BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg891409
Length=3798
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G37830.1 | Symbols: OXP1 | oxoprolinase 1 | chr5:15056188-15... 5984 0.0
> AT5G37830.1 | Symbols: OXP1 | oxoprolinase 1 | chr5:15056188-15060777
REVERSE LENGTH=4351
Length=4351
Score = 5984 bits (3240), Expect = 0.0
Identities = 3613/3797 (95%), Gaps = 9/3797 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGAACTGTGATTGAAGAAAAGCTAAGATTTTGTATTGACAGAGGAGGAACTTTCACT 60
||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||
Sbjct 104 ATGGGAACTGTAATCGAAGGAAAGCTAAGATTTTGTATAGATAGAGGAGGTACTTTCACT 163
Query 61 GATGTGTACGCTGAGATTCCAGGACATTCCGATGGTCATGTTTTGAAGCTTTTATCAGTT 120
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 164 GATGTATACGCTGAGATTCCAGGACATTCCGATGGTCATGTGTTGAAGCTTTTATCAGTT 223
Query 121 GATCCATCGAATTACGACGACGCTCCGGTCGAAGGAATTCGGAGAATACTCGAGGAGTAT 180
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 GATCCATCGAATTACGACGATGCTCCGGTCGAAGGAATTCGGAGAATACTCGAGGAGTAT 283
Query 181 ACAGGGAAGAAGATACCAAGAACGTCTAAGATACCAACTGATAAGATTCAGTGGATTAGG 240
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 284 ACAGGGAAGAAGATACCAAGAACGTCGAAGATACCAACTGATAAGATACAGTGGATTAGA 343
Query 241 ATGGGGACTACTGTGGCAACCAACGCGTTGTTGGAGAGGAAAGGGGAACGGATCGCTTTG 300
||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||
Sbjct 344 ATGGGAACTACTGTGGCAACGAATGCTTTGTTAGAGAGGAAAGGTGAAAGAATAGCTTTG 403
Query 301 TGTGTTACTAAAGGGTTTAAAGATTTGTTGCAGATAGGTAATCAAGCTAGGCCTGATATT 360
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 404 TGTGTAACTAAAGGGTTTAAAGATTTGTTGCAGATAGGTAATCAAGCTAGACCTGATATT 463
Query 361 TTCGATCTTACTGTTGCGAAACCGTCGAATCTTTatgaggatgtgattgaggttgatgaa 420
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||
Sbjct 464 TTTGATCTTACTGTTGCGAAACCGTCGAATCTTTATGAGGAGGTTATAGAGGTTGATGAA 523
Query 421 agagttgtgcttgggttggatggtgatgatgatgatg-ataat--ttgatTAAAGGAGTG 477
||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | | |||||||||||||||
Sbjct 524 AGAGTTGTGCTTGCGTTGGAAGATGATGATGATGATGAAGGGTCGTTGATTAAAGGAGTG 583
Query 478 TCTGGTGAGTTTGTTAGAGTTGTGAAACCGTTTGATGGAGATGGTTTGAAACCGTTGTTG 537
||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 584 TCTGGGGAGTTTCTTAGAGTTGTGAAGCCGTTTGATGGAGAAGGTTTGAAACCTTTGTTG 643
Query 538 AAGGGTTTGCTTGATAGAGGGATAAGTTGTTTGGCGGTTGTTTTGATGCATTCGTATACT 597
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644 AAGGGTTTGCTTGATAAAGGGATAAGTTGTTTGGCTGTTGTTTTGATGCATTCGTATACT 703
Query 598 TATCCGAAGCATGAGATTGCGGTGGAGAAGTTGGCTTTGGAGATGGGTTTTATACATGTT 657
||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||
Sbjct 704 TATCCGAAGCATGAGATGGATGTGGAGAAGTTGGCTTTAGAGATGGGTTTTAGACATGTT 763
