BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg893964 Length=5082 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT5G20320.1 | Symbols: DCL4, ATDCL4 | dicer-like 4 | chr5:68592... 8021 0.0 > AT5G20320.1 | Symbols: DCL4, ATDCL4 | dicer-like 4 | chr5:6859218-6869266 REVERSE LENGTH=5660 Length=5660 Score = 8021 bits (4343), Expect = 0.0 Identities = 4871/5121 (95%), Gaps = 56/5121 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGCGTGAAGAAGTTGACTTGAGCTTGACCATACCCTCGAAGATTTTGGGAAAGCGAGAC 60 |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| Sbjct 199 ATGCGTGACGAAGTTGACTTGAGCTTGACCATTCCCTCGAAGCTTTTGGGGAAGCGAGAC 258 Query 61 AGAG-a-aaaaaaa-ggtaaagaagaaacaaacaaaaacaaaaaagagagagctaaaatg 117 |||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||| | Sbjct 259 AGAGAACAAAAAAATTGTGAAGAAGAAAAAAACAAAAAC---AAA-A-A-AGCTAAAAAG 312 Query 118 cagcaaaagGACCCAATTCTTC-T--CACTA--G-TGCCACTCACAAGTTTC-T--TCCT 168 |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||| | |||| Sbjct 313 CAGCAAAAGGACCCAATTCTTCTTCACACTAGTGCTGCCACTCACAAGTTTCTTCCTCCT 372 Query 169 GCTTTGACCATGCCGTACGGTGAAATCGAAATCGGCGACGATTTTCGCTCTCTCGACTGT 228 ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | Sbjct 373 CCTTTGACCATGCCGTAC-----AGT-GAAATCGGCGACGATCTTCGCTCACTCGACTTT 426 Query 229 G---ACGCCGATGTTTCCTCCGACATTCACCtctcttcttcttcctctttttattcgttt 285 | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| Sbjct 427 GACCACGCCGATGTTTCTTCCGACCTTCACCTCACTTCTTCTTCCTCTGTTTCTTCGTTT 486 Query 286 tcttcttcttcgtcttc----tt-t-----G-T-GTACCGATGATCCTTCACCGAAAATG 333 || |||||||||||||| || | | | |||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 487 TCCTCTTCTTCGTCTTCTTTGTTCTCCGCGGCTGGTACGGATGATCCTTCACCGAAAATG 546 Query 334 GAGAAAGACCCTAGAAAAATCGCCAGGAGGTATCAGGTGGATCTGTGTAAGAAAGCAATG 393 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | Sbjct 547 GAGAAAGACCCTAGAAAAATCGCCAGGAGGTATCAGGTGGAGCTGTGTAAGAAAGCAACG 606 Query 394 GAGGAGAACATTATTGTATATTTGGGTACAGGTTGTGGGAAGACTCACATTGCAGTGATG 453 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 607 GAGGAGAACGTTATTGTATATTTGGGTACAGGTTGTGGGAAGACTCACATTGCAGTGATG 666 Query 454 GTTATATATGAGCTCGGTCATTTGGTTCTTAGTCCCAAGAAAAGTGTTTGTATTTTTCTT 513 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 667 CTTATATATGAGCTTGGTCATTTGGTTCTTAGTCCCAAGAAAAGTGTTTGTATTTTTCTT 726 Query 514 GCTCCCACCGTGGCTTTGGTTGAACAGCAAGCTAAGGTCATAGCGGACTCTGTCAACTTC 573 |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 727 GCTCCCACCGTGGCTTTGGTCGAACAGCAAGCCAAGGTCATAGCGGACTCTGTCAACTTC 786 Query 574 AAAGTTGCAGTACATTGTGGAGGCAAGAGGATTGTGAAGAGCCACTCTGAGTGGGAGAGA 