BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg908702
Length=4962
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G71010.1 | Symbols: FAB1C | FORMS APLOID AND BINUCLEATE CELL... 7919 0.0
> AT1G71010.1 | Symbols: FAB1C | FORMS APLOID AND BINUCLEATE CELLS
1C | chr1:26782839-26788970 FORWARD LENGTH=5205
Length=5205
Score = 7919 bits (4288), Expect = 0.0
Identities = 4748/4970 (96%), Gaps = 31/4970 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGGAATACCTGATGGTTCACTGCTAGATCTAATTGTTAAGGTTAGGTCTTGGATAACT 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAATACCTGATGGTTCACTGCTAGATCTAATTGATAAGGTTAGGTCTTGGATAACT 60
Query 61 TTGGATTCAAGTGATTCTTTGTGC---TTGTCTTCATCTAAACAAGACTTTGAAATTATG 117
| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 61 TCGGATTCAAGTGATTCTTTGTTCTTGTTGTCTTCATCTAAACAAGACTTTGGAATTATG 120
Query 118 CCAATCGTTTCCAAAATGTGTCATGACTGTGGAACCAAGGTGGAACAAGGTTATTGTTGT 177
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||
Sbjct 121 CCTATCGTTTCCAAAATGTGTCATGACTGTGGAACAAAGGTGGAACAAGGATATTGTTGT 180
Query 178 CTTAGTTGTGGTTCTTGTTGGTGCAAGAGTTGTTCTGATAGTACAGAAGAGAGCAAGATG 237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct 181 CTTAGTTGTGGTTCTTGTTGGTGCAAGAGTTGTTCTG--A-TACAGAAGAGAGCAAGATG 237
Query 238 AAGTTGTGCAGAGAATGTGATGGAGAGGTTCGTGAGTTAAGGGGTAAGAGCTATGATAAG 297
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 238 AAGTTGTGTAGAGAATGTGATGCTGAGGTTCGTGAGTTAAGGGTTAAGAGCTATGATAAG 297
Query 298 GTTCATCCCCGGGATAGTCCTGATCCGCCTTCTTCTCTTGCAACCGAAACCGAGAGTCTT 357
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
Sbjct 298 GTTCATCCTCGGGATAGCCCTGATCCGCCTTCTTCTCTTGCTACCGAAAGCGAGAGTCTT 357
Query 358 GCTTCGAGTCTTGAAATCCGTGATTGTAGGAACATGGCTTCTATTCGTTGCTATCCTAGC 417
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358 GCCTCGAGTCTTGAAATCCGTGATTGTAGGAACATGGCTTCTATTCGTTGCTATCCTAGC 417
Query 418 AGGGGAGAGGAAGAAGAGGCTAGATATTGTGGTAAACAGTTGTTAAGCCCTTCAAGTGAA 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 418 AGGGGAGAGGAAGAAGAGGCTAGATATTGTGGTAAACAGTTGTTAAGCCCTTCGAGTG-A 476
Query 478 T-ACTATCAGGACAGTTCAGATATAGAGTCGGGTAGTGTTAGTGCTAGACATGAGCTTTT 536
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 TAACTATCAGGACAGTTCAGATATAGAGTCGGGTAGTGTTAGTGCTAGACATGAGCTTTT 536
Query 537 TAGTTGTAAATCTTCTGCTGGGTCCAGTCCTCACGACAGTCCATTAAGGAACAATTTTAG 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 537 TAGTTGTAAATCTTCTGCTGGGTCCAGTCCTCACGACAGTCCATTAAGGAACAATTTTAG 596
Query 597 TCCTCTTGGGCGCTTTGTACAGCACGCGAAAGACCTAAGAAGCCCTACTGTTTGTTCTTT 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 TCCTCTTGGGCGCTTTGTACAGCACGCGAAAGACCTAAGAAGCCCTACTGTTTGTTCTTT 656
Query 657 TGATAATCATCAAGAACAACTCATGGCTGGTAATTTAGTTAAGCCAGGTCAGGGGGTATT 716
|||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TGATAATCATCAAGAACAACTCTTGGCTGATAATTTAGTTAAGCCAGGTCAGGGGGTATT 716
