BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg918742
Length=7185
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G02080.1 | Symbols: | transcription regulators | chr1:37333... 1.154e+04 0.0
> AT1G02080.1 | Symbols: | transcription regulators | chr1:373335-386847
FORWARD LENGTH=7461
Length=7461
Score = 1.154e+04 bits (6247), Expect = 0.0
Identities = 6872/7178 (96%), Gaps = 25/7178 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 18 CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT 77
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 157 CTCATGACTCCCTCCAAGGTCGCCGGTCATACCCGGTTCTTGCTCCACAGCTTTCATGAT 216
Query 78 TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTGGTTGATTTTGGAGTCGAGACT 137
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 217 TCCGATGTCGACTCCATCGCCCTCCAGCTTTCTCAGTTTGTTGATTTTGGAGTCGAGACT 276
Query 138 AGCATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTCGATTGCTTCACCGTCCGGAGAAGCCATCCTAAT 197
|| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 277 AGTATTCCAGTTCTCAAGACCTGCCTGGATTGCTTCACCGCCCGGAGAAGCCATCCTAAT 336
Query 198 TCGTCGCAGCTTGAGAAGGTTGTATCCTTGGTCTTTAAACATGTGCTCAATTTGTCTAAT 257
|||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 337 TCGTTGCAGCTTGAGAAAGTTGTATCCTTGCTCTTTAAACATGTGCTCAAGTTGTCAAAC 396
Query 258 CTCGCCACCCTGCTTTCTCACGCCCTCAAGGATGTTGAGCTCACTCAAGATTCCGTCCAT 317
|| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||
Sbjct 397 CTTGCCACCCTGCTTCCTCACGCCCTCAATGATTTTGAGCTCACTCAAGAATCCGTGGAT 456
Query 318 GATTTGACTACTTGTTTGAATTTTTCTACCTCTGAGAAAATTGGCTTTGCTCTCGCCCTC 377
|||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 457 GATTTGACTACTACTTTGAATTTTTCAATCTCTGAGAATATTGGCTTTGCTCTCGCCCTG 516
Query 378 ACTGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACGGCTGGACGCAACCTACTATTGGCTGAGATT 437
|| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||
Sbjct 517 ACCGATTTTGAAAGATTAGATGCAAAGACCACTGGACGGAACTTACTGTTGGCTCAGATT 576
Query 438 GAGCAACTCTCTGCCAATACTGGCCAGATTGATTCAACTGAGCAAATTCAGAATGTTCTT 497
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||
Sbjct 577 GAGCAACTCTGTGCCAATACTGGCCAGATTCTTTCATCTGAGCTAATCCATTCTGTTCTT 636
Query 498 TTGTTTCTCCACAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG 557
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 TCGTTTCTCCGCAAATCTGAGGATCTTTCCATGCATTTGGATTCCTTCTTACAGTTTTTG 696
Query 558 TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTTACACCTATGCTTTCTCAACAA 617
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
Sbjct 697 TCTTCTGCTCAACCTAGAGATGACTTCTCTTTTGCTCTAACACCTATGCTTGCTCAACAA 756
Query 618 GTTCATGAAGCTCATGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACATTGATTCTGCTGAAAACGAG 677
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||
Sbjct 757 GTTCATGAAGCTCCTGTTTTCAGGAGCATGGATTTTCACACTGATTCTGCTGATAACGAC 816
Query 678 TTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAATCAGTGTTGGAGATCTCATGGGAGAA 737
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 817 CTTGATGCTATCTTAGCTGAAATCGATAAGGAAGTCAGCGTTGGAGATCTCATGGGAGAA 876
Query 738 TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCTACAATGCAAAGAAATCTTGTCTACTTTTGCT 797
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 877 TTAGGTTGTGGATTCACTGCTGATGCCCAACAATGCAAAGAAATCTTGTCTAGTTTTGCT 936
Query 798 CCATTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTCTTGGCAATGTTTCTCGGACATGTGCTGAT 857
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 937 CCACTAGGAGAGGCTACTATCTCAAGAATTGTTGGCAATGTTTCTCGGACCTGTGCTGAT 996
Query 858 CTTGTAGATAATCACACCACCTTTCCAACATTCACTTTAGCCCTTGGTTGCTGCATCCCT 917
|||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||| ||
Sbjct 997 CTTGAAGATAATCAAACCACCTTTTCAACGTTTACTGTAGCCCTTGGTTCCTGCATTCCA 1056
Query 918 ACTGAACTTCCCACCCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG 977