633 ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 787 AAAGTTGCAATACATTGTGGAGGCAAGAGGATTGTGAAGAGCCACTCGGAGTGGGAGAGA 846 Query 634 GAGATTTCAGAGAATGAGGTTCTTGTTATGACTCCACAAATACTTCTGCACAACTTACAG 693 |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 847 GAGATTGCAGCGAATGAGGTTCTTGTTATGACTCCACAAATACTTCTGCATAACTTACAG 906 Query 694 CACTGTTTCATCAGGATGGAGTGTATCTCCCTTCTAATATTTGATGAGTGTCACCATGCT 753 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 907 CACTGTTTCATCAAGATGGAGTGTATCTCCCTTCTAATATTTGATGAGTGTCACCATGCT 966 Query 754 CAACAACAAAGCAACCATCCTTATGCGGAAATCATGAAGGTTTTCTATAAATCAGAAAGT 813 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 967 CAACAACAAAGCAACCATCCTTATGCAGAAATCATGAAGGTTTTCTATAAATCGGAAAGT 1026 Query 814 TTACAACGGCCTCGAATATTTGGAATGACTGCATCTCCAGTTGTTGGCAAAGGATCTTTT 873 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1027 TTACAACGGCCTCGAATATTTGGAATGACTGCATCTCCAGTTGTTGGCAAAGGGTCTTTT 1086 Query 874 CAATCAGAGAATTTATCGAAAAGCATAAATAGCCTTGAAAATTTGCTCAATGCCAAGGTT 933 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1087 CAATCAGAGAATTTATCGAAAAGCATTAATAGCCTTGAAAATTTGCTCAATGCCAAGGTT 1146 Query 934 TATTCAGTGGAAAGCAATGTCCAGCTGGATGGTTTTGTTTCATCTCCTTTAGTCAAAGTA 993 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1147 TATTCAGTGGAAAGCAATGTCCAGCTGGATGGTTTTGTTTCATCTCCTTTAGTCAAAGTA 1206 Query 994 TATTATTATCAGTCAGCTATAAGTGATGCATCTCAATCAACCATCAGATATGAAAACATG 1053 |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 1207 TATTATTATCGGTCAGCTTTAAGTGATGCATCTCAATCGACCATCAGATATGAAAACATG 1266 Query 1054 CTGGAGGACATCAAACAGCGGTGCTTGACATCAATTAAGCTGCAGATTGATACCCATCAA 1113 ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| Sbjct 1267 CTGGAGGACATCAAACAGCGGTGCTTGGCATCACTTAAGCTGCTGATTGATACTCATCAA 1326 Query 1114 ACACAAACCCTCCTAAATATGAAAAGGCTTCTCaaaaaaaCTCATGATAATCTCATATAT 1173 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| Sbjct 1327 ACACAAACCCTCCTAAGTATGAAAAGGCTTCTCAAAAGATCTCATGATAATCTCATATAT 1386 Query 1174 TCTCTGGTGAATCTTGGCCTCTGGGGAGCAATACAGGCTGCTAAAATTCAATTGAATAGT 1233 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 1387 ACTCTGCTGAATCTTGGCCTCTGGGGAGCAATACAGGCTGCTAAAATCCAATTGAATAGT 1446 Query 1234 G------ATGTACAAGAAGAGCCTGTGGGCGAGAATCCTAAGTCAAAGATATGTGATACA 1287 | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1447 GACCATAATGTACAAGACGAGCCTGTGGGAAAGAATCCTAAGTCAAAGATATGTGATACA 1506 Query 1288 TATCTTTCTCTGGCTGCTGAGGTCCTCTCTTCTGGTGTTGCTAAAGATGAGAATGCATCT 1347 ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1507 TATCTTTCTATGGCTGCTGAGGCCCTCTCTTCTGGTGTTGCTAAAGATGAGAATGCATCT 1566 Query 1348 