BLASTN 2.2.26+
Reference:
Zheng Zhang, Scott Schwartz, Lukas Wagner, and Webb Miller (2000),
"A greedy algorithm for aligning DNA sequences", J Comput Biol 2000;
7(1-2):203-14.
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
33,602 sequences; 51,074,197 total letters
Query= Ahg921218
Length=6049
Score E
Sequences producing significant alignments: (Bits) Value
AT1G22060.1 | Symbols: | LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 23... 9766 0.0
AT1G22000.1 | Symbols: | FBD, F-box and Leucine Rich Repeat do... 632 1e-179
> AT1G22060.1 | Symbols: | LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN:
23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST
Arabidopsis thaliana protein match is: FBD, F-box and Leucine
Rich Repeat domains containing protein (TAIR:AT1G22000.1);
Has 84739 Blast hits to 38714 proteins in 2257 species: Archae
- 1436; Bacteria - 11314; Metazoa - 40747; Fungi - 7706;
Plants - 4675; Viruses - 308; Other Eukaryotes - 18553 (source:
NCBI BLink). | chr1:7773063-7781499 REVERSE LENGTH=6614
Length=6614
Score = 9766 bits (5288), Expect = 0.0
Identities = 5802/6055 (96%), Gaps = 16/6055 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 1 TGTTTTGA-TATTTTGAGTAAAATGTCGAGACTGGCAAAATGGAAGCTGGAGAAAGCCAA 59
|||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 TGTTTTGATTTTTTTGAGT--AATGTCGAGACTGGCTAAATGGAAGCTGGAGAAAGCCAA 342
Query 60 AGTCAAAGTCGTCTTTCGATTGCAGTTTCACGCTACCCATGTTCCACAAGCGGGATGGGA 119
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 343 AGTCAAGGTCGTCTTTCGATTGCAGTTTCACGCTACCCATGTTCCACAAGCGGGTTGGGA 402
Query 120 CAAACTATTCATTTCTTTCATACCCGCTGACTCCGTAAAAGCTACAGCAAAGACAACTAA 179
||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 CAAACTATTTATATCTTTCATTCCCGCTGACTCCGTAAAAGCTACAGCAAAGACAACTAA 462
Query 180 AGCACTTGTGAGAAATGGAACTTGTAAGTGGGGGGATCCAATCTATGAAACTACACGGCT 239
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct 463 AGCACTTGTGAGAAATGGAACTTGCAAGTGGGGGGATCCTATCTATGAAACTACAAGGCT 522
Query 240 GCTTCAGGATACTAGGACCAAGCAATATGATGAAAAACTTTATAAGATTGTTGTGGCTAT 299
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 523 GCTTCAGGATACTAGGACCAAGCAATTTGATGAAAAACTTTATAAGATTGTTGTCGCTAT 582
Query 300 GGGTACTTCTAGATCTAGTATACTTGGAGAGGCTATGATCAACCTTGCTGAATATGCTGA 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 GGGTACTTCTAGATCTAGTATACTTGGAGAGGCTATGATCAACCTTGCTGAATATGCTGA 642
Query 360 TGCCTTAAAACCTTTTGCTGTGGTATTGCCCTTGCAAGGCTGTGATTCAGGAGCTACCTT 419
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
Sbjct 643 TGCCTTAAAACCTTTTGCTGTGATATTGCCCTTGCAAGGCTGTGATCCAGGAGCTATCTT 702
Query 420 ACATGTCACTATACAGCTGTTAACTTCAAAAACTGGTTTCAGAGAGTTCGAGCAGCAAAG 479
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 703 ACATGTCACTATACAGCTGTTAACCTCAAAAACTGGTTTCAGAGAGTTCGAGCAGCAAAG 762
Query 480 AGAACTCAGTGAGAGGGGACCATCAACGACCTCTGACCATAGCAGCCCTGACGAATCTTC 539
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 763 AGAAATCAGTGAGAGGGGACCATCAACGACCCCTGACCATAGCAGTCCTGACGAATCTTC 822
Query 540 TCGTTGCAGGATTTCACCTTCTGATGAGACTCTTAGTCATGTTGATAAGACAACTATGAG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||
Sbjct 823 TCGTTGCAGGATTTCACCTTCTGATGAGACTCTTAGTCATGTTGATAAGACAAATATAAG 882
Query 600 AGGGAGTTTCAAAGAAAAGTTCCGAGATAATTCTTTAGTGGAAGAAACTGTGGGGCCAAA 659