Query 658 TCGTTGTCTTCTGCTTTGACTCCTATGGTTCGGGCTGTTCCTCGGGGTTTAACAGCTACT 717
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 TCGTTGTCTTCTGCTTTGACACCCATGGTTCGGGCTGTTCCTCGGGGTTTAACAGCTACT 823
Query 718 GTGGATGCTTATTTGACTCCGGTGATTAAAGAGTACTTATCGGGTTTCATTTCGAAGTTT 777
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||
Sbjct 824 GTGGATGCGTATTTGACACCAGTGATTAAAGAGTACTTGTCGGGTTTTATTTCCAAATTT 883
Query 778 GATGATGATCTTGGGAAAGTGAATGTTTTATTCATGCAATCTGATGGAGGTTTAGCACCA 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 GATGATGATCTTGGGAAAGTGAATGTTTTATTCATGCAATCTGATGGAGGTTTAGCACCA 943
Query 838 GAAAGTAGGTTTTCAGGGCATAAGGCTGTGTTGTCAGGTCCAGCAGGAGGAGTTGTTGGT 897
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 944 GAAAGTAGGTTTTCAGGGCATAAGGCTGTGTTATCAGGTCCAGCAGGAGGAGTTGTTGGT 1003
Query 898 TACTCGCAGACTCTCTTTGGTCTTGAAACTGAAAAACCGTTGATTGGATTTGATATGGGT 957
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1004 TACTCACAGACACTCTTTGGTCTTGAAACTGAAAAACCGCTGATTGGATTTGATATGGGT 1063
Query 958 GGTACATCAACGGATGTTAGCCGCTATGATGGGAGTTATGAGCAAGTCATAGAAACACAG 1017
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 1064 GGTACGTCAACGGATGTTAGCCGCTATGATGGAAGTTATGAGCAAGTTATAGAAACTCAG 1123
Query 1018 ATTGCTGGAACAATCATACAAGCGCCACAGCTTGACATAAACACTGTTGCTGCTGGTGGT 1077
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||
Sbjct 1124 ATTGCTGGAACAATTATACAAGCGCCACAGCTTGACATAAATACCGTTGCTGCCGGTGGT 1183
Query 1078 GGGTCGAAACTAAAGTTTCAGTTTGGTGCTTTCCGGGTGGGACCTGATTCTGTGGGTGCT 1137
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GGGTCGAAACTAAAGTTTCAGTTTGGTGCTTTCCGAGTGGGACCTGATTCTGTGGGTGCT 1243
Query 1138 CACCCAGGTCCAGTTTGTTACCGGAAAGGAGGGGAGTTATCAGTTACTGATGCGAATCTC 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1244 CACCCAGGTCCAGTTTGTTACCGGAAAGGAGGTGAGTTAGCAGTTACTGATGCGAATCTT 1303
Query 1198 GTTTTGGGATTTGTTATTCCTGATTATTTTCCATCCAT-TTTCGGGCCTAATGAAGATCA 1256
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||
Sbjct 1304 GTTTTGGGGTTTGTTATTCCTGATTATTTTCCATCCATATTT-GGGCCCAATGAAGATCA 1362
Query 1257 GCCTTTAGATGTAGCGGCAACAAGAGAAGCATTTGAAAAACTTGCAGGACAGATTAAT-T 1315
||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
Sbjct 1363 GCCCTTAGATGTAGCAGCAACAAGAGAAGCATTTGAAAAGCTTGCAGGACAGATTAATAT 1422
Query 1316 CATATAGAAAGAGCCAGGATCCGTCTGCAAAGGACATGACAGTGGAGGCAATAGCAATGG 1375
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||
Sbjct 1423 -ATATAGAAAGAGCCAGGATCCATCTGCAAAAGACATGTCTGTGGAGGAAATAGCAATGG 1481
Query 1376 GGTTTGTGAGTGTTGCTAACGAGACAATGTGCCGTCCCATTCGGCAACTGACAGAGATGA 1435
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1482 GTTTTGTGAGTGTTGCTAACGAGACAATGTGCCGTCCCATACGGCAACTGACAGAGATGA 1541
