BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg910885
Length=2463
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G11300.1 | Symbols: | protein serine/threonine kinases;prot... 3941 0.0
> AT1G11300.1 | Symbols: | protein serine/threonine kinases;protein
kinases;ATP binding;sugar binding;kinases;carbohydrate
binding | chr1:3794238-3800719 FORWARD LENGTH=5104
Length=5104
Score = 3941 bits (2134), Expect = 0.0
Identities = 2355/2463 (96%), Gaps = 10/2463 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGACTTCATGAGAGCTTGAGTCCTTTCGTTTATGTTCTTGTACTGTCTTGCTTCCTC 60
||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 152 ATGAGACTTCATGAGAGCTCGAGTCCTTTTGTTTGTATTCTTGTACTGTCTTGCTTCTTC 211
Query 61 TTGAGCTTGTCTCTGGCTCAGGAAAGAGCTTTCTTTTCTGGCAAGCTCAATGATTCCGAG 120
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 212 TTGAGCGTGTCTCTGGCTCAGGAAAGAGCTTTCTTTTCTGGCAAGCTCAATGATTCCGAG 271
Query 121 ACGATAGTCTCCAGCTTTAGCACGTTCAGGTTCGGTTTCTTCAGCCCTGTTAATTCCACT 180
||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 ACGATTGTCTCTAGCTTTCGGACATTCAGGTTCGGTTTCTTCAGCCCTGTTAATTCCACA 331
Query 181 AGTCGATATGCTGGTATATGGTATAACAGTATATCTGTACAAACTGTGATATGGGTTGCC 240
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 332 AGTCGATATGCTGGTATATGGTATAACAGTGTTTCTGTACAAACTGTGATATGGGTTGCT 391
Query 241 AACAAAGATAAACCGACT-AATGACTCCTCTGGAGTTATTTCAGTATCTGAAGATGGAAA 299
||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||
Sbjct 392 AACAAAGATAAGCCGA-TCAATGATTCCTCTGGAGTTATTTCGGTTTCTCAAGATGGAAA 450
Query 300 TCTCGTAGTTACTGATGGTCAGAGGCGTGTTCTATGGTCAACTAACATCTCTACTCAAGC 359
||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 451 TCTTGTAGTTACGGATGGACAGAGGCGTGTTCTATGGTCAACTAACGTCTCTACTCAAGC 510
Query 360 TCA-TGCCAATTCTTCTGTCGCTGAGCTTCTGGATTCGGGGAATCTCGTGCTAAAGGAGG 418
|| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 511 -CAGTGCCAATTCTACTGTCGCTGAGCTTCTTGATTCCGGGAATCTGGTGCTAAAAGAGG 569
Query 419 CGAGTAGTGATGCATATCTTTGGGAGAGCTTCAAGTATCCTACTGATTCTTGGTTGCCAA 478
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570 CGAGTAGTGACGCGTATCTTTGGGAGAGCTTCAAGTATCCTACTGATTCTTGGTTGCCAA 629
Query 479 ATATGTTGGTTGGGACAAACGCAAGAACCGGAGGAGGAAATGTCACAATAACTTCTTGGA 538
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 630 ATATGTTGGTTGGGACAAACGCAAGAATTGGAGGAGGAAACGTCACGATAACTTCTTGGA 689
Query 539 AAAACCCTTCGGATCCTTCGCCCGGGAGCTACACTGCTGCACTCGTTCTTGCTGCATATC 598
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 AATCCCCTTCGGATCCTTCGCCTGGGAGCTACACTGCTGCACTCGTTCTTGCTGCATATC 749