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1057 ACTGAACTTCCCACGCCAAGGTCGTGGAATGTTGATATTCTAGTTGACACAATCAAGCAG 1116
Query 978 CTT---GCTCCTGGCACAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT 1034
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117 CTTCAGGCTCCTGGCATAAGCTGGAGGAAAGTAATTGAGAATCTCGATCATGACGGATTT 1176
Query 1035 GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGCTCTATAAAGCTGCTTGCAAG 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1177 GACATCCCTAATATGGAGTCTTTCTCATTTTTTATGCGGATCTATAAAGCTGCTTGCAAG 1236
Query 1095 GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGCTTCTGTCTGGAAAAATATGGAAGGTCAAGTA 1154
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||
Sbjct 1237 GAGCCATTTCCTCTTGATGCTGTATGTGGTTCTGTCTGGAAAAATATGGATGGTCAATTA 1296
Query 1155 TCCTTTCTTAAGCATGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA 1214
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1297 TCCTTTCTTAAGCACGCAATATCTGCTCCACCAGAAGTATTCACCTTTATGCATTCTCCA 1356
Query 1215 AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCATGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1357 AGGAAGCTGGTATATATTGATAACATGCACAGCCAAGAGCAACAGTTAGGACTATCCAAT 1416
Query 1275 CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCCTGAATGTGCTTTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT 1334
|||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1417 CATGCATGGCTGTCGCTCGATCTCTTGGATGTACTGTGCCAATTGGCCGAGAGAGGTCAT 1476
Query 1335 GCTGTTTTAGTTAGCTCGTTGCTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT 1394
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 GCTGTTTTAGTTAGTTCGTTACTCCAGTATCCACTCACACAGTGTCCTAGAACCTTGCTT 1536
Query 1395 CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTAGTTTCTGCT 1454
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1537 CTTGGAATGACACACATCAAAACTGCCTATAACCTCATACAGCGTGAAGTGGTTTCTGCT 1596
Query 1455 ATTCTTCCAGTGATAATAACGAATTCCCAGGATAGTGGTTTTATCCTTAATCTCTGGCAT 1514
||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1597 ATTCTGCCAGTGATAATAACGAGTCCCCAGGATAGTGGTTTTATCCATAATCTCTGGCAT 1656
Query 1515 CAGAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTTTAGATGCCCAAAATCTTAAAGCAGACAGC 1574
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||
Sbjct 1657 CAAAATGCAGAACTCGTTCTGTGGGGGATTATAGATGCCCAACATCTCAAAGCAGACAGC 1716
Query 1575 TTGCTCCGAATAATTGAAATCTGTCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA 1634
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 ATGCTCCGAATAATTGAAATCTGCCATGAGCTAAAGATTCTCTCTGTTGTCTTAGAATCA 1776
Query 1635 GTTCCAGTCTCATTCAGTATCAAATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC 1694
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GTTCCAGTCTCATCCAGTATCAGATTGGCAGTCCTTGCCTCATTGAGAGGTCTTTTGGAC 1836
Query 1695 ATTGAGAACTGGTTGCCAAACTGCCTGTATGTGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGT 1754
||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1837 ATTGAGAACTGGTTGCCTAACTGCTTGTATATGTATAAGGATCTCTTTGCTGAGGAGTGC 1896
Query 1755 CTCAAATTTGTCAAGAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTTACTGCCAAAAGTTTT 1814
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||
Sbjct 1897 CTCAAATTTGTCAAAAATGTGCATTTTAGCGAATCAGACGATTTCAGGGCCAAAATTTTT 1956
Query 1815 CATCCTTCAGATCCTTTATCAGATCTTCATCTGGATGCAACAACTTCCCTAATGAAAGTT 1874
|||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||
Sbjct 1957 CATCCTTCTGATCCATTATCAGATCTTCATTTGGAAGCAACAACTTCCCTTTTAAAAGTT 2016
Query 1875 TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTAGTCGAGGAGATTGAAAAGGTC 1934
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct 2017 TTGAAAGCTCATGATAATGCGATTACTTCATCTCAACTGGTCGAGGAGATTGAAAAAGTC 2076
Query 1935 AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAACTGCAGAATGGCGAGGCTAAAGATTCATCA 1994
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2077 AATGCAGCTATTTTGGATTGTAATCCTAAGCTGCAGAATGGTGAGGCTAAAGATTCATCA 2136