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||
Sbjct 883 AGGGAGTTTCAAAGAAAAGTTCCGAGACAATTCTTTAGTGGAAGAAACAGTGGGGCTAAA 942
Query 660 TGACCTTGATTCAGGATTGGGATTTGATGTCTCTTCAAACACATCAGGGAGCCTAAACGC 719
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 TGACCTTGATTCAGGATTGGGTTTTGATGTCTCTTCAAACACATCAGGGAGCCTAAACGC 1002
Query 720 TGAGAAGCATGATATATCCAACACAAATGAAATTGACAGCCTCAAAAGTGTGGTATCTGG 779
|||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 TGAGAAACATGATATATCCAGCATAAACGAAGTTGACAGCCTCAAAAGTGTGGTATCTGG 1062
Query 780 AGATCTGAGTGGACTTGCTCAGAGCCCGCAGAAAGATAAAGACGGTCATGAGTGGCATCA 839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||
Sbjct 1063 AGATCTGAGTGGACTTGCTCAGAGCCCGCAGAAAGAGAAAGACAGTCTTGGGTGGCAACA 1122
Query 840 TGGCTGGGGTTCAGACTATCTTGGTAAGAATAGCGAGTTGGGGAATGCAATAGAAGACAA 899
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1123 TGGCTGGGGGTCAGACTATCTTGGTAAGAATAGCGATTTGGGCAATGCAATAGAAGACAA 1182
Query 900 CAATAAGCTTAAAGGATTCTTGGAAGACATGGAATCATCCATTAATGAGATTAAGATTGA 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 CAATAAGCTTAAAGGATTCTTGGAAGACATGGAATCATCCATTAATGAGATTAAGATTGA 1242
Query 960 AGTGAGTTCGCTACAGTGCCATGCAGATGATATAGGTTCCAAAGCTCAAGATTTTTCTCA 1019
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 AGTGAGTTCGCTGCAGTGCCATGCAGATGATATAGGTTCCAAAGCTCAAGATTTTTCTCA 1302
Query 1020 AATACTTATATCAGAGATTGGTTCTGGGGATCATTTAGTCAGAGAAGTATCTGTGCTGAA 1079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 AATACTTATATCAGAGATTGGTTCTGGGGATCATTTGGTCAGAGAAGTATCTGTGCTGAA 1362
Query 1080 ATCAGAGTGCTCAAAGTTAAAAGAAGAGATGGAGCGCTTACGTAATGTCAAATCACACGT 1139
||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
Sbjct 1363 ATCAGAGTGTTCAAAGTTAAAAGAAGAGATGGAGCGATTACGTAACGTCAAATCACACGT 1422
Query 1140 TCTATATAATAGCAAAGACCAAGATAATGTTCCACACAGTCTACAACTAAGATGGCGGCA 1199
||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1423 TCTATTTAATAGCAAAGATCAAGATAATGTTCCCCACAGTCTACAACTAAGATGGCTGCA 1482
Query 1200 GGGACTTTTAGTTGTAGAGGATAACATAAGAGAAATTCAAAACAAAGTTTGCTATGGCTA 1259
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1483 GGGACTTTTAGTTGTAGAGGATAACATAAGAGAAATTCAAAACAAAGTATGCTATGGCTA 1542
Query 1260 CCATGACAGAGACTTAAGATTGTTCCTCTCAGACTTTGAGTCTCTGCTTGGAGTTCTACA 1319
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 1543 CCATGACAGAGACTTAAGATTGTTCCTCTCAGACTTTGAGTCTCTGCTCGGAGTTCTACA 1602
Query 1320 GGATATTAAAAGGCAGATTG-GCCAGCCTATATCTCACTTCAGCACAGTATCATCTGAGA 1378
|||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
Sbjct 1603 GGATTTTAAAACGCAGATTGAG-CAGCCTATATCTCACTTCAGCACTGTACCATCTGAGA 1661
Query 1379 AAATCATCATGACCGATAATAAAGAGAGAGGCATGTCGAAAGCAGAGCATTTTGTATCAG 1438
||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1662 AAATCATCATGACTGATAGTAAAGAGAGAGGCCTTTCGAAAGCAAAGCATTTTGTATCAG 1721
Query 1439 GCTCTGAGGTTGACACTGATATTTATCAACCAGAACTTGATCCACTTCAATATCTTGGTA 1498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1722 GCTCTGAGGTTGACACTGATATTTATCAACCAGAACTTGATCCGCTTCAATATCTTGGTA 1781
Query 1499 TGCCTGATCTTACTTCTCGTGAACCCAATTCAGCAGATTCTGTTAGTGCCATGAGAGATA 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1782 TGCCTGATCTTACTTCTCGTGAACCCAATTCAGCAGATTCTGTTAGTGCCATGAGAGATA 1841