Query 717 GGAACAGGAAGATCACGAGGAGGAAGAGGATAAGTTGCAACCGCCGTTGGATTTTGAGAA 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 717 GGAACAGGAAGATCACGAGGAGGAAGAGGATAAGTTGCAACAGCCGTTGGATTTTGAGAA 776
Query 777 CAACGGCCGCATCTGGTATCCTCCACCACCGGAAGATGAGAATGATGATGCTGAGAGTAA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 777 CAACGGCCGCATCTGGTATCCTCCACCACCGGAAGATGAGAATGATGATGCTGAGAGTAA 836
Query 837 TTACTTTCAATATGATGACGAAGATGATGATATTGGGGACTCTGCTACCGAGTTTTCATT 896
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 837 TTACTTTCATTATGATGACGAAGATGACGATATTGGGGACTCTGCTACCGAGTTTTCATT 896
Query 897 GAGTAGTAGCTTTTCTAGCCACGTTCCTA-CAAGAGAGAAACTGGGAGAAAATAGCAATG 955
|||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct 897 GAGTAGTAGCTTTTCTAGCCACATTCCTACCAA-AGAGAAATTGGGAGAAAACAGCAATG 955
Query 956 AACCTCTTCGAACCGTGGTGCATGACCACTTTCGAGCTCTTGTTGCAGAGCTATTGCGTG 1015
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 956 AACCTCTTCGAACCGTGGTGCATGACCACTTCCGAGCTCTTGTTGCAGAGCTATTACGTG 1015
Query 1016 GGGAGGAGCTTAGTCCATCTGATGATGGCAGTGCTGGGGAATGGCTGGATATTGTCACTG 1075
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1016 GGGAGGAGCTTAGTCCATCTGATGATGGCAGTGCCGGGGAGTGGCTGGATATTGTCACTG 1075
Query 1076 CTTTAGCGTGGCAGGCTGCAAATTTTGTAAAGCCGGATACTCGTGCAGGCGGCAGTATGG 1135
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 CTTTAGCGTGGCAAGCTGCAAATTTTGTAAAGCCGGATACTCGTGCAGGCGGCAGTATGG 1135
Query 1136 ATCCCGGGAATTATGTGAAAATAAAATGTGTAGCATCGGGAAATCAAAATGAGAGCATTC 1195
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 ATCCCGGGAATTATGTAAAAATAAAATGTGTAGCATCTGGAAATCAAAATGAGAGCATTC 1195
Query 1196 TCATCAGGGGAATAGTGTGTAGCAAGAACATTACGCACAAGCGAATGACATCACAGTACA 1255
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 1196 TCATCAGGGGAATAGTGTGTAGCAAGAACATTACGCACAAGCGAATGATATCGCAGTACA 1255
Query 1256 AAAATCCAAGGGTGCTGCTTTTAGCTGGGTCTCTTGAGTATCAGAGAGTCGCAGGCCAAT 1315
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1256 AAAATCCAAGGGTGATGCTTTTAGCTGGTTCTCTTGAGTATCAGAGAGTTGCAGGCCAAT 1315
Query 1316 TAGCATCCTTTAACACGTTGCTTCAACAGGAAAATGAACATATGAAGGCGATAATTGCAA 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1316 TAGCATCCTTTAACACGTTGCTTCAACAGGAAAATGAACATATGAAGGCGATAATAGCAA 1375
Query 1376 AAATAGAGTCCCTTCGTCCTAATGTTCTTCTGGTAGAGAAAAGTGCATCTTCATATGCCC 1435
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 AAATAGAGTCCCTTCGTCCTAATGTTCTGCTGGTAGAGAAAAGTGCATCTTCATATGCCC 1435
Query 1436 AACAATACCTTCTAGAGAAGGAAATTTCGTTGGTGCTCAATGTGAAAAAGTCATTGCTGG 1495
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1436 AGCAATACCTTCTAGAGAAGGAAATTTCATTGGTGCTCAATGTGAAAAGGTCATTGCTGG 1495
Query 1496 ACCGTATAGCCCGTTGCACCGGTGCTGTTCTTTGCCCCTCACTAGATAGTATTAGTACTG 1555
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496 ACCGTATAGCCCGTTGCACTGGTGCTGTTCTTTGCCCCTCACTAGATAGTATTAGTACTG 1555
Query 1556 CTCGATTGGGTCACTGTGAGCTGTTCCGGACTGAGAAAGTGTTGGAGCAACATGAAGCTG 1615
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 CTCGATTGGGTCACTGTGAGCTGTTCCGGACTGAGAGAGTGTTGGAGCAACATGAAGCTG 1615