GAACTCCTCAGCTTAGCAGCGTTGAAGGAACCATTATTCTCTAGAAAGCTAGTTCAATTG 1407 || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1567 GACCTCCTCAGCTTAGCGGCGTTGAAGGAACCATTATTCTCTAGAAAGCTAGTTCAATTG 1626 Query 1408 ATTAAGATCCTTTCGGCATTCAGGCTAGAGCCACACATGAAGTGTATAATATTTGTCAAT 1467 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1627 ATTAAGATCCTTTCGGTATTCAGGCTAGAGCCACACATGAAATGTATAATATTTGTCAAT 1686 Query 1468 CGGATTGTGACTGCAAGAACATTGTCATGCATACTAAATAACTTGGAACTGCTACGGTCT 1527 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1687 CGGATTGTGACTGCAAGAACATTGTCATGCATACTAAATAACTTGGAACTGCTACGGTCT 1746 Query 1528 TGGAAGTCTGATTTCCTTGTTGGACTTAGTTCTGGACTGAAGAGCATGTCAAGGAGGGGT 1587 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || Sbjct 1747 TGGAAGTCTGATTTCCTTGTTGGACTTAGTTCTGGACTGAAGAGCATGTCAAGAAGGAGT 1806 Query 1588 ATGGAAACAATACTTAAACGGTTCCAATCTAAAGAGCTCAATTTACTGGTTGCCACTAAA 1647 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1807 ATGGAAACAATACTTAAACGGTTCCAATCTAAAGAGCTCAATTTACTGGTTGCCACTAAA 1866 Query 1648 GTTGGTGAAGAAGGCCTTGATATTCAGACATGCTGTCTTGTGATCCGTTATGATTTACCA 1707 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1867 GTTGGTGAAGAAGGCCTTGATATTCAGACATGCTGTCTTGTGATCCGTTATGATTTACCA 1926 Query 1708 GAGACTGTTACCAGCTTCATACAGTCCAGAGGTCGTGCTCGAATGCCTCAGTCTGAATAT 1767 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1927 GAGACTGTTACCAGCTTCATACAGTCCAGAGGTCGTGCTCGAATGCCTCAGTCTGAATAT 1986 Query 1768 GCGTTTCTAGTGGACAGCGGAAACGAGAAAGAGATGGATCTTATTGAAAATTTTAGAGTA 1827 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| Sbjct 1987 GCGTTTCTAGTGGACAGCGGAAACGAGAAAGAGATGGATCTTATTGAAAATTTTAAAGTA 2046 Query 1828 AATGAAGATCGAATGAATCGGGAAATTACTTCCAGAA-CGTCAGAGGAAACTTGTCCTAT 1886 ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| Sbjct 2047 AATGAAGATCGAATGAATCTAGAAATTACTTACAGAAGC-TCAGAGGAAACTTGTCCTAG 2105 Query 1887 ACTTGATGAGGAGTTATACAAAGTTCATGAGACAGGAGCTTGTATCAGTGGTGGAAGTAG 1946 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2106 ACTTGATGAGGAGTTATACAAAGTTCATGAGACAGGAGCTTGTATCAGTGGTGGAAGCAG 2165 Query 1947 CATCTCCCTTCTCTATAAATATTGTTCTAGGCTTCCACATGATGAATTTTTTCAGCCCAA 2006 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2166 CATCTCCCTTCTCTATAAATATTGTTCTAGGCTTCCACATGATGAATTTTTTCAGCCCAA 2225 Query 2007 GCCAGAGTTTCAATTCAAGCCTGTTAATGAATTTGGTGGAACTATCTGTCGCATAACTTT 2066 ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2226 GCCAGAGTTTCAATTCAAGCCTGTTGACGAATTTGGTGGAACTATCTGTCGCATAACTTT 2285 Query 2067 ACCTGCTAATGCTCCTATAAGTGAAATCGTCAGTTCACTACTACCTTCAACTGAAGCTGC 2126 ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| Sbjct 2286 