BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg894358
Length=1605
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G24540.1 | Symbols: BGLU31 | beta glucosidase 31 | chr5:8384... 2470 0.0
AT5G24550.1 | Symbols: BGLU32 | beta glucosidase 32 | chr5:8392... 2193 0.0
> AT5G24540.1 | Symbols: BGLU31 | beta glucosidase 31 | chr5:8384876-8388027
REVERSE LENGTH=1605
Length=1605
Score = 2470 bits (1337), Expect = 0.0
Identities = 1516/1605 (94%), Gaps = 2/1605 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCAATTAAGCTAATTGCACTAGTAATCACACTATGTGTAGCATCATGGGATACTGCA 60
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Sbjct 1 ATGGCAATTAAGCTCATTGCACTAGTAATCACACTATGTGTAGCATCATGGGATGTTGCA 60
Query 61 GAAGGAAGATCTTTAAGATTTTCTACAACTCCTCTAAATCGTTATAGCTTTCCTCCTCAT 120
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Sbjct 61 CAGGGCAGATCTTTAAGATTTTCTACAACTCCTCTAAATCGTTATAGCTTCCCTCCTCAT 120
Query 121 TTTGATTTTGGTGTTGCCTCTTCCGCTTATCAGTATGAAGGTGCAGTAGAAGAAGGAGGG 180
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Sbjct 121 TTTGATTTTGGTGTTGCCTCTTCCGCTTATCAGTATGAAGGTGCAGTAGAAGAAGGAGGG 180
Query 181 AGGAGTCTAAGCATATGGGATAATTTCACACATGCATTTCCAGAAAGGACGAACATGGAC 240
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Sbjct 181 AGGAGTCTAAGCATATGGGACAATTTCACACATGCATTTCCAGAAAGGACGAACATGGAC 240
Query 241 AATGGAGATGTTGCCGTTGATTTTTACCATCGTTATAAGGAAGACATCAAATTAATAAAG 300
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Sbjct 241 AATGGAGATGTTGCCGTTGATTTTTACCATCGTTATAAGGAAGACATCAAACTAATAAAG 300
Query 301 GAAATGAATATGGATAGTTTCAGATTTTCCCTGTCCTGGTCAAGAATATTACCGAGTGGA 360
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Sbjct 301 GAAATGAATATGGATAGTTTCAGATTTTCCCTGTCCTGGTCAAGAATATTACCAAGTGGA 360
Query 361 AAAGTAAGTGATGGGGTCAATCAAGACGGTGTTCAATTCTACAAGAATCTTATTGATGAA 420
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Sbjct 361 AAACTAAGTGATGGGGTCAATAAAGAAGGTGTTCAATTCTACAAGAATCTTATTGATGAA 420
Query 421 CTTATCAAGAACGGTATAAAACCTTTTGTAACAATTTATCATTGGGATATCCCTCAAGCT 480
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Sbjct 421 CTTATCGAGAACGGTATCAAACCTTTTGTAACAATTTATCACTGGGATATCCCTCAAGCT 480
Query 481 CTTGATGATGAGTATGGTAGCTTTTTAAGTCCTCGAATCATAGATGATTTTCGAAACTAC 540
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Sbjct 481 CTTGATGATGAGTATGGTAGCTTTTTAAGTCCTCGAATCATAGATGATTTTCGAAACTAT 540
Query 541 GCCAGATTTTGTTTCCAAGAGTTTGGGGACAAGGTCAGTATGTGGACAACGTTCAACGAA 600
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Sbjct 541 GCCAGATTTTGTTTCCAAGAGTTTGGGGACAAGGTCAGTATGTGGACAACTTTCAACGAG 600
Query 601 CCATATGTTTATAGCGTTTCTGGTTATGATGCGGGAAATAAGGCAATGGGTCGATGTTCC 660
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Sbjct 601 CCATATGTTTATAGCGTTTCGGGTTATGATGCGGGTAATAAGGCAATGGGTCGATGTTCT 660
Query 661 AAATGGGTAAACAGTTTGTGCATAGCCGGTGATTCGGGCACGGAGCCTTATTTAGTCTCT 720
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Sbjct 661 AAATGGGTAAACAGTTTATGTATCGCCGGTGACTCGGGCACGGAGCCTTATTTAGTCTCC 720