Query 1616 GCAATCAGTCAAACCGAAAACCATCAAGGACATTGATGTACTTTGAAGGGTGTCCTAGGC 1675
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616 GCAATCAGTCAAACAGAAAACCATCAAGGACATTGATGTACTTTGAAGGGTGTCCTAGGC 1675
Query 1676 GCCTAGGTTGCACGGTTGTGCTTAGGGGAAGTTGTCGCGAGGAGCTAAAGAAGGTTAAAC 1735
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676 GCCTAGGTTGCACGGTTGTGCTTCGGGGAAGTTGTCGTGAGGAGCTAAAGAAGGTTAAAC 1735
Query 1736 ACGTTATTCAGTATGCTGTATTTGCAGCTTATCACTTATCACTGGAGACTTCATTCCTTG 1795
| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1736 ATGTTATTCAGTACGCTGTATTTGCAGCTTATCACTTATCGTTGGAGACTTCATTCCTTG 1795
Query 1796 CGGATGAAGGTGCTTCTCTGCCTAAAATTAGACTGAAACAACC-GGGAATGGTGCGGACA 1854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||
Sbjct 1796 CGGATGAAGGTGCTTCTCTGCCTAAAATTAGACTGAAGCAACCAGGG-ATGGTGCGGACT 1854
Query 1855 GCATCACAAAGGAGGATCATTGATGAAGGCATTTCCTTAATAACTCAATCTCCTACAGAA 1914
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 GCATCACAAAGGAGGATAATTGATGAAGGCATTTCCTTAATAACTCAATCTCCTACAGAA 1914
Query 1915 ACAGATAGTCAAGCTTTGATTGAAACAGCTGCACATGAAGATGAGA-ATACGGC-CCTGA 1972
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |
Sbjct 1915 ACAGATAGTCAAGCTTTGCTTGAAACAGCTGCACATGAAGATGA-ACATACGGCTCCT-A 1972
Query 1973 TGCCTGAGCTTGAGGTTTGTGAATCATTGTGTGAGGATTTTGATCCTAGTCAAATATTCC 2032
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||
Sbjct 1973 TGCCTGAGCATGAAGTTTGTGAATCATTGTGTGAGGATTTTGATCCTACTCAGATATT-- 2030
Query 2033 CACCATCTTCTGGCGTAATTGCTTCTGAAGTTGAGACTGAACAATCTGATGCCCTGAATG 2092
| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2031 C-CCA----C---CG----T-CTTCTGAAGTTGAGACTGAACAATCTGATACCCTGAATG 2077
Query 2093 GAGATTTTGCCAGTAATTTGGTGACAGGATCATATTCTTCGAATCAGTTAAATGATTTGC 2152
|||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2078 GAGATTTTGCCAATAATTTGGTAACAAGATCATATTCTTCGAATCAGTTAAATGATTTGC 2137
Query 2153 ATGAGCCCACTTTGTGCCTAAGTAGTGAAATCCCTGAAACGCCAACTCAACAGCTGAGTG 2212
|||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct 2138 ATGAACCCACTTTGTGCTTAAGTAGTGAAATTCCTGAAACGCCGACTCAACAGCCGAGTG 2197
Query 2213 GTGAAGAAGAGAACGGCAGAGGTGAAGAAGAGAACCAATTAGTGAACACCCACGATTTGC 2272
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
Sbjct 2198 GTGAAGAAGATAACGGCAGAGGTGAAGAAGAGAACCAATTAGTGAACCCCCAAGATTTGC 2257
Query 2273 CACAAAATGAGAGCCTCTATGAAGATGATGTTTCCAGCGAGTATTTCTCTGCCGCGGACT 2332
||||| |||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||
Sbjct 2258 CACAACATGAGAGCTTCTATGAAGATGATGTCTCTAGTGAGTATTTCTCTGCTGCGGACT 2317
Query 2333 CTCATCAGAGCATATTGGTCTCATTTTCAAGCCGTTGTGTATTGAAAGAATCAGTATGTG 2392
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2318 CTCATCAGAGCATATTGGTCTCATTTTCAAGCCGTTGTGTTTTGAAAGAATCAGTATGTG 2377
Query 2393 AACGCTCACGACTCTTGCGGATTAAGTTCTATGGATCATTTGATAAACCTCTCGGGAGAT 2452
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2378 AACGTTCACGACTCTTGCGGATTAAGTTCTATGGATCCTTTGATAAACCTCTCGGAAGAT 2437
