BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg897087
Length=5277
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G43300.1 | Symbols: ATMIN7, BEN1 | HOPM interactor 7 | chr3:... 8709 0.0
> AT3G43300.1 | Symbols: ATMIN7, BEN1 | HOPM interactor 7 | chr3:15233896-15245034
REVERSE LENGTH=5616
Length=5616
Score = 8709 bits (4716), Expect = 0.0
Identities = 5107/5294 (96%), Gaps = 34/5294 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCGGCTGGTGGATTTTTGACTCGAGCATTTGATACGATGCTTAAGGAGTCCGGAGGA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCTGGTGGATTTTTGACTCGAGCATTTGATACGATGCTTAAGGAGTCTGGAGGA 60
Query 61 AAGAAGTATCCTGATCTCCAGAAAGCTATTCAGGCTTATCAAGATGGTTCGAAGGTTGTT 120
||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 61 AAGAAGTTTCCTGATCTCCAGAAAGCTATTCAAGCTTATCAAGATGGTTCAAAGGTTGTT 120
Query 121 ACACAGGCTGCATCCTCGAGTGTAGACGAGAGTTCACAAGCTGAAGTTGGAGGTGAAAAA 180
|| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 121 ACGCAGGCTGCACCCTCGAGCATAGTGGAGAGTTCACAAGCTGAAGGTGGAGGTGAAAAA 180
Query 181 ACTGGGGGAGAAACAGATGAACCGAAAAAAGTCCCAAGTTCTGAAGTGGCCG-AGCAGGC 239
||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| | || |||||||
Sbjct 181 ACTGGGGTAGAAGCAGATGAACCGCAAAAAGTCACGAGTGCTGAAGTAG-CGCAGCAGGC 239
Query 240 TAGCCAGTTAAAAAATGAGACTATAAATGTTTCCTTAGCAAATGCTGGACACACATTAGG 299
|||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 TAGCCAGTCAAAAAGTGAGACTATAAACGTTTCCTTAGCAAATGCTGGACACACATTAGG 299
Query 300 GGGAGCGGAAGTGGAGCTTGTTCTGAAACCTCTACGCCTTGCATTTGAGACAAAGAACTT 359
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 GGGAGCGGAAGTGGAGCTTGTGCTGAAACCTCTACGCCTTGCATTTGAGACAAAGAACTT 359
Query 360 AAAAATATTTGATGCTGCTTTGGATTGTCTTCATAAACTCATTGCCTATGATCATTTGGA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 360 AAAAATATTTGATGCTGCTTTGGATTGTCTTCATAAACTCATTGCCTATGATCATTTGGA 419
Query 420 GGGGGATCCGGGATTGGATGGTGGAAAAAACTCTGCACCTTTCACCGACATTCTGAACAT 479
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 AGGGGATCCGGGGTTGGATGGTGGAAAAAATTCTGCACCTTTCACCGACATTCTGAACAT 479
Query 480 GGTTTGCAGCTGTGTTGATAATTCATCACCAGACAGCACTGTACTCCAAGTGCTGAAGGT 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 480 GGTTTGCAGCTGTGTTGATAATTCATCACCAGACAGCACTGTACTCCAAGTACTGAAGGT 539
Query 540 TCTTCTTACAGCTGTTGCTTCAGGAAAGTTCAAAGTGCATGGGGAGCCATTGCTGGGAGT 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 540 TCTTCTTACAGCTGTTGCTTCAGGAAAGTTCAAAGTGCATGGGGAGCCATTGCTGGGAGT 599
Query 600 TATTCGAGTTTGCTATAACATTGCTCTAAACAGCAAGAGCCCAATTAACCAAGCAACTTC 659
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TATTAGAGTTTGCTATAACATTGCTCTAAACAGCAAGAGCCCAATTAACCAAGCAACTTC 659
