BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg903917
Length=2370
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G10390.1 | Symbols: FLD | Flavin containing amine oxidoreduc... 3879 0.0
> AT3G10390.1 | Symbols: FLD | Flavin containing amine oxidoreductase
family protein | chr3:3229293-3232345 FORWARD LENGTH=2655
Length=2655
Score = 3879 bits (2100), Expect = 0.0
Identities = 2281/2370 (96%), Gaps = 6/2370 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGTCTCATTCTCCGCGCCAAAGAAACGAAGGAGAGGCCGTTCTCAGCGCTCAGTGTCG 60
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 1 ATGGTCTCATTCTCCGCACCAAAGAAACGAAGGAGAGGACGTTCTCAGCGCTCAATGTCT 60
Query 61 TCGCTTAATACCCTCCCCGTCCCTAACGTAGGTGTTCTTCCAGGTCACACTAATTTCGTG 120
||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||
Sbjct 61 TCGCTTAATTCCCTTCCCGTCCCTAACGTAGGTCTTCTTCCTGGTAACAGTAATTTCGTG 120
Query 121 TCATCTTCAGCTTCTTCTTCCGGTAGATTGAACGTAGAGATTGTCAATGGATCAAACCAG 180
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||
Sbjct 121 TCATCTTCAGCTTCTTCTTCCGGTAGATTTAACGTAGAGGTCGTCAATGGATCAAACCAG 180
Query 181 ACTCTGAAAAGTTATCCTGGGATTGGTGATGAGATCATTACGATTAACAAGGAGGCTACC 240
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 181 ACTGTGAAAAGTTATCCTGGGATTGGTGATGAGATCATTACGATTAACAAGGAAGCTACC 240
Query 241 ACCGAAGCTCTGCTTGCTCTCACAGCTGGGTTTCCTGCTGATTCGCTTACCGAGGAAGAG 300
|| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 ACTGAAGCTTTGCTTGCTCTCACTGCTGGGTTTCCTGCTGATTCGCTTACCGAGGAAGAG 300
Query 301 ATTGAATTCGGTGTGGTCCCTGTGGTTGGAGGCATTGAACAAGTCAATTACATTTTGATA 360
||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 301 ATTGAATTCGGTGTGGTGCCTATTGTTGGAGGCATTGAACAAGTCAATTACATTTTGATT 360
Query 361 AGGAACCACATTATATCAAAATGGCGAGAAAATATATCTAGTTGGGTCACAAAGGAGATG 420
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGGAACCACATTATATCCAAATGGCGAGAAAATATATCTAGTTGGGTCACAAAGGAGATG 420
Query 421 TTT-TTCGATTCTATTCCTAAACATTGCAGTAGTCTCTTGGATTCGGCTTATAATTACTT 479
||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 421 TTTCTT-AATTCGATTCCTAAACATTGTAGTAGTCTCTTAGATTCGGCTTATAATTACTT 479
Query 480 GGTTACACATGGATATATCAATTTTGGTATAGCACAGGCAATTAAAGATAAGTTTCCTGC 539
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 480 GGTTACACATGGATATATCAATTTTGGAATAGCACAGGCGATTAAAGATAAGTTTCCTGC 539
Query 540 TCAATCAAGTAAGTCTAGTGTGGTTGTAGTGGGTGCTGGATTGTCTGGGTTGGCTGCAGC 599
||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||| || |||||||||||||||||
Sbjct 540 TCAGTCAAGCAAGTCTAGTGTGATTATAGTTGGTGCTGGTTTATCTGGGTTGGCTGCAGC 599
Query 600 TAGGCAACTGATGAGGTTTGGGTTTAAAGTCACGGTTTTAGAGGGTAGGAAACGACCCGG 659
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 600 TAGGCAACTGATGAGGTTTGGCTTCAAAGTCACGGTTTTGGAGGGTAGGAAACGACCCGG 659
Query 660 TGGACGGGTTTATACCAAAAAGATGGAAGCTAATAGGGTAGGTGCTGCAGCGGATTTAGG 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGGACGGGTTTATACCAAAAAGATGGAAGCTAATAGGGTAGGTGCTGCAGCGGATTTAGG 719