Query 599 CAGAGCTCTTCATTATGAACAATAATAATAATAACAGCACGGTGTGGCGAAGTGGCCCGT 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 CAGAGCTCTTCATTATGAACAATAATAATAATAACAGTACGGTGTGGCGAAGTGGCCCGT 809
Query 659 GGAATGGCCAGATGTTTAATGGTTTACCAGATGTGTATGCAGGCGTTTTTCTTTATAGAT 718
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 810 GGAATGGCCAGATGTTTAATGGTTTACCAGATGTTTATGCGGGTGTTTTTCTTTATAGAT 869
Query 719 TCATAGTTAATGATGACACAAATGGATCTGTCACCATGTCATATGCTAATGATTCAACTT 778
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 870 TCATAGTTAATGATGACACCAATGGATCTGTCACCATGTCATATGCTAATGATTCAACCT 929
Query 779 TGAGATACTTCTACATGGATTATAGAGGATCCGTGATCCGAAGAGATTGGAGTGAGGCTA 838
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 930 TGAGATACTTCTACATGGATTATAGAGGATCTGTGATCCGAAGAGATTGGAGTGAGACTA 989
Query 839 GGAGAAACTGGACTGTCGGGTTACAAGTTCCGGCAACCGAGTGTGACATCTACAGGCGAT 898
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 990 GGAGAAACTGGACGGTCGGGTTACAAGTTCCAGCAACCGAGTGTGACAACTACAGGCGAT 1049
Query 899 GTGGGGAATTCGCTACCTGCAATCCTCGGAAAACCCCGCCTTGTTCTTGCATTAGAGGGT 958
|||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1050 GTGGCGAATTCGCTACTTGCAATCCACGGAAAAACCCGCTTTGTTCTTGCATTAGAGGGT 1109
Query 959 TTAGGCCAAGGAACCTTATAGAGTGGAACAATGGAAACTGGAGTGGTGGATGCACAAGAA 1018
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTAGGCCAAGGAACCTAATAGAGTGGAACAATGGAAACTGGAGTGGTGGATGCACAAGAA 1169
Query 1019 GGGTCCCTTTGCAGTGTGAAAGACAGAACAATAATGGGAGTGCTGATGGGTTTTTGAGGC 1078
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 GGGTTCCTTTGCAGTGTGAAAGACAGAACAATAATGGGAGTGCTGATGGGTTTTTGAGGC 1229
Query 1079 TGCGGCGAATGAAATTGCCTGACTTTGCAAGAAGATCCGAAGCAAGCGAACCAGAATGCT 1138
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 TGCGGCGAATGAAACTGCCTGACTTTGCAAGAAGATCCGAAGCAAGCGAACCAGAATGCT 1289
Query 1139 TAAGGACTTGTTTACAGACATGTTCTTGTATAGCTGCTGCTCATGGCTTAGGATATGGCT 1198
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 TAAGGACTTGTTTGCAGACATGTTCTTGTATAGCTGCTGCTCATGGCTTAGGATATGGCT 1349
Query 1199 GCATGATTTGGAATGGAAGCTTAGTTGATTCGCAGGAGTTGTCTGCTAGTGGATTGGATC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 GCATGATTTGGAATGGAAGCTTAGTTGATTCGCAGGAGTTGTCTGCTAGTGGATTGGATC 1409
Query 1259 TTTATATCCGTCTTGCACAATCAGAAATCAAAACAAAGGACAGGCGACCAATTTTGATTG 1318
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
Sbjct 1410 TTTATATCCGTCTTGCACATTCAGAAATCAAAACAAAGGATAAGCGACCAATTTTGATCG 1469
Query 1319 GTAC-ATCATTGGCAGGCGGTATTTTTGTTGTGGCTGCTTGTGTTCTTCTGGCACGACGG 1377
|||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470 GTACAAT-ATTGGCAGGCGGTATTTTTGTTGTGGCAGCTTGTGTTCTTCTGGCACGACGA 1528