Query 1995 GCAT--CAACTGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAAGCAAACGCCTATTTCCATCAAA 2052
|| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||
Sbjct 2137 GC-TCCCAA-TGCATATGGAGATGATGTTGAGGCAGAGGCAAACGCATATTTTCATCAAA 2194
Query 2053 TGTTTTCTAGTCAGTTGAGTGTTGATGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGACT 2112
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 2195 TGTTTTCTAGTCATTTGAGTGTTGACGCAATGGTTCAAATGCTTTCCCGATACAAGGAAT 2254
Query 2113 CTTTGGTTCAAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAAT 2172
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2255 CTTTGGTTCCAAGGGAAAAATTAATTTTTGAATGCATGATTGCTAATCTGTTTGAAGAAT 2314
Query 2173 ATCGGTTTTTCCCCAAGTATCCCGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTT 2232
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2315 ATCGGTTTTTCCCCAAGTATCCTGAGAGACAGCTGAAAATAGCCTCCATACTCTTTGGTT 2374
Query 2233 CTGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCCCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTTGTGT 2292
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2375 CTGTTATAAAACACCAGCTTATAAGTTCGCTCACTCTGGGGATGGCCCTGCGTCTAGTGT 2434
Query 2293 TGGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGG 2352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 TGGATTCTTTGCGTAAACCTGCAGATTCAAAAATGTTTCTGTTTGGAAGCAAAGCTCTGG 2494
Query 2353 AACAGTTCGTGAATCGTCTTGTTGAATTGCCTCAATACTGCAACCATATTTTGCAAATAT 2412
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2495 AACAGTTTGTGAATCGTCTGGTTGAATTGCCTCAATACTGTAACCATATTTTGCAAATAT 2554
Query 2413 CTCATCTGCGTAGCACTCACCCTGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGA 2472
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2555 CTCATCTGCGTAGTACTCACCCGGAGTTAGTCACTGTTATTGAACAAGCACTTTCAAGGA 2614
Query 2473 TATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCGCACCCTGGGCCCTCACAGTCTT 2532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2615 TATCATCTGGTAATTTAGAATCAGATGCCTCTGTTTCACACCCTGGTCCCTCACAATCTT 2674
Query 2533 TCCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAATCTGCATTACAGC-TTCAA 2591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
Sbjct 2675 TCCCTGGAAATGGCGAGTTGAGTGGTTCTGGAATTGGCCAACCTGCATTACAGCTTTCTT 2734
Query 2592 CAGAAAAATGAAGTGCATATTGATGACCGCAGCA--AAGTGCCAAATGTGCCATCTAACG 2649
| | | || || | || | | | ||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2735 C-------TCCCCTACAGCTTCA--ACAGAAAAATGAAGTGCCAAGTGTGCCATCTAACG 2785
Query 2650 AGGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACCACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTA 2709
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2786 AGGCAAAGCCACTTCTGCCATCGTTATCAACTACTTCCGTTGATGTTTCTGTCAATCCTA 2845
Query 2710 AGAATCCTGGCATTTCAACTTCTTCATCAACCTCCGCTGGTTTTGTTCGCCCAGCTCGTG 2769
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2846 AGAATCCTGGCATTCCAACTTCTTCATCAACCTCAACTGGTTTTGTTCGTCCAGCTCGTG 2905
Query 2770 CAGCCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAG 2829
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2906 CAACCACTTCAACAAGGTTTGGCTCGGCTTTGAACATAGAAACCTTGGTTGCAGCAGCAG 2965
Query 2830 AAAGAAGGGAAAACGCAATTGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCTTTCA 2889
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2966 AAAGAAGGGAAAACGCAATCGAGGCTCCACCTTCAGATGTTCAGGACAAAGTTTCGTTCA 3025
Query 2890 TAATTAATAATATCTCTACAGCAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTT 2949
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3026 TAATCAATAATATCTCTACAACAAACATTGAATCTAAAGGGAAAGAGTTTGCTGAAATTT 3085
Query 2950 TGCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCG 3009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3086 TGCCCCAACAGTATTATCCTTGGTTTGCACAGTACATGGTTATGAAAAGAGCGAGCATCG 3145
