BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg920634
Length=3365
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G17230.1 | Symbols: | Leucine-rich receptor-like protein ki... 5517 0.0
AT1G17232.1 | Symbols: | Potential natural antisense gene, loc... 1007 0.0
> AT1G17230.1 | Symbols: | Leucine-rich receptor-like protein
kinase family protein | chr1:5891324-5895075 FORWARD LENGTH=3577
Length=3577
Score = 5517 bits (2987), Expect = 0.0
Identities = 3242/3368 (96%), Gaps = 5/3368 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 ACCAAAGCTAACTTGTAAAAATGAGAGGGAGGATATGTTTCTTGGCAATAGTAATTCTCT 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 32 ACCAAAGCTAACTTGTAAAAATGAGAGGGAGGATATGTTTCTTGGCAATAGTGATTCTCT 91
Query 61 GTTCTTTCTCCTTCATCTTAGTAAGATCCTTAAACAAAGAAGGGCGAGTTCTTCTGGAGT 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
Sbjct 92 GTTCTTTCTCCTTCATCTTAGTAAGATCCTTAAACGAAGAAGGGCGTGTTCTTCTGGAGT 151
Query 121 TTAAAGCTTTCCTTAATGACTCGAATGGTTATCTCGCAAGCTGGAACCAGTTGGATTCAA 180
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 152 TTAAAGCTTTCCTTAATGACTCCAATGGCTATCTCGCAAGCTGGAATCAGTTGGATTCAA 211
Query 181 ATCCCTGCAACTGGACCGGAATCGAGTGTACCC-GCATCAGAACGGTAACTTCTGTTGAT 239
|||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||
Sbjct 212 ATCCCTGCAACTGGACCGGAATCGCGTGTACCCATC-TCAGAACTGTAACTTCTGTTGAT 270
Query 240 TTAAATGGAATGAATCTATCAGGTACACTATCTCCTCTCATATGCAAGCTTCATGGTTTA 299
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271 CTAAATGGGATGAATCTATCAGGTACACTATCTCCTCTCATATGCAAGCTTCATGGTTTA 330
Query 300 AGGAAATTGAATGTCTCCACCAACTTCATCTCTGGTCCAATCCCTCGAGATTTATCTCTC 359
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 331 AGGAAATTGAATGTCTCCACCAACTTCATCTCTGGTCCAATCCCTCAAGATTTATCTCTC 390
Query 360 TGTCGAAGTCTAGAGGTTCTTGATCTCTGCACAAATAGGTTCCATGGAGTGATACCAATT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 391 TGTCGAAGTCTAGAGGTTCTTGATCTCTGCACAAATAGGTTCCATGGAGTGATACCAATT 450
Query 420 CAGCTAACTATGATCATCACTCTTAAGAAGCTGTATCTATGCGAGAATTATCTTTTCGGT 479
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 451 CAGCTAACCATGATCATCACTCTTAAGAAGCTGTATCTATGCGAGAATTATCTTTTCGGT 510
Query 480 ACAATCCCTAGACAAATAGGTAGTTTGAGTTCGCTCCAAGAGCTTGTGATCTACAGCAAC 539
| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 511 TCTATCCCTAGACAAATCGGTAATTTGAGTTCACTCCAAGAGCTTGTGATCTACAGCAAT 570
Query 540 AATCTCACCGGTGTAATCCCTCCTTCCACGGGGAAATTGAGACTGCTCCGGATCATTAGG 599
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 571 AATCTCACCGGTGTAATCCCTCCTTCCATGGCGAAATTGAGACAGCTCCGGATCATTAGG 630
Query 600 GCAGGACGGAATGCATTCTCGGGTGTGATTCCATCTGAAATCAGCGGATGTGAGAGCCTG 659
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 631 GCAGGACGGAATGGATTCTCGGGTGTGATTCCGTCTGAAATCAGCGGATGCGAGAGCCTA 690
