BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg920834
Length=2625
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 4169 0.0
AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superf... 1744 0.0
> AT1G18900.3 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr1:6528984-6532614 FORWARD LENGTH=3156
Length=3156
Score = 4169 bits (2257), Expect = 0.0
Identities = 2460/2561 (96%), Gaps = 2/2561 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 21 AATGATACGCCCAAAGCATATTAGTAACCTCTCAAGTACAGCAAGATCCTTTTTTCTGAA 80
|||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422 AATGATACGCGCTAAGCATATTAGTAACCTTTCAAGTACAGCAAGATCCTTTTTTCTGAA 481
Query 81 TGGATCGAGAACAAGTGTAGCTGACGGGAATTCGTGTGCGTACACGGACGATGAAACTTG 140
||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||
Sbjct 482 TGGATCGAGAACAAGTGTAACTGATGGGAATTCTTGTGTGTACTCGGATGATGAAAATTG 541
Query 141 TGTCTCGAGACGTCAGCAACTTAGGAAGGAAGCTGCACAGACTGAAAAACGACCATCCAG 200
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 TGTCTCGAAACGTCAGCAACTTAGGAAGGAAGCTGGACAGACTGAAAAACGACCATCCAG 601
Query 201 TATTCTCCCAAAGCCTTCAGTTGTGGGATGTATATTACCAGGAGAGGTAACTAAACCAGT 260
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 602 TATCCTCCCAAAGCCTTCAGTTGTGGGATGTATATTACCAGGAGAGGTAACAAAACCAGT 661
Query 261 GGTTCCAAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTATTGCCACAGCATGTTTCTTC 320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 GGTTCCAAAGAAGGTTGATGATTTTGGTCGGCCATCTCTATTGCCACAGCATGTTTCTTC 721
Query 321 TTCCCCTGCTTTGCCGCTTAAATCAAATTCGGTTAATTATGCATCAACCATCATTAGAGA 380
||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||
Sbjct 722 TTCCCCTGCCTTGCCGCTTAAATCACATTCCGTTAACTATGCATCAACCGTCGTTAGAGA 781
Query 381 GGAGGTGGAAGGTAAAGCTTCTTCAGAACCTATTGGGGATCAGATTTTTAAGGCCGGTAT 440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
Sbjct 782 GGAGGTGGAAGGTAAAGCTTCTTCAGAACCTATTGGGGATCAGATTTTCAAGGCTGGTAT 841
Query 441 TGTAGCAGTAAATTTTCTGTCAGATTTAGCGAATTGTAAGATTCCTTCGTATGATGGAGG 500
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 842 TGTTGCAGTAAATTTTCTGTCAGATTTATCGAATTGTAAGATTCCTTCATATGATGGAGG 901
Query 501 AAGTGAGGCATTTGGATTACCGAAAAGCTGTATGGTTGATCCAACACGGCCTATTTCAAG 560
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 AAGCGATGCATTTGGATTACCGAAAAGCTGTATGGTTGATCCAACACGGCCTATTTCAAG 961
Query 561 TGTCAAGTCGTCGAATGTGAAAGCTATAAGAAGAGAGCACTTTTCCAAAGTTTACCCTAG 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||
Sbjct 962 TGTCAAGTCGTCGAATGTGAAAGCTATAAGAAGAGAGCACTTTGCCAAAATTTACCCTAG 1021
Query 621 ATCAGCTGCAAAAGAGTCGTCAATCGGTAAAACTAGAAATCCCAGTAGCAATTTCCGAGG 680
|||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1022 ATCAGCTGCAAAAGAGTCGTCAGTTGGTACAACTAGAAATCCCAGTAGCAATTTTCGAGG 1081
Query 681 GGCCAAGGAAGCTGAAAGAACTGGATTTGTTAAAGGATTCAGACAAGTTTCTAATTCTGT 740
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1082 GGCCAAGGAAGCTGAAAGAACTGGGTTTGTTAAAGGATTCAGACAAGTTTCAAATTCTGT 1141
Query 741 GGTAGGAAAGTCATTACCCACAACAAATAACACATATGGCAAGAGGACAAGTGTGTTGCA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1142 GGTAGGAAAGTCATTACCCACAACAAATAACACATATGGCAAGAGGACAAGCGTGTTGCA 1201
Query 801 AAGACCCCATATTGATTCGAACAGGTTTGTGCCAAGCGGTTTCAGTAATTCTTCAATGGA 860
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 1202 GAGACCCCATATTGATTCGAACAGGTTTGTGCCAAGCGGTTTCAGTAATTCTTCAGTGGA 1261
