BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg919570
Length=6768
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G08260.1 | Symbols: EMB142, EMB2284, POL2A, TIL1, EMB529, AB... 4205 0.0
AT2G27120.1 | Symbols: POL2B, TIL2 | DNA polymerase epsilon cat... 2556 0.0
AT1G08270.2 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MIT (Inte... 339 3e-91
> AT1G08260.1 | Symbols: EMB142, EMB2284, POL2A, TIL1, EMB529,
ABO4, ESD7 | DNA polymerase epsilon catalytic subunit | chr1:2590944-2606892
FORWARD LENGTH=6486
Length=6486
Score = 4205 bits (2277), Expect = 0.0
Identities = 2478/2574 (96%), Gaps = 17/2574 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 3039 AATCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAACTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACA 3098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2968 AATCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAACTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACA 3027
Query 3099 ATGAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTGAGCAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAA 3158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3028 ATGAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTGAGCAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAA 3087
Query 3159 CGCCTGGCTGAATTTCTTGGTGTTACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGTTGCCAGTAC 3218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 3088 CGCCTGGCTGAATTTCTTGGTGTTACAATGGTCAAAGATAAAGGACTACGTTGCCAGTAC 3147
Query 3219 ATTGTTGCTTGTGAACCAAAGGGTACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTTCCTGTTGCCATA 3278
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3148 ATTGTTGCTTGTGAACCAAAGGGTACACCGGTAAGCGAACGTGCTGTTCCTGTTGCCATA 3207
Query 3279 TTTACAACGAATCCAGAAGTTATGAAGTTTCATCTT-CGAAAATGGTGCAAGACATCATC 3337
|||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3208 TTTACAACAAATCCGGAAGTTATGAAGTTTCAT-TTGCGAAAATGGTGCAAGACATCATC 3266
Query 3338 AGATGTCGGAATTCGTCTAATTATTGACTGGTCGTATTACAAGCAGCGCCTTAGTTCAGC 3397
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3267 AGATGTCGGAATTCGTCTGATTATTGACTGGTCGTATTACAAGCAGCGCCTTAGTTCAGC 3326
Query 3398 TATCCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTGGCAAATCCCGTGTCTAG 3457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 3327 TATCCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTGGCAAATCCCGTGCCTAG 3386
Query 3458 GGTGCTTCATCCTGACTGGCTCCATAAAAAGGTTCGTGAGAAAGACGACAAATTTCGCCA 3517
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3387 GGTGCTTCATCCTGACTGGCTCCATAAAAAGGTCCGTGAGAAAGACGACAAATTTCGCCA 3446
Query 3518 GAGAAAACTAGTTGATATGTTCAGCTCAGCAAATAAAGATGGTGTGTTGGAAACAGATCA 3577
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||
Sbjct 3447 GAGAAAACTAGTTGATATGTTCAGCTCAGCAAATAAAGATGTTGTGTTGGACACAGATCT 3506
Query 3578 TCCGGTGACTAAAGATAATGTGGAAGATATTGAGGATTTTTGCAAAGAAAACAAGCCTTC 3637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||
Sbjct 3507 TCCGGTGACTAAAGATAATGTGGAAGATATTGAGGATTTTTGCAAAGAAAATAGGCCTTC 3566
Query 3638 CGTGAAAGGGCCAAAACCAATTGCGCGATCTTATGAAGTCAAGAAAAAACAGTCTGAACG 3697
||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |
Sbjct 3567 CGTCAAAGGGCCAAAGCCAATTGCGCGTTCCTATGAAGTCAATAAAAAACAGTCTGAATG 3626
Query 3698 TGAGCAGCAAGAGAGCTGGGATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAACATTGACAA 3757
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TGAGCAGCAAGAGAGCTGGGATACAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAACATTGACAA 3686
Query 3758 GAGCGTAAACTACCAAGGATGGCTTGAACTgaaaaagagaaaatggaaagtaactctaga 3817
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3687 GAGCGTAAACTACCAAGGATGGCTTGAACTGAAAAAGAGAAAATGGAAAGTAACTCTAGA 3746
Query 3818 aaagaagaaaagacgaagGTTGGGTGATCTAAGATCTCCAAACCAGATTGATGCTCACGA 3877
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||
Sbjct 3747 GAAGAAGAAAAAACGAAGGTTGGGTGATCTAAGATCTTCAAACCAGGTTGATACTCACGA 3806
Query 3878 GATAAATCAAAAAGTTGGTCAGGGAAGAGGTGGTGTGGGTTCATACTTTAGGAGGCCTGA 3937
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3807 GATAAATCAAAAAGTCGGTCAGGGAAGAGGAGGTGTGGGTTCATACTTTAGGAGGCCTGA 3866
Query 3938 AGAAGCTTTGACTAGTTCACATTGGCAGGTGTGCACAATAATACAGCTGGTTCCAAGTCC 3997
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3867 AGAAGCTTTGACTAGTTCACATTGGCA-----G----ATAATACAGCTGGTCCCAAGTCC 3917
Query 3998 ACAGAGCGGACAATTTTTTGCTTGGGTGGTTGTGGAAGGGTTGATGCTTAAGATCCCATT 4057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3918 ACAGAGCGGACAATTTTTTGCTTGGGTGGTTGTGGAAGGGTTGATGCTTAAGATCCCATT 3977
Query 4058 GACGATCTCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGTTCCTATAGCTGAATATTTCCAAGG 4117
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 3978 GTCGATCCCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGTTCCTATAGATGAATATTTCCAAGG 4037
Query 4118 AAAGTGTGTCAACAAGATTCTTCCCCATGGAAGGCCTTGTTATACTTTGACTGAGGTCAA 4177
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4038 AAAGTGTGTCAACAAGATTCTTCCTCATGGAAGGCCTTGTTATAGTTTGACTGAGGTCAA 4097
Query 4178 GATTCAAGAAGATAAATTTAAAAAGGAAAGTAAAAAGCGTGCAGCTCTTCTTGCAGACCC 4237
||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4098 GATTCAAGAAGATCAATTTAAAAAAGAAAGTAAAAAGCGTGCAGCTCTTCTTGCAGACCC 4157
Query 4238 CAGAGTTGAGGGCATATATGAAACTAAGGTGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGAT 4297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4158 TGGAGTTGAGGGCATATATGAAACTAAGGTGCCTCTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGAT 4217
Query 4298 TGGATGTGTATGCAAAGTTGATAACAAAGCCAAGCACCGTAACACCCAAAATGGATGGGA 4357
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4218 TGGATGTGTATGCAAAATTGATAACAAAGCCAAGCACCGTAACACCCAAGATGGATGGGA 4277
Query 4358 AGTTGGTGAACTTCACATGAAAACTACTACTGAGTGTCATTACTTGGAGCGTTCAATTCC 4417
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||
Sbjct 4278 AGTTGGTGAACTTCACATGAAAACTACAACTGAGTGTCACTACTTGAAGCGTTCAATTCC 4337
Query 4418 ACTTCTTTTCTTGTATAACAGTACCTCAACAGGGCGTGCTATATATGTTTTATTTTGTCA 4477
|||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 4338 ACTTGTTTACTTGTATAACAGCACCTCAACAGGGCGTGCTATATATGTTTTATATTGTCA 4397
Query 4478 TGCATCGAAGCTTATGTCTGCCGTGGTAGTTGATCCTTTTAACAGCAATGAATTATTACC 4537
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 4398 TGTATCGAAGCTTATGTCTGCCGTTGTAGTTGATCCTTTTAACGGCAATGAATTATTACC 4457
Query 4538 ATCTGCCCTAGAGAGACAGTTAAGAGATAGTTGCCAAGAATTGTCACTTG----A--GTC 4591