ACCTGCTAATGCTCCTATAAGTGAAATCGAAAGTTCACTACTACCTTCGACAGAAGCTGC 2345 Query 2127 TAAAAAGGATGCTTGTCTAAAGGCTGTGTATGAGTTGCACAACTTGGGTGTACTTAACGA 2186 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2346 TAAAAAGGATGCTTGTCTAAAGGCTGTGCATGAGTTGCACAACTTGGGTGTACTTAACGA 2405 Query 2187 TTTTCTGTTACCAGATTCAAAGGATGAAATTGAGGACGAGTTGTCAGATGATGAATTTGA 2246 ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 2406 TTTTCTGTTGCCAGATTCCAAGGATGAAATTGAGGACGAATTGTCAGATGATGAATTTGA 2465 Query 2247 TTTTGATAACATCAAAGGTGAAGGTTGTTCACGAGGTGAACTGTATGAGATG-GTTGTTC 2305 |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || | Sbjct 2466 TTTTGATAACATCAAAGGTGAAGGCTGTTCACGAGGTGACCTGTATGAGATGCGT-GTAC 2524 Query 2306 CTGTCTTATTTAAACAAAAGTGGGATTCATCAAGAAGTTGTGTCAGTCTTCATTCTTACT 2365 | ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 2525 CAGTCTTGTTTAAACAAAAGTGGGATCCATCTACAAGTTGTGTCAATCTTCATTCTTACT 2584 Query 2366 ACATAAGGTTTGTGCCTCATCCCGCAGATAGGAGCTACAAAAAGTTTGGTTTCTTCATGA 2425 | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2585 ATATAATGTTTGTGCCTCATCCCGCTGATAGGATCTACAAAAAGTTTGGTTTCTTCATGA 2644 Query 2426 AGTCACCTCTTCCCGTTGAGGCTGAGACTATGGATTTCGATCTTCACCTTGCTCATCAAA 2485 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 2645 AGTCACCTCTTCCCGTTGAGGCTGAGACTATGGATATCGATCTTCACCTTGCTCATCAAA 2704 Query 2486 GATCTGTAAGTGTAAAGATTTTTCCATCAGGAGTCACAGAATTCGACAACGATGAGATAA 2545 ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2705 GATCTGTAAGTGTAAAGATTTTTCCATCAGGGGTCACAGAATTCGACAACGATGAGATAA 2764 Query 2546 GGCTAGCGGAGCTTTTCCAGGAGGTTGCCCTGAAGGTTCTTTTTGAACGGGGGGAGCTGA 2605 | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2765 GACTAGCTGAGCTTTTCCAGGAGATTGCCCTGAAGGTTCTTTTTGAACGGGGGGAGCTGA 2824 Query 2606 TCCCGGAATTTGTGCCCTTAGAACTGCAAGACTCTTCTAGAACAAGCAAATCTACCTTCT 2665 ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2825 TCCCGGACTTTGTTCCCTTGGAACTGCAAGACTCTTCTAGAACAAGCAAATCCACCTTCT 2884 Query 2666 ACCTTCTTCTTCCAATCAGTCTGCATGATGCAGAAAGTGTTATATCTGTAGATTGGGTGA 2725 |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2885 ACCTTCTTCTTCCACTCTGTCTGCATGATGGAGAAAGTGTTATATCTGTAGATTGGGTGA 2944 Query 2726 CTATCAGAAGCTGCTTGTCATCACCAATCTTTAAGACTCCATCTGTTTTAGTGGAAGATA 2785 ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2945 CTATCAGAAACTGCTTGTCATCACCAATCTTTAAGACTCCATCTGTTTTAGTGGAAGATA 3004 Query 2786 TAGTTCCTCCTACGGGATCTTATTTAAATCTAGCAAATGGCTGCTGGAAAATTGATGATG 2845 || |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3005 TATTTCCTCCTTCGGGCTCTCATTTAAAGCTAGCAAATGGCTGCTGGAATATTGATGATG 3064 Query 2846 TGAAGAACAGCTTGGTTTTTATGACCCACAATAAACAGTTTTACTTTGTAGCTGATATCT 2905 ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| Sbjct 3065 TGAAGAACAGCTTGGTTTTTACAACCTACAGTAAACAATTTTACTTTGTTGCTGATATCT 3124 Query 2906 GCTACGGAAGAAATGGGTTCAGTCCTGTTAAGGAATCTAGCACCAAAAGCCATATGGAGA 2965 || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 3125 GCCATGGAAGAAATGGTTTCAGTCCTGTTAAGGAATCTAGCACCAAAAGCCATGTGGAGA 3184 Query 2966 ACATATATAAGTTGTATGGCGTGGAACTCAAGCGTCCTGGACAGCCACTCTTGCGTGTGA 3025 |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| Sbjct 3185 GCATATATAAGTTGTATGGCGTGGAACTCAAGCATCCTGCACAGCCACTCTTGCGTGTGA 3244 Query 3026 AACCACTTTGTCATGTTCGGAACTTGCTTCACAACAGAATGCAGAAGAATTTGGAACCAC 3085 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| Sbjct 3245 AACCACTTTGTCATGTTCGGAACTTGCTTCACAACCGAATGCAGACGAATTTGGAACCAC 3304 Query 3086 AAGAACTTGATGAATACTTCATAGAGATTCCTCCCGAGCTTTCTCAGTTAAAGATAAAAG 3145 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| Sbjct 3305 AAGAACTTGACGAATACTTCATAGAGATTCCTCCCGAACTTTCTCACTTAAAGATAAAAG 3364 Query 3146 GATTATCTAAAGACATCGGAAGCTCGTTATCCTTGCTACCATCAATCATGCATCGTGTGG 3205 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3365 GATTATCTAAAGACATCGGAAGCTCGTTATCCTTGTTACCATCAATCATGCATCGTATGG 3424 Query 3206 AGAATTTACTCGTGGCTATTGAACTGAAACATGTGATGTCTGCTTCGATCCCTGAGATAG 3265 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 3425 AGAATTTACTCGTGGCTATTGAACTGAAACATGTGCTGTCTGCTTCGATCCCTGAGATAG 3484 Query 3266 CTGAAGTTTCTGGTCACAGAGTACTCGAGGCGCTCACAACAGAGAAATGTCATGAGCGCC 3325 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3485 CTGAAGTTTCTGGTCACAGGGTACTCGAGGCGCTCACAACAGAGAAATGTCATGAGCGCC 3544 Query 3326 TTTCTCTTGAAAGGCTTGAGGTGCTTGGTGATGCATTCCTCAAGTTTGCTGTTAGCAGAC 3385 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3545 TTTCTCTTGAAAGGCTTGAGGTGCTTGGTGATGCATTCCTCAAGTTTGCTGTTAGCCGAC 3604 Query 3386 ACCTTTTTCTACACCATGATAGGCTTGATGAAGGAGAGCTGACTCGGAGACGCTCTAACG 3445 |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| Sbjct 3605 ACCTTTTTCTACACCATGATAGTCTTGATGAAGGAGAGTTGACTCGGAGACGCTCTAACG 3664 Query 3446 CCGTTAACAATTCCAACTTGTGTAGGCTTGCAATAAAAAGAAATTTGCAGGTCTACATCC 3505 |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| Sbjct 3665 TTGTTAACAATTCCAACTTGTGCAGGCTTGCAATAAAAAAAAATCTGCAGGTCTACATCC 3724 Query 3506 GTGATCAAGCATTAGATCCTACTCAGTTCTTTGCATTTGGCCATCCATGCAGAGTAACCT 3565 ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3725 GTGATCAAGCATTGGATCCTACTCAGTTCTTTGCATTTGGCCATCCATGCAGAGTAACCT 3784 Query 3566 GTGACGAGGTAACGAGTAAAGAGGTTCATTCCTTGAATAGGGTTCCTGGGCTCTTGGAGT 3625 ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| Sbjct 3785 GTGACGAGGTAGCCAGTAAAGAGGTTCATTCCTTGAATAGGGATCTTGGGATCTTGGAGT 