Query 660 TAAAGCAATGCTGACTCAGATGATAAGCATTGTATTCAGGAGAATGGAGACTGACATTGT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TAAAGCAATGCTGACTCAGATGATAAGCATTGTATTCAGGAGAATGGAGACTGACATTGT 719
Query 720 TTCCGCACCATCCACAGTGTCTCAGGAAGATCATGTTTCAGGCGACAGTTCAAGCCCTAA 779
||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 720 TTCCGCATCATCCACAGTGTCTCAAGAAGAACATGTTTCAGGTGACACTTCAAGCCCTAA 779
Query 780 AAATGAAGAAATAACTGCAGCTGACGAAAATGAGAAAGAAATGACCTTAGGAGATGCACT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780 AAATGAAGAAATAACTGCAGCTGACGAAAATGAGAAAGAAATGACCTTAGGAGATGCACT 839
Query 840 CACTCAGGCAAAAGACACAACTCTTGCTTCTGTTGAAGAGCTGCATACCCTTGTGGGCGG 899
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 CACTCAGGCTAAAGACACAACTCTTGCATCTGTTGAAGAGCTGCATACCCTTGTGGGCGG 899
Query 900 TGCTGATATTAAGGGTTTAGAAGCTGCCCTTGACAAAGCTGTGCATCTTGAAGATGGCAA 959
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TGCTGATATTAAGGGTTTAGAAGCCGCCCTTGACAAAGCTGTGCATCTTGAAGATGGCAA 959
Query 960 GAAGATAAAACGGGGCATCGAGCTGGAGAGCATGAGTATTGGACAGCGTGATGCATTGCT 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GAAGATAAAACGGGGCATCGAGCTGGAGAGCATGAGTATTGGACAGCGTGATGCATTGCT 1019
Query 1020 TGTTTTCCGTACCCTTTGCAAGATGGGTATGAAAGAAGATAGTGATGAAGTCACAACCAA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 TGTTTTCCGTACCCTTTGCAAGATGGGTATGAAAGAAGATAGTGATGAAGTCACAACCAA 1079
Query 1080 GACCCGTATATTGTCTCTTGAGCTTCTTCAGGGTATGTTAGAAGGAGTTAGTCATTCGTT 1139
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 1080 GACCCGTATATTGTCTCTTGAGCTTCTTCAGGGTATGTTAGAAGGAGTTAGTCACTCATT 1139
Query 1140 TACAAAGAACTTTCACTTTATAGATTCAGTGAAAGCCTACCTCTCATATGCATTGTTGCG 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 TACAAAGAACTTTCACTTTATAGATTCAGTGAAAGCCTACCTCTCATATGCATTGTTGCG 1199
Query 1200 GGCTTCAGTATCTCAGTCTTCTGTCATATTTCAGTATGCATCTGGTATCTTCTCCGTGCT 1259
||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GGCGTCGGTTTCTCAGTCTTCTGTCATATTTCAGTATGCATCTGGTATCTTCTCCGTGCT 1259
Query 1260 TTTACTGCGGTTCAGAGACAGTTTAAAATTTAGAAATTCCTTTTATTGTGGGGATTGTTA 1319
||| |||||||||||||||||||| ||| || || | | | |||||||||
Sbjct 1260 TTTGCTGCGGTTCAGAGACAGTTT-AAA---AGTAA--GC----A---T--GGATTGTTA 1304
Query 1320 CCTTTCACCATATTTTTCTGATCCTAAATCTCACTTTCAGGGTGAAATTGGTATCTTTTT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1305 CCTTTCACCATATTTTTCTGATCCTAAATCTCACTCTCAGGGTGAAATTGGTATATTTTT 1364
Query 1380 CCCCATCATCATCTTAAGATCATTAGATAGCTCCGAGTGTCCCAATGACCAAAAGATGGG 1439
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1365 CCCCATCATCGTCTTAAGATCATTAGATAACTCCGAGTGTCCCAATGACCAAAAGATGGG 1424
Query 1440 TGTTCTTAGGATGCTTGAGAAAGTCTGCAAAGATCCGCAGATGCTTGTTGATGTGTATGT 1499
