BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg909961
Length=3864
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G02990.3 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unkn... 6191 0.0
> AT1G02990.3 | Symbols: | FUNCTIONS IN: molecular_function unknown;
INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN:
cellular_component unknown; BEST Arabidopsis thaliana protein
match is: CW-type Zinc Finger (TAIR:AT3G62900.1). | chr1:681396-687315
REVERSE LENGTH=4379
Length=4379
Score = 6191 bits (3352), Expect = 0.0
Identities = 3706/3872 (96%), Gaps = 43/3872 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGATTTTGGTGAGTAGTAGCGATGCTAGAAGCGAATTAGGGTTAGGGTTTGGTGGATTA 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 215 ATGATTTTGGTGAGTAGTAGCGATGCTAGAAGCGAATTAGGGTTAGGGTTTGGTGGATTA 274
Query 61 GGTGAAGAAATCATGCAAGATTGTGACTTTGAGGAAGAAAGCACACATTCTTATGTTTCT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 275 GGTGAAGAAATCATGCAAGATTGTGACTTTGAGGAAGAAAGTACACATTCTTATGTTTCT 334
Query 121 TGCGTTGACCCAGATGTTGCTCTCTCTTATATCGATGAGAAACTTGAAAACGTCTTGGGA 180
||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 335 TGCGTTGACCCAGATGTTGCTCTCTCTTACATTGATGAGAAACTCGAAAACGTCTTGGGA 394
Query 181 CATTTTCAGAAAGATTTTGAAGGTGGAGTTTCAGCTGAAAATTTGGGTGCAAAGTTTGGT 240
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 395 CATTTTCAGAAAGATTTTGAAGGTGGAGTTTCTGCTGAAAATTTGGGTGCAAAGTTTGGT 454
Query 241 GGCTATGGTTCCTTTTTGTCTATGTATCAGAGATCTCCTGTTTCTTCACGTCCTAAGACT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 455 GGCTATGGTTCCTTTTTGTCTATGTATCAGAGATCTCCTGTTTGTTCACGTCCTAAGACT 514
Query 301 CCACCAGATGTTCAACAAAACCAATTGGGGGGTCGATCTAATTGCTCAGCTTCATCACTT 360
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 TCACCAGAAGTTCAACAAAACCAATTGGGTGGTCGATCTAATTGCTCAGCTTCATCACTA 574
Query 361 GTACCTCAACTATCAATATCCGGATCCTCTTCGAAACCTCCTGCCTCTGATGTTTTCGTC 420
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||
Sbjct 575 GTACCTCAACTATCAATATCCGGATCCGCTTCAAAACCTCCTGCTTCTGATGTTTTGGTC 634
Query 421 AAATTAAAAAAGTTCGTCAAATCAAGTAATATAGGGACACCTGATAGCAAACAAAAACCT 480
|||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 635 AAATTAAACAAGTTTGTCAAATCAAGTCATATAGGGACACCTGATAGCAAACACATGTCT 694
Query 481 GACACAAAAATTTCTTCTTCTGCTCCATCAAATCATAAGACTCTCAGACTTCGTATAAAA 540
||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 695 GACGCAAAAACTTCTTCTTCTGCTCCATCAAATCATAAGACTCTCAGGTTTCGTATAAAA 754
Query 541 GTTGGTTCGAGTGACCTCTCTTCACTCAAAAACGTTTCTACCTATACTAAAGAAGGCCTC 600
|||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 755 GTTGGTTCAAGTGACCTCTCGTCACTCAAAAACGTTTCTACCTTTACTAAAGAAGGCCTC 814
Query 601 AATATGCTACCATCAGCATCGCGGGTGAATTGCCTTTCAGAAGTTGAACAAGACTTACTG 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 815 AATATGCTACCATCAGCATCGCGGGTGAATTGCCTCTCAGAAGTTGAACAAGATTTACTG 874