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | |||
Sbjct 4458 ATCTGCCTTAGAGAGACAGTTTAGAGATAGTTGCCTAGAATTATCACTTGATTCATTGTC 4517
Query 4592 TTGGGATGGTATCCGTTTCCAGGTGCGCTATGTTGACCATCCCGAAGCTGCCAAGAAGAT 4651
|||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4518 TTGGGATGGTATCCGTTTCCAGGTGCACTACGTTGACCATCCCGAAGCTGCCAAGAAGAT 4577
Query 4652 TATACAAATAGCAATAAGTGAATACAGAGAGGAAAATTGTGGACCAACTGTTGCTGTCAT 4711
||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4578 AATACAAAGAGCAATAAGTGAATACAGAGAAGAAAATTGTGGACCAACTGTTGCTGTCAT 4637
Query 4712 CGAATGCCCTGTCTTTAACTCCATGAAGGAAGGTATCAAGGCCCTGGATGATTTCCCATG 4771
|||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4638 TGAATGCCCTGACTTTACCTTCATGAAGGAAGGTATTAAGGCCCTAGATGATTTCCCATG 4697
Query 4772 TGTGAGGATTCCTTTCAACGGCGATGATAACAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCC 4831
|||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4698 TGTGAGGATTCCCTTCAACGACGATGACAATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCC 4757
Query 4832 AGCAGCAAAAATAGCAATGTTCCGTTGTGCTGCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGAT 4891
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4758 AGCTGCAAAAATAGCAATGTTCCGTTGTGCTGCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGAT 4817
Query 4892 TGCCCACTCAAGATACGCCCATGTGCCTCTGGGGAATTTTGGACTTGATTGGCTAACATT 4951
| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4818 TACCCAATCAAGATACGCCCATGTGCCTCTGGGGAATTTTGGACTTGATTGGCTAACATT 4877
Query 4952 CACAATAGATATCTTCCTATCCAGGGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTCCTCTGGGTGTC 5011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4878 CACAATAGATATCTTCCTATCCAGGGCACTCCGTGACCAGCAACAGGTCCTTTGGGTGTC 4937
Query 5012 AGATAATGGTGTTCCAGACCTTGGAGGTATAAACAACGAAGAGGCATTCTTTGCTGATGA 5071
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4938 AGATAATGGTGTTCCAGACCTTGGAGGTATAAACAATGAAGAGGCATTCTTTGCCGATGA 4997
Query 5072 GGTGCAACAGACAAGTTTAGTATTCCCTGGAGCGTATAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAA 5131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4998 GGTGCAACAGACAAGTTTAGTATTCCCTGGAGCGTATAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAA 5057
Query 5132 GATCCATAACTTGGCTGTTAATGCCCTTCTGAAAAGCAACCTGGTGAATGAAATGGAAAG 5191
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5058 GATCCATAACTTGGCTGTTAATGCCCTTCTGAAAAGCAACCTGGTGAATGAAATGGAAGG 5117
Query 5192 AGGCGGTTTTTTGGGATTTGAACAGGATGTGAATCCTAGAGGAATTAATTCAAACGATAA 5251
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5118 AGGCGGTTTTATGGGATTTGAACAGGATGTGAATCCTAGAGGAATTAATTCAAACGATAA 5177
Query 5252 CACCAGTTTTGATGAGACCACTGGATGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAGTTGAT 5311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5178 CACCAGTTTTGATGAGACCACTGGATGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAGTTGAT 5237
Query 5312 TCATAGTTGCTTGACTGATGTGCGTAAATCTGAAAATATATATGCTGATTCCATTTTGCA 5371
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5238 TCATAGTTGCTTGACTGATGTGCGTAAATCTAAAAATATATATGCTGATTCCATTTTGCA 5297
Query 5372 ACGTTTGTCTTGGTGGCTCTGCAGCCCTTCCTCGAAGCTCCATGATCCAGCTCTTCATCT 5431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5298 ACGTTTGTCTTGGTGGCTCTGCAGCCCTTCCTCGAAGCTCCATGATCCAGCTCTTCATCT 5357
Query 5432 CATGCTTCACAAGGTCATGCAAAAAGTGTTTGCACTGCTATTGACTGATTTGCGGAGATT 5491
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5358 CATGCTTCACAAGGTCATGCAAAAGGTGTTTGCACTGCTATTGACTGATTTGCGGAGATT 5417
Query 5492 AGGTGCTATAATAATATATGCAGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGTGAAATTTGA 5551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5418 AGGTGCTATAATAATATATGCAGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGTGAAATTTGA 5477
Query 5552 TCTATCTGCAGCTAAGGCTTATTGTGAAAGCTTGCTATCAACGGTGGGGAATAG 5605
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 5478 TCTATCTGCAGCTAAGGCTTATTGTGAAAGCTTGCTATCAACGGTGCGGAATAG 5531
Score = 2505 bits (1356), Expect = 0.0
Identities = 1526/1602 (95%), Gaps = 36/1602 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 ATGAGCGGAGACAATCGAAGACGGGATCGAAAGGATACGCGGTGGTCGAAGAAGCCTAAG 80
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCGGAGATAATCGAAGACGGGATCGAAAGGATACGCGGTGGTCGAAGAAGCCTAAG 60
Query 81 GTAGTGAACACTGCGGAAGATGAACTCGAATCTAAACTCGGATATGGGCTTTTCTCTGAA 140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 61 GTAGTGAACACTGCGGAAGATGAACTCGAATCTAAACTCGGATTTGGGCTTTTCTCTGAA 120
Query 141 GGTGAAACCCGACTTGGCTGGTTACTCACATTCTCATCCTCATCTTGGGAAGATCGCGAT 200
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GGTGAAACCCGACTTGGGTGGTTACTCACATTCTCATCGTCATCTTGGGAAGATCGCGAT 180
Query 201 ACTGGGAAAGTCTATAGTTGTGTGGACCTTTACTTTGTTACTCAGGACGGGTTTTCTTTC 260
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 181 ACTGGGAAAGTCTATAGTTGTGTGGACCTTTACTTTGTTACTCAGGACGGCTTTTCTTTC 240
Query 261 AAGACAAAGTACAAGTTCCACCCATACTTCTATGCAGCCACGAAAGACAAAATGGAATTG 320
||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 241 AAGACAAAGTACAAGTTCCGTCCTTACTTTTATGCAGCCACGAAAGACAAAATGGAATTG 300
Query 321 GAAGTCGAAGCCTATTTGAGACGCCGATATGAAAGACAAGTCGCTGATATTGAGATTGTT 380
||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 301 GAACTCGAAGCCTACTTGAGACGCCGATATGAAAGACAAGTTGCTGATATTGAGATTGTT 360
Query 381 GAAAAAGAGGATCTTGATCTTAAAAATCATCTATCCGGCCTGCAAAAGAAATACCTAAAA 440
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 361 GAAAAAGAAGATCTTGATCTTAAAAATCATCTATCTGGCCTGCAAAAAAAATACCTAAAA 420
Query 441 ATATCATTTGATACTGTGCAACAATTGATGGAAGTCAAGAGGGATCTGCTGCATATCGTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||| ||
Sbjct 421 ATATCATTTGATACTGTGCAACAATTGATGGAAGTCAAGCGGGATTTGTTACATATTGTC 480
Query 501 GAACGAAACCAGGCAAAATTTGATGCACTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAA 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 481 GAACGAAACCAGGCAAAATTTGATGCACTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAA 540
Query 561 CGAGAACAACGTCCTCAAGATTGCTTAGACTCTATCGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTT 620
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CGAGAACAACGTCCTCAAGATTGCTTAGACTCTATCGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTA 600
Query 621 CCTTATCATGTTCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGGAGTGGGCAATGGTACAATGTC 680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 601 CCTTATCATGTTCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGGAGTGGGCAATGGTACAATGTC 660
