BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg897634
Length=4908
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G47910.2 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase... 5600 0.0
AT3G47890.1 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase... 4601 0.0
> AT3G47910.2 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related
protein | chr3:17674417-17681722 REVERSE LENGTH=5422
Length=5422
Score = 5600 bits (3032), Expect = 0.0
Identities = 3493/3709 (94%), Gaps = 58/3709 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTCAGAAGAAGAAAACCT-C-CG-CTCGTTCCAAACAATCGCCGTCTTCTGCGGCG 57
||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 279 ATGGGCCAGAAGAAGAAAACCTCCGCGTCTCGCTCCAAACAACCGCCGTCTTCTACGGC- 337
Query 58 GTGACGACGGTGGCTGTGGCAGAGGTGGAGCCGTCTGAGATTTCCGCTTGTAGCTTCAAC 117
|| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 -TG-TGACGGT-G--GT---AGAGGTGGAGCCGTCTGAGATTTCCGCTTGTAGCTTCAAC 389
Query 118 GATGGGGGTTTTTCTGGACCAGACGCTAATGTTGAGCCGTTGGATTCAGCTGTCGTCAAG 177
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 390 GATGGGGGTTTTTCCGGACCAGACGCTAATGGTGAGCCGTTGGATTCATCTGTCGTCAAG 449
Query 178 CTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGACGGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGT 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450 CTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGACGGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGT 509
Query 238 CTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCATCAAGACTCTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGA 297
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 510 CTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCACCAAGACTCTGCCCTAATTCACCGTGTTCAGGGA 569
Query 298 ACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTGTACGAGGATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTG 357
||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||
Sbjct 570 ACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAGGATCTCGCTACGAAACAGAAGTATCTC 629
Query 358 CGAAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGCTGTCTCCAAATTCGATTGAGTTT 417
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 630 CGAAATGCAATCGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGGAGCTGTCTCCTAACTCGATTGAGTTT 689
Query 418 GGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCCAACGATGGGAAGAGAGAGTACGAG 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 690 GGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTGCTAACGAAGGGAAGAGAGAGTACGAG 749
Query 478 GAGGTTGTGCAAGAGTGCCATCGTGCTCTTTCCATCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGG 537
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 GAGGTTGTGCAAGAGTGCCACCGTGCTCTCTCCATCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGA 809
Query 538 GAGAGTCTTCAGGATGAGACTCAGCTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGCACAT 597
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 810 GAGAGTCTTCAGGATGAGACTCAGCTGAAGATATTGACACCTGAGGCTCGTATTGCTCAT 869
Query 598 TTCCAGGATGAGCTCAGATCACTGATACAGAAGTCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGG 657
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 870 TTCCAGGATGAGCTCAGGTCACTGATACAGAAGTCTAACATTTATTCATTGTCCACTTGG 929
Query 658 ATGCAGAACTTGGGAAATGGTGAAGAGAAATTTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCC 717
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 930 ATGCAGACCTTGGGAAATGGTGAAGAGAAATTTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCC 989
Query 718 GAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGACCAGGAGGCCGAATGAGATTAAAAAAGCT 777
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||
Sbjct 990 GAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGTCCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAATCT 1049
Query 778 ACCAAGACTCTTGAAGAGAGGAGGAAGGAGGTTGAAGTGAGGGTAGCTGCACATAGGTTG 837
||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1050 ACCAAGACTAATGAAGAGAGGAGGAAGGAGATTGAAGTGAGGGTAGCTGCGCATAGGTTG 1109
Query 838 TTGCAGCAGAAGTCTGAGTCTTCCCCATCGGAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGG 897
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTGCAGCAGAAGTCAGAGTCTTCCCCGTCGGAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGA 1169
Query 898 TCAGATCCAACATTAGGAGCGGGGCCAAGAAGTGGGGAGAGAAGAAAGCATGGAAATGCA 957
|||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1170 TCAGATTCAGCATTAGCCGCGGGGCCAAGAAGCGGGGAGAGAAGAAAGCATGGGAATGCA 1229
Query 958 AGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGTGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTG 1017
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 AGGAAAAATGGCTCCACAGCGGATAGAAGGGATCGGGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTG 1289
