TTTGGGCTTTTTGGACAAAGATATAGTTTTGTCAGATTCCCTGTCAAGGGCACTCG-GCA 4846
Query 3071 TTGAAGACTATGGACCGAAGACTTTGGTGCAGATTCTTTCTTCATTGAGTCACAAGAATG 3130
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4847 TTGAAGACTATGGACCGAAGACTTTGGTGCAAATTCTTTCTTCATTGAGTCACAAGAATG 4906
Query 3131 GTTGTCTACAATCAATGGGCTTTACATGGTTATCGTCTATTCTTACTGAACTTTACATAC 3190
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4907 GTTGTCTACAATCAATGGGCTTTACATGGTTATCGTCTATTCTTACTGAACTTTACCTAC 4966
Query 3191 TATTCCGTTCTTCTGGGCATGGTAATGTAGAGTTAGGTATAGATAAGACTCTTATAGATG 3250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4967 TATTCCGTTCTTCTGGGCATGGTAATGTAGAGTTAGGTATAGATAAGAGTCTTATAGATG 5026
Query 3251 ACCTTCACAAGATCCCATTTATTCCCCTGTCAAATGGTAAGTTCACCGCTTTAGATGAAG 3310
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5027 ACCTTCACAAGATCCCATTTATTCCCCTCTCAAATGGTAAGTTCACCTCTTTAGATGAAG 5086
Query 3311 GCGCAGTATGGTTGCACCATGACACCACTGGGTTAGATCTTGGTGATGTATTTGAAGCAT 3370
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5087 GCGCAGTGTGGTTGCACCATGACACCACTGGGTTAGATCTTGGTGATGTATTTGAAGCAT 5146
Query 3371 TTCCTGTGTTATATGGAAATCTCCGAACCATTGATCATTCCCTTCTTTTGGCGTCTTCGG 3430
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5147 TTCCTGTGTTATATGGAAATCTCCGAACCATTGATCATTCCCTTCTTTTGGCGTCTTCTG 5206
Query 3431 TTGATGAAAAATCCTCTGTGGATGACCTCGTAAACATGCTTTGTGCAATTGGCGTTCAAA 3490
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5207 TTGATGAAAAATCCTCTGTGGATGACCTTGTAAACATGCTTTGTGCAATTGGCGTTCAAA 5266
Query 3491 AGCTGTCAGCACATGAAATCATCAAAGTTCATATATTACCAGCCTTTGAGGCAAGGAGTA 3550
|||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5267 AGCTGTCAGCACATGAAATCGTTAAAGCTCATATATTACCAGCCTTTGAGGCAAGGAGTA 5326
Query 3551 CAGATACAGTGGAGGGTTTGATGGTTGATTACTTATGCTTTGTGATGACACATCTACGAT 3610
||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5327 CAGGTGCAGTGGACGGTTTAATGGTTGATTACTTATGCTTTGTGATGACACATCTACGAT 5386
Query 3611 CTAGCTGTCATATTTGTCAT-AATGAGAGGAACTACATTATTTCTGAGTTAAGAAGCAAA 3669
|| ||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5387 CTGGCTGTCATATTTGTC-TGAAGGAGAGGAAGTACATTATTTCTGAGTTGAGAAGCAAA 5445
Query 3670 GCTCTGGTATTATCAAATTATGGGTTGAAACAGCTCGGTGAGGGGTCAATTCATTTCGGT 3729
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5446 GCTCTGGTATTATCAAATTATGGGTTGAAACAGCTAGGTGAAGGGTCAATTCATTTCGGT 5505
Query 3730 GAAGAATTTGGAAACCAGGTCAACATGAAGAAGCTTACCAAAAACTTGGATATTTCATGG 3789
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5506 GAAGAATATGGAAACCAGGTCAACATGAAGAAGCTTACCAAAAACTTGGATATATCATGG 5565
Query 3790 CATGTGGTTGATGGTACCTACTTGAAACATCCAGCATCAAAATTTTATGCATGCGGATTG 3849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5566 CATGTGGTTGATGGTACCTACTTGAAACATCCAGCATCAAAATTTTATGCATGCGGATTG 5625
