BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg917411
Length=3240
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT5G57110.1 | Symbols: ACA8, AT-ACA8 | autoinhibited Ca2+ -ATPa... 5177 0.0
> AT5G57110.1 | Symbols: ACA8, AT-ACA8 | autoinhibited Ca2+ -ATPase,
isoform 8 | chr5:23109438-23117544 REVERSE LENGTH=3637
Length=3637
Score = 5177 bits (2803), Expect = 0.0
Identities = 3080/3217 (96%), Gaps = 6/3217 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ATGACAAGTCTCTTGAAGCCATCGCCGGGACGACGACGGGGAACCGATTTGGAGTCTGGT 60
||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||
Sbjct 122 ATGACGAGTCTCTTGAAGTCATCGCCTGGACGACGCCGTGGAGGCGATGTGGAGTCTGGG 181
Query 61 AAGACTGATA-ACGCTGACTCCGATAGCGATACTTTCTACATCCCCTCGAAGAATGCTTC 119
|||| ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 182 AAGAGTGA-ACACGCAGACTCTGATAGCGACACTTTCTACATCCCATCGAAGAATGCTTC 240
Query 120 AATTGAGCGGCTTCAACAGTGGAGAAAAGCTGCTCTGGTTCTCAATGCCTCCCGGAGATT 179
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 241 TATTGAGCGGCTTCAACAGTGGAGAAAAGCTGCACTGGTTCTCAATGCGTCCCGGAGATT 300
Query 180 CCGTTACACCTTGGACTTGAAGAAGGAGCAAGAAACGAGGGAAATGCGACAGAAGATCAG 239
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 301 CCGGTACACCTTGGACTTGAAGAAGGAGCAAGAAACGAGGGAAATGAGACAGAAGATCAG 360
Query 240 AAGCCATGCTCATGCTCTCTTGGCTGCGAATCGTTTTATGGATATGGGACGTGAG-CAAG 298
||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 361 AAGTCATGCTCATGCTCTTTTGGCGGCGAATCGTTTTATGGATATGGGACGTGAGTC-AG 419
Query 299 GAGGTGAGAAAACAACAGCGCCTGCAACTCCGGCTGGTGATTTTGGAATTACACCTGAAC 358
||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 420 GAGTTGAAAAAACAACTGGGCCTGCAACTCCGGCTGGTGATTTTGGAATTACTCCTGAAC 479
Query 359 AGCTTGTGATAATGTCAAAGGATCACAACACTGGTTCCCTGGAGCAATATGGAGGGGCTC 418
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||
Sbjct 480 AGCTTGTGATAATGTCAAAGGATCACAACAGTGGTGCCCTGGAGCAATATGGAGGGACTC 539
Query 419 AAGGATTGTCAAATTTGCTCAAGACAAATCCAGAGAAAGGTATCAGTGGAGATGATGATG 478
|||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 540 AAGGATTGGCCAATTTGCTCAAGACAAATCCAGAGAAAGGTATCAGTGGCGATGATGATG 599
Query 479 ACTTGCTAAAGCGCAAGACCGTTTATGGATCAAACACCTATCCTCGCAAGAAAGGCAAAG 538
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 600 ACTTGCTAAAGCGCAAGACCATTTATGGATCAAACACATATCCTCGCAAGAAAGGGAAAG 659
Query 539 GGTTTCTGAGGTTTCTTTGGGATGCTTGCCATGATCTCACCTTGATCATTTTAATGGTTG 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 GGTTTCTGAGGTTTCTTTGGGATGCTTGCCATGATCTCACCTTGATCATTTTAATGGTTG 719
Query 599 CTGCAGTAGCGTCTTTAGCACTTGGGATAAAAACAGAGGGTATCAAAGAAGGATGGTATG 658
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 720 CTGCTGTAGCGTCTTTAGCACTTGGGATAAAAACAGAGGGTATCAAAGAAGGATGGTATG 779
Query 659 ATGGAGGAAGCATTGCATTTGCTGTGATTCTTGTGGTTGTTGTGACAGCTGTCAGTGACT 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 780 ATGGAGGAAGCATTGCATTTGCTGTGATTCTTGTGATTGTTGTGACGGCTGTCAGTGACT 839