Query 1018 AGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAAGAGTTAAGTTCAGTGATCTTAAGAGTCACTTT 1077
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 AGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAAGAGTTAAGTTTAGTGATCTTAAGAGTCACTTT 1349
Query 1078 AGTGCTTCAAAGGATGGGCAAGCATATGAGATTCTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAG 1137
|||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 AGTGGTTCAAAGGATGGGCAAGCATATGAGATTGTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAG 1409
Query 1138 GCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCTTGCTGCCGGTGTAGTGAAAACTTCATAGAGCCT 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
Sbjct 1410 GCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCTTGCTGCCGGTGTAGTCAAAACTTCATAGAGTCT 1469
Query 1198 GAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAGGAGCACATGGGTAACGTGTTACCTAAGATGCAA 1257
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1470 GAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAGGCGCACATGGGTAACGTCTTACCTAAGATGCAA 1529
Query 1258 ATGGTTTTGCCTCAAATTGTCGACACTGAAAGGATTGATATGCTTTTTAATTCCCCATGG 1317
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1530 ATGGTTTTGCCACAAATTGTCGACACTGAGAGGATTGATATGCTTTTTAAGTCCCCATGG 1589
Query 1318 AAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGGTGAAATTGCTTCTCAGTCAGCAGAAAATCCAAAAT 1377
||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1590 AAACCATTGGATCTCTCTGCTACACTGAAATTGCTTCGAAGTCAGCAGAAAATACAAAAT 1649
Query 1378 TCTGAGTTTAATGAATTTCACTCTGGAGATAATATCGATGACGGTGACGATTGCTTCAAG 1437
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1650 TCTGAGTTTGATGAATTTCACTCTGGAGATAATATGGATGGTGGTGACGATTGCTTCAAG 1709
Query 1438 GATGCATGGAATGATACTACACCAGAGAAAGAAAACCTTGGAGATGCTTGCAACGGTTGG 1497
|||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||
Sbjct 1710 GATGCATGGAATGATACTACACCAGA-----------T-GGAGATACTTGCAACGGTTGG 1757
Query 1498 AATGAGAATGAATCTGAAGA--AGGT-AAGCTGTCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGA 1554
|||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758 AATGAGAATGAATCTGAAGAGGAGGTTAAGCTATCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGA 1817
Query 1555 TGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTT 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1818 TGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGTGCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTT 1877
Query 1615 GAGCTGCTTATTAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATTCAATTT 1674
|||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1878 GAGCAACTGATCAGACACAAATATTTAGCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAATTT 1937
Query 1675 ACGGTGGATGAACTCCAGAATCTACCCTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAAC 1734
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1938 ACGCTGGATGAACTCCAGAATCTACCCTCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAAC 1997
Query 1735 AAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTGCCATCTCAAG-AAAATTCTCAAATT 1793
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||
Sbjct 1998 AAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTTGGGAGCTTCCCATCTCA-GCAAAATCCTCAAATT 2056
Query 1794 CCTGCAGGACTTGTCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCCGAACAAAGTAACCCCAA 1853
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 2057 CCTGCAGGACTTATCTCAGGCCTGTGGATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCCA 2116
Query 1854 CGATGAAATTAATTTTGGTGACCTGGGTCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGG 1913
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2117 CGATGAGATTAATTTTGGTGACCTGGGTCGTGAAGTCACAGAGGAGATTCTTCTTGATAG 2176
Query 1914 TGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATGAAAAATTGCTTGGAACTGAGTGCATCCAAGAGAT 1973
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 2177 TGAAGATTCATGTCTTCTTATGGATGAAAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAAAA 2236
Query 1974 ATATATGGGCTCAGCACTTAATAATG---CTA-A-----T---GGA-A-AT-G--A-TG- 2014
|||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||| | || | | ||
Sbjct 2237 ATATATGGGCTCAGCATTTAATAATGTAACTATAGCAAGTTCTGGAGATATTGCTAATGG 2296
Query 2015 ---TG-T----CTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCGCAGGACCCTCTAG 2066
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2297 AAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATGGATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAG 2356
Query 2067 CGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGTGCACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGA 2126
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2357 CGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGCGCACAAAGGAAGATAAAACTAATCAAGGACTGGA 2416
Query 2127 GATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATG 2186
