BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg905146
Length=3888
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT3G21250.2 | Symbols: MRP6, ABCC8 | multidrug resistance-assoc... 3254 0.0
> AT3G21250.2 | Symbols: MRP6, ABCC8 | multidrug resistance-associated
protein 6 | chr3:7457433-7463525 REVERSE LENGTH=4894
Length=4894
Score = 3254 bits (1762), Expect = 0.0
Identities = 1939/2024 (96%), Gaps = 13/2024 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1873 GTTATGGAGGAAGGAAGAATCACTCAGTTAGGAAAATATGAGGAGCTCTTAATGATGGGG 1932
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641 GTTATGGAGGAAGGAACAATCACTCAGTCAGGAAAATATGAGGAGCTCTTAATGATGGGG 2700
Query 1933 ACTGCATTCCAACAGCTGGTGAATGCTCATAATGATGCAGTAACTGTATTACCTTTAGCG 1992
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2701 ACTGCATTCCAACAGCTGGTAAATGCTCATAATGATGCAGTAACTGTATTACCTTTAGCG 2760
Query 1993 AGTAACGAAAGCCTCGGAGATCTTAGGAAAGAGGG-TAGAGACAGAGAGATAAGAAACAT 2051
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||
Sbjct 2761 AGTAACGAAAGCCTCGGAGATCTTAGGAAAGAGGGCAAG-GACAGAGAGATAAGAAACAT 2819
Query 2052 GGCGGTTGTCGAAAAAATCGAAGAAGAGATCGAAAAAACGGATATTCCAGGGGTACAACT 2111
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 GACGGTTGTCGAAAAAATCGAAGAAGAGATCGAAAAAACGGATATTCCAGGGGTACAACT 2879
Query 2112 TACACAAGAAGAAGAAAAAGAGAGCGGTTATGTTGGGTTGAAACCTTTCTTGGACTATTT 2171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 2880 TACACAAGAAGAAGAAAAAGAGAGCGGTTATGTTGGGATGAAACCTTTCTTGGACTATAT 2939
Query 2172 CCGTGTCTCTCGAGGATGGTGTCTTCTATGGTCAAGCGTATTGGGTCAGGTTGGATTTGT 2231
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2940 CGGTGTCTCTCGAGGATGGTGTCTTCTATGGTCAAGCGTATTGGGTCAGGTTGGCTTTGT 2999
Query 2232 AGTTTTTCAGGCTGCATCAACATACTGGCTGGCTTTTGCCATTGGGATCCCTAATCTCAC 2291
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 3000 AGTTTTTCAGGCTGCATCAACATACTGGCTGGCTTTTGCCATCGGGATCCCTAAAATCAC 3059
Query 2292 TAATACAATGCTTATTGGAGTCTATAGCATTATCTCAACTCTTAGTGCTGGTTTTGTATA 2351
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3060 GAATACAATGCTTATTGGAGTCTATAGCATTATATCAACTCTTAGTGCTGGTTTTGTATA 3119
Query 2352 CGCGAGAGCTATTACGACTGCTCATCTTGGACTAAAAGCTTCCAAAGCCTTCTTCTCTGG 2411
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 TGCGAGAGCTATTACGACTGCCCATCTTGGACTAAAAGCTTCCAAAGCCTTCTTCTCTGG 3179
Query 2412 TTTCACAAATGCAGTCTTCAAAGCCCCGATGCTTTTCTTCGATTCTACTCCAGTTGGGCG 2471
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 3180 TTTCACAAATGCAGTCTTCAAAGCCCCGATGCTTTTCTTTGATTCTACTCCAGTTGGCCG 3239
Query 2472 CATTCTCACCCGAGCTTCATCTGATTTGAACGTCTTGGACTTTGACATTCCATTTGCATT 2531
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||
Sbjct 3240 CATTCTCACCCGAGCTTCGTCTGATTTGAACGTGTTGGACTATGACGTTCCATTTGCCTT 3299