Query 660 AAGGTACTTGGATTAGCAGAGAATCTTCTTGAGGGTTCTCTTCCTATGCAGCTCGAGAAG 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 691 AAGGTACTTGGATTAGCAGAGAATCTTCTTGAGGGTTCTCTTCCTAAGCAGCTCGAGAAG 750
Query 720 CTTCAAAATCTTACTGATCTGATACTCTGGCAAAACCGTCTATCCGGTGAGATACCTCCT 779
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 751 CTTCAAAATCTTACTGATTTGATACTCTGGCAAAACCGTCTATCTGGTGAGATACCTCCT 810
Query 780 TCGGTAGGAAACATCACCAGACTGGAGGTGCTTGCGCTGCACGAAAACTACTTCACGGGA 839
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 811 TCCGTAGGAAACATCAGCAGACTGGAGGTGCTTGCGCTGCATGAAAACTACTTCACGGGA 870
Query 840 TCAATTCCAAGAGAGATTGGGAAGCTCACAAAGATGAAAAGGCTGTACCTTTACACAAAC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 871 TCAATTCCAAGAGAGATTGGGAAGCTCACAAAGATGAAAAGGCTGTACCTTTACACAAAC 930
Query 900 CAGTTAACCGGAGAGATACCTCATGAAATAGGCAACTTGACAGATGCAGCTGAGATAGAT 959
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 931 CAGTTAACCGGAGAGATACCTCGCGAAATAGGCAACTTGATAGATGCAGCTGAGATAGAT 990
Query 960 TTTTCGGAGAATCAGTTAACAGGTTTCATCCCAATAGAGTTTGGTCAGATCCTGAATCTA 1019
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||
Sbjct 991 TTTTCGGAGAATCAGTTAACAGGTTTCATACCAAAAGAGTTTGGTCATATCCTGAATCTC 1050
Query 1020 AAACTACTTCATCTTTTTGAGAACATTCTTCTAGGTCCAATTCCTAGGGAGCTTGGGGAA 1079
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1051 AAATTACTTCATCTTTTTGAGAACATTCTTCTAGGTCCAATTCCTAGGGAGCTTGGGGAA 1110
Query 1080 TTGACACTGTTGGAGAAGCTAGACTTGTCTATCAATAAACTAAATGGTACTATCCCGCGA 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
Sbjct 1111 TTGACACTGTTGGAGAAGCTAGACTTGTCTATCAATAGACTAAACGGTACTATCCCGCAA 1170
Query 1140 GAGCTTCAGTTCCTACCTTACCTTGTCGATTTGCAGCTTTTTGACAACCAGCTTGAAGGG 1199
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 GAGCTTCAGTTCCTACCTTACCTTGTAGATTTGCAGCTTTTTGACAACCAGCTTGAAGGG 1230
Query 1200 ACGATACCTCCTCTAATCGGTTTCTATAGCAGTTTTTCTGTTCTTGACATGTCTGCCAAT 1259
| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 AAGATACCTCCTTTAATCGGTTTCTATAGCAATTTTTCTGTTCTTGACATGTCTGCCAAT 1290
Query 1260 TCTCTGTCTGGTCCAATTCCAGCCCATTTCTGCAGATTTCAGACGCTAATACTTCTGAGT 1319
|||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1291 TCTCTGTCTGGTCCAATTCCTGCCCACTTCTGCAGATTTCAGACGCTAATACTTCTGAGT 1350
Query 1320 GTTGGTTCAAACAAGTTATCAGGAAACATCCCTCGTGATCTGAAAACCTGCAAGTCACTG 1379
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351 CTTGGTTCAAACAAGTTATCAGGAAACATCCCTCGTGATCTGAAAACCTGCAAGTCACTG 1410
Query 1380 ACAAAGCTAATGCTAGGCGATAACTGGCTAACAGGAAGCCTTCCCGCTGAATTATTTAAT 1439
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 1411 ACAAAGCTAATGCTAGGCGATAACCAGCTAACAGGAAGCCTTCCCATTGAATTATTTAAT 1470
Query 1440 CTTCAGAACCTTACTGCATTAGAGCTTCACCAAAACTGGTTATCAGGGAATATATCTGCA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 CTTCAGAACCTTACTGCATTAGAGCTTCACCAAAACTGGTTATCAGGGAATATATCTGCA 1530