Query 721 CACCACCTTCTTCTTGCTCACGCTGCTGCTGTTGAAGAGTTCAGGAAATGTGATAAGATT 780
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Sbjct 721 CACCACCTTCTTCTCGCTCACGCTGCTGCTGTTGAAGAGTTCAGGAAATGTGACAAGATT 780
Query 781 TCAAAAAATTCCAAAATAGGCATAGTGTTGTCCCCTTATTGGTTCGAGCCATATGACATT 840
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Sbjct 781 TCGCAAGATTCCAAGATAGGCATAGTGTTGTCTCCTTATTGGTTCGAGCCATATGACAGT 840
Query 841 GCTTCTAATGCTGATAAAGAAGCTGTTGAAAGAGCTCTTGCTTTCAATATTGGTTGGCAT 900
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Sbjct 841 GCTTCTAATGCTGATAAAGAAGCAGTTGAAAGGGCTCTTGCTTTCAATATTGGTTGGCAT 900
Query 901 CTCAGCCCTCT-GATTTTCGGAGACTATCCCGAGATAATAAAGGCAAGCGCTAGAAATAG 959
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Sbjct 901 CTCAGCCCTCTAG-TTTTCGGAGACTATCCAGAGACGATAAAGATAAGCGCTGGAAATAG 959
Query 960 ACTGCCATCTTTCACCAAAGAGCAATCTATGATGGTTAAAAATTCATTTGATTTTATTGG 1019
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Sbjct 960 ACTGCCATCTTTTACCAAAGAGCAATCTATGATGGTTAAAAATTCGTTTGATTTTATCGG 1019
Query 1020 TGTAAATTACTACACTGCACGGTTTGTCGCTCACGATCTTAATGTCGATATTTCAAGGCC 1079
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Sbjct 1020 TGTAAATTACTACACTGCACGGTTTGTTGCTCACGATCTTAACGTCGATATTTCACGGCC 1079
Query 1080 TCGCTTCATGACCGACCAACACCTCCAATACAAATTGACAAATCGTAGCGGAGACACCAT 1139
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Sbjct 1080 TCGCTTCATGACCGACCAACACCTCCAATACAAATTGACAAATCGTACCGGCGACACCAT 1139
Query 1140 CTCATTGGAATCGGATGGGACCAAAATTCTCTGGTCATATCCGGAAGGGCTACGAAAGAT 1199
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Sbjct 1140 CTCATTGGAATCGGATGGTACCAAAATTCTCTGGTCATATCCGGAAGGGTTACGAAAGAT 1199
Query 1200 TCTTAATTACATCAAAAATAAATACAATAATCCAACTATTTACATAACAGAAAATGGTTT 1259
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Sbjct 1200 TCTTAATTATATCAAAAATAAGTACAACAATCCAACTATCTACATAACTGAAAACGGTTT 1259
Query 1260 TGATGACTACGAAAATGGAACAGTGACACGTGAAGAGATAATAGAAGACACAAAGAGAAT 1319
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Sbjct 1260 CGATGACTACGAAAATGGAACGGTGACACGTGAAGAGATACTAGAAGACACAAAGAGAAT 1319
Query 1320 AGAATACCACCAAAAACATCTTCAACAACTCCAGAAAGCGATCATTGAGGATGGGTGTAA 1379
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Sbjct 1320 AGAGTACCACCAAAAACATCTTCAAGAACTCCAGAAAGCGATCACTGAGGATGGGTGTGA 1379
Query 1380 CGTGAAAGGCTATTTCACATGGTCGTTGTTGGATAATTTTGAATGGGAACATGGATATGC 1439
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Sbjct 1380 CGTGAAAGGCTACTTCACATGGTCGTTATTGGATAATTTTGAATGGGAACATGGATATGC 1439
Query 1440 TGTGAGATTTGGTCTGTACTACGTTGACTATAAAAATGGTCTAAAAAGACATGCTAAAAA 1499
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Sbjct 1440 AGTGAGATTTGGTTTGTACTACGTTGACTATAAAAATGGTCTTCAACGACATGCTAAACA 1499
Query 1500 CTCATCCATATGGTTCAAGCATTTTCTTCTGAGATCTGGAAAACCAATGCCGATGGATCT 1559
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Sbjct 1500 TTCAGCTATGTGGTTCAAACATTTTCTTGAGAGATCCGGAAAGCCAATGCCGATGGATCT 1559
Query 1560 GTTTAAAAGTGTCAAGAGATGGTGGTATGGATTACAGATGATTTA 1604
