BLASTN 2.2.26+ Reference: Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000), "A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000; 7(1-2):203-14. Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated 33,602 sequences; 51,074,197 total letters Query= Ahg904083 Length=4155 Score E Sequences producing significant alignments: (Bits) Value AT3G11960.1 | Symbols: | Cleavage and polyadenylation specific... 6606 0.0 > AT3G11960.1 | Symbols: | Cleavage and polyadenylation specificity factor (CPSF) A subunit protein | chr3:3786386-3793375 FORWARD LENGTH=4400 Length=4400 Score = 6606 bits (3577), Expect = 0.0 Identities = 3986/4176 (95%), Gaps = 57/4176 (1%) Strand=Plus/Plus Query 1 ATGGCGGCTCCGGAGGATGAATCTTCCGCTCAGTCTCAATCTTC-CTCTGCCACAGCGGC 59 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| Sbjct 46 ATGGCGGCTCCGGAGGATGAATCTTCCGCTCAGTCTCAATCATCAC-CTGCCACGGCGGC 104 Query 60 TCCTACGCCTCCTCCGTCCTCTTCCCCTTCCTCTGCTGGGGATCATTACCTAGCTAAGTG 119 ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 105 TCCTACGCCTCCTCCTTCCTCTTCCCCTTCCTCTGCTGGGGATCACTACCTAGCTAAGTG 164 Query 120 CATCCTCCGCCCCAGCGTCGTTCTCCAGGTTGCTTATGGCTACTTCCGCTCCCTTTCCTC 179 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 165 CATCCTCCGCCCCAGCGTCGTTCTCCAGGTTGCTTATGGCTACTTCCGCTCCCCTTCCTC 224 Query 180 CCGCGACATAGTTTTCGGCAAGGAGACCTGCATAGAATTGGTGGTTATTGGTGAAGACGG 239 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 225 CCGCGACATAGTTTTCGGCAAGGAGACCTGCATAGAATTGGTGGTTATTGGTGAAGACGG 284 Query 240 GATTGTTGAATCGGTGTGTGAACAGTATGTATTTGGAACAATTAAGGATTTGGCTGTCAT 299 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 285 GATTGTTGAATCGGTGTGTGAACAGTATGTATTTGGAACAATTAAGGATTTGGCTGTCAT 344 Query 300 ACCTCAGAGTAGCAAGCTATATTCGAATAGTTTGCAGATGGGAAAAGACCTTCTGGCTGT 359 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 345 ACCTCAGAGTAGCAAGCTTTATTCGAATAGTTTGCAGATGGGAAAAGACCTTCTGGCTGT 404 Query 360 TCTTTCTGATTCTGGAAACCTCTCATTCCTCTCATTTAGCAATGAAATGCACAGGTTCTC 419 |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 405 TCTTTCTGATTCTGGAAAGCTCTCATTTCTCTCATTTAGCAATGAAATGCACAGGTTCTC 464 Query 420 GCCCATACAACATGTTCAACTTTCTACTCCAGGTAACTCACGGATTCAACTCGGAAGAAT 479 ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 465 GCCAATACAACATGTTCAACTTTCTACTCCAGGTAACTCAAGGATTCAACTCGGAAGAAT 524 Query 480 GCTCACAATAGATTCCAGTGGTCTCTTTCTTGCTGTCAGTGCGTATCATGATCGTTTTGC 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| Sbjct 525 GCTCACAATAGATTCCAGTGGTCTCTTTCTTGCTGTCAGTGCGTATCATGACCGTTTTGC 584 Query 540 TCTGTTTTCCCTCTCAACATCGTCTATGGGTGATATTATTCATGAGAGGATTTCTTATCC 599 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| Sbjct 585 TCTGTTTTCCCTCTCAACATCGTCTATGGGTGATATTATTCATCAGAGGATTTCTTATCC 644 Query 600 TTCTGAAGACGGAGGGAATGGTAGCTCTGTACAAGCAATATCTGGTACTATTTGGAGCAT 659 |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 645 TTCTGAAGACGGAGGGAATGGTAGCTCTATTCAAGCAATATCTGGTACTATTTGGAGCAT 704 Query 660 GTGTTTCATTTCTAAAGATTTTAATGATTCCGAATCCAAGGAGTATGCTCCTGTTCTTGC 719 ||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 705 