Query 3010 AGCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGTTGT 3069
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 3146 AGCCGAATTTTCATGATCTGTACCTGAAGTTCTTGGACAAAGTTGATTCCAAGCTGCTGT 3205
Query 3070 TTAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGTTCAGAGCTCA 3129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3206 TTAAGGAGATACTTCAAAATACTTACGAAAATTGCAAGGTTCTTTTGGGCTCAGAGCTCA 3265
Query 3130 TAAAGTCAAGTTCAGAAGAGCGATCTCTGCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAAGT 3189
||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3266 TAAAGTCGAGTTCTGAAGAGCGTTCTCTTCTTAAAAATTTAGGCAGTTGGCTTGGAAGGT 3325
Query 3190 TGACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTG 3249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3326 TGACCATTGGAAGGAATTATGTTTTAAGGGCGCGAGAAATAGATCCAAAATCCTTGATTG 3385
Query 3250 TGGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCGGTCATTCCATTCACTTCAAAGGTTCTGG 3309
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3386 TGGAGGCCTATGAAAAAGGGTTGATGATAGCAGTCATTCCGTTCACTTCAAAGGTTCTGG 3445
Query 3310 AGCCATGCCAAAACAGTATTGCGTATCAGCCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTTG 3369
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 3446 AGCCATGCCAAAACAGTATTGCTTATCAACCTCCCAATCCTTGGACGATGGCTATACTAG 3505
Query 3370 GGTTGCTCGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAG 3429
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3506 GGTTGCTTGCTGAGATCTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAATCTGAAGTTTGACATAG 3565
Query 3430 AGGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAGGTGAAGGAAGTAGCGCCAACTTCCCTTCTAA 3489
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 3566 AGGTTTTATTCAAGAACCTTGGTGTTGAAATGAAGGAAGTAGTGCCAACTTCCCTTCTAA 3625
Query 3490 AGGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGGAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCTTGGAGTAA 3549
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3626 AGGATCGGAAGAGAGAAATAGATGGCAATCCTGATTTTAGTAACAAAGATCCTGGAGTAA 3685
Query 3550 CACAAATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAGCAAA 3609
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3686 CACAGATATCTCAGCCACAGATGATTCCAGAGCCTAAAACAATTTCTCCTCTTAAACAAA 3745
Query 3610 TCGATCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCACCTAATACAGACGTTCCCTCGAAGTTATTAT 3669
| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 3746 TTGACCTACCTCTTGATGTTGCAAATTCGCCTAATACAGATGTTCCCTCGAAGTTATTAT 3805
Query 3670 CACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGACGAGAAAGTGG 3729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
Sbjct 3806 CACAGTATGTAGCCCCACAACGTGTTTATACTAATACTTTGATGGATGAGGAGAAAGTAG 3865
Query 3730 CAACTCTAGGCTTGCCTGAGCAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCAT 3789
||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3866 CAACTCTTGGCTTGCCAGAACAGCTCCCGTCACCTCAAGGACTGTTCCAGTCAACTCCAT 3925
Query 3790 CCCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAACATTGGAAATCATGTTG 3849
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 3926 CGCCATTGTTTTCTATTAGTCAGCTGTCAGCAGCACTTCCCAATATTGGAAATCATGTTG 3985
Query 3850 TTATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAGAGAGTGGTACCAC 3909
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3986 TTATCAATCAGAAATTAAGCGCATTTGGTATGCACTTTCCATTTCAAAGAGTGGTACCAC 4045
Query 3910 TTGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTA 3969
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4046 TTGCCATGGACAGAGCTATCAAGGAGATTGTGTCTGGTATTGTTCAGCGAAGTGTTTGTA 4105
Query 3970 TTGCATGCCAAACAACAAAAGAGCTTGTGCTAAAGGATTATGCCCTGGAACCCGATGAGT 4029
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4106 TTGCATGCCAAACAACAAAGGAGCTTGTGCTAAAGGATTACGCCCTGGAACCCGATGAGT 4165
Query 4030 CACGTATTTATAATGCCGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATG 4089