Query 720 TGGGAGTGTTTTGACTGGAACATTAGGAAATCCTCTAGGGATTATAGCCAGACAG-TTGG 778
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |
Sbjct 720 TGGGAGTGTTTTGACTGGAACATTAGGAAATCCTTTAGGGATTATAGCGAGACAGCTT-G 778
Query 779 GTTCTTCTCTTTATAAGGTACGAGATAAGTGTCCTCTATATAGAGTGGATGGTAAACCGG 838
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 779 GTTCTTCTCTCTATAAGGTACGAGACAAGTGTCCTCTTTATAGGGTGGATGGTAAGCCGG 838
Query 839 TTGATCCAGATGTGGATATGAAGGTTGAGGTAGCTTTTAACCAGCTTCTAGACAAGGCAA 898
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 839 TTGATCCAGATGTGGATATAAAGGTTGAGGTAGCGTTTAACCAGCTTCTAGACAAGGCAA 898
Query 899 GTAAACTTAGGCAGTTGATGGGTGATGTTTCCATGGATGTCTCCCTTGGGGCAGCACTCG 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 GTAAACTTAGGCAGTTGATGGGTGATGTTTCCATGGATGTCTCCCTTGGGGCAGCACTCG 958
Query 959 AGACATTCAGGCAGGTTTCTGGGAATGATTTGGCCACCGAGGAGATGGGTTTGTTTAACT 1018
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AGACATTCAGGCAGGTTTCTGGGAATGATGTGGCCACCGAGGAGATGGGTTTGTTTAACT 1018
Query 1019 GGCATCTTGCTAACTTAGAATATGCAAATGCGGGCCTAGTATCAAAGCTTTCTCTTGCAT 1078
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1019 GGCATCTTGCTAACTTGGAGTATGCAAATGCGGGCCTAGTATCAAAGCTTTCTCTTGCAT 1078
Query 1079 TCTGGGATCAAGATGACCCATATGATATGGGTGGAGACCACTGCTTTCTGCCTGGAGGAA 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079 TCTGGGATCAAGATGACCCATATGATATGGGTGGAGATCACTGCTTTCTGCCTGGAGGAA 1138
Query 1139 ATGGAAGGCTGGTTCAGGCTTTGGCTGAAAATGTACCAATCTTATATGAGAAGACCGTCC 1198
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1139 ATGGAAGGCTGGTTCAGGCTTTGGCTGAAAATGTACCAATATTATATGAGAAGACCGTCC 1198
Query 1199 AAACAATCAGATATGGTTCAAATGGTGTCAAGGTAATTGCTGGAAATCAAGTGTATGAGG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1199 AAACAATCAGATATGGTTCAAATGGTGTCAAGGTAACTGCTGGAAATCAAGTGTATGAGG 1258
Query 1259 GTGATATGGTGCTGTGTACAGTTCCCCTTGGTGTTCTTAAGAACGGATCCATCAAATTTG 1318
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGATATGGTGCTGTGTACAGTTCCCCTTGGTGTCCTTAAGAACGGATCCATCAAATTTG 1318
Query 1319 TTCCCGAATTACCTCAGAGAAAGCTTGATTGTATGAAGAGATTAGGTTTTGGGTTACTGA 1378
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 TTCCCGAATTACCTCAGAGAAAGCTTGATTGTATAAAGAGATTAGGTTTTGGGTTACTGA 1378
Query 1379 ACAAAGTTGCAATGCTCTTTCCGTATGTATTTTGGAGCACAGATCTGGATACCTTTGGGC 1438
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1379 ATAAAGTTGCAATGCTCTTTCCGTATGTATTTTGGAGCACAGATCTCGATACCTTTGGGC 1438
Query 1439 ATCTTACTGAGGATCCGAACTATCGAGGTGAATTCTTTCTGTTCTATAGCTACGCACCTG 1498
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1439 ATCTTACTGAGGATCCGAACTATCGAGGTGAATTCTTTCTGTTCTATAGCTACGCACCGG 1498
Query 1499 TTGCTGGTGGTCCTCTCTTGATCGCGTTGGTTGCGGGAGAAGCTGCTCATAAGTTTGAGA 1558
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 TTGCTGGTGGTGCTCTCTTGATCGCGTTGGTTGCGGGAGAAGCTGCTCATAAGTTTGAGA 1558