GTGCTTCATTTCTAAAGATTTT-A--A-T--GAATCCAAGGAGTATGCTCCTATTCTTGC 758 Query 720 CATTGTTATAAATAGGATTGGGTCTCTCATGAATGAGCTGGCTTTGTTTAGATGGAATGT 779 ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 759 CATTGTTATAAATAGGAAAGGGTCCCTCATGAATGAGCTGGCTTTGTTTAGATGGAATGT 818 Query 780 CAAAGAGGAATCCATATGTTTAATATCAGAGTATGTTGAAGCTGGGGCTCTGGCACATAG 839 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 819 CAAAGAGGAATCCATATGTTTAATATCAGAGTATGTTGAAACTGGGGCTCTGGCACATAG 878 Query 840 TATTGTCGAAGTTCCTTACTCCTCTGGATTTGCCTTTCTGTTTAGGATTGGTGATGCACT 899 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 879 TATTGTCGAAGTTCCTCACTCCTCTGGATTTGCCTTTCTGTTTAGGATTGGTGATGTTCT 938 Query 900 CTTAATGGATCTTAGAGATCCTCAAAACCCTTGCTGTCTGTTTAGGACATCCTTAGATCT 959 |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | Sbjct 939 CTTAATGGATCTAAGAGATCCTCAAAACCCTTGCTGTCTGTTTAGGACATCCTTAGATTT 998 Query 960 TGTTCCTGCTTCACTAGTGGAAGAGCATTTTGTCGAAGAGTCGTGTAGAGTACAAGATGG 1019 ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 999 TGTTCCTGCTTCATTAATGGAAGAGCATTTTGTTGAAGAGTCGTGTAGAGTACAAGATGG 1058 Query 1020 AGACGATGAGGGTTTTAATGTTGCTGCATGTGCTTTGTTAGAG--C-----TC---A-GT 1068 |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| | || | || Sbjct 1059 AGACGATGAGGGCTGTAATGTTGTTGTATGTGCTTTGTTAGAGCTCAGGGATCATGAGGT 1118 Query 1069 ----GATCATGATCCCATGTTCATAGATACTGAAAGTGACATTGGAAAGTTGAGTTCTAA 1124 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1119 CAGGGATCATGATCCCATGTTCATAGATACTGAAAGTGACATTGGAAAGTTGAGTTCTAA 1178 Query 1125 GCATGTCTCTTCATGGACTGGGGAGCCGGAAAATAATCATAATCCTCGGATGATTATATG 1184 | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 1179 GAACGTCTCTTCATGGACTTGGGAGCCGGAAAATAATCATAATCCTCGGATGATTATTTG 1238 Query 1185 CTTAGATGATGGTGAATTTTACATGTTTGAACTCATATATGAAGATGATGGGGTTAAAGT 1244 ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1239 CTTAGATAATGGTGATTTTTTCATGTTTGAACTCATATATGAAGATGATGGGGTTAAAGT 1298 Query 1245 AAATCTATCAGAGTGTTTATACAAAGGTTTACCATGCAAGGAAATTTTATGGGTCGAAGG 1304 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| Sbjct 1299 AAATCTATCAGAGTGTTTATACAAAGGTTTACCATGCAAGGATATTTTATGGATCGAAGG 1358 Query 1305 TGGATT-CTTGGCTACTTTTGCGGAAATGGCAGATGGAACGGTTTTCAAATTGGGAACTG 1363 |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1359 TGGATTCCTT-GCTACATTTGCAGAAATGGCAGATGGAACGGTTTTCAAATTGGGAACTG 1417 Query 1364 AGAAGCTACATTGGATGAGTTCCATACAAAATATTGCTCCAATCTTGGATTTTTCGGTTA 1423 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| Sbjct 1418 AGAAGCTACATTGGATGAGTTCCATACAAAATATTGCTCCGATCTTGGATTTTTCGGTTA 1477 Query 1424 TGGATGACCAGAATGAGAAACGAGACCAAATATTTGCTTGCTGTGGTGTAACCCGTGAAG 1483 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| Sbjct 1478 TGGATGACCAGAATGAAAAACGAGACCAAATATTTGCTTGTTGTGGTGTAACCCCTGAAG 1537 Query 1484 GCTCTCTGAGAATTATTCGTAGTGGCATTAATGTAGAAAAACTTCTGAAAACCGCGCCTG 1543 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1538 GCTCTCTGAGAATTATTCGTAGTGGCATTAATGTAGAAAAACTTCTGAAAACCGCGCCTG 1597 Query 1544 TTTATCAAGGAATAACTGGTACTTGGACTCTTAAAATGAAGCTTACTGATGTATACCATT 1603 ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1598 