Query 2532 CATATTTGTGGTAGCACCGGCTGTTGAGCTCACTGCAGCTCTTATCATCATGACATATGT 2591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 3300 CATATTTGTGGTAGCACCGGCTGTTGAGCTCACTGCAGCTCTTCTCATCATGACGTATGT 3359
Query 2592 CACATGGCAAGTAATTATCATAGCTCTTCTTGCTTTGGCAGCCACGAAAGTTGTTCAGGA 2651
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3360 CACATGGCAAGTAATTATCATAGCCCTTCTTGCTTTGGCAGCCACGAAAGTTGTTCAGGA 3419
Query 2652 TTACTATTTAGCCTCTGCAAGGGAGCTGATTAGGATCAATGGAACAACCAAAGCTCCAGT 2711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3420 TTACTATTTAGCCTCTGCAAGGGAGCTGATTAGGATCAATGGAACAACCAAAGCTCCAGT 3479
Query 2712 GATGAATTATGCTGCAGAAACCTCACTTGGAGTGGTGACAATACGAGCTTTTGGAACAGT 2771
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 3480 GATGAATTATGCTGCAGAAACCTCACTTGGGGTGGTGACAATTCGAGCTTTTGGAACCGC 3539
Query 2772 AGAGAGATTCTTCAAAAACTACTTAAACCTAGTTGATGCAGATGCCGTACTATTCTTTCT 2831
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3540 AGAGAGATTCTTCAAAAACTACTTAAACCTAGTTGATGCAGATGCCGTGCTATTCTTTCT 3599
Query 2832 GTCTAATGCAGCCATGGAGTGGGTGATTCTGAGGATTGAAACTATGCAGAATGTGACTTT 2891
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||
Sbjct 3600 GTCTAATGCAGCCATGGAGTGGGTGATTTTGAGGATAGAGACTCTGCAGAATGTGACTTT 3659
Query 2892 GTTCACTTGTGCACTTCTGCTTATCCTTATTCCCAAGGGATACATAGCTCCAGGCCTCGT 2951
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3660 GTTCACTTGTGCACTTCTTCTTATCCTTATTCCCAAGGGCTACATAGCTCCAGGCCTCGT 3719
Query 2952 CGGGCTTTCACTCTCCTATGCATTAACACTGACACAAACTCAGGTGTTTCTGACCCGATG 3011
|| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3720 TGGACTTTCGCTCTCCTATGCATTAACACTGACACAAACTCAGGTGTTTCTGACCCGATG 3779
Query 3012 GTATTGCACCTTATCGAATTCAATCATTTCAGTAGAGAGGATAAAACAATATATGAACAT 3071
|||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3780 GTATTGTACTTTGTCGAATTCCATCATTTCAGTAGAGAGGATCAAACAATATATGAACAT 3839
Query 3072 ACCAGAAGAACCTCCTGCAATTGTGGATGATAGAAGACCACCTTCCTCATGGCCTTCCAA 3131
|||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3840 ACCAGAAGAACCTCCTGCAATTATAGATGATAAAAGACCACCTTCCTCATGGCCTTCCAA 3899
Query 3132 TGGTACAATTCACTTGCAGGAGCTTAAGATAAGATATCGCCCCAATGCTCCGTTGGTTCT 3191
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3900 TGGTACAATTCATTTGCAGGAGCTTAAGATAAGATATCGACCCAATGCTCCGTTGGTTCT 3959
Query 3192 CAAAGGAATCTCTTGCACATTCAGGGAAGGGACAAGAGTAGGAGTTGTCGGGAGGACGGG 3251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 CAAAGGAATCTCTTGCACATTCAGGGAAGGGACAAGAGTAGGAGTTGTCGGGAGGACGGG 4019
Query 3252 AAGCGGGAAAAGCACTTTAATCAGTGCTTTGTTTCGCTTGGTAGAACCAGCAAGTGGTTG 3311
|||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4020 AAGCGGAAAAAGCACATTGATCAGCGCATTGTTTCGCTTGGTAGAACCAGCAAGTGGTTG 4079
Query 3312 CATATTGATTGATGGGATTGACATAAGTAAGATTGGCCTAAAAGACTTGAGAATGAAACT 3371
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 4080 TATATTGATTGATGGGATTGACATAAGTAAGATTGGCCTTAAAGACCTGAGAATGAAACT 4139