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4166 CACGTATTTATAATGCAGCTCACTTGATGGTTGCGAGTTTAGCTGGGAGTTTGGCTCATG 4225
Query 4090 TGACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTCCAGG 4149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 4226 TGACTTGCAAGGAACCCCTGCGCACTTCAATATCCGGTCATCTACGGAATTCGCTTCAGG 4285
Query 4150 GTCTGAATATTTCAAATGACGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACAAATGACAACC 4209
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4286 GTCTGAATATTTCAAATGATGCTCTTGAACAAATTGTGCAACTTGTCACCAATGACAACC 4345
Query 4210 TTGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCGGCTACAGAGAAGGCAATACAAACAATTG 4269
| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4346 TGGATTTGGGTTGTGCTGCTATTGAACAGGCTGCTACAGAAAAGGCAATACAAACAATTG 4405
Query 4270 ATGCGGACATTGCACAGCAATTGTTGTTACGCAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCT 4329
||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4406 ATGCGGACATTGCTCAACAATTGTTGTTACGGAGAAAGCATAGAGATGGTGCTGGATCCT 4465
Query 4330 CCTTTTTTGATCCAAACATTCTAGGACAAAATTCCGTCAGTTTTATACCTGAATCCCTCC 4389
||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4466 CCTTTTTCGATCCAAACATTCTATCACAGAATTCCGTCAGTTTTATACCCGAATCCCTCC 4525
Query 4390 GTCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGCGAGTTTATGAGGATTTTGTTCAAC 4449
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4526 GTCCAAAACCTGGACACCTCTCCCTGTCTCAGCAGAGAGTTTATGAGGACTTTGTTCAAC 4585
Query 4450 ATCCTTGGCAGAAGCAGTCGACCCAAACGTCACACGGTTTATCTACTGCATCAAGCTCAT 4509
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4586 ATCCTTGGCAAAAGCAGTCGACCCAAACTTCACACGGTTTATCTGCTGCATCAAGCTCAT 4645
Query 4510 CTGGCGATGTTGCGCTTGGTAGTGGGTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCGTCTGAAT 4569
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 4646 CTGGTGATGTTGCGCTTGGTAGTGGTTATGGTCCAGTATCAGGAAAAGTTGCTTCTGAAT 4705
Query 4570 TTTTGTCTAGTGCTGGAAACACTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCAACAGATATTTCTG 4629
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 4706 TTTTGTCTAATGCTGGAAACGCTCGGATGGACATGGTCTCCCGGCCATCAGATATTTCTG 4765
Query 4630 TGGATGGTTTTGAATCTTCCCCAGTCTCACTTTTAAGCTCACAAGTTGATCCAGCTGGTG 4689
||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 4766 TGGATGGTTTTGAATCTTCTCCAGTCTCACTTTTGAGCTCACAAGTCGATCCAGCTGGTG 4825
Query 4690 ACTCATCCAGTCTTCAATTTTCTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAAT 4749
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4826 ACTCATCCAGTCTTCAATTTACTAAGTCACTACCAACCTCTGAATTGAATCTGGCTGAAT 4885
Query 4750 CCTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTT---CTGCTA 4806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4886 CCTCTGACGCTGCTACGAAAGAAACTGGAACATCACTGCAGACATTGACTTCAGCTGCTA 4945
Query 4807 CCATGGAACGACTTGGTGGAAATAATATTATACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCAC 4866
|||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4946 CCATGGAACGACTTGGTGCTAGTAATATTACACAGCCTTCACTGTCCACGAGAGATGCAC 5005
Query 4867 TGGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAG 4926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5006 TGGATAAATGTCAAATTGTTACTCAGAAGATGGAGGAATTAGTGGCTAATAATGCAGGAG 5065
Query 4927 ATGACGAAATCCAGGCCGTAGTTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCA 4986
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5066 ATGATGAAATCCAGGCCGTAATTTCTGAAGTTCCTGAAATCATCCTCAGATGTATAAGCA 5125
Query 4987 GAGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCCCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTATGAGAATGCAT 5046
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5126 GAGATGAAGCCGCTTTTGCTGTCGCTCAAAAAGCTTTCAAGGCTCTTTACGAGAATGCAT 5185
Query 5047 CAAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATTCGTGATGTTTGCA 5106
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 5186 CAAGTAACCTTCACGTCAGTGCTAACCTAGCAATACTTGTTGCTATCCGTGATGTTTGCA 5245
Query 5107 AGCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTTATTTATTCAGAGGAGGAGCGGAAGCTCA 5166
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 5246 AGCGTGTTGTTAAAGAGCTCACTAGTTGGGTGATTTATTCAGAGGAGGATCGGAAGCTCA 5305
Query 5167 ACAAAGATATTACTATTGGTCTAATCCAACGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATG 5226
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5306 ACAAAGATATTACTATTGGTCTTATCCAGCGTGAGTTGCTTAGCCTAGCGGAGTACAATG 5365
Query 5227 TCCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGAGCGCAACTGACTTTGCTATTT 5286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 5366 TCCACATGGCGAAGCATCTTGATGGAGGGAGAAACAAGACCGCAACTGACTTTGCTATTT 5425
Query 5287 CTCTACTCCAATCTTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTG 5346
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5426 CTCTACTCCAATCCTTGGTCACTGAGGAGTCGAGTGTCATTTCAGAGCTCCACAGTCTTG 5485
Query 5347 TTGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCGCCTGAGTCATTGCAACAGCTAA 5406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 5486 TTGATGCGCTGGCAAAGCTTGCCTCAAAATCCGGATCTTCTGAGTCATTGCAACAGCTAA 5545
Query 5407 TTGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAA 5466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5546 TTGACATCATACGAAATCCAGTTACTAACACAGCTGGCCTCTCTGATAGTTCAACCGGAA 5605
Query 5467 ATGACAACAATGATAGGCAAAAGGATGAAAAGGTTGCGTGCAATATCACCACTAACACAG 5526
|||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||
Sbjct 5606 ATGATAACAACGATAGGCAAAAGGATGAGAAGGTTGCGTGC-A-A-CACCACTAACACAG 5662
Query 5527 AAGAGAATACCAGCTTGGATTATGTGGAATTAGATCCTGCGGTTTTCCAGAATCGGGTGT 5586
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5663 AAGAGAGTACCAGCTTGGATTATGTGGAATCAGATCCTGCGGGTTTCCAGAATCGGGTGT 5722
Query 5587 CCACGCTTTTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCTT 5646
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5723 CCACGCTATTTAAAAACTGGTATCAAATCTGCGAACTTCCTGGTGCAAATGAAACCGCAT 5782
Query 5647 GTTCACAATACGTCTTGCATTTGCATCAGACTGGACTACTTAAGGGAGATGATACAACAG 5706
|||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5783 GTTCACAATATGTCCTGCATTTGCACCAGACTGGATTACTTAAGGGAGATGATACAACAG 5842
Query 5707 AGAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATA 5766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5843 AGAGTTTTTTCCGAATTCTTCTGGAACTTTCTGTTGCTCATTGTATATCTTCTGAAGATA 5902
Query 5767 TTAATTCTGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTG 5826
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5903 TTAATTCCGGTGCTGTGCAATCTCCTCAGCAACCTCAGAGTCCATCATTCCTTATCATTG 5962
Query 5827 ATATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCA 5886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5963 ATATGTATGCAAAGCTTGTTTTTTCAATATTGAAGTATTTCCCTGAGCAGGAGTCTAGCA 6022
Query 5887 GCAAGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGCCACAGTGAGATTTATTCACAAGGACG 5946
| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6023 GTAGGTTATTTCTTCTTTCAGAGATCATGGCTGACACAGTGAGATTTATTCAAAAGGACG 6082
Query 5947 CAGAAGATAAAAAGACATCACTCAATCCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGC 6006
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6083 CAGAAGATAAAAAGACATCACTCAATTCTAAACCATATTTCCGATTGTTCATCAACTGGC 6142
Query 6007 TACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAG 6066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6143 TACTGGACTTGTGTTCCCTGGATCCTGGGACGGATGGTGCAAACTTTCAGGTTCTCACAG 6202
Query 6067 CTTTTGCCAACGCCTTCCACGCGTTGCAGCCTCTTAAGATACCTGCTTTCAGCTTTGCAT 6126
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||
Sbjct 6203 CTTTTGCCAACGCCTTCCACGCATTGCAGCCTCTTAAGATTCCTGCTTTCAGTTTTGCAT 6262
Query 6127 GGCTAGAGCTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGA 6186
