BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg901298
Length=2079
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G34670.2 | Symbols: | Protein of unknown function (DUF630 a... 3314 0.0
> AT2G34670.2 | Symbols: | Protein of unknown function (DUF630
and DUF632) | chr2:14612581-14615795 REVERSE LENGTH=2809
Length=2809
Score = 3314 bits (1794), Expect = 0.0
Identities = 1997/2093 (95%), Gaps = 22/2093 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGTTGTGCTGCTTCAAGAATTGATAATGAAGAAAAAGTTTTAGTGTGTAGGCAGAGA 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 565 ATGGGTTGTGCTGCTTCAAGAATTGATAATGAAGAAAAGGTTTTAGTGTGTAGGCAGAGA 624
Query 61 AAGAGGCTAATGAAAAAGTTATTAGGGTTCAGGGGAGAATTTGCTGATGCACAGTTGGCT 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 625 AAGAGGCTAATGAAAAAGTTATTAGGGTTCAGGGGAGAATTTGCAGATGCACAGTTGGCT 684
Query 121 TATCTTAGAGCTTTGAGGAATACTGGAGTTACTCTTAGGCAATTCACTGAGTCTGAGACC 180
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 685 TATCTTAGAGCTTTGAGGAACACTGGTGTTACTCTTAGGCAATTCACTGAGTCTGAGACC 744
Query 181 TTGGAGCTTGAAAACACTAGTTATGGTTTAAGTTTGcctttgcctccttcaccgcctcct 240
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 745 TTGGAGCTTGAAAACACTAGTTATGGTTTAAGTTTGCCTTTGCCTCCTTCGCCTCCTCCT 804
Query 241 acattacctccttcacctccacctcctcctccATTTAGCCCGGATTTGAGAAATCC---- 296
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 ACATTGCCTCCTTCACCTCCACCACCTCCTCCATTTAGCCCGGATTTGAGAAATCCTGAG 864
Query 297 -C--G--A--A-TTGGCTGATGAGGAGGAAGAGGGTGCTGCAGAGATTGATGGTGGTAAT 348
| | | | |||||||||||||||||||| || | || | | | |||||||||||||
Sbjct 865 ACTAGTCATGACTTGGCTGATGAGGAGGAAGA-GG-G-TG-A-A-AATGATGGTGGTAAT 918
Query 349 GATGCAAGTGGTGCAACTCCTCCGCCTCCTTTGCCGAATTCTTGGAACATTTGGAACCCT 408
|||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 919 GATGGAAGTGGTGCAGCTCCTCCGCCTCCATTGCCGAATTCTTGGAACATTTGGAACCCT 978
Query 409 TTTGAGTCACTGGAGCTGCATAGTCATCCAAATGGTGACAATGTAGTTACACAAATTGGG 468
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 979 TTTGAGTCACTTGAGCTGCATAGTCATCCAAATGGTGACAATGTAGTTACACAAGTTGAA 1038
Query 469 CTGAAGAAGAAGCAGCAAATTCAGCAAGCTGAAGAAGAAAATTGGGCTGAGACGAAGTCT 528
||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 1039 CTGAAGAAGAAACAACAAATTCAGCAAGCTGAAGAGGAAGATTGGGCGGAGACGAAGTCT 1098
Query 529 CAGTTTGAGGAAGAAGATGAGCAACAACAAGCAGGAGGTACTTGCCTTGATTTAAGTGTT 588
|| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1099 CAATTTGAGGAAGAAGATGAGCAACAAGAAGCAGGAGGTACTTGCCTTGATTTGAGTGTT 1158
Query 589 CATCAAATAGAGGCTGTTAGTGGCAGTGACATGAAGAAGCCACAG-CGTCTGAAGTTTAA 647
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 1159 CATCAAATAGAGGCTGTTAGTGGCTGTAACATGAAGAAGCCAC-GTCGTCTGAAGTTTAA 1217
Query 648 GCTGGGAGAAGTTATGGACGATAACTCATCAATGACAAGCTGCTCCGGTAAAGATCTGGA 707
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1218 GCTGGGAGAAGTTATGGACGGTAACTCATCTATGACAAGCTGCTCCGGTAAAGATCTTGA 1277
Query 708 GAACACTCGTGTGACTGATTGTAAG-ATCAGGAGGACCTTAGAAGGAATCATCAGAGAGT 766
||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 GAAAACTCATGTGACTGATTGT-AGAATCAGGAGGACCTTAGAAGGAATCATCAGAGAGT 1336
Query 767 TGGATGATTATTTTCTAAAAGCGTCGGGTTGCGAGAAGGAGATAGCTGTGATAGTAGACA 826
|||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TGGATGATTATTTTCTTAAAGCATCGGGTTGCGAGAAGGAGATAGCTGTGATAGTAGACA 1396
Query 827 TCAACAGTAGGGATACTGTTGATCCTTTCAGGTACCAGGAAACAAGAAGGAACAGAAGCA 886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1397 TCAACAGTAGGGATACTGTTGATCCTTTCAGGTACCAGGAAACAAGAAGGAAGAGAAGCA 1456
Query 887 GTTCCGCAAAGGTATTCAGTTCATTGTCATGGAGCTGGTCTTCAAAGTCTCTTCAGTTGG 946
| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457 GCTCGGCAAAGGTATTCAGTGCATTGTCATGGAGTTGGTCTTCAAAGTCTCTTCAGTTGG 1516
Query 947 GCAAAGATGCTACAACAAGCGGCACTGTTGAACCCTGTAGGCCTGGAGCTCACTGCAGCA 1006
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1517 GCAAAGATGCTACAACAAGCGGGACTGTTGAACCCTGTAGGCCTGGAGCTCACTGCAGCA 1576
