BLASTN 2.2.26+


Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.



Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
           33,602 sequences; 51,074,197 total letters



Query= Ahg893964

Length=5082
                                                                      Score     E
Sequences producing significant alignments:                          (Bits)  Value

  AT5G20320.1 | Symbols: DCL4, ATDCL4 | dicer-like 4 | chr5:68592...  8021    0.0  


> AT5G20320.1 | Symbols: DCL4, ATDCL4 | dicer-like 4 | chr5:6859218-6869266 
REVERSE LENGTH=5660
Length=5660

 Score = 8021 bits (4343),  Expect = 0.0
 Identities = 4871/5121 (95%), Gaps = 56/5121 (1%)
 Strand=Plus/Plus

Query  1     ATGCGTGAAGAAGTTGACTTGAGCTTGACCATACCCTCGAAGATTTTGGGAAAGCGAGAC  60
             |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||
Sbjct  199   ATGCGTGACGAAGTTGACTTGAGCTTGACCATTCCCTCGAAGCTTTTGGGGAAGCGAGAC  258

Query  61    AGAG-a-aaaaaaa-ggtaaagaagaaacaaacaaaaacaaaaaagagagagctaaaatg  117
             |||| | |||||||  || ||||||||| ||||||||||   ||| | | |||||||| |
Sbjct  259   AGAGAACAAAAAAATTGTGAAGAAGAAAAAAACAAAAAC---AAA-A-A-AGCTAAAAAG  312

Query  118   cagcaaaagGACCCAATTCTTC-T--CACTA--G-TGCCACTCACAAGTTTC-T--TCCT  168
             |||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||| |  ||||
Sbjct  313   CAGCAAAAGGACCCAATTCTTCTTCACACTAGTGCTGCCACTCACAAGTTTCTTCCTCCT  372

Query  169   GCTTTGACCATGCCGTACGGTGAAATCGAAATCGGCGACGATTTTCGCTCTCTCGACTGT  228
              |||||||||||||||||     | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
Sbjct  373   CCTTTGACCATGCCGTAC-----AGT-GAAATCGGCGACGATCTTCGCTCACTCGACTTT  426

Query  229   G---ACGCCGATGTTTCCTCCGACATTCACCtctcttcttcttcctctttttattcgttt  285
             |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct  427   GACCACGCCGATGTTTCTTCCGACCTTCACCTCACTTCTTCTTCCTCTGTTTCTTCGTTT  486

Query  286   tcttcttcttcgtcttc----tt-t-----G-T-GTACCGATGATCCTTCACCGAAAATG  333
             || ||||||||||||||    || |     | | |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  487   TCCTCTTCTTCGTCTTCTTTGTTCTCCGCGGCTGGTACGGATGATCCTTCACCGAAAATG  546

Query  334   GAGAAAGACCCTAGAAAAATCGCCAGGAGGTATCAGGTGGATCTGTGTAAGAAAGCAATG  393
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
Sbjct  547   GAGAAAGACCCTAGAAAAATCGCCAGGAGGTATCAGGTGGAGCTGTGTAAGAAAGCAACG  606

Query  394   GAGGAGAACATTATTGTATATTTGGGTACAGGTTGTGGGAAGACTCACATTGCAGTGATG  453
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607   GAGGAGAACGTTATTGTATATTTGGGTACAGGTTGTGGGAAGACTCACATTGCAGTGATG  666

Query  454   GTTATATATGAGCTCGGTCATTTGGTTCTTAGTCCCAAGAAAAGTGTTTGTATTTTTCTT  513
              ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667   CTTATATATGAGCTTGGTCATTTGGTTCTTAGTCCCAAGAAAAGTGTTTGTATTTTTCTT  726

Query  514   GCTCCCACCGTGGCTTTGGTTGAACAGCAAGCTAAGGTCATAGCGGACTCTGTCAACTTC  573
             |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727   GCTCCCACCGTGGCTTTGGTCGAACAGCAAGCCAAGGTCATAGCGGACTCTGTCAACTTC  786