TTTATCAAGGAATAACTGGTACTTGGACTGTTAAAATGAAGCTTACTGATGTATACCATT 1657 Query 1604 CATTTCTTGTTTTGTCATTTGTTGAGGAGACCAGGGTTTTATCAGTTGGATTAAGTTTTA 1663 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1658 CATTTCTTGTTTTGTCATTTGTTGAGGAGACCAGGGTTTTATCAGTTGGATTAAGTTTTA 1717 Query 1664 AAGATGTCACTGATTCAGTAGGTTTCCAGTCTGATGTTTGCACCTTGGCATGTGGGCTTG 1723 ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1718 AAGATGTCACTGATTCAGTTGGTTTCCAGTCTGATGTTTGCACCTTCGCATGTGGGCTTG 1777 Query 1724 TTGCTGATGGTTTGTTGGTTCAGATTCACCAAGATGCAATAAGGCTGTGCATGCCCACCA 1783 |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | Sbjct 1778 TTGCTGATGGTTTGTTGGTTCAGATTCATCAAGATGCAATTAGGCTGTGCATGCCTACAA 1837 Query 1784 TGGATGCTCATTCTGATGGTATTCCTGGTTCTTCACCATTTTTCTCGTCGTGGTTTCCAG 1843 ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 1838 TGGATGCTCATTCTGATGGTATTCCTGTTTCTTCACCATTTTTCTCATCGTGGTTTCCAG 1897 Query 1844 AAAATGTCAGTATCAGCTTGGGGGCAGTTGGTCAAAATTTGATAGTTGTCTCTACGTCTA 1903 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1898 AAAATGTCAGTATCAGCTTGGGGGCAGTTGGTCAAAATTTGATAGTTGTCTCTACGTCTA 1957 Query 1904 ACCCTTGTTTCTTGTCTATTCTTGGGGTCAAATCAGTATCATCTCAATGCTGTGAAATCT 1963 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1958 ACCCTTGTTTCTTGTCTATTCTTGGGGTCAAATCAGTATCATCTCAATGCTGTGAAATCT 2017 Query 1964 ATGAAATCCAACGAGTAACATTGCAGTATGAAGTTTCCTGCATCTCAGTTCCTCAAAAAC 2023 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2018 ATGAAATTCAACGAGTAACATTGCAGTATGAAGTTTCCTGCATCTCAGTTCCTCAAAAAC 2077 Query 2024 ATATTGGAAAAAAGCGATCCTGTGCTTCTTCGCCGGATAATAGTTT-CAAAGCTGCGATT 2082 |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| Sbjct 2078 ATATTGGAAAAAAGAGATCCCGTGATTCTTCCCCGGATAATT-TTTGCAAAGCTGCGATT 2136 Query 2083 CCTTCTGGTATGGAGCAAGGCTATTCATTTTTGATTGGCACACATAAGCCTTCTGTTGAA 2142 ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2137 CCTTCTGCTATGGAGCAAGGCTATACATTTTTGATTGGCACACATAAGCCTTCTGTTGAG 2196 Query 2143 GTCCTGTCCTTCTCAGAAGATGGTGTTGGTGTTCGAGTCCTTGCTTCTGGGTTGGTATCG 2202 ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2197 GTCCTTTCCTTCACAGAAGATGGTGTTGGTGTTCGAGTCCTTGCTTCTGGGTTGGTATCG 2256 Query 2203 CTAACAAATACAATGGGAGCTGTTATTAGTGGGTGCATTCCTCAAGATGTAAGACTCGTG 2262 |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2257 CTAACAAATACAATGGGAACTGTTATTAGTGGGTGCATTCCTCAAGATGTAAGACTCGTG 2316 Query 2263 TTAGTTGATCAACTTTATGTCCTTTCTGGGTTGAGAAATGGGATGCTTCTCCGTTTTGAG 2322 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2317 TTAGTTGATCAACTTTATGTCCTTTCTGGGTTGAGAAATGGGATGCTTCTCCGTTTTGAG 2376 Query 2323 TGG-CCCCTTTTTTCAAATGCATCCGGGTTGAATTGTCCAGATTATTTTAGTTACTGTAA 2381 ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2377 TGGGCCCCTTTTT-CAAATTCATCCGGGTTGAATTGTCCAGATTATTTTAGTCACTGTAA 2435 Query 2382 AGAAGAGATGGACATTGTTGTGGGCAAAAAAGACAATTTACCCA-TCAACCTTCTATTAA 2440 ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| Sbjct 2436 AGAGGAGATGGACACTGTTGTGGGCAAAAAAGACAATTTACC-AGTCAACCTTCTGTTAA 2494 Query 2441 TTGCTACTCGACGCATTGGCATCACACCTGTTTTCTTGGTTCCGTTCAGTGATTCACTGG 2500 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2495 