Query 661 AATGGGATTTGTGATTCACCGACTAAAATTCTTATGGCTATGGTGTCATTCCCTTTGCAT 720
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 875 AATGGGATTTGTGATTCGCCCACTAAAATTCTTATGGCTATGGTGTCATTCCCTTTGCAT 934
Query 721 AAAGATCAGCTGTTATCACCTCTCTCTGATGATCTTATTTTGTTGGGATCGAAAGAAAAG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 935 AAAGATCAGCTGTTATCACCTCTCTCTGATGATCTTATTCAGTTGGGATCGAAAGAAAAG 994
Query 781 ATTTTCAAAGATGCTGGATATGGTTCTGCAAACAAGTCGGACT-CAAAAAGTACACCCGA 839
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||
Sbjct 995 ATTTTGAAAGATGCTGGATATGGTTCTACAAACAAGACGGA-TGCAAAAAGTACACCCGA 1053
Query 840 TGATTTGGTTGTTTCTGATTCACAAAAGCGTGCTGGTAAGTTTTCC-ATTGGGAAGAAGG 898
|| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 1054 TGGTTTAGTTGTTTCTGATTCACAAAAGCGTGCTGGTAAG-TTTCCTATTGGGAAGAAGG 1112
Query 899 AAAAGTTAAGGGATAGGGTAAAGTATAGGCCACCGTCAAACAAGCGTGACAGAAATCATA 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1113 AAAAGTTAAGGGATAGGGTAAAGTATAGGCCACCGTCAAACAAGCTTGACAGAAATCATA 1172
Query 959 CTGTATCCAATACTGAAAAAGAGGCTGACAAAGAGTCCTGCGAGGAGCTTGTTTCCAAGA 1018
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1173 CCGTATCCAATACTGAAAAAGAGGCTGACAAAGAGTCCTGTGAGGAGCTTGTTTCCAAGA 1232
Query 1019 CTATGAAGCTTCCACTTTTATCCTGTCTATCACCGTCATATATCCACCCAGCAAAAGAGA 1078
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1233 CTATGAAGCTTCCACTTTTATCCTGTCTATCACCTTCATATATCCACCCGGCAAAAGAGA 1292
Query 1079 TTGATAAAGTATCAGATTCTAATGTGGAG-GTTATATCAAGAGGAACGAACAAAGATGCA 1137
||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1293 TTGATAACGTATCAGATTCTAATGTGGAGAG-TATATTAAGAGGAACGAACAAAGATGCA 1351
Query 1138 GCTTTGATGGGTTCAAAGCCGGAACTAGAAGATAATGTAGTGGCATTTTCAGATCGAAGC 1197
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 GCTTTGATGGGTTCAAAGCCGGAACTAGAAGATAATGTAGTGGCATTTTCAGATCGAAGT 1411
Query 1198 GTTAAGGAAACTGAAAGTATTAACGTAAGAAAAGACGTTTACCTGATAAAAGGTGAACCT 1257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 GTTAAGGAAACTGAAAGTATTAACGTAAGAAAAGACGTGTACCTGATAAAAGGTGAACCT 1471
Query 1258 CTAAACTCATTGGAAAGTAATTCCAAGAGGGAGAAAGCTCCAAGTATTGAACATGTAGAT 1317
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 CTAAACTCATTGGAAAGTAATCCCAAGCGGGAGAAAGCTCCAAGTATTGAACATGTAGAT 1531
Query 1318 TATTCTTCTGTGGTTAAGGGTAGTCAGAGTGAGACAAGGAATGAAGAGCAAATTTTAAAG 1377
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1532 TATTCTTCTGTGGTTAAGGGTACTCAGAGTGAGACAAGGAATGAAGAGCAAATTTTAAAG 1591
Query 1378 TCAAAACTGCCTAAAGCACAGAAGTCACAAAAAAGTTCAAGCTCCATTGTTTCCATGAAT 1437
|||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1592 TCAAAACTGCCTAAAGTACAGAGGTCACAAAAAGGTTCAAGCTCCATTGTTACCATGAAT 1651
Query 1438 AGTCTGAGAGGCAAGGACGCGGCTGTAAATATAATTAAGAAGAATGTACCAGATAAATTG 1497