Query 1378 ATTGTCATGAAGAAAAGAGCAAAAAAGAAAGGAAGAGATGCAGAGCAGATTTTTGAGAGA 1437
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 ATTGTCATGAAGAAAAGAGCGAAAAAGAAAGGAAGAGATGCAGAGCAGATTTTTGAGAGA 1588
Query 1438 GTGGAAGCTTTAGCTGGTGGTAATAAAGGAAAGCTGAAAGAGCTACCATTGTTTGAGTTT 1497
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1589 GTGGAAGCCTTAGCTGGTGGTAATAAAGGAAAGTTGAAAGAGCTACCATTGTTTGAGTTT 1648
Query 1498 CAAGTGCTAGCAGCAGCAACTAATAATTTTTCTCTCAGAAATAAGCTTGGACAAGGTGGC 1557
||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1649 CAAGTGCTAGCAGCAGCAACTAATAATTTCTCGCTGAGAAATAAGCTTGGACAAGGTGGC 1708
Query 1558 TTTGGTCCTGTTTACAAAGGGAAGTTGCAAGAGGGGCAAGAGATTGCTGTGAAGAGGCTG 1617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709 TTTGGTCCTGTTTACAAAGGGAAGTTGCAAGAGGGGCAAGAGATTGCTGTGAAGAGGCTG 1768
Query 1618 TCACGAGCATCAGGGCAAGGGCTTGAGGAACTTGTTAATGAAGTGGTTGTGATTTCTAAG 1677
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||
Sbjct 1769 TCACGAGCATCAGGACAAGGGCTTGAGGAGCTTGTTAACGAAGTGGTTGTAATTTCTAAG 1828
Query 1678 TTGCAACATCGGAATCTGGTGAAATTACTTGGTTGTTGCATTGCAGGAGAAGAGAGGATG 1737
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 TTGCAGCATCGGAATCTGGTGAAATTACTTGGTTGTTGCATTGCAGGAGAAGAGAGGATG 1888
Query 1738 TTAGTCTATGAGTTCATGCCCAAGAAAAGCTTAGACTATTATCTCTTTGACTCAAGGAGG 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1889 TTAGTCTATGAGTTCATGCCCAAGAAAAGCTTAGACTATTATCTCTTTGACTCAAGGAGG 1948
Query 1798 GCAAAACTTCTTGATTGGAAGACGCGGTTTAACATAATCAATGGAATATGTAGAGGGCTT 1857
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1949 GCAAAACTTCTTGATTGGAAGACCCGGTTTAACATAATCAATGGAATATGTAGAGGTCTT 2008
Query 1858 CTGTACCTTCACAGAGATTCTAGGCTGAGAATCATTCATAGAGATCTGAAAGCTAGCAAC 1917
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||
Sbjct 2009 CTGTACCTTCACAGAGATTCTAGGCTGAGAATCATTCACAGAGACCTGAAAGCTAGTAAC 2068
Query 1918 ATCTTGTTAGATGAGAATCTGATTCCGAAAATATCTGATTTTGGGTTGGCTCGGA-TTTT 1976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||
Sbjct 2069 ATCTTGTTAGATGAGAATCTGATTCCGAAAATATCTGATTTCGGGTTGGC-CAGAATTTT 2127
Query 1977 CCCAGGGAATGAAGGTGAAGCAAACACCCGAAGGGTCGTTGGAACATACGGTTATATGGC 2036
||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2128 TCCAGGGAATGAAGATGAAGCAAATACCAGAAGGGTCGTTGGAACATATGGCTATATGGC 2187
Query 2037 ACCTGAATATGCAATGGGAGGACTGTTTTCAGAGAAATCTGATGTTTTCAGCTTAGGAGT 2096
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2188 ACCTGAATATGCAATGGGAGGACTGTTTTCAGAGAAATCTGACGTTTTCAGCTTAGGAGT 2247