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1425 TGTTCTTAGGATGCTTGAGAAAGTCTGCAAAGATCCTCAGATGCTTGTTGATGTGTATGT 1484
Query 1500 AAACTATGATTGTGATCTAGAGGCTCCAAACTTGTTTGAGCGCATGGTAACAACTTTGTC 1559
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 AAACTATGATTGTGATCTAGAGGCCCCAAACTTGTTTGAGCGCATGGTAACAACTTTGTC 1544
Query 1560 TAAAATTGCTCAAGGGTCTCAGAGTGCTGATCCAAATCCTGCCATGGCTTCGCAGACAGC 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 TAAAATTGCTCAAGGGTCTCAGAGTGCTGATCCAAATCCTGCCATGGCTTCGCAGACAGC 1604
Query 1620 TTCAGTTAAAGGTTCATCCCTTCAGTGCCTCGTCAACGTTCTTAAATCACTAGTTGATTG 1679
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1605 TTCGGTTAAAGGTTCATCCCTTCAGTGCCTGGTCAACGTTCTTAAATCACTAGTTGATTG 1664
Query 1680 GGAGAAAATAAGGAGAGAGGCAGAAAATAGTACACGAAATGCAAATGAGGACTCTGCTTC 1739
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1665 GGAGAAAATAAGGAGAGAGGCAGAAAATAGTACAAGAAATGCAAACGAGGACTCTGCTTC 1724
Query 1740 TGCTGGAGAGCCAATTGAAACCAAAAGCAGGGAAGATATCCCAAGCAACTTTGAGAAGGC 1799
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725 TACTGGAGAGCCAATTGAAACCAAAAGCAGGGAAGATGTCCCAAGCAACTTTGAGAAGGC 1784
Query 1800 TAAAGCTCATAAATCCACAATGGAGGCTGCCATCTCCGAGTTCAACAGGAATTCAGTGAA 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785 TAAAGCTCATAAATCCACAATGGAGGCTGCCATCTCCGAGTTCAACAGGAATTCAGTGAA 1844
Query 1860 GGGTGTCGAATATCTAATTGCAAACAAGTTGGTCGAAAGGAATCCTGCTTCAGTTGCACA 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 GGGTGTCGAATATCTAATTGCAAACAAGTTGGTTGAAAGGAATCCTGCTTCAGTTGCACA 1904
Query 1920 GTTTCTGAGAAGTACTTCGAATCTGAGCAAGGTTATGATTGGCGATTATCTGGGCCAACA 1979
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1905 GTTTCTGAGAAGTACTTCGAGTCTGAGCAAGGTTATGATTGGCGATTACCTGGGCCAACA 1964
Query 1980 CGAGGAGTTTCCTCTTGCTGTCATGCACGCATATGTTGATTCAATGAAATTTTCGGAAAT 2039
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1965 CGAGGAGTTTCCTCTTGCTGTCATGCATGCATATGTTGATTCAATGAAATTTTCAGAAAT 2024
Query 2040 GAAGTTTCATTCAGCTATTCGTGAATTTCTCAAAGGTTTTAGACTTCCAGGAGAGGCCCA 2099
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2025 GAAGTTTCATTCGGCTATTCGTGAATTTCTCAAAGGTTTTAGACTTCCTGGAGAGGCCCA 2084
Query 2100 AAAAATTGATCGCATTATGGAAAAGTTTGCTGAGAGATATTGCGCAGACAATCCGGGTCT 2159
|||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2085 AAAAATTGATCGTATTATGGAAAAGTTCGCAGAAAGATATTGCGCAGACAATCCGGGTCT 2144
Query 2160 TTTCAAGAATGCAGATACTGCATATGTTCTAGCCTATGCAGTTATCATGTTAAATACAGA 2219
|||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 TTTCAAGAATGCAGATACAGCCTACGTTCTAGCCTATGCAGTTATCATGTTAAATACAGA 2204
Query 2220 TGCACATAATCCAATGGTTTGGCCTAAGATGTCAAAATCGGATTTCACACGTATGAATGC 2279