Query 3850 AAGGAGTGGCGGGAATTTTTTCAAGAGATTGGAATAGCTGATTTTGTTCAAGTGGTTCAA 3909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 5626 AAGGAGTGGCGGGAATTTTTTCAAGAGATTGGAATAGCTGATTTTGTTCAAGTAGTTCAA 5685
Query 3910 GTTGAAAAGACCATTGCTGAGTTTTATTCTGTTTCACGTTGTGAAAAGTATGATATCAAC 3969
|||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5686 GTTGAAAAGAGCATTGCTGAATTCTATTCTGTTTCACACTGTGAAAAGTATGATATCAAC 5745
Query 3970 TTGTTATCTCCTGAGTTAACTGTTAAAGACTGGGAATCCCCAGAACTAGTTGATCTCTTG 4029
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5746 TTGTTATCTCCTGATTTAACTGTTAAAGACTGGGAATCCCCGGAACTAGTTGATCTCTTG 5805
Query 4030 TCTCTCTTGCACAAAAGTAATGGCCGCAAAGGTTGCAAGTACCTGTTGGAAGTCCTTGAT 4089
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 5806 TCTCTCTTGCACAAAAGTAATGGCCGTAAAGGTTGCAAGTATCTTTTGGAAGTCCTTGAT 5865
Query 4090 AGACTGTGGGATGAATGTTACCATGAAAAAACAACTGTTAACTATAACTCAGGTACGCAT 4149
||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 5866 AGACTGTGGGACGATTGTTACTATGACAAAACAACTGTTAACTATAACTCGGGTACGCAT 5925
Query 4150 GGTGTCATCAGATCATCAGAATCTTCATTTATGAGGGTAATTTGTGATTCTCAATGGATA 4209
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5926 GGTATCATCAGATCATCAGAATCTTCATTTATGAGGGTAATTTGTGATTCTCTATGGATA 5985
Query 4210 GTTTCAAGCATGGACAGCGAATTGCATCTTGCAAAAGGCCTCTATCATGATTGTGATGAT 4269
|||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5986 GTTTCAAGCATGGACAGCAAATTGCATCTTTCAAAAGACCTCTATCATGATTGTGATGAT 6045
Query 4270 GTGCAGTCTATACTTGGCATGAATGCTCCCTATTCAGTTCCTAAGGTTACAAGTGTCAAA 4329
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6046 GTGCAGTCAATACTTGGCATGAATGCTCCCTATGCAGTTCCTACGGTTACAAGTGTCAAG 6105
Query 4330 TTACTTAGTGATATTGGTTTTAAGACCAAAGTTTGCCTCGATGATGCTCTGGAAATCCTA 4389
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 6106 TTACTTAGTGATATTGGTTTTAAGACCAAAGTTTCCCTCGATGATGCTTTGGAAGTCCTA 6165
Query 4390 GAAGCTTGGGTACACTGTGGAGACAATTTCAAATCAAGCATCTCTCAGATTACCAGATTT 4449
||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6166 GAATCTTGGGTACACTGTGGAGACTCTTTCAAATCAAGCATCTCTCAGATTACCAGATTT 6225
Query 4450 TACAAATATATGTGGAATGAAATGGCTGATTCAAAGCAGAAAATAACTGAAAAGCTTCAT 4509
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 6226 TACAAATATTTGTGGAATGAAATGGCTGATTCAAAACAGAAAATTACTGAAAAGCTTCAT 6285
Query 4510 ACTATCCCGTCTGTATTTGTACCACATGGAAATGGAAGTAGGCAGAATGATATGGTATCT 4569
||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6286 ACTCTTCCGTCTGTGTTTGTACCACATGGAATTGCAAGTAGGCAGAATGATATGATATCG 6345
Query 4570 GGAATATTCTTGTCACTTGATGATGTTTACTGGAATGATTCTGCTGGCGTTTTAGATGAG 4629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6346 GGAATATTCTTGTCACTTGATGATGTTTACTGGAATGATTCTGCTGGCGTTTTAGATGAG 6405
Query 4630 ATAAAAGAGATCAGTTCGCAGATCAGTAGCGTTGTGGAACCATTGCGTAGGAAATCATTG 4689
