BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg902795
Length=4617
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT2G47410.1 | Symbols: | WD40/YVTN repeat-like-containing doma... 5498 0.0
> AT2G47410.1 | Symbols: | WD40/YVTN repeat-like-containing domain;Bromodomain
| chr2:19448307-19457265 FORWARD LENGTH=5221
Length=5221
Score = 5498 bits (2977), Expect = 0.0
Identities = 3324/3488 (95%), Gaps = 37/3488 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1135 AACAC-GGCATCCACGAGCAATGCATCTCAGAGTCATCAAATATTATGTTGTGCATACAA 1193
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1492 AACACTGG-ATCCACGAGCAATGCATCTCAGAGTCATCAAATATTATGTTGTGCATACAA 1550
Query 1194 TGCTAATGGAACCATTTTCGTCACGGGTAGCTCTGACAGCAATGCAAGGGTTTGGAGTGC 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TGCTAATGGAACCATTTTCGTCACGGGTAGCTCTGACAGCAATGCAAGGGTTTGGAGTGC 1610
Query 1254 CTCAAAACCTAACTTGGATGATGCTGAACAGCCGACTCATGAGCTGGATGTTCTACGTGG 1313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1611 CTCAAAACCTAACTTGGATGATGCTGAACAGCCGACTCATGAGCTGGATGTTCTACGGGG 1670
Query 1314 CCATGAGAACGATGTCAACTATGTGCAATTTAGTGGTTGTGCTGTGGCTCCGAAATGTTC 1373
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
Sbjct 1671 CCATGAGAATGATGTCAACTATGTGCAATTTAGTGGTTGTGCTGTGGCTCCAAAATCTTC 1730
Query 1374 AACAGCTGATACTCTGAAGGAAGATAGCTACCCAAAGTTTAAGAATTCCTGGTTTTCTCA 1433
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1731 AACAGCTGATGCTCTGAAGGAAGATAGCTACCCAAAGTTTAAGAATTCCTGGTTTTGTCA 1790
Query 1434 TGACAACATAGTAACCTGCTCTCGAGATGGTAGTGCAATTATATGGACTCCAAGATCACG 1493
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1791 TGACAATATAGTAACCTGCTCTCGCGATGGTAGTGCAATTATATGGACTCCAAGATCACG 1850
Query 1494 TAAATTCCATGGGAAATCTGGACGCTGGATGAAAGGATATCATCTGAAGGTTCCACCTCC 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TAAATTCCATGGGAAATCTGGACGCTGGATGAAAGGATATCATCTGAAGGTTCCACCTCC 1910
Query 1554 TCCACTTCCTCCACAACCTCCTCGAGGAGGCCCACGTCAAAGGTTTCTTCCAACACCACG 1613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1911 TCCACTTCCTCCACAACCTCCTCGAGGAGGCCCACGTCAAAGGTTTCTTCCAACACCACG 1970
Query 1614 GGGTGTTAATATGATTATATGGAGCTTGGATAATCGTTTCGTACTTGCCGCTATCATGGA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1971 GGGTGTTAATATGATTATATGGAGCTTGGATAATCGTTTTGTACTTGCCGCTATCATGGA 2030
Query 1674 TTGCAGGATTTGTGTTTGGAATGCTGCTGATGGTAGCTTAGTGCATTGTTTAACTGGTCA 1733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 TTGCAGGATTTGTGTTTGGAATGCTGCTGATGGTAGCTTAGTGCATTGTTTAACTGGTCA 2090
Query 1734 CAGTGAATCGTCCTATGTCTTGGATGTCCATCCTTTCAATCCTCGGATTGCTATGAGCGC 1793
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2091 CAGTGAATCGTCTTATGTCTTGGATGTCCATCCTTTCAATCCTCGGATTGCTATGAGCGC 2150