3844 Query 3626 CAAATA--G-TGAAATCAGATGTAGCAAAGGCCATCATTGGTTGTACAAGAAAACAATTG 3682 |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3845 CAAATACTGGTGAAATCAGATGTAGCAAAGGCCATCATTGGTTGTACAAGAAAACAATTG 3904 Query 3683 CTGATGTGGTTGAGGCTCTTGTGGGAGCTTTCTTAGTTGACAGTGGCTTCAAAGGTGCTG 3742 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3905 CTGATGTGGTTGAGGCTCTTGTGGGAGCTTTCTTAGTTGACAGTGGCTTCAAAGGTGCTG 3964 Query 3743 TGAAATTTCTTA-GCTGGATTGGTGTAAATGTTGATTTTGAATCCTTGCAAGTACAAGAT 3801 |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3965 TGAAATTTCTGAAG-TGGATTGGTGTAAATGTTGATTTTGAATCCTTGCAAGTACAAGAT 4023 Query 3802 GCTTGTATTGCAAGCAGGCGCTACATACCCCTCACTACTCGCAATAATTTGGAGGCCCTT 3861 |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4024 GCTTGTATTGCAAGCAGGCGCTACTTGCCCCTCACTACTCGCAATAATTTGGAGACCCTT 4083 Query 3862 GAAAACCAGCTTGACTATAACTTCCTCCACAAAGGTCTACTTGTACAAGCCTTTATCCAT 3921 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4084 GAAAACCAGCTTGACTATAAGTTCCTCCACAAAGGTCTACTTGTACAAGCCTTTATCCAT 4143 Query 3922 CCATCTTACAACAGGCATGGAGGAGGCTGCTACCAGAGATTGGAGTTTCTTGGGGATGCT 3981 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4144 CCATCTTACAACAGGCATGGAGGAGGCTGCTACCAGAGATTGGAGTTTCTTGGGGATGCT 4203 Query 3982 GTTCTGGACTACTTGATGACATCCTATTTTTTCACTGTCTTCCCGAAACTGAAACCTGGT 4041 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| Sbjct 4204 GTTCTGGACTACTTGATGACATCCTATTTTTTCACAGTCTTCCCGAAACTGAAACCTGGT 4263 Query 4042 CAACTGACCGATCTAAGATCGCTCTCAGTAAATAATAAGGCGCTAGCAAATGTTGCTGTC 4101 |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4264 CAACTGACCGATCTAAGATCTCTCTCAGTAAATAATGAGGCGCTAGCAAATGTTGCTGTC 4323 Query 4102 AGTTTTTCGCTAAAGAGATTTCTATTTTGCGAGTCCGTATATCTCCATGAAGCTATAGAG 4161 |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| Sbjct 4324 AGTTTTTCGCTAAAGAGATTTCTATTTTGCGAGTCCATTTATCTTCATGAAGTTATAGAG 4383 Query 4162 GATTATACCAATTTCCGGGCAGCGTCCCCATTGGCAAGTGGACCATCTGAAGGTCCAAGA 4221 |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 4384 GATTATACCAATTTCCTGGCATCTTCCCCATTGGCAAGTGGACAATCTGAAGGTCCAAGA 4443 Query 4222 TGCCCAAAGGTTCTTGGTGACTTGGTAGAATCCTGTTTGGGGGCTCTTTTCCTCGATTGT 4281 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4444 TGCCCAAAGGTTCTTGGTGACTTGGTAGAATCCTGTTTGGGGGCTCTTTTCCTCGATTGT 4503 Query 4282 GGATTCAACTTGAATCATGTCTGGACTATGATGCTATCATTTCTAGATCCGGTCAAAAAC 4341 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4504 GGGTTCAACTTGAATCATGTCTGGACTATGATGCTATCATTTCTAGATCCGGTCAAAAAC 4563 Query 4342 TTGGCTAACCTGCAGATTAGTCCTATAAAGGAACTGATTGAACTTTGCCAGTCTTACAAG 4401 ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4564 