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 GATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGTTCTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATG 2476
Query 2187 CGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCACTGCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGG 2246
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2477 CGAGCACTTAAGCTATGAGGGAGCACTGCAGACTGTCGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAGG 2536
Query 2247 CCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGTTTACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGTTGAGGAA 2306
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2537 CCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAATTTACCCATGAAAGCTATGAAACTGTGCTGAGGAA 2596
Query 2307 ACGAAGAGACGATCTAAATGAGAATGACCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGA 2366
||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2597 ACGAAGAGAAGAGCTAAATGAGAGTGACCATGAGTTGTTGTTTATCAGTAGCAGGTTTGA 2656
Query 2367 GTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCTGAAACCCTTAACCACAATCAATTTGG 2426
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2657 GTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGAAAGATGCCGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGG 2716
Query 2427 ATATGAAGAATCATATGGCTGCACGAGTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGC 2486
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2717 ATATGAAGAATCATATGGCTGCACTAGTTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGC 2776
Query 2487 TGATGAATGGGGGATGAATGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGAT 2546
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2777 TGATGAATGGGGGATAAAGGATTCCTTACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGAT 2836
Query 2547 CCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCTTCAGAGCTTAGCAGAATTGACGCGA-AAATGATGC 2605
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||
Sbjct 2837 TCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCTGCAGAGCTTAGCAGAATCGATGC-ACAAATGATGC 2895
Query 2606 GTACTGTCACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATT 2665
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2896 GAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTAGAGCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATT 2955
Query 2666 ATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAG 2725
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956 ATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAAGTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAG 3015
Query 2726 CAGAGAGAGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCTTTACTTGTTGAGCTCG 2785
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3016 CAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCTGATGCTGCAAGAGAAGCCTTACTTGTTGAGCTAG 3075
Query 2786 CTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACATGCTGGAAA 2845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3076 CTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGAGGAAGAAATGATAATTCAAAAAACACGCTGGAAA 3135
Query 2846 AGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCAACTA 2905
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 3136 AGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGACACTAGGAAAGTGAAGGATATGAAGGCAACTA 3195
Query 2906 TTGGAAACGACCATCGCTTCAATGCTGATTCTGTTGAACACAGCCCCCTTCCGGTTGCAT 2965
|||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3196 TTGGAAGCGACCATCGCTCCAATGCTGATTCAGTTGAACACAGCCCCCTTCCGGTTGCAC 3255
Query 2966 CTGTCGGTGATTATTCAGAGGCTGATGTTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTATAAAAGAAC 3025
||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3256 CTGTCGGCGATCATTCAGAGGCTGACATTGTTTCTGAAGCTGTTGAAGCTTTAAAAGAAG 3315
Query 3026 AAGAAGAGGAATATAAACGCCAAAGAGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAA 3085
| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3316 AGGAAGAGGAATATAAACGCCAAATAGAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAA 3375
Query 3086 CTCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGAGGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAAC 3145
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3376 CCCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGAGGATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAAC 3435
Query 3146 AAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCCCATGAATGTTGCAAAGGCAGTGTATAATGCATGCA 3205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct 3436 AAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCCCATGAATGTTGCAAAGACAGTGTATAATGGGTGCA 3495
Query 3206 CAGATAATGTAGTTGATTATTTAGATTTACAAGGACATGGAAAATCCATAAATCAGGAGA 3265
||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||