Query 3372 CAGCATCATTCCTCAAGAACCAACTCTTTTCCGTGGCTGCATAAGGACAAACCTTGATCC 3431
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4140 GAGCATCATTCCTCAAGAACCAACTCTTTTCCGTGGCTGCATAAGGACAAACCTTGATCC 4199
Query 3432 TTTAGGTGTTTACTCTGACGATGAAATATGGAAGGCTCTAGAGAAGTGTCAGCTCAAGAC 3491
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4200 TTTAGGTGTTTACTCCGACGATGAAATATGGAAGGCTCTAGAGAAGTGTCAGCTCAAGAC 4259
Query 3492 AACGATTAGCAATCTGCCAAATAAACTTGATTCTTCAGAAGTGAGTGATGAAGGAGAAAA 3551
||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4260 AACGATTAGCAATCTTCCTAATAAACTTGATTCTTCAG---TGAGTGATGAAGGAGAAAA 4316
Query 3552 CTGGAGCGTGGGACAGAGACAACTGTTCTGTCTTGGAAGGGTATTGTTAAAGAGAAACAA 3611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 4317 CTGGAGCGTGGGACAGAGACAACTGTTCTGTCTTGGAAGAGTACTGTTAAAGAGAAACAA 4376
Query 3612 GATATTAGTGTTAGATGAAGCTACAGCTTCCATTGATTCAGCAACTGATGCAATCATTCA 3671
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4377 AATATTAGTGTTAGATGAAGCTACAGCTTCCATTGATTCAGCAACTGATGCAATCATTCA 4436
Query 3672 GAGAATTATAAGAGAAGAGTTTGCAGATTGCACAGTGATAACAGTTGCCCATAGAGTACC 3731
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 4437 GAGAATTATAAGAGAAGAGTTTGCAGACTGTACAGTGATAACAGTTGCACATAGAGTACC 4496
Query 3732 AACTGTCATAGACAGTGACATGGTCATGGTTCTCTCCTTTGGTGATCTT-GTGGAATACA 3790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||
Sbjct 4497 AACTGTCATAGACAGTGACATGGTCATGGTTCTCTCTTTTGGTGAT-TTAGTAGAGTACA 4555
Query 3791 ACGAGCCTTCAAAGCTAATGGAGACTGATTCTTACTTCTCTAAGCTTGTTGCTGAGTATT 3850
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4556 ACGAGCCTTCGAAGCTAATGGAGACTGATTCTTACTTCTCTAAGCTTGTTGCTGAGTATT 4615
Query 3851 GGGCTAGTTGCAGAGGAA-CTC-----AGAATCTCCAATTATAA 3888
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
Sbjct 4616 GGGCTAGTTGCAGAGGAAACTCTTCTCAGAATCTCCAATTATAA 4659
Score = 2987 bits (1617), Expect = 0.0
Identities = 1787/1870 (96%), Gaps = 8/1870 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 AGTCTTTTGCTTCTCCTTTGCTCCTGGATGAATTTGAGATCTTCTTCTGCAGCAGCTCAA 69
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 745 AGTCTTTTGCTTCTCCTTTGTTCATGGATGAATTTGAGATCTTCTTCTGCAGCAGCTCAA 804
Query 70 GATTGCAGTG-AAGCAGGACTTTCTGATCCTCTATTGACTAAAAATCCTAGAAAAGAATC 128
||||| |||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GATTGTAGTGTAA-CAGGACTTTCTGATCCTCTTTTAACTAAAAATCCTAGAAAAGAATC 863
Query 129 GGCGAGGTTAGCAACAGCTGGATTTTTCAGCATTCTATCGTTCTCTTGGATGAATCCTTT 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 864 GGCGAGGTTAGCAACAGCTGGATTTTTCAGCATTCTATCTTTCTCTTGGATGAATCCTTT 923
Query 189 ACTCTCGCTGGGATTCAAGAAACCATTATCCCCTCAAGATATCCCAAGTGTAGTCCCGGA 248
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 924 ACTCTCGCTGGGATTCAAGAAACCATTATCCCCTGAAGATATCCCAAGTGTAGTCCCGGA 983
Query 249 GGATGAGGCTGAATTAGCTTAC-AGTAAATTTTCTCAAGCATGGGATACTCTTCTCGCAG 307