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1652 AGTCAGAGAGGCAAGGACGCTGCTGTAAATATAATTAAGAAGAATGTACCAGATAAATTG 1711
Query 1498 CAGGAAGATATTGGAGAATCCGAACACATGTATAAGGGATTCTTTGGTGATTCGAAAGAA 1557
||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 CAGGAAGATATTGAAGAATCCGAACACATGTGTAAGGGATTCTTTGGTGATTCGAAAGAA 1771
Query 1558 TCaaaagaagaaaaacaaagtagt-ccgatacttaaagctgaaaaagcaaagctttcaga 1616
||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1772 TCAAAAGAAGAAAAACAAATTAGTCCCG-TACTTAAAGCTGAGAAAGAAAAGCTTTCAGA 1830
Query 1617 agaaaaTGCATTGGAG-GAGAGTTTCAACAGTGTTAAAAATGATGAAGAGGCTTGTGACC 1675
|||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1831 AGAAAATGCATTGG-GCGAGAGTTTCAACAGTGTTAAAAATGATGAAGAGGCTTGTGATC 1889
Query 1676 ATCTAAATTTGGTATGTGAACCTGATTTGAAACACCTTATTAAGCCGAGTGACTTGAATG 1735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890 ATCTAAATTTGGTATGTGAACCTGATTTGAAACACCTTATTAAGCCGAGTGACTTGAATG 1949
Query 1736 AAGATAGGCACACCACTAAGCAGAGTGTTAGACGGGAAGTGAAAAATAAGCATTCTCTTG 1795
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950 AAGATAGGCACACCACCAAGCAGAGTGTTAGACGGGAAGTGAAAAATAAGCATTCTCTTG 2009
Query 1796 AAGGAGGAATGGAGAATATGGGAATGGAATCTGAAAGGGAACTTTCTGGGGTTTCTAAGA 1855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2010 AAGGAGGAATGGAGAATATGGGAATGGAATCTGAAAGGGAACTTTCTGGGGTTTCTAAGA 2069
Query 1856 AACCAAAGACTGGAAAATCACGATTTTCCACTTTAGATCAACCTGGATCCAACAAATCCA 1915
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 AACCAAAGACTGGAAAATCACGATTTTCCGCTGTAGATCAACCTGGATCCAACAAATCCA 2129
Query 1916 ACCAAATTCTGGACGTTTTAGATACTAACAAAACTATGATTACTCAAGCCTCAGCCGAAA 1975
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2130 ACCAAATTCTGGAAGTTTTAGATACTAACAAAACTATGATTACTCAAGCCTTAGCCGAAA 2189
Query 1976 ATGTCAAGGATTTTGCTAAGGCTTCCTCGCATGGCGAACGTGATGACAGAAAGAGGAAAC 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2190 ATGTCAAGGATTTTGCTAAGGCTTCCTCGCATGGCGAACGTGATGACAGAAAGAGGAAAC 2249
Query 2036 TGAAGGAAAATGAAGAAAGTGGAGATTGTATGAGACCTAGAGAAGCTGCAGTAATAGAGT 2095
||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |
Sbjct 2250 TGAAGGAAAATGAGGAAAGTGGAGATTGTATGAGACTTAGAGAAGCTGCAGTAATGGAAT 2309
Query 2096 CAAGTGGAGAGAACGTTAGAAAAAGTAAGAGGCTTAAAGGTTCAAGTTGTGATGAAAAAG 2155
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310 CAAGTGGAGAGAACGTTAGAAAGAGAAAGAGGCTTAAAGGTTCAAGTTGTGATGAAAAAG 2369
Query 2156 AGTTGCCTTTTAGTAGTGAAAGCTGTGATAAGGAAAGAAGAGTTAGTCAAGAAAATGGTA 2215
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2370 AGTTGCCTTTTAGTAGTGAAAGCTGTGATAAGGAAAGAAGTGTTAGTCAAGAAAATGGTA 2429
Query 2216 GAGATTGTGCTTCCCATCTACCTTTTATAGC-GTCCTCTCCGATTTTGTGTAAGGATTTG 2274
||||| ||||||| |||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2430 GAGATAGTGCTTCTCATCTACCTTCTACA-CTGTCCTCTCCGAGTTTGTGTAAGGATTTG 2488