Query 1500 GACCTGGGGAAGCTGAAGAATTTAGAAAGACTGCGTCTAGCTAACAACAATTTTACTGGT 1559
|||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 GACCTGGGAAAGCTGAAGAATTTGGAAAGACTGCGTCTAGCTAACAACAATTTTACTGGT 1590
Query 1560 GAAATTCCTCCTGAGATTGGGAATCTCACAAAGATTGTTGGCTTAAACATCTCCTCCAAT 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1591 GAAATTCCTCCTGAGATTGGGAATCTCACAAAGATTGTTGGCTTTAACATCTCCTCCAAT 1650
Query 1620 CAGCTCACTGGTCACATCCCTAAAGAATTGGGGAGTTGTGTCACTATCCAGAGACTTGAC 1679
|||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1651 CAGCTCACTGGTCACATCCCTAAAGAGTTGGGAAGTTGTGTCACTATCCAGAGGCTTGAC 1710
Query 1680 CTTAGTGGAAACAGGTTTTCCGGGTACATACCACAAGATCTTGGTCAGTTGGTGA-ATTT 1738
|||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||
Sbjct 1711 CTTAGTGGCAACAAGTTTTCCGGATACATAGCACAAGAGCTTGGTCAGTTGGT-ATATTT 1769
Query 1739 GGAGATTTTGAGATTGTCTGATAATAGATTGACAGGAGAAATTCCTCATAGCTTTGGAGA 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 GGAGATTTTGAGATTGTCTGATAATAGATTGACCGGAGAAATTCCTCATAGCTTTGGAGA 1829
Query 1799 TCTAACTCGGCTCATGGAGTTACAACTAGGAGGCAATCTCTTGTCTGAAAGCATCCCAGT 1858
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1830 TCTTACTCGGCTCATGGAGTTACAACTAGGAGGCAATCTCTTGTCTGAAAACATCCCAGT 1889
Query 1859 GGAGCTCGGAAAGTTAACCTCTCTGCAAATCTCCCTCAACATTAGTCACAATAATCTCTC 1918
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1890 GGAGCTCGGGAAGTTAACCTCTCTGCAAATCTCCCTCAACATTAGTCACAATAATCTCTC 1949
Query 1919 AGGTACGATTCCAGACAGTTTAGGAAATCTACAAATGTTGGAGATACTTTACCTCAACGA 1978
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1950 AGGTACTATTCCAGACAGTTTAGGAAATCTACAGATGTTGGAGATACTTTACCTCAACGA 2009
Query 1979 CAACAAGCTATCAGGTGAGATCCCTGCATCAATTGGGAATCTCATGAGCCTCCTCATCTG 2038
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2010 CAACAAGCTTTCAGGTGAGATCCCTGCATCAATTGGGAATCTCATGAGCCTCCTCATCTG 2069
Query 2039 CAATGTCTCAAACAATAACTTGGTCGGAACAGTACCAGACACAGCCGTGTTCCAGCGGAT 2098
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CAATATCTCAAACAATAACTTGGTCGGAACAGTACCAGACACAGCCGTGTTCCAGCGGAT 2129
Query 2099 GGATTCATCAAACTTTGCTGGAAACCACGGTTTGTGTAACTCTCAGAGCAGCCACTGCCA 2158
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||
Sbjct 2130 GGATTCATCGAACTTTGCTGGAAACCATGGTTTGTGTAACTCTCAGAGAAGCCATTGTCA 2189
Query 2159 ACCACTTGTCCCACATTCTGATTCAAAGCTAAGTTGGTTAGTCAATGGTTCGCAGAGGCA 2218
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||
Sbjct 2190 ACCACTTGTCCCACATTCTGATTCAAAGCTAAATTGGTTAATCAACGGTTCGCAAAGGCA 2249
Query 2219 AAAGATCTTGACAATCACTTGTATGGTAATCGGCTCGGTTTTTCTTATCACTTTTCTTGC 2278
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2250 AAAGATCTTGACAATCACTTGTATTGTAATCGGGTCGGTTTTTCTTATCACTTTTCTTGG 2309
Query 2279 TATCTGTTGGGCAATAAAGCGGCGGGAACCAGCGTTTGTTGCACTTGAGGATCAAACAAA 2338
| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310 TCTCTGTTGGACAATAAAGCGGCGGGAACCAGCGTTTGTTGCACTTGAGGATCAAACAAA 2369
Query 2339 ACCAGATGTCATGGACAGCTACTATTTCCCTAAAAAAGGTTTCACATATCAAGGCCTTGT 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2370 ACCAGATGTCATGGACAGCTACTATTTCCCTAAAAAAGGTTTCACATATCAAGGCCTCGT 2429
Query 2399 GGATGCAACCAGAAACTTTTCCGAAGACGTGGTTTTAGGGAGAGGAGCGTGTGGAACTGT 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 2430 GGATGCAACCAGAAACTTTTCCGAAGACGTGGTTTTAGGGAGAGGAGCGTGTGGAACAGT 2489
Query 2459 CTACAAAGCTGAAATGTCAGATGGCGAGATGATAGCTGTAAAGAAGCTAAATTCTCGCGG 2518
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 2490 CTACAAAGCTGAAATGTCAGGTGGCGAGGTGATAGCTGTAAAGAAGCTGAATTCTCGCGG 2549
Query 2519 CGAAGGAGCTAGTTCTGATAATAGCTTCAGAGCTGAAATATCAACACTTGGAAAGATAAG 2578
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2550 TGAAGGAGCTAGTTCTGATAATAGTTTCAGAGCTGAGATATCAACTCTTGGAAAGATAAG 2609
Query 2579 GCACCGGAATATTGTGAAGCTATATGGTTTCTGCTATCACCAGAACTCAAATCTTCTCTT 2638
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 2610 GCACCGGAATATTGTGAAGCTATATGGTTTCTGCTATCACCAGAATTCAAATCTTCTCTT 2669
Query 2639 GTATGAGTACATGTCAAAAGGAAGCCTCGGCGAACAACTACAGCGAGGTGAGAAAAACTG 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2670 GTATGAGTACATGTCAAAAGGAAGCCTCGGCGAACAACTACAGCGAGGTGAGAAAAACTG 2729
Query 2699 CTTGTTGGATTGGAATGCTCGGTATAAAATCGCCCTCGGTGCTGCAGAGGGTCTGTGTTA 2758
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 2730 TTTGTTGGATTGGAATGCTCGGTATAGAATCGCCCTCGGTGCTGCAGAGGGTTTGTGTTA 2789
Query 2759 TCTCCATCATGATTGCAGACCTCAAATAGTTCATCGCGACATAAAATCGAACAACATTCT 2818
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2790 TCTCCATCATGATTGCAGACCTCAAATAGTCCATCGCGACATAAAATCGAACAACATTCT 2849
Query 2819 TCTTGATGAACTGTTCCAGGCTCATGTTGGAGATTTTGGCCTGGCTAAGTTGATTGATCT 2878
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2850 TCTTGATGAACGGTTCCAGGCTCATGTTGGAGATTTTGGCCTGGCTAAGTTGATTGATCT 2909
Query 2879 CTCTTACTCAAAGTCCATGTCAGCTGTTGCTGGGTCTTACGGATACATCGCTCCAGAATA 2938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2910 CTCTTACTCAAAGTCCATGTCAGCTGTTGCTGGGTCTTACGGATACATCGCTCCAGAATA 2969
Query 2939 TGCTTACACGATGAAGGTGACAGAGAAATGCGATATCTATAGCTTTGGAGTTGTGCTTCT 2998
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2970 TGCTTACACGATGAAGGTGACAGAGAAATGTGATATCTATAGCTTTGGAGTTGTGCTTCT 3029
Query 2999 GGAGCTAATAACAGGAAAGCCCCCAGTTCAACCGCTGGAGCAAGGAGGGGATCTAGTCAA 3058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3030 GGAGCTAATAACAGGAAAGCCCCCAGTTCAACCGCTGGAGCAAGGAGGGGATCTAGTCAA 3089
Query 3059 TTGGGTTAGAAGATCAATTCGTAACATGGTTCCAACCATTGAAATGTTTGATGCGAGGCT 3118
||||||| || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3090 TTGGGTTCGACGATCGATCCGTAACATGATTCCAACCATTGAAATGTTTGATGCGAGGCT 3149