Query  574   AAAGTTGCAGTACATTGTGGAGGCAAGAGGATTGTGAAGAGCCACTCTGAGTGGGAGAGA  633
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  787   AAAGTTGCAATACATTGTGGAGGCAAGAGGATTGTGAAGAGCCACTCGGAGTGGGAGAGA  846

Query  634   GAGATTTCAGAGAATGAGGTTCTTGTTATGACTCCACAAATACTTCTGCACAACTTACAG  693
             |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  847   GAGATTGCAGCGAATGAGGTTCTTGTTATGACTCCACAAATACTTCTGCATAACTTACAG  906

Query  694   CACTGTTTCATCAGGATGGAGTGTATCTCCCTTCTAATATTTGATGAGTGTCACCATGCT  753
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  907   CACTGTTTCATCAAGATGGAGTGTATCTCCCTTCTAATATTTGATGAGTGTCACCATGCT  966

Query  754   CAACAACAAAGCAACCATCCTTATGCGGAAATCATGAAGGTTTTCTATAAATCAGAAAGT  813
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  967   CAACAACAAAGCAACCATCCTTATGCAGAAATCATGAAGGTTTTCTATAAATCGGAAAGT  1026

Query  814   TTACAACGGCCTCGAATATTTGGAATGACTGCATCTCCAGTTGTTGGCAAAGGATCTTTT  873
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1027  TTACAACGGCCTCGAATATTTGGAATGACTGCATCTCCAGTTGTTGGCAAAGGGTCTTTT  1086

Query  874   CAATCAGAGAATTTATCGAAAAGCATAAATAGCCTTGAAAATTTGCTCAATGCCAAGGTT  933
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1087  CAATCAGAGAATTTATCGAAAAGCATTAATAGCCTTGAAAATTTGCTCAATGCCAAGGTT  1146

Query  934   TATTCAGTGGAAAGCAATGTCCAGCTGGATGGTTTTGTTTCATCTCCTTTAGTCAAAGTA  993
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1147  TATTCAGTGGAAAGCAATGTCCAGCTGGATGGTTTTGTTTCATCTCCTTTAGTCAAAGTA  1206

Query  994   TATTATTATCAGTCAGCTATAAGTGATGCATCTCAATCAACCATCAGATATGAAAACATG  1053
             |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  1207  TATTATTATCGGTCAGCTTTAAGTGATGCATCTCAATCGACCATCAGATATGAAAACATG  1266

Query  1054  CTGGAGGACATCAAACAGCGGTGCTTGACATCAATTAAGCTGCAGATTGATACCCATCAA  1113
             ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct  1267  CTGGAGGACATCAAACAGCGGTGCTTGGCATCACTTAAGCTGCTGATTGATACTCATCAA  1326

Query  1114  ACACAAACCCTCCTAAATATGAAAAGGCTTCTCaaaaaaaCTCATGATAATCTCATATAT  1173
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct  1327  ACACAAACCCTCCTAAGTATGAAAAGGCTTCTCAAAAGATCTCATGATAATCTCATATAT  1386

Query  1174  TCTCTGGTGAATCTTGGCCTCTGGGGAGCAATACAGGCTGCTAAAATTCAATTGAATAGT  1233
              ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct  1387  ACTCTGCTGAATCTTGGCCTCTGGGGAGCAATACAGGCTGCTAAAATCCAATTGAATAGT  1446

Query  1234  G------ATGTACAAGAAGAGCCTGTGGGCGAGAATCCTAAGTCAAAGATATGTGATACA  1287
             |      |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1447  GACCATAATGTACAAGACGAGCCTGTGGGAAAGAATCCTAAGTCAAAGATATGTGATACA  1506

Query  1288  TATCTTTCTCTGGCTGCTGAGGTCCTCTCTTCTGGTGTTGCTAAAGATGAGAATGCATCT  1347
             ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1507  TATCTTTCTATGGCTGCTGAGGCCCTCTCTTCTGGTGTTGCTAAAGATGAGAATGCATCT  1566