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Sbjct 1560 GTTTAAGAGTGTCAAGAGATGGTGGTCTACATTACAGATGATTTA 1604
> AT5G24550.1 | Symbols: BGLU32 | beta glucosidase 32 | chr5:8392059-8395302
REVERSE LENGTH=1605
Length=1605
Score = 2193 bits (1187), Expect = 0.0
Identities = 1474/1613 (91%), Gaps = 18/1613 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCAATTAAGCTAATTGCACTAGTAATCACACTATGTGTAGCATCATGGGATACTGCA 60
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Sbjct 1 ATGGCAATTAAGCTAATTGCACTAGTAATCACAATTTGTGTAGCATCATGGGATAGTGCA 60
Query 61 GAAGGAAGATCTTTAAGATTTTCTACAACTCCTCTAAATCGTTATAGCTTTCCTCCTCAT 120
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Sbjct 61 CAAGGAAGATCTTTAAGATTTTCTACGACTCCTCTAAATCGATATAGCTTTCCTCCTCAT 120
Query 121 TTTGATTTTGGTGTTGCCTCTTCCGCTTATCAGTATGAAGGTGCAGTAGAAGAAGGAGGG 180
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Sbjct 121 TTTGATTTTGGTGTTGCTTCTTCTGCTTATCAGTATGAAGGTGCAGTAGAAGAAGGAGGG 180
Query 181 AGGAGTCTAAGCATATGGGATAATTTCACACATGCATTTCCAGAAAGGACGAACATGGAC 240
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Sbjct 181 AGGAGTCCGAGTATATGGGACAATTTCACACATGCATTCCCAGAAAGGACAAACATGGAT 240
Query 241 AATGGAGATGTTGCCGTTGATTTTTACCATCGTTATAAGGAAGACATCAAATTAATAAAG 300
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Sbjct 241 AATGGAGATGTTGCTGTAGACTTTTATCATCGTTATAAGGACGACATCAAACTAATAAAG 300
Query 301 GAAATGAATATGGATAGTTTCAGATTTTCCCTGTCCTGGTCAAGAATATTACCGAGTGGA 360
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Sbjct 301 GAAATGAATATGGATAGTTTCAGATTTTCCCTGTCCTGGTCAAGAATACTACCAAGTGGA 360
Query 361 AAAGTAAGTGATGGGGTCAATCAAGACGGTGTTCAATTCTACAAGAATCTTATTGATGAA 420
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Sbjct 361 AAATTAAGCGATGGGGTAAATAAAGAAGGTGTTCAATTCTACAAGAATCTTATAGATGAA 420
Query 421 CTTATCAAGAACGGTATAAAACCTTTTGTAACAATTTATCATTGGGATATCCCTCAAGCT 480
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Sbjct 421 CTTATCAAGAATGGTATCAAACCTTTTGTAACAATTTATCATTGGGATATTCCTCAAGCT 480
Query 481 CTTGATGATGAGTATGGTAGCTTTTTAAGTCCTCGAATCATAGATGATTTTCGAAACTAC 540
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Sbjct 481 CTTGATGACGAGTATGGTAGCTTTTTAAGTCCTCGAATCATAGATGATTTTAGAAACTTC 540
Query 541 GCCAGATTTTGTTTCCAAGAGTTTGGGGACAAGGTCAGTATGTGGACAACGTTCAACGAA 600
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Sbjct 541 GCCAGATTTTGTTTCCAAGAGTTTGGAGACAAGGTCAGTATGTGGACAACCTTCAACGAG 600
Query 601 CCATATGTTTATAGCGTTTCTGGTTATGATGCGGGAAATAAGGCAATGGGTCGATGTTCC 660
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Sbjct 601 CCATATGTTTATAGTGTTTCGGGTTATGACGCGGGCAATAAGGCAATTGGTCGATGTTCA 660
Query 661 AAATGGGTAAACAGTTTGTGCATAGCCGGTGATTCGGGCACGGAGCCTTATTTAGTCTCT 720
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Sbjct 661 AAATGGGTAAACAGTTTGTGTATTGCTGGTGATTCGGGCACAGAACCTTATTTAGTCTCT 720
Query 721 CACCACCTTCTTCTTGCTCACGCTGCTGCTGTTGAAGAGTTCAGGAAATGTGATAAGATT 780
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Sbjct 721 CACAACCTTCTTCTTGCTCACGCTGCTGCCGTCGAAGAGTTCAGGAAATGTGACAAGATT 780