Query 1436 AGGGTCATGAAACAAAGAATCATGCACTCGCATGCTTTGGAGGTGCTGGACCGCAGCATG 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1542 AGGGTCATGAAACAAAGAATCATGCACTCGCATGCTTTGGAGGTGCTGGACCGCAACATG 1601
Query 1496 CTTGTGCAATAGCCAGGTCTTTGGGCATGAAAGAAGTTCTTGTTCACAGATACTGTGGAA 1555
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602 CTTGTGCAATAGCTAGGTCTTTGGGCATGAAAGAAGTTCTTGTTCACAGATACTGTGGAA 1661
Query 1556 TTTTGAGTGCTTATGGAATGGGTTTGGCAGATGTTATAGAAGATGCTCAAGAGCCATATT 1615
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1662 TTTTGAGTGCTTATGGAATGGGTTTGGCAGATGTCATTGAAGATGCTCAAGAGCCATATT 1721
Query 1616 CAGCTGTTTATGGCCCTGAATCTCTTTCAGAGGCCTTTAGAAGGGAAGCTCTATTGCTGG 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||
Sbjct 1722 CAGCTGTTTATGGCCCTGAATCTCTTTCAGAGGTCTTTAGAAGGGAAACGGTATTGCTGA 1781
Query 1676 GAGAAGTGAGAGAGAAGCTCCAGGAGCAGGGTTTTGATAATGGAAGTATCTCCACTGAGA 1735
||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1782 GAGAAGTGAGAGAAAAGCTCCAGGAACAGGGGTTTGGTGATGGAAATATCTCCACTGAGA 1841
Query 1736 CATATTTGAATTTAAGATATGACGGGACAGATACAGCGATCATGGTAAAGGGTaaaaaaa 1795
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 CATATTTGAACTTAAGATATGATGGGACAGATACAGCTATCATGGTAAAGGGTAAAAAAA 1901
Query 1796 CTGGAGATGGGTTGGCATTTGATTATGCTGCAGAGTTTCTCAAGCTTTTTGAGCAAGAGT 1855
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1902 CTGGAGATGGGTCGGCATTTGATTATGCTGCAGAGTTTCTCAAGCTTTTCGAGCAAGAGT 1961
Query 1856 ATGGATTTAAACTTCAAAACAGAAATATTCTAATATGTGATGTTCGGGTTCGGGGAATTG 1915
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 ATGGATTTAAACTTCAAAACAGAAATCTTCTCATATGTGATGTTCGGGTTCGGGGAATTG 2021
Query 1916 GAGTGACTAGTATACTAAAACCACGGGCAGTTGAAGCTGCCCCTGGT-ACTCCTAAGGTT 1974
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 2022 GAGTGACTAGTATACTAAAACCACGGGCAGTTGAAGCTGCCCCT-GTCACTCCTAAGGTT 2080
Query 1975 GAAAGGCACTACAAAGTTTACTTTCAAGGCGGATGGCATGACACACCGTTGTTCAAGTTG 2034
|||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081 GAAAGGCACTACAAGGTTTACTTTGAAGGCGGATGGCATGACACACCGTTGTTCAAGTTG 2140
Query 2035 GAGAATTTAGGTTTTGGCCATGAGATTCCCGGCCCTGCAATCATCATGAACGGGAATAGT 2094
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2141 GAGAATTTAGGTTTTGGCCATGAGATTCTCGGCCCTGCGATCATCATGAACGGGAACAGT 2200
Query 2095 ACAGTTATTGTAGAACCTCAGTGCAAAGCCATCATTACAAAATATGGGAACATCAAAATT 2154
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||
Sbjct 2201 ACAGTTATTGTAGAACCTCAGTGCAAAGCCATCATTACAAAGTATGGAAACATTAAAATT 2260
Query 2155 GAGGTAGAGTCTGCAATGAGCAGTGTGAAGCTTGCAGAGAATGTTGCAGATGTTGTTCAA 2214
||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2261 GAGGTAGAGCCAGCAACGAGCAGTGTGAAGCTTGCAGAGAATGTTGCAGATGTTGTTCAG 2320
Query 2215 CTGTCCATATTTAATCACAGATTCATGGGTATAGCTGAGCAAATGGGAAGAACCCTGCAA 2274