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 6406 ATAAAAGAGATCAGTTCGCAGATCAGCAGTGTTGTGGAACCATTGCGTAGAAAAACATTG 6465
Query 4690 TGCAATATCTATCCAGGTCTCCATGACTTTTTTGTGAATGGGTGTGGAGTACCTGAGACG 4749
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6466 GGCAATATCTATCCAGGTCTACATGACTTTTTTGTGAATGGGTGTGGAGTACCTGAGACG 6525
Query 4750 CCTTCGTTTCAAGATTACCTTAAAATTCTAGGGCAGTTTGCACATAATGTGTCACCTTCA 4809
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 6526 CCTTCGTTTCAAGAGTACCTTAAAATTCTAGGGCAGTTTGCACATAATGTGTCACCCTCA 6585
Query 4810 TGTGCTGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTGAAGTGGAGTGATGACTTGAACTCTGGC 4869
| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6586 TCTGCCGCCAAGGCTGTCTTCAAAATTTTCCTGAAGTGGAGTGATGACTTGAACTCTGGC 6645
Query 4870 AAATCTTCCGAAGATGTTGTTCATTTTAAAGAGAGACTTTCAGAACTCGAGTACACTGTA 4929
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6646 AAATCTTCCGAAGATGTTATTCATTTTAAAGAGAGACTTTCAGAACTGGAGTACACTGTA 6705
Query 4930 CTTCCTACTGAAAATGACAAGTGGGTTTCCTTGCACTCCTCGTTCGGTCTAGTATGTTGG 4989
|| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 6706 CTCCCTACTGAAAATGATAAGTGGGTTTCCTTGCACTCCTCGTTTGGTCTCGTATGTTGG 6765
Query 4990 TGTGATGATGAGAAGTTAAAGAAGAGATTTAAGAAGAAGGATAACATTGAGTTTATTAAC 5049
|||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |
Sbjct 6766 TGTGATAATGAGAAGTTAAAGAAGAGATTTAAAAACAAGGATAAAATTGAGTTTATTAGC 6825
Query 5050 TTTGGGGAAAATGATGACGAAGAGCAAGAAGTGCTTCAAACAAAAGTGTCTGGGCTCATG 5109
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6826 TTTGGGGAAAATGATGACGAAGGGCAAGAAGTGCTTCAAACAAAAGTGTCTGGGCTCATG 6885
Query 5110 CACAGCTTAGGCATTCCAAGTATTTCTGAGGTGGTAAAGCGTGAAGCGAAATATGAAGGT 5169
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6886 CACAGTTTGGGCATTCCAAGTATTTCTGAGGTGGTAAAGCGTGAAGCGAAATATGAAGGT 6945
Query 5170 TTGCAAGATAATACTGTAACAGTATCACTTGTTAACTGGGCTCTGCCTTACGCACAGCGA 5229
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 6946 TTGCAAGATAATACTGTAACAGTGTCACTTGTTAACTGGGCTCTGCCTTATGCACAGCGG 7005
Query 5230 TATATCTTTACTCTTCATCATGAGAAGTACACCCAAACAAAAAAGACAGTCCATAGTCAA 5289
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7006 TATATCTTTACTCTTCATCATGAGAAGTATACCCAAACAAAAAAGACAGTCCATAGTCAA 7065
Query 5290 GTCAAACGTCTACAAGTCTTTGTTGTTGATAAGTTATGCTATAGGAATGTCATACCGCAA 5349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 7066 GTCAAACGTCTACAAGTCTTTGTTGTTGATAAGTTATCCTATAGGAATGTCATACCGCAA 7125
Query 5350 CATGGCATTAGCTCTAACAGGGAGATCAAATGCAGCTCTCTTCTGCAGGATAAAGCTCTG 5409
||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7126 TATGGCATCAGCTCTAAAAAGGAGTTCAAATGCAGTTCTCTTCTGCAGGATAAAGCTCTG 7185
Query 5410 TACACAACACCATGTCTAGATTCCCATTCCATGTTCATGGAACTGTCTCGTTTGTTTTTC 5469