Query 2453 ATTTGAAAGATGATCTATTCGATAAGACTTCTAGTTGTAGATCTTGCAAGGAGCTGGTGG 2512
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
Sbjct 2438 ATTTGAAAGATGATCTTTTCGATAAGACTTCTAGTTGTAGATCCTGTAAGGAGCTGGTTG 2497
Query 2513 ATGCGCATGTGCTCTGCTATTCTCATCAGAATGGAAACCTTACTATCAATGTTAGACGTC 2572
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498 ATGCGCATGTACTCTGCTATTCTCATCAGAATGGAAACCTTACTATCAATGTTAGACGTC 2557
Query 2573 TTCCTTCCATGAAGCTTCCTGGTGAACAAGATGGGAAGATATGGATGTGGCATCGCTGCT 2632
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2558 TCCCTTCCATGAAGCTTCCTGGTGAACAAGATGGGAAGATATGGATGTGGCATCGTTGCT 2617
Query 2633 TAAGATGTGCACATATAGATGGAGTTCCACCAGCTACTCGTAGAGTAGTTATGTCTGATG 2692
|||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2618 TAAGATGTGCACATGTAGATGGAGTCCCACCTGCTACTCGTAGAGTAGTTATGTCTGATG 2677
Query 2693 CAGCATGGGGACTGTCTTTTGGAAAGTTTTTGGAACTTAGCTTTTCGAATCATGCAACAG 2752
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2678 CAGCATGGGGATTGTCTTTTGGAAAGTTTCTGGAACTTAGCTTTTCGAATCATGCAACTG 2737
Query 2753 CGAATCGAGTTGCATCTTGTGGTCATTCGCTTCAAAGAGACTGCCTTCGATTCTATGGAT 2812
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 CGAATCGTGTTGCATCTTGCGGTCATTCGCTTCAAAGAGACTGCCTTCGATTCTATGGAT 2797
Query 2813 TTGGTAACATGGTTGCTTTCTTTAGATATTCTCCCATCAATATACTTACGGTCCTCCTCC 2872
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||
Sbjct 2798 TTGGTAACATGGTGGCATTCTTTAGATATTCTCCCATCAATATACTTACTGTACTCCTCC 2857
Query 2873 CCCCGTCGATGCTTGAGTTCAACAGCCATCCTCAACAGGAGTGGATACGGACAGAGGCAA 2932
| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2858 CACCGTCGATGCTTGAGTTCAATAGCCATCCTCAACAGGAGTGGATACGAACAGAGGCAG 2917
Query 2933 CTGAGCTTGCTGGTAAAATGCGGACTATGTATGCGGAGATATCTGGTATGCTGAACCGGA 2992
||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |
Sbjct 2918 CTGAGCTTGTTGGTAAAATGAGGACTATGTATACGGAGATATCTGATATGCTCAACCGCA 2977
Query 2993 TGGAAGAAAAAAGCAGTTTGCTGGAACCTGAACAATCCGAAGCCTCTGATCTGCAGAGTC 3052
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||
Sbjct 2978 TGGAAGAAAAAAGCAGTTTGCTTGAACCTGAACAATCTGAAGCATGTGATCTACATAGTC 3037
Query 3053 GCGTCATCGGATTAAAAGATCAGCTCGTGAAAGAAAAAGATGAATACGATGATGCGCTGC 3112
|| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3038 GCATCATCGGATTAATAGATCAACTTGTGAAAGAAAAAGATGAATACGATGATGCACTGC 3097
Query 3113 AACCTATATTTGAGGAGAATCTGCAAATTCAGGGAAGTTTGGATATCCTAGAGCTGAATC 3172
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3098 AACCTATTTTTGAGGAGAATCTGCAAATTCAGGGAAGTTTGGATATCCTAGAGCTGAATC 3157
Query 3173 GATTGAGACGGGCGCTCATGATTGGTGCTCATGCTTGGGATCATCAGCTTTACTTGTTAA 3232
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3158 GATTGAGACGAGCACTCATGATTGGTGCTCATGCTTGGGATCATCAGCTTTACTTGTTAA 3217
Query 3233 ATTCTCAACTCAAGAAAGCATCAGTTTTTAAAACTGGTGATGACAATGCTTCTCGGAATC 3292
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3218 ACTCTCAACTCAAGAAAGCATCAGTCTTTAAAACTGGTGATGACAATGCTCCTCGGAATC 3277