||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 TGCGCATAATCCTATGGTTTGGCCTAAGATGTCAAAATCAGATTTCACACGTATGAATGC 2264
Query 2280 CACGAATGATCCTGAAGATTGTGCTCCAACTGAACTTCTGGAAGAGATCTATGATTCTAT 2339
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 CACTAATGATCCTGAAGATTGTGCTCCAACTGAACTTCTGGAAGAGATCTATGATTCTAT 2324
Query 2340 TGTACAAGAAGAAATTAAACTAAAAGATGATGACACCATGAAGAAGCTCAGCAGTCAAAG 2399
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2325 TGTACAAGAAGAAATTAAACTAAAAGACGATGACACCATGAAGAAGCTCAGTAGTCAAAG 2384
Query 2400 GCCAGGAGGAGAAGAAAGAGGTGGTCTTGTCAGTATTCTTAATCTGGGTTTGCCAAAAAG 2459
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2385 GCCAGGAGGAGAAGAAAGAGGTGGTCTTGTCAGCATTCTTAATCTGGGTTTGCCAAAGAG 2444
Query 2460 AATATCAGCAGCTGATGCTAAGTCTGAGACTGAGGACATTGTTAGGAAAACACAGGAAAT 2519
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 AATATCAGCAGCTGATGCTAAATCTGAGACTGAGGACATTGTTAGGAAAACACAGGAAAT 2504
Query 2520 TTTCCGGAAGCATGGAGTGAAACGAGGAGTCTTCCACACTGTTGAGCAAGTCGAAATTAT 2579
|||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||
Sbjct 2505 TTTCCGAAAGCATGGAGTGAAAAGAGGAGTCTTTCACACGGTTGAGCAAGTGGACATTAT 2564
Query 2580 AAGGCCCATGGTGGAAGCTGTTGGGTGGCCTTTACTTGCTGCTTTCTCCGTTACAATGGA 2639
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 AAGGCCCATGGTGGAAGCTGTTGGGTGGCCTCTGCTTGCTGCTTTCTCCGTTACAATGGA 2624
Query 2640 AGTAGGTGATAACAAACCAAGGATTCTTCTCTGCATGGAGGGATTTAAAGCTGGAATACA 2699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2625 AGTAGGTGATAACAAACCAAGGATTCTTCTCTGCATGGAGGGATTTAAAGCTGGAATACA 2684
Query 2700 TATTGCTTATGTTCTTGGAATGGATACAATGCGATATGCCTTTCTAACATCGCTTGTCAG 2759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 TATTGCTTATGTTCTTGGAATGGATACAATGCGATATGCATTTCTAACATCGCTTGTCAG 2744
Query 2760 GTTCACTTTCTTGCATGCTCCAAAAGAAATGCGGAGCAAAAATGTTGAAGCATTGAGGAT 2819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745 GTTCACTTTCTTGCATGCTCCAAAAGAAATGCGGAGCAAAAATGTTGAAGCATTGAGGAT 2804
Query 2820 ATTACTGGCTTTGTGTGACTCGGAACCTGATACCCTTCAAGATACTTGGAATGCAGTTTT 2879
|||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2805 ATTACTGGGGTTGTGTGACTCAGAACCTGACACCCTTCAAGATACTTGGAATGCAGTTTT 2864
Query 2880 AGAATGTGTTTCTAGGCTTGAATTCATTATTTCTACTCCTGGGATTGCTGCAACAGTAAT 2939
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 2865 AGAATGTGTTTCTAGGCTGGAATTCATTATTTCTACTCCCGGAATTGCTGCAACAGTAAT 2924
Query 2940 GCATGGATCAAACCAGATCTCCAGGGATGGGGTTGTTCAATCATTGAAGGAGTTAGCCGG 2999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 GCATGGATCAAACCAGATCTCCAGGGATGGGGTTGTTCAATCATTGAAGGAGTTAGCCGG 2984
Query 3000 GAGGCCTGCTGAACAAGTTTTTGTAAACAGTGTCAAGCTGCCCAGTGAATCTGTTGTGGA 3059