Sbjct 3496 CAGATAATGAAGTTGATTATTTAGTTTTACAAGGACAAGAAAAATCCATAAATCAGGAGA 3555
Query 3266 AAAGGAATGGACGACTTGACGACCTGGAAGGAGCCAGAGTGAATACAAATGGAGTTTTCC 3325
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3556 AAAGGAATGGACGACTTGATGACCTGGAAGGAGCCAGTGTGAATACAAATGGAGTTTTCC 3615
Query 3326 CGTCAACAAATTATTCTGCGATATCTGATAGTGCAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAA 3385
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3616 CGTCAACAAATCATTCTGCGATATCTGATACTGCAAAGGTGCAGAATGTAAAATCCCAAA 3675
Query 3386 AAGTAGTGCCTAATGGCACAGCTATGCAAGCTGGTATGTTCCAATCTGATCAACGAACTG 3445
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3676 AAGTAGTGCCTAACGGCACAGCTATGCAAGCTGGTATTTTCCAATCTGATCAACGAACTG 3735
Query 3446 GGAGGAGAGGTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTAGTTGATGGAAAATATCCGGTCA 3505
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3736 GGAGGAGAACTAGACGCCAAAAAGCTTCAAACAAGTTAGCTGATGGAAAATATCCGGTCA 3795
Query 3506 CACCTCCTGAGACCGAAAATAGTAAATCTCAGTGGTCAGGCACCGACGCCGAGAGACATT 3565
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||
Sbjct 3796 CACCTCCTGAGACCGAAAATAGTAAATCTCAGTTGTCAGGCACCAACGGCGAGAGACATT 3855
Query 3566 CTGAAACTCTACGTAACAATGGTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTG 3625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3856 CTGAAACTCTACGTAACAATGGTGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTG 3915
Query 3626 AAGACGATGAAGAAGAAAGGTTTCAAGCTGACCTTAAAAGGGCACTGCT 3674
|||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||
Sbjct 3916 AAGACGATGACGAAGAAAGGTTTCAAGCTGACATGCAAAGGGCAGTGCT 3964
Score = 1890 bits (1023), Expect = 0.0
Identities = 1095/1130 (97%), Gaps = 4/1130 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 3781 GACGTGTACCAAGGAGGTAGAAATATGGCTTCATGTTTGAGGACACCTCTGGAAGTAAAC 3840
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3975 GACGTGTACCAAGGAGGTAGAAATATGGCGTCATGTTTGAGGACACCGCTGGAAGTAAAC 4034
Query 3841 AATGATGGGGGTTTATCTGATGACACAATTGAGTCTAGGAGCTCAACCGGAGTTGCCATA 3900
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 4035 AATGATGGGGGTTTATCTGATGACACAATGGAGTCTAGGAGCTCAACAGGAGTTACCATA 4094
Query 3901 TTTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTGAATGTTATCATA 3960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4095 TTTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATA 4154
Query 3961 CAGTCTCTATGGAATCTGGAGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACAGAGTTCAACACAAGAG 4020
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4155 CAGTCTCTATGGAATTTGGAGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACGGAGTTCAACACGAGAG 4214
Query 4021 CACCATCACGTGGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATTTTTACTGCTTTG 4080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 4215 CACCATCACGTGGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATCTTTACCGCTTTG 4274
Query 4081 AGCGCTGCTTCGAGTGAAACACAAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCT 4140
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4275 AGCGCTGCTTCAAGTGAAAAACAAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCT 4334
Query 4141 TTGAGTAATTTGTATCCAGATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 4200
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4335 TTAAGTAATTTGTATCCAGATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 4394
Query 4201 GAAGTACTGGCGGTGATCTTTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4260
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4395 GAAGTACTGGCTGTGATCTTTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4454
Query 4261 TCTGATGTGGATTCCTCAGACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACA 4320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4455 TCTGATGTGGATTCCTCAGACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCACA 4514
Query 4321 TGTATTGCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGT 4380
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4515 TGTATTGCCCATTCTTTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTGT 4574
Query 4381 GGGCTAGAATCCAGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCC 4440
||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4575 GGGCTGGAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGCC 4634
Query 4441 CTACGCACCATGAAGGTTACATGCACTGAGAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGTC 4500
|||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||
Sbjct 4635 CTACGCACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGATGAACTTCTTAACCTTGTC 4694
Query 4501 GAGATGAACCATCAACTAGCCTGTGATTCCGAAACGGGTGGATGTGGGAAACTCAACCAT 4560
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 4695 GAGATGAACCATCAACTAGCCTGTGATCCCGAAACCGGTGGGTGTGGGAAACTCAACCAT 4754
Query 4561 ATCCACCATATTCTCACTACTCCACCGCATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAAC 4620