Query  1348  GAACTCCTCAGCTTAGCAGCGTTGAAGGAACCATTATTCTCTAGAAAGCTAGTTCAATTG  1407
             || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1567  GACCTCCTCAGCTTAGCGGCGTTGAAGGAACCATTATTCTCTAGAAAGCTAGTTCAATTG  1626

Query  1408  ATTAAGATCCTTTCGGCATTCAGGCTAGAGCCACACATGAAGTGTATAATATTTGTCAAT  1467
             |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1627  ATTAAGATCCTTTCGGTATTCAGGCTAGAGCCACACATGAAATGTATAATATTTGTCAAT  1686

Query  1468  CGGATTGTGACTGCAAGAACATTGTCATGCATACTAAATAACTTGGAACTGCTACGGTCT  1527
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1687  CGGATTGTGACTGCAAGAACATTGTCATGCATACTAAATAACTTGGAACTGCTACGGTCT  1746

Query  1528  TGGAAGTCTGATTTCCTTGTTGGACTTAGTTCTGGACTGAAGAGCATGTCAAGGAGGGGT  1587
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct  1747  TGGAAGTCTGATTTCCTTGTTGGACTTAGTTCTGGACTGAAGAGCATGTCAAGAAGGAGT  1806

Query  1588  ATGGAAACAATACTTAAACGGTTCCAATCTAAAGAGCTCAATTTACTGGTTGCCACTAAA  1647
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1807  ATGGAAACAATACTTAAACGGTTCCAATCTAAAGAGCTCAATTTACTGGTTGCCACTAAA  1866

Query  1648  GTTGGTGAAGAAGGCCTTGATATTCAGACATGCTGTCTTGTGATCCGTTATGATTTACCA  1707
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1867  GTTGGTGAAGAAGGCCTTGATATTCAGACATGCTGTCTTGTGATCCGTTATGATTTACCA  1926

Query  1708  GAGACTGTTACCAGCTTCATACAGTCCAGAGGTCGTGCTCGAATGCCTCAGTCTGAATAT  1767
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1927  GAGACTGTTACCAGCTTCATACAGTCCAGAGGTCGTGCTCGAATGCCTCAGTCTGAATAT  1986

Query  1768  GCGTTTCTAGTGGACAGCGGAAACGAGAAAGAGATGGATCTTATTGAAAATTTTAGAGTA  1827
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct  1987  GCGTTTCTAGTGGACAGCGGAAACGAGAAAGAGATGGATCTTATTGAAAATTTTAAAGTA  2046

Query  1828  AATGAAGATCGAATGAATCGGGAAATTACTTCCAGAA-CGTCAGAGGAAACTTGTCCTAT  1886
             |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| 
Sbjct  2047  AATGAAGATCGAATGAATCTAGAAATTACTTACAGAAGC-TCAGAGGAAACTTGTCCTAG  2105

Query  1887  ACTTGATGAGGAGTTATACAAAGTTCATGAGACAGGAGCTTGTATCAGTGGTGGAAGTAG  1946
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  2106  ACTTGATGAGGAGTTATACAAAGTTCATGAGACAGGAGCTTGTATCAGTGGTGGAAGCAG  2165

Query  1947  CATCTCCCTTCTCTATAAATATTGTTCTAGGCTTCCACATGATGAATTTTTTCAGCCCAA  2006
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2166  CATCTCCCTTCTCTATAAATATTGTTCTAGGCTTCCACATGATGAATTTTTTCAGCCCAA  2225

Query  2007  GCCAGAGTTTCAATTCAAGCCTGTTAATGAATTTGGTGGAACTATCTGTCGCATAACTTT  2066
             ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2226  GCCAGAGTTTCAATTCAAGCCTGTTGACGAATTTGGTGGAACTATCTGTCGCATAACTTT  2285

Query  2067  ACCTGCTAATGCTCCTATAAGTGAAATCGTCAGTTCACTACTACCTTCAACTGAAGCTGC  2126
             |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct  2286  ACCTGCTAATGCTCCTATAAGTGAAATCGAAAGTTCACTACTACCTTCGACAGAAGCTGC  2345