Query 3293 CAGAGATGCAGGATCCTCCAAAGATTGACCGTAGAATGCAGGAAGGTTCAGATGAGAGGG 3352
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3278 CAGAGATGCATGATCCTCCAAAGATTGACCGTAGAATGCAGGAAGGTTCAGATGAGAGGG 3337
Query 3353 AAGAACAAGCCCATACTGTTTCAGAAGCTAATGGTGATAACAAAGATCCGGAAAGCATGC 3412
| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
Sbjct 3338 ATGAACAATCCCATACTGATTCAGAAGCTAATGGTGATAACAAAGATCCGGAAAACATTC 3397
Query 3413 CCTCCCCTGGCACTTCTCTGTCTGAGAGGATAGATTCGGCGTGGTTGGGCTCGTTTCAAA 3472
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3398 CCTCCCCTGGCACTTCTCTATCTGAGAGGATAGATTCGGCGTGGTTGGGCTCGTTTCAAA 3457
Query 3473 ATCTAGAGAAAGCCGAGACAATTGCTGAGACAGAAGGCTTTTCAGCTGTTAATTCTCCTC 3532
||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3458 ATCTAGAGAAAGCCGAGACTATTGCTGAGACGGAAGGCTTTTCAGCTGTTAATTCTTCTC 3517
Query 3533 TCCGGAGACTTGCCAGGCCAATCCGAGTCCAGTCTTTTGATTCAGCGATACGATTTCAAG 3592
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3518 TCCGGAGGCTTGCCAGGCCAATTCGAGTCCAGTCTTTTGATTCAGCGATACGGTTTCAAG 3577
Query 3593 AACGGATCCAAAAAGGTTGGCCACCATCTTCTTTGTATCTCTCGACCCTCAGATCTTTCC 3652
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3578 AACGTATCCAAAAAGGTTTGCCACCATCTTCTTTGTATCTCTCGACCCTCAGATCTTTCC 3637
Query 3653 ACGCTTCTGGCGAGTACAGGAATATGGTGAGGGACCCTGTTTCAAATGTGATGAGGACTT 3712
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3638 ACGCTTCTGGCGAGTATAGGAATATGGTGAGGGACCCTGTTTCAAATGTGATGAGGACTT 3697
Query 3713 ACTCACAGATGTTGCCACTGGAAGTACAGAAATTGGATCTGATTGTTGGTTCAACGCCTA 3772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 3698 ACTCACAGATGTTGCCACTGGAAGTACAGAAATTGGATCTGATTGTTGGTTCAGCGCCAA 3757
Query 3773 CATACATCTCTTCGGCATCTCAAATGGCTGATGGGGCGCGGATGCTGATTCCTCAACGGG 3832
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||
Sbjct 3758 CATACATCTCTTCTGCATCTCAAATGGCTGATGGGGCACGGATGTTGATTCCTCAACGGG 3817
Query 3833 GCCTTAACGATATTGTGGTTCCTGTATATGATGATGATCCGGCAAGTGTTGTATCATATG 3892
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3818 GCCTTAACGATATCGTGGTTCCTGTATACGATGATGATCCAGCTAGTGTTGTATCATATG 3877
Query 3893 CTATCAATTCAAAGGAATATAAGGAGTGGATCGTTAACAAAGGTCTCGCTTCTAGTAGTA 3952
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3878 CTATCAATTCAAAGGAATATAAGGAGTGGATCGTTAACAAAGGTCTTGCTTCTAGTAGTA 3937
Query 3953 GTAGCAGCAACTTGAATAACAAAGAGTCCGAACCTTCCACCTTCTCGACTTGGCGTTCGC 4012
|||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
Sbjct 3938 GTAGCAGCAATTTGAATAACAGAGAGTCTGAACCTTCCGCCTTCTCGACTTGGCGTTCTC 3997
Query 4013 TGTCGATGGATGTTGATTACATTCAACACGCAGTGTATGGGTCTTCTCAAGACGATAGAA 4072
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3998 TGTCGATGGATGTTGATTACATTCAACACGCGGTGTATGGATCTTCTCAAGACGATAGAA 4057
Query 4073 AGTCTCCACATTTGACCATTTCTTTCAGCGACCGCGCTTCTTCTTCCTCTACTGCAACTG 4132
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4058 AGTCTCCGCATTTGACCATTTCTTTCAGCGACCGCGCTTCTTCTTCCTCTACTGCCACTG 4117
Query 4133 ATGGTAAAGTGAAGTTCTCTGTGACGTGTTATTTTGCAACGCAGTTTGACACTCTGAGAA 4192