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4755 ATCCACCATATTCTCACTACTCCACCACATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAAAC 4814
Query 4621 ACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGAC 4680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4815 ACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAGAC 4874
Query 4681 ATCAGCATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGGTT 4740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4875 ATCAGCATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCTGTGGTT 4934
Query 4741 TGTTATTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATC 4800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4935 TGTTATTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGATC 4994
Query 4801 ATGTACGATGACAAAACCGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGAGT-GATGTTCTTTCTATGTG 4859
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||
Sbjct 4995 ATGTACGATGACAAAACCGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGA-TCGATGTTCTTTCAATGTG 5053
Query 4860 TGAAAGAGGACACTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAGA-AGCGTTAA 4908
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 5054 TGAAAGAGGACACTTGCAGCCACAGGTTCTTCTCTACGAGAGA-CGTTAA 5102
> AT3G47890.1 | Symbols: | Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-related
protein | chr3:17666927-17673530 REVERSE LENGTH=4952
Length=4952
Score = 4601 bits (2491), Expect = 0.0
Identities = 3217/3562 (90%), Gaps = 72/3562 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 153 GCCGTTGGATTCAGCTGTCG-TCAAGCTAGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCGTTTGGAC 211
|||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |
Sbjct 27 GCCGTTGGATTCGGCTCT-GATCAAGCTCGAATGCGAGAAGGCACTGAAGTCATTCGGTC 85
Query 212 GGGGGAGCTATAACAAGGCGATTCGTCTGATAAAGGATTCGTGCTCTCGCCATCAAGACT 271
| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 86 GTGGGAGCTACAACAAAGCGATTCGTCTCATTAAGGATTCATGCTCTCGCCATCAAGACT 145
Query 272 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTCAAGGTTGCTGCTGTGTACGAGG 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
Sbjct 146 CTGCCCTAATCCACCGTGTTCAGGGAACTATCTGCGTGAAGGTTGCTGCTGTCTACGAAG 205
Query 332 ATCTAGCTACGAAACACAAGTATCTGCGAAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 391
|||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 ATCTAGCTACGAAACAGAAGTATCTCCGGAATGCAATTGAATCTGCTAGAAAAGCTGTGG 265
Query 392 AGCTGTCTCCAAATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTATGAGGCTG 451
|| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 266 AGTTGTCTCCTGATTCGATTGAGTTTGGGCATTTTTATGCCAACTTGCTTTACGAGGCTG 325
Query 452 CCAACGATGGGAAGAGAGAGTACGAGGAGGTTGTGCAAGAGTGCCATCGTGCTCTTTCCA 511
| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |
Sbjct 326 CTAATGATGGAAAGAGAGAGTACGACGAAGTTGTGCAAGAGTGTCATCGTGCTCTCTCTA 385
Query 512 TCGAATATCCGATTGATCCTGCTAGGGAGAGTCTT-CAGGATGAGACTCAGCTGAAGATA 570
||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 386 TCGAAAATCCGATTGATCCTGCTAAAGAGAGT-TTGCAGGATGAAACTCAGCTTAAGATA 444
Query 571 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGCACATTTCCAGGATGAGCTCAGATCACTGATACAGAAG 630
|||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct 445 TTGACACCTGAGGCTCGTATTGTTCATGTGCAGGATGAGCTCAGGTCACTAATACAGAAA 504
Query 631 TCTAACATTTA-TTCATTGTCCACTTGGATGCAGAACT-TGGGAAATGGTGAAGAGAAAT 688
|| |||| ||| ||||||||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||||| |
Sbjct 505 TCCAACA-TTAGTTCATTGTCCACTTGGATGAATAA-TCTGGGAAAAGGTGAAGAGAAGT 562
Query 689 TTAGGTTGATCCCTCTTAGGAGAATGGCCGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGATTCAGA 748
|| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 563 TTCGGTTGATACCTATTAGGAGAATGGCTGAGGATCCTATTGAGAGTAACTTGGTTCAGA 622
Query 749 CCAGGAGGCCGAATGAGATTAAAAAAGCTACCAAGACTCTTGAAGAGAGGAGGAAGGAGG 808
|||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||||||
Sbjct 623 CCAGGAGGCCTAATGAGATTAAAAAGGCTAACAAGAGTATTGAAGAGATAAGGAAGGAGG 682
Query 809 TTGAAGTGAGGGTAGCTGCA-CATAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCTGAGTCTTCCCCATCG 867
||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |
Sbjct 683 TTGAAGTTAGGGTAGCTGCAGC-TAGGTTGTTGCAGCAGAAGTCAGAG---T----GT-- 732
Query 868 GAGAATGTAGAAGCTGTTAACAACAAGGGGTCAGATCCAACATTAGGAGCGGGGCCA-AG 926
|||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||
Sbjct 733 GAGAATGTAGGCGCTGTTGACAACAAGGGATCAGATGCAACATTAGGTTCGGGG-AAGAG 791
Query 927 AAGTGGGGAGAGAAGAAAGCATGGAAATGCAAGGAAAAACGGCTCCACAGCGGATAGAAG 986
||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 792 AAGCGGTGAGAGGAGAAAGCATGGGAATGCAAGGAGAAACGGCTCCACAGCGGATAGAAG 851
Query 987 GGATCGTGTTAGGTCATACTGGGATTCTTTGAGCAAAGAAATGAAGAAAGAATTCCTAAG 1046