Query 1559 AAATACTCGAGCTTGTACGAGGGCTGGACGAGTCTAAAGCTGAACGTGATAGCCTTACCA 1618
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842 AAATACTTGAGCTTGTACGAGGGCTGGACGAGTCTAAAGCTGAACGTGATAGCCTTACCA 1901
Query 1619 AGAAAATGGATCAGATGGAGTGCTATTACGAATCTCTGGTCCAGGAGCTTGAGGAAACTC 1678
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902 AGAAAATGGATCAGATGGAATGCTATTACGAATCTCTGGTCCAGGAGCTTGAGGAAACTC 1961
Query 1679 AAAGGCAGTTGCTAGTAGAGTTACAGAATCTAAGGACTGAACATTCCACGTGCCTCTATA 1738
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1962 AAAGGCAGTTGCTAGTAGAGTTACAGAGTTTAAGGACTGAACATTCCACGTGCCTCTATA 2021
Query 1739 GTATCTCTGGCGCTAAGGCTGAGGTGGAAACGTTGCGTCACGATATGAATGAGCAAACAC 1798
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2022 GTATCTCTGGCGCTAAGGCGGAGATGGAAACGTTGCGTCACGACATGAATGAGCAAACAC 2081
Query 1799 TAAGGTTTTCTGAGGAGAAGAAAACTTTAGATTCGTTGAATGAAGAACTGGATAAACGAG 1858
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2082 TAAGGTTTTCTGAGGAGAAGAAAACTTTGGATTCTTTTAATGAAGAACTGGATAAACGAG 2141
Query 1859 CTATGGCTGCGGAGGCAGCACTTAAAAGAGCCCGCTTGAATTATTCTATTGCTGTCAACC 1918
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 CTATGGCTGCAGAGGCAGCACTTAAAAGGGCCCGCTTGAATTATTCTATTGCTGTCAACC 2201
Query 1919 ATTTGCAGAAGGATCTTGAATTGCTTTCATCCCAGGTTGTATCTATGTTTGAGACCAATG 1978
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 2202 ATTTGCAGAAGGATCTTGAATTGCTTTCATCTCAGGTTGTATCCATGTTTGAGACCAATG 2261
Query 1979 AGAACCTCATTAAGCAAGCCTTTCCAGAACCTCCACAAAGCTTTCACGAATGCATTCAAT 2038
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2262 AGAATCTCATTAAGCAAGCCTTTCCAGAACCTCCACAAAGCTTTCACGAATGCATTCAAT 2321
Query 2039 CAACAGATGATTCAAATCCTGAGAAACAGGACACTCGTGATGTAAAACTCATACAGTTTC 2098
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2322 CAACAGATGATTCAATTTCTGAGAAACAGGACACTCGTGATGTAAAACTCATACAGTTTC 2381
Query 2099 AGAATGAGAAAAAGGGGATGAAGGAACGGCCTTTAAAAGGTGATATTATTCTTCTAGAAG 2158
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2382 AGAATGAGAAAAAGGGGATGAAGGAACGCCCTTTAAAAGGTGATATTATTCTTCTAGAAG 2441
Query 2159 ATTTGAAGAGATCTCTTCATGTGCAAGAAAGCTTATATCAAAAAGTTGAAGAAGAACTCT 2218
|| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442 ATATGAAGAGATCTCTTCATGTGCAAGAAAGCTTGTATCAAAAAGTTGAAGAAGAACTCT 2501
Query 2219 ATGAGATGCATTCAAGGAACTTATATCTGGAAGTATTCTCAAACATTCTACGAGAAACTG 2278
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2502 ATGAGATGCACTCAAGGAACTTATATCTGGAAGTATTCTCAAACATTCTACGAGAAACTT 2561
Query 2279 TTCTTGAAGCAGGTGTTGACATAAGGATCATGAAAGCGAAAATTGATGAACTTGGATGGC 2338
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TTCTTGAAGCAAGTGTTGACATAAGGATCATGAAAGCGAAAATTGATGAACTTGGATGGC 2621
Query 2339 AGCTGGAGCTTTCAACAGAGGCCAAGGAAATATTGAAGCAGAGGCTGGATATTACTTTGG 2398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622 AGCTGGAGCTTTCAACAGAGGCCAAGGAAATATTGAAGCAGAGGCTGGATATTACTTTGG 2681
Query 2399 ACGAGGTTTGCTCCCTGAATGAGGAGAAAACCACATGCATTGCCAAATGGAATGCTGTAG 2458
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2682 ACGAGGTTTGCTCCCTGAAAGAGGAGAAAACCACATGCATTGCCAAATGGAATGCTGTAG 2741
Query 2459 CTTTGCAGAATCAAAGTTTAGAGGCAAATTTGCAGAATATTACTCACGAAAACCTCATCC 2518
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2742 CTTTGCAGAATCAAAGCTTAGAGGCAAATTTGCAGAATATTACTCACGAAAACCTCATCC 2801