Query 1794 TGGCTATGATGGGAAAACAATCATCTGGGATATATGGGAGGGTATACCAATCAAAGTATA 1853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2151 TGGCTATGATGGGAAAACAATCATCTGGGATATATGGGAGGGTATACCAATCAAAGTGTA 2210
Query 1854 CGAAATCGGGAGATTTAAGTTGGTTGATGGAAAGTTTTCACAAGATGGGACATCTATTGT 1913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 CGAAATCGGGAGATTTAAGTTGGTTGATGGAAAGTTTTCACAAGATGGGACATCTATTGT 2270
Query 1914 GCTTTCAGATGACGTTGGCCAGATATATTTTCTAAACACAGGACAAGGAGAGTCTCAAAA 1973
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2271 GCTTTCAGATGATGTTGGCCAGATATATTTTCTAAACACAGGACAAGGAGAGTCTCAAAA 2330
Query 1974 GAATGCAAAATACGACCAGTTCTTCCTTGGTGATTATCGTCCTCTTATTCGAGATACCAA 2033
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331 GAATGCAAAATACGACCAGTTCTTCCTTGGTGATTATCGTCCTCTTATTCGAGATACCAA 2390
Query 2034 TGGACACGTTCTTGATCAGGAGACGCAGCTTCTTCCTCATCGGAGGAACCTTCAGGATCT 2093
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2391 TGGACATGTTCTTGATCAGGAGACGCAGCTACTTCCTCATCGGAGGAACCTTCAGGATCT 2450
Query 2094 CCTTTGTGATTCAAGTATGATTCCGTATCCAGAACCTGACCAGACAATGTTTCAGCAACG 2153
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2451 TCTTTGTGATTCAAGTATGATTCCGTATCCAGAACCTGACCAGACAATGTTTCAGCAACG 2510
Query 2154 CAGACTTGGTGCACTAGGAGTTGAATGGCGTCCTTCCTCGATAAAGTTTTCTGTTGGCCC 2213
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511 CAGACTTGGTGCATTAGGAGTTGAATGGCGTCCTTCCTCGATAAAGTTTTCTGTTGGCCC 2570
Query 2214 TGATTTTAGTTTAGGTCAAGATTATATAATGCCTCCTTTGGCTGATCTGGATAGATTGAT 2273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2571 TGATTTTAGTTTAGGTCAAGATTATATAATGCCTCCTTTGGCTGATCTGGATAGACTGAT 2630
Query 2274 CGAGCCGTTGCCTGAGTTTATAGATGCTATGTACTGGGAACCAGAACACGAAGTTCTGAG 2333
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2631 TGAGCCATTGCCTGAGTTTATAGATGCTATGTACTGGGAACCAGAACACGAAGTTCTGAG 2690
Query 2334 TGACGACAATGATTCGGAGTATAATGCTGAAGTTTCCTCTGATGGAGCTAGGGCAAGCCC 2393
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2691 TGACGACAATGATTCAGAGTATAATGCTGAAGTTTCCTCTGATGGGGCTAGGGCAAGCCC 2750
Query 2394 ATATTCCGACTCGTCAAATGAACTTGAGTGCAGTTCCGAGGACAGTGAAGTTGAAAATAT 2453
|| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2751 ATGTTCCAACTCTTCAAATGAACTTGAGTGCAGCTCCGAGGACAGTGACGTTGAAAATAT 2810
Query 2454 TCACGAAAATAACTATCATTGGAAAAGAAGAAGAAAACATCCTAGGGCCGAGGTCTCTAC 2513
|||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||
Sbjct 2811 TCACGAAAGTAGCTATCATTGGAAAAGAAGAAGAAAACATCCTAAGGTCAACGTCTCTAC 2870
Query 2514 TTCATCTGGAAGACGTGATAAGAGGAATTTGGATGAGAATGATAGCTCGAAATCTGGACT 2573
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 2871 TTCATCTGGAAGACGTGATAAGAGGATTTTGGATGAGAATGATAGCTCGAATTCTGGAAT 2930
Query 2574 TAAGAAAAGTAAGAACCGGAGAATTGTCGTGAAGGCTTCAAAAAGAAAATATTCTGATGT 2633