|||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7186 TACACAACACCAAGTCTGGATTCCCATTCCTTGTTCATGGAACTGTCTCGTTTGTTTTTC 7245
Query 5470 AACGGAGTTCCTGATCTGCATTTGGCAAATTTCCTTCACTTGATAAAAACTATGGCGGAA 5529
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||
Sbjct 7246 AACGGAGTGCCTGATCTGCATTTGGCAAATTTCCTTCACTTGATCAAAACAATGGCAGAA 7305
Query 5530 TCTGGGTTGAGCGAGGAGCAAATGGACTCATTCATTCTGAACAGTCAGAAAGTTCATCAG 5589
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7306 TCTGGGTTGAGCGAGGAGCAAATGGAATCCTTCATTCTGAACAGTCAGAAAGTTCATCAG 7365
Query 5590 ATTCCTGATGGTGAAAAGATCTGGTCCCTTAAATCTGCTGTTAAAGCGAAGAAGAAAGCT 5649
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7366 GTTCCTGATGGTGAAGAGATCTGGTCCCTCAAATCTGCTGTTAAAGCGAAGAAGAAAGCT 7425
Query 5650 GGAATACGCTTGAGTTGGTTACCTTCAAGTTCCAAAACAGGACGTGGTTCTAGCAAGACT 5709
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||
Sbjct 7426 GGAATAAGCTTGAGCTGGTTACCTTCAAGTTCTAAAACAAGACATGGTTCTAGCAAGACC 7485
Query 5710 AACACTGATGATTCTAAACAAGAGCTGGCCTCTAGCAGCAGCAAAGAGTATGTAACAGAG 5769
|||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 7486 AACACTGATGATTCTAAACAAGAGCTGGACACTAGTAGCAGCAAAGAGGATGTAACAGAG 7545
Query 5770 GCTCTTGAGGAAAAAATACCGACTGA-A--ACCGATACCAACTTGGTTTCAGGATATGAT 5826
|||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 7546 GCTCTTGAAGAAAAAATACCGATTGAGATGACCAATACCAACTTGGTTTCTGGATATGAT 7605
Query 5827 AATTGTGCAGGCACAAGTTCACGAGCTAGTGTGCCAAACCCATTGCATTCTATGCATATG 5886
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 7606 AATTGTGCAGGCACAAGTTCACGAGCTAGTGAGCCAAACCCGTTGCATTCTATGCATATG 7665
Query 5887 ATTAGTGGCTCAACCTCAGGGAATCAGGCTGCTATTCACCTCAACCCAAATCTTCCACAT 5946
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 7666 ATTAGTGGCTCAACCTCAGGGAATCAGGCTGCTATGCATCTCAATCCAAATCTTCCTCAT 7725
Query 5947 GAATGGAACAATTCCTTCACAGCTAATTTCAGCGATAGAGATCAGCTTCATACCGGCACA 6006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 7726 GAATGGAACAATTCCTTCACAGCTAATTTCAGCGATAGAGACCAGCTTCATACAGGCACA 7785
Query 6007 CCTTGGGCTGCACAAGCGCAACAGACCGGTAGAAAAGGTGAAGAAATCGCTTATAGATAC 6066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 7786 CCTTGGGCTGCACAAGCGCAACAGACCGGTAGAAAAGGTGAAGAAATCGCTTACAGATAC 7845
Query 6067 TTTGTTGCGAAATACGGCAATGAGGCTCTGGTTAGATGGGTTAACGACCAGAGCGAAACT 6126
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7846 TTTGTTGCAAAATACGGCAATGAGGCACTGGTTAAATGGGTTAACGACCAGAGCGAAACC 7905
Query 6127 GGTTTACCTTACGACCT-ACTGATTGAAAACCGGGGTGGTAAGAAAGAGTACGTAGAGGT 6185
||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 7906 GGTTTACCTTACGACCTCA-TGATCGAAAACCGAGGTGGTAAGAAAGAGTACGTGGAGGT 7964
Query 6186 GAAAGCAACGGTGTCTACACGGAAAGACTATTTCAACTTGACAGTGAGGGAATGGCAATT 6245