Query  2127  TAAAAAGGATGCTTGTCTAAAGGCTGTGTATGAGTTGCACAACTTGGGTGTACTTAACGA  2186
             |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2346  TAAAAAGGATGCTTGTCTAAAGGCTGTGCATGAGTTGCACAACTTGGGTGTACTTAACGA  2405

Query  2187  TTTTCTGTTACCAGATTCAAAGGATGAAATTGAGGACGAGTTGTCAGATGATGAATTTGA  2246
             ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  2406  TTTTCTGTTGCCAGATTCCAAGGATGAAATTGAGGACGAATTGTCAGATGATGAATTTGA  2465

Query  2247  TTTTGATAACATCAAAGGTGAAGGTTGTTCACGAGGTGAACTGTATGAGATG-GTTGTTC  2305
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |
Sbjct  2466  TTTTGATAACATCAAAGGTGAAGGCTGTTCACGAGGTGACCTGTATGAGATGCGT-GTAC  2524

Query  2306  CTGTCTTATTTAAACAAAAGTGGGATTCATCAAGAAGTTGTGTCAGTCTTCATTCTTACT  2365
             | ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  2525  CAGTCTTGTTTAAACAAAAGTGGGATCCATCTACAAGTTGTGTCAATCTTCATTCTTACT  2584

Query  2366  ACATAAGGTTTGTGCCTCATCCCGCAGATAGGAGCTACAAAAAGTTTGGTTTCTTCATGA  2425
             | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2585  ATATAATGTTTGTGCCTCATCCCGCTGATAGGATCTACAAAAAGTTTGGTTTCTTCATGA  2644

Query  2426  AGTCACCTCTTCCCGTTGAGGCTGAGACTATGGATTTCGATCTTCACCTTGCTCATCAAA  2485
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2645  AGTCACCTCTTCCCGTTGAGGCTGAGACTATGGATATCGATCTTCACCTTGCTCATCAAA  2704

Query  2486  GATCTGTAAGTGTAAAGATTTTTCCATCAGGAGTCACAGAATTCGACAACGATGAGATAA  2545
             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2705  GATCTGTAAGTGTAAAGATTTTTCCATCAGGGGTCACAGAATTCGACAACGATGAGATAA  2764

Query  2546  GGCTAGCGGAGCTTTTCCAGGAGGTTGCCCTGAAGGTTCTTTTTGAACGGGGGGAGCTGA  2605
             | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2765  GACTAGCTGAGCTTTTCCAGGAGATTGCCCTGAAGGTTCTTTTTGAACGGGGGGAGCTGA  2824

Query  2606  TCCCGGAATTTGTGCCCTTAGAACTGCAAGACTCTTCTAGAACAAGCAAATCTACCTTCT  2665
             ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct  2825  TCCCGGACTTTGTTCCCTTGGAACTGCAAGACTCTTCTAGAACAAGCAAATCCACCTTCT  2884

Query  2666  ACCTTCTTCTTCCAATCAGTCTGCATGATGCAGAAAGTGTTATATCTGTAGATTGGGTGA  2725
             |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2885  ACCTTCTTCTTCCACTCTGTCTGCATGATGGAGAAAGTGTTATATCTGTAGATTGGGTGA  2944

Query  2726  CTATCAGAAGCTGCTTGTCATCACCAATCTTTAAGACTCCATCTGTTTTAGTGGAAGATA  2785
             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2945  CTATCAGAAACTGCTTGTCATCACCAATCTTTAAGACTCCATCTGTTTTAGTGGAAGATA  3004

Query  2786  TAGTTCCTCCTACGGGATCTTATTTAAATCTAGCAAATGGCTGCTGGAAAATTGATGATG  2845
             || |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3005  TATTTCCTCCTTCGGGCTCTCATTTAAAGCTAGCAAATGGCTGCTGGAATATTGATGATG  3064

Query  2846  TGAAGAACAGCTTGGTTTTTATGACCCACAATAAACAGTTTTACTTTGTAGCTGATATCT  2905
             |||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||
Sbjct  3065  TGAAGAACAGCTTGGTTTTTACAACCTACAGTAAACAATTTTACTTTGTTGCTGATATCT  3124