|||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||
Sbjct 852 GGATCGGGTTAAGTCATACTGGGATTCTATGAGCAAAGAAATGAAGAAACAATTGCTTAG 911
Query 1047 AGTTAAG-TTCAGTGATCTTAAGAGTCACTTTAGTGCTTCAAAGGATGGGCAA-GCATAT 1104
||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||
Sbjct 912 AGTTAAGCTT-AGCGATCTTAAGAGTCATTTTAGTGCTTCAAAGGATGGG-AATGAAAAT 969
Query 1105 GAGATTCTTAGCGAGGCACTGTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGCT 1164
|||||| |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 970 GAGATTATTAGTGAAGCTCTTTCCTTTTGTGAGGCCAATAAGACTTGGAGGTTCTGGGTT 1029
Query 1165 TGCTGCCGGTGTAGTGAAAACTTCATAGAGCCTGAGGCTCATATGCATCATATTGTGCAG 1224
||||||| |||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 TGCTGCCAGTGTAGCGAAAAGTTCATAAAGTCTGAGGCTTATATGCATCATATTGTGCAG 1089
Query 1225 GAGCACATGGGTAACGTGTTACCTAAGATGCAAATGGTTTTGCCTCAAA-TTGTCGACAC 1283
| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||
Sbjct 1090 GTGCACATGGGTAATGTCTTACCTAAGATGCAAATGGTTCTGCCTCAAAGTT-TTGACAC 1148
Query 1284 TGAAAGGATTGATATGCTTTTTAATTCCCCATGGAAACCATTGGATCTCTCTGCTGCGGT 1343
||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1149 TGAGAGGATTGATATGCTTCTTACTTCCCCATGGAAACCGTTGGATCTCTCTGCTGCGGT 1208
Query 1344 GAAATTGCTTCTCAGTCAGCAGAAAATCCAAAATTCTGAGTTTAATGAATTTCACTCTGG 1403
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||
Sbjct 1209 AAAATGGCTTCGCAGTCGGCAGAAAATCCAAAACTCTGAGTTTAGTGAGTTTCACGCTGG 1268
Query 1404 AGATAATATCGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCATGGAATGATACTACACCAGA 1463
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 1269 AGATAATATGGATGACGGTGACGATTGCTTCAAGGATGCACGGAATGATACTTCACCAGA 1328
Query 1464 GAAAGAAAACCTTGGAGA-TGCTTGCAACGGTTG-GAATGAGAATGAATCTGAAGAAGGT 1521
|||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||
Sbjct 1329 GAAAGAAAGCCTTGGAGACT-CTTGCAAGGGTTGTG-ATGAGAATGACCCAGAAGAAGGT 1386
Query 1522 AAGCTGTCGATCGCGTTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGT 1581
|||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 AAGCTGTCAATCACATTTCCTCCTCCTGATGGATGGCCTATATCTGATGATCCTGAACGT 1446
Query 1582 GCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTGCTTATTAGACACAAATATTTA 1641
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||
Sbjct 1447 GCAAAGCTCCTTGAAAAAATCCGTGCAGCCTTTGAGCTACTGATCAGACACAAATATTTA 1506
Query 1642 GCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATTCAATTTACGGTGGATGAACTCCAGAATCTACCC 1701
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| ||
Sbjct 1507 GCTGCCAGCCATCATGATAAGGTGATACAGTTTACGCTGGATGAACTTCAGAATCTTGCC 1566
Query 1702 TCGGTTTCGCAATTCTTAAATCGTGGCTTGAACAAGTCACCCTTATGCATCTGCTTTTTG 1761
||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1567 TCGGTGTCACAATTCTTAAATCGTAGCTTGAACCAGTCACCCATATGCATCTGCTTTTTG 1626
Query 1762 GGAGCTTGCCATCTCAAG-AAAATTCTCAAATTCCTGCAGGACTTGTCTCAGGCCTGTGG 1820
||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627 GGAGCTTCCCAGCTC-AGAAAAATTCTCAAATTCCTGCAGGACTTGTCTCAGGCCTGTGG 1685
Query 1821 ATTGAGTCGATATTCCGAACAAAGTAACCCCAACGATGAAATTAATTTTGGTGACCTGGG 1880
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |
Sbjct 1686 ATTGAGTCGATATTCTGAACAAAGTAACCCCAACGATGAATTTAATTTTGGGGCCCTGTG 1745
Query 1881 TCGTGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATGA 1940
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746 TAGAGAAGTTACAGAGGAGATTCTTCTTGATGGTGAAGATTCATGTCTTCTTTTGGATGA 1805
Query 1941 AAAATTGCTTGGAACTGAGTGCATCCAAGAGATATATAT-GG----GC--T-C---A-GC 1988
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | | | |
Sbjct 1806 AAAATTGCTTGGCACTGAGTGCATCCAAGAGATATATATGGGCTCAGCATTGCATAATGT 1865
Query 1989 A-CT-T---AA----T----A-A-TGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATGG 2033
| || | || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866 AGCTGTAGCAAGTTCTGGGGATATTGCTAATGGAAATGATGTGTCTTCTGGTGCGGATGG 1925
Query 2034 ATTTCTTTCATGGATCTTCGCAGGACCCTCTAGCGGGGAACAAGTTGTGTCATGGATGTG 2093
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1926 ATTTCTTTCATGGATCTTCACAGGACCCTCTAGCGAGGAACAAGTTGTGTCATGGATGCG 1985
Query 2094 CACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAGCATCTTGAGAAGGAGTT 2153
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1986 CACAAAGGAAGAGAAAACAAATCAAGGACTGGAGATCATGCAACATCTTGAGAAGGAGTT 2045
Query 2154 CTATCACTTACAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCACT 2213
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046 CTATCACTTGCAGAACCTCTGCGAGAGAAAATGCGAGCACTTAAGCTACGAGGGAGCACT 2105
Query 2214 GCAGACTGTTGAGGACCTTTGTCTTGAAGAAGGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGTT 2273
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106 GCAGACTGTTGAGGATCTTTGTCTTGAAGAAAGCCGGAAGAGGGAGACTTCAGCAGAGTT 2165
Query 2274 TACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGTTGAGGAAACGAAGAGACGATCTAAATGAGAATGA 2333