Query 2519 TTCTGCAAAAGATTGATGAACTGGAATCTGTAGCGGTGGAGTCCAAGAATTGGAAGACCA 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||
Sbjct 2802 TTCTGCAAAAGATTGATGAACTGGAATCTGTAGTGTTGGAGTCTAAGAGTTGGAAGACCA 2861
Query 2579 ATTATGAGACATGCATTTGTGAGAAGAATGAGCTTGCAGAGCTTATGGAGAAAGAAGCGG 2638
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862 ATTATGAGACATGCATTTGTGAGAAAAAAGAGCTTGCAGAGCTTATGGAGAAAGAAGCGG 2921
Query 2639 TGGAAAAAGCTCATT-TCCGGACAAGGCTTGCTACTGTGCAAGCTGAGTTTGATGCTGTG 2697
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 2922 TGGAAAAAGCTCATTAT-CGGACAAGGCTTGCTACTGTGCAGGCTGAGTTTGATGCTGTG 2980
Query 2698 AGAGGTAAGTTTGATGATCTGGCAACTGCAAATGGAAATCTACATCAGAACCTCAGTAGT 2757
|||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
Sbjct 2981 AGAGGTAAGTTTGATGATTTGGCTACTGCAAATGGAAATCTACAGCAGAATCTCAGTAGT 3040
Query 2758 CTGAAGGAGAAGTTGATAAACACGTTATGCTGCTACAATGAAAAACTCATTTCATTGCCC 2817
|||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||
Sbjct 3041 CTGACGGACAAGTTGATAAACACGTTAGGCTGCTACAATGAAAAACTCGTTTCCTTGCCC 3100
Query 2818 CTGTGGGAAGAGGGAGTGGATCTTGATTTGGAGTCCCATGATTTAACAGAGCAGCTTGAT 2877
| ||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3101 CAGTGGG-A-A-GGAGTGGATCTTGATTTTGAGTCCCATGATTTAACAGAGCAGCTTGAT 3157
Query 2878 AAATTCTTGTGTAAGATATATGAAAAATGTTTCGTACTTATATCAGAGTATGATGACCTG 2937
||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||
Sbjct 3158 AAATTCTTGTGTAAGATATGTGAAAAGTGTTTCGTACTTATATCAGAGAATAATGGCCTG 3217
Query 2938 ATTG-AAGAAAAATCCATGATAGAGTCATATTTAAGGGCTGCTGAGTCTGATGTTATGGA 2996
| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3218 A-TGAAAGAAAAATCCATGACAGAGTCATATTTAAGGGCTGCTGAGTCTGATGTTATGGA 3276
Query 2997 GCTCAAGCAGAAGCATGAGAATGATGTACAATGTCTGGTCACTAAACTAGAAGCTTCCAC 3056
||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 3277 GCTCAAGCAGATGCATGAGAATGATGTACAATGTATGGTCACTAAATTAGAAGCTTCCAC 3336
Query 3057 TGCCCTCCTCCAGAGACTGCAGTTGGAAACTGAGTCTATCGTGGGCAAAATGAAGGTTAT 3116
||||||||||| |||||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||
Sbjct 3337 TGCCCTCCTCCGGAGACTGCAGTTGGAAACCGAATCGGTCATGGATAAAATGAAGGTTAT 3396
Query 3117 TACTGAAGCTGAACAAAACTATGAGAGCCGTAACTTGGACTTTCTTTCTCGTCTTGACTA 3176
|||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
Sbjct 3397 TACTGAAGATGAACAAAACTATGAGAGCCGTCACTTGGACCTTCTTTCTCGTCTTGACCA 3456
Query 3177 TTTTGAGAATGAAATGCATCTAATTGTGTCCAAGAATGAGGGACTTGGCCAAGAGATTAG 3236
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3457 TTTTGAGAATGAAATGCATCTACTTGTGTCCAAGAATGAGGGACTTGGTCAAGAGATTAG 3516
Query 3237 AGAATTAAGCTCTGTAGCTGTTGAACATGGAAGAACCAAGCTGCTTGTGGAAGAACTTGC 3296
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 3517 TGAATTAAGCTCTGTAGCAGTTGAACATGGAAGAACCAAGCTGCTTGTGGAAGAACTGGC 3576
Query 3297 TGAGGAAAACAAACGTGTTCTGGTTTCTCTTCAGGATAAATCTCAGGAAACTTTGGGTCT 3356
||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3577 TGAGGAAAAGAAACGTGTTCTGGTTTCACTTCAAGATAAATCTCAGGAAACTTTGGGTCT 3636
Query 3357 TGTGCGTGAGCTTGAAAATTTAAAGAAAACGTTTGACCACGAGTTGAGACTTGAAAGAAG 3416
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3637 TGTGCGTGAGCTTGAAAATTTAAAGAAAACGTTTGACCACGAGTTGAGACTTGAAAGAAA 3696
Query 3417 CTCGAGGCAGGAACTAGAAATTAAAATGCAAGATCTTACATATGAGTTGATCGCCAAAAG 3476
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||