Query 861 AATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAATTCCGGATA 920
|||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
Sbjct 1262 AATGATGAAAGGACCTTCAGGGACTGCTCTGACATCAAGACAGTATTGTAATTCCGGACA 1321
Query 921 CATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTCAGATGGGGCCCTGCTGCCGAAGA 980
||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 1322 CATTGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTACGAAGATTCAGGTGGGGGCCTGCTGCTGAAGA 1381
Query 981 GGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAACA 1040
||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1382 GGCCCTTCAAAATCTAGGTTTGAGGATAGACGCATACCAAGCAAACCAAGTTCTTAAGCA 1441
Query 1041 GATGAATGACTATGGAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1442 GATGAATGACTATGGAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGGCAACCTGGGTT 1501
Query 1101 TAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATT 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502 TAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTTGGTAATCTCGGTCGTGCTAAGCAATT 1561
Query 1161 TGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCAGCCAAACACAGT 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 1562 TGGTGCAATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTTAGAGATGGATGTCAGCCAAACACAGT 1621
Query 1221 TACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAA 1280
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622 TACATATAACCGACTTATCCACAGCTATGGCCGTGCCAATTACCTGAACGAAGCTATGAA 1681
Query 1281 CGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCT 1340
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682 TGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAACTTACTGTACCCT 1741
Query 1341 TATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATATGTACCAGAGAAT 1400
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1742 TATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATATGTACCAGAGAAT 1801
Query 1401 GCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGG 1460
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1802 GCAGGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAATAAACTGTCTTGG 1861
Query 1461 AAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAGGGTTG 1520
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 1862 AAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGTTGATCAAGGTTG 1921
Query 1521 TACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGACTTGCATGCCAAAGCGAGAAACTA 1580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGACTTGCATGCCAAAGCGAGAAACTA 1981
Query 1581 TCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGT 1640
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1982 TCAGAATGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAACGCTGGGTTTGAGCCTGACAAAGT 2041
Query 1641 GACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042 GACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCGAGGAAGCAGAGGC 2101
Query 1701 TGTTTTCACCGAGATGCAGCAGAAGAACTGGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTT 1760
|||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2102 TGTTTTCACCGAGATGCAACAGAAAAATTGGATTCCTGATGAGCCAGTTTATGGTCTTTT 2161
Query 1761 GGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAGGCAAT 1820
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2162 GGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGAAAAGGCGTGGCAATGGTATCAAGCAAT 2221