Query 719 ACAAACAGTCGCTCCAGTTTCAAAACTTGAATGATGAAAAGAGAAACATACATCTGGAGG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 ACAAACAGTCGCTCCAGTTTCAAAACTTGAATGATGAAAAGAGAAACATACATCTGGAGG 899
Query 779 TGTTAAGAGGTGGAAGACGAGTGGAAATTTCGATCTATGACATAGTGGTGGGTGATGTCA 838
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 TGTTAAGAGGTGGAAGACGAGTGGAGATTTCGATCTATGACATAGTGGTGGGTGATGTCA 959
Query 839 TACCCCTCAACATTGGCAATCAGGTTCCTGCGGATGGAATCCTGATAGCTGGCCACTCTC 898
| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||
Sbjct 960 TTCCTCTCAACATTGGCAATCAGGTTCCTGCTGATGGAGTACTGATATCTGGCCACTCTC 1019
Query 899 TTGCCGTTGATGAGTCTAGCATGACTGGAGAGAGCAAAATAGTTAACAAAGACGCCAACA 958
| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1020 TCGCCCTTGATGAATCTAGCATGACTGGAGAGAGCAAAATTGTTAACAAAGACGCTAACA 1079
Query 959 AGGACCCATTCTTAATGTCTGGCTGTAAAGTGGCAGATGGAAATGGTTCTATGCTGGTTA 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGGACCCATTCTTAATGTCTGGCTGTAAAGTGGCAGATGGAAATGGTTCTATGCTGGTTA 1139
Query 1019 CTGGTGTTGGAGTCAACACTGAATGGGGATTGCTGATGGCCAGTATTTCTGAAGACAATG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 CTGGTGTTGGAGTCAACACTGAATGGGGATTGCTGATGGCCAGTATTTCTGAAGACAATG 1199
Query 1079 GTGAAGAAACTCCATTGCAGGTGCGCTTAAATGGGGTAGCTACTTTTATTGGTTCAATTG 1138
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200 GTGAAGAAACTCCCTTGCAGGTGCGCTTAAATGGGGTAGCTACTTTTATTGGTTCAATTG 1259
Query 1139 GCTTAGCGGTTGCTGCTGCTGTACTAGTGATTCTTCTGACTCGATATTTCACTGGTCACA 1198
|||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 GCTTAGCGGTGGCTGCTGCTGTGCTAGTGATTCTTCTGACTCGATATTTCACTGGTCACA 1319
Query 1199 CTAAAGCCGCTAATGGAGGTCCTCAATTTGTTAAAGGCAAGACAAAAATCGGTCATG-TA 1257
|||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||
Sbjct 1320 CTAAAGACAATAATGGAGGTCCTCAATTCGTTAAAGGCAAGACAAAAGTCGGTCATGTTA 1379
Query 1258 GTTGATGATGTGATCAAAGTCCTTACCGTAGCGGTTACAATTGTCGTAGTGGCAGTGCCT 1317
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380 -TTGATGATGTGGTCAAAGTCCTTACCGTAGCGGTTACAATTGTCGTAGTGGCAGTGCCT 1438
Query 1318 GAGGGTCTTCCATTGGCTGTTACTTTAACCCTTGCCTATTCAATGAGGAAAATGATGGCA 1377
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 GAGGGTCTTCCTTTGGCTGTTACTTTAACCCTTGCCTATTCAATGAGGAAAATGATGGCA 1498
Query 1378 GATAAGGCTTTGGTGAGGAGGCTATCTGCTTGCGAGACAATGGGCTCTGCCACCACTATT 1437
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1499 GATAAGGCTTTGGTGCGGAGGCTATCTGCTTGCGAGACAATGGGCTCTGCCACCACTATT 1558
Query 1438 TGCAGTGATAAAACTGGAACACTAACTTTGAATCAGATGACAGTGGTTGAGTCGTATGCT 1497
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 1559 TGCAGCGATAAAACTGGAACACTAACTCTGAATCAGATGACTGTGGTTGAGTCTTATGCT 1618
Query 1498 GGGGGCaaaaaaaCAGATACTGAACAATTGCCAGCAACTATCACTTCGTTAGTTGTTGAA 1557
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 1619 GGGGGCAAGAAAACAGATACTGAACAATTGCCAGCAACTATCACTTCGCTAGTAGTTGAA 1678