Sbjct 3697 CTTGAGGCAGGAACTAGAAATTAAAATGCAAGATCTTACATCTGAGGTGATCGCCAAAAG 3756
Query 3477 TTCCAAATTGATGAGCTTTGATGAGCAAAGCTCTGAGTTGGTCCGTCTTAAGCAAATGGT 3536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3757 TTCCAAATTGATGAGCTTTGATGAGCAAAGCTCTGAGTTGGTCCGTCTTAAGCAAATGGT 3816
Query 3537 TTCCGATTTGGAGCTGGAGAAGGCAACCCACACTCATCGTCTGACAAGATATGAAACATC 3596
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3817 TTCCGATCTGGAGCTGGAGAAGGCAACTCACACTCATCGTCTGACAAGATATGAAACATC 3876
Query 3597 TCTGAGAAGCTTTACTCGTGATTCATCATATATTTCCGATTTGGAATCTCAGTTACTTGA 3656
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3877 TCTGAGAAGCTTGACTCGTGATTCATCATATATTTCCGATTTGGAATCTCAGATACTTGA 3936
Query 3657 AATGATGGAATTCTCAGTAGCAGCAGATATCCAGATTGTTTTCACAAGAACGGAATGGGA 3716
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 3937 AATGATGGAAATCTCAGTAGCAGCAGATATCCAGATTGTTTTCACAAGAACTGAATGGGA 3996
Query 3717 GACTTATGCTTACAAGCTCCACAAGGAACATTTTGAGGTACTGACTGCGTTCAATGACTC 3776
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct 3997 GACTTATGCTGACAAGCTCCACAAGGATCATTTTGAGGTACTGACTGCCTTCAATGACTC 4056
Query 3777 TCGTAATGTAGGAGCTCAGCATATGGATGCTAATATAAAGTTGTTGGCAGATCTCGACTC 3836
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4057 TCGTAATGTAGGAGCTCAGCATATGAATGCTAATATAAAGTTGTTGGCAGATCTCGACTC 4116
Query 3837 CGTAAAAACAGAATTGAAAACTGAGAGAAGTTTGAGAAACAACTTAGACAGAAGAGTTGA 3896
| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4117 CCTAAAATCAGAATTGAAAATTGAGAGAAATTTGAGAAACAACTTAGACAGAAGAGTTGA 4176
Query 3897 AGAACTCGCCTCTGAGTTAGATGAAAAGCATTTGCTGTTGGAGAACTTTGATTTGCAGAA 3956
||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||
Sbjct 4177 AGAACTCACCTCTGAGTTAGATGAAAAACATTTGTTGTTAGAGAACTTTGATTTGCAGAA 4236
Query 3957 ATCTCAAGTGGAACTTTTGGAGAAGATGGCAGCTGAGCTGGAATCTGCAAAGTCTTCTCA 4016
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||
Sbjct 4237 ATCTCAAGTGGAACTTTTGGAGAAGATGGTAGCTGAGCTGGAATCTGAAAAGTCTTTTCA 4296
Query 4017 ACGTTTGGAGTATGTTAGAAATGCTCATCGAGAGTCTTCTTTTATAGAAGAACTGTTTCA 4076
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 4297 ACGTTTGGAGTACGTTAGAAATGCTCATCGAGAGTCTTCTTTCATAGAAGAACTGTTTCA 4356
Query 4077 ATGTCTAATGGCTGCAGATGTTCAGCTTATTTTTACAAAGATCCAGTCTGAGATCTGTAT 4136
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 4357 GTGTCTAATGGCTGCAGATGTTCAGCTTATTTTTACAAAGATCCAGTCTGATATCTGTAT 4416
Query 4137 CAATGACCTTGGAGAACAACTTAGCTGCTGCTCTAAGAGCCACCTTGAGTTTCAGAAGAA 4196
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 4417 CAATGAGTTTGCAGAACAACTTAGCTGCTGCTCTAATAGCCACCTTGAGTTTCAGAAGAA 4476
Query 4197 GTACACTGATGTGGAATCTGCCCTAAACCATTGTCTAGTCAACGAAACGCGGTATATGGA 4256
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4477 GTACACTGATGTGGAATCTGCCCTTAACCATTGTCTAGTCAACGAAACGCGGTATATGGA 4536
Query 4257 CGAAAACAATCAGTTATTGATTAGTCTTGAAGTCTTAAAGTCTGAACTAGAGTCTTCCAT 4316
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 4537 CGAAAACAATCAGTTATTGATTAATCTTGAAGTCTTAAAGTCTGAGCTAGAGTCTTCCAT 4596
Query 4317 GGCTAAAAGTAGAGCTCTTGCTAATAGAAATGATGAAATGTCAGTTGAACTCGAAGAGCA 4376
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 4597 GGCTAAAAGTAGAGCTCTTGCTGATAGAAATGATGAAATGTCAGCTGAACTCGAAGAGCA 4656
Query 4377 TGCAACTAGGGATGAGAATGCAGAAAGAAGTTGCTCTGAGAGAAGCTTATGTGCTCCTGA 4436