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321 CTATCCATATTTAATCACAGATTCATGGGTATAGCTGAGCAAATGGGAAGAACCCTGCAA 2380
Query 2275 CGTACTTCTATATCGACAAATATCAAGGAACGATTGGATTTTTCTTGCGCCTTGTTTAGT 2334
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2381 CGTACTTCCATATCGACAAATATCAAAGAAAGATTGGATTTTTCATGCGCCTTGTTTAGT 2440
Query 2335 CCTGACGGTGGCTTAGTTGCTAATGCGCCACATGTTCCAGTTCATCTGGGTGCCATGTCA 2394
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 CCTGACGGTGGCTTAGTTGCTAATGCGCCACATGTTCCAGTTCATCTGGGTGCCATGTCC 2500
Query 2395 AGTACAGTTCGCTGGCAGCTCAAACATTGGGGTGAAAATCTGAACGAAGGAGATGTTTTG 2454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2501 AGTACAGTTCGCTGGCAGCTCAAACATTGGGGTGAAAATCTGAACGAAGGAGATGTTTTG 2560
Query 2455 GTAACAAATCATCCTTGCGCCGGTGGTAGCCATTTGCCTGATATAACCGTTATCACGCCT 2514
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2561 GTAACAAATCATCCTTGCGCCGGTGGTAGCCATTTGCCTGATATAACCGTTATCACACCT 2620
Query 2515 GTTTTTGACAATGCAAAGCTTGTGTTCTTCGTAGCTAGTAGAGGTCACCACGCAGAAGTT 2574
||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2621 GTTTTTGACAAGGGAAAGCTTGTGTTCTTTGTGGCTAGTAGAGGTCACCACGCAGAAGTA 2680
Query 2575 GGAGGTATAACTCCCGGTAGCATGCCTCCGTTCTCAAAGGCGATTTGGGAAGAAGGTGCT 2634
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 2681 GGAGGCATAACTCCCGGAAGCATGCCTCCGTTCTCAAAGGCGATTTGGGAGGAAGGAGCT 2740
Query 2635 GCGATAAAAGCGTTTAAAGTTGTTGAAAAAGGTGTTTTTCAGGAAGAAGGAATTGTTAAA 2694
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2741 GCGATAAAAGCATTTAAAGTTGTTGAAAAAGGTGTTTTTCAGGAAGAAGGAATTGTAAAA 2800
Query 2695 CTTCTTCAATTCCCTTCTTCTGATGAGACAACAGCTAAGATTCCAGGAACCAGGCGGATT 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2801 CTTCTTCAATTCCCTTCTTCTGATGAGACAACAACTAAGATTCCAGGAACCAGACGGATT 2860
Query 2755 CAGGACAATCTCTCAGATCTTCAAGCTCAGATAGCTGCAAACCAAAGAGGAATTTCTCTA 2814
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861 CAGGACAATCTCTCGGATCTCCAAGCTCAGATAGCTGCAAACCAAAGAGGAATTTCTCTA 2920
Query 2815 ATTAAAGAGTTGATTGAGCAATATGGTCTTGGAACTGTTCAGGCTTACATGAAATATGTT 2874
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2921 ATTAAAGAGCTGATTGAGCAATATGGCCTTGGAACTGTTCAGGCTTACATGAAATACGTT 2980
Query 2875 CAGCTTAACGCTGAAGAAGCAGTGAGAGAAATGCTGAAGTCTGTAGCTATTAGAGTCTCC 2934
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct 2981 CAGCTTAACGCCGAAGAAGCAGTGAGAGAAATGCTGAAGTCTGTAGCTAATAGAGTTTCC 3040
Query 2935 TCGGAAACACCAAATTCCAGGGTTGGTAATTCTGTGACCATAGAAGAAGAGGATTACATG 2994
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3041 TCGGAAACACCAAATTCCAGGGTTGGTAACTCCGTGACCATAGAAGAAGAGGATTACATG 3100
Query 2995 GATGATGGATCCGTCATTCACTTAAAACTCACAATTGATGCTGACAAAGGAGAAGCCTTC 3054
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct 3101 GATGATGGATCCATAATTCACTTAAAACTCACAATTGATGCCGACAAAGGAGAAGCCTCC 3160