Query 3119 AGATACGAATGATAAGAGAACACTTAATGAGATGTCTCTAGTCCTAAAAATTGCACTGTT 3178
|||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 3150 AGATACAAATGATAAGAGAACAGTTCATGAAATGTCTCTTGTCCTAAAGATTGCACTGTT 3209
Query 3179 CTGCACCAGCAACTCTCCAGCTAGTAGACCAACAATGAGAGAAGTTGTCGCTATGATTAC 3238
|||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 3210 CTGCACCAGCAATTCTCCAGCTAGTAGACCAACTATGAGAGAAGTGGTCGCTATGATTAC 3269
Query 3239 AGAAGCTCGGGGATCAAGCAGCCTCTCTACCTCATCCATTACATCAGAAACTCCTCTAGA 3298
|||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3270 AGAAGCTCGGGGATCAAGTAGCCTTTCTTCCTCATCCATTACATCAGAAACTCCTCTAGA 3329
Query 3299 AGAAGCAAACTCCTCCAAAGAAATT-GACTTTGTTGCATCACCTTGAAGTCAGCAAATAA 3357
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3330 AGAAGCAAACTCCTCCAAAGAAATTTGACTTTGTCGCATCACCTTGAAGTCAGCAAATAA 3389
Query 3358 ATCCAGTT 3365
||||||||
Sbjct 3390 ATCCAGTT 3397
> AT1G17232.1 | Symbols: | Potential natural antisense gene, locus
overlaps with AT1G17230 | chr1:5892300-5893652 REVERSE
LENGTH=1229
Length=1229
Score = 1007 bits (545), Expect = 0.0
Identities = 606/636 (95%), Gaps = 2/636 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 1664 TATCCAGAGACTTGACCTTAGTGGAAACAGGTTTTCCGGGTACATACCACAAGATCTTGG 1723
||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||
Sbjct 635 TATCCAGAGGCTTGACCTTAGTGGCAACAAGTTTTCCGGATACATAGCACAAGAGCTTGG 576
Query 1724 TCAGTTGGTGA-ATTTGGAGATTTTGAGATTGTCTGATAATAGATTGACAGGAGAAATTC 1782
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 575 TCAGTTGGT-ATATTTGGAGATTTTGAGATTGTCTGATAATAGATTGACCGGAGAAATTC 517
Query 1783 CTCATAGCTTTGGAGATCTAACTCGGCTCATGGAGTTACAACTAGGAGGCAATCTCTTGT 1842
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 CTCATAGCTTTGGAGATCTTACTCGGCTCATGGAGTTACAACTAGGAGGCAATCTCTTGT 457
Query 1843 CTGAAAGCATCCCAGTGGAGCTCGGAAAGTTAACCTCTCTGCAAATCTCCCTCAACATTA 1902
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 456 CTGAAAACATCCCAGTGGAGCTCGGGAAGTTAACCTCTCTGCAAATCTCCCTCAACATTA 397
Query 1903 GTCACAATAATCTCTCAGGTACGATTCCAGACAGTTTAGGAAATCTACAAATGTTGGAGA 1962
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 396 GTCACAATAATCTCTCAGGTACTATTCCAGACAGTTTAGGAAATCTACAGATGTTGGAGA 337
Query 1963 TACTTTACCTCAACGACAACAAGCTATCAGGTGAGATCCCTGCATCAATTGGGAATCTCA 2022
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336 TACTTTACCTCAACGACAACAAGCTTTCAGGTGAGATCCCTGCATCAATTGGGAATCTCA 277
Query 2023 TGAGCCTCCTCATCTGCAATGTCTCAAACAATAACTTGGTCGGAACAGTACCAGACACAG 2082
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 276 TGAGCCTCCTCATCTGCAATATCTCAAACAATAACTTGGTCGGAACAGTACCAGACACAG 217
Query 2083 CCGTGTTCCAGCGGATGGATTCATCAAACTTTGCTGGAAACCACGGTTTGTGTAACTCTC 2142
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 216 CCGTGTTCCAGCGGATGGATTCATCGAACTTTGCTGGAAACCATGGTTTGTGTAACTCTC 157