||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2931 TAAGAGAACCAAGAACCGAAGAATTGTCGTGAAGGCTTCAAAAAGAAAACATTCTGATGT 2990
Query 2634 CAAAGCATCACGGCCGCAAAGAGCAGCGGCTCAAAATGCTCGATCCTTGCTTTCTAAAAT 2693
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2991 CAAAGCATCACGGCCGCAGAGAGCAGCAGCTCAAAATGCTCGATCCTTGCTTTCTAAAAT 3050
Query 2694 TTCTGGAAGCTCTTCGGATGAAGTTGATGATGATAATGATTCATCCAACAGTGAATCTGA 2753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051 TTCTGGAAGCTCTTCGGATGAAGTTGATGATGATAATGATTCATCCAACAGTGAATCTGA 3110
Query 2754 TAGAAGCATACCCACGTCGCGACAGTTGGACAACCCATCTCATATGCTGGAATCTCTTTC 2813
||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3111 TAGAAGCATACCCACTTTGCGACAGTTGGACAAACCATCTCAGATGCTGGAATCTCTTTC 3170
Query 2814 AAATGACAAACAGAAGAAAAGATTGATTGTAAAGATCTCTGTTAAGAAGGCAGCTGAGTC 2873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||
Sbjct 3171 AAATGACAAACAGAAGAAAAGATTGATTGTAAAGATCTCTGTTAAGAAGCCAGCAGAGTC 3230
Query 2874 TGTGGAAAGCAAGGGAGATGTAATAAATCGGGCTGATTTGGAGCAATTATCTTTTAAATC 2933
| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |
Sbjct 3231 TATGGGAAGCAAGGGAGATGTGATAAATCAGGCTGATTTAGAGCAACTATCTTCCAAACC 3290
Query 2934 TTTGGATGAAAATCACAAAGTGATTGGTATATACTCCAGGGAACCCGGGTCAAGTTCTGT 2993
|||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3291 TTTGGAGGAGAATCACAGAGTGATTGGTATATATTCCAGAGAACCCGGGTCAAGTTCTGT 3350
Query 2994 AGATGCAAAAGGCGATTCATGGTGTCAGAATATTCTTTACTCTATGAATATGCCACAGAG 3053
|||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3351 AGATGCAAAAGGTGATTCAGGGTGTCAGAGTATTCCCTACTCTATGAATACGCCACAGAG 3410
Query 3054 AGAAAAGGCCGATAATCAATTGATAAAATCTTCAGATCAAGACCAGAATATGTGCAAGTG 3113
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3411 AGAAAAGGCCGATAATCAGTTGATAAGATCTTCAGATCAAGACCAGAATATGTGCAAGTG 3470
Query 3114 GAGGGACGAGATTCCTGTTTGTGAACCTACCGAATTAACTGCGTCTGAGAACGTAGAAGA 3173
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 3471 GAGGGAAGAGATTCCTGTTTGTGAACCTACCGAATTAACTGCGCCTGAGAACATAGAAGA 3530
Query 3174 AGCCCAACCATTTAATGGGGATGAAGATCTG-TCGAGAGTTGAACCCTTGTCTGCTGATG 3232
||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||| || | || | | |
Sbjct 3531 AGCCCAACCATTTTATGGGGATGAAG--CTGAT-GAGA-TT---C--TT--C--CA-A-- 3574
Query 3233 AGATTCTTCCAAAGAAAGTTCGACGACTGAGATTAAAGCTTCGGCATCCCAACAGTCCTC 3292
||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3575 AGA-------AA-G----TTCGACGACTGAGGTTAAAGCTTCGGCATCCCAACAGTCCTC 3622
Query 3293 TAAAACTAGAACCTGATGAGATAGCAGATGATTTGGCAGATGGTGGAGATGGGTTTGCAT 3352
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3623 GAAAACTAGAACCTGATGAGGTGGCAGATGATTTGGCAGATGGTGGAGATGGGTTTGCAT 3682
Query 3353 CCATAGCTCCCTCTTCCATGAATCCGATTATAGATTCTGAACCTGTGATAGATAGTGTTA 3412
||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3683 CCATAGCTCCCTCTTTCATGAATCCGATTATGGATTCTGAACCTGTGATAGATAGCGTTA 3742