Query 3055 TTTGACTTTACAGGCACAAGCCCGGAAGTCTATGGTAACTGGAATGCCCCAGAAGCAGTT 3114
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3161 TTTGACTTTACAGGCACAAGCCCGGAAGTCTACGGTAACTGGAATGCCCCAGAAGCAGTT 3220
Query 3115 ACATCTGCAGCAGTTATTTACTGCCTCCGTTGTTTGGTTAATGTCGACATTCCGCTAAAC 3174
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3221 ACATCTGCAGCGGTTATTTACTGCCTCCGTTGTTTGGTTAATGTCGACATTCCGCTAAAC 3280
Query 3175 CAAGGCTGCTTAGCTCCGGTTGAGATCCGGATACCCGCTGGTTCATTCCTGTCTCCAAGC 3234
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3281 CAAGGCTGCTTAGCTCCGGTTGAGATCCGCATACCCGCTGGTTCATTCCTGTCTCCAAGC 3340
Query 3235 GAAAAAGCAGCTGTTGTTGGAGGCAACGTTCTAACATCCCAGAGAGTTACAGATGTTGTT 3294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3341 GAAAAAGCAGCTGTTGTTGGAGGCAACGTTCTAACATCCCAGAGAGTTACAGATGTTGTC 3400
Query 3295 TTAACAGCTTTCCAGGCTTGTGCTTGTTCCCAAGGATGCATGAACAATCTCACATTTGGA 3354
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3401 CTAACAGCATTCCAGGCTTGTGCTTGTTCCCAAGGATGCATGAACAATCTCACATTTGGA 3460
Query 3355 GACGACACATTTGGGTACTACGAGACCATTGGTGGAGGATGCGGAGCCGGACCCACATGG 3414
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3461 GACGACACATTTGGGTACTACGAGACCATTGGTGGTGGATGCGGAGCCGGACCCACATGG 3520
Query 3415 GACGGTACAAGCGGAGTCCAATGCCATATGACTAACACGCGGATGACTGATCCCGAGATC 3474
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3521 AACGGGACAAGCGGAGTCCAATGCCATATGACTAACACGCGGATGACTGATCCCGAGATC 3580
Query 3475 TTCGAGCAAAGGTACCCGGTTCTGTTGCATAAATTTGGATTGAGAGAGAACAGTGGAGGT 3534
|| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3581 TTTGAGCAAAGGTACCCGGTTCTGTTGCATAGATTTGGATTGAGAGAGAATAGTGGAGGC 3640
Query 3535 AATGGGTTGCATAAAGGAGGCGATGGATTGGTGAGAGAGATAGAGTTTAGAAAGCCAGTG 3594
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3641 AATGGGTTGCATAAAGGAGGCGATGGATTGGTGAGAGAGATAGAGTTTAGAAAGCCTGTA 3700
Query 3595 GTGGTTAGTATCCTCTCAGAGAGACGAGTACACTCGCCACGTGGATTGAACGGTGGCCAA 3654
|||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 GTGGTTAGCATCCTCTCAGAGAGAAGAGTTCACTCGCCACGTGGATTGAACGGTGGCCAA 3760
Query 3655 AACGGAGTTCGTGGAGCAAACTATCTCATCACTAAAGACAAACGAAGAATCTATCTTGGA 3714
|| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3761 AATGGACTCCGTGGAGCAAACTATCTCATCACTAAAGACAAACGAAGAATCTATCTTGGA 3820
Query 3715 GGCAAGAATACAGTACATGTAGAAGCCGGTGAAATCCTACAGATTCTTACTCCAGGCGGT 3774
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3821 GGCAAGAATACGGTACACGTAGAAGCCGGTGAAATCTTACAGATTCTTACTCCAGGCGGT 3880
Query 3775 GGCGGATTCGGTTCCAA 3791
||||||||||| |||||
Sbjct 3881 GGCGGATTCGGCTCCAA 3897
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 189179542053
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5