BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg892758
Length=3846
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G08310.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like s... 3777 0.0
AT5G08305.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 2067 0.0
> AT5G08310.1 | Symbols: | Tetratricopeptide repeat (TPR)-like
superfamily protein | chr5:2672756-2675254 REVERSE LENGTH=2499
Length=2499
Score = 3777 bits (2045), Expect = 0.0
Identities = 2290/2410 (95%), Gaps = 10/2410 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCCTTCTCGAGAATTGCTCTTCTTTGCCAACGATTCTCTAGacaacaacaacaacaa 60
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCTTCTCGAGAATCGCTCTTCTTTGCCAACGATTCTCTAG---ACAACAACAACAA 57
Query 61 cGCCAA---CTTCACAGACCATTCACTACAG-AGCTAGATAACACCAGATTTCTCTATCC 116
|||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct 58 CGCCAACTTCTTCACAGACCACTCACTAC-GAAGCTAGATAACACCAGATTCCTCCATCC 116
Query 117 CAATCAATCCAAGCTTGCCCAAAACCTGATTGCGATCTTCACAAGACAACCTTTTTCCCC 176
||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 117 CAATCAATCCAAGCTTGCCCAAAACCTAATCGTGATCTTCACTAGACAACCTTTTTCACC 176
Query 177 TGACGACCCTGAGCTATTAAAACTCGCTCCAGAGCTCAACACCAAGGTAGTTGAAACAGT 236
|||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 177 TGACGACCCTGAGCTACTGATACTCTCTCCAGAGCTCAACACCAAGGTAGTCGAAACCGT 236
Query 237 CTTGAATGAATTCAAAAGATGGGGTTTGGCTTATCTTTTCTTCAATTGGGCTTGTAAACA 296
|||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 237 CTTGAATGGATTCAAAAGGTGGGGTTTGGCTTATCTGTTCTTCAATTGGGCTTCTAAACA 296
Query 297 GGAAGGTTATAGAAACGATATGTATGCTTACAATGCCATGGCTTCTATCCTATCACGTGC 356
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAGGTTACAGAAACGATATGTATGCTTACAATGCCATGGCTTCTATCCTATCACGTGC 356
Query 357 TCGACAAAATGCCTCACTGACGGCTTTGGTTGGAGATATTCTGAATTCTCGTTGTTTAAT 416
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||
Sbjct 357 TCGACAAAATGCCTCACTGAAAGCTTTGGTTGTAGATGTTCTGAATTCTCGTTGTTTCAT 416
Query 417 GTCTCCCGGAGCGTTAGGGTTTTTTATTCGGTGTTTGGGTAATGCTGGGCTAGTGGAAGA 476
|||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 417 GTCTCCTGGAGCTTTCGGGTTTTTCATTCGGTGTTTAGGTAATGCTGGGCTAGTGGATGA 476
Query 477 AGCAAGTTCTGTTTTTGATCGAGTTAGAGAGATGGGTCTTTGTGTTCCTAATGCTTATAC 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 AGCAAGTTCTGTTTTTGATCGAGTTAGAGAGATGGGTCTTTGTGTTCCTAATGCTTATAC 536
Query 537 ATATAACTGTTTGTTAGAAGCAATTTCTAAGTCGAATTCAAGTTCGGTTGAGTTGGTTGA 596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||
Sbjct 537 TTATAACTGTTTGTTAGAAGCAATTTCTAAGTCGAATTCGAGCTCTGTTGAGTTGGTTGA 596
Query 597 GGCGAGGTTGCAGGAGATGAGGGATTGCGGTTTTCATTTCGATAAATTTACTCTTACACC 656
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GGCGAGGTTGAAGGAGATGAGGGATTGCGGTTTTCATTTCGATAAATTTACTCTTACACC 656
Query 657 AGTTTTGCAGGTTTATTGCAACAATGGGAAGTCCGAGAGAGCGTTGAGTGTTTTTAATGA 716