Query 2143 AGAGCAGCCACTGCCAACCACTTGTCCCACATTCTGATTCAAAGCTAAGTTGGTTAGTCA 2202
|||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 156 AGAGAAGCCATTGTCAACCACTTGTCCCACATTCTGATTCAAAGCTAAATTGGTTAATCA 97
Query 2203 ATGGTTCGCAGAGGCAAAAGATCTTGACAATCACTTGTATGGTAATCGGCTCGGTTTTTC 2262
| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 96 ACGGTTCGCAAAGGCAAAAGATCTTGACAATCACTTGTATTGTAATCGGGTCGGTTTTTC 37
Query 2263 TTATCACTTTTCTTGCTATCTGTTGGGCAATAAAGC 2298
||||||||||||||| | |||||||| |||||||||
Sbjct 36 TTATCACTTTTCTTGGTCTCTGTTGGACAATAAAGC 1
Score = 981 bits (531), Expect = 0.0
Identities = 573/594 (96%), Gaps = 0/594 (0%)
Strand=Plus/Minus
Query 946 CAGCTGAGATAGATTTTTCGGAGAATCAGTTAACAGGTTTCATCCCAATAGAGTTTGGTC 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 1229 CAGCTGAGATAGATTTTTCGGAGAATCAGTTAACAGGTTTCATACCAAAAGAGTTTGGTC 1170
Query 1006 AGATCCTGAATCTAAAACTACTTCATCTTTTTGAGAACATTCTTCTAGGTCCAATTCCTA 1065
| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 ATATCCTGAATCTCAAATTACTTCATCTTTTTGAGAACATTCTTCTAGGTCCAATTCCTA 1110
Query 1066 GGGAGCTTGGGGAATTGACACTGTTGGAGAAGCTAGACTTGTCTATCAATAAACTAAATG 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
Sbjct 1109 GGGAGCTTGGGGAATTGACACTGTTGGAGAAGCTAGACTTGTCTATCAATAGACTAAACG 1050
Query 1126 GTACTATCCCGCGAGAGCTTCAGTTCCTACCTTACCTTGTCGATTTGCAGCTTTTTGACA 1185
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1049 GTACTATCCCGCAAGAGCTTCAGTTCCTACCTTACCTTGTAGATTTGCAGCTTTTTGACA 990
Query 1186 ACCAGCTTGAAGGGACGATACCTCCTCTAATCGGTTTCTATAGCAGTTTTTCTGTTCTTG 1245
||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 989 ACCAGCTTGAAGGGAAGATACCTCCTTTAATCGGTTTCTATAGCAATTTTTCTGTTCTTG 930
Query 1246 ACATGTCTGCCAATTCTCTGTCTGGTCCAATTCCAGCCCATTTCTGCAGATTTCAGACGC 1305
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 929 ACATGTCTGCCAATTCTCTGTCTGGTCCAATTCCTGCCCACTTCTGCAGATTTCAGACGC 870
Query 1306 TAATACTTCTGAGTGTTGGTTCAAACAAGTTATCAGGAAACATCCCTCGTGATCTGAAAA 1365
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 TAATACTTCTGAGTCTTGGTTCAAACAAGTTATCAGGAAACATCCCTCGTGATCTGAAAA 810
Query 1366 CCTGCAAGTCACTGACAAAGCTAATGCTAGGCGATAACTGGCTAACAGGAAGCCTTCCCG 1425
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 809 CCTGCAAGTCACTGACAAAGCTAATGCTAGGCGATAACCAGCTAACAGGAAGCCTTCCCA 750
Query 1426 CTGAATTATTTAATCTTCAGAACCTTACTGCATTAGAGCTTCACCAAAACTGGTTATCAG 1485
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 749 TTGAATTATTTAATCTTCAGAACCTTACTGCATTAGAGCTTCACCAAAACTGGTTATCAG 690
Query 1486 GGAATATATCTGCAGACCTGGGGAAGCTGAAGAATTTAGAAAGACTGCGTCTAG 1539
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 689 GGAATATATCTGCAGACCTGGGAAAGCTGAAGAATTTGGAAAGACTGCGTCTAG 636
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 167457255734
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5