BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg908972
Length=1473
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G73602.1 | Symbols: CPuORF32 | conserved peptide upstream op... 2444 0.0
AT1G73600.2 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent met... 2431 0.0
> AT1G73602.1 | Symbols: CPuORF32 | conserved peptide upstream
open reading frame 32 | chr1:27670626-27673569 FORWARD LENGTH=1841
Length=1841
Score = 2444 bits (1323), Expect = 0.0
Identities = 1426/1476 (97%), Gaps = 6/1476 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGGCTGT-GTATGGCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCACTCTGT 59
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 200 ATGGCT-TCGTATGGCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCATTCAGT 258
Query 60 GGGATTGAGTGTAGAGGCCATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGA 119
|||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 259 GGGATTGAGTGTTGAAGCTATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGA 318
Query 120 ACGTCCTGAGATACTTGCGCTTCTTCCACCGATTGAAGGGAAAACAGTGCTAGAGTTTGG 179
||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 319 ACGTCCTGAGATACTTGCGTTTCTTCCACCTATTGAAGGGACAACAGTGCTAGAGTTTGG 378
Query 180 TGCTGGAATTGGTCGTTTCACTACT-AATTTAGCTCACAAGGCTGGCCAGCTCATTGCGG 238
|||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||
Sbjct 379 TGCTGGAATTGGTCGTTTTACTACTGAA-TTAGCTCAGAAGGCCGGCCAGGTCATTGCGG 437
Query 239 TTGACTTCATTGAAAGTGTTATCAAAAAGAATCAAAACATTAACGGGCACTACAAGAACG 298
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 438 TTGACTTCATTGAAAGTGTTATCAAAAAGAATGAGAACATTAACGGTCACTACAAGAACG 497
Query 299 TCAAATTTCTGTGCGCTGATGTCACATCGCCAAATATGAACTTTCTAAACGAGTCTATGG 358
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||
Sbjct 498 TCAAATTTCTGTGCGCTGATGTCACATCACCAAATATGAACTTTCCAAATGAGTCTATGG 557
Query 359 ATCTGATATTCTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGAT-AGAGAGGTTGAAGATTTG 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||
Sbjct 558 ATCTGATATTCTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGATCA-AGAGGTTGAAGATTTG 616
Query 418 GCGAAAAAGATGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGT 477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 GCGAAAAAGATGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGT 676
Query 478 TTCCATCAGTCTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAA 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677 TTCCATCAGTCTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAA 736
Query 538 TTTTACACAAAGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAA 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 TTTTACACAAAGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAA 796
Query 598 CTCTCTTTGGTTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAAC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 797 CTCTCTTTGGTTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAAC 856
Query 658 CAGATATGCTGGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTC 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 857 CAGATATGCTGGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTC 916
Query 718 TTGGACAATGTCCAGTATAAGTCAAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTATTTGGAGAA 777
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 917 TTGGACAATGTCCAGTATAAGTCTAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTCTTTGGAGAA 976
Query 778 GGCTTTGTTAGCACAGGGGGACTCGAGACAACGAAGGAATTTGTGGATATGCTTGATCTG 837
|| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 977 GGGTTTGTTAGCACAGGGGGACTCGAGACAACAAAGGAATTCGTGGATATGCTGGATCTG 1036
Query 838 AAACCTGGCCAGAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATG 897
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAACCTGGCCAAAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATG 1096
Query 898 GCTGAGAACTTTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097 GCTGAGAACTTTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTT 1156
Query 958 GCGCTTGAACATGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACC 1017
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 GCGCTTGAACACGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACC 1216
Query 1018 AAAAAGGAGTATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTACAGCAGAGACACCATTCTGCAT 1077
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 1217 AAGAAGGAGTATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTATAGCAGAGACACCATTCTACAT 1276
Query 1078 ATCCAAGACAAGCCAGCATTGTTCAGAACATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAA 1137
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277 ATCCAAGACAAGCCAGCATTGTTCAGAAGATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAA 1336
Query 1138 GTTCTCATCACTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTTCAGACTTTGCAAACTAT 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 1337 GTTCTCATCACTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTCCAGACTTTGCAATCTAC 1396
Query 1198 ATCAAGCAACGAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGAC 1257
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 ATCAAGAAACGAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGAT 1456
Query 1258 GCTGGATTCGAAGAGGTAACCACAGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAA 1317
||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457 GCTGGTTTCGAGGAGGTAATCGCGGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAA 1516
Query 1318 CGGGAACTGGATGCAGTAGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGCGACTTCTCGGAAGAG 1377
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 1517 CGGGAACTGGATGCAGTGGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGTGACTTCTCGAAAGAG 1576
Query 1378 GATTACGAGGATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAG 1437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577 GATTACGAGGATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAG 1636