TTGTCTAACCTTCAGATTAGTCCTATAAAAGAACTGATTGAACTTTGCCAGTCTTACAAG 4623 Query 4402 TGGGATCGGGAAATATCAGCGACGAAAAAGGATGGTGGTTTTTCTGTTGAATTAAAAGTG 4461 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| Sbjct 4624 TGGGATCGGGAAATATCAGCGACGAAAAAGGATGGTGCTTTTACTGTTGAACTAAAAGTG 4683 Query 4462 ACCAAGAAAGGTTGTTGCCTTACAGTTTCTGCAACTGGTCGGAACAAAAGAGAGAGCACA 4521 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 4684 ACCAAGAATGGTTGTTGCCTTACAGTTTCTGCAACTGGTCGGAACAAAAGAGAGGGCACA 4743 Query 4522 AAAAAGGCCGCACAGCTGATGATTACATCCCTGAAGGCTCATGAGCAA-ATAACAACCTC 4580 |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| Sbjct 4744 AAAAAGGCTGCACAGCTGATGATTACAAACCTGAAGGCTCATGAG-AACATAACAACCTC 4802 Query 4581 TCATCCGTTGGAGGATGTTCTGAAGAATAGCAACCTTAATGAAGCTAAATTAATTGGCTA 4640 ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| Sbjct 4803 CCATCCGTTGGAGGATGTTCTGAAGAATGGCATCCGAAATGAAGCTAAATTAATTGGCTA 4862 Query 4641 CAATGAAGATCCTATAGATGTTGTGAATCTTGTTGGGCTGGACGTTGAAAACCTAAAAAT 4700 ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 4863 CAATGAAGATCCTATAGATGTTGTGGATCTTGTTGGGCTGGACGTTGAAAACCTAAATAT 4922 Query 4701 CCAAGAAAATCTTGGCGAGAATAGTGAAATAAGCAGCTCATACGTCATCAGACGAGGTCT 4760 || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4923 CCTAGAAACTTTTGGCGGGAATAGTGAAAGAAGCAGCTCATACGTCATCAGACGAGGTCT 4982 Query 4761 CCCCCAGGCACCATCTAAAACAGAAGACAGGCTTCCTCAAAAGACCATCATAGAAGCAGG 4820 |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| Sbjct 4983 CCCCCAAGCACCATCTAAAACAGAAGACAGGCTTCCTCAAAAGGCCATCATAAAAGCAGG 5042 Query 4821 TCAACCAAGCAGCAAAACCGCAAAATCCCTCTTGCACGAAACATGTGTTGCTAACTGTTG 4880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5043 TGGACCAAGCAGCAAAACCGCAAAATCCCTCTTGCACGAAACATGTGTTGCTAACTGTTG 5102 Query 4881 GAAGCCTCCACACTTCGAATGTTGTGAGGAGGAAGGACCAGGCCACCTGAAATCATTCGT 4940 |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5103 GAAGCCACCACACTTCGAATGTTGTGAAGAGGAAGGACCAGGCCACCTGAAATCATTCGT 5162 Query 4941 CTATAAGGTAATCCTGGAAGTTGAAGATGCGCCCAATATGACATTGGAGTGTTATGGTGA 5000 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| Sbjct 5163 CTACAAGGTAATCCTGGAAGTTGAAGATGCGCCCAATATGACATTGGAATGTTATGGTGA 5222 Query 5001 GGCTAGAGCAACGAAGAAAGGTGCAGCAGAGCACGCTGCCCAAGCTGCTATATGGTGCCT 5060 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 5223 GGCTAGAGCAACGAAGAAAGGTGCAGCAGAGCACGCTGCCCAAGCTGCTATATGGTGCCT 5282 Query 5061 CAAGCATTCTGGATTCCTTTG 5081 ||||||||||||||||||||| Sbjct 5283 CAAGCATTCTGGATTCCTTTG 5303 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 253593896865 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5