||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 657 AGTTTTGCAGGTTTATTGCAACACTGGTAAGTCTGAGAGAGCGTTGAGTGTTTTCAATGA 716
Query 717 GATTCTTAGTAGAGATTGGCTTGATGAACATATTTCAACCATCTTGGTTGTGTCATTTTG 776
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 717 GATTCTTAGTAGAGGTTGGCTTGATGAACATATTTCAACGATTTTGGTTGTTTCATTTTG 776
Query 777 TAAGTGGGGTCAGGTGGATAAGGCCTTT-GAGTTGATTGAGATGCTCGAAGAACGCCATA 835
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 777 TAAGTGGGGTCAGGTGGATAAGG-CTTTCGAGTTGATTGAGATGCTTGAAGAACGAGATA 835
Query 836 TTAGGTTGAACTATAAGACATTTTGTGTTTTGATTCATGGATTTGTAAAGGAGTCTCGGA 895
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 836 TTAGGTTGAACTATAAGACATATTGTGTTTTGATACATGGATTCGTAAAGGAGTCACGGA 895
Query 896 TTGATAAAGCATTTCAGTTGTTTGAGAAAATGCGTCGGATGGGTATGAACGCTGATATTG 955
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 896 TTGATAAAGCTTTTCAGTTGTTTGAGAAAATGCGTCGGATGGGTATGAACGCTGATATTG 955
Query 956 CATTGTATGATGTGTTGATAGGAGGACTTTGCAAGCATAAAGATCTTGAGATGGCTCTGA 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 956 CATTGTATGATGTGTTGATAGGAGGACTTTGCAAGCATAAAGATCTTGAGATGGCGCTGA 1015
Query 1016 GTTTGTATTTGGAGATTAAGAGGTCGGGAATCCCACCTGATAGAGGAATACTTGGGAAGC 1075
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016 GTTTGTATTTGGAGATTAAGAGGTCAGGAATTCCACCTGATAGAGGAATACTTGGGAAGC 1075
Query 1076 TATTATGTTCATTTTCTGAAGAAAGTGAATTAAGTCGGATAACAAAAGTGATCATTGGAG 1135
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 1076 TATTATGTTCATTTTCCGAAGAAAGTGAATTAAGTCGAATAACAGAAGTGATCATTGGAG 1135
Query 1136 ACATAGACACAAAATCTGTGATGCTTCTTTATAAATCTTTGTTGGAGGGGTTTATTAGGA 1195
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1136 ACATAGACAAAAAATCTGTGATGCTTCTTTACAAATCTTTGTTTGAGGGGTTTATTAGGA 1195
Query 1196 ATGATTTGGTGCATGAGGCTTACAGTTTTATTCAGAACCTCATGGGAAATCATGAGTCGG 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 1196 ATGATTTGGTGCATGAGGCTTACAGTTTTATTCAGAATCTCATGGGAAATTATGAGTCGG 1255
Query 1256 ATGGTATGTCTGAGATTGTGAAGCTTCTTAAGGATCAAAATAAAGCAATCCTCCCAGATT 1315
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 ATGGTGTGTCTGAGATTGTTAAGCTTCTTAAGGATCATAATAAAGCAATCCTCCCAGATT 1315
Query 1316 CAGATTCTCTTAGCATTGTGATTGACTGCTTAGTCAAAGCTAACAAGGTGAATATGGCAG 1375
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1316 CAGATTCTCTTAGCATTGTGATTAATTGCTTAGTCAAAGCTAACAAGGTGGATATGGCAG 1375
Query 1376 TGACCTTGTTACATGATATTGTCCAGAATGGTCTTATTCCAAGTCTTATGATGTACAACA 1435
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 1376 TGACCTTGTTACATGATATTGTCCAGAATGGCCTTATTCCAGGTCCTATGATGTACAACA 1435
Query 1436 ACATAATAGAGGGGATGTGTAAAGAAGGAAGGTCGGAAGAAAGCTTGAAACTCTTAGCAG 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1436 ACATAATAGAGGGGATGTGTAAAGAAGGAAGGTCGGAAGAAAGCTTGAAACTCTTAGGAG 1495
Query 1496 AAATGAAGGATGCCGGAGTTGAACCAAGTCAATACACACTTAATTGTATTTATGGTTGCT 1555