Query 1558 GGAATATCTCAAAACACAACTGGTAGTATTTTTGTCCCAGAGGGCGGCGGTGATTTAGAG 1617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct 1679 GGAATATCTCAAAACACAACTGGTAGTATTTTTGTCCCAGAGGGTGGAGGTGATTTAGAG 1738
Query 1618 TACTCTGGTTCACCAACAGAAAAGGCCATTCTTGGCTGGGGAGTTAAGCTGGGAATGAAT 1677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739 TACTCTGGTTCACCAACAGAAAAGGCCATTCTTGGCTGGGGAGTTAAGCTGGGAATGAAT 1798
Query 1678 TTTGAGACAGCCAGGTCGCAGTCTTCAATCCTTCATGCTTTTCCATTTAACTCAGAGAAG 1737
|| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1799 TTCGAGACAGCCCGATCGCAGTCTTCTATTCTTCATGCTTTTCCATTTAACTCAGAGAAG 1858
Query 1738 AAACGTGGTGGTGTTGCTGTAAAAACGGCTGATGGTGAAGTTCATGTTCACTGGAAAGGA 1797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859 AAACGTGGTGGTGTTGCTGTAAAAACGGCTGATGGTGAAGTTCATGTTCACTGGAAAGGA 1918
Query 1798 GCTTCTGAAATTGTCCTGGCATCATGCAGAAGCTACATCGATGAGGATGGTAATGTGGCA 1857
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GCTTCTGAAATTGTCCTGGCATCATGCCGAAGCTACATCGATGAGGATGGTAATGTGGCA 1978
Query 1858 CCAATGACTGATGACAAGGCATTGTTTTTCAAGAATGGCATTAACGATATGGCTGGAAGA 1917
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1979 CCAATGACTGACGACAAGGCATCGTTTTTCAAGAATGGCATTAATGATATGGCTGGAAGA 2038
Query 1918 ACCTTACGATGTGTTGCACTCGCCTTTAGAACCTATGAGGCTGAAAAGGTCCCAACAGGC 1977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 ACCTTACGATGTGTTGCACTCGCCTTTAGAACCTATGAGGCTGAAAAGGTCCCAACAGGC 2098
Query 1978 GAAGAGCTCTCAAAGTGGGTACTCCCAGAGGATGACCTTATTTTATTAGCTATAGTAGGC 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 2099 GAAGAGCTCTCAAAGTGGGTACTCCCAGAGGATGATCTTATATTATTAGCTATAGTGGGC 2158
Query 2038 ATAAAGGATCCATGTAGACCAGGAGTCAAAGATTCAGTTCAGTTGTGTCAAAATGCTGGT 2097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2159 ATAAAGGATCCATGTAGACCAGGAGTCAAAGATTCAGTTGTGTTGTGTCAAAATGCTGGT 2218
Query 2098 GTCAAGGTTCGTATGGTTACTGGTGACAACGTCCAAACTGCCAGGGCTATTGCCTTGGAA 2157
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 GTCAAGGTCCGTATGGTTACTGGTGACAACGTCCAAACTGCCAGGGCTATTGCCTTGGAA 2278
Query 2158 TGTGGAATATTAACTTCAGATTCAGATCTCTCTGAGCCTACTCTCATTGAAGGAAAATCA 2217
||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2279 TGTGGAATACTAAGTTCAGATGCAGATCTCTCCGAGCCTACTCTCATTGAAGGAAAATCA 2338
Query 2218 TTCCGTGCGATGACTGATGCAGGAAGGGACAAGATTAGTGACAAAATATCAGTTATGGGC 2277
||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 2339 TTCCGTGAGATGACTGATGCAGAAAGGGACAAGATTAGTGACAAAATATCGGTTATGGGC 2398
Query 2278 CGATCATCGCCCAATGACAAACTTCTGCTGGTACAATCTCTGAGACGACAAGGGCATATT 2337
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2399 CGATCATCTCCCAATGACAAACTTCTGCTGGTACAATCTCTGAGACGACAAGGGCATGTT 2458
Query 2338 GTTGCAGTCACCGGGGATGGGACAAATGATGCTCCTGCGTTGCACGAGGCAGATATTGGT 2397
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2459 GTTGCTGTCACCGGGGATGGGACAAATGATGCTCCTGCATTGCACGAGGCAGATATTGGT 2518
