BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg908733
Length=1908
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G71270.1 | Symbols: POK, TTD8, ATVPS52 | Vps52 / Sac2 family... 2739 0.0
AT1G71300.1 | Symbols: | Vps52 / Sac2 family | chr1:26874064-... 2584 0.0
> AT1G71270.1 | Symbols: POK, TTD8, ATVPS52 | Vps52 / Sac2 family
| chr1:26863587-26870015 FORWARD LENGTH=2471
Length=2471
Score = 2739 bits (1483), Expect = 0.0
Identities = 1754/1886 (93%), Gaps = 14/1886 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 13 GCATTGGGCCAAGCTATGTGCGACTTCAGTAATCATGATCAGAAAATTGGATTTGATTTA 72
|||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 171 GCATTGGGCCAAACTATGGGGGACTTTAGTAATCATG---AGAAACTTGGATTTGATTTA 227
Query 73 GGAGCATTTGTCGGAGACTTGGCTTTTGAAGAGGATTCAGGAGGCAGTGAGGATATATCA 132
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct 228 GGAGCATTTGTTGGAGACTTGGCTTTTGAAGAAGATTC---AGGCAGTGAGGATATTTCA 284
Query 133 TTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAACTGATGAGGTTGTCGCCAATATA 192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 285 TTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAAGTGATGAGGTTGTTGCCAATATA 344
Query 193 CTATCCAATGGTGACAAACTTAGAGAATATGCAAAAGGTGTAGAAAACAATCTACTCAAG 252
|| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||
Sbjct 345 CTGTCTAGTGGTGACAAACTTAGAGAATATGCAAAAGGGGTTGAAAACAATCTACGCAAG 404
Query 253 GTTGAATTGGATTCAGTTC-AGGATTACATAAAAGAAAGTGACAACCTCGTCTTACTTCA 311
||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 405 GTTGAATTGGATTCA-ATCGAGGATTACATAAAGGAAAGTGACAACCTAGTCTCACTTCA 463
Query 312 CGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCTTGTCACAAATGGAAACTCTCCTCGGTGGATT 371
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 464 CGATCAGATTCGTGACTGTGACAGCATCCTGTCACAAATGGAAACTCTTCTCAGTGGATT 523
Query 372 TCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAATTCAATGGA 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 524 TCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGTTCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAAGTCAATGGA 583
Query 432 CATGGGTTTGAGACTGAAAAACCGAAGGGTGGCTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGA 491
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 584 CATGGGTTTGAGATTGAAAAACCGCAGGGTGGCTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGA 643
Query 492 AGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTAATTGTTGATGGAGAGGTGAATGAAGA 551
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 644 AGACATTATAGTGCCACCAAAGATGATAGATGTAATTGTTGACGGAGAGGTGAATGAAGA 703
Query 552 GTATATCAAAACACTTGAGATTCTGAGTAAGAAGCTGAAATTTGTAGAAGCAGATCAAGC 611
|||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 704 GTATATGAAAACGCTTGAAATTCTGAGTAAGAAGCTAAAATTTGTAGAAGCAGATCAGGC 763
Query 612 AGTTAAAAGTTCCAAAGCATTAAAAGATGTAAAGCCTGAGCTTGAAAAGCTCCGACAGAA 671
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||
Sbjct 764 AGTTAAAAGTTCCAAAGCGTTAAAAGATGTAGAGCCTGAGCTCGAAAAGCTTCGGCAGAA 823
Query 672 AGCTATTTCCAAGATTTATGATTTTATTGTCCAGAAGCTTATAGCCCTGAAGAAACCAAA 731
||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 824 AGCTATTTCCAAGGTGTATGATTTTATTGTCCAGAAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAA 883
Query 732 AACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTATTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTT 791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 AACAAACATTCAGATTCTTCAACAGAGTGTGTTATTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTT 943
Query 792 CCTCAAAGAACATGGAAAACAAGTGTTTATGGATGTCCGCGCTGCATATATTGATACCAT 851
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||
Sbjct 944 CCTCAAGGAACATGGAAAAGAAGTGTTTATGGATGTTCGTGCTGCATACATTGATACCAT 1003