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4657 CGCAACTAGGGATGAGAATGCAGAAAGAAGTTACTCTGAGAGAAGCTTATGTGCTCCTGA 4716
Query 4437 GGTCGAGCAATTGAAATCTTTGTTGTTTGGGTATGAAGAAGAAATAGAAAATTTGACGGT 4496
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4717 GGTCGAGCAATTAAAATCTTTGCTGTTTGGGTATGAAGAAGAAATAGAAAATTTGACGGT 4776
Query 4497 GTTAAAAGCTGAAGCGGAAATTACAGTTGAGATACTAAATGATAAACTAACTGGGCTGTG 4556
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
Sbjct 4777 GTTAAAAGCGGAGGCGGAAATTACAGTTGAGATACTAAAAGATAAACTAACTGGGCTTTG 4836
Query 4557 TGGGAAAGGTGCCAGTGAGCTTGAAACACTGAAGAATAGGTGCAGTGATCTCACTCAGAA 4616
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4837 TGGGAAAGGTGCCAGTGAGCTTGAAACACTGAAAAATAGGTGCAGTGATCTCACTCAGAA 4896
Query 4617 GCTCTCTGAGCAGATTTTGAAAACAGAGGAGTTCAAAAGCTTGTCCAATCATTTGAAAGA 4676
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 4897 GCTCTCTGAGCAGATTTTGAAAACAGAAGAGTTCAAAAGCATGTCCAATCATTTGAAAGA 4956
Query 4677 ACTTAAGGACAATGCTGAAGCTGAATGCAACCGTGCTCGTGAAAAGGCCGACTATAAAGC 4736
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct 4957 GCTTAAGGACAATGCTGAAGCAGAATGCAATCGTGCTCGTGAAAAGGCCGACTACAAAGC 5016
Query 4737 CCCGCTAACTCCACAGCAGGAGTCGTTGAGAATCATTTTCATCAAAGAACAGTATGAAAC 4796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5017 CCCGCTAACTCCACAGCAGGAGTCGTTGAGAATCATTTTCATCAAAGAACAGTATGACAC 5076
Query 4797 CAAGCTGCAGGAACTTCAATATCAACTGACCATGTCCAAGAAGCATGGTGAGGAAATTCT 4856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5077 CAAGCTGCAGGAACTTCAATATCAACTGACCATGTCCAAGAAGCATGGTGAGGAAATTCT 5136
Query 4857 GATGAAATTACAAGATGCCATTGATGAGAATGAAGCAAGGAAAAAGGCAGAATCCAGCCA 4916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5137 GATGAAATTACAAGATGCCATTGATGAGAATGAAGCAAGGAAAAAGGCAGAATCCAGCCA 5196
Query 4917 ATTAAAGAGAACTAAAGAGCTGGAGG-ATAAAATATTGGAATTGGAGGCTGATCGACAAT 4975
|||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5197 ATTAAAGAGATCTAAAGAGCTGGAGGGA-AAAATATTGGAACTGGAGGCTGATCGACAAT 5255
Query 4976 CTGTTATCTATGATAAACGTGAGAAAACAACGGCTTATGACATGATGAAGGCAGAGTTGG 5035
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 5256 CTGTTATCTATGATAAACGTGAGAAAACCACGGCTTATGACATGATGAAGGCAGAGCTGG 5315
Query 5036 ATTGTTCACTATTGAGCCTTGAGTGCTGCAAAGAGGAAAAACAGAAGCTTGAAGCTATTC 5095
|||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5316 ATTGCTCATTATTAAGCCTTGAGTGCTGCAAAGAAGAAAAACAGAAGCTTGAAGCTATTC 5375
Query 5096 TACAGCAATGCAAAGAGGAGAGTTTGAAAATGTCCAAAGAGCTAGAATCAAGGAGAGAAT 5155
| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 5376 TGCAACAATGCAAAGAGCAGAGTTTGAAAATGTCCAAAGAGCTAGAATCAAGGAGAGGAT 5435
Query 5156 TAGTACAACGTTGTAGCTCTCACAAAAATATTGAGATGGAAGAAAATGATAGATTAAATA 5215
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5436 TAGTACAACGTTGCAGCTCTCAGAAAAATATTGAGATGGAAGAAAATGATAGATTAAATA 5495
Query 5216 -TGGAGGTGTCGGAGTTGGCTGACAAAAGTACAATTGCAGTCTCTTCAGGCGACTTGGTG 5274
|| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 5496 GTG-AGGTGTCAGAGTTGGCTGACAAAAATACAATTGCAGTCTCTTCAGGCGACTCGGTG 5554
Query 5275 AACAATGAGCAAAGGGAAGTTGCTTGTTTTGATCCTACAGTGCGGATCATCAGTCCCAGT 5334
||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5555 AACAACGGGCAAAGGGAAGTTGCTTGTATTGATCCTACAGTGCGGATCATCAGTCCCAGG 5614
Query 5335 TCAAAAATTCAGGGTGCAATTCAATTGAGCAGTGTAAATGGAAATGGAGACCAATTACCT 5394