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2985 GAGACCTGCTGAACAAGTTTTTGTAAACAGTGTCAAGCTGCCCAGTGAATCTGTTGTGGA 3044
Query 3060 ATTCTTTACTGCTCTATGTGGTGTTTCAGCTGAAGAACTGAAACAGTCTCCTGCCCGTGT 3119
|| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 3045 GTTTTTTACTGCGCTATGTGGTGTTTCAGCTGAAGAATTGAAGCAGTCTCCTGCCCGTGT 3104
Query 3120 TTTCAGCTTGCAGAAGCTAGTGGAGATCAGTTATTACAATATAGCTCGTATCCGAATGGT 3179
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3105 TTTCAGCTTGCAGAAGCTAGTTGAGATCAGTTATTACAATATAGCACGTATCCGAATGGT 3164
Query 3180 CTGGGCAAGAATATGGTCTGTCCTTGCCGAACATTTCGTATCTGCTGGTAGCCATCATGA 3239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3165 CTGGGCAAGAATATGGTCTGTCCTTGCCGAACATTTCGTATCTGCTGGTAGCCATCATGA 3224
Query 3240 TGAAAAAATTGCAATGTATGCCATAGATTCTCTGAGACAGCTCGGGATGAAGTATTTGGA 3299
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3225 TGAAAAGATTGCAATGTATGCCATAGATTCTCTGAGACAGCTCGGGATGAAGTATTTAGA 3284
Query 3300 ACGTGCTGAGCTCACCAATTTCACTTTCCAAAATGATATTCTCAAACCGTTCGTTATTAT 3359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3285 ACGTGCTGAGCTCACCAATTTCACTTTCCAAAATGATATTCTCAAACCGTTCGTTATTAT 3344
Query 3360 CATGCGGAATACTCAAAGCCAGACCATAAGGAGCCTAATTGTTGACTGCATCGTTCAGAT 3419
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3345 CATGCGGAATACTCAAAGTCAGACCATAAGGAGCCTAATTGTTGACTGCATCGTTCAGAT 3404
Query 3420 GATAAAATCTAAAGTTGGAAGTATAAAATCGGGATGGAGGAGTGTTTTTATGATATTTAC 3479
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GATAAAATCTAAAGTTGGAAGTATCAAATCGGGATGGAGGAGTGTTTTTATGATATTTAC 3464
Query 3480 AGCAGCTGCAGATGACGAAGTTGAATCGATAGTTGAAAAATCATTTGAGAATGTTGAGCA 3539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3465 AGCAGCTGCAGATGACGAAGTTGAATCGATAGTTGAAAAATCATTTGAGAATGTTGAGCA 3524
Query 3540 AGTTATTCTGGAACACTTTGACCAGGTGATAGGTGACTGCTTCATGGATTGCGTCAATTG 3599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3525 AGTTATTCTGGAACACTTTGACCAGGTGATAGGTGACTGCTTCATGGATTGTGTCAATTG 3584
Query 3600 TCTCATCAGGTTTGCCAATAATAAAGCTTCAGACCGGATAAGCCTGAAAGCTATTGCCCT 3659
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3585 TCTCATCAGGTTTGCCAATAACAAAGCTTCAGACCGGATAAGCCTGAAAGCTATTGCCCT 3644
Query 3660 TCTCAGAATATGTGAGGATCGGCTTGCAGAGGGACTTATACCTGGTGGTGTTCTCAAGCC 3719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 3645 TCTCAGAATATGTGAGGATCGGCTTGCAGAGGGACTTATACCCGGTGGTGTTCTTAAGCC 3704
Query 3720 CGTTGATGGCAATGAGGATGAAACTTTTGATGTGACAGAGCATTACTGGTTTCCGATGCT 3779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3705 CGTTGATGGCAATGAGGATGAAACTTTTGATGTGACAGAGCATTACTGGTTTCCGATGCT 3764
Query 3780 TGCCGGTCTGTCTGATCTCACATCTGATTTTAGGCCCGAAGTTAGAAACTGTGCTTTGGA 3839