Query 852 GAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCATGCTTATATTCAAGCATTTGAGAAATTACAGAT 911
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
Sbjct 1004 GAACAAGGTGTTAAGTGCACATTTTCGTGCTTATATTCAAGCACTTGAGAAACTACAGTT 1063
Query 912 AGATATAGCCACATCAAATGACTTGATTGGGGTGGAGACTAGAAGCAGTGGCCTCTTCTC 971
||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||||||||
Sbjct 1064 AGATATAGCCACAGCATATGACTTAATTGGGGTAGAGACCAGAACCACCGGCCTCTTCTC 1123
Query 972 AAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGAACCGCTCTGTCGTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATAAA 1031
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1124 AAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGAACCGCTCTGCCGTTTTTGCTTTGGGTGACAGGATAAA 1183
Query 1032 AATTATAAAGGAAATTGATCAACCTGCATTGATCCCGCACATTGCCGAAGCCAGCTCGT- 1090
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
Sbjct 1184 AATTATAAAGGATATTGATCAACCTGCTTTGATCCCGCACATAGCCGAAGCCAGCTC-TC 1242
Query 1091 TCAAATATCCTTATGAAGTGCTATTCAGGAGTTTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTA 1150
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 TCAAATATCCTTATGAAGTGCTCTTCAGGAGCCTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTA 1302
Query 1151 CTTCTGAGTATATCTTTTGTGATGATTTCTTTGGTGAAGCGTCTATATTCTATGAAATTT 1210
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||
Sbjct 1303 CTTCTGAGTATATGTTTTGTGATGATTTCTTTGGTGAAGAGTCCATATTCTATGAAATTT 1362
Query 1211 TTGCGGGTCCATTCTCTGTTATCGATGAGCACGTCAATTCCGTCCTCTCAAACTGTTTTG 1270
||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||
Sbjct 1363 TTGCGGGTCCATTTTCTGTCATCGATGAGCACTTCAATCCCGTTCTTTCAAACTGTTTTG 1422
Query 1271 ATGCTATCGGTCTGATGCTTATGATTCGCATTATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTC 1330
||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423 ATGCTATTGGCCTGATGCTTATGATTCGCATAATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTC 1482
Query 1331 GCCGGAGGATTCCATGCCTGGATTCATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTCTGTGGCCTC 1390
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1483 GCCGGAGAATTCCATGCCTGGACTCATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTC 1542
Query 1391 GTTTTAAGATGGTGTTCGACTTACACATCAGCAGTCTGCGAGATGCAAACATAAATACAT 1450
|||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||
Sbjct 1543 GTTTCAAGATGGTGTTTGACTCACACCTTAGCAGTCTGAGAGATGCAAACATTAAGACAT 1602
Query 1451 TATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATGAGGCGTTATGCTGAATTTACGGCTT 1510
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1603 TATGGGAAGATGATGTTCATCCTCACTATGTCATGAGGCGTTATGCTGAATTCACGGCTT 1662
Query 1511 CGTTTATTCACCTGAATGTTGAATATGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGAGCGTT 1570
||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1663 CGTTTATTCACCTAAACGTTGAATATGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATCTGGAGCGGT 1722
Query 1571 TAAGAATGGCAGTAGACAGCTTGATTCTTAAGCTTGCAAAGTTTTTCCCGAAG-CCAAAG 1629
|||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||
Sbjct 1723 TAAGAATGGCTGTAGATGGGTTGATTCTCAAGCTTGCAAAGTTGTTCCC-AAGGCCAAAG 1781
Query 1630 CAGCAAATTGTGTTTCTCATAAACAACTACGATATGACAATTGCTGTGCTGAAGGAAGCT 1689
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct 1782 CAGCAAATTGTGTTTCTCATAAATAACTACGATATGACAATCGCTGTACTGAAGGAAGCT 1841
Query 1690 GAACCAGAAGGTGGGACAATTCAAATGCATTTTGAGGAATTGCTAAAGAGTAACACTTCA 1749
| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 GGACCAGAAGGTGGGAAAATTCAAATGCATTTTGAGGAAATGCTAAAGAGTAACACTTCA 1901
Query 1750 TTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCTTTGATTTGATCAAATTTGTGAAAAGT 1809
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