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7965 GAAAGCAACGGTATCGACACGGAAAGACTATTTCAACTTGACAGTGAGGGAATGGCAATT 8024
Query 6246 TGCAAGTGAGAAAGGAGAGAATTACATAATTGCTCATGTTTTGTTAGGAAACAGTAATGC 6305
||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8025 TGCAAATGAGAAAGGAGAGAGTTACATAATAGCTCATGTTTTGTTAGGAAACAGTAATGC 8084
Query 6306 AATCCTCACACAGCATAAAAACCCGGTCAAGTTATGCCAAGAAGGTCATCTCCGGTTATT 6365
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 8085 AATCCTCACACAGCATAGAAACCCGGTCAAGTTATGCCAAGAAGGTCATCTCCGGTTATT 8144
Query 6366 GATTCTCATGCCTAACCAGAGAAACGAGGTCAATGTTTCATTTTAA 6411
| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct 8145 GGTTCTCATGCCCAACCAGAGAAACGAGGTCAACGTTACATTTTAA 8190
> AT1G08300.1 | Symbols: NVL | no vein-like | chr1:2614774-2618823
FORWARD LENGTH=2241
Length=2241
Score = 446 bits (241), Expect = 2e-123
Identities = 378/444 (85%), Gaps = 10/444 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 5956 AATTCCTTCACAGCTAATTTCAGCGAT-AGAGATCAGCTTCATACCGGCACACCTTGGGC 6014
|||||| || || || | |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||
Sbjct 1678 AATTCCGTCTCAACTGACTTCAGC-ATAAGAAATCAGCTTCATACCGGCGCACTTTGGGC 1736
Query 6015 TGCACAAGCGCAACAGACCGGTAGAAAAGGTGAAGAAATCGCTTATAGATACTTTGTTGC 6074
|||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 1737 TGCACAGGCGCAAGAGTCCGGTAAAAAAGGTGAAGAAATAGCTTACAGATACTTTGTTGC 1796
Query 6075 GAAATACGGCAATG-AGGCTCTGGTTAGATGGGTTAACGACCAGAGCGAAACTGGTTTAC 6133
||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||||| || || || ||||| || ||||
Sbjct 1797 AAAATATGGCAA-GAAGGCACTGGTTAAATGGGTTAATGAGCATAGTGAAACCGGATTAC 1855
Query 6134 CTTACGACC-TACTGATTGAAAACCGGGGTGGTAAGAAAGAGTACGTAGAGGTGAAAGCA 6192
||||||||| || | || |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 CTTACGACCTTA-TCATCGAAAACAGAGGAGGTAACAAAGAGTACGTAGAGGTGAAAGCA 1914
Query 6193 ACGGTGTCTACACGGAAAGACTATTTCAACTTGACAGTGAGGGAATGGCAATTTG-CAAG 6251
|| || || ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | |||| |||
Sbjct 1915 ACTGTATCCACAGGGAAAGACTATTTCAATTTGTCAGTGAAGGAATGGGAGTTTGCCAA- 1973
Query 6252 TGAGAAAGGAGAGAATTACATAATTGCTCATGTTTTGTTAGGAAACAGTAATGCAATCCT 6311
|||||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 1974 TGAGAAAGGAGAGAGTTACGTTATAGCTCATGTTTTATTAGGCAACAGTAATGCCATCCT 2033
Query 6312 CACACAGCATAA-AAACCCGGTCAAGTTATGCCAAGAAGGTCATCTCCGGTTATTGATTC 6370
|||||| || || || | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2034 CACACAACA-AAGGAATCTTGTCAAATTACGCCAAGACGGTCATCTCCGGTTATTGATTC 2092
Query 6371 TCATGCCTAACCAGAGAAACGAGG 6394
||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 2093 TCATGCCTAGCCAGCGAAACGAGG 2116
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 320001115603
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5