Query 681 AGCATTTCCAGCACCGATGTCATACTGGAGAAGAGGACAGATCTTCTTCAACGCGCAGAA 740
|| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 AGTATTTCCAGCACCGATGTCATATTGGAGAAGAGGACAGATCTTCTTCAACGCGCAGAA 720
Query 741 GTCCGTGTTTGTGCCTTCGATATAGAGACAACAAAGCTTCCGTTAAAGTTTCCGGATGCT 800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 721 GTCCGTGTTTGTGCCTTCGATATAGAGACAACAAAGCTTCCGTTGAAGTTTCCTGATGCT 780
Query 801 GAATATGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTCGATGGGCAAGGTTTTCTAATTATT 860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 GAATATGATCAAATTATGATGATATCCTACATGGTCGATGGGCAAGGTTTTCTAATTATT 840
Query 861 AACAGAGAGGTAACTGCTTGTGTTGGCGAAGATGTAGAAGATCTGGAATATACACCCAAA 920
||||||||| | | | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 841 AACAGAGAG-T----G-T-GT-T-GGCGAAGATGTAGAAGATCTGGAATATACACCAAAA 891
Query 921 CCAGAATTTGAAGGGTATTTCAAAGTTACTAATGTTAAAAATGAGGTTGAACTCCTCCAA 980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 CCAGAATTTGAAGGGTATTTCAAAGTTACTAATGTTAAAAATGAGGTTGAACTCCTCCAA 951
Query 981 AGATGGTTTTACCATATGCAAGAGTTGAAACCCGGTATTTATGTTACATACAATGGTGAC 1040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 952 AGATGGTTTTACCATATGCAAGAGTTGAAACCCGGTATTTATGTTACATACAACGGTGAC 1011
Query 1041 TTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATAAAAATGAATGAG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 TTTTTTGACTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATAAAAATGAATGAG 1071
Query 1101 GAATTGGGATTCCGGTGTGATCATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAATTCGTTTGTCAT 1160
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1072 GAATTGGGATTCCGTTGTGATCAGAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAATTCGCTTGTCAT 1131
Query 1161 TTGGATTGTTTTGCTTGGGTTAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTG 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132 TTGGATTGTTTTGCTTGGGTTAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTG 1191
Query 1221 AAGGCTGTAACAAAGGCAAAACTGGGTTATGATCCACTGGAAGTGAACCCAGAGGATATG 1280
|||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1192 AAGGCTGTTACAAAGGCAAAACTAGGTTATGATCCACTGGAAGTGAACCCAGAGGACATG 1251
Query 1281 GTTCGGTTTGCGATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTT 1340
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 GTTCGGTTTGCGATGGAAAAGCCCCAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTT 1311
Query 1341 GCAACTTACTACCTATACATGACATATGTCAATCCGTTCATTTTTTCTCTCGCAACTATC 1400
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312 GCAACTTATTACCTATACATGACATATGTCAATCCATTCATTTTTTCTCTCGCAACTATC 1371
Query 1401 ATCCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTT 1460
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 ATCCCAATGGTCCCTGATGAGGTTTTACGTAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTT 1431
Query 1461 CTGATGGTTCAGGTATCAACCTATCTACCACAAGCACAGGCTTACAAGGTAAATGTTGTA 1520
||||||||| ||| | | | || | | | | | | || | ||||||
Sbjct 1432 CTGATGGTTGAGG---C----T-T--AC-A-A-G----G-C--A-AA--T----GTTGTA 1464
Query 1521 TGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAATTCTACCAAAATCAACTTCTTGAAAGT 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 TGTCCCAACAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAATTCTACCAAAATCAACTTCTTGAAAGT 1524
Query 1581 GAGACATATATTGGTGGGCATGTAGAGTGCCTTGAAAGTGGT 1622
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 GAGACATATATTGGTGGTCATGTAGAGTGCCTTGAAAGTGGT 1566
Score = 2235 bits (1210), Expect = 0.0
Identities = 1315/1363 (96%), Gaps = 17/1363 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 1623 CAACTGATTGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTATCACTGTAGAAGGGAAAATG 1682
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1621 CAACTGATCGATAACCTTGGTCGTGATCTGGAATATGCTATCACTGTAGAAGGAAAAATG 1680
Query 1683 AGAATGGATTCAATTTCCAATTATGATGAAGTGAAGGACGAAATCAAGGAGAAGCTCGAG 1742
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1681 AGAATGGATTCAATTTCCAATTATGATGAAGTGAAGGACGAAATCAAGGAGAAGCTTGAG 1740
Query 1743 AAACTACGAGATGACCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCA 1802
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1741 AAGTTACGAGATGACCCTATACGGGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCA 1800
Query 1803 GCGATGTATCCAAATATCATTTTAACAAACAGGCTCCAGGTACATCTAATCTCTCCACCA 1862
|| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | || | ||||||
Sbjct 1801 GCCATGTATCCAAATATCATCTTAACAAACAGG---C---T---TC--A----GCCACCA 1845
Query 1863 TCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAACCTCCCCGGAAAGACCTGT 1922
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
Sbjct 1846 TCAATAGTTACGGATGAGATTTGCACAGCATGTGATTTCAACCGCCCGGGAAAGACCTGT 1905
Query 1923 CTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACATTCATGGGAAAGAAAAGTGATTAT 1982
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906 CTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGTGTGACATTCATGGGAAAGAAAAGTGATTAT 1965
Query 1983 TACCATTTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATTTGTTGATGCTGGTGCAAATATACA-GTC 2041
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
Sbjct 1966 TACCATTTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATTTGTTGATGCTGGTGCAAATATA-ATGTC 2024
Query 2042 TTCAAAATCATTCCTTGATCTGCCAAAGGTGGATCAACAATCTAAGCTAAAAGAAAGACT 2101
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2025 TTCAAAATCGTTCCTTGATCTGCCAAAGGTGGATCAACAATCTAAGCTAAAAGAACGACT 2084
Query 2102 aaaaaaaTATTGTCAAAAGGCTTATAAACGAGTACTTGACAAGCCAATTACTGAAGTTCG 2161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2085 AAAAAAATATTGTCAAAAGGCTTATAAACGAGTACTTGACAAGCCAATTACTGAAGTTCG 2144
Query 2162 TGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTGTTCGGAGCTTTCG 2221
||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2145 TGAAGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCTTTCTATGTGGATACTGTTCGGAGCTTTCG 2204
Query 2222 AGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGC 2281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 AGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGC 2264
Query 2282 CAAGGCAAGTGGTAATTCAATCAAGATCCAGGAAGCACAGGACATGGTAGTGGTTTACGA 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 CAAGGCAAGTGGTAATTCAATCAAGATCCAGGAAGCACAGGACATGGTAGTGGTTTACGA 2324
Query 2342 TTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATTCTTAATTCCTTCTATGGATATGTCATGCGAAA 2401