Query 1821 GCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCTCCTTAGTACCTTCCT 1880
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct 2222 GCTTCATGCTGGTCTGCGACCTAATGTTCCTACATGCAACTCCCTTCTTAGTACCTTCCT 2281
Query 1881 TAGGGTTAACAAGATAGCTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACATGCTGGCACTTGGTCT 1940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2282 TAGGGTTAACAAGATAGCTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACATGCTGGCGCTTGGTCT 2341
Query 1941 ACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCACAGATGGTCGATCAAA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
Sbjct 2342 ACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCACGGATGGTCGGTCAAA 2401
Query 2001 ACTTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAGCACAGGTCATCCAGCACACATGTT 2060
|||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 2402 ACTTGATATGGGTTTCTGTGGCCAGTTGATGGCAAGCACAGGTCATCCAGCACATATGTT 2461
Query 2061 TCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGTGCGCAACCATGCGAACAA 2120
|||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462 TCTCCTCAAGATGCCAGCTGCGGGTCCGGATGGCGAAAACGTGCGCAACCATGCGAACAA 2521
Query 2121 CTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGT 2180
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2522 TTTCCTGGATCTTATGCATAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGCGAGGACTCGTGGATGCGGT 2581
Query 2181 GGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGGGATCTGTTTGGGAAGTTGC 2240
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct 2582 GGTTGACTTTCTACATAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCCGGATCTGTCTGGGAAGTTGC 2641
Query 2241 TGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTAT 2300
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2642 TGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCATTAAGGGAGAAAAGCTGCAGCTACTGGCTTAT 2701
Query 2301 CAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACTCTTGCTTG 2360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 2702 CAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGCTGTCTAGGACGCTTGCTTG 2761
Query 2361 GTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCT-CAGGAACTTTCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTG 2419
|||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2762 GTTCCGTAAGCAGATGTTAG-CTTCAGGAACTTGCCCTTCTCGGATTGATATAGTAACTG 2820
Query 2420 GTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAAGAGC 2479
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 2821 GTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGTACATCAATGGTGAGACAAGCAGTTGAGGAGC 2880
Query 2480 TTCTCAACATCTTTGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCGGGTTGTTTCGTTG 2539
| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 2881 TGCTGAACATCTTTGGTTCACCGTTTTTCACGGAGAGTGGAAACTCAGGTTGTTTCGTTG 2940
Query 2540 GATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCTGCAGTCTCAT 2580
|| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2941 GAAGCGGAGAGCCTCTTAACAGATGGTTGCTGCAGTCTCAT 2981
> AT1G74750.1 | Symbols: | Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily
protein | chr1:28086800-28089367 FORWARD LENGTH=2568
Length=2568
Score = 1744 bits (944), Expect = 0.0
Identities = 1496/1764 (85%), Gaps = 32/1764 (2%)