|| | |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 5615 TCGATAATTCAGGGTACTATTCAATCGAGCAGTGTAAATGGAAACAGAGACCAATTACCT 5674
Query 5395 TCCGGAGAAGCAATGGCGCTGGACAAAAGTGAAGAAAGCGTAGCTTTGATTAATCATAAT 5454
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||
Sbjct 5675 TCCGGAGAAGCAATGGCGCTGGACAAACGTGAAGAAAGCCTAGCTTTGATCAATGATAAA 5734
Query 5455 TTCAGGGCAGAGACTTTAAGGTCTAGCATGGATAACTTAAACAATGAGCTAGAACGGATG 5514
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||
Sbjct 5735 TTCAGGGCAGAGACTTTAAGGTCTAGCATGGATCACCTAAACGATGAGCTAGAACGGATG 5794
Query 5515 AAGAATGAGAATCTACTTCAACCTCAAGATGATAATGATTCAGACACCAGATTTCCGGGT 5574
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5795 AAGAATGAGAATCTACTTGAACCTCAAGATGATAATGATTCAGACACCAGATTTCCGGGT 5854
Query 5575 TTGGAACAGGAGCTGATACAGTTGCGTCAGGCAAAGGAAGAACTTCAAAGTATCTTCCCT 5634
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 5855 TTGGAACAGGAGCTGATGCAGTTGCGTCAGGCAAAGGAAGAACTTCAGAGTATCTTCCCT 5914
Query 5635 CTATCTCAAGAGAATTTCAGTTGCGGAAATGCATTGGAAAGGGTTCTTGCACTGGAAATA 5694
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 5915 CTATCTCAAGAGAATTTCAGTTGCGGAAACGCATTGGAAAGGGTTCTTGCACTGGAAATA 5974
Query 5695 GAACTTGCTGAAGCATTGCGTGGAAAGAAAAAATCAACCATACATTTCCAGAGCTCTTTC 5754
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 5975 GAACTCGCTGAAGCATTGCGTGGAAAGAAAAAATCAACCACCCATTTCCAGAGCTCTTTC 6034
Query 5755 TTGAAGCAACACACTGATGACGAAGCAATCTTCCAGAGTTTCAGAGACATAAATAATCTA 5814
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 6035 TTGAAGCAACACACCGATGACGAAGCAATCTTCCAGAGTTTCAGAGACATAAACAATCTA 6094
Query 5815 ATTGAAGAAATGCTGGAGACCAAAGGCCGGTATTCGTCTATGGAGACAGAGCTTAGGGAA 5874
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6095 ATTGAAGAAATGTTGGATACCAAAGGCCGGTATTCGTCTATGGAGACAGAGCTTAGGGAA 6154
Query 5875 ATGCACGACCGTTATTCTCAGCTAAGCCTCAAGTTTGCAGAGGTTGAAGGAGAGAGACAA 5934
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6155 ATGCATGACCGTTATTCTCAGCTAAGCCTCAAGTTTGCAGAGGTTGAAGGAGAGAGACAA 6214
Query 5935 AAGCTCATGATGACTCTGAAGAACGTAAGGGCATCGAAGAAGGCTATGCTCTTGAACCGT 5994
||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6215 AAGCTGATGATGACTCTGAAGAACGTTAGGGCATCAAAGAAGGCTATGCTCTTGAACCGT 6274
Query 5995 TCATCATCAGCAACTCTTGGTGAACATTAATGCACAGAAGTTACTTACCATGTAT 6049
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 6275 TCATCATCAGCAACTCTTGGTGAACATTAATGCACAGATGTTACTTACCATGTAT 6329
> AT1G22000.1 | Symbols: | FBD, F-box and Leucine Rich Repeat
domains containing protein | chr1:7744189-7747785 FORWARD LENGTH=2504
Length=2504
Score = 632 bits (342), Expect = 1e-179
Identities = 439/483 (91%), Gaps = 17/483 (4%)
Strand=Plus/Plus
Query 4840 CATGGTGAGGAAATTCTGATGAAATTACAAGATGCCATTGATGAGAATGAAGCAAGGAAA 4899
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1714 CATGGTGAGGAACTTCTGATGAAATTACAAGATGCCATTGATGAGAATGAAGCTAGGAAA 1773
Query 4900 AAGGCAGAATCCAGCCAATTAAAGAGAACTAAAGAGCTGGAGGATAAAATATTGGAATTG 4959
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct 1774 AAGGCACAATCCAGCCAATTAAAGAGAACTAAAGAGCTGGAGGATAAAATATTGGAACTG 1833
Query 4960 GAGGCTGATCGACAATCTGTTATCTATGATAAACGTGAGAAAACAACGGCTTATGACATG 5019
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 1834 GAAGCTGATCGACAATCTGTTATCTATGATAAACGTGAGAAAACCACGGCTTATGACATG 1893