Query 1007 CACTTGAGAAGCTATACACAGCTGAGAAGAAACTTTACCAGCTAGTCAGAAACAAAGAGA 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 CACTTGAGAAGCTATACACAGCTGAGAAGAAACTTTACCAGCTAGTCAGAAACAAAGAGA 1636
Query 1067 TTGCCAAAGTGGAGCATGAGAGGAAGTCTGCATTACTGCAAAAGCAAGATGGGGAAACCT 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637 TTGCCAAAGTGGAGCATGAGAGGAAGTCTGCATTACTGCAAAAGCAAGATGGGGAAACCT 1696
Query 1127 ATGATTTGAGCAAAATGGAGAAGGCACGCTTGTCTTTGGAGAGTTTGGACACCGAGATAC 1186
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1697 ATGATTTGAGCAAAATGGAGAAAGCACGCTTGTCTTTGGAGAGTTTGGAAACCGAGATAC 1756
Query 1187 AGCGTCTAGAAGATTCCATAACTACAACACGCTCATGTATGCTTAACTTGATCAATGATG 1246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 AGCGTCTAGAAGATTCCATAACTACAACACGCTCATGTTTGCTTAACTTGATCAATGATG 1816
Query 1247 AGCTGTATCCGCAGCTAGTTGCTTTAACTTCTGGGCTAGCACATATGTGGAAAACAATGC 1306
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1817 AGCTGTATCCGCAGCTAGTTGCTTTAACTTCAGGGCTAGCACAGATGTGGAAAACAATGC 1876
Query 1307 TCAAGTGCCATCAAGTTCAAATTCATATATCACAGCAACTGAACCATCTTCCAGATTACG 1366
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1877 TCAAGTGTCATCAAGTTCAAATTCATATATCCCAGCAACTGAACCATCTTCCGGATTACC 1936
Query 1367 CAAGTATAGATCTCAGTTCGGAATACAAACGCCAGGCGGTTAATCAACTAGAGACTGAGG 1426
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 1937 CGAGTATAGATCTCAGTTCGGAATACAAACGCCAGGCGGTTAATGAACTAGAGACCGAGG 1996
Query 1427 TTACTTGCTGGTACAATAGCTTTTGCAAGTTAGTAAATTCTCAGCGAGAATACGTGAAAA 1486
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1997 TTACTTGCTGGTACAATAGCTTTTGCAAGTTAGTAAATTCCCAGCGAGAATACGTGAAAA 2056
Query 1487 CACTCTGTACGTGGATCCAACTTACTGATCGCCTCTCTAATGAAGACAACCAAAGAAGTA 1546
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2057 CACTCTGTACGTGGATCCAACTTACTGATCGCCTCTCTAACGAAGACAACCAAAGAAGTA 2116
Query 1547 GCTTGCCTGTTGCTGCTCGTAAGCTCTGCAAAGAATGGCATCTTGTATTTGAAAAGCTTC 1606
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2117 GCTTGCCTGTTGCTGCTCGTAAGCTCTGCAAAGAGTGGCAGCTTGTATTTGAAAAGCTTC 2176
Query 1607 CTGATAAGGTAACTTCGGAGGCCATTAAAAGCTTTCTGATGTCAATTAAATCTGTTATTC 1666
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2177 CTGATAAGGTAACTTCAGAGGCCATTAAAAGCTTTCTGATGTCAATTAAATCTATTATTC 2236
Query 1667 ATCAACAAGCTGAGGAATACAACCTGCGGAGGAAATGTAATAAACTTGAGAGGAGGCTTG 1726
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237 ATCAACAAGCTGAGGAATACAACCTGCGTAGGAAATGCAATAAACTTGAGAGGAGGCTTG 2296
Query 1727 AGAAAGAGCTAATTTCACTGGCTGAGATCGAAAGAAGGCTCGAGGGAATTTTAGCAATGG 1786
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2297 AGAAAGAGCTAATTTCACTGGCTGAGATTGAAAGAAGGCTCGAGGGGATTTTAGCAATGG 2356
Query 1787 AAGAAGAGGAAGTAAGCTCAGCGAGTTTGGGCTCTAAGCATCCGTTGACAATCAAACAAG 1846
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2357 AAGAGGAGGAAGTAAGCTCAACGAGTTTGGGCTCTAAGCATCCGTTGTCAATCAAACAAG 2416
Query 1847 CCAAGATCGAAGCCTTGAGAAAACGAGTGGATATTGAGAAAGCTAAGTACTTAAACTCGG 1906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2417 CCAAGATCGAAGCCTTGAGAAAACGAGTGGATATTGAGAAAACTAAGTACTTAAACTCGG 2476
Query 1907 TCGAGGTTAGTAAGAGAATGACACTGGACAACCTCAAATCAAGCCTTCCCAATGTCTTTC 1966
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2477 TCGAGGTTAGTAAGAGAATGACACTAGACAACCTCAAATCAAGCCTTCCCAATGTCTTTC 2536
Query 1967 AGGTGTTGACTGCTCTCGCTAATGTCTTTGCCAATGGGTTTGAATCCATGAATGGTCAAA 2026
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||
Sbjct 2537 AGATGTTGACTGCTCTAGCTAATGTCTTTGCCAATGGGTTTGAATCCGTTAATGGCCAAA 2596
Query 2027 CCGGTACAGATGTTTTCGACACATCCCAAGATTCCGATGAGTCTCAACCCTAA 2079
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||
Sbjct 2597 CCGGTACAGATGTTTCCGACACATCCCAACATTCCGATGAATCTCAACCCTAA 2649
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 103061718885
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5