Strand=Plus/Plus
Query 853 TCAATGGAAATGGTGAAAGGGCCTCCAGGGACTGCTCTGACATCAAGGCAGTATTGCAAT 912
|||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| ||
Sbjct 817 TCAAGGGAAATGATGAAAGTGACTCCAAGGACTGCTCCAACACCTAGGCAGCATTGTAA- 875
Query 913 TCC-GGATACATAGTGGAAAATGTTTCCAGCGTTTTGCGAAGATTC-AGATGGGGCCCTG 970
|| ||||| | || ||||||||||| || | ||||| |||||| || ||||| | ||
Sbjct 876 CCCTGGATATGTTGTAGAAAATGTTTCTAGTATATTGCGGAGATTCAAG-TGGGGACATG 934
Query 971 CTGCCGAAGAGGCCCTTCAAAATCTCGGTTTGAGGATCGATGCATACCAAGCAAACCAAG 1030
||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||
Sbjct 935 CTGCCGAAGAGGCCCTTCACAATTTTGGTTTCAGGATGGATGCATACCAAGCTAATCAAG 994
Query 1031 TTCTTAAACAGATGAATGACTATG-GAAATGCTCTTGGTTTCTTCTACTGGTTAAAAAGG 1089
||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||
Sbjct 995 TTCTTAAGCAGATGGATAATTATGCG-AATGCGCTTGGTTTCTTCTATTGGCTGAAAAGG 1053
Query 1090 CAACCTGGGTTTAAGCATGATGGGCATACTTATACCACTATGGTGGGTAATCTCGGTCGT 1149
||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||
Sbjct 1054 CAACCTGGGTTCAAGCATGATGGGCATACGTATACCACTATGGTAGGTAATCTTGGTCGT 1113
Query 1150 GCTAAGCAATTTGGTGCA-ATAAACAAGCTCCTCGATGAGATGGTCAGAGACGGATGTCA 1208
|| |||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||| |
Sbjct 1114 GCAAAGCAATTCGGTG-AGATAAACAAGCTTCTTGATGAGATGGTTAGGGATGGGTGTAA 1172
Query 1209 GCCAAACACAGTTACATATAATCGACTTATCCATAGCTATGGCCGCGCCAATTACCTGAA 1268
|||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||
Sbjct 1173 GCCAAATACTGTTACATATAACCGACTCATCCATAGCTACGGGCGTGCAAATTACCTCAA 1232
Query 1269 CGAAGCTATGAACGTGTTCAATCAAATGCAAGAGGCTGGATGCAAACCTGACCGTGTAAC 1328
||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||
Sbjct 1233 AGAAGCGATGAATGTTTTTAATCAGATGCAAGAGGCTGGTTGTGAGCCTGACCGTGTAAC 1292
Query 1329 TTACTGTACCCTTATAGACATTCATGCTAAAGCTGGATTTCTAGATATTGCCATGGATAT 1388
|||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct 1293 TTACTGTACCCTGATAGATATCCATGCTAAAGCTGGATTTCTTGACATTGCCATGGATAT 1352
Query 1389 GTACCAGAGAATGCAAGCAGGAGGTCTTTCTCCGGATACTTTCACTTACAGTGTCATAAT 1448
|||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||
Sbjct 1353 GTACCAAAGAATGCAAGAAGCAGGGCTTTCTCCTGATACCTTCACCTACAGTGTTATAAT 1412
Query 1449 AAACTGTCTTGGAAAAGCTGGACATTTACCCGCTGCACACAAGCTCTTTTGTGAGATGGT 1508
|||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||
Sbjct 1413 AAACTGTCTTGGAAAAGCGGGCCATTTACCTGCTGCCCATAGGCTCTTTTGTGAAATGGT 1472
Query 1509 TGATCAGGGTTGTACCCCTAACTTGGTCACATACAACATCATGATGGAC-TTGCATGCCA 1567
|| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||
Sbjct 1473 TGGTCAAGGTTGTACTCCTAATTTGGTCACATTCAACATCATGATAG-CTTTGCATGCCA 1531
Query 1568 AAGCGAGAAACTATCAGAGTGCGTTGAAGCTTTACCGTGACATGCAAAATGCTGGGTTTG 1627
| ||| | || ||| ||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||
Sbjct 1532 AGGCGCGGAATTATGAGACTGCGTTGAAGCTCTACAGAGACATGCAAAATGCCGGGTTTC 1591
Query 1628 AGCCTGACAAAGTGACATACAGCATTGTGATGGAGGTGCTTGGACACTGTGGATATCTCG 1687
| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||
Sbjct 1592 AACCTGACAAAGTGACCTACAGTATTGTTATGGAGGTACTTGGACACTGTGGATTTCTCG 1651
Query 1688 AGGAAGCAGAGGCTGTTTTCACCGAGATGCAGCAG-AAGAACTGGATTCCTGATGAGCCA 1746
|||||||||||| ||||||| | |||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||
Sbjct 1652 AGGAAGCAGAGGGTGTTTTCGCTGAGATGCAAC-GTAAGAACTGGGTTCCTGATGAACCG 1710
Query 1747 GTTTATGGTCTTTTGGTGGATTTGTGGGGAAAAGCAGGTAATGTGGA-AAAGGCGTGGCA 1805