Query 2097 GATACTCTTAGAGATTATCAGTGGAAGAAGAAACTCAAATTCGACTCTTTTAGCTTATGT 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2248 GATACTCTTAGAGATTATCAGTGGAAGAAGAAACTCAAATTCGACTCTTTTAGCTTATGT 2307
Query 2157 ATGGTCAATCTGGAACGAAGGGGAGATTAATGGTCTGGTAGATCCTGAGATTTTTGACC- 2215
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2308 ATGGTCAATCTGGAACGAAGGGGAGATTAATAGTCTGGTAGATCCTGAGATCTTTGACCT 2367
Query 2216 ACCTCTTTGAGAAAGAAATACACAAATGCATTCACATTGGGCTTTTGTGTGTGCAAGAAG 2275
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 AC-TCTTTGAGAAAGAAATACACAAATGCATTCACATTGGGCTTTTGTGTGTGCAAGAAG 2426
Query 2276 CTGCTAATGATAGGCCGAGTGTTTCTACAGTGTGTTCGATGCTCAGCAGCGAGATTGCAG 2335
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2427 CTGCTAACGATAGGCCAAGTGTTTCTACAGTGTGTTCGATGCTCAGCAGCGAGATTGCAG 2486
Query 2336 ACATTCCAGAACCAAAACAGCCTGCTTTTATATCAAGGAACAATATTCCAGAAGTTGAGT 2395
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
Sbjct 2487 ATATTCCAGAACCAAAACAGCCTGCTTTTATATCAAGGAACAATGTTCCAGAAGCTGAGT 2546
Query 2396 CCGCTGAGAACAGTGACCCTAAAGACTCTATCAACAATGTCACCATCACCGATGTTACAG 2455
|| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2547 CCTCTGAGAACAGTGACCTTAAAGACTCTATCAACAATGTCACCATCACCGATGTTACAG 2606
Query 2456 GAC 2458
|||
Sbjct 2607 GAC 2609
Score = 3206 bits (1736), Expect = 0.0
Identities = 2240/2482 (90%), Gaps = 40/2482 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGAGACTTCATGAGAGCTTGAGTCCT-TTCGTTTATGTTCTTGT-ACTGTCTTGCTTCC 58
||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |||||||||||||
Sbjct 2642 ATGAGACTTCATGAGAGCTTGAGTCCTATT-GTTCATGTTCTT-TCACTGTCTTGCTTCT 2699
Query 59 TCTTGAGCTTGTCTCTGGCTCAGGAAAGAGCTTTCTTTTCTGGCAAGCTCAATGATTCCG 118
| || ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2700 TTTTAAGCGTCTCTCTAGCTCATGAAAGAGCTTTATTTTCTGGCACGCTCAATGATTCCG 2759
Query 119 AGACGATAGTCTCCAGCTTTAGCACGTTCAGGTTCGGTTTCTTCAGCCCTGTTAATTCCA 178
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2760 AGACGATAGTCTCCAGCTTCCGAACGTTCAGGTTCGGTTTCTTCAGCCCTGTTAATTCCA 2819
Query 179 CTAGTCGATATGCTGGTATATGGTATAACAGTATAT-CTGTACAAACTGTGATATGGGTT 237
| | |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820 CCAACCGATATGCTGGTATATGGTATAACAGCAT-TCCTGTACAAACTGTGATATGGGTT 2878
Query 238 GCCAACAAAGATAAACCGACT-AATGACTCCTCTGGAGTTATTTCAGTATCTGAAGATGG 296
|| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 2879 GCTAACAAAGATACGCCGA-TCAATGACTCCTCTGGAGTGATTTCAATATCTGAAGATGG 2937
Query 297 AAATCTCGTAGTTACTGATGGTCAGAGGCGTGTTCTATGGTCAACTAACATCTCTACTCA 356
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||
Sbjct 2938 AAATCTGGTAGTTACTGATGGTCAGAGGCGTGTTTTGTGGTCAACTAACGTTTCTACTCG 2997