TTGCTACCCGACGCATTGGCATCACACCTGTTTTCTTGGTTCCGTTCAGTGATTCACTGG 2554 Query 2501 ATTCAGACATCATAGCTCTTAGTGATAGGCCATGGTTGTTACAAACAGCTCGACAAAGCC 2560 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2555 ATTCAGACATCATAGCTCTTAGTGACAGGCCATGGTTGTTACAAACAGCTCGACAAAGCC 2614 Query 2561 TTTCTTATACTTCCATCTCATTCCAACCTTCTACTCATGCAACTCCTGTATGCTCGTCTG 2620 |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || Sbjct 2615 TTTCCTATACTTCCATCTCATTCCAACCTTCTACTCATGCAACTCCTGTATGCTCGTTTG 2674 Query 2621 AATGCCCTCAAGGAATTCTTTTTGTTTCAGAGAACTGTTTACATCTGGTGGAGATGGTGC 2680 ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2675 AATGCCCCCAAGGAATTCTTTTTGTTTCAGAGAACTGTTTACATCTGGTGGAGATGGTGC 2734 Query 2681 ACAGCAAACGGCGTAATGCGCAAAAATTTCACCTTGGAGGCACCCCACGAAAGGTTATCT 2740 ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2735 ACAGCAAACGGCGTAATGCGCAAAAGTTTCAGCTTGGAGGCACCCCGCGAAAGGTTATCT 2794 Query 2741 ACCATAGTGAAAGCAAACTATTGATTGTGATGAGAACTGATCTGTATGATACGTGTACGT 2800 |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 2795 ACCACAGTGAAAGCAAATTATTGATTGTGATGAGAACTGATCTGTATGATACATGTACGT 2854 Query 2801 CTGATATATGCTGTGTGGACCCGCTCGGTGGGTCAGTGTTATCATCCTACAAGCTCAAAC 2860 |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2855 CTGATATATGCTGTGTAGACCCGCTCAGTGGGTCAGTGTTATCATCCTACAAGCTCAAAC 2914 Query 2861 CTGGAGAAATTGGGAAGTCAATGGAGCTTGTACGTGTGGGAAATGAGCATGTCCTTGTGG 2920 ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| Sbjct 2915 CTGGAGAGACTGGAAAGTCAATGGAGCTTGTACGTGTGGGAAATGAACATGTCCTTGTGG 2974 Query 2921 TTGGGACGAGTTTGTCTTCTGGTCCTGCTATACTACCCAGTGGTGAAGCTGAAAGTACAA 2980 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2975 TTGGGACGAGTTTGTCTTCTGGTCCTGCTATACTACCCAGTGGTGAAGCTGAAAGTACAA 3034 Query 2981 AAGGACGATTAATCATCCTCTGCCTAGAACACACTCAAAACTCGGATAGTGGCTCAATGA 3040 |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| Sbjct 3035 AAGGACGAGTAATCATCCTCTGCTTAGAACACACTCAAAACTCGGATAGTGGTTCAATGA 3094 Query 3041 CAATTTGCTCAAAGGCTGGTTCGTCTTCCCAACGTACATCACCTTTTCGTGATGTTGTGG 3100 ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| Sbjct 3095 CAATTTGTTCAAAGGCTTGTTCGTCTTCCCAACGTACATCACCTTTCCATGATGTTGTGG 3154 Query 3101 GATACACAACAGAACAAC-TGTCAAGCAGTAGTCACTGCAGCAGTCCAGATGATAATAGC 3159 |||||||||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| Sbjct 3155 GATACACAACAGAA-AACCTATCAAGCAGTAGCCTCTGCAGCAGTCCAGATGATTACAGC 3213 Query 3160 TATGATGGAATCAAATTTGATGAAGCTGAAACATGGCAGTTAAGATTGGCCTCTGCAACC 3219 ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3214 TATGATGGAATCAAACTTGATGAAGCTGAAACATGGCAGTTAAGATTGGCCTCTTCAACC 3273 Query 3220 ACTTGGCCGGGGATGGTACTTGCAATCTGTCCATACCTTGATCATTACTTCCTGGCGTCT 3279 ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| Sbjct 3274 ACTTGGCCGGGTATGGTACTTGCAATCTGTCCATACCTTGATCATTACTTCCTGGCATCT 3333 Query 3280 GCTGGCAATGCTTTCTATGTATGTAGTTTTCCGAACGATAGTCCTGAGAGAATGAAGAGG 3339 || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3334 GCCGGCAATGCTTTCTATGTCTGTGGTTTTCCGAACGATAGTCCTGAGAGAATGAAGAGG 3393 Query 3340 TTTGCGGTGGGAAGGACTCGTTTCATGATAACATCTCTGCGCACATACTTCACTAGAATT 3399 |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3394 TTTGCGGTAGGAAGGACCCGTTTCATGATAACATCTCTGCGCACATACTTCACTAGAATT 3453 Query 3400 GTAGTTGGGGATTGCCGTGATGGTGTTCTATTTTATTCTTATGACGAGGACTCGAAGAAA 3459 || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| Sbjct 3454 GTTGTTGGGGATTGCCGTGATGGTGTTCTATTTTATTCTTATCACGAGGAATCAAAGAAA 3513 Query 3460 CTTCACCAAATATATTGTGATCCAGCGCAGAGGTTAGTTGCTGACTGCTTTCTAATGGAT 3519 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| Sbjct 3514 CTTCACCAAATATATTGTGATCCAGCGCAGAGGTTAGTTGCTGACTGTTTTCTAATGGAT 3573 Query 3520 GCCAATTCTGTTGCTGTATCTGATCGCAAGGGGAGTATAGCAATCCTGTCTTGCCAAGAT 3579 || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| Sbjct 3574 GCTAATTCCGTTGCTGTATCTGATCGCAAGGGGAGTATAGCAATCCTGTCTTGCAAAGAT 3633 Query 3580 CATTCAGAATTTGGTACGAAGCACTTAGCCTTTTCTCCTCGTGATGATCCAGAATATTCA 3639 |||||||| ||||||| ||||||| | || | | || | | | || Sbjct 3634 CATTCAGACTTTGGTATGAAGCAC----C-TT--------G--A--AT--A---T-T-CA 3669 Query 3640 AGTCCGGAGTCCAACCTGAATCTAAACTGTGCTTATTACATGGGTGAGATTGCAATGGCT 3699 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || Sbjct 3670 AGTCCGGAGTCCAACCTGAATCTAAACTGTGCTTATTACATGGGAGAGATTGCCATGTCT 3729 Query 3700 ATCAAAAAGGGTTGCAACATCTACAAACTTCCAGCTGATGATGTACTGCAAAGTTATGGT 3759 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3730 ATAAAAAAGGGTTGCAACATCTACAAACTTCCAGCTGATGATGTACTGCGAAGTTATGGT 3789 Query 3760 CTTAGTAAAAGTATTGACACAGCTGATGACACTATCATAGCAGGCACGCTATTGGGAAGT 3819 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3790 CTTAGTAAAAGTATTGACACAGCTGATGACACTATCATAGCAGGCACGCTATTGGGAAGT 3849 Query 3820 ATATTTGTGTTTGCTCCTATTTCAAGCGAGGAATATGAGCTCTTAGAAGCTGTCCAAGCA 3879 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| Sbjct 3850 ATATTTGTGTTTGCTCCTATTTCAAGCGAGGAATATGAGCTCTTAGAAGGTGTCCAAGCA 3909 Query 3880 AAGCTCGGGATCCATCCCCTGACTGCTCCTGTACTTGGTAATGATCATAATGAGTTCCGA 3939 ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3910 AAGCTTGGGATCCATCCCCTGACTGCTCCTGTACTTGGTAATGATCATAATGAGTTCCGA 3969 Query 3940 GGTCGAGAGAATCCGTCCCAAGCGACAAAGATATTGGATGGTGACATGCTTGCTCAGTTC 3999 ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 3970 GGTCGAGAGAATCCGTCCCAAGCGAGAAAGATATTGGATGGTGACATGCTTGCTCAGTTC 4029 Query 4000 TTGGAGCTTACAAATAGACAGCAGGAGTCAGTTTTATCGACACCTCAGCCATCACCAAGC 4059 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4030 TTGGAGCTTACAAATAGACAGCAGGAGTCAGTTTTATCGACACCTCAGCCATCACCAAGC 4089 Query 4060 ACATCAAAAGCAAGTTCAAAACAACGTTCTTCCCCGCCTCTCATGCTACATCAAGTTGTA 4119 |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| Sbjct 4090 ACATCAAAAGCAAGTTCAAAGCAACGTTCTTTCCCGCCTCTCATGCTACACCAAGTTGTA 4149 Query 4120 CAGTTGCTCGAGCGTGTCCATTACGCTTTGCACTAG 4155 |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 4150 CAGTTGCTTGAGCGTGTCCATTACGCTTTGCACTAG 4185 Lambda K H 1.33 0.621 1.12 Gapped Lambda K H 1.28 0.460 0.850 Effective search space used: 207089140704 Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM Number of letters in database: 51,074,197 Number of sequences in database: 33,602 Matrix: blastn matrix 1 -2 Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5