Query 3413 GAGATTCTTCTGCACATGACTTTGAGTTTGGAGAATCTACAGCTGATGTGAGACGTAGGA 3472
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3743 GAGATTCTTCTGCACATAACTTTGAGTTTGGAGAAGCTACAGCTGATGTGATACGTAGGA 3802
Query 3473 AAAGATCCGTAAGAAGTGAATCTAGTACAAGAAATAGCGCATTACGCGTAAGGTTGGGCT 3532
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3803 AAAGATCCATAAGAAGTGAATCTAGTACAAGAAATAGCGCATTACGCATAAGGTTGGGCT 3862
Query 3533 CTGGATCTGTAGATAAAATAAAGAAACAAGGGATTCCTTCCACAAACAAGTATGATGGTG 3592
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||
Sbjct 3863 CTGGATCTGTAGACAAAATAAAGAAACAAGGGATTCCTTCCACAAGCGTGTATGATGATG 3922
Query 3593 CATCACTTGAAGAATGGCCTTCTACCTCAAAAGCTGGGTCCCGGTCTAGATCTGCAAGCG 3652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 3923 CATCACTTGAAGAATGGCCTTCTACCTCAAAAGCTGGGTCCAGGTCTAGATCTGCAAGCG 3982
Query 3653 CCAGCAAACCAAGTCTGCATACTGGGATAAGGTTGAATAGTGTCTCAAGAAAAATCTCAT 3712
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3983 TCAGCAAACCAAGTCTTCATACTGGGATAAGGTTGAATAGTGTCTCAGGAAAAATCTCAT 4042
Query 3713 GGTTATTGTTGTCTGAACACGAGGAAGGCTGCCGTTATATACCCCAGCTAGGGGATGAAG 3772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4043 GGTTATTGTTGTCTGAACACGAGGAAGGCTGCCGTTATATACCTCAGCTAGGGGATGAAG 4102
Query 3773 TTATTTACTTCAAGCAGGGTCATCAAGAGTTCCTTGAAACTAGAGAATTAAATGACAGGG 3832
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4103 TTATTTACTTCAAGCAGGGTCATCAAGAGTTCCTTAAAACTAAAGAATTAAATGACAGGG 4162
Query 3833 ACCGATCAAGGTACCTTCCCCGAAACCTAGGAGCGGTAGAGATTTGCAAAGTCGAGAAAC 3892
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4163 ACCGATCAAGGTACCTTCCCCGAAACCTAGGAGCAGTAGAGATTTGCAAAGTCGAGAAAC 4222
Query 3893 TTAACTACGATACATATCCTGGTTCTGGGGAAAGCTGCTGCAAAATGACCCTCAGGGTTC 3952
||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4223 TTAACTATGATACATATCCTGGTTCTGGAGATAGCTGCTGCAAAATGACCCTCAGGGTTC 4282
Query 3953 TGGATTCTTCTTCATCACATGCCTCCCGCAAAGAGTTTCAACTGACACTTCCTGATCTCA 4012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4283 TGGATTCTTCTTCATCACATGCCTCCCGCAAAGAGTTTCAACTGACACTTCCTGAGCTCA 4342
Query 4013 TTAATTTCCCTGATTTTATTGTGGAGAAGACTAGATACGACGCTGCAATTCAAACAAAAT 4072
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 4343 TTAATTTCCCTGATTTTATTGTGGAGAAGACTCGATACGACGCTGCAATTCAAACAAACT 4402
Query 4073 GGGAAATTGGTGATGAGTGCCGTGTGTGGTGGAGAAATG-AATCCGGTGAAGGCGGGGAT 4131
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |
Sbjct 4403 GGAAAATTGGTAATGAGTGCCGTGTGTGGTGGAGAGACGCAA-CCGGTGAAGGCGGGGCT 4461
Query 4132 TGGTGGGGAGGTAGGATTGAGTCTTCACAAGAAAAATCCAGTGACTTCCCAGATAGTCCA 4191
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||
Sbjct 4462 TGGTGGGAAGGTAGGATTGAGTCTTCACAAGTAAAATCCACTGACTTCCCAGAGAGTCCA 4521