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3765 TGCCGGTCTATCTGATCTCACATCTGATTATAGGCCCGAAGTTAGAAACTGTGCTCTGGA 3824
Query 3840 GGTGTTGTTTGATTTGCTGAATGAAAGGGGAAACAAGTTCTCCACACCTTTCTGGGAGAG 3899
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3825 GGTGTTGTTTGATTTGCTAAATGAAAGGGGAAACAAGTTCTCCACACCTTTCTGGGAGAG 3884
Query 3900 TATCTTCCATCGCATCTTGTTTCCAATTTTTGATCATGTGAGTCATGCTGGAAAGGAAAG 3959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3885 TATCTTCCATCGCATCTTGTTTCCAATTTTTGATCATGTGAGTCATGCTGGAAAGGAAAG 3944
Query 3960 CTTAATATCTTCCGGGGATGTAAAATTTCGTGAAACAAGCATTCATTCCCTCCAGCTCCT 4019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3945 CTTAATATCTTCCGGGGATGTAAAATTTCGTGAAACAAGCATTCATTCCCTTCAGCTCCT 4004
Query 4020 CTGCAATCTCTTCAATACGTTCTATAAGGAAGTATGTTTTATGCTGCCTCCACTTTTAAG 4079
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4005 CTGCAATCTCTTCAATACGTTCTACAAGGAAGTATGTTTTATGCTGCCTCCACTTTTAAG 4064
Query 4080 TTTGCTCCTAGACTGTGCGAAGAAATCAGATCAGACAGTCGTGTCAATTTCCTTAGGAGC 4139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||
Sbjct 4065 TTTGCTCCTAGACTGTGCGAAGAAATCAGATCAGACAGTTGTTTCAATTTCATTAGGAGC 4124
Query 4140 ATTGGTTCACCTCATCGAGGTTGGAGGCCACCAATTTAGTGAGGGAGACTGGGATATGCT 4199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4125 ATTGGTTCACCTCATCGAGGTTGGAGGCCACCAATTTAGTGAGGGAGACTGGGATATGCT 4184
Query 4200 TTTGAAAAGCATAAGAGATGCATCATACACAACTCAACCGCTGGAGCTGTTGAATGCTTT 4259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4185 CTTGAAAAGCATAAGAGATGCATCATACACAACTCAACCGCTGGAGCTGTTGAATGCTTT 4244
Query 4260 GAGTTTTGACAATCCGAAAAAGAACCTAGTTCTGACAGGAGACATAGAGGCCGATGCCTC 4319
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4245 GAGTTTTGACAATCCGAAAAAGAACCTAGTTTTGGCAGGAGACATAGAGGCCGATGCCTC 4304
Query 4320 TGATTCTCCACGAGTTGATCGTAATCCGGACGATATTAAAGATAATGGGAAAGTTTCCGC 4379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4305 TGATTCTCCACGAGTTGATCGTAATCCGGACGATATTAAAGATAATGGGAAAGTGTCCGC 4364
Query 4380 CCAGGCATCTCCAAGGATTGGTACTCATGGTGCTTCCGTAGAATCTGGGATACCGCCTAA 4439
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4365 CCAGGCATCTCCAAGGATTGGTACTCATGGTACTTCCCTAGAATCTGGGATACCGCCTAA 4424
Query 4440 GTCTGATGGCTCGGAAGGTCGTCCATCGTCATCTGGAAGAGCTCAAAAGGATGGGGATGA 4499
| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
Sbjct 4425 GGCTGATGGTTCGGAAGGTCGTCCATCGTCATCTGGAAGGGCTCAAAAGGATGTGGATGA 4484
Query 4500 TGTGAATTTGCAGCGGAGTCAGACTTTTGGCCAAAGATTCATGGACAATATCTTCCTCAG 4559
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 4485 TGTGAATCTGCAGCGGAGTCAGACTTTTGGCCAAAGATTCATGGACAATCTCTTCCTCCG 4544