Query 1438 CAGAAGTGGGGTTTGTTCATCGCCAAGAGAAATTGA 1473
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1637 CAGAAGTGGGGTTTGTTCATCGCCAAGAGAAACTGA 1672
> AT1G73600.2 | Symbols: | S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
superfamily protein | chr1:27669152-27673572
FORWARD LENGTH=1759
Length=1759
Score = 2431 bits (1316), Expect = 0.0
Identities = 1417/1466 (97%), Gaps = 5/1466 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 10 TATGGCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCACTCTGTGGGATTGAGT 69
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 125 TAT-GCGAGGAGCGTGAAATCCAAAAGAATTACTGGAAAGAGCATTCAGTGGGATTGAGT 183
Query 70 GTAGAGGCCATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGAACGTCCTGAG 129
|| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 184 GTTGAAGCTATGATGCTTGATTCCAAAGCTTCTGACCTCGACAAAGAAGAACGTCCTGAG 243
Query 130 ATACTTGCGCTTCTTCCACCGATTGAAGGGAAAACAGTGCTAGAGTTTGGTGCTGGAATT 189
||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 244 ATACTTGCGTTTCTTCCACCTATTGAAGGGACAACAGTGCTAGAGTTTGGTGCTGGAATT 303
Query 190 GGTCGTTTCACTACT-AATTTAGCTCACAAGGCTGGCCAGCTCATTGCGGTTGACTTCAT 248
|||||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 304 GGTCGTTTTACTACTGAA-TTAGCTCAGAAGGCCGGCCAGGTCATTGCGGTTGACTTCAT 362
Query 249 TGAAAGTGTTATCAAAAAGAATCAAAACATTAACGGGCACTACAAGAACGTCAAATTTCT 308
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 363 TGAAAGTGTTATCAAAAAGAATGAGAACATTAACGGTCACTACAAGAACGTCAAATTTCT 422
Query 309 GTGCGCTGATGTCACATCGCCAAATATGAACTTTCTAAACGAGTCTATGGATCTGATATT 368
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 423 GTGCGCTGATGTCACATCACCAAATATGAACTTTCCAAATGAGTCTATGGATCTGATATT 482
Query 369 CTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGAT-AGAGAGGTTGAAGATTTGGCGAAAAAGA 427
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 CTCCAACTGGCTGCTAATGTATCTCTCTGATCA-AGAGGTTGAAGATTTGGCGAAAAAGA 541
Query 428 TGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGTTTCCATCAGT 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 TGTTACAATGGACAAAGGTTGGCGGGTATATTTTCTTTCGGGAGTCTTGTTTCCATCAGT 601
Query 488 CTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAATTTTACACAA 547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 CTGGTGATAACAAGCGGAAGTACAACCCAACACACTACCGTGAACCTAAATTTTACACAA 661
Query 548 AGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAACTCTCTTTGG 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 AGCTTTTCAAAGAATGCCATATGAATGACGAAGATGGGAATTCGTATGAACTCTCTTTGG 721
Query 608 TTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAACCAGATATGCT 667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 722 TTAGCTGTAAATGCATTGGAGCTTATGTGAGAAACAAAAAGAACCAGAACCAGATATGCT 781
Query 668 GGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTCTTGGACAATG 727
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 782 GGCTTTGGCAGAAAGTCAGTTCGGATAATGATAGGGGCTTCCAACGCTTCTTGGACAATG 841
Query 728 TCCAGTATAAGTCAAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTATTTGGAGAAGGCTTTGTTA 787
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 842 TCCAGTATAAGTCTAGTGGTATCTTACGCTATGAGCGTGTCTTTGGAGAAGGGTTTGTTA 901
Query 788 GCACAGGGGGACTCGAGACAACGAAGGAATTTGTGGATATGCTTGATCTGAAACCTGGCC 847
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 902 GCACAGGGGGACTCGAGACAACAAAGGAATTCGTGGATATGCTGGATCTGAAACCTGGCC 961
Query 848 AGAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATGGCTGAGAACT 907
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AAAAAGTTCTAGACGTTGGGTGCGGAATAGGAGGAGGGGACTTCTACATGGCTGAGAACT 1021
Query 908 TTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTTGCGCTTGAAC 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 TTGACGTGGATGTTGTGGGCATTGATCTATCTGTAAACATGATCTCTTTTGCGCTTGAAC 1081
Query 968 ATGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACCAAAAAGGAGT 1027
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1082 ACGCAATAGGACTCAAATGCTCTGTAGAATTCGAAGTAGCTGATTGCACCAAGAAGGAGT 1141
Query 1028 ATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTACAGCAGAGACACCATTCTGCATATCCAAGACA 1087
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1142 ATCCTGATAACACCTTTGATGTTATTTATAGCAGAGACACCATTCTACATATCCAAGACA 1201
Query 1088 AGCCAGCATTGTTCAGAACATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAAGTTCTCATCA 1147
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 AGCCAGCATTGTTCAGAAGATTCTACAAATGGTTGAAGCCGGGAGGGAAAGTTCTCATCA 1261
Query 1148 CTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTTCAGACTTTGCAAACTATATCAAGCAAC 1207
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||
Sbjct 1262 CTGATTACTGCAGAAGCCCCAAAACCCCATCTCCAGACTTTGCAATCTACATCAAGAAAC 1321
Query 1208 GAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGACGCTGGATTCG 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct 1322 GAGGTTATGATCTTCATGATGTACAAGCATACGGTCAGATGCTGAGAGATGCTGGTTTCG 1381
Query 1268 AAGAGGTAACCACAGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAACGGGAACTGG 1327
| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382 AGGAGGTAATCGCGGAGGATAGAACCGATCAGTTCATGAAAGTCCTGAAACGGGAACTGG 1441
Query 1328 ATGCAGTAGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGCGACTTCTCGGAAGAGGATTACGAGG 1387
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1442 ATGCAGTGGAGAAGGAGAAGGAAGAATTCATCAGTGACTTCTCGAAAGAGGATTACGAGG 1501
Query 1388 ATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAGCAGAAGTGGG 1447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 ATATTATAGGCGGGTGGAAGTCAAAGCTACTTAGGAGCTCAAGTGGTGAGCAGAAGTGGG 1561
Query 1448 GTTTGTTCATCGCCAAGAGAAATTGA 1473
|||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1562 GTTTGTTCATCGCCAAGAGAAACTGA 1587
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 72640188615
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5