Query  2906  GCTACGGAAGAAATGGGTTCAGTCCTGTTAAGGAATCTAGCACCAAAAGCCATATGGAGA  2965
             || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  3125  GCCATGGAAGAAATGGTTTCAGTCCTGTTAAGGAATCTAGCACCAAAAGCCATGTGGAGA  3184

Query  2966  ACATATATAAGTTGTATGGCGTGGAACTCAAGCGTCCTGGACAGCCACTCTTGCGTGTGA  3025
              |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct  3185  GCATATATAAGTTGTATGGCGTGGAACTCAAGCATCCTGCACAGCCACTCTTGCGTGTGA  3244

Query  3026  AACCACTTTGTCATGTTCGGAACTTGCTTCACAACAGAATGCAGAAGAATTTGGAACCAC  3085
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  3245  AACCACTTTGTCATGTTCGGAACTTGCTTCACAACCGAATGCAGACGAATTTGGAACCAC  3304

Query  3086  AAGAACTTGATGAATACTTCATAGAGATTCCTCCCGAGCTTTCTCAGTTAAAGATAAAAG  3145
             |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct  3305  AAGAACTTGACGAATACTTCATAGAGATTCCTCCCGAACTTTCTCACTTAAAGATAAAAG  3364

Query  3146  GATTATCTAAAGACATCGGAAGCTCGTTATCCTTGCTACCATCAATCATGCATCGTGTGG  3205
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct  3365  GATTATCTAAAGACATCGGAAGCTCGTTATCCTTGTTACCATCAATCATGCATCGTATGG  3424

Query  3206  AGAATTTACTCGTGGCTATTGAACTGAAACATGTGATGTCTGCTTCGATCCCTGAGATAG  3265
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3425  AGAATTTACTCGTGGCTATTGAACTGAAACATGTGCTGTCTGCTTCGATCCCTGAGATAG  3484

Query  3266  CTGAAGTTTCTGGTCACAGAGTACTCGAGGCGCTCACAACAGAGAAATGTCATGAGCGCC  3325
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3485  CTGAAGTTTCTGGTCACAGGGTACTCGAGGCGCTCACAACAGAGAAATGTCATGAGCGCC  3544

Query  3326  TTTCTCTTGAAAGGCTTGAGGTGCTTGGTGATGCATTCCTCAAGTTTGCTGTTAGCAGAC  3385
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  3545  TTTCTCTTGAAAGGCTTGAGGTGCTTGGTGATGCATTCCTCAAGTTTGCTGTTAGCCGAC  3604

Query  3386  ACCTTTTTCTACACCATGATAGGCTTGATGAAGGAGAGCTGACTCGGAGACGCTCTAACG  3445
             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct  3605  ACCTTTTTCTACACCATGATAGTCTTGATGAAGGAGAGTTGACTCGGAGACGCTCTAACG  3664

Query  3446  CCGTTAACAATTCCAACTTGTGTAGGCTTGCAATAAAAAGAAATTTGCAGGTCTACATCC  3505
               |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
Sbjct  3665  TTGTTAACAATTCCAACTTGTGCAGGCTTGCAATAAAAAAAAATCTGCAGGTCTACATCC  3724

Query  3506  GTGATCAAGCATTAGATCCTACTCAGTTCTTTGCATTTGGCCATCCATGCAGAGTAACCT  3565
             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3725  GTGATCAAGCATTGGATCCTACTCAGTTCTTTGCATTTGGCCATCCATGCAGAGTAACCT  3784

Query  3566  GTGACGAGGTAACGAGTAAAGAGGTTCATTCCTTGAATAGGGTTCCTGGGCTCTTGGAGT  3625
             ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||
Sbjct  3785  GTGACGAGGTAGCCAGTAAAGAGGTTCATTCCTTGAATAGGGATCTTGGGATCTTGGAGT  3844