Query 4560 GAATCTCACATCTCAACCAAAAAGCTCTGTTGCAGAAGTGTCTGTACCTTCCTCTCCATA 4619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
Sbjct 4545 GAATCTCACATCTCAACCAAAAAGCTCTGTTGCAGAAGTGACTGTACCCTCCTCTCCATA 4604
Query 4620 TAAGCATGAAGATCCTACAGAGCCCGACAGCAGAGAAGAAGAGAGTCCAGC-TCTGGGAG 4678
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 4605 TAAGCATGAAGATCCTACAGAGCCTGACAGCAGAGAAGAAGAGAGTCCAGCAT-TGGGAG 4663
Query 4679 CTATTAGACGAAAATGCATCACACAATTACTACTACTTGGTGCTATCAACAGCATTCAGC 4738
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4664 CTATTAGAGGAAAATGCATCACACAATTACTACTACTTGGTGCTATCAACAGCATCCAGC 4723
Query 4739 AAAAATACTGGAGTAATTTGAAAACACTACAGAAGATTGCGATTATGGACATCTTATTCT 4798
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4724 AAAAATACTGGAGTAATTTGAAAACCCCACAGAAGATTGCGATTATGGACATCTTATTCT 4783
Query 4799 CTTTCATAGAATTTGCTTCTTCCTACAATTCATATTCTAATCTCAGAACACGTATGAATC 4858
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4784 CTTTCATCGAATTTGCTTCTTCCTACAATTCATATTCTAACCTTAGAACACGTATGAATC 4843
Query 4859 ACATTCCCGCTGAGAGGCCACCTTTAAACCTTCTCCGGCAAGAGCTGGAAGGAACCACCA 4918
|||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4844 ACATTCCCACAGAGAGGCCACCTCTAAACCTTCTCCGGCAAGAGCTGGAAGGAACCACCA 4903
Query 4919 TATATTTGGACGTCTTGCAAAAGACAACTTCTGGGCTTGCAGATGATGCATCTAACTCGG 4978
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4904 TATATTTGGACGTCTTGCAAAAGACAACTTCTGGGCTTGCGGATGATGCATCTAACTCGG 4963
Query 4979 AAGATAGACTAGAAGGTGCAGCAGAAGAAAAATTGGTATCGTTCTGTGAACAGGTGCTGA 5038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4964 AAGATAGACTAGAAGGTGCAGCAGAAGAAAAATTGGTATCGTTCTGTGAACAGGTTCTGA 5023
Query 5039 AAGAAACATCTGATCTCCAGTCCACTTTGGGGGAGACTACTAACATGGATGTCCATCGGG 5098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5024 AAGAAACATCTGATCTCCAGTCCACTTTGGGGGAGACTACTAACATGGATGTTCATCGGG 5083
Query 5099 TACTGGAGCTGCGTTCTCCTGTGATTGTGAAGGTTTTGGAAGGCATGTGCTTCATGAACA 5158
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5084 TACTGGAGCTACGTTCTCCCGTGATTGTGAAGGTTTTGGAAGGCATGTGCTTCATGAACA 5143
Query 5159 ACACAATATTCAGGAAACACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACAAGGCTCAT--G-- 5214
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
Sbjct 5144 ACACAATATTCAGGAAGCACATGAGAGAGTTCTACCCTCTGCTCACGAGGCTCGTTTGCT 5203
Query 5215 G--A-CA--T--A-A---GAGGTGCACTAGCCAACCTTTTCAAAGCACAATTGAAGCCAC 5263
| | || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5204 GTGAACAGATGGAGATAAGAGGTGCACTAGCCAACCTTTTCAAAGCACAATTGAAGCCAC 5263
Query 5264 TTTTGCAACAGTAA 5277
||||||||||||||
Sbjct 5264 TTTTGCAACAGTAA 5277
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 263376450750
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5