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325 TTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTCTATGGATATGTCATGCGAAA 2384
Query 2402 GGGTGCAAGATGGTATTCCATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACCTATACTGGAGCCAAAAT 2461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385 GGGTGCAAGATGGTATTCCATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACCTATACTGGAGCCAAAAT 2444
Query 2462 CATACAGAATGCCCGTTTGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGA 2521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2445 CATACAGAATGCCCGTTTGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGA 2504
Query 2522 TGGTATATGGTGTTGTCTCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACAATAGA 2581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 TGGTATATGGTGTTGTCTCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACAATAGA 2564
Query 2582 CATGAAGAAACTCACGATCTCGTATCCTTGTGTTATGCTTAATGTTGATGTGGCAAAAAA 2641
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2565 CATGAAGAAACTCACCATCTCGTATCCTTGTGTTATGCTTAATGTTGATGTGGCAAAGAA 2624
Query 2642 TAATACAAATGATCAATATCAGACTCTTGTAGATCCTGTACGCAAGACTTATGAATCACA 2701
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 2625 TAATACAAATGATCAATATCAGACTCTTGTAGATCCTGTACGCAAGACATATAAATCACA 2684
Query 2702 TAGTGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTAGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCTGC 2761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2685 TAGTGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTAGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCTGC 2744
Query 2762 ATCGAAAGAAGAAGGAATCTTAATTAAGAAGCGCTATGCTGTTTTTAATCATGATGGAAC 2821
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2745 ATCGAAAGAAGAAGGAATCTTAATCAAGAAGCGTTATGCTGTTTTCAATCATGATGGAAC 2804
Query 2822 CTTAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATCAAGCGTAGAGGGGAGTTGAAACTCATTAAAGT 2881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2805 CTTAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATCAAGCGTAGAGGGGAGCTGAAACTCATTAAAGT 2864
Query 2882 TTTCCAGGCCGAGCTTTTTGACAAATTTCTCCATGGATCAACCCTTGAAGAGTGCTATTC 2941
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||
Sbjct 2865 TTTCCAGGCCGAGCTTTTTGACAAATTTCTCCATGGATCAACTCTTGAAGAGTGTTATTC 2924
Query 2942 TGCTGTTGCAGAGGTTGCTGATCGATGGCTTGACCTACTCGAT 2984
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2925 TGCTGTTGCAGCGGTTGCTGATCGATGGCTTGACCTACTCGAT 2967
Score = 809 bits (438), Expect = 0.0
Identities = 465/478 (97%), Gaps = 2/478 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 6270 GTAATGAGAAAGAGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAGTGTGCTGCTGAAGCCGAA 6329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6010 GTAATGAGAAAGAGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAGTGTGCTGCTGAAGCCGAA 6069
Query 6330 TTTCTTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCTAATGTAGCTTGCAGCAACTGTGATGCC 6389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6070 TTTCTTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCTAATGTAGCTTGCAGCAACTGTGATGCC 6129
Query 6390 TACAGAGACCTAGATATATGCAGAGACCCAGTACTATTAACAGAGAAAGAATGGTCATGT 6449
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6130 TACAGAGACCTAGATATATGCAGAGACCCAGCACTGTTAACAGAGAAAGAATGGTCATGT 6189
Query 6450 G-GAGATCCACAATGTGGGAAGATATATGACAGAGAGCAGATGGAGAGTAGCCTTCTCGA 6508
| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 6190 GCG-GATACACAATGTGGGAAGATATATGACAGAGAGCAGATGGAGAGTAGCCTTCTAGA 6248
Query 6509 GATGGTGAGACAGAGAGAAAGAATGTACCATATGCAGGATCTAGTGTGCATTAGGTGCAA 6568
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6249 GATGGTGAGACAGAGAGAAAGAATGTACCATATGCAGGATGTAGTGTGCATTAGGTGCAA 6308
Query 6569 TCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAA 6628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6309 TCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAA 6368
Query 6629 GGAGAGCGGGTCAGAGTTCAGCAAGAGGATGGAGATCTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCA 6688
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
Sbjct 6369 GGAGAGTGGGTCAGAGTTCAGCAAGAGGATGGAGATATTCATGGATATAGCAAAGCGCCA 6428
Query 6689 GAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATCTCATGGATCTTATATGGCCCCAGCTATTAA 6746
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||
Sbjct 6429 GAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATCTCTTGGATCATATATGGCCCTAGCTATTAA 6486
Score = 520 bits (281), Expect = 1e-145
Identities = 302/312 (97%), Gaps = 2/312 (1%)
Strand=Plus/Plus
Query 5872 AGAGGGATTTCATTATAATCGTTGCCAAGTTTATATTTGACCCCTGGAAATTTGCAATAG 5931
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5699 AGAGGGATTTCATTATAATCATTGCCAAGTTTATATTTGACCCCTGGAAATTTGCGATAG 5758
Query 5932 AGaaa-aaaaaGGGCAGTTCAGAGAGTTTAGAGGCACAGATGGTAGAATATCTAAGAGAA 5990
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5759 A-AAATAAAAAGGGCAGTTCAGAGAGTTTAGAGGCACAGATGATAGAATATCTAAGAGAA 5817
Query 5991 CAGATTGGATCAACCTTCATAAATATGCTTGTTAAAAAGGTTGATGATATCATGTCACAC 6050
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5818 CAGATTGGATCAACCTTCATAAATATGCTTGTCAAAAAGGTTGATGATATCATGTCACAC 5877
Query 6051 ATGAAGGAGATAAACGTTTCAGATGCATCTCGAGTTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGAGAT 6110
|||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5878 ATGAAGGAGATAAATGTTTCAGATGCATCTCGGGTTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGAGAT 5937
Query 6111 TACACGTTGGAATTTATACAGGTTATCTCTGCTGTTCTGGCTCTTGACCAAAACGTCCTG 6170
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 5938 TACTCGTTGGAATTTATACAGGTTATCTCTGCTGTTCTGGCTCTTGACCAAAACGTCCAG 5997
Query 6171 CAAGATGTTCTG 6182
||||||||||||
Sbjct 5998 CAAGATGTTCTG 6009
Score = 115 bits (62), Expect = 5e-24
Identities = 70/73 (96%), Gaps = 3/73 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 5700 TATAACTACGCTGGTATCCGAGCTACCGATGATGAAATTTCACTTGACGAAGTGACTATT 5759
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5599 TATAACTACGCTGGTATCCGAG---CCGATGATGAAATTTCACTTGACGAAGTGACTATT 5655
Query 5760 GAACCAAAGTGGA 5772
|||||||||||||
Sbjct 5656 GAACCAAAGTGGA 5668
> AT2G27120.1 | Symbols: POL2B, TIL2 | DNA polymerase epsilon catalytic
subunit | chr2:11581223-11594346 FORWARD LENGTH=6417
Length=6417
Score = 2556 bits (1384), Expect = 0.0
Identities = 2216/2595 (85%), Gaps = 147/2595 (6%)