Query 2275 GGCTCTGAAATTATCAAAAATAATGTCTGCGAA-GCCAAAGGTTCACTAGTTGAATCAGT 2333
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2489 GGCTCTGAAATTATCAAAAATAATGTCCGCGAAAGT-AAAGGTTCACTAGTTGAATCAGT 2547
Query 2334 TGCCCCTTCGGCCTTGAGAGTGTTAGACTCAGGTGAGCTTAAATCAGGAAGAATTTCAGA 2393
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2548 TGCCCCTTTGGCCTTGAGAGTGTTAGACTCAGGTGAGCTTAAATCAGGAAGAATTTCAGA 2607
Query 2394 GAGGGATGAATACCATGATGCTGATTCTAATACTGGTGATACGTTAAAAAGATGCCGAGA 2453
|||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2608 AAGGGATGAGTACCATGATACTGATTATAATGCTGGTGAGACGTTAAAAAGATGCCGAGA 2667
Query 2454 TGGTGAGGCTTATAGCACTATCGATAGACCAGGGACAACAAAGAAGGCTGCAGAAAATTC 2513
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2668 TGGTGAGGCTTATAGTACTATCGATAGACCAGGGACAACAAAGAAGGCTGCAGAAGATTC 2727
Query 2514 CAAGGATAGAGAAAGAGCATATGGTGAAGATTGTTCAATTGAAAACTTTAAACCAAAGAA 2573
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2728 CAAGGATAGAGAAAGAGCATATGGGGAGGATTGTTCAATTGAAAACTTAAAACCAAAGAA 2787
Query 2574 GTCAGGGAGATGTCCTGGTGAAAATTGCATAGAGGGTGGCTCTAAGCAAAAGAGTAGGGA 2633
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||
Sbjct 2788 GTCAGGGAGATATCCTGGTGAAAATTGCATAGAGGGTGACTCTAAGCAAAAGAGTAGAGA 2847
Query 2634 AGAGGGGTCATCTGCACCTTCGAAAGAGAATAACTGGGGTCTGGTGAATGACGTGCAAGA 2693
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2848 AGAGGAGTCATCTGCACCTTCGAAAGATAATAACTGGGGTCTGGTGAATAACGTGCAAGA 2907
Query 2694 TCTTGGCACTGCTGTTaaagtaaaaagaaaagaaagcaggagcaagaaaagacctgctag 2753
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2908 TCTTGGCACTGCTGTTAAAGTAAAAACAAAAGAAAGCAGGAGCAAGAAAAGACCTGCTAG 2967
Query 2754 aaaagTGTCTTTGGAGAGTAATAAAGAAGACTCAAGGGAATATCAAGATCCTAATACTAA 2813
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2968 AAAAGTGTCTATGGAGTGTAATAAAGAAGACTCAAGGGAATATCAAGATCCTAATACTAA 3027
Query 2814 GCTAGATAGAAGTAGTAGTCATTTTTCTTCTCGACAGAAACCTGATACAGCAAACACTTC 2873
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 GCTAGATAGAAGTGGTAGTCATTTTTCTTCTCGACAGAAACCTGATACAGCAAACACTTC 3087
Query 2874 TCGTGGGAAAAGCAACCCATTGGAAGTGACCACTGAGAAATTAAAGAATAAATCAGCTTC 2933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3088 TCGTGGGAAAAGCAACCCATTGGAAGTGACCACTGAGCAATTAAAGAATAAATCAGCTTC 3147
Query 2934 ACCAGCTGGCACAGATCAGGTTGAAGTCTTGGGTCACGGCACTGAGATATCAAATACAAA 2993
||||||| || || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 3148 ACCAGCT--CA-AG-T----T-GAAGTCTTGGGTCACGACACTGAGATATCAAATACAAA 3198
Query 2994 GAAACAGAGACTGCGGAATGATAATCACAGTGTGACCCACGATGAAGGTTCGCGAAACCA 3053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3199 GAAACAGAGACTGCGGAATGATAATCACAGTGTGACCCACGATGAAGGTTCGCGAAACCA 3258
Query 3054 AAAGCAAAATGGAAGTAGGCATAAGGATCATGTTGGCTTAAGCCCTTTGAAAAAGGAATC 3113
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3259 AAAGCAAAATGGAAGTAGGCATAAGGATCATGTTGGCTTAAGCCCTTTCAAAAAGGAATC 3318