Query 357 AGCTCA-TGCCAATTCTTCTGTCGCTGAGCTTCTGGATTCGGGGAATCTCGTGCTAAAGG 415
||| || |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |
Sbjct 2998 AGC-CAGTGCCAATTCTACTGTCGCTGAGCTTTTGGAGTCCGGGAACCTCGTGCTAAAAG 3056
Query 416 AGGCGAGTAGTGATGCATATCTTTGGGAGAGCTTCAAGTATCCTACTGATTCTTGGTTGC 475
| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3057 ATGCCAATACCGATGCATATCTTTGGGAGAGCTTCAAGTATCCTACTGATTCTTGGTTGC 3116
Query 476 CAAATATGTTGGTTGGGACAAACGCAAGAACCGGAGGAGGAAATGTCACAATAACTTCTT 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3117 CAAATATGTTGGTTGGGACAAACGCAAGAACCGGAGGAGGAAACATCACAATAACTTCTT 3176
Query 536 GGAAAAACCCTTCGGATCCTTCGCCCGGGAGCTACACTGCTGCACTCGTTCTTGCTGCAT 595
||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3177 GGACAAACCCTTCGGATCCTTCGCCGGGGAGCTACACTGCTGCACTCGTTCTTGCTCCAT 3236
Query 596 ATCCAGAGCTCTTCATTATGAACAATAATAATAATAACAGC-ACGGTGTGGCGAAGTGGC 654
|||||||||| || ||| | ||||||||| | || || || ||||||||||| ||||||
Sbjct 3237 ATCCAGAGCTTTTTATTTTCAACAATAATGACAACAA-TGCTACGGTGTGGCGCAGTGGC 3295
Query 655 CCGTGGAATGGCCAGATGTTTAATGGTTTACCAGATGTGTATGCAGGCG-TTTTTCTTTA 713
|| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||| | || | | ||||||||
Sbjct 3296 CCTTGGAACGGACTGATGTTTAACGGTTTACCAGATGTATAT-CCGGGGCTCTTTCTTTA 3354
Query 714 TAGATTCATAGTTAATGATGACACAAATGGATCTGTCACCATGTCATATGCTAATGATTC 773
|||||| | ||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3355 TAGATTTAAAGTTAATGATGACACCAATGGTTCAGCCACCATGTCATATGCTAATGATTC 3414
Query 774 AACTTTGAGATACTTCTACATGGATTATAGAGGATCCG-TGATCCGAAGAGATTGGAGTG 832
|||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||
Sbjct 3415 AACTTTGAGACACCTCTACTTGGATTATAGAGGATTTGCT-ATCCGGAGAGATTGGAGTG 3473
Query 833 AGGCTAGGAGAAACTGGACTG-TCGGGTTACAAGTTCCGGCAACCGAGTGTGACATCTAC 891
||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3474 AGGCTAGGAGAAACTGGAC-GTTAGGGTCACAAGTTCCGGCAACCGAGTGTGACATTTAC 3532
Query 892 AGGCGATGTGGGGAATTCGCTACCTGCAATCCTCGGAAAACCCCGCCTTGTTCTTGCATT 951
|| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||
Sbjct 3533 AGCCGATGTGGTCAATACACTACCTGCAATCCTCGGAAAAACCCGCATTGTTCTTGCATT 3592
Query 952 AGAGGGTTTAGGCCAAGGAACCTTATAGAGTGGAACAATGGAAACTGGAGTGGTGGATGC 1011
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3593 AAAGGGTTTAGGCCAAGGAACCTTATAGAGTGGAACAATGGAAACTGGAGTGGTGGATGC 3652
Query 1012 ACAAGAAGGGTCCCTTTGCAGTGTGAAAGACAGAACAATAATGGGAGTGCTGATGGGTTT 1071
| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 3653 ATAAGAAAGCTCCCTTTGCAGTGTGAAAGACAGAACAATAAGGGGAGTGCTGATAGGTTT 3712