|||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 984 GGATGAGGCTCAATTAGCTTACAAG-AAATTTTCTCAAGCATGGGATACTCTTCTTGGAG 1042
Query 308 AAGGAAGCTCATCGAAGGAAAGAAACTTGGTGTTTAGAGCCGTTGCAAAAGTTTACTTCA 367
| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
Sbjct 1043 ATGAAAGCTCAACTAAGGAAAGAAACTTGGTGTTTAGAGCCGTTGTGAAAGTTTACTTTA 1102
Query 368 AGGAGAACATATTCATAGCAGTTTGTGCATTTTTCAGAAC-TCTTGCTGTTGTATCTCTT 426
| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||
Sbjct 1103 AAGAAAACATTTTCATAGCAGTTTTTGCATTTCTCAGAACAT-TTGCTGTTGTTTCTCTT 1161
Query 427 CCATTAATGCTATATGTCTTTGTGGATTATGCAAACAGTGACCACAGGGATCTCCACAAT 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1162 CCATTAATGCTATATGTCTTTGTGGATTATGCAAACAGTGACCACAGGGATCTCCGCAAT 1221
Query 487 GGGTTCTTCAACTTAGCTTGTCTAGTTATGCTGAAACTAGTTGAATCCTTGACAATGAGA 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 GGGTTCTTCAACTTAGCTTGTCTAGTTATGCTGAAACTAGTTGAATCCTTGACAATGAGA 1281
Query 547 CATTGGTATTTTGCATCAAGAAGATCAGGAATGAGGATAAGATCAGCACTAATGGTAGCT 606
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||
Sbjct 1282 CATTGGTATTTTGCATCAAGAAGATCAGGAATGAGGATTAGATCAGCGCTAATGGTAGCT 1341
Query 607 GCATACAAAAAGCAGCTAAAGCTATCAAGTTTGGGGAGGAAAAGGCATTCATCTGGAGAG 666
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1342 GCATACAAAAAACAGCTAAAGCTATCAAGTTTAGGGAGGAAAAGGCATTCATCTGGAGAG 1401
Query 667 ATTGTGAATTATATCGCAGTGGATGCATATCGTATGGGAGAATTCTTATGGTGGTTCCAC 726
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 ATTGTGAATTATATCGCGGTGGATGCATATCGTATGGGAGAATTCTTATGGTGGTTCCAC 1461
Query 727 TCAGGATGGAGTCTTACACTGCAGCTTTTGCTTTCGACAGCTGTACTTTTTGGAGTGGTT 786
|| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462 TCGGGATGGAGCCTTTCGCTGCAGCTTTTGCTTTCTACAGCTGTACTTTTTGGAGTGGTT 1521
Query 787 GGAGCAGGAGCTTTTCCAGGTTTAATTCTTCTTCTCCTATGTGGTCTGCTCAATCTACCA 846
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1522 GGTGCAGGAGCTTTTCCAGGTTTAATTCTTCTTCTCCTATGTGGTCTGCTGAATCTACCA 1581
Query 847 TTTGCAAAGATGCTACAGAACTGCCAGACCCAGTTCATGATCGCGCAGGATAAGCGATTG 906
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582 TTTGCAAAGATGCTACAGAACTGCCAGACACAGTTCATGATCGCGCAGGATAAGCGATTG 1641
Query 907 AGGTCCACCTCAGAGATTTTGAACAGTATGAAAGTCATTAAGCTGCAGTCATGGGAAGAC 966
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1642 AGGTCCACCTCAGAGATTTTGAACAGTATGAAAGTCATTAAGCTGCAGTCATGGGAAGAT 1701
Query 967 GAGTTCAAGAAAAAGATAGAATCTTGTCGTGATGATGAATTCAAATGGTTGGCTAAGGCT 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1702 GAGTTCAAGAAAAAGATAGAATCTTGTCGTGATGATGAATTCACATGGTTGGCTAAAGCT 1761
Query 1027 CAGCTGACAAAGGCCTTTGGTACTTTCTTGTATTGGATGTCTCCAACAATAGTTTCTTCT 1086
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 CAGCTGACAAAGGCCTTTGGTTCTTTCTTGTATTGGATGTCTCCAACAATAGTTTCTTCT 1821
Query 1087 GTTATTTTCTTGGGATGTGCTCTATTGAAGAGTGCGCCGCTGAACGCAAGCACCATTTTC 1146