Query 4192 TGGGAAAGATACAGAGTTGTCTATGAAACAGGGGACACAAGTCTTCACAGCCCGTGGGAG 4251
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||
Sbjct 4522 TGGGAAAGATACAGAGTTGTCTATGAAACAGGGGAAACGAGTCTTCACAGCCCGTGGGAG 4581
Query 4252 TTTGACAATCCCCAGTTTCCCTGGGAAAAATCTACCATCgaaga-gaagagaagagagaa 4310
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 4582 TTTGACAATCCCGAGTTTCCCTGGGAAAAATCTACCATCGAAGATGA-GAGAAGAGAGAA 4640
Query 4311 ACTGCTTTCATTATTTGCTGGACTAGTAAAATCAATCAGCAAGCATCAGGATAGTTATGG 4370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4641 ACTGCTTTCATTATTTGCTGGACTAGTAAAATCAATCAGCAAGCATCAGGATAGTTACGG 4700
Query 4371 GATCCAAAAGCTAAACGAAGCTGCTCAAAAGATGGATTTCTGCAATAGGTTCCCGGTTCC 4430
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4701 GATCCAAAAGCTAAACGAAGCAGCTCAAAAGATGGATTTCTGCAATAGGTTCCCGGTTCC 4760
Query 4431 TTTATACCCTGAGCTGATTCACCAGAGACTAGAGAATCAGTACTACAGAAGTATTGAATC 4490
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4761 ATTATACCCTGAGCTGATTCACGAAAGACTAGAGAATCAGTACTACAGAAGTATTGAATC 4820
Query 4491 GTTTAAACACGACGTGGATGCAATGCTCTCAAATGCGGAGTTGTATTTCGTTAGAAACGC 4550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4821 GTTTAAACACGACGTGGATGCAATGCTCTCAAATGCGGAGTTGTATTTCGTTAGAAGTGC 4880
Query 4551 ACATATGCTTTCGAAGATGAAGCGACT-CGGAGATAAATTGACAAAAACGTTAAGAAAGG 4609
|||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4881 ACATATGCTTTCGAAGATAAAGCGACTGCG-AGATAAATTGACAAAAACGTTAAGAAAGC 4939
Query 4610 TGATCTGA 4617
||||||||
Sbjct 4940 TGATCTGA 4947
Score = 1857 bits (1005), Expect = 0.0
Identities = 1080/1116 (97%), Gaps = 5/1116 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGACTGGATACACAAATCTACTCCTTTTATGGAAACTTCGAATCTGGCAAACCTGGTT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 385 ATGGACTGGATACACAAATCTACTCCTTTTATGGAACCTTCGAATTTGGCAAAACTGGTT 444
Query 61 CAAGGAAATGTTCCTCTTGC-GCCACATGAGAGCCATTCTTCGCTAACTGATGTAGATAT 119
|||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 445 CAAGGAAATGTTCCTCTT-CAGCCACATGACAGCCATTCTTCGCTAACTGATCTAGATAT 503
Query 120 GGACCTTAGAGAAGTCTATTTCCTGATTTTACATTTTCTTTCTACTGGCCCCTGCCAACG 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct 504 GGACCTTAGAGAAGTCTATTTCCTGATTTTACATTTTCTTTCTATTGGCCCCTGCGAACG 563
Query 180 AACCTTTGGCCACTTGAGAGACGAAATTTTGGAAAATGGCCTTTTGCCCCGTAGATATCA 239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||
Sbjct 564 AACCTTTGGCCACTTGAGAGACGAAATTTTGGAAAAAGGGCTTTTACCCCGTAGATATCA 623
Query 240 TTCCTGGTGGTCAAGAAGTGGCACTTGTAGTGGGCGTGCTGACGATGATGGCATCTCCCT 299
||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 624 TTCCTGGTGGTCAAGAAGTGGCATTTATAGCGGGCGTGCTGATGATGATGGCATCTCCCT 683
Query 300 ACCCTTGAGTTATGATAATTTGATAGAGAGGTATCCTCATATCGAAAAGGATCACTTGGT 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 CCCCTTGAGTTATGATAATTTGATAGAGAGGTATCCTCATATCGAAAAGGATCACTTGGT 743