Query 2398 CTTGCTATGGGAATAGCAGGAACAGAAGTGGCTAAGGAGAGTTCGGACATCATCATCTTG 2457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2519 CTTGCTATGGGAATAGCAGGAACAGAAGTGGCTAAGGAGAGTTCGGACATCATCATCTTG 2578
Query 2458 GATGACAACTTTGCTTCAGTTGTCAAGGTTGTTCGCTGGGGACGATCAGTGTACGCCAAC 2517
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||
Sbjct 2579 GATGACAACTTTGCTTCAGTTGTCAAGGTTGTTCGATGGGGGCGATCAGTGTATGCCAAC 2638
Query 2518 ATTCAGAAATTCATCCAATTTCAGCTCACAGTCAATGTCGCCGCTCTCATAATTAACGTT 2577
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 2639 ATTCAGAAGTTCATCCAATTTCAGCTCACAGTCAATGTCGCCGCTCTCGTAATTAATGTT 2698
Query 2578 GTAGCTGCTATTTCGAGTGGTGATGTTCCACTTACCGCTGTGCAGCTTCTCTGGGTTAAT 2637
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2699 GTAGCTGCTATTTCGAGTGGTGACGTTCCACTTACCGCTGTGCAGCTTCTCTGGGTTAAT 2758
Query 2638 CTGATAATGGACACTCTTGGAGCATTGGCTTTGGCTACTGAACCACCCACTGATCACCTC 2697
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2759 CTGATAATGGACACTCTTGGAGCATTGGCTTTGGCTACTGAACCACCCACTGATCACCTC 2818
Query 2698 ATGGGGAGGCCTCCAGTTGGCAGAAAAGAACCTCTTATTACCAACATCATGTGGAGAAAC 2757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819 ATGGGGAGGCCTCCAGTTGGCAGAAAAGAACCTCTTATTACCAACATCATGTGGAGAAAC 2878
Query 2758 TTGTTGATCCAGGCTACCTATCAAGTGAGTGTATTGTTAACACTCAATTTCGGAGGCATA 2817
||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2879 TTGCTGATCCAGGCTATTTATCAAGTGAGTGTATTGTTAACACTCAATTTCCGAGGCATA 2938
Query 2818 AGCATACTTGGCCTGGAGCATGAAGAGCATGCACACGCCACCAGAGTGAAGAACACAATA 2877
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2939 AGCATACTTGGCCTGGAGCATGAAGTGCATGAACACGCCACTAGAGTGAAGAACACAATA 2998
Query 2878 ATCTTCAACGCCTTTGTTCTCTGCCAAGCTTTCAATGAGTTCAATGCTCGTAAACCAGAT 2937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2999 ATCTTCAACGCCTTTGTTCTCTGCCAAGCTTTCAATGAGTTCAATGCTCGTAAACCAGAT 3058
Query 2938 GAGAAGAACATCTTCAAAGGTGTGATCAAGAATCGTCTCTTTATGGGAATAGTTGTCATA 2997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 3059 GAGAAGAACATCTTCAAAGGTGTGATCAAGAATCGTCTCTTTATGGGAATAATAGTCATA 3118
Query 2998 ACTCTCGTCCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTCGGTAAATTTGCTTCCACGACGAAA 3057
||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3119 ACTCTTGTGCTCCAGGTTATCATTGTTGAGTTCCTTGGTAAATTCGCTTCCACGACGAAA 3178
Query 3058 CTTGACTGGAAACAATGGCTAATCTGTGTTGGCATCGGTGTTATCAGTTGGCCACTTGCT 3117
|| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 3179 CTAAACTGGAAGCAATGGCTTATCTGTGTTGGCATCGGTGTTATCAGTTGGCCTCTTGCT 3238
Query 3118 TTGGTCGGGAAATTCATTCCGGTGCCAGCAGCTCCTTTAAGCAACAAACTGTCAGCACTG 3177
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||
Sbjct 3239 TTGGTCGGGAAATTCATTCCGGTGCCTGCAGCTCCTATAAGCAACAAATTGAAAGTACTA 3298
Query 3178 AAATGCTGGGGCAAGAAGAAAAAGTCTTCTGGAGAAG 3214
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3299 AAATTCTGGGGCAAGAAGAAAAATTCTTCTGGAGAAG 3335
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 161186387859
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5