Query 781 TCAAAAAATTCCAAAATAGGCATAGTGTTGTCCCCTTATTGGTTCGAGCCATATGACATT 840
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Sbjct 781 TCACAAGATGCTAAGATAGGCATAGTGTTGTCCCCTTATTGGTTTGAGCCTTATGACATT 840
Query 841 GCTTCT-AATGCTGATAAAGAAGCTGTTGAAAGAGCTCTTGCTTTCAATATTGGTTGGCA 899
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Sbjct 841 GATTCCGAAT-CTGATAAAGAAGCAGTTGAACGAGCTCTTGTTTTCAATATTGGTTGGCA 899
Query 900 TCTCAGCCCTCT-G-ATTTTCGGAGACTATCCC-GAGATAATAAAGGCAAGC-GCTAGAA 955
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Sbjct 900 TCTCAGCCCTTTAGTATTT--GGAGACTA-CCCTGAAACGATTAAGACAA-CAGCTGGAA 955
Query 956 ATAGACTGCCATCTTTCACCAAAGAGCAATCTATGATGGTTA-AAAATTCATTTGATTTT 1014
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Sbjct 956 ATAGATTGCCTTCTTTCACCAAAGAGCAATCTATGATG-TTACAAAATTCATTTGATTTT 1014
Query 1015 ATTGGTGTAAATTACTACACTGCACGGTTTGTCGCTCACGATCTTAATGTCGATATTTCA 1074
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Sbjct 1015 ATCGGAATAAATTACTACACGGCACGATTTGTCGCTCACGATCTTCACGTCGATCTTTCC 1074
Query 1075 AGGCCTCGCTTCATGACCGACCAACACCTCCAATACAAATTGACAAATCGTAGCGGAGAC 1134
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Sbjct 1075 CGACCTCGCTTCACGACTGACCAACACCTCCAATACAAATTGACAAATCGTAGCGGCGAC 1134
Query 1135 -ACCATCTCATTGGAATCGGATGGGACCAAAATTCTCTGGTCATATCCGGAAGGGCTACG 1193
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Sbjct 1135 CAC-ATCTCATCAGAATCGGATGGGACAAAAATTCTCTGGTCATATCCGGAAGGCCTACG 1193
Query 1194 AAAGATTCTTAATTACATCAAAAATAAATACAATAATCCAACTATTTACATAACAGAAAA 1253
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Sbjct 1194 AAAGCTTCTTAACTATATCAAAAATAAATATAACAATCCAACTATTTACATAACTGAAAA 1253
Query 1254 TGGTTTTGATGACTACGAAAATGGAACAGTGACACGTGAAGAGATAATAGAAGACACAAA 1313
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Sbjct 1254 CGGTTTCGATGACTACGAAAATGGATCAGTGACACGTGAAGAGATAATAGAAGACACAAA 1313
Query 1314 GAGAATAGAATACCACCAAAAACATCTTCAACAACTCCAGAAAGCGATCATTGAGGATGG 1373
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Sbjct 1314 GAGAATAGAGTACCACCAAAACCATCTTCAACAACTCCAGAAAGCGATCACTGAGGATGG 1373
Query 1374 GTGTAACGTGAAAGGCTATTTCACATGGTCGTTGTTGGATAATTTTGAATGGGAACATGG 1433
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Sbjct 1374 GTGTAACGTGAAAGGCTATTTCACATGGTCATTGTTGGATAATTTTGAATGGGAACATGG 1433
Query 1434 ATATGCTGTGAGATTTGGTCTGTACTACGTTGACTATAAAAATGGTCTAAAAAGACATGC 1493
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Sbjct 1434 ATATGCAGTGAGATTTGGTTTGTACTACGTTGACTATAAAAATGGTCTATCACGACATGC 1493
Query 1494 TAAAAACTCATCCATA-TGGTTCAAGCATTTTCTTCTGAGATCTGGAAAACCAATGCCGA 1552
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Sbjct 1494 TAAAAACTCAGCCA-AGTGGTTCAAACATTTCCTTCAGAGATCTGGAAAACCAATGCCCT 1552
Query 1553 TGGATCTGTTTAAAAGTGTCAAGAGAT-GGTGGTATGGATTACAGATGATTTA 1604
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Sbjct 1553 TGGATCTGTTTAAGAGTGTCAAGA-ATTGGTGGTCTGCAATACCGATGATTTA 1604
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 79266660555
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5