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 AAATGAAGGATGCCGGAGTTGAACCAAGTCAATTCACGCTTAATTGTATTTATGGTTGCT 1555
Query 1556 TGGCTGAACGATGCGATTTTGCAGGAGCATTGGACCTGCTGAAAAAGATGCGTTTTTATG 1615
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 TGGCTGAACGATGCGATTTTGTAGGAGCATTGGACCTGCTGAAAAAGATGCGTTTTTATG 1615
Query 1616 GATTTGAGCCATGGATAAAGCATACTACCTGTCTTGTCAAAAAACTTTGCGAGAATGGAA 1675
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 GATTTGAGCCATGGATAAAGCATACTACCTTTCTTGTCAAAAAACTTTGCGAGAATGGAA 1675
Query 1676 AGGCTGTTAATGCTTGCAAATACATTGATGATGTAGCTGGAGAAGGTTTCCTTCGTCACA 1735
||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1676 GGGCTGTTGATGCTTGCAAGTACCTTGATGATGTAGCTGGAGAAGGTTTCCTTGGTCACA 1735
Query 1736 TGGTTTCCTATACTGCTGCAATTGAGGGTCTCATAAGAAATGAGGGAGTAGATAGAGGTT 1795
||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1736 TGGTTGCCTCTACTGCTGCGATTGATGGCCTCATAAAAAATGAGGGAGTAGATAGAGGTT 1795
Query 1796 TAGAGTTATTCCGAGACACATGTGCCAATGGTCACTGCCCTGATGTGATTGCATATCATG 1855
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 TAGAGTTATTCCGAGACATATGTGCCAATGGTCACTGCCCTGATGTGATTGCATATCATG 1855
Query 1856 TATTGATAAAGGCTCTATGTAAAGCGTGTCGAACTACGGAAGCTGATAACCTGTTTAACG 1915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |
Sbjct 1856 TATTGATAAAGGCTCTATGTAAAGCGTGTCGAACTATGGAAGCTGATATCCTATTTAATG 1915
Query 1916 AAATGGTATCAAAAGGACTAAAACCTTCTGTTGCTACTTATAACAGTATGATAGATGGAT 1975
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 AAATGGTATCAAAAGGACTAAAACCTACTGTTGCTACTTATAACAGTATGATAGATGGAT 1975
Query 1976 GGTGCAAGGAAGGTGAGATTGACCGGGGCCTGTCTTGTATAGTGAGGATGTATGAGGATG 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1976 GGTGCAAGGAAGGTGAGATTGACCGGGGCCTGTCTTGTATAGTGAGGATGTATGAGGATG 2035
Query 2036 AGAAAAACCCTGATGTTATTACTTACACTAGCTTAATACACGGGCTATGCGCTAGCAGAA 2095
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 2036 AGAAAAACCCTGATGTTATTACTTACACTAGCTTAATACATGGGCTATGCGCTAGCGGAA 2095
Query 2096 GACCTAGTGAAGCAATCTCTCGTTGGAATGAAATGAAGGGCAAAGATTGCTATCCAAATA 2155
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2096 GACCTAGTGAAGCAATCTTTCGTTGGAATGAAATGAAGGGAAAAGATTGCTATCCAAATA 2155
Query 2156 GAATTACTTTCATGGCACTTATTCAGGGTCTTTGCAACTGTGGCTGGTCTAGTGAAGCCT 2215
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||
Sbjct 2156 GAATTACTTTTATGGCACTTATTCAGGGTCTTTGCAAGTGTGGCTGGTCTGGTGAGGCCT 2215
Query 2216 TAGTTTATTTTCGTGAGATGGAAGAAAAGGAAATGGAGCCTGATTCAGCTGTTTACTTAT 2275
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 TAGTTTATTTTCGTGAGATGGAAGAAAAAGAAATGGAGCCTGATTCAGCTGTTTACTTAT 2275
Query 2276 CCCTCGTAAGCTCTTTTCTGTCAAGTGAAAACATCAGTGCCGGGTTTGGGATATTCAGAG 2335
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2276 CACTCGTAAGCTCTTTTCTGTCAAGTGAAAACATCAATGCTGGGTTTGGGATATTCAGAG 2335