Query 1072 TTGAGGCTGCGGCGAATGAAATTGCCTGACTTTGCAAGAAGATCCGAAGCAAGCGAACCA 1131
|||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 3713 TTGAAGCTGCAGCGAATGAAAATGCCTGACTTTGCAAGAAGATCCGAAGCCAGCGAACCA 3772
Query 1132 GAATGCTTAAGGACTTGTTTACAGACATGTTCTTGTATAGCTGCTGCTCATGGCTTAGGA 1191
|||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||
Sbjct 3773 GAATGCTTTATGACTTGTTTGCAGTCATGTTCTTGTATAGCTTTTGCTCATGGATTAGGA 3832
Query 1192 TATGGCTGCATGATTTGGAATGGAAGCTTAGTTGATTCGCAGGAGTTGTCTGCTAGTGGA 1251
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||
Sbjct 3833 TATGGCTGCATGATTTGGAATAGAAGCTTAGTTGATTCACAAGTGTTGTCTGCTAGTGGA 3892
Query 1252 TTGGATCTTTATATCCGTCTTGCACAATCAGAAATCAAAACAAAGGACAGGCGACCAATT 1311
||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||
Sbjct 3893 ATGGATCTTTCTATCCGTCTTGCACATTCAGAATTCAAAACACAGGACAGGCGACCTATT 3952
Query 1312 TTGATTGGTACATCATTGGCAGGCGGTATTTTTGTTGTGGCTG-CTTGTGTTCTTCTGGC 1370
||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||
Sbjct 3953 TTGATCGGTACATCATTGGCAGGAGGCATTTTTGTTGTGGC-GACTTGTGTCCTTCTGGC 4011
Query 1371 ACGACGGATTGTCATGAAGAAAAGAGCAAAAAAGAAAGGAAGAGATGCAGAGCAGATTTT 1430
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 4012 ACGACGTATTGTCATGAAGAAAAGAGCTAAAAAGAAAGGAACAGATGCAGAGCAAATTTT 4071
Query 1431 TGAGAGAGTGGAAGCTTTAGCTGGTGGTAATAAAGGAAAGCTGAAAGAGCTACCATTGTT 1490
| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||
Sbjct 4072 TAAGAGAGTAGAAGCTTTAGCTGGTGGTAGTAGAGAAAAGTTGAAAGAGCTACCTTTGTT 4131
Query 1491 TGAGTTTCAAGTGCTAGC-AGCAGCAACTAATAATTTTTCTCTCAGAAATAAGCTTGGAC 1549
||||||||||||| |||| | | ||||| |||| || ||||| || |||||||| ||||
Sbjct 4132 TGAGTTTCAAGTGTTAGCTA-CTGCAACCGATAACTTCTCTCTTAGCAATAAGCTCGGAC 4190
Query 1550 AAGGTGGCTTTGGTCCTGTTTACAAAGGGAAGTTGCAAGAGGGGCAAGAGATTGCTGTGA 1609
|||| || |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4191 AAGGCGGTTTTGGTCCGGTTTACAAGGGGATGTTGCTAGAAGGTCAAGAGATTGCTGTGA 4250
Query 1610 AGAGGCTGTCACGAGCATCAGGGCAAGGGCTTGAGGAACTTGTTAATGAAGTGGTTGTGA 1669
|||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||
Sbjct 4251 AGAGACTGTCACAAGCATCAGGACAAGGGCTTGAGGAACTTGTCACTGAAGTGGTTGTGA 4310
Query 1670 TTTCTAAGTTGCAACATCGGAATCTGGTGAAATTACTTGGTTGTTGCATTGCAGGAGAAG 1729
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||
Sbjct 4311 TTTCTAAGTTGCAACATCGAAATCTGGTGAAATTATTTGGTTGCTGCATTGCAGGGGAAG 4370
Query 1730 AGAGGATGTTAGTCTATGAGTTCATGCCCAAGAAAAGCTTAGACTATTATCTCTTTGACT 1789
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |
Sbjct 4371 AAAGGATGTTAGTCTATGAGTTCATGCCCAAGAAAAGCTTAGACTTTTATATATTTGA-T 4429