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||
Sbjct 2166 TACCCATGAAAGCTATGAATCTGTGCTGAGGAAACGAAGAGAAGAGCTAAATGAAAATGA 2225
Query 2334 CCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTATAACAAATGTTTTGAA 2393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2226 CCTTGAGTTGGTGTTTATCAGTAGTAGGTTTGAGTTAGATGCTTTAACAAATGTGTTGAA 2285
Query 2394 AGATGCTGAAACCCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGAG 2453
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286 AGATGCTGAAACTCTTAACCACAATCAATTTGGATATGAAGAATCATATGGCTGCACGAG 2345
Query 2454 TTCTCAGCTTCGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAATGATTCCTT 2513
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2346 TTCTCAGCTACGTGATCTGGAATCTGGTGAAGCTGATGAATGGGGGATGAAAGATTCCTT 2405
Query 2514 ACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGATTGCGATCCAGAAACAAAAAGAGCAGTTGTCTTC 2573
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 2406 ACATGAGGCTGACAGTTTCATAGAGGTTGCGATCCAGAAACAAAAAGAGCAATTGTCTGC 2465
Query 2574 AGAGCTTAGCAGAATTGACGCGAAAATGATGCGTACTGTCACTGGGATGCAGCAATTAGA 2633
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2466 AGAGCTTAGCAGAATTGACGCGCAAATGATGCGAAATGTCACTGGGATGCAGCAATTAGA 2525
Query 2634 GCTAAAGCTTGGACCAGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAA 2693
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2526 GCTAAAGCTTGGACCGGTTTCCTCCAACGATTATCAGATAGTATTGTTACCTTTGGTGAA 2585
Query 2694 GTCCTACATGCGGGCACATTTGGAGGCGTTAGCAGAGAGAGATGCCACTGAGAAGTCTGA 2753
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2586 GTCCTACATGCGTGCACATTTGGAGGCGTTGGCAGAGAAAGATGCCACTGAGAAGTCTGA 2645
Query 2754 TGCTGCAAGAGAAGCTTTACTTGTTGAGCTCGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGCTCGAGG 2813
||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2646 TGCTGCAAGAGAAGCGTTACTTTTTGAGCTAGCTCTTGATTCTAAGAAGGAGGGTCGAGG 2705
Query 2814 AAGAAATGATAATTCAAAAAACATGCTGGAAAAGTCCAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGA 2873
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2706 AAGAAATGATAATTCAAAACACACGCTGGAAAAGTCGAAGGACAAGAAAAAGATTAAAGA 2765
Query 2874 CACTAGGAAACTGAAGGATTTGAAGGCAACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGCTGA 2933
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2766 CACTAGGAAACTGAAGAATTTGAAGGCTACTATTGGAAACGACCATCGCTTCAATGGTGA 2825
Query 2934 TTCTGTTGAACACAGCCCCCTTCCGGTTGCATCTGTCGGTGATTATTCAGAGGCTGATGT 2993
|| |||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||
Sbjct 2826 CTCAATTGAGCACAGCCTCCTTTCGGTTGCATCTTTTGGTGATCATTCAGAGGCTGACGT 2885
Query 2994 TGTTTCTGAAGCTGTTGAAGC-TATAAAAGAACAAGAAGAGGAATATAAACGCCA-AAGA 3051
|||||||||||| ||||||| | ||| || | ||||||||||| | ||| ||
Sbjct 2886 TGTTTCTGAAGCCATTGAAGCGT-TAAGTGATGAGGAAGAGGAATACAGACGTTGTAAC- 2943
Query 3052 GAGCTAGAGGAGGAGGAGAGAAAACTTGAAAAAACTCTAGAGTATCAGAGAAGAATTGAG 3111
||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2944 GAGTTAGAGGAAGAGGAGAGGAAGCTTGCAAAAACTCTAGAGTATCAAAGAAGAATTGAG 3003
Query 3112 GATGAAGCTAAGGAGAAGCACATGGCAGAACAACAAAAGAAATACAGCTCTTCAGTTCCC 3171
|||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 3004 AATGAAGCTAAGGAGAAGCACATCGCCGAACAAAAAAAGAAATACAGCTGTTCAGATCCG 3063
Query 3172 ATGAATGTTG-CAAAGGCAGTGTATAATGCAT-GCACAGATAATGTAGTTGATTATT-TA 3228
|||||||| | || ||||||||||| ||| || ||| ||| ||| | ||||| || |
Sbjct 3064 ATGAATGT-GACAGAGGCAGTGTATGATG-ATTGCATAGAAAATTTCTTTGATGATGCT- 3120
Query 3229 GATTTACAAGGACATGGAAAATCCATAAATCAGGAGAAAAGGAATGGACGACTTGACGAC 3288
|||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||
Sbjct 3121 GATTTACAAGAACAAGAAAAACCCATAAATCAGGAGAAATGGAATAAACAACTTGATGAC 3180
Query 3289 CTGGAAGGAGCCAGAGTGAATACAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATTATTCTGCGATA 3348
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||
Sbjct 3181 TTGGAAGGAGCCAAAGTGAATATAAATGGAGTTTTCCCGTCAACAAATCATTGTGTGATA 3240
Query 3349 TCTGATAGTGCAAAGGTGCAGGATGTAAAATCCCAAAAAGTAGTGCCTAATGGCACAGCT 3408
||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||
Sbjct 3241 TCTGATACTGCAAAGGTGCTGGATGTAATATCCCAAGAAGTAGTGCCTAACGGTATAGCT 3300
Query 3409 ATGCAAGCTGGTATGTTCCAATCTGATCAACGAACTGGGAGGAGAGGTAGACGCCAAAAA 3468
|| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3301 ATTCAAGCTGGTGTTTTCCAATCTGATCAACGCCCTGGGAGGAGGGGTAGACGCCAAAAA 3360
Query 3469 GCTTCAAACAAGTTAGTTGATGGAAAATATCCGGTCACACCTCCTGAGACCGAAAATAGT 3528
|||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| |||||
Sbjct 3361 GCTTCAAACAAGTTGGTTGATGGAAAATATCAGGTCACACTTTCTGAGAGCGAGGATAGT 3420
Query 3529 AAATCTCAGTGGTCAGGCACCGAC-GCCGAGAGACATTCTGAAACTCTACGTAACAATGG 3587
||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3421 AAATCTCAGAGGTCAGGCACCGACAGT-GAGAGACAATCTGAAACTCTACGTAGCAATGG 3479