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4118 AAGGTAAAGTGAAGTTCTCTGTGACGTGTTATTTTGCAACGCAGTTTGACACTCTGAGAA 4177
Query 4193 AGACGTGCTGTCCGAGTGAAGTGGACTTTGTGAGATCCTTGAGCCGATGTCAGAGATGGT 4252
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4178 AGACTTGCTGTCCGAGTGAAGTGGACTTTGTGAGATCCTTGAGCCGTTGTCAGAGATGGT 4237
Query 4253 CTGCACAGGGAGGGAAAAGCAATGTTTACTTTGCCAAGTCATTGGACGAGAGGTTCATCA 4312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4238 CTGCACAGGGAGGGAAAAGCAATGTTTACTTTGCCAAGTCATTGGACGAGAGGTTCATCA 4297
Query 4313 TTAAACAAGTCGTCAAAACCGAGTTGGATTCTTTCGAGGATTTTGCACCTGAATACTTCA 4372
| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4298 TAAAACAAGTCGTCAAAACCGAGCTGGATTCTTTCGAGGATTTTGCACCTGAGTACTTCA 4357
Query 4373 AATATATGAAGGAATCACTCAGTTCCGGGAGCCCCACTTGTCTTGCTAAGATTCTCGGTA 4432
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4358 AATATTTGAAGGAATCACTCAGTTCCGGGAGCCCTACTTGTCTTGCTAAGATTCTCGGTA 4417
Query 4433 TCTACCAGGTATCAATTAAACACCCGAAAGGTGGAAAAGAGACAAAGATGGATTTGATGG 4492
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4418 TCTACCAGGTCTCAATTAAACATCCGAAAGGTGGAAAAGAGACAAAGATGGATTTGATGG 4477
Query 4493 TGATGGAGAATCTCTTCTACAACAGAAGAATATCGAGGATCTATGATCTCAAGGGATCTG 4552
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4478 TGATGGAGAATCTCTTCTACAACAGAAGAATATCTAGGATCTATGATCTCAAGGGATCTG 4537
Query 4553 CACGGTCACGGTACAATCCAAACACATCCGGAACAGACAAAGTTTTGTTAGACATGAATC 4612
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4538 CACGGTCAAGGTACAATCCAAACACATCCGGAGCAGACAAAGTTTTGTTAGACATGAATC 4597
Query 4613 TGCTTGAGACACTGCGGACAGAACCGATATTCCTAGGAAGCAAGGCCAAGCGAAGCCTGG 4672
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||
Sbjct 4598 TGCTAGAGACACTGCGCACAGAACCGATATTCCTAGGAAGCAAGGCCAAGAGAAGCTTGG 4657
Query 4673 AAAGAGCTATATGGAACGACACCAACTTCTTGGCTTCTGTGGATGTAATGGACTATTCAT 4732
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4658 AAAGAGCGATATGGAACGACACCAATTTCTTGGCTTCTGTGGATGTAATGGACTACTCAT 4717
Query 4733 TACTGGTTGGGTTCGACGAAGAGCGTAAAGAACTGGTTCTTGGGATCATCGACTTCATGA 4792
| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4718 TGCTGGTTGGATTCGACGAAGAGCGGAAAGAACTAGTTCTCGGGATCATCGACTTCATGA 4777
Query 4793 GACAGTACACATGGGACAAGCACCTTGAGACTTGGGTCAAAGCTTCAGGCATTTTGGGTG 4852
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4778 GACAGTACACATGGGACAAGCACCTAGAGACTTGGGTTAAAGCTTCAGGCATTTTGGGTG 4837
Query 4853 GACCCAAGAATGCTTCTCCAACCATAGTCTCTCCAAAACAGTACAAGAGGAGGTTTAGAA 4912
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4838 GACCCAAGAATGCTTCTCCAACTATAGTCTCACCAAAACAGTACAAGAGGAGGTTTAGAA 4897
Query 4913 AGGCCATGACCACTTATTTTCTCACTGTTCCTGAGCCATGGACCTCTTGA 4962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4898 AGGCCATGACCACTTATTTTCTCACTGTTCCTGAGCCATGGACCTCTTGA 4947
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 247573863705
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5