Query 1790 -CAA-GGAGGGCAAAACTTCTTGATTGGAAGACGCGGTTT-AACATAATCAATGGAATAT 1846
||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct 4430 CCAAGGGA-AGCAAAACTTCTTGACTGGAACACGCGGTTTGAA-ATAATCAATGGAATAT 4487
Query 1847 GTAGAGGGCTTCTGTACCTTCACAGAGATTCTAGGCTGAGAATCATTCATAGAGATCTGA 1906
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4488 GTAGAGGTCTCCTGTACCTTCACAGAGATTCTAGGCTGAGAATCATTCACAGAGATCTGA 4547
Query 1907 AAGCTAGCAACATCTTGTTAGATGAGAATCTGATTCCGAAAATATCTGATTTTGGGTTGG 1966
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4548 AAGCAAGCAACATCTTGCTAGATGAGAATCTGATTCCGAAAATATCTGATTTTGGGTTGG 4607
Query 1967 CTC-GGATTTTCCCAGGGAATGAAGGTGAAGCAAACACCCGAAGGGTCGTTGGAACATAC 2025
| | |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4608 C-CAGGATATTCCCGGGGAATGAAGATGAAGCAAACACCAGAAGGGTCGTTGGAACATAT 4666
Query 2026 GGTTATATGGCACCTGAATATGCAATGGGAGGACTGTTTTCAGAGAAATCTGATGTTTTC 2085
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4667 GGCTATATGGCACCTGAATATGCAATGGGAGGACTGTTTTCAGAGAAATCTGATGTTTTC 4726
Query 2086 AGCTTAGGAGTGATACTCTTAGAGATTATCAGTGGAAGAAGAAACTCAAATTCGACTCTT 2145
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 4727 AGCTTAGGAGTGATACTCTTAGAGATTATCAGTGGAAGAAGAAACTCACATTCAACTCTT 4786
Query 2146 TTAGCTTATGTATGGTCAATCTGGAACGAAGGGGAGATTAATGGTCTGGTAGATCCTGAG 2205
|| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4787 TTGGCTCATGTGTGGTCAATCTGGAACGAAGGGGAGATTAATGGTATGGTAGATCCTGAG 4846
Query 2206 ATTTTTGACCACCTCTTTGAGAAAGAAATAC-ACAAATGCATTCACATTGGGCTTTTGTG 2264
||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||
Sbjct 4847 ATTTTTGACCAACTTTTTGAGAAAGAAATACGA-AAATGCGTTCACATTGCGCTTTTGTG 4905
Query 2265 TGTGCAAGAAGCTGCTAATGATAGGCCGAGTGTTTCTACAGTGTGT-TCGATGCTCAGCA 2323
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||
Sbjct 4906 TGTGCAAGACGCTGCTAATGATAGGCCAAGTGTTTCTACAGTGTGTAT-GATGCTTAGCA 4964
Query 2324 GCGAGATTGCAGACATTCCAGAACCAAAACAGCCTGCTTTTATATCAAGGAACAATA-TT 2382
| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | ||
Sbjct 4965 GTGAGGTTGCAGACATTCCAGAACCGAAACAGCCTGCTTTTATGCCTAGAAACGTTGGTT 5024
Query 2383 CCAGAAGTTGAGTCCGCTGAGAACAGTGACCCT-AAAGACTCTATCAACAATGTCACCAT 2441
||||| ||||| | |||||| || || | || |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5025 T-AGAAGCTGAGTTCTCTGAGAGCATTG-CTCTTAAAGCCTCTATCAACAATGTCACCAT 5082
Query 2442 CACCGATGT-TACAGGACGTTA 2462
||| ||||| | ||||||||||
Sbjct 5083 CACTGATGTCT-CAGGACGTTA 5103
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 122206673148
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5