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1822 GTTGTTTTCTTGGGATGTGCTCTATTGAAGAGTGCGCCGCTGAACGCAAGCACCATCTTC 1881
Query 1147 ACGGTTTTAGCTACACTAAGAGTTATGTCAGAGCCTGTCAGACTTATACCTGAGGCAATT 1206
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||
Sbjct 1882 ACGGTTTTAGCTACACTAAGAGTTATGTCAGAGCCTGTCAAAATTATACCTGATGCAATT 1941
Query 1207 TCTGCTATCATCCAAGTCAATGTCTCGTTCGATAGATTAAACAAATTTTTGCTTGACGAC 1266
|||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1942 TCTGCTATCATCCAAGGCAATGTCTCGTTCCAAAGATTAAACAACTTTTTGCTTGACGAC 2001
Query 1267 GAGCTAAAGATGGATGAAATCGAAAGAAGTGGTCTGGAGGTATATGGAACAGCAGTTGAC 1326
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||
Sbjct 2002 GAGCTAAAGATGGATGAAATCGAAAGAAGTGGTCTGGATGCATCTGGAACAGCAGTTGAC 2061
Query 1327 ATACAAGCAGGTAAATTCAGTTGGGATCCAGAAACTAAGATTCCAACTCTCCGAAATATA 1386
||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2062 ATACAAGTAGGTAACTTCGGTTGGGAACCAGAAACTAAGATTCCAACTCTTCGGAATATA 2121
Query 1387 CATCTGGAAATCAAGCATGGGCAAAAGGTTGCGGTTTGTGGACCAGTTGGGGCCGGAAAA 1446
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||
Sbjct 2122 CATCTGGAAATCAAGCATGGGCAAAAAGTTGCAGTTTGTGGACCAGTTGGAGCAGGAAAA 2181
Query 1447 TCATCGCTGTTGCATGCAGTACTCGGAGAAATACCTAAAGTTTCTGGAACTGTAAAGGTC 1506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2182 TCATCGCTGTTGCATGCAGTACTCGGAGAAATACCTAAAGTTTCTGGAACTGTAAAGGTC 2241
Query 1507 TCTGGGTCCATCGCTTATGTTTCTCAGACCTCTTGGATCCAAAGTGGTACCATCCGGGAC 1566
| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2242 TTTGGGTCCATCGCTTATGTTTCTCAGACTTCTTGGATCCAAAGTGGTACCATCCGGGAC 2301
Query 1567 AATATCCTTTATGGAAAGCCCATGGAA-GCTAGAAGATACAATGATGCTATTAAAGCATG 1625
|||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 2302 AATATCCTCTATGGAAAGCCCATGGAAAG-TAGACGATACAATGCTGCTATTAAAGCATG 2360
Query 1626 TGCGTTGGATAAGGACATGAACGGTTTTGGACATGGTGACCTCACAGAAATAGGACAAAG 1685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2361 TGCGTTGGATAAGGACATGAACGGTTTTGGACATGGTGACCTCACAGAAATAGGACAAAG 2420
Query 1686 AGGGATTAACTTGAGTGGAGGACAAAAGCAAAGGATTCAGCTGGCCCGTGCTGTCTTTGC 1745
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2421 AGGGATTAACTTGAGCGGAGGACAAAAGCAAAGGATTCAGCTGGCCCGTGCTGTCTATGC 2480
Query 1746 CGACGCTGATGTTTACCTCCTTGATGATCCTTTTAGTGCCGTGGATGCACATACAGCTGG 1805
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2481 AGACGCCGATGTTTACCTGCTTGATGATCCTTTTAGTGCTGTGGATGCACATACAGCTGG 2540
Query 1806 AGTTCTTTTTCATAAATGTGTTGAGGACTCGCTGAAGGAGAAAACTGTCATTCTGGTCAC 1865
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2541 AGTTCTTTTTCATAAATGTGTTGAGGACTCGCTGAAGGAGAAAACTGTTATTCTGGTCAC 2600
Query 1866 TCACCAAGTT 1875
||||||||||
Sbjct 2601 TCACCAAGTT 2610
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 193694566923
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5