Query  3626  CAAATA--G-TGAAATCAGATGTAGCAAAGGCCATCATTGGTTGTACAAGAAAACAATTG  3682
             ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3845  CAAATACTGGTGAAATCAGATGTAGCAAAGGCCATCATTGGTTGTACAAGAAAACAATTG  3904

Query  3683  CTGATGTGGTTGAGGCTCTTGTGGGAGCTTTCTTAGTTGACAGTGGCTTCAAAGGTGCTG  3742
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3905  CTGATGTGGTTGAGGCTCTTGTGGGAGCTTTCTTAGTTGACAGTGGCTTCAAAGGTGCTG  3964

Query  3743  TGAAATTTCTTA-GCTGGATTGGTGTAAATGTTGATTTTGAATCCTTGCAAGTACAAGAT  3801
             |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  3965  TGAAATTTCTGAAG-TGGATTGGTGTAAATGTTGATTTTGAATCCTTGCAAGTACAAGAT  4023

Query  3802  GCTTGTATTGCAAGCAGGCGCTACATACCCCTCACTACTCGCAATAATTTGGAGGCCCTT  3861
             |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4024  GCTTGTATTGCAAGCAGGCGCTACTTGCCCCTCACTACTCGCAATAATTTGGAGACCCTT  4083

Query  3862  GAAAACCAGCTTGACTATAACTTCCTCCACAAAGGTCTACTTGTACAAGCCTTTATCCAT  3921
             |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4084  GAAAACCAGCTTGACTATAAGTTCCTCCACAAAGGTCTACTTGTACAAGCCTTTATCCAT  4143

Query  3922  CCATCTTACAACAGGCATGGAGGAGGCTGCTACCAGAGATTGGAGTTTCTTGGGGATGCT  3981
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4144  CCATCTTACAACAGGCATGGAGGAGGCTGCTACCAGAGATTGGAGTTTCTTGGGGATGCT  4203

Query  3982  GTTCTGGACTACTTGATGACATCCTATTTTTTCACTGTCTTCCCGAAACTGAAACCTGGT  4041
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4204  GTTCTGGACTACTTGATGACATCCTATTTTTTCACAGTCTTCCCGAAACTGAAACCTGGT  4263

Query  4042  CAACTGACCGATCTAAGATCGCTCTCAGTAAATAATAAGGCGCTAGCAAATGTTGCTGTC  4101
             |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4264  CAACTGACCGATCTAAGATCTCTCTCAGTAAATAATGAGGCGCTAGCAAATGTTGCTGTC  4323

Query  4102  AGTTTTTCGCTAAAGAGATTTCTATTTTGCGAGTCCGTATATCTCCATGAAGCTATAGAG  4161
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||
Sbjct  4324  AGTTTTTCGCTAAAGAGATTTCTATTTTGCGAGTCCATTTATCTTCATGAAGTTATAGAG  4383

Query  4162  GATTATACCAATTTCCGGGCAGCGTCCCCATTGGCAAGTGGACCATCTGAAGGTCCAAGA  4221
             |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct  4384  GATTATACCAATTTCCTGGCATCTTCCCCATTGGCAAGTGGACAATCTGAAGGTCCAAGA  4443

Query  4222  TGCCCAAAGGTTCTTGGTGACTTGGTAGAATCCTGTTTGGGGGCTCTTTTCCTCGATTGT  4281
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4444  TGCCCAAAGGTTCTTGGTGACTTGGTAGAATCCTGTTTGGGGGCTCTTTTCCTCGATTGT  4503

Query  4282  GGATTCAACTTGAATCATGTCTGGACTATGATGCTATCATTTCTAGATCCGGTCAAAAAC  4341
             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4504  GGGTTCAACTTGAATCATGTCTGGACTATGATGCTATCATTTCTAGATCCGGTCAAAAAC  4563

Query  4342  TTGGCTAACCTGCAGATTAGTCCTATAAAGGAACTGATTGAACTTTGCCAGTCTTACAAG  4401
             ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4564  TTGTCTAACCTTCAGATTAGTCCTATAAAAGAACTGATTGAACTTTGCCAGTCTTACAAG  4623