Sbjct 1902 TTATTTGTGGAAGAACTGCTGGTGGAGCATTTCAGTGATTTGATCAAATTCGTGAAAAAT 1961
Query 1810 CGAGCCTCTGAGGATTCTAG-TTCAAATTTAGAGAGGTCCATCACAGTTGCTGAAGTAGA 1868
||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||
Sbjct 1962 CGAGCTTCTGAGGATTCGAGCTT-AAATCCAGAGAGGTCCATTACAATTGCTGAAGTAGA 2020
Query 1869 GCCGCTGGTGAAAGACTTTGGAAGCA 1894
||| |||||||| |||||||||||||
Sbjct 2021 GCCACTGGTGAAGGACTTTGGAAGCA 2046
> AT1G71300.1 | Symbols: | Vps52 / Sac2 family | chr1:26874064-26878340
FORWARD LENGTH=2187
Length=2187
Score = 2584 bits (1399), Expect = 0.0
Identities = 1673/1803 (93%), Gaps = 28/1803 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 115 GGCAGTGAGGATATATCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAACTGAT 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 142 GGCAGTGAGGATATATCATTGGAAGGGCTTCAACAAGAACTTGAAGAATGTGAAAGTGAC 201
Query 175 GAGGTTGTCGCCAATATACTATCCAATGGTGACAAACTTAGAGAATATGCAAAAGGTGTA 234
|||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 202 GAGGTTGTTGCCAATATACTGTCCAGTGGTGACAAACTTAGAGAATATGCCAAAGGTGTT 261
Query 235 GAAAACAATCTACTCAAGGTTGAATTGGATTC-----A----G----T-TC--A--GGAT 276
||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || | |||
Sbjct 262 GAAAACAATCTACGGAAGGTTGAATTGGATTCAGTTGAGGTTGCTATTCTCTTACCTGAT 321
Query 277 TACATAAAAGAAAGTGACAACCTCGTCTTACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTGACAGC 336
||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 322 TACATAAAAGAAAGTGATAAACTAGTCTCACTTCACGATCAGATTCGTGACTGTAACTGC 381
Query 337 ATCTTGTCACAAATGGAAACTCTCCTCGGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGT 396
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 ATCTTGTCACAAATGGAAACTCTTCTCAGTGGATTTCAGGAAGAGATTGGTTCTATAAGT 441
Query 397 TCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAATTCAATGGACATGGGTTTGAGACTGAAAAACCGA 456
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 442 TCAGACATAAAGATTCTTCAAGAAAATTCAATGGACATGGGTTTGAGACTGAAAAATCGA 501
Query 457 AGGGTGGCTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACATTATAGTGCCACCAAAGATG 516
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct 502 AGGGTGACTGAATCAAAGCTAGCAAAATTTGTCGAAGACTTTATAGTACCACCAAAGATG 561
Query 517 ATAGATGTAATTGTTGATGGAGAGGTGAATGAAGAGTATATCAAAACACTT-GAGATTCT 575
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
Sbjct 562 ATTCATGTAATTGTTGATGGAGAGGTGAATGAAGAGTATATCAAAACACTTGGA-ATTCT 620
Query 576 GAGTAAGAAGCTGAAATTTGTAGAAGCAGATCAAGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCATTAAA 635
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 621 GAGCAAGAAGCTGAAATTTGTAGAAACAGATCAAGCAGTTAAAAGTTCCAAAGCATTAAA 680
Query 636 AGATGTAAAGCCTGAGCTTGAAAAGCTCCGACAGAAAGCTATTTCCAAGATTTATGATTT 695
||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 681 AGATGTAGAGCCTGAGCTTGAAAAGCTCCGGCAAAAAGCTATTTCCAAGGTTTATGATTT 740
Query 696 TATTGTCCAGAAGCTTATAGCCCTGAAGAAACCAAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACA 755
|||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATTGTTCAGAAGCTTATAGCCCTGAGGAAACCCAAAACAAACATTCAGATTCTTCAACA 800
Query 756 GAGTGTGTTATTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAAGAACATGGAAAACAAGT 815
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 801 GAGTGTGTTTTTAAAGTACAAGTATATTATCTCCTTCCTCAAAGAACATGGAAAAGAAGT 860
Query 816 GTTTATGGATGTCCGCGCTGCATATATTGATACCATGAACAAGGTGTTAAGTGCACATTT 875
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 861 GTTTATGGATGTCCGCGCTGCATACATAGATACCATGAACAAGGTGCTAAGTGCACATTT 920
Query 876 TCATG-CTTATATTCAAGCATTTGAGAAATTACAGATAGATATAGCCACATCAAATGACT 934
||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 921 TCA-GTCTTATATTCAAGCATTTGAGAAACTACAGTTAGATATAGCCACATCAAACGACT 979