Query 3114 CACGAGTCAGACTGCCTCCAACTCAATCAAAGAGGCTACAGACTTGAAACACATGGCTGA 3173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3319 CACGAGTCAGACTGCCTCCAACTCAATCAAAGAGGCTACAGACTTGAAACACATGGCTGA 3378
Query 3174 TCGTCTTAAGAATGCTGTGTCCAATCACGAGAGCACAGGTGTTTACTTTCAGGCAGCTCT 3233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3379 TCGTCTTAAGAATGCTGTGTCCAATCACGAGAGCACAGGTGTTTACTTTCAGGCAGCGCT 3438
Query 3234 TAAGTTTCTTCATGGTGCCTCCCTTTTGGAGTCATCTGGCATTGATAATGCTACACATAA 3293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3439 TAAGTTTCTTCATGGTGCCTCCCTTTTGGAGTCATCTGGCA---------C--------- 3480
Query 3294 GACCATTGCCAGATCCAAGGATATTTATGGCAGCACAGCAAAACTTTGCGAGTTCTGTGC 3353
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 3481 GACCATTGCCAGATCCAAGGATATTTACGGCAGCACAGCCAAACTTTGCGAGTTCTGTGC 3540
Query 3354 TCATGAATACGAGAAAAATAAAGATATGGGGGCTGCTGCTCTGGCTTATAAATGTATGGA 3413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3541 TCATGAATACGAGAAAAATAAAGATATGGGGGCTGCTGCTCTGGCTTATAAATGTATGGA 3600
Query 3414 AGTAGCTTATCTAAGGATAACTTATACCTCCCATGGTAACATAAGAAGATACAGATATGA 3473
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3601 AGTAGCTTATCTAAGGATAACATATACCTCCCATGGTAACATAAGAAGATGCAGATATGA 3660
Query 3474 GTTGCAAGCAGCTTTGCAAGTGATTCCTTCAGGTGAATCTCCTTCCTTTGCTTCTGATGG 3533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3661 GTTGCAAGCAGCTTTGCAAGTGATTCCTTCAGGTGAATCTCCTTCCTTTGCTTCTGATGG 3720
Query 3534 TGAAAATTCAAACCACACATTGGCAGCGGAAAAGTTTGCTTTGTCCAACAATGTGAGATC 3593
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3721 TGAAAATTCAAACCACACATTAACAGCGGAAAAGTTTGCTTTGTCCAACACTGTGAGATC 3780
Query 3594 ATCCCCTAGCGTAACCGGAAACCATGTTATCTCTTCAGGAAACAATTCCTCTCTTTCACA 3653
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3781 ATCCCCTAGCGTAACCGGAAACCATGTTATCTCTTCAGGAAACAATTCCTCTCTTTCACA 3840
Query 3654 GCTTTTGGCATTTTCGCAAAACGTAAGCT-CTGCTATGGATGCGTCAAGAAAAGCGCAGA 3712
|||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 3841 GCTTTTGGCATTTTCGAAAAACGTAAACTAC-GCTATGGAAGCATCAAGAAAAGCGCAGA 3899
Query 3713 TTGCATTAGCAGCTGCAAAGGGAAAATCGTATGAAACCAGATACAGTAGTGATGGTATAA 3772
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||
Sbjct 3900 TTGCATTAGCAGCTGCAAAGGGAAAATCGTTTGAAACGAGATACAGTAGTAATGGTATAA 3959
Query 3773 CATGCATCAAAAGGGCTCTTGACTTGAATTTTCAGGACATGGAGAAACTGTTGCATGTGG 3832
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3960 CATGCATCAAAAGGGCTCTTGACTTCAATTTTCAGGACATGGAGAAACTGTTGCATGTGG 4019
Query 3833 TGAGGCTTGCAATGGAATCCATAAACCGGTGA 3864
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4020 TGAGGCTTGCAATGGAATCCATAAACCGGTGA 4051
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 192490560291
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5