||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||| || |||||
Sbjct 1711 GTTTACGGTCTTTTGGTGGACTTGTGGGGAAAAGCTGGCAATGTAGATAAA-GCTTGGCA 1769
Query 1806 ATGGTATCAGGCAATGCTTCATGCTGGTCTGCTACCTAATGTTCCTACATGCAATTCCCT 1865
|||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||||||
Sbjct 1770 GTGGTATCAAGCAATGCTTCAAGCCGGTCTGCGACCTAATGTTCCCACCTGCAATTCCCT 1829
Query 1866 CCTTAGTACCTTCCTTAGGGTTAACAAGATAG-CTGAAGCTTATGAGTTATTACAAAACA 1924
|| || || ||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||| ||
Sbjct 1830 TCTCAGCACTTTCCTTAGGGTCCACAGGAT-GTCTGAAGCCTATAACTTATTACAAAGCA 1888
Query 1925 TGCTGGCACTTGGTCTACGCCCCTCTTTGCAGACATACACGTTACTCTTGAGCTGTTGCA 1984
||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||
Sbjct 1889 TGCTGGCGCTTGGTCTACATCCTTCTTTGCAGACATACACATTGCTATTGAGTTGTTGCA 1948
Query 1985 CAGATGGTCGATCAAAAC-TTGACATGGGTTTTTGTGGCCAGCTGATGGCAAG-CACAGG 2042
|||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||
Sbjct 1949 CAGATGCTCGTTC-AAACTTTGACATGGGCTTTTGTGGCCAGCTAATGGC-AGTCTCAGG 2006
Query 2043 TCATCCAGCACACATGTTTCTCCTCAAGATGCCAGCAGCGGGTCCAAATGGCGAAAACGT 2102
|||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| ||||| |||| ||
Sbjct 2007 TCATCCGGCTCACATGTTTCTGCTCAAAATGCCACCTGCAGGTCCTGATGGCCAAAAAGT 2066
Query 2103 GCGCAACCATG-CGAACAACTTCCTGGATCTTATGCACAGCGAGGACAGGGAGAGCAAGC 2161
||| | |||| | | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||
Sbjct 2067 GCGTGATCATGTC-AGCAACTTCCTTGATTTTATGCACAGTGAGGACAGAGAGAGCAAGC 2125
Query 2162 GAGGACTCGTGGATGCGGTGGTTGACTTTCTACACAAGTCCGGGCAAAAAGAAGAGGCGG 2221
|||||||| |||| || || || || ||||| |||||||| || | |||||||||||| |
Sbjct 2126 GAGGACTCATGGACGCAGTAGTGGATTTTCTCCACAAGTCAGGTCTAAAAGAAGAGGCTG 2185
Query 2222 GATCTGTTTGGGAAGTTGCTGCACAAAAGAATGTGTTTCCTGATGCGTTAAGGGAGAAAA 2281
| || || |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||
Sbjct 2186 GCTCGGTATGGGAAGTGGCTGCAGGTAAGAATGTGTATCCAGATGCATTGAGGGAGAAAA 2245
Query 2282 GCTGCAGCTACTGGCTTATCAATCTCCATGTAATGTCAGAGGGAACTGCAGTCACCGCGC 2341
||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |
Sbjct 2246 GCTACAGCTATTGGCTTATAAATCTCCATGTAATGTCGGAAGGAACTGCAGTCATCGCAC 2305
Query 2342 TGTCTAGGACTCTTGCTTGGTTCCGTAAGCAGATGTTAGTCTCAGGA-ACTTTCCCTTCT 2400
| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||
Sbjct 2306 TTTCCAGGACACTTGCATGGTTCCGTAAGCAGATGTTGGTTTCAGGAGACTGT-CCTTCA 2364
Query 2401 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGTAGTAGAGTCACCGGCACATCAATGGTG 2460
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||
Sbjct 2365 CGGATTGATATAGTAACTGGTTGGGGAAGACGAAGTAGAGTCACAGGCACGTCGATGGTT 2424
Query 2461 AGACAAGCAGTTGAAGAGCTT-CTCAACATCTTTGG-TTCACCGTTTTTCACGGAGAGTG 2518
|||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |
Sbjct 2425 AGACAAGCAGTTGAGGAA-TTGCTCAACATATTCAACTTC-CCGTTTTTCACTGAGAACG 2482
Query 2519 GAAACTCGGGTTGTTTCGTTGGATGCGGAGAGCCTCTCAACAAATGGTTGCT-GCAGTC- 2576
| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| | | ||
Sbjct 2483 GGAACTCAGGCTGTTTTGTAGGAAGCGGAGAGCCTCTCAAGAATTGGTTGCTTGAA-TCA 2541
Query 2577 TCATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2600
| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2542 T-ATGTTGAGAGGATGCATTTGCT 2564
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 130333717914
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5