Query 360 GAAGCTTCTCAAACAACTAATTTTAAACCCGTCTTTCCCTTCACACATGAGAGTTGAAGG 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 GAAGCTTCTCAAACAACTAATTTTAAACCCGTCTTTCCCTTCACACATGAGAGTTGAAGG 803
Query 420 AAATGGTCCTAATGCTGCTGATGTTCCAACACTATTGGGATCTGGCACCTTTTCACTTGT 479
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 804 AAATGCTCCTAATGCTGCTGATGTTCCAACACTATTGGGATCTGGCACCTTTTCACTTGT 863
Query 480 CGATCGTA--AA-AATATAGTCTCTCAGAAAGCTAGGCATGTTGCGTCATACTTACGCTG 536
||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 GGATCGTAGTAACAATATAGAGTCTCAGAAAGCTAGGCATGTTGCGTCATACTTACGCTG 923
Query 537 GCCGCATATGCATGCCGATCAAGTGCGTGGCCTAAGTCTCAGAGAAATTGGAGGAGGTTT 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 GCCGCATATGCATGCCGATCAAGTGCGTGGCCTAAGTCTCAGAGAAATTGGAGGAGGTTT 983
Query 597 CAGAAAACACCACCGTGCACCGTCCATTCTTTCAGCATGTCATGCTATTGCAAAACCATC 656
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 984 CAGGAAACACCACCGTGCTCCGTCCATTCTTTCAGCATGTCATGCTATTGCAAAACCATC 1043
Query 657 AACAATGGTTCAAAAGATGCAAAATATAAAGAAGCTCAGAGGACATCGTAATGCTGTCTA 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1044 AACAATGGTTCAAAAGATGCAAAATATAAAGAAGCTCAGAGGACATCGTAATGCTGTCTA 1103
Query 717 CTGCGCTATATTTGATCGTTCTGGAAGATATGTTATCACTGGTTCCGATGACCGGCTTGT 776
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1104 CTGCGCTATATTTGATCGTTCTGGAAGATATGTTATCACTGGCTCCGATGACCGGCTTGT 1163
Query 777 CAAAATTTGGTCAATGGAAACTGCGCTTTGCTTGGCTAGCTGCCGCGGGCATGAAGGTGA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1164 CAAAATTTGGTCAATGGAAACTGCGCTTTGCTTGGCTAGCTGCCGTGGGCATGAAGGTGA 1223
Query 837 CATTACAGACTTGGCTGTTAGTTCAAATAATGCTTTGGTGGCGTCAGCTTCAAACGATTT 896
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 1224 CATTACAGACTTGGCCGTTAGTTCAAACAATGCTTTGGTTGCTTCAGCTTCAAACGATTT 1283
Query 897 TGTGATTCGAGTGTGGCGGTTGCCTGATGGAATGCCAATTTCTGTATTGCGGGGCCACAC 956
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1284 TGTGATTCGAGTGTGGCGGTTGCCTGATGGAATGCCAATTTCTGTATTGCGGGGACACAC 1343
Query 957 TGGAGCTGTTACTGCAATTGCGTTCAGTCCCAGACAGGCGTCTGTTTACCAACTTTTATC 1016
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1344 TGGAGCTGTTACCGCAATTGCATTCAGTCCCAGACAGGCGTCTGTTTACCAACTTTTATC 1403
Query 1017 GTCATCAGATGATGGAACCTGTCGTATCTGGGATGCTAGGTATTCTCAGTGGCTCCCACG 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 GTCATCAGATGATGGAACCTGTCGTATCTGGGATGCTAGGTATTCTCAGTGGCTCCCACG 1463
Query 1077 AATCTATGTTCCAAGTCCTTCAGATGCTAGCACTGG 1112
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1464 AATCTATGTTCCAAGTCCTTCAGATGCTAACACTGG 1499
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 230266268370
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5