Query 1559 CAATGCCACCCACTGACGCAGTGACTCGTGTTCTTCATATTCTTAGGGGTATTTATGAAC 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CAATGCCACCCACTGACGCAGTGACTCGTGTTCTTCATATTCTTAGGGGTATTTATGAAC 1618
Query 1619 CTCAAGGAATAATTGTCCCTGATCCGCTACAAACGGTCTGCACCAGATGGGGCGGGGATC 1678
|||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1619 CTCAAGGAATAAATGTCCCTGATCCACTTCAAACGGTCTGCACCAGATGGGGTGGGGATC 1678
Query 1679 CATTCAGTTTAGGATCTTACTCCAATGTTGCAGTGGGAGCTTCAGGCGATGATTACGATA 1738
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1679 CATTCAGTTTAGGATCTTACTCTAATGTTGCAGTGGGAGCTTCAGGCGATGATTACGATA 1738
Query 1739 TATTAGCAGAAAGTGTGGGAGATGGAAGGCTTTTCTTTGCCGGGGAAGCCACGACAAGGC 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||
Sbjct 1739 TATTAGCAGAAAGTGTGGGAGATGGAAGGCTTTTCTTTGCCGGAGAAGCCACAACAAGGC 1798
Query 1799 GATACCCTGCAACCATGCATGGAGCTTTTGTTACTGGTCTGAGAGAAGCTGCAAACATGG 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1799 GATACCCTGCAACCATGCATGGAGCTTTTGTTACTGGTCTGCGAGAAGCTGCAAACATGG 1858
Query 1859 CTCAATCTGCAAAGGCCCGAGGCATAAGGAAAAGAATCGATAGGAACCCATCAAAGAATG 1918
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1859 CTCAATCTGCAAAGGCCCGAGGCATAAGGAAAAGAATCGATAGGAACCCATCAAGGAATG 1918
Query 1919 CTCATTCCTGTGCCATTCTTCTTGCAGATTTATTCAGGGACCCTGATCTGGAGTATGGGA 1978
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||
Sbjct 1919 CTCATTCCTGTGCCATTCTTCTTGCAGATTTATTTAGGGACCCTGATCTGGAATTTGGGA 1978
Query 1979 GTTTTTCCATAATCTTTAGCAGGAGGAATCCGGACCCAAAATCTCCTGCGATTTTGAGGG 2038
|||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1979 GTTTTTGCATAATCTTTAGTAGGAGGAATCCAGACCCAAAATCTCCTGCTATTTTGAGGG 2038
Query 2039 TAACTCTAAGCGAACCTCGTAAGAGAAACGAGGACCCAAAAGCAGATCAACACTCAAACA 2098
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2039 TAACTCTAAGCGAGCCTCGTAAGAGAAACGAGGACCCAAAAGCAGATCAGCACTCAAACA 2098
Query 2099 AGATACTGTTTCAGCAGCTTCAGTCTCATTTCAACCAACAGCAACAGATTCAGGTGTATA 2158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099 AGATACTGTTTCAGCAGCTTCAGTCTCATTTCAACCAGCAGCAACAGATTCAGGTGTATA 2158
Query 2159 CATTATTAACTAGACAACAGGCTCTTGACCTGAGAGAAGTCAGAGGGGGTGATGAAAAGA 2218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2159 CATTATTAACTAGACAACAGGCTCTTGACCTGAGAGAAGTCAGAGGTGGTGATGAAAAGA 2218
Query 2219 GACT-TAACTATCTCTGTGAGACACTTGGAGTGAAACTGGTGGGGAGAAAAGGTCTTGGT 2277
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 GACTATA-CTATCTCTGTGAGACACTTGGAGTGAAACTGGTGGGGAGAAAAGGTCTTGGT 2277
Query 2278 ATTGGAGCTGATTCAGTCATTGCTTCTATTAAAGCAGAGCGAACCGGTCGCAAGCTACCA 2337
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2278 GTTGGAGCTGATTCAGTCATTGCTTCTATTAAAGCCGAGCGAACTGGTCGCAAGCTACCA 2337
Query 2338 TCATCATCTACCTCAGGCACAAAATCTGGT 2367
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338 TCATCATCTACCTCAGGCACAAAATCTGGT 2367
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 117670077480
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5