Query 2336 AAATGGTTCATAAAGGAAGATTTCCGGTTTCAGTAGATAGGAACTATCTGCTTGCAGTTG 2395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 2336 AAATGGTTCATAAAGGAAGATTTCCGGTTTCAGTAGATAGGAACTATATGCTTGCTGTTA 2395
Query 2396 ATGCTACAAG 2405
||| ||||||
Sbjct 2396 ATGTTACAAG 2405
> AT5G08305.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr5:2670134-2671765 REVERSE LENGTH=1632
Length=1632
Score = 2067 bits (1119), Expect = 0.0
Identities = 1343/1450 (93%), Gaps = 19/1450 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 2405 GCGACGTCAATTACGCTTACAAGTTATTGTCGAAACTATCTAATCCTCCTG-ATTACGGC 2463
||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||
Sbjct 194 GCGACGTTGACTACGCTTACAAATTCTTGTCAAAACTATCTGATCCTCC-GAATTACGGA 252
Query 2464 TGGAATTTCGTCATACGAGGTTTCTCCAATAGCAAAAACCCCGAGAAATCGATTC-GTGT 2522
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||
Sbjct 253 TGGAATTTCGTAATACGAGGTTTCTCCAATAGCAGAAACCCCGAGAAATCGA-TCAGCGT 311
Query 2523 CTATATCCAGATTTTGAGGTCCGGGTT-TTCACCTGATCATATGACTTATCCGTTTCTTC 2581
|||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 312 CTATATCCAGATGTTGAGGTTCGGGTTATT-ACCTGATCATATGACTTATCCGTTTCTTA 370
Query 2582 TGAAGTCGAGTTCTCGTCTCTCGAACAGAGAAA-TTGGTGGGTCTTTGCATTGCTCCGTG 2640
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGAAGTCGAGTTCTCGTCTCTCGAACAGA-AAACTTGGTGGGTCTTTGCATTGCTCCGTG 429
Query 2641 GTTAAAACTGGGCTTGAGTGGGATTTGTTCATATGTAATACTCTTATTCATATGTATGGT 2700
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 GTTAAATCTGGGCTTGAGTGGGATTTGTTCATATGTAATACTCTTATTCATATGTATGGT 489
Query 2701 ACGTTCCGAGACAAAGCTTCTGCGCGCAAGTTGTTCGATGAAATGCCTTATAAGAACTTG 2760
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 490 TCGTTCCGAGACCAAGCTTCTGCGCGCAAGTTGTTCGATGAAATGCCTCATAAGAACTTG 549
Query 2761 GTTACTTGGAACTCTATTTTGGATTCCTATGCGAAGTCCGGGGATGTTGTTTCGGCAAGA 2820
|||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||
Sbjct 550 GTTACTTGGAACTCTATTTTAGATGCGTATGCCAAGAGCGGGGATGTTGTTTCAGCAAGA 609
Query 2821 CTGGTGTTTGATGAAATGACTAAGAGAGATGTTGTGTCTTGGAGTTCTATGATCGATGGG 2880
||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 CTGGTGTTTGATGAAATGAGTGAGAGAGATGTTGTGACTTGGAGTTCTATGATCGATGGC 669
Query 2881 TATGTAAAAAGTGGTGAATATAATGAAGCATTGGAAATTTTCGATCAGATGATGAGAATG 2940
||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 TATGTAAAAAGAGGTGAATATAACAAAGCGTTGGAAATTTTCGATCAGATGATGAGAATG 729
Query 2941 GGTTCATCAAAGGCAAATGAAGTCACTATGGTTAGCGTTTTGTGCGCTTGTGCTCACTTG 3000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 730 GGTTCATCAAAGGCAAATGAAGTCACTATGGTTAGCGTTATATGCGCTTGTGCTCACTTG 789
Query 3001 GGTGCGCTAAATCGAGGGAAG-GTGGTACATCGCTATATACTCGATGTGCATTTGCCCTT 3059
||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 790 GGTGCGCTAAATCGAGGAAAGACT-GTACATCGCTATATACTCGATGTGCATTTGCCGTT 848
Query 3060 AACAGTTATATTGCAGACATCTCTTATTGATATGTATGCTAAATGCGGGTCGATAAGAGA 3119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||