Query  4402  TGGGATCGGGAAATATCAGCGACGAAAAAGGATGGTGGTTTTTCTGTTGAATTAAAAGTG  4461
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||
Sbjct  4624  TGGGATCGGGAAATATCAGCGACGAAAAAGGATGGTGCTTTTACTGTTGAACTAAAAGTG  4683

Query  4462  ACCAAGAAAGGTTGTTGCCTTACAGTTTCTGCAACTGGTCGGAACAAAAGAGAGAGCACA  4521
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct  4684  ACCAAGAATGGTTGTTGCCTTACAGTTTCTGCAACTGGTCGGAACAAAAGAGAGGGCACA  4743

Query  4522  AAAAAGGCCGCACAGCTGATGATTACATCCCTGAAGGCTCATGAGCAA-ATAACAACCTC  4580
             |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct  4744  AAAAAGGCTGCACAGCTGATGATTACAAACCTGAAGGCTCATGAG-AACATAACAACCTC  4802

Query  4581  TCATCCGTTGGAGGATGTTCTGAAGAATAGCAACCTTAATGAAGCTAAATTAATTGGCTA  4640
              ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||
Sbjct  4803  CCATCCGTTGGAGGATGTTCTGAAGAATGGCATCCGAAATGAAGCTAAATTAATTGGCTA  4862

Query  4641  CAATGAAGATCCTATAGATGTTGTGAATCTTGTTGGGCTGGACGTTGAAAACCTAAAAAT  4700
             ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct  4863  CAATGAAGATCCTATAGATGTTGTGGATCTTGTTGGGCTGGACGTTGAAAACCTAAATAT  4922

Query  4701  CCAAGAAAATCTTGGCGAGAATAGTGAAATAAGCAGCTCATACGTCATCAGACGAGGTCT  4760
             || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  4923  CCTAGAAACTTTTGGCGGGAATAGTGAAAGAAGCAGCTCATACGTCATCAGACGAGGTCT  4982

Query  4761  CCCCCAGGCACCATCTAAAACAGAAGACAGGCTTCCTCAAAAGACCATCATAGAAGCAGG  4820
             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct  4983  CCCCCAAGCACCATCTAAAACAGAAGACAGGCTTCCTCAAAAGGCCATCATAAAAGCAGG  5042

Query  4821  TCAACCAAGCAGCAAAACCGCAAAATCCCTCTTGCACGAAACATGTGTTGCTAACTGTTG  4880
             |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5043  TGGACCAAGCAGCAAAACCGCAAAATCCCTCTTGCACGAAACATGTGTTGCTAACTGTTG  5102

Query  4881  GAAGCCTCCACACTTCGAATGTTGTGAGGAGGAAGGACCAGGCCACCTGAAATCATTCGT  4940
             |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5103  GAAGCCACCACACTTCGAATGTTGTGAAGAGGAAGGACCAGGCCACCTGAAATCATTCGT  5162

Query  4941  CTATAAGGTAATCCTGGAAGTTGAAGATGCGCCCAATATGACATTGGAGTGTTATGGTGA  5000
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct  5163  CTACAAGGTAATCCTGGAAGTTGAAGATGCGCCCAATATGACATTGGAATGTTATGGTGA  5222

Query  5001  GGCTAGAGCAACGAAGAAAGGTGCAGCAGAGCACGCTGCCCAAGCTGCTATATGGTGCCT  5060
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  5223  GGCTAGAGCAACGAAGAAAGGTGCAGCAGAGCACGCTGCCCAAGCTGCTATATGGTGCCT  5282

Query  5061  CAAGCATTCTGGATTCCTTTG  5081
             |||||||||||||||||||||
Sbjct  5283  CAAGCATTCTGGATTCCTTTG  5303



Lambda     K      H
    1.33    0.621     1.12 

Gapped
Lambda     K      H
    1.28    0.460    0.850 

Effective search space used: 253593896865


  Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
    Posted date:  Sep 25, 2014  6:13 PM
  Number of letters in database: 51,074,197
  Number of sequences in database:  33,602



Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5