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6263 GGCTAGAACTTGTCAGCCACAGAAGCTTCATGCCCAAACTACTTACAGTAAATGGCCAGA 6322
Query 6187 AGGGTTGGCCATATGTTCAACGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTT 6246
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6323 AGGGTTGGCCATATGTTCAGCGCCTGCTGGTGGACTTGCTTCAGTTTCTTGAGCCATTTT 6382
Query 6247 TAAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCAGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTGT 6306
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 6383 TAAGAAATGCTGAACTCGGAGGACCGGTTCATTTCCTATACAAAGGGACATTGAGAGTAT 6442
Query 6307 TACTGGTGCTGCTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTG 6366
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6443 TACTGGTTCTGCTTCATGATTTCCCAGAGTTCCTATGTGATTATCATTTTACTTTCTGTG 6502
Query 6367 ATGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCGCGGA 6426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6503 ATGTGATTCCTTCAAGTTGCATACAAATGCGGAATATTATCCTCAGTTCTTTTCCACGGA 6562
Query 6427 ACATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTGCCTGAGATAG 6486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 6563 ACATGAGGCTTCCTGATCCTTCTACCCCAAATTTAAAGATTGATTTGTTACCTGAGATAG 6622
Query 6487 TAGAAGCTCCCTGTATCCTTTCCGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGA 6546
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6623 TAGAAGCTCCCTGTATCCTTTCTGAGGTTGATGCTGCGCTAAAGGCAAAGCAAATGAAGA 6682
Query 6547 ATGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGA 6606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6683 ATGACGTGGATGAGTATCTTACGTCGAGGCAGCAAAATTCAACTTTCCTAAGTGAGTTGA 6742
Query 6607 AGACAAAGTTACTTCTGTCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTAC 6666
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6743 AGACAAAGTTACTTCTATCGTCCAGCGAGGCTAGTTCAGCTGGAACCCGTTACAGTGTAC 6802
Query 6667 CATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCG 6726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6803 CATTGATCAACTCGCTTGTGCTATATACTGGAATGCAGGCTATTCAGCAGCTTCAGGCCG 6862
Query 6727 GTGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAAC 6786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6863 GTGAGACACAGGCTCAAAATGTTGTGGCCTTGCAGATGTTCAAGTATTTAAGTATGGAAC 6922
Query 6787 TTGATACTGAAGGGCGGTACCTGTTCCTAAATGCAATAGCCAATCAGCTTCGATATCCCA 6846
||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||
Sbjct 6923 TTGATACGGAAGGGCGGTATCTGTTCCTTAATGCAATCGCCAATCAGCTTCGATACCCCA 6982
Query 6847 ACAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTGTTCTTCGAATCTGACCAGG 6906
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 6983 ACAACCACACTCATTACTTTTCTTTCATCATGCTCTATCTATTCTTCGAATCTGATCAGG 7042
Query 6907 AGATCATACAGGAGCAAATAACAAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCAC 6966
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 7043 AGATCATACAGGAGCAAATAACTAGAGTGCTGTTGGAACGGCTAATTGTGAACAGGCCAC 7102
Query 6967 ATCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATGGCTTCT 7026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 7103 ATCCATGGGGACTTCTAATCACATTCATTGAGCTAATAAAGAACCCAAGATATAGCTTCT 7162
Query 7027 GGAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTCTTTGAATCGGTAGCCA 7086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 7163 GGAAACAAGCCTTCATCAGATGTGCGCCTGAGATTGAGAAGCTGTTTGAATCGGTAGCCA 7222
Query 7087 GATCCTGTGGTGGCCTTAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTCTCGGGAGGTTGGGTCTCAG 7146
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 7223 GATCCTGTGGTGGCCTGAAGCCTGTCGACGAGGGAATGGTTTCGGGAGGTTGGGTCTCAG 7282
Query 7147 ACAATTCTCATTAGCTCTCTAGCTTTCAACTTGTATAT 7184
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 7283 ACAATTCTCACTAGCTCTTTAGCTTTCAACTTGTATAT 7320
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 358804321537
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5