Query 3588 TGATGTGGGAACAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGGTT 3647
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3480 TGATGCGGGACCAAAGACATTAAGACAATTACAAGCTGAAGACGATGAAGAAGAAAGATT 3539
Query 3648 TCAAGCTGACCTTAAAAGGGCA 3669
||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540 TCAAGCTGACCTTAAAAGGGCA 3561
Score = 1530 bits (828), Expect = 0.0
Identities = 1029/1126 (91%), Gaps = 14/1126 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3784 GTGTACCAAGGAGGTAGAAATATGGCTTCATGTTTGAGGACACCTCTGGAAGTA-AACAA 3842
||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||
Sbjct 3580 GTGTACCGAGGTCGTAGAAATATGACATCATGTTTGAGGACATCTCTGGAAG-ACAACAA 3638
Query 3843 TGATGGGGGTTTATCTGATGACACAATTGAGTCT-AGGAGCTCAACCGGAGTTGCCATAT 3901
|||| ||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||||||||
Sbjct 3639 TGATTGGGTTTTATCTGATGTCACAAAGGAATCTCA-GAGTTCGCCCGGAGTTGCCATAT 3697
Query 3902 TTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTGAATGTTATCATAC 3961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3698 TTGGCACAGGTCTTCAGAATGAAGTTGGCGAATACAATTGCTTTTTAAATGTTATCATAC 3757
Query 3962 AGTCTCTATGGAATCTGGAGCTGTTTCGAGCTGAGTTCTTACAGAGTTCAACACAAGAGC 4021
||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||
Sbjct 3758 AGTCTCTGTGGAATCTGGGGATGTTTCGGGCTGAGTTCTTGCGGAGCTCAACACTAGAGC 3817
Query 4022 ACCATCACGTGGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCTTTGTATGAAATTTTTACTGCTTTGA 4081
|||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 3818 ACCATCACTTTGGAGATCCTTGTGTTGTCTGCTCATTGTATGCGATTTTTACAGCTTTAA 3877
Query 4082 GCGCTGCTTCGAGTGAAACAC-AAAATGAACCTGTGGCACCTTCATCTCTCAGGATTGCT 4140
| |||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 3878 GTACTGCTTCGAGTGAAACACGAAAA-GAACCTGTTGCTCCTTCATCTCTCAGGATTGCT 3936
Query 4141 TTGAGTAATTTGTATCCAGATAGTAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 4200
|| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3937 TTAAGTAACTTGTATCCTGATAGCAGTTTCTTCCAAGAGGCTCAGATGAACGATGCTTCA 3996
Query 4201 GAAGTACTGGCGGTGATCTTTGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4260
|||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 GAAGTATTGGCCGTAATCTTCGACTGCCTTCATCGCTCATTTGCTCAAAGTTCAAGCGTG 4056
Query 4261 TCTGATGTGGATTCCT-CAGACAGCAACTGTACTGGTTCATGGGACTGTGCCAACCGCAC 4319
||||| || | || | || |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 4057 TCTGACACAGAAT-CTGCTGAGAGCAACAGTACGGGCTCATGGGACTGTGCCAATCGCTC 4115
Query 4320 ATGTATTGCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATATTTTTGAGCAACTGAATTGCTACAGCTG 4379
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4116 ATGTATTGCCCATTCTCTGTTTGGAATGGATGTTTCTGAGCAATTGAATTGCTACAGCTG 4175
Query 4380 TGGGCTAGAATCCAGGCATATGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGC 4439
|||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4176 TGGGCTGGAGTCCAGGCATTTGAAGTACACTTCCTTTTTCCATAACATCAACGCTAGTGC 4235
Query 4440 CCTACGCACCATGAAGGTTACATGCACTGAGAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGT 4499
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4236 CCTACGCACCATGAAGGTTACATGCGCTGAAAATTCATTTGACGAACTTCTAAATCTTGT 4295
Query 4500 CGAGATGAACCATCAACTAGCCTGTGATTC-CGAAACGGGTGGATGTGGGAAACTCAACC 4558
||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||| |||||||||| |||||
Sbjct 4296 CGAGATGAACCATCAACTAGCTTGTGAT-CGCGAAGCTGGTGGGTGTGGGAAACGCAACC 4354
Query 4559 ATATCCACCATATTCTCACTACTCCACCGCATGTATTTACTACAGTTTTAGGGTGGCAAA 4618
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4355 ATATCCACCATATTCTCACCACTCCACCACATGTTTTTACTATAGTTTTAGGGTGGCAAA 4414
Query 4619 ACACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCAGCTACTCTTGCAGCCTTGAATACCGAGATAG 4678
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 4415 ACACATGTGAGACTGTAGAAGACATAGCCGCTACTCTTGCAGCTTTGAATACAGAGATAG 4474
Query 4679 ACATCAGCATCATGTACCGTGGTCTGGACCCTAAGAGCACATATAGCTTAGTTTCCGTGG 4738
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4475 ACATCAGCATCATGTACCGTGGTGTGGACCCTAAGAACACATATAGCTTAGTTTCCGTGG 4534
Query 4739 TTTGTTATTATGGACAGCATTATCATTGTTTTGCACATAGTCGTGAGCACGATCAGTGGA 4798
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4535 TTTGTTATTATGGACAGCATTATCACTGTTTTGCATATAGTCATGAGCACGATCAGTGGA 4594
Query 4799 TCATGTACGATGAC-AAAACCGTCAAGGTGATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATG 4857
|||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4595 TCATGTACGATGACCAAAAC-GTCAAGGTTATCGGTAGCTGGAGTGATGTTCTTTCTATG 4653
Query 4858 TGTGAA-AGAGGACACTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAGAAG 4902
||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 4654 TGT-AAGAGAGGACATTTGCAACCACAGGTTCTTCTCTACGAAAAG 4698
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 244864848783
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5