Sbjct 849 AACAGTTATATTGCAGACATCTCTTATTGATATGTATGCGAAATGCGGATCGATAGGAGA 908
Query 3120 CGCTTGGGGAGTTTTTTGTGGAGCATCCGTTAAGAAAACGGATGCGTTGATGTGGAATGC 3179
||||||| | || |||| | ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 909 CGCTTGGAGCGTGTTTTATAGAGCATCTGTTAAGGAAACAGATGCCTTGATGTGGAATGC 968
Query 3180 TATGATTGGAGGGCTTGCGAGTCATGGTTTCATAAGAGAGTCGCTCCTACTGTTTCACAA 3239
||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 969 TATCATTGGAGGGCTTGCGAGTCACGGGTTCATTAGAGAGTCGCTCCAACTGTTTCACAA 1028
Query 3240 AATGCAAGAATCCAAGATTGACCCGGACGAGATAACATTCTTGTGCTTGCTTGCTGCTTG 3299
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029 AATGCGAGAATCAAAGATTGACCCGGACGAGATAACATTCTTGTGCTTGCTTGCTGCTTG 1088
Query 3300 TTCCCATGGCGGATTAGTGAAAGAAGCGTGGCATTTCTTCACA-AGTCTCAAGGAAAGCG 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
Sbjct 1089 TTCCCATGGCGGATTAGTGAAAGAAGCGTGGCATTTCTTCA-AGAGTCTCAAGGAAAGTG 1147
Query 3359 GAGCAGAACCAAAGAGCGAGCATTATGCTTGTATGGTCGATGTGCTTTCCCGAGCTGGGC 3418
| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1148 GTGCGGAACCAAAGAGCGAGCATTATGCTTGTATGGTTGATGTGCTTTCCAGAGCTGGTC 1207
Query 3419 TAGTTAAAGATGCGCATGATTTTATATCTGAAATGCCGATAAAACCGACGGGTTCAGTGT 3478
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1208 TAGTTAAAGACGCACATGATTTTATATCTGAAATGCCGATAAAACCGACGGGTTCAATGT 1267
Query 3479 TGGGTGCTTTGTTTAACGGGTGTATAAATCATGGAAACTTGGAGCTTGCGGAAACAGTTG 3538
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 TGGGTGCTTTGCTTAACGGGTGTATAAATCACGGAAACTTGGAGCTTGCGGAAACAGTTG 1327
Query 3539 GAAAGAAGCTTATTGAGTTACAACCACATAATGATGGACGATATGTTGGGCTTGCAAACG 3598
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 1328 GAAAGAAGCTTATAGAGTTGCAACCACATAATGATGGACGATATGTCGGGCTAGCAAACG 1387
Query 3599 TTTATGCGATAAACAAGCAGTTT-GGCGCAGCTCGGTCTATGAGAGAAGCAACGGAGAAG 3657
|||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1388 TTTATGCGATCAACAAGCAGTTTAGG-GCAGCTCGGTCTATGAGAGAAGCAATGGAGAAG 1446
Query 3658 AAAGGAGTGAAGAAAATTGCAGGTCACAGTATAATTGATTTGAATGGAACATC-ACACAG 3716
||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||
Sbjct 1447 AAAGGAGTGAAGAAAATTGCAGGGCACAGTATACTTGATTTGGATGGAACA-CGACATAG 1505
Query 3717 ATTCATAGCTCATGACCAAACACATTTTCACTCCGACAAGATCTATGCAGTGTTACAGCT 3776
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1506 ATTCATCGCTCATGACAAAACACATTTTCACTCCGACAAGATCTATGCAGTGTTACAGCT 1565
Query 3777 GATTGGAACTGGGATGAATCTCGATGTTGATTATGATGATAGTGAAGAGTGTCATTGTTT 3836
|| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||
Sbjct 1566 GACTGGAGCTTGGATGAATCTCGATGTTGACTATGATGATC---AAGACAATCATTGTTT 1622
Query 3837 TTGTTCTTGA 3846
||||||||||
Sbjct 1623 TTGTTCTTGA 1632
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 191587555317
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5