Query 935 TGATTGGGGTGGAGACTAGAAGCAGTGGCCTCTTCTCAAGAGCTAGGGAGCCACTAAAGA 994
||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 980 TGATTGGTGTGGACACTAGAAGCACTGGCCTCTTCTCAAGATCTAAGGAGCCACTAAAGA 1039
Query 995 ACCGCTCTGTCGTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATAAAAATTATAAAGGAAATTGATCAAC 1054
|||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040 ACCGTTGTGCCGTTTTTGCTTTGGGTGAGAGGATACAAATTATAAAGGAAATTGATCAAC 1099
Query 1055 CTGCATTGATCCCGCACATTGCCGAAGCCAGCTCGT-TCAAATATCCTTATGAAGTGCTA 1113
|||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||
Sbjct 1100 CTGCTTTGATCCCGCACATAGCCGAAGCCAGCTC-TCTCAAGTATCCTTATGAAGTGCTC 1158
Query 1114 TTCAGGAGTTTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATCTTTTGTGAT 1173
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 TTCAGGAGCTTGCACAAGCTACTTATGGATACAGCTACTTCTGAGTATATCTTTTGTGAA 1218
Query 1174 GATTTCTTTGGTGAAGC-GTCTATATTCTATGAAATTTTTGCGGGTCCATTCTCTGTTAT 1232
||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1219 GATTTCTTTGGTGAA-CAGTCTATATTTTATGAAATATTTGCGGGCCCATTCTCTGTTAT 1277
Query 1233 CGATGAGCACGTCAATTCCGTCCTCTCAAACTGTTTTGATGCTATCGGTCTGATGCTTAT 1292
| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||
Sbjct 1278 CTATGAGCACTTGGATTCCGTCCTCTCAAGCTGTTATGATGCTATCGGTTTGCTGCTTAT 1337
Query 1293 GATTCGCATTATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGGATTCCATGCCTGGA 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 GATTCGCATTATACACCACCACCAGCTTATCATGTCTCGCCGGAGGATTCCATGCCTGGA 1397
Query 1353 TTCATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTCTGTGGCCTCGTTTTAAGATGGTGTTCGACTT 1412
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||
Sbjct 1398 TTCATATCTGGACAAGGTTAATATTTCTTTGTGGCCTCGTTTTAAGACGGTGTTTGACTT 1457
Query 1413 ACACATCAGCAGTCTGCGAGATGCAAACATAAATACATTATGGGAAGATGATGTTCATCC 1472
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1458 GCACATCGGCAGTCTGCGAAATGCAAACATAAATACAATATGGGAAGATGATGTGCATCC 1517
Query 1473 TCACTATGTCATGAGGCGTTATGCTGAATTTACGGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGA 1532
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 TCACTATATCATGAGACGTTATGCTGAATTCACGGCTTCGTTTATTCACCTGAATGTTGA 1577
Query 1533 ATATGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGAGCGTTTAAGAATGGCAGTAGACAGCTT 1592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1578 ATATGGAGATGGGCAGCTTGATATAAATTTGGAGCGTTTAAGAATGGCAGTAGACAGCTT 1637
Query 1593 GATTCTTAAGCTTGCAAAGTTTTTCCCGAAG-CCAAAGCAGCAAATTGTGTTTCTCATAA 1651
||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||||||| |
Sbjct 1638 GATTCTTAAGCTTGCAAAGTTGTTCCC-AAGGCCAAAGCAACAGATGGTGTTTCTCATTA 1696
Query 1652 ACAACTACGATATGACAATTGCTGTGCTGAAGGAAGCTGAACCAGAAGGTGGGACAATTC 1711
||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
Sbjct 1697 ACAACTATGATATGACCATTGCTGTGCTGAAGGAAGCTGAACCAGAGGGTGGGAAAATTC 1756
Query 1712 AAATGCATTTTGAGGAATTGCTAAAGAGTAACACTTCATTATTTGTGGAAGAACTGCTGG 1771
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||
Sbjct 1757 AAATGCATTTTGAGGAATTACTAAAGAGCAACACTTCCTTATTTGCGGAAGAATTGCTGG 1816
Query 1772 TGGAGCATTTCTTTGATTTGATCAAATTTGTGAAAAGTCGAGCCTCTGAGGATTCTAGTT 1831
||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||
Sbjct 1817 TGGAGCATTTCAGTGATATGATCAAATTTGTTAAAAGCCGAGCCAATGAGGATTCAAGTC 1876
Query 1832 CAAATTTAGAGAGGTCCATCACAGTTGCTGAAGTAGAGCCGCTGGTGAAAGACTTTGGAA 1891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1877 CAAATTTAGAGAGGTCCATCACAGTTGCTGAAGTAGAGCCGCTGGTGAAGGACTTTGGAA 1936
Query 1892 GCA 1894
|||
Sbjct 1937 GCA 1939
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 94477425690
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5