Strand=Plus/Plus
Query 3041 TCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAACTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACAAT 3100
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2946 TCAAGGAAAAGATATTGCCGATAGTGAATTGCTAGATTATATATCAGAATCAAGCACTAT 3005
Query 3101 GAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTGAGCAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACG 3160
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 GAGCAAATCGTTAGCAGATTATGGTCAACAAAAGTCATGTGCAGTGACCACAGCAAAACG 3065
Query 3161 CCTGGCTGAATTTCTTGGTGTTACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGTTGCCAGTACAT 3220
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 3066 CCTGGCTGATTTTCTTGGTGATACAATGGTCAAAGATAAAGGACTGCGCTGCCAATACAT 3125
Query 3221 TGTTGCTTGTGAACCAAAGGGTACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTTCCTGTTGCCATATT 3280
|||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3126 CGTTGCTCGTGAACCAGAGGGGACACCTGTAAGTGAACGTGCTGTCCCTGTTGCCATATT 3185
Query 3281 TAC-AAC-GA--ATCCAGAAGTTATGAAGTTTCATCTTCGAAAATGGTGCAAGACATCAT 3336
| | ||| || |||| ||| | |||||| |||| | |||||||||||||| |||||
Sbjct 3186 T-CAAACAGATGATCCTGAA---AAAAAGTTTTATCTGCAAAAATGGTGCAAGATATCAT 3241
Query 3337 CAGATGTC-GGAATTCG-TCTAATTATTGACTGG-TCGTATTACAAGCAGCGCCTT-AGT 3392
|| || | ||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |
Sbjct 3242 CATAT-ACTGGAATCCGTTC-AATTATTGACTGGAT-GTATTACAAGCAGCGTCTTCA-T 3297
Query 3393 TCAGCTATCCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTGGCAAATCCCGTG 3452
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
Sbjct 3298 TCAGCTATTCAAAAAGTTATTACCATTCCTGCTGCAATGCAGAAGGTGGCAAAT-CC-TG 3355
Query 3453 T-C-TAGGGTGCTTCATCCTGACTGGCTCCATAAAAAGGTTCGTGAGAAAGACGACAAAT 3510
| | |||||||| ||||||| | |||||| | ||||||| || | | |||||||
Sbjct 3356 TACTTAGGGTGCGTCATCCTTATTGGCTCGAGAAAAAGG-TC-T------G-TGACAAAT 3406
Query 3511 TTCGCCAGAGAAAACTAGTTGATATGTTCAGCTCAGCAAATAAAGATGGTGTGTTGGAAA 3570
|||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | || | |
Sbjct 3407 TTCGTCAGGGAAAAATAGTTGATATGTTTAGCTCAGCAAACAAAGA---T-CATTCG--A 3460
Query 3571 CAGATCATCCGGTGACTAAAGATAATGTGGAAGATATTGAGGATTTTTGCAAAGAAAACA 3630
|| | | | | || ||| | | | |||| |||||||| || |||||||||||||||
Sbjct 3461 CA-A-C-T-C-AAGA-TAATG-T-A-GTGGCGGATATTGAAGAGTTTTGCAAAGAAAAC- 3510
Query 3631 AG-CCTTCCGTGAAAGGGCCAAAACCAATTGCGCGATC-TTATGAAGTCAAGAAAAAACA 3688
|| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||| | | ||| ||
Sbjct 3511 AGACCTTCCGTAAAAGGGCCAAAGCCAGTTGCGCGTTCATT-TGAAGTCGATAGAAATCA 3569
Query 3689 GTCTGAACGTGAGCAGCAAGAGAGCTGGGATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTTCAGAA 3748
||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 3570 CTCTGAGGGTAAGCAGCAAGAGAGTTGGGATCCAGAGTTCCATGATATCTCATTACAGAA 3629
Query 3749 CATTGACAAGAGCGTAAACTACCAAGGATGGCTTGAACT-gaaaaagagaaaatggaaag 3807
| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||
Sbjct 3630 CGTTGACAAGAATGTAGATTACCAAGGATGGCTTGAACTGGAAAAA-AGAAAATGGAAAA 3688
Query 3808 taactct-a-gaa-aagaagaaaagacgaagGTTGGGTGATCTAAGATCTCCAAACCAG- 3863
| ||||| | ||| ||||| |||| | ||||| | | || ||| | | | |
Sbjct 3689 TGACTCTAACGAATAAGAA-AAAA-A-GAAGG-T-ACTCCTC-AAG-T-T--TATTTGGT 3738
Query 3864 ATTGA--T-GCTCACGAGATAAATCAAAAAGT-TGGTCAGGGAAGAGGT-GGTGTGGGTT 3918
|||| | | || | |||||| ||||||| | || |||||||| || ||||| || |
Sbjct 3739 TTTGATTTGGAACAAAATATAAATAAAAAAGTCT-GTAAGGGAAGA-GTAGGTGTAGGCT 3796
Query 3919 CATACTTTAGGAGGCCTGAAGAAGCTTTGACTAGTTCACATTGGCAGGTGTGCACAATAA 3978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||| ||||
Sbjct 3797 CATACTTTAGGAGGCCTGAAGAAGCTTTGACTAGTTC-C--T---A--TTTGCA-GATAA 3847
Query 3979 TACAGCTGGTTCC-AAGTCCACAGAGCGGACAATTTTTTGCTTGGGTGGTTGTGGAAGGG 4037
||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3848 TACAGTTGG-TCCAAAGTCCACAGAGCGGGCAATTTTTTGCTTGGGTTGTTGTGGAAGGA 3906
Query 4038 TTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATCTCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAG-TTCC 4096
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
Sbjct 3907 TTGATGCTTAAGATCCCATTGACGATCCCAAGGGTGTTTTACATTAATTCCAAAGCTT-C 3965
Query 4097 TATAGCT-GAATATTTCCA-AGGAAAGTGTGTCAACAAGATTCTTCCCCATGGAAGGCCT 4154
||||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||
Sbjct 3966 TATAGCTGGAA-ACTT-CACGGGAAAGTGTATCAACAAGATTCTTCCTCACGGAAAGCCT 4023
Query 4155 TGTTATACTTTGACT-GAGGTCAAGATTCAAGAAGATAAATTTA-AAAAGGAAAGTAAAA 4212
||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||
Sbjct 4024 TGTTACAATTTGA-TGGAGGTCAATATTCAGGAAGATCAATTTATAAAA-GAAAGCAAAA 4081
Query 4213 AGCGTGCAGCTCTTCTTGCAGACCCCAG-AGTTGAGGGCATATATGAAACTAAGGTGCCT 4271
||| ||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4082 AGCTTGCCGCTCTACTTGCAGACCCC-GAAATTGAGGGCATATATGAAACTAAGATGCCT 4140
Query 4272 CTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGTGTATGCAAAGTTGATA-ACAAAGCCAA 4330
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||
Sbjct 4141 CTGGAGTTTAGTGCTATATGTCAGATTGGATGTGTATGCAAAATTGA-AGACACGGCCAA 4199
Query 4331 GCACCGTAACACCCAAAATGGATGGGAAGTTGGTGAACTTCACATGAAAACTACTACTGA 4390
||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||
Sbjct 4200 ACACCGTAACACCCAAGATGGATGGAAACTTGGTGAACTTCACAGGATAACTACAACTGA 4259
Query 4391 GTGTCATTACTTGGAGCGTTCAATTCCACTTCTTT-TCTTGTATAACAGTACCTCAACAG 4449
||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||
Sbjct 4260 GTGTCGCTACTTGGAGAATTCTATTCCACTTGTTTAT-TTGTATCACAGCACCTCAACAG 4318
Query 4450 GGCGTGCTATATATGTTTTATTTTGTCATGCATCGAAGCTTATGTCTGCCGTGGTAGTTG 4509
| |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4319 GTCGTGCTGTTTATGTTTTATATTGTCATGCTTCGAAGCTTATGTCTGTTGTGGTAGTCA 4378
Query 4510 ATCCTTTTAAC-AGCAATGAATTATTACCATCTGCCCTAGAGAGACAGTTAAGAGATAGT 4568
|||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4379 ATCCTTACGGTGA-CAAGGAATTATTATCATCTGCCCTAGAGAGACAGTTTAGAGATAGA 4437
Query 4569 TGCCAAGAATTGTCACTTGAG---T---CTTGGGATGGTATCCGTTTCCAGGT-GCGCTA 4621
||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| | | ||
Sbjct 4438 TGCCAAGAACTGTCACCTGAGCCATTTTCTTGGGATGGTATCCTTTTCCAGGTCGAG-TA 4496
Query 4622 TGTTGACCATCCCGAAGCTGCCAAGAAGATTAT-ACAAATAGCAATAAGTGAATACAGAG 4680
|||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||| ||| | ||||||||||||
Sbjct 4497 TGTTGACCATCCAGAAGCTGCCACGAA-ATTTTTACAAAAAGCGCTCTGTGAATACAGAG 4555
Query 4681 AGGAAAATTGTGGACCAACTGTTGCTGTCATCGAATGCCCTGTCTTTAACTCCATGAAGG 4740
| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||
Sbjct 4556 AAGAAAATTGTGGAGCAACTGTGGCAGTCATTGAATGCCCTGACTTTAACACCACGAAGG 4615
Query 4741 AAGGTATCAAGGCCCTGGATGATTTCCCATGTGTGAGGATTCCTTTCAACGGCGATGATA 4800
||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
Sbjct 4616 AAGGTGTAAAGGCCCTGGAAGATTTCCCATGTGTGAGGATTCCCTTCAACGACGATGACA 4675
Query 4801 ACAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCAGCAAAAATAGCAATGTTCCGTTGTG 4860
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct 4676 ATAGTTATCAGCCTGTCTCCTGGCAACGTCCAGCAGCAAAAATAGCAGTGCTCCGTTGTG 4735
Query 4861 CTGCAGCATTTCAGTGGTTGGATCGGAGGATTGCCCACTCAAGATACGCCCATGTGCCTC 4920
|| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 4736 CTTCAGCAATTCAGTGGTTGGACCGGAGGATTGCCCAGTCAAGATACGCCCATGTGCCTC 4795
Query 4921 TGGGGAATTTTGGACTTGATTGGCTAACATTCACAATAGATATCTTCCTATCCAGGGCAC 4980
||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 4796 TGGGGAATTTTGGACGTGATTGGTTAACGTTCACAGTAGATATCTTCCTGTCCAGGGCAC 4855
Query 4981 TCCGTGACCAGCAACAGGTCCTCTGGGTGTCAGATAATGGTGTTCCAGACCTTGGAGGTA 5040
||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 4856 TCCGTGACCAGCAACAGGTTCTTTGGGTCTCAGATAATGGTGTTCCAGACCTTGGAGATA 4915
Query 5041 TAAACAACGAAGAGGCATT-CTTTGCTGATGAGGTGCAACAGACAAGTTTAG-TATTCCC 5098
||||||| |||||| |||| || ||||||||| | || | |||| | |||||||
Sbjct 4916 TAAACAATGAAGAGACATTTCTA-GCTGATGAG----A-CA-A---GTTT-GCTATTCCC 4964
Query 5099 TGGAGCGTATAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGATCCATA-ACTTGGCTGTTAATGCCC 5157
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||
Sbjct 4965 TGGAGCGTACAGAAAAGTGTCTGTGGAGTTAAAGGTCCATAGA-TTAGCTGTTAATGCCC 5023
Query 5158 TTCTGAAAAGCAACCTGGTGAATGAAATGGAAAGAGGCGGTTTTTTGGGATTTGAACAGG 5217
|||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||
Sbjct 5024 TTCTGAAAAGTGACCTGGTGAGTGAAATGGAAGGAGGCGGCTTTTTGGG-TGTGAA---- 5078
Query 5218 ATGTGAATCCTAGAGGAATTAA-TTCAAACGATAACACCAGTTTTGATGAGACCACTGGA 5276
| | | |||||||| || || ||||||||| |||||||||||||| | ||||
Sbjct 5079 -T-T----C-TAGAGGAAGTAGCTT-AAACGATAATGGCAGTTTTGATGAGAATAATGGA 5130
Query 5277 TGTGCTCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAGTTGATTCATAGTTGCTTGACTG-ATG-TGC 5334
|| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||| |||
Sbjct 5131 TGCGCGCAAGCATTTCGTGTCCTGAAACAATTGAT-CA-AGC-GCTTGT-TGCATGATGC 5186
Query 5335 GTA-AAT-CTGAAAATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACGTTTGTCTTGGTGGCTCTG 5392
|| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
Sbjct 5187 GTGTAATTCTGGCAATATATATGCTGATTCCATTTTGCAACATCTGTCTTGGTGGCTCCG 5246
Query 5393 CAGCCCTTCCTCGAAGCTCCATGATCCAGCTCTTCATCTCATGCTTCACAAGGTCATGCA 5452
|||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5247 CAGCCCTTCCTCAAAGCTTCACGATCCAGCTCTCCATCTCATGCTTCACAAGGTCATGCA 5306
Query 5453 AAAAGTGTTTGCACTGCTATTGACTGATTTGCGGAGATTAGGTGCTATAATAATATATGC 5512
||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5307 AAAGGTGTTTGCGCTGCTTTTGACTGATTTGCGGAGGTTAGGTGCTATAATAATATACGC 5366
Query 5513 AGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGTGAAATTTGATCTATCTGCAGCTAAGGCTTA 5572
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||
Sbjct 5367 AGACTTCTCAAAGGTCATTATCGACACAGGGAAATTTGATCTATCTGCTGCAAAGACTTA 5426
Query 5573 TTGTGAAAGCTTGCT 5587
|||||||||||||||
Sbjct 5427 TTGTGAAAGCTTGCT 5441
Score = 1901 bits (1029), Expect = 0.0
Identities = 1373/1534 (90%), Gaps = 44/1534 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 93 GCGGAAGATGAACTCGAATCTAAACTCGGATATGGGCTTTTCTCTGAAGGTGAAACCCGA 152
|||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| ||
Sbjct 49 GCGGCAGATGAACTCGAAACTAAACTTGGATTTGGGCTTTTCTCCCAAGGGGAAACGCGG 108
Query 153 CTTGGCTGGTTACTCACATTCT-CATCCTCATCTTGGGAAGATCG-CGATACTGGGAAAG 210
|| || ||| ||||||| || | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||
Sbjct 109 CTCGGGTGGCTACTCACGTT-TGCATCATCATCTTGGGAAGAT-GCCGATACTGGGAAAA 166
Query 211 TCTATAGTTGTGTGGACCTTTACTTTGTTACTCAGGACGGGTTTTCTTTCAAGACAAAGT 270
|| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||
Sbjct 167 CCTTTAGTTGTGTGGACCTTTTCTTTGTCACTCAGGACGGCTCTTCTTTTAAGACTAAGT 226
Query 271 ACAAGTTCCACCCATACTTCTATGCAGCCACGAAAGACAAAATGGAATTGGAAGTCGAAG 330
||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||
Sbjct 227 ACAAGTTCCGCCCTTACTTGTATGCCGCCACCAAAGACAATATGGAACTGGAAGTTGAAG 286
Query 331 CCTATTTGAGACGCCGATATGAAAGACAAGTCGCTGATATTGAGATTGTTGAAAAAGAGG 390
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |
Sbjct 287 CCTACTTGAGACGCCGATATGAAAGACAAGTTGCTGATATTCAGATTGTTCACAAAGAAG 346
Query 391 ATCTTGATCTTAAAAATCATCTATCCGGCCTGCAAAAGAAATACCTAAAAATATCATTTG 450
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||
Sbjct 347 ATCTTTATCTTAAAAATCATCTATCTGGCCTGCAAAAAAAATATCTCAAAGTATCATTTG 406
Query 451 ATACTGTGCAACAATTGATGGAAGTCAAGAGGGATCTGCTGCATATCGTTGAACGAAACC 510
| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||
Sbjct 407 ACACTGTGCAACAATTGGTGGAAGTAAAGAGGGATCTGTTGCATATTGTCGAACGAAACC 466
Query 511 AGGCAAAATTTGATGCACTTGAAGCATACGAATCCATATTGGCTGGAAAACGAGAACAAC 570
||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct 467 TCGCAAAATTTAATGCACTTGAAGCTTACGAATCCATCTTGTCTGGAAAACGAGAACAAC 526
Query 571 GTCCTCAAGATTGCTTAGACTCTATCGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATG 630
|||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 527 GTCCTCAAGACTGCTTAGACTCTGTGGTGGACCTCCGCGAGTACGATGTTCCTTATCATG 586
Query 631 TTCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGGAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGCATTTCCA 690
| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 587 TCCGATTTGCAATTGATAATGATGTGCGTAGTGGGCAATGGTACAATGTCAGTATTTCCA 646
Query 691 GCACCGATGTCATACTGGAGAAGAGGACAGATCTTCTTCAACGCGCAGAAGTCCGTGTTT 750
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 647 GCACTGATGTCATACTAGAGAAGAGGACGGATCTTCTCCAACGCGCAGAAGTTCGCGTTT 706
Query 751 GTGCCTTCGATATAGAGACAACAAAGCTTCCGTTAAAGTTTCCGGATGCTGAATATGATC 810
|||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 707 GTGCATTCGATATAGAGACAGTAAAGCTTCCATTGAAGTTCCCGGATGCTGAATATGATC 766
Query 811 AAATTATGATGATATCCTACATGGTCGATGGGCAAGGTTTTCTAATTATTAACAGAGAGG 870
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 767 AAATTATGATGATATCCTACATGGTTGATGGGCAAGGTTTTCTAATTACTAACAGAGAG- 825
Query 871 TAACTGCTTGTGTTGGCGAAGATGTAGAAGATCTGGAATATACACCCAAACCAGAATTTG 930
| | | || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 826 T----G-T-GT-T-GGCAAAGACATAGAAGATCTGGAATATACACCCAAACCAGAGTTTG 877
Query 931 AAGGGTATTTCAAAGTTACTAATGTTAAAAATGAGGTTGAACTCCTCC-AAAGATGGTTT 989
|||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||
Sbjct 878 AAGGGTATTTCAAAGTCACGAATGTTACCAACGAGGTTGAACTCCTCCGAAA-ATGGTTT 936
Query 990 TAC-CATATGCAAGAGTTGAAACCCGGTATTTATGTTACATACAATGGTGACTTTTTTGA 1048
| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 937 T-CTCATATGCAAGAGTTGAAACCTGGTATTTATGTTACATACAACGGTGACTTTTTTGA 995
Query 1049 CTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATAAAAATGAATGAGGAATTGGG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||
Sbjct 996 CTGGCCATTTATAGAACGGAGAGCATCTCATCATGGGATCAAAATGAACGAGGAGTTGGG 1055
Query 1109 ATTCCGGTGTGATCATAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAATTCGTTTGTCATTTGGATTG 1168
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||
Sbjct 1056 ATTCCGTTGTGATCAAAATCAAGGTGAATGTCGAGCTAAGTTTGTGTGCCATTTGGATTG 1115
Query 1169 TTTTGCTTGGGTTAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCATGGTCTGAAGGCTGT 1228
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1116 TTTTTCTTGGGTGAAACGTGATAGCTATCTTCCTCAGGGAAGCCAGGGTCTGAAGGCTGT 1175
Query 1229 AACAAAGGCAAAACTGGGTTATGATCCACTGGAAGTGAACCCAGAGGATATGGTTCGGTT 1288
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct 1176 TACAAAGGTAAAACTGGGTTACGATCCACTGGAAGTGAATCCTGAGGACATGGTTCGGTT 1235
Query 1289 TGCGATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTA 1348
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236 TGCAATGGAAAAGCCACAGACAATGGCCTCCTACTCTGTCTCTGATGCTGTTGCAACTTA 1295
Query 1349 CTACCTATACATGACATATGTCAATCCGTTCATTTTTTCTCTCGCAACTATCATCCCAAT 1408
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1296 CTACCTATACATGACATATGTCCATCCGTTCGTTTTTTCTCTCGCAACTATCATTCCAAT 1355
Query 1409 GGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTCTGATGGT 1468
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1356 GGTCCCTGATGAGGTTTTACGCAAAGGGAGTGGCACCCTTTGTGAAATGCTTTTGATGGT 1415
Query 1469 TCAGGTATCAACCTATCTACCACAAGCACAGGCTTACAAGGTAAATGTTGTATGTCCCAA 1528
| ||| | | | || | | | | | | || | ||||||||||||||
Sbjct 1416 TGAGG---C----T-T--AC-A-A-G----G-C--A-AA--T----GTTGTATGTCCCAA 1448
Query 1529 CAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAATTCTACCAAAATCAACTTCTTGAAAGTGAGACATA 1588
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449 CAAAAATCAAGCTGACCCTGAGAAGTTCTACCAAGGTAAACTTCTTGAAAGTGAGACATA 1508
Query 1589 TATTGGTGGGCATGTAGAGTGCCTTGAAAGTGGT 1622
||||||||| |||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1509 TATTGGTGGCCATGTAGAGTGCCTCCAAAGTGGT 1542
Score = 1851 bits (1002), Expect = 0.0
Identities = 1247/1364 (91%), Gaps = 21/1364 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 1623 CAACTGATTGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTATCACTGTAGAAGGGAAAATG 1682
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct 1597 CAACTGATCGATAACCTTGGTCGGGATCTGGAATATGCTATCACTGTTGAAGGAAAAATG 1656
Query 1683 AGAATGGATTCAATTTCCAATTATGATGAAGTGAAGGACGAAATCAAGGAGAAGCTCGAG 1742
|||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||
Sbjct 1657 AGAATGGATTCAGTTTCCAATTTTGATGAAGTAAAGGAAGTAATCAGGGAAAAGCTCGAG 1716
Query 1743 AAACTACGAGATGACCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCA 1802
|| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1717 AAGTTACGGGATGATCCTATACGTGAAGAGGGGCCTCTTATTTATCACCTTGATGTCGCG 1776
Query 1803 GCGATGTATCCAAATATCATTTTAACAAACAGGCTCCAGGTACATCTAATCTCTCCACCA 1862
||||||||||||||||| || |||||||||||| | | || | ||||||
Sbjct 1777 GCGATGTATCCAAATATTATCTTAACAAACAGG---C---T---TC--A----GCCACCA 1821
Query 1863 TCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAACCTCCCCGG-AAAGACCTG 1921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||
Sbjct 1822 TCAATAGTTACGGATGAGGTTTGCACAGCATGTGATTTCAA-CGGCCCGGAAAAGACCTG 1880
Query 1922 TCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACATTCATGGGAAAGAAAAGTGATTA 1981
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||
Sbjct 1881 TCTTAGAAAACTTGAATGGGTTTGGCGTGGGGTGACGTTCAAGGGAAATAAAAGTGAATA 1940
Query 1982 TTACCATTTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATTTGTTGATGCTGGTGCAAATATACAGTC 2041
||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 1941 TTACCATCTGAAGAAGCAGATTGAGTCTGAATCTGTTGATGCTGGAGCAAATATGCAGTC 2000
Query 2042 TTCAAAATCATTCCTTGATCTGCCAAAGGTGGATCAACAATCTAAGCTAAAAGAAAGACT 2101
||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||
Sbjct 2001 TTCAAAACCTTTTCTTGATCTGCCAAAGGTGGAACAACAATCCAAATTAAAAGAACGACT 2060
Query 2102 aaaaaaaTATTGTCAAAAGGCTTATAAACGAGTACTTGACAAGCCAATTACTGAAGTTCG 2161
|||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2061 GAAAAAATACTGTCAAAAGGCATATAGCCGAGTACTTGACAAGCCAATCACTGAAGTTCG 2120
Query 2162 TGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTGTTCGGAGCTTTCG 2221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct 2121 CGAGGCTGGGATATGCATGAGAGAAAACCCGTTCTATGTGGACACTGTGCGCAGCTTTCG 2180
Query 2222 AGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAATTGTCAGAGGC 2281
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2181 AGATAGGAGGTATGAATACAAAACACTTAACAAGGTCTGGAAGGGAAAGTTGTCAGAGGC 2240
Query 2282 CAAGGCAAGTGGTAATTCAATCAAGATCCAGGAAGCACAGGACATGGTAGTGGTTTACGA 2341
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2241 CAAGGCAAGTGGCAATTTAATCAAGATCCAGGAAGCACATGACATGGTAGTGGTTTACGA 2300
Query 2342 TTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATTCTTAATTCCTTCTATGGATATGTCATGCGAAA 2401
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 2301 TTCCTTGCAGCTAGCTCATAAGTGTATACTTAATTCCTTTTATGGATATGTCATGCGAAA 2360
Query 2402 GGGTGCAAGATGGTATTCCATGGAAATGGCTGGTGTAGTTACCTATACTGGAGCCAAAAT 2461
||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 2361 GGGCGCAAGATGGTACTCCATGGAAATGGCTGGGGTAGTTACTTATACTGGAGCCAAAAT 2420
Query 2462 CATACAGAATGCCCGTTTGCTTATTGAGCGAATTGGGAAACCACTTGAGTTGGATACAGA 2521
||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 2421 CATCCAGAATGCTCGTTTGCTTATTGAACGAATTGGGAAACCACTTGAGCTGGATACAGA 2480
Query 2522 TGGTATATGGTGTTG-TCTCCCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACTTTTAAAACAATAG 2580
||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
Sbjct 2481 TGGTATATGGTGT-GCTCTACCTGGATCTTTTCCTGAGAACTTTACCTTTAAAACCATAG 2539
Query 2581 ACATGAAGAAACTCACGATCTCGTATCCTTGTGTTATGCTTAATGTTGATGTGGCAAAAA 2640
| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |
Sbjct 2540 ATATGAAGAAATTCACCATCTCGTATCCGTGTGTAATACTTAATGTTGATGTGGCGAAGA 2599
Query 2641 ATAATACAAATGATCAATATCAGACTCTTGTAGATCCTGTACGCAAGACTTATGAAT-CA 2699
||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||
Sbjct 2600 ATAATTCAAATGACCAATATCAGACTCTAGTAGATCCTGTACGAAAGACATAT-AATTCA 2658
Query 2700 CATAGTGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTAGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCT 2759
| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2659 CGTAGCGAATGCTCAATTGAATTTGAAGTGGATGGACCGTACAAGGCAATGATTATTCCT 2718
Query 2760 GCATCGAAAGAAGAAGGAATCTTAATTAAGAAGCGCTATGCTGTTTTTAATCATGATGGA 2819
||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 2719 GCATCCAAGGAAGAGGGAATCTTAATTAAGAAGCGGTATGCTGTTTTCAATCATGACGGA 2778
Query 2820 ACCTTAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATCAAGCGTAGAGGGGAGTTGAAACTCATTAAA 2879
||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||
Sbjct 2779 ACCATAGCAGAACTCAAGGGGTTTGAGATGAAGCGTAGAGGAGAGCTGAAACTCATTAAA 2838
Query 2880 GTTTTCCAGGCCGAGCTTTTTGACAAATTTCTCCATGGATCAACCCTTGAAGAGTGCTAT 2939
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 2839 GTTTTCCAGGCCGAGCTATTTGACAAATTTCTGCATGGATCAACCCTTGAAGAGTGTTAT 2898
Query 2940 TCTGCTGTTGCAGAGGTTGCTGATCGATGGCTTGACCTACTCGA 2983
||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||
Sbjct 2899 TCTGCTGTTGCAGCTGTTGCAAATCGTTGGCTTGACCTACTCGA 2942
Score = 628 bits (340), Expect = 2e-178
Identities = 433/477 (91%), Gaps = 10/477 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 6270 GTAATGAGAAAGAGTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAGTGTGCTGCTGAAGCCGAA 6329
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5941 GTAATGAGAAAGATTCTGTTGAAGTACATTAAAGTAAAAGAATGTGCTGCTGAAGCCGAA 6000
Query 6330 TTTCTTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCTAATGTAGCTTGCAGCAACTGTGATGCC 6389
||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||
Sbjct 6001 TTTATTGATCCTGGGCCATCCTTCATCTTACCCAACGTGGCTTGCAGCAACTGCGGTGCC 6060
Query 6390 TACAGAGACCTAGATATATGCAGAGACCCAG-TACTATTAACAGAGAAAGAATGGTCATG 6448
||||||||||||||| | ||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 6061 TACAGAGACCTAGATTTCTGCAGAGACTCAGCT-CTCTTAACAGAAAAAGAATGGTCATG 6119
Query 6449 TG-GAGATCCACAATGTGGGAAGATATATGACAGAGAGCAGATGGAGAGTAGCCTTCTCG 6507
|| | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||
Sbjct 6120 TGCG-GATCCGCAATGTGTGAAGATATATGACAAAGAGCAGATAGAGAGTAGCATTATCC 6178
Query 6508 AGATGGTGAGACAGAGAGAAAGAATGTACCA-TATGCAGGATCTAGTGTGCATTAGGTGC 6566
|||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 6179 AGATGGTGAGACAGAGGGAAAGAATGTACCAGT-TGCAGGATCTAGTGTGCAATAGGTGC 6237
Query 6567 AATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGC 6626
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 6238 AATCAGGTGAAAGCCGCTCATTTGACAGAGCAGTGTGAGTGTTCTGGATCCTTTAGATGC 6297
Query 6627 AAGGAGAGCGGGTCAGAGTT-CAGCAAGAGGATGGAGATCTTCTTGGATATAGCAAAGCG 6685
|||||||| || ||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 6298 AAGGAGAGTGGTTCAGATTTCCA-CAAGAGGATTGAGATTTTCTTGGATATAGCAAAGCG 6356
Query 6686 CCAGAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATCTCATGGATCTTATATGGCC-CCAGCT 6741
|||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || || ||||||
Sbjct 6357 CCAGAAGTTTAGACTGCTAGAAGAATGCATCTCCTGGATTTTATTTG-CCACCAGCT 6412
Score = 350 bits (189), Expect = 1e-94
Identities = 275/316 (87%), Gaps = 8/316 (3%)
Strand=Plus/Plus
Query 5871 CAGAGGGATTTCATTATAATCGTTGCCAAGTTTATATTTGACCCCTGGAAATTTGCAATA 5930
|||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||
Sbjct 5629 CAGAAGGATTTTATCATAATTGTTGCCACGTTTATATTTGGCCCCTGGAAATTTGCATTA 5688
Query 5931 GAGaaaaaaaaGGGCAGTTCAGAGAGTTTAGAGGCACAGATGGTAGAATATCT-AAGAGA 5989
|||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 5689 GAGAAAAAAAGGGGCAGTGCAGAGAGTTTAGAGGCAGAGATGGTAGAATATCTCAAG-GA 5747
Query 5990 ACAGATTGGATCAACC--TTCATAAATATGCTTGTTAAAAAGGTTGATGATATCATGTCA 6047
|||||| ||| | || ||||||| ||| ||||| | ||| ||| | |||||| ||||
Sbjct 5748 ACAGATAGGA--ACCCGGTTCATAAGCATGATTGTTGAGAAGATTGGTAATATCAGGTCA 5805
Query 6048 CACATGAAGGAGATAAACGTTTCAGATGCATCTCGAGTTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGA 6107
||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||
Sbjct 5806 CACATCAAGGATATAAACGTGTCAGATGCATCTTGGGCTTCTGGTCAAGCTCCCAAAGGA 5865
Query 6108 GATTACACGTTGGAATTTATACAGGTTATCT-CTGCTGTTCTGGCTCTTGACCAAAACGT 6166
||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 5866 GATTACACGTTCGAATTTATACAAATTAT-TACTGCTGTTCTGGCTCTTGATCAAAACGT 5924
Query 6167 CCTGCAAGATGTTCTG 6182
| |||||||||||||
Sbjct 5925 TCAGCAAGATGTTCTG 5940
> AT1G08270.2 | Symbols: | CONTAINS InterPro DOMAIN/s: MIT (InterPro:IPR007330);
BEST Arabidopsis thaliana protein match is:
AAA-type ATPase family protein (TAIR:AT2G27600.1); Has 35333
Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798;
Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531;
Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink).
| chr1:2606269-2607507 REVERSE LENGTH=1034
Length=1034
Score = 339 bits (183), Expect = 3e-91
Identities = 197/204 (97%), Gaps = 0/204 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 6537 CATATGCAGGATCTAGTGTGCATTAGGTGCAATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAG 6596
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 CATATGCAGGATGTAGTGTGCATTAGGTGCAATCAGGTGAAAGCGGCTCATTTGACAGAG 675
Query 6597 CAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAAGGAGAGCGGGTCAGAGTTCAGCAAGAGG 6656
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 674 CAGTGTGAGTGTTCTGGTTCCTTTAGATGCAAGGAGAGTGGGTCAGAGTTCAGCAAGAGG 615
Query 6657 ATGGAGATCTTCTTGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATC 6716
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 ATGGAGATATTCATGGATATAGCAAAGCGCCAGAAGTTTAGACTGTTAGAAGAATACATC 555
Query 6717 TCATGGATCTTATATGGCCCCAGC 6740
|| |||||| |||||||||| |||
Sbjct 554 TCTTGGATCATATATGGCCCTAGC 531
Score = 93.5 bits (50), Expect = 2e-17
Identities = 55/57 (96%), Gaps = 1/57 (2%)
Strand=Plus/Minus
Query 6371 TTGCAGCAACTGTGATGCCTACAGAGACCTAGATATATGCAGAGACCCAGTAC-TAT 6426
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||
Sbjct 786 TTGCAGCAACTGTGATGCCTACAGAGACCTAGATATATGCAGAGACCCAGCACATAT 730
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 337898718340
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5