Query 5020 ATGAAGGCAGAGTTGGATTGTTCACTATTGAGCCTTGAGTGCTGCAAAGAGGAAAAACAG 5079
|||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1894 ATGAAGGCAGAGCTGGATTGCTCATTATTAAGCCTTGAGTGCTGCAAAGAAGAAAAACAG 1953
Query 5080 AAGCTTGAAGCTATTCTACAGCAATGCAAAGAGGAGAGTTTGAAAATGTCCAAAGAGCTA 5139
||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1954 AAGCTTGAAGCTATTCTGCAACAATGCAAAGAGGAGAGTTTGAAAATGTCCAAAGAGCTA 2013
Query 5140 GAATCAAGGAGAGAATTAGTACAACGTTGTAGCTCTCACAAAAATATTGAGATGGAAGAA 5199
| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct 2014 GGATCAAGGAGAGAATTAGTACAACGTTGCAGCTCTCATAAAAATATTGAGATGGAAGAA 2073
Query 5200 AATGATAGATTAAATATGGAGG-T-----GTCGGAGTTGGCTGACAA-AAGTACAATTGC 5252
||||||||||| | ||||| | | ||||||||||| |||||| || ||||| |||
Sbjct 2074 AATGATAGATTGGACATGGATGATCAAATGTCGGAGTTGGATGACAATAA-TACAACTGC 2132
Query 5253 AGTCTCTTCAGGCGACTTGGTGAACAATGAGCAAAGGGAAGTTGCTTGTTTTGATCCTAC 5312
||||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||| | |
Sbjct 2133 AGTCTCTTCAGGCGA-------ACCA-TAAGCAAAGGAAAGTTACTTGTTTTGATCAT-C 2183
Query 5313 AGT 5315
|||
Sbjct 2184 AGT 2186
Score = 257 bits (139), Expect = 7e-67
Identities = 151/157 (96%), Gaps = 0/157 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4282 CTTGAAGTCTTAAAGTCTGAACTAGAGTCTTCCATGGCTAAAAGTAGAGCTCTTGCTAAT 4341
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||
Sbjct 1402 CTTGAAGTCTTAAAGTCTGAGCTAGAGTCTTCCATGGCTAAAAGTAGAGCTCTTGGTGAT 1461
Query 4342 AGAAATGATGAAATGTCAGTTGAACTCGAAGAGCATGCAACTAGGGATGAGAATGCAGAA 4401
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462 AGAAATGATGAAATGTCAGTTGAACTCGAAGAGCACGCAACTAGGGATGAGAATGCAGAA 1521
Query 4402 AGAAGTTGCTCTGAGAGAAGCTTATGTGCTCCTGAGG 4438
||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522 AGAAGTTACTCTAAGAGAAGCTTATGTGCTCCTGAGG 1558
Score = 219 bits (118), Expect = 4e-55
Identities = 138/148 (93%), Gaps = 0/148 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 4505 CTGAAGCGGAAATTACAGTTGAGATACTAAATGATAAACTAACTGGGCTGTGTGGGAAAG 4564
|||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| | |||| |||
Sbjct 1553 CTGAGGCGGAAATTACAGTTGAGAAACTAAAAGATAAACTAACCGCGCTATATGGGCAAG 1612
Query 4565 GTGCCAGTGAGCTTGAAACACTGAAGAATAGGTGCAGTGATCTCACTCAGAAGCTCTCTG 4624
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 GTGCCAGTGAGCTTGAAACACTGAAAAATAGGTGCAGTGATCTCACTCAGAAGCTCTCTG 1672
Query 4625 AGCAGATTTTGAAAACAGAGGAGTTCAA 4652
||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 1673 AGCAGATTTTGAAAACAGAAGAGTTCAA 1700
Score = 100 bits (54), Expect = 1e-19
Identities = 62/66 (94%), Gaps = 0/66 (0%)
Strand=Plus/Plus
Query 5540 AAGATGATAATGATTCAGACACCAGATTTCCGGGTTTGGAACAGGAGCTGATACAGTTGC 5599
||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2247 AAGATGATAATAATTTAGACACCAGATTTCCAGGTTTGGAACAGGAGCTGATACAGTTGC 2306
Query 5600 GTCAGG 5605
|| |||
Sbjct 2307 GTGAGG 2312
Lambda K H
1.33 0.621 1.12
Gapped
Lambda K H
1.28 0.460 0.850
Effective search space used: 301852846161
Database: TAIR10_cdna_20110103_representative_gene_model_updated
Posted date: Sep 25, 2014 6:13 PM
Number of letters in database: 51,074,197
Number of sequences in database: 33,602
Matrix: blastn matrix 1 